Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9953
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9953, 536 aa
1>>>pF1KB9953 536 - 536 aa - 536 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2224+/-0.00125; mu= -4.2141+/- 0.074
mean_var=285.8806+/-62.744, 0's: 0 Z-trim(109.5): 61 B-trim: 242 in 2/50
Lambda= 0.075855
statistics sampled from 10874 (10916) to 10874 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.335), width: 16
Scan time: 3.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6997.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 ( 536) 3496 396.6 3.9e-110
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CCDS11768.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17 (1004) 595 79.3 2.4e-14
>>CCDS6997.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 (536 aa)
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Smith-Waterman score: 3496; 99.8% identity (100.0% similar) in 536 aa overlap (1-536:1-536)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASGESGLTQLLM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 TEVMKLQKKVQDLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERVQRLKEECEAGSRELKRCKE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAEDDCKVERKHTLKLRHAMEQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 GLSSGEPPEKERRRLKESFENYRRKRALRKMQKGWRQGEEDRENTTGSDNTDTEGS
490 500 510 520 530
>>CCDS48057.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 (492 aa)
initn: 3127 init1: 3127 opt: 3130 Z-score: 1874.7 bits: 356.5 E(32554): 4.2e-98
Smith-Waterman score: 3130; 99.0% identity (99.4% similar) in 487 aa overlap (1-487:1-486)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSDYENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSDPNLVIRKRK
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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10 20 30 40 50 60
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pF1KB9 VGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASGESGLTQLLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASGESGLTQLLM
70 80 90 100 110 120
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pF1KB9 TEVMKLQKKVQDLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERVQRLKEECEAGSRELKRCKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TEVMKLQKKVQDLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERVQRLKEECEAGSRELKRCKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 ENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAEDDCKVERKHTLKLRHAMEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAEDDCKVERKHTLKLRHAMEQ
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pF1KB9 RPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQVLEEDWRQALRDHQEQANT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQVLEEDWRQALRDHQEQANT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 IFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 IATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQLET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQLET
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pF1KB9 LVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDA
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pF1KB9 GLSSGEPPEKERRRLKESFENYRRKRALRKMQKGWRQGEEDRENTTGSDNTDTEGS
: .: :
CCDS48 G-PAGLPGIGAVC
490
>>CCDS5336.2 CARD11 gene_id:84433|Hs108|chr7 (1154 aa)
initn: 1228 init1: 414 opt: 899 Z-score: 550.1 bits: 112.6 E(32554): 2.6e-24
Smith-Waterman score: 1250; 39.9% identity (69.8% similar) in 547 aa overlap (1-531:8-538)
10 20 30 40
pF1KB9 MSDY-----ENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQV
:.:: ...: :. .: : :. :.:...:::::::::.. .::..:
CCDS53 MPGGGPEMDDYMETLKDEEDALWENVECNRHMLSRYINPAKLTPYLRQCKVIDEQDEDEV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 LSDPNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIID
:. : : . ..: :::::. :..:::.::::::.:::.::: ::::::.: :: :.
CCDS53 LNAPMLPSKINRAGRLLDILHTKGQRGYVVFLESLEFYYPELYKLVTGKEPTRRFSTIVV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 ASGESGLTQLLMTEVMKLQKKVQ-------DLTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRKHQERV
:. :::..::.::.:::.... .: : : . .: :.. . : :::
CCDS53 EEGHEGLTHFLMNEVIKLQQQMKAKDLQRCELLARLRQLEDEKKQMTLTRVELLTFQERY
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 QRLKEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAE
..::: .. . :: . :..::.:::: :. ::::. :.::.:::::::::::: : : :
CCDS53 YKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNKME
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KB9 DDCKVERKHTLKLRHAMEQRPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKL---DRSSP
..::.::...:::.. .:.::..: . ::..:. .:... :::.. .: :: : ..
CCDS53 EECKLERNQSLKLKNDIENRPKKEQVLELERENEMLKTKNQELQSIIQAGKRSLPDSDKA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKM
...::.: ..::.:.:: .: :..:... ::.: : . .:::: .::.: .: :: .:
CCDS53 ILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEEKEDLELKCSTLGKDCEM
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 YKDRIEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQ
:: :.....::.::: :::::. .:.: ..:... : ::: :::.::: :: ::....
CCDS53 YKHRMNTVMLQLEEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKYRKQIRELEEKNDEMRIE
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 VFQCEAQLLAVEGRLRRQQLETLVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLAGG
. . :: .. .:..::: . . :..:... :: . ::. :.. .: :
CCDS53 MVRREACIVNLESKLRRLSKD----SNNLDQSLPRNLPVTIISQDFGDASPRTNGQEADD
430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 GSPKQPFAALHQEQVLRNPHDAGLSSGEPPEKERRRLKE-SFENYRRKRALRKMQKGWRQ
.: .. ..:.:. : ..: :: ... . .:.. . .
CCDS53 SSTSE-----------ESPEDSKYFLPYHPPQRRMNLKGIQLQRAKSPISLKRTSDFQAK
480 490 500 510 520
520 530
pF1KB9 GEEDRENTTGSDNTDTEGS
:.:. :.: .: ..
CCDS53 GHEE-EGTDASPSSCGSLPITNSFTKMQPPRSRSSIMSITAEPPGNDSIVRRYKEDAPHR
530 540 550 560 570 580
>>CCDS13948.1 CARD10 gene_id:29775|Hs108|chr22 (1032 aa)
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Smith-Waterman score: 950; 35.0% identity (63.5% similar) in 543 aa overlap (7-518:24-565)
10 20 30 40
pF1KB9 MSDYENDDECWNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPD
.: :. .:: : :. ...:...:::::::.:.. .
CCDS13 MPGRAEAGEAEEEAGAGSGSEAEEDALWERIEGVRHRLARALNPAKLTPYLRQCRVIDEQ
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50 60 70 80 90 100
pF1KB9 DEEQVLSDPNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVF
:::.::: . : ..: :.:::. :..:: ::::.::.:::. . .::.:::.
CCDS13 DEEEVLSTYRFPCRVNRTGRLMDILRCRGKRGYEAFLEALEFYYPEHFTLLTGQEPAQRC
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pF1KB9 SMIIDASGESGLTQLLMTEVMKLQ--KKVQ-DLTALLSSKDDFIKELRVK-DSLLRKHQ-
:::.: : ::::.::::: .:. .: : . :... ..: :. .. :: .:
CCDS13 SMILDEEGPEGLTQFLMTEVRRLREARKSQLQREQQLQARGRVLEEERAGLEQRLRDQQQ
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160 170 180 190 200 210
pF1KB9 --ERVQRLKEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHS
:: :::.:. :::: :: : :.::: .:::::. ::::..:..:.::::: .:::: .
CCDS13 AQERCQRLREDWEAGSLELLRLKDENYMIAMRLAQLSEEKNSAVLRSRDLQLAVDQLKLK
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220 230 240 250 260
pF1KB9 LMKAEDDCKVERK--------HTLKLRHAMEQRPSQ-ELLWELQQEKALLQARVQELEAS
. . :..: . :. . . .. :..:.. .:. ::. :. : : ..::. .
CCDS13 VSRLEEECALLRRARGPPPGAEEKEKEKEKEKEPDNVDLVSELRAENQRLTASLRELQEG
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 VQEGKLDRSSP-----YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEK
.:. ..: ...::.:::.: ..:: . . ... .:. .: : . ..:
CCDS13 LQQEASRPGAPGSERILLDILEHDWREAQDSRQELCQKLHAVQGELQWAEELRDQYLQEM
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pF1KB9 EMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALR
: ..:. .:.:: .:: :. ..: :.::. :::::: .:.... :....: ::: :
CCDS13 EDLRLKHRTLQKDCDLYKHRMATVLAQLEEIEKERDQAIQSRDRIQLQYSQSLIEKDQYR
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390 400 410 420 430
pF1KB9 KQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQ----LETLVLSSDLEDGSPRRSQEL
:::: : . ::: . . :. .: .:.: : :.. . : .: .. .
CCDS13 KQVRGLEAERDELLTTLTSLEGTKALLEVQLQRAQGGTCLKACASSHSLCSNLSSTWSLS
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KB9 SLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQ------VLRNPHDAGLSSGEPPEKER
.:. : . . .. . :: :.. : .:. .: : .:: . :..
