Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5972
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5972, 561 aa
1>>>pF1KB5972 561 - 561 aa - 561 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7024+/-0.00211; mu= 13.2149+/- 0.126
mean_var=275.2088+/-52.796, 0's: 0 Z-trim(103.1): 988 B-trim: 10 in 1/49
Lambda= 0.077311
statistics sampled from 6174 (7243) to 6174 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.529), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 3.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31183.1 ZNF37A gene_id:7587|Hs108|chr10 ( 561) 3997 460.9 1.9e-129
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CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1646 198.7 1.7e-50
CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 742) 1577 191.1 3.9e-48
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 1570 190.2 6.1e-48
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1570 190.3 6.2e-48
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1569 190.3 7.4e-48
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 1554 188.4 2e-47
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1545 187.5 4.5e-47
CCDS58659.1 ZNF382 gene_id:84911|Hs108|chr19 ( 549) 1543 187.1 4.6e-47
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1545 187.6 4.8e-47
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1545 187.6 4.8e-47
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 1545 187.6 4.9e-47
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 1545 187.7 4.9e-47
CCDS33091.1 ZNF528 gene_id:84436|Hs108|chr19 ( 628) 1543 187.2 5e-47
CCDS33004.1 ZNF382 gene_id:84911|Hs108|chr19 ( 550) 1538 186.6 6.8e-47
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1532 186.4 1.5e-46
CCDS12954.1 ZNF416 gene_id:55659|Hs108|chr19 ( 594) 1516 184.2 3.9e-46
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1499 182.3 1.5e-45
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1499 182.4 1.5e-45
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1499 182.4 1.5e-45
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1499 182.4 1.6e-45
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 1491 181.4 2.7e-45
CCDS46166.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 661) 1476 179.8 9e-45
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CCDS77773.1 ZNF717 gene_id:100131827|Hs108|chr3 ( 864) 1459 178.1 3.9e-44
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 1451 177.0 6.1e-44
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 1451 177.0 6.1e-44
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 1451 177.0 6.2e-44
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 1449 176.8 7.5e-44
CCDS46043.1 ZNF181 gene_id:339318|Hs108|chr19 ( 570) 1446 176.4 8.5e-44
CCDS54310.1 ZNF578 gene_id:147660|Hs108|chr19 ( 590) 1446 176.4 8.7e-44
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1443 175.9 9.6e-44
CCDS82338.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 640) 1443 176.1 1.1e-43
CCDS12502.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 659) 1443 176.1 1.2e-43
CCDS82337.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 641) 1441 175.9 1.3e-43
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1441 175.9 1.4e-43
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1441 175.9 1.4e-43
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1441 175.9 1.4e-43
CCDS54257.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 563) 1437 175.3 1.7e-43
CCDS32990.2 ZNF181 gene_id:339318|Hs108|chr19 ( 571) 1434 175.0 2.2e-43
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1431 174.8 3e-43
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CCDS47538.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 697) 1426 174.3 4.4e-43
