Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8561
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8561, 967 aa
1>>>pF1KB8561 967 - 967 aa - 967 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8069+/-0.0012; mu= 6.0644+/- 0.072
mean_var=284.8737+/-62.466, 0's: 0 Z-trim(109.6): 604 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.075989
statistics sampled from 10321 (11032) to 10321 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.339), width: 16
Scan time: 4.690
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6058.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 ( 967) 6482 725.5 1.2e-208
CCDS6057.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 (1009) 5012 564.4 4e-160
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1052) 2266 263.4 1.7e-69
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1065) 2266 263.4 1.7e-69
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 783 100.4 8.5e-21
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 822) 783 100.7 1.3e-20
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 769 99.3 4.5e-20
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 769 99.3 4.6e-20
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1161) 753 97.6 1.6e-19
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1167) 753 97.6 1.6e-19
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1182) 753 97.6 1.6e-19
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1043) 746 96.7 2.5e-19
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1058) 746 96.8 2.5e-19
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1064) 746 96.8 2.5e-19
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1079) 746 96.8 2.5e-19
CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2 (1292) 732 95.3 8.3e-19
CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2 (1308) 732 95.3 8.3e-19
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 ( 542) 724 94.0 8.5e-19
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 728 94.7 9.3e-19
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1004) 718 93.7 2e-18
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1037) 718 93.7 2.1e-18
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1038) 718 93.7 2.1e-18
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 ( 986) 715 93.3 2.5e-18
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 987) 714 93.2 2.7e-18
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 694) 708 92.4 3.4e-18
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 711 92.9 3.4e-18
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1015) 711 92.9 3.5e-18
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1016) 711 92.9 3.5e-18
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 752) 708 92.4 3.6e-18
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 764) 708 92.4 3.6e-18
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 986) 710 92.8 3.7e-18
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 822) 708 92.5 3.8e-18
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (1055) 710 92.8 3.8e-18
CCDS47992.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9 ( 612) 702 91.7 4.9e-18
CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1055) 705 92.3 5.6e-18
CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1225) 705 92.3 6.2e-18
CCDS74052.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1240) 705 92.3 6.3e-18
CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1255) 705 92.3 6.3e-18
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 504) 695 90.8 7.3e-18
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 695 90.8 7.3e-18
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 525) 695 90.8 7.5e-18
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 526) 695 90.8 7.5e-18
CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 619) 696 91.0 7.8e-18
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 998) 697 91.4 9.9e-18
CCDS33255.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 312) 686 89.6 1.1e-17
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 ( 976) 696 91.2 1.1e-17
CCDS6688.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9 ( 635) 690 90.4 1.2e-17
CCDS83251.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 434) 683 89.4 1.6e-17
CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 505) 683 89.5 1.8e-17
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7 ( 987) 687 90.3 2.1e-17
>>CCDS6058.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 (967 aa)
initn: 6482 init1: 6482 opt: 6482 Z-score: 3859.4 bits: 725.5 E(32554): 1.2e-208