CCDS13 EFPSPLGGPEATGEAAVMGGPEPHNSEEATDSEKEINRLSILPFPPSAGSILRRQREEDP
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530
pF1KB9 RRLKESFENYRRKRALRKMQKGWRQGEEDRENTTGSDNTDTEGS
:.:: .. . . : : :
CCDS13 APPKRSFSSMSDITGSVTL-KPWSPGLSSSSSSDSVWPLGKPEGLLARGCGLDFLNRSLA
550 560 570 580 590
>>CCDS58605.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17 (740 aa)
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Smith-Waterman score: 608; 31.9% identity (62.0% similar) in 461 aa overlap (7-451:15-458)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSDYENDDEC-WNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSD
:.: :...:. : .. : :::.:::::: ::: :::.:: .
CCDS58 MGELCRRDSALTALDEETLWEMMESHRHRIVRCICPSRLTPYLRQAKVLCQLDEEEVLHS
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pF1KB9 PNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASG
: :. ..: :::.:. :..: .::::::... :..: ::: .: :: .
CCDS58 PRLTNSAMRAGHLLDLLKTRGKNGAIAFLESLKFHNPDVYTLVTGLQPDVDFSNFSGLME
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB9 ESGLTQLLMTEVMKLQKKVQDLTA----LLSSKDDFIKELRVKDSLLRK-HQERVQ--RL
: ::. : . .::..... . :: ... ..: . .. . :: ... :.
CCDS58 TSKLTECLAGAIGSLQEELNQEKGQKEVLLRRCQQLQEHLGLAETRAEGLHQLEADHSRM
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 KEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHSLMKAE--D
:.: : .:. : :.: .:... .. .:: : : :.:: :. ::. :..:. .
CCDS58 KREVSAHFHEVLRLKDEMLSLSLHYSNALQEKELAASRCRSLQEELYLLKQELQRANMVS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 DCKVERKHTLKLRHAMEQRPSQELLWELQQEKALLQARVQELEASVQEGKLDRSSPYIQV
.:..: .. .:: : .:. ..: : .:..:. ... : :. : ..
CCDS58 SCELELQEQ-SLRTASDQESGDEELNRLKEENE----KLRSLTFSLAEK---------DI
250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 LEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEKEMFELQCLALRKDSKMYKDR
::.. .: ..:: .. : :::. .: .: . ::::. :: . ..:...
CCDS58 LEQSLDEARGSRQELVERIHSLRERAVAAERQREQYWEEKEQTLLQFQKSKMACQLYREK
290 300 310 320 330 340
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pF1KB9 IEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALRKQVRELGEKADELQLQVFQC
..:. :. :. ::::: ..:. . . ...: :::.::.:: :: ... ::. :. :
CCDS58 VNALQAQVCELQKERDQAYSARDSAQREISQSLVEKDSLRRQVFELTDQVCELRTQLRQL
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB9 EAQ---LLAVEGRLRR---QQLETLVLSSDLEDGSPRRSQELSLPQDLEDTQLSDKGCLA
.:. .: :.: :. .. . :: .. :: ... :: .. :. :::
CCDS58 QAEPPGVLKQEARTREPCPREKQRLV---RMHAICPRDDSDCSLVSSTESQLLSDLSATS
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 GGGSPKQPFAALHQEQVLRNPHDAGLSSGEPPEKERRRLKESFENYRRKRALRKMQKGWR
CCDS58 SRELVDSFRSSSPAPPSQQSLYKRVAEDFGEEPWSFSSCLEIPEGDPGALPGAKAGDPHL
470 480 490 500 510 520
>>CCDS11768.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17 (1004 aa)
initn: 600 init1: 261 opt: 595 Z-score: 371.1 bits: 79.3 E(32554): 2.4e-14
Smith-Waterman score: 608; 31.9% identity (62.0% similar) in 461 aa overlap (7-451:15-458)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MSDYENDDEC-WNVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSD
:.: :...:. : .. : :::.:::::: ::: :::.:: .
CCDS11 MGELCRRDSALTALDEETLWEMMESHRHRIVRCICPSRLTPYLRQAKVLCQLDEEEVLHS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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