Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5982
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5982, 568 aa
1>>>pF1KB5982 568 - 568 aa - 568 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9600+/-0.00118; mu= 15.1942+/- 0.070
mean_var=77.9787+/-15.867, 0's: 0 Z-trim(102.5): 180 B-trim: 20 in 2/47
Lambda= 0.145240
statistics sampled from 6811 (7001) to 6811 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16
Scan time: 3.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 3809 808.4 0
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 1670 360.2 4.2e-99
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 1505 325.6 1e-88
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 1499 324.3 2.4e-88
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 1490 322.5 9.3e-88
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 1490 322.5 9.4e-88
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 1473 318.9 1.2e-86
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 1470 318.3 1.7e-86
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 1431 310.1 4.7e-84
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 1431 310.1 5.7e-84
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 1431 310.1 6e-84
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 1406 304.9 2.3e-82
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 1400 303.6 4.6e-82
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 1367 296.7 6.3e-80
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 1359 295.0 2e-79
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 1350 293.2 7.5e-79
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 1328 288.5 1.7e-77
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 1323 287.4 2.8e-77
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 1322 287.3 3.6e-77
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 1322 287.3 3.6e-77
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 1299 282.4 9e-76
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 ( 624) 1247 271.6 2.1e-72
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 496) 1227 267.3 3.1e-71
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17 ( 608) 1219 265.7 1.2e-70
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 544) 1165 254.3 2.7e-67
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 1030 226.1 9.5e-59
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 427) 1014 222.7 7.4e-58
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 1008 221.5 2.4e-57
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 987 217.1 7e-56
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 960 211.4 2.3e-54
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 917 202.4 1.3e-51
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 917 202.4 1.3e-51
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 910 200.9 3.6e-51
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 899 198.6 1.8e-50
CCDS75163.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 437) 894 197.5 2.8e-50
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 891 197.0 5.8e-50
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 613) 882 195.1 2.1e-49
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 882 195.1 2.2e-49
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 882 195.1 2.3e-49
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 882 195.1 2.3e-49
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 876 193.8 5e-49
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 803 178.5 2e-44
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 784 174.5 3.2e-43
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 752 167.8 3.3e-41
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 516) 732 163.6 5.4e-40
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 710 159.0 1.6e-38
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 708 158.6 2e-38
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 663 149.2 1.3e-35
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 624 141.0 3.9e-33
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 616) 623 140.8 4.7e-33
>>CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 (568 aa)