Smith-Waterman score: 6482; 99.9% identity (99.9% similar) in 967 aa overlap (1-967:1-967)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSGVSEPLSRVKLGTLRRPEGPAEPMVVVPVDVEKEDVRILKVCFYSNSFNPGKNFKLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MSGVSEPLSRVKLGTLRRPEGPAEPMVVVPVDVEKEDVRILKVCFYSNSFNPGKNFKLVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 CTVQTEIREIITSILLSGRIGPNIRLAECYGLRLKHMKSDEIHWLHPQMTVGEVQDKYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 CTVQTEIREIITSILLSGRIGPNIRLAECYGLRLKHMKSDEIHWLHPQMTVGEVQDKYEC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LHVEAEWRYDLQIRYLPEDFMESLKEDRTTLLYFYQQLRNDYMQRYASKVSEGMALQLGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LHVEAEWRYDLQIRYLPEDFMESLKEDRTTLLYFYQQLRNDYMQRYASKVSEGMALQLGC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LELRRFFKDMPHNALDKKSNFELLEKEVGLDLFFPKQMQENLKPKQFRKMIQQTFQQYAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LELRRFFKDMPHNALDKKSNFELLEKEVGLDLFFPKQMQENLKPKQFRKMIQQTFQQYAS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LREEECVMKFFNTLAGFANIDQETYRCELIQGWNITVDLVIGPKGIRQLTSQDAKPTCLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LREEECVMKFFNTLAGFANIDQETYRCELIQGWNITVDLVIGPKGIRQLTSQDAKPTCLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EFKQIRSIRCLPLEEGQAVLQLGIEGAPQALSIKTSSLAEAENMADLIDGYCRLQGEHQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EFKQIRSIRCLPLEEGQAVLQLGIEGAPQALSIKTSSLAEAENMADLIDGYCRLQGEHQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 SLIIHPRKDGEKRNSLPQIPMLNLEARRSHLSESCSIESDIYAEIPDETLRRPGGPQYGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SLIIHPRKDGEKRNSLPQIPMLNLEARRSHLSESCSIESDIYAEIPDETLRRPGGPQYGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 AREDVVLNRILGEGFFGEVYEGVYTNHKGEKINVAVKTCKKDCTLDNKEKFMSEAVIMKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AREDVVLNRILGEGFFGEVYEGVYTNHKGEKINVAVKTCKKDCTLDNKEKFMSEAVIMKN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LDHPHIVKLIGIIEEEPTWIIMELYPYGELGHYLERNKNSLKVLTLVLYSLQICKAMAYL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 ESINCVHRDIAVRNILVASPECVKLGDFGLSRYIEDEDYYKASVTRLPIKWMSPESINFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ESINCVHRDIAVRNILVASPECVKLGDFGLSRYIEDEDYYKASVTRLPIKWMSPESINFR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 RFTTASDVWMFAVCMWEILSFGKQPFFWLENKDVIGVLEKGDRLPKPDLCPPVLYTLMTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RFTTASDVWMFAVCMWEILSFGKQPFFWLENKDVIGVLEKGDRLPKPDLCPPVLYTLMTR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 CWDYDPSDRPRFTELVCSLSDVYQMEKDIAMEQERNARYRTPKILEPTAFQEPPPKPSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 CWDYDPSDRPRFTELVCSLSDVYQMEKDIAMEQERNARYRTPKILEPTAFQEPPPKPSRP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 KYRPPPQTNLLAPKLQFQEEDFIQPSSREEAQQLWEAEKVKMRQILDKQQKQMVEDYQWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 KYRPPPQTNLLAPKLQFQEEDFIQPSSREEAQQLWEAEKVKMRQILDKQQKQMVEDYQWL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 RQEEKSLDPMVYMNDTSPLTPEKEVGYLEFTGPPQKPPRLGAQSIQPTANLDRTDDLVYL
::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RQEEKSLDPMVYMNDKSPLTPEKEVGYLEFTGPPQKPPRLGAQSIQPTANLDRTDDLVYL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 NVMELVRAVLELKNELCQLPPEGYVVVVKNVGLTLRKLIGSVDDLLPSLPSSSRTEIEGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 NVMELVRAVLELKNELCQLPPEGYVVVVKNVGLTLRKLIGSVDDLLPSLPSSSRTEIEGT
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910 920 930 940 950 960
pF1KB8 QKLLNKDLAELINKMRLAQQNAVTSLSEECKRQMLTASHTLAVDAKNLLDAVDQAKVLAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QKLLNKDLAELINKMRLAQQNAVTSLSEECKRQMLTASHTLAVDAKNLLDAVDQAKVLAN
910 920 930 940 950 960
pF1KB8 LAHPPAE
:::::::
CCDS60 LAHPPAE
>>CCDS6057.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 (1009 aa)
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Smith-Waterman score: 6320; 95.7% identity (95.7% similar) in 999 aa overlap (1-957:1-999)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSGVSEPLSRVKLGTLRRPEGPAEPMVVVPVDVEKEDVRILKVCFYSNSFNPGKNFKLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MSGVSEPLSRVKLGTLRRPEGPAEPMVVVPVDVEKEDVRILKVCFYSNSFNPGKNFKLVK
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pF1KB8 CTVQTEIREIITSILLSGRIGPNIRLAECYGLRLKHMKSDEIHWLHPQMTVGEVQDKYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 CTVQTEIREIITSILLSGRIGPNIRLAECYGLRLKHMKSDEIHWLHPQMTVGEVQDKYEC
70 80 90 100 110 120
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pF1KB8 LHVEAEWRYDLQIRYLPEDFMESLKEDRTTLLYFYQQLRNDYMQRYASKVSEGMALQLGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LHVEAEWRYDLQIRYLPEDFMESLKEDRTTLLYFYQQLRNDYMQRYASKVSEGMALQLGC