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 1419 173.4 7e-43
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1420 173.6 7.3e-43
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 1419 173.5 7.5e-43
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 1419 173.5 7.6e-43
>>CCDS31183.1 ZNF37A gene_id:7587|Hs108|chr10 (561 aa)
initn: 3997 init1: 3997 opt: 3997 Z-score: 2437.5 bits: 460.9 E(32554): 1.9e-129
Smith-Waterman score: 3997; 100.0% identity (100.0% similar) in 561 aa overlap (1-561:1-561)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MITSQGSVSFRDVTVGFTQEEWQHLDPAQRTLYRDVMLENYSHLVSVGYCIPKPEVILKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MITSQGSVSFRDVTVGFTQEEWQHLDPAQRTLYRDVMLENYSHLVSVGYCIPKPEVILKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 EKGEEPWILEEKFPSQSHLELINTSRNYSIMKFNEFNKGGKCFCDEKHEIIHSEEEPSEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EKGEEPWILEEKFPSQSHLELINTSRNYSIMKFNEFNKGGKCFCDEKHEIIHSEEEPSEY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NKNGNSFWLNEDLIWHQKIKNWEQSFEYNECGKAFPENSLFLVHKRGYTGQKTCKYTEHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NKNGNSFWLNEDLIWHQKIKNWEQSFEYNECGKAFPENSLFLVHKRGYTGQKTCKYTEHG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KTCDMSFFITHQQTHPRENHYGNECGENIFEESILLEHQSVYPFSQKLNLTPIQRTHSIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KTCDMSFFITHQQTHPRENHYGNECGENIFEESILLEHQSVYPFSQKLNLTPIQRTHSIN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NIIEYNECGTFFSEKLVLHLQQRTHTGEKPYECHECGKTFTQKSAHTRHQRTHTGGKPYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NIIEYNECGTFFSEKLVLHLQQRTHTGEKPYECHECGKTFTQKSAHTRHQRTHTGGKPYE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 CHECGKTFYKNSDLIKHQRIHTGERPYGCHECGKSFSEKSTLTQHQRTHTGEKPYECHEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CHECGKTFYKNSDLIKHQRIHTGERPYGCHECGKSFSEKSTLTQHQRTHTGEKPYECHEC
310 320 330 340 350 360
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pF1KB5 GKTFSFKSVLTVHQKTHTGEKPYECYACGKAFLRKSDLIKHQRIHTGEKPYECNECGKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GKTFSFKSVLTVHQKTHTGEKPYECYACGKAFLRKSDLIKHQRIHTGEKPYECNECGKSF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SEKSTLTKHLRTHTGEKPYECIQCGKFFCYYSGFTEHLRRHTGEKPFGCNECGKTFRQKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SEKSTLTKHLRTHTGEKPYECIQCGKFFCYYSGFTEHLRRHTGEKPFGCNECGKTFRQKS
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pF1KB5 ALIVHQRTHIRQKPYGCNQCGKSFCVKSKLIAHHRTHTGEKPYECNVCGKSFYVKSKLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ALIVHQRTHIRQKPYGCNQCGKSFCVKSKLIAHHRTHTGEKPYECNVCGKSFYVKSKLTV
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550 560
pF1KB5 HQRIHLGRNPINVVNEGNYSG
:::::::::::::::::::::
CCDS31 HQRIHLGRNPINVVNEGNYSG
550 560
>>CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX (620 aa)
initn: 6928 init1: 1526 opt: 1650 Z-score: 1022.4 bits: 199.2 E(32554): 1.3e-50
Smith-Waterman score: 1721; 47.3% identity (66.8% similar) in 605 aa overlap (1-557:1-585)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MITSQGSVSFRDVTVGFTQEEWQHLDPAQRTLYRDVMLENYSHLVSVGYCIPKPEVILKL
: :: :.:.::.: :::::::.:.: :::::::::::.::.:: :: . ::..::::
CCDS35 MAKPQGLVTFEDVAVDFTQEEWQYLNPPQRTLYRDVMLETYSNLVFVGQQVTKPNLILKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KB5 EKGEEPWILEEKFPSQSHLELINTSRNYSIMKFNEFNKGGKC------FCDEK-------
: : : : :.: . :. ..... .. .. . :: : :.:
CCDS35 EVEECP--AEGKIPFWNFPEVCQVDEQ---IERQHQDDQDKCLLMQVGFSDKKTIITKSA
70 80 90 100 110
110 120 130 140
pF1KB5 ---HE---IIH-------SEEEPSEYNKNGNSFWLNEDLIWHQKIKN-------------
:: :.: : ..:..... ::.. : ::. ... .:
CCDS35 RDCHEFGNILHLSTNLVASIQRPDKHESFGNNMVDNLDLFSRSSAENKYDNGCAKLFFHT
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150 160 170 180 190
pF1KB5 -WEQS------FEYNECGKAFPENSLFLVHKRGYTGQKTCKYTEHGKTCDM-SFFITHQQ
.:.. . :.::::.. ... . .:.: .:.: . : :: . : .:.: .