initn: 3809 init1: 3809 opt: 3809 Z-score: 4315.4 bits: 808.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3809; 100.0% identity (100.0% similar) in 568 aa overlap (1-568:1-568)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGGIMAPKDIMTNTHAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQKDFPAHRIVLAACSDYFCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MGGIMAPKDIMTNTHAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQKDFPAHRIVLAACSDYFCA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 MFTSELSEKGKPYVDIQGLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQELLPAACLLQLKGVKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MFTSELSEKGKPYVDIQGLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQELLPAACLLQLKGVKQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQKHFPEVVQHEEFILLSQGEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQKHFPEVVQHEEFILLSQGEVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPNLLQYVRMPLLTPRYITDVIDAEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPNLLQYVRMPLLTPRYITDVIDAEP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 FIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRPELRSQMQGPRTRARLGANEVLLVVGGFGSQQSPIDVVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRPELRSQMQGPRTRARLGANEVLLVVGGFGSQQSPIDVVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KYDPKTQEWSFLPSITRKRRYVASVSLHDRIYVIGGYDGRSRLSSVECLDYTADEDGVWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KYDPKTQEWSFLPSITRKRRYVASVSLHDRIYVIGGYDGRSRLSSVECLDYTADEDGVWY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SVAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGGFDGSRRHTSMERYDPNIDQWSMLGDMQTAREGAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SVAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGGFDGSRRHTSMERYDPNIDQWSMLGDMQTAREGAG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 LVVASGVIYCLGGYDGLNILNSVEKYDPHTGHWTNVTPMATKRSGAGVALLNDHIYVVGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LVVASGVIYCLGGYDGLNILNSVEKYDPHTGHWTNVTPMATKRSGAGVALLNDHIYVVGG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 FDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMTTPRCYVGATVLRGRLYAIAGYDGNSLLSSIECY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMTTPRCYVGATVLRGRLYAIAGYDGNSLLSSIECY
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KB5 DPIIDSWEVVTSMGTQRCDAGVCVLREK
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DPIIDSWEVVTSMGTQRCDAGVCVLREK
550 560
>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 (609 aa)
initn: 2213 init1: 924 opt: 1670 Z-score: 1892.7 bits: 360.2 E(32554): 4.2e-99
Smith-Waterman score: 1670; 44.5% identity (75.0% similar) in 569 aa overlap (3-566:36-600)
10 20 30
pF1KB5 MGGIMAPKDI--MTNTHAKSILNSMNSLRKSN
:. : . ... : .. :. .: :::
CCDS13 MRRCTNIRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 TLCDVTLRVEQKDFPAHRIVLAACSDYFCAMFTSELSEKGKPYVDIQGLTASTMEILLDF
::::.: : : . :::..:.::: :: ::::.::.:. . : :. . .::.:.::
CCDS13 ELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDF
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 VYTETVHVTVENVQELLPAACLLQLKGVKQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDL
.:: . : ::: :::::::::: ...::::::. ::::::::::: ::.::.: .:
CCDS13 AYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCREL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 MQAAEVFSQKHFPEVVQHEEFILLSQGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKE
.. :. :.:..: ::.. :::.:: ... .:. ::..: ::: ::.::. :::.. .:
CCDS13 LRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQE
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220 230 240 250 260 270
pF1KB5 REESLPNLLQYVRMPLLTPRYITDVIDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRPELRSQMQG
:. .::..::.::.:::.:.... .. ..:.:. . .:::::::::.. : :. : :::
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280 290 300 310 320
pF1KB5 PRTRAR--LGANEVLLVVGGFGSQQSPIDVVEKYDPKTQEWSFLPSITRKRRYVASVSLH
:::: : . .:::..:::. : .. :. ::.:::.:.:: .. :....: :. :
CCDS13 PRTRPRKPIRCGEVLFAVGGWCSGDA-ISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLD
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pF1KB5 DRIYVIGGYDGRSRLSSVECLDYTADEDGVWYS-VAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGGF
: .:..::.:: : :.::: : ... : : ::: .. : .:...:: ..:. ::
CCDS13 DLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQ---WSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQ
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390 400 410 420 430 440
pF1KB5 DGSRRHTSMERYDPNIDQWSMLGDMQTAREGAGLVVASGVIYCLGGYDGLNILNSVEKYD
:: . .:::::. ..:. ...:.: : :....: .: .: .:: :: . ::.::.:.
CCDS13 DGVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYN
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450 460 470 480 490 500
pF1KB5 PHTGHWTNVTPMATKRSGAGVALLNDHIYVVGGFDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMT
:. ..: ...::.:.:. : :. .: ::.::: : :..:::.: :: ::..:. :..::
CCDS13 PQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAMT
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510 520 530 540 550 560
pF1KB5 TPRCYVGATVLRGRLYAIAGYDGNSLLSSIECYDPIIDSWEVVTSMGTQRCDAGVCVLRE
. : :: .:. :.:.:..:.::.. :..:: .:: ..:.. .:. .: .:: :..
CCDS13 SRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKM
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 K
CCDS13 THCESHIW
>>CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 (587 aa)
initn: 1276 init1: 899 opt: 1505 Z-score: 1706.1 bits: 325.6 E(32554): 1e-88
Smith-Waterman score: 1505; 41.1% identity (72.8% similar) in 569 aa overlap (8-567:24-585)
10 20 30 40
pF1KB5 MGGIMAPKDIMTN-THAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQKD
. : .: .: . .. :: ::... :::: . .:. .