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pF1KB8 LELRRFFKDMPHNALDKKSNFELLEKEVGLDLFFPKQMQENLKPKQFRKMIQQTFQQYAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LELRRFFKDMPHNALDKKSNFELLEKEVGLDLFFPKQMQENLKPKQFRKMIQQTFQQYAS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LREEECVMKFFNTLAGFANIDQETYRCELIQGWNITVDLVIGPKGIRQLTSQDAKPTCLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LREEECVMKFFNTLAGFANIDQETYRCELIQGWNITVDLVIGPKGIRQLTSQDAKPTCLA
250 260 270 280 290 300
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pF1KB8 EFKQIRSIRCLPLEEGQAVLQLGIEGAPQALSIKTSSLAEAENMADLIDGYCRLQGEHQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EFKQIRSIRCLPLEEGQAVLQLGIEGAPQALSIKTSSLAEAENMADLIDGYCRLQGEHQG
310 320 330 340 350 360
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pF1KB8 SLIIHPRKDGEKRNSLPQIPMLNLEARRSHLSESCSIESDIYAEIPDETLRRPGGPQYGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SLIIHPRKDGEKRNSLPQIPMLNLEARRSHLSESCSIESDIYAEIPDETLRRPGGPQYGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 AREDVVLNRILGEGFFGEVYEGVYTNHKGEKINVAVKTCKKDCTLDNKEKFMSEAVIMKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AREDVVLNRILGEGFFGEVYEGVYTNHKGEKINVAVKTCKKDCTLDNKEKFMSEAVIMKN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LDHPHIVKLIGIIEEEPTWIIMELYPYGELGHYLERNKNSLKVLTLVLYSLQICKAMAYL
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pF1KB8 ESINCVHRDIAVRNILVASPECVKLGDFGLSRYIEDEDYYKASVTRLPIKWMSPESINFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ESINCVHRDIAVRNILVASPECVKLGDFGLSRYIEDEDYYKASVTRLPIKWMSPESINFR
550 560 570 580 590 600
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pF1KB8 RFTTASDVWMFAVCMWEILSFGKQPFFWLENKDVIGVLEKGDRLPKPDLCPPVLYTLMTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RFTTASDVWMFAVCMWEILSFGKQPFFWLENKDVIGVLEKGDRLPKPDLCPPVLYTLMTR
610 620 630 640 650 660
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pF1KB8 CWDYDPSDRPRFTELVCSLSDVYQMEKDIAMEQERNARYRTPKILEPTAFQEPPPKPSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 CWDYDPSDRPRFTELVCSLSDVYQMEKDIAMEQERNARYRTPKILEPTAFQEPPPKPSRP
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB8 KYRPPPQTNLLAPKLQFQ------------------------------------------
::::::::::::::::::
CCDS60 KYRPPPQTNLLAPKLQFQVPEGLCASSPTLTSPMEYPSPVNSLHTPPLHRHNVFKRHSMR
730 740 750 760 770 780
740 750 760 770 780 790
pF1KB8 EEDFIQPSSREEAQQLWEAEKVKMRQILDKQQKQMVEDYQWLRQEEKSLDPMVYMNDTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS60 EEDFIQPSSREEAQQLWEAEKVKMRQILDKQQKQMVEDYQWLRQEEKSLDPMVYMNDKSP
790 800 810 820 830 840
800 810 820 830 840 850
pF1KB8 LTPEKEVGYLEFTGPPQKPPRLGAQSIQPTANLDRTDDLVYLNVMELVRAVLELKNELCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LTPEKEVGYLEFTGPPQKPPRLGAQSIQPTANLDRTDDLVYLNVMELVRAVLELKNELCQ
850 860 870 880 890 900
860 870 880 890 900 910
pF1KB8 LPPEGYVVVVKNVGLTLRKLIGSVDDLLPSLPSSSRTEIEGTQKLLNKDLAELINKMRLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LPPEGYVVVVKNVGLTLRKLIGSVDDLLPSLPSSSRTEIEGTQKLLNKDLAELINKMRLA
910 920 930 940 950 960
920 930 940 950 960
pF1KB8 QQNAVTSLSEECKRQMLTASHTLAVDAKNLLDAVDQAKVLANLAHPPAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QQNAVTSLSEECKRQMLTASHTLAVDAKNLLDAVDQAKVLANLAHPPAE
970 980 990 1000
>>CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1052 aa)
initn: 2672 init1: 1140 opt: 2266 Z-score: 1361.1 bits: 263.4 E(32554): 1.7e-69
Smith-Waterman score: 2540; 44.8% identity (67.9% similar) in 970 aa overlap (39-910:35-996)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 SRVKLGTLRRPEGPAEPMVVVPVDVEKEDVRILKVCFY--SNSFNPGKNFKLVKCTVQTE
:.::: : ::: .: .... :.
CCDS63 YLDPNLNHTPNSSTKTHLGTGMERSPGAMERVLKVFHYFESNS-EPTTWASIIRHGDATD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 IREIITSILLSGRIGPNIRLAECYGLRLKHMKSDEIHWLHPQMTVGEVQDKYECLHVEAE
.: :: .:. : .. . . :::.::.:..:.:.:::: .: :. :..::: : :
CCDS63 VRGIIQKIVDSHKV----KHVACYGFRLSHLRSEEVHWLHVDMGVSSVREKYELAHPPEE
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 WRYDLQIRYLPEDFMESLKEDRTTLLYFYQQLRNDYMQRYASKVSEGMALQLGCLELRRF
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CCDS40 GDFLTFLRRKKDELKLKQLVKFSLDAAAGMLYLESKNCIHRDLAARNCLVGENNVLKISD
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pF1KB8 FWLENKDVIGVLEKGDRLPKPDLCPPVLYTLMTRCWDYDPSDRPRFTELVCSLSDVYQME
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CCDS40 T
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CCDS35 HHHSTVADGLITTLHYPAPKRNKPTVYGVSPNYDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGEVYEG
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CCDS35 VW---KKYSLTVAVKTLKED-TMEV-EEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTREPPFYII
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CCDS35 TEFMTYGNLLDYLRECNRQEVNAVVLLYMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLVGEN
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pF1KB8 ECVKLGDFGLSRYIEDEDYYKASVTRLPIKWMSPESINFRRFTTASDVWMFAVCMWEILS
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