CCDS35 EYEKTNPGMKPYGYKECGKGLRRKKGLSLHQRIKNGEKPFECTACRKTFSKKSHLIVHWR
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200 210 220 230 240 250
pF1KB5 THPRENHYG-NECGENIFEESILLEHQSVYPFSQKLNLTPIQRTHSINNIIEYNECGTFF
:: :. .: .:::. :::: .: :::. . .: ::: :
CCDS35 THTGEKPFGCTECGKA---------------FSQKSQLIIHLRTHTGERPFECPECGKAF
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260 270 280 290 300 310
pF1KB5 SEKLVLHLQQRTHTGEKPYECHECGKTFTQKSAHTRHQRTHTGGKPYECHECGKTFYKNS
:: .. .. :::::::::::.::::.::::: ::.:::: : ::: .::..: ..
CCDS35 REKSTVIIHYRTHTGEKPYECNECGKAFTQKSNLIVHQKTHTGEKTYECTKCGESFIQKL
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320 330 340 350 360 370
pF1KB5 DLIKHQRIHTGERPYGCHECGKSFSEKSTLTQHQRTHTGEKPYECHECGKTFSFKSVLTV
::: :. :::..:. :.:: :.::.:::: ::::::::::..: ::::.:. ::.: :
CCDS35 DLIIHHSTHTGKKPHECNECKKTFSDKSTLIIHQRTHTGEKPHKCTECGKSFNEKSTLIV
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pF1KB5 HQKTHTGEKPYECYACGKAFLRKSDLIKHQRIHTGEKPYECNECGKSFSEKSTLTKHLRT
::.:::::::::: .:::.: .::.: ::: :.::::.::::: :.::.:: : : :
CCDS35 HQRTHTGEKPYECDVCGKTFTQKSNLGVHQRTHSGEKPFECNECEKAFSQKSYLMLHQRG
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 HTGEKPYECIQCGKFFCYYSGFTEHLRRHTGEKPFGCNECGKTFRQKSALIVHQRTHIRQ
::::::::: .: : : : . : : :: :::. ::::::.::.:: ::.::: : .
CCDS35 HTGEKPYECNECEKAFSQKSYLIIHQRTHTEEKPYKCNECGKAFREKSKLIIHQRIHTGE
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500 510 520 530 540 550
pF1KB5 KPYGCNQCGKSFCVKSKLIAHHRTHTGEKPYECNVCGKSFYVKSKLTVHQRIHLGRNPIN
::: : : :.: ::.:: :.::::::::: :. :::.: :: .::::: : :..: .
CCDS35 KPYECPVCWKAFSQKSQLIIHQRTHTGEKPYACTECGKAFREKSTFTVHQRTHTGEKPYK
530 540 550 560 570 580
560
pF1KB5 VVNEGNYSG
.. :
CCDS35 CTECGKAFTQKSNLIVHQRTHAGKKAHGRGHTRKSKFMAH
590 600 610 620
>>CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX (639 aa)
initn: 6928 init1: 1526 opt: 1646 Z-score: 1019.9 bits: 198.7 E(32554): 1.7e-50
Smith-Waterman score: 1717; 47.4% identity (67.1% similar) in 601 aa overlap (5-557:24-604)
10 20 30 40
pF1KB5 MITSQGSVSFRDVTVGFTQEEWQHLDPAQRTLYRDVMLENY
:: :.:.::.: :::::::.:.: :::::::::::.:
CCDS35 MTPASASGEDSGSFYSWQKAKREQGLVTFEDVAVDFTQEEWQYLNPPQRTLYRDVMLETY
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50 60 70 80 90 100
pF1KB5 SHLVSVGYCIPKPEVILKLEKGEEPWILEEKFPSQSHLELINTSRNYSIMKFNEFNKGGK
:.:: :: . ::..::::: : : : :.: . :. ..... .. .. . :
CCDS35 SNLVFVGQQVTKPNLILKLEVEECP--AEGKIPFWNFPEVCQVDEQ---IERQHQDDQDK
70 80 90 100 110
110 120 130
pF1KB5 C------FCDEK----------HE---IIH-------SEEEPSEYNKNGNSFWLNEDLIW
: : :.: :: :.: : ..:..... ::.. : ::.