CCDS41 MEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 FPAHRIVLAACSDYFCAMFTSELSEKGKPYVDIQGLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENV
. :::.:::::: :::::::...::. ..:. . ..:. :.:..:: ..:: :::
CCDS41 IEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 QELLPAACLLQLKGVKQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQKHFP
: ::::: :::: :.: ::.::.::: :.:::::: ::..:.:.::.: :......:::
CCDS41 QVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFP
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 EVVQHEEFILLSQGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPNLLQYVR
::. :::. :: .: .::. :.. :.::: ::::::.:... :. : : . .:...::
CCDS41 EVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 MPLLTPRYITDVIDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRP-ELRSQMQGPRTRARLGAN--
.::: :...... : .:. . :.:.. :: :.:: : . : ...:::. : ..
CCDS41 LPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLP
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330
pF1KB5 EVLLVVGGFGSQQSP--IDVVEKYDPKTQEWSFLPSITRKRRYVASVSLHDRIYVIGGYD
.:..:::: :.: : :: :: . ..:. . . .: .. : . ..:..::..
CCDS41 KVMIVVGG----QAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFN
310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 GRSRLSSVECLDYTADEDGVWYSVAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGGFDGSRRHTSMER
: :. .:. : . :. : :.: :. ::. ::..:.:..:. :::::: .:.:
CCDS41 GSLRVRTVDVYDGVKDQ---WTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEA
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 YDPNIDQWSMLGDMQTAREGAGLVVASGVIYCLGGYDGLN--ILNSVEKYDPHTGHWTNV
:. . ..: ... :.: : ..:. :. : .: .::::: . :..::.:.: :..: :
CCDS41 YSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYV
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 TPMATKRSGAGVALLNDHIYVVGGFDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMTTPRCYVGAT
. :.:.::::::..:. ..:..:: :: .:::.:. :..: :..:. : .:.
CCDS41 ADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVC
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pF1KB5 VLRGRLYAIAGYDGNSLLSSIECYDPIIDSWEVV-TSMGTQRCDAGVCVLREK
.. : ::...: ::. :.:.: :.:. :.: .. :.:.: : ::: :...
CCDS41 AVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
540 550 560 570 580
>>CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 (555 aa)
initn: 1276 init1: 899 opt: 1499 Z-score: 1699.6 bits: 324.3 E(32554): 2.4e-88
Smith-Waterman score: 1499; 41.8% identity (73.2% similar) in 553 aa overlap (23-567:8-553)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MGGIMAPKDIMTNTHAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQKDFPAHRIVLAACSDYFCA
:: ::... :::: . .:. .. :::.:::::: ::::
CCDS58 MGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 MFTSELSEKGKPYVDIQGLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQELLPAACLLQLKGVKQ
:::...::. ..:. . ..:. :.:..:: ..:: :::: ::::: :::: :.:
CCDS58 MFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQ
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CCDS30 VSSTSL
640
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CCDS33 QSIKDACCTFLRERLHPKNCLGVRQFAETMMCAVLYDAANSFIHQHFVEVSMSEEFLALP
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CCDS33 LEDVLELVSRDELNVKSEEQVFEAALAWVRYDREQRGPYLPELLSNIRLPLCRPQFLSDR
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CCDS33 VQQDDLVRCCHKCRDLVDEAKDYHLMPERRPHLPAFRTRPRCCTSIAGLIYAVGGLNSAG
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CCDS33 DSLNVVEVFDPIANCWERCRPMTTARSRVGVAVVNGLLYAIGGYDGQLRLSTVEA--YNP
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CCDS33 ETD-TWTRVGSMNSKRSAMGTVVLDGQIYVCGGYDGNSSLSSVETYSPETDKWTVVTSMS
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CCDS33 SNRSAAGVTVFEGRIYVSGGHDGLQIFSSVEHYNHHTATWHPAAGMLNKRCRHGAASLGS
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CCDS33 KMFVCGGYDGSGFLSIAEMYSSVADQWCLIVPMHTRRSRVSLVASCGRLYAVGGYDGQSN
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CCDS33 LSSVEMYDPETDCWTFMAPMACHEGGVGVGCIPLLTI
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CCDS54 MEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAA
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CCDS54 MFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVE
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