CCDS35 CLLMQVGFSDKKTIITKSARDCHEFGNILHLSTNLVASIQRPDKHESFGNNMVDNLDLFS
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170
pF1KB5 HQKIKN--------------WEQS------FEYNECGKAFPENSLFLVHKRGYTGQKTCK
... .: .:.. . :.::::.. ... . .:.: .:.: .
CCDS35 RSSAENKYDNGCAKLFFHTEYEKTNPGMKPYGYKECGKGLRRKKGLSLHQRIKNGEKPFE
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 YTEHGKTCDM-SFFITHQQTHPRENHYG-NECGENIFEESILLEHQSVYPFSQKLNLTPI
: :: . : .:.: .:: :. .: .:::. :::: .:
CCDS35 CTACRKTFSKKSHLIVHWRTHTGEKPFGCTECGKA---------------FSQKSQLIIH
240 250 260 270 280
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 QRTHSINNIIEYNECGTFFSEKLVLHLQQRTHTGEKPYECHECGKTFTQKSAHTRHQRTH
:::. . .: ::: : :: .. .. :::::::::::.::::.::::: ::.::
CCDS35 LRTHTGERPFECPECGKAFREKSTVIIHYRTHTGEKPYECNECGKAFTQKSNLIVHQKTH
290 300 310 320 330 340
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 TGGKPYECHECGKTFYKNSDLIKHQRIHTGERPYGCHECGKSFSEKSTLTQHQRTHTGEK
:: : ::: .::..: .. ::: :. :::..:. :.:: :.::.:::: :::::::::
CCDS35 TGEKTYECTKCGESFIQKLDLIIHHSTHTGKKPHECNECKKTFSDKSTLIIHQRTHTGEK
350 360 370 380 390 400
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 PYECHECGKTFSFKSVLTVHQKTHTGEKPYECYACGKAFLRKSDLIKHQRIHTGEKPYEC
:..: ::::.:. ::.: :::.:::::::::: .:::.: .::.: ::: :.::::.::
CCDS35 PHKCTECGKSFNEKSTLIVHQRTHTGEKPYECDVCGKTFTQKSNLGVHQRTHSGEKPFEC
410 420 430 440 450 460
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 NECGKSFSEKSTLTKHLRTHTGEKPYECIQCGKFFCYYSGFTEHLRRHTGEKPFGCNECG
::: :.::.:: : : : ::::::::: .: : : : . : : :: :::. :::::
CCDS35 NECEKAFSQKSYLMLHQRGHTGEKPYECNECEKAFSQKSYLIIHQRTHTEEKPYKCNECG
470 480 490 500 510 520
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 KTFRQKSALIVHQRTHIRQKPYGCNQCGKSFCVKSKLIAHHRTHTGEKPYECNVCGKSFY
:.::.:: ::.::: : .::: : : :.: ::.:: :.::::::::: :. :::.:
CCDS35 KAFREKSKLIIHQRIHTGEKPYECPVCWKAFSQKSQLIIHQRTHTGEKPYACTECGKAFR
530 540 550 560 570 580
540 550 560
pF1KB5 VKSKLTVHQRIHLGRNPINVVNEGNYSG
:: .::::: : :..: . .. :
CCDS35 EKSTFTVHQRTHTGEKPYKCTECGKAFTQKSNLIVHQRTHAGKKAHGRGHTRKSKFMAH
590 600 610 620 630
>>CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 (742 aa)
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10 20 30 40 50 60
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10 20 30 40 50 60
70 80 90
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:.::: :... : : ::. : : . :. . .:
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100 110 120 130 140 150
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: :. ..: ... ... . .. . . . : .. ... .. ..: :.:. ::
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160 170 180 190 200 210
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::: . ::. :: .: . .: . : :: .:.:: :: : .:::. ... :
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220 230 240 250 260
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...:: :. : ::.: : ::::. . : .:: : .: :...
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270 280 290 300 310 320
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:.:: : ::: : .:::.: .: ::::::: ::. : :::.: . .: ::. :
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330 340 350 360 370 380
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390 400 410 420 430 440
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:.: .: .:..:.::::::::: :: :::.: ::.:.::.: : :..:
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CCDS59 GKSMLIAHQRTHTGEKPYICNECGKGFTMKSTLSIHQQTHTGEKPYKCNECDKTFRKKTC
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>--
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. : :. :.: :
CCDS59 AHLSILVKHRRIHR
730 740
>>CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 (616 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS12 MDVMLENYCHLISVGCHMTKPDVILKLERGEEP
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70
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80 90 100 110
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.:... .: :: :. .:: .. ::: ::.: :.: . . ...:.: : :.. :..
CCDS12 -HNQSARAFSHNEVLMQYQKTETPAQSFGYNDCEKSFLQRGGLITHSRPYKGENPSVYNK
160 170 180 190 200 210
180 190 200 210 220
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. .. .. ...: ::::... ..:.:. ::... : :
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230 240 250 260 270 280
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350 360 370 380 390 400
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:::::::::: :.::::.:: :..:..:.:::. :::: : :::.: .:. :. ::: :
CCDS12 QRTHTGEKPYICNECGKSFSQKTTLALHEKTHNEEKPYICSECGKSFRQKTTLVAHQRTH
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410 420 430 440 450 460
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CCDS12 TGEKSYECPHCGKAFRMKSYLIDHHRTHTGEKPYECNECGKSFSQKTNLNLHQRIHTGEK
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470 480 490 500 510 520
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530 540 550 560
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. ::: : :..: :::: : :..: : ::
CCDS12 SECGKCFRQKTNLIVHQRTHTGEKPY-VCNECGKSFSYKRNLIVHQRTHKGENIEMQ
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>>CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 (647 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB5 SVSFRDVTVGFTQEEWQHLDPAQRTLYRDVMLENYSHLVSVGYCIPKPEVILKLEKGEEP
::::: ::.::: . ::.::::::.::::
CCDS74 SVSFNDVTVDFTQEEWQHLDHAQKTLYMDVMLENYCHLISVGCHMTKPDVILKLERGEEP
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70
pF1KB5 WI-------LEEKFPSQSHL----------------------------------------
: :::.. ... :
CCDS74 WTSFAGHTCLEENWKAEDFLVKFKEHQEKYSRSVVSINHKKLVKEKSKIYEKTFTLGKNP
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80 90 100 110
pF1KB5 ---------------------ELINTSRNYSIMKFNEFNKGGKCFCDEKHEIIHSEEEPS
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CCDS74 VNSKNLPPEYDTHGRILKNVSELIISNLNPARKRLSEYNGYGKSLLSTKQETTHPEVKS-
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pF1KB5 EYNKNGNSFWLNEDLIWHQKIKNWEQSFEYNECGKAFPENSLFLVHKRGYTGQKTCKYTE
.:... .: :: :. .:: .. ::: ::.: :.: . . ...:.: : :.. :..
CCDS74 -HNQSARAFSHNEVLMQYQKTETPAQSFGYNDCEKSFLQRGGLITHSRPYKGENPSVYNK
190 200 210 220 230 240
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pF1KB5 HGKTCDMSFFITHQQTHPRENHYGNECGENIFEESILLEHQSVY----P---------FS
. .. .. ...: ::::... ..:.:. ::... : :
CCDS74 KRRATNI-----------EKKHTCNECGKSFCRKSVLILHQGIHSEEKPYQCHQCGNAFR
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CCDS74 RKSYLIDHQRTHTGEKPFVCNECGKSFRLKTALTDHQRTHTGEKSYECLQCRNAFRLKSH
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:::: ::: .:::.: :: : : ::::::::::: .::: : .... : : :::::
CCDS74 TGEKSYECPHCGKAFRMKSYLIDHHRTHTGEKPYECNECGKSFSQKTNLNLHQRIHTGEK
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:. ::::::.::::..: :::. : :: : : ::::.: :: :: :.:::::::::.:
CCDS74 PYVCNECGKSFRQKATLTVHQKIHTGQKSYECPQCGKAFSRKSYLIHHQRTHTGEKPYKC
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CCDS74 SECGKCFRQKTNLIVHQRTHTGEKPY-VCNECGKSFSYKRNLIVHQRTHKGENIEMQ
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>>CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 (778 aa)
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CCDS71 IPFNMDVSSFPSRKMFCQYDSRGMSFNTVSELVISKINYLGKKSDEFNACGKLLLNIKHD
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CCDS71 ETHTREK-NEVLKNRNTLSHRENTLQHEKIQTLDHNFEYSICQETLLEKAVFNTRKRENA
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pF1KB5 GQKTCKYTEHGKT-CDMSFFITHQQTHPRENHY---------------------------
...: :.: :.: :: : .. :: ...::
CCDS71 EENNCDYNEFGRTFCDSSSLLFHQIPPSKDSHYEFSDCEKFLCVKSTLSKHDGVPVKHYD
250 260 270 280 290 300
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pF1KB5 ----GN------------------------ECGENIFEESILLEHQSVYP----------
:: :::. ..:.: : .:: :.
CCDS71 CGESGNNFRRKLCLSQLQKGDKGEKHFECNECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGEKHFQCNQC
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pF1KB5 ---FSQKLNLTPIQRTHSINNIIEYNECGTFFSEKLVLHLQQRTHTGEKPYECHECGKTF
: .: ::: ::.:. .. .: :::: ::.: .: :.::::::::::.:. :::::
CCDS71 GKTFWEKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTF
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::: :.::::::: :::::.::::.: :: : ::: ::::.:. : :::::: .::
CCDS71 YQKSDLTKHQRTHTGQKPYECYECGKSFCMNSHLTVHQRTHTGEKPFECLECGKSFCQKS
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pF1KB5 TLTQHQRTHTGEKPYECHECGKTFSFKSVLTVHQKTHTGEKPYECYACGKAFLRKSDLIK
:::::::: :.:::::. ::::: ::::: :: ::: :::::: :::.: ::::
CCDS71 HLTQHQRTHIGDKPYECNACGKTFYHKSVLTRHQIIHTGLKPYECYECGKTFCLKSDLTI
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pF1KB5 HQRIHTGEKPYECNECGKSFSEKSTLTKHLRTHTGEKPYECIQCGKFFCYYSGFTEHLRR
::: ::::::. : :::: ::.::::..: ::::::::::: .:::.: : .:.: :
CCDS71 HQRTHTGEKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRT
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pF1KB5 HTGEKPFGCNECGKTFRQKSALIVHQRTHIRQKPYGCNQCGKSFCVKSKLIAHHRTHTGE
::::::. :::::::: ::: : ::: :: .::: ::.:::.:: :: ::.:.:::: :
CCDS71 HTGEKPYECNECGKTFCQKSQLTQHQRIHIGEKPYECNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQE
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pF1KB5 KPYECNVCGKSFYVKSKLTVHQRIHLGRNPINVVNEGNYSG
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CCDS71 KPYKCNECGKSFCVKSGLILHERKHTGEKPYECNECGKSFSHKSSLTVHHRAHTGEKSCQ
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>>CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 (569 aa)
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CCDS12 MSKDLVTFGDVAVNFSQEEWEWLNPAQRNLYRKVMLENYRSLVSLGVSVSKPDVISLL
10 20 30 40 50
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pF1KB5 EKGEEPWILEE---KFPSQSHLELINTSRNYSIMKFNEFNKGGKCFCDEKHEIIHSEEEP
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CCDS12 EQGKEPWMVKKEGTRGPCPD-WEYVFKNSEFS-SKQETYEESSKVVTVGARHLSYSLDYP
60 70 80 90 100 110
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pF1KB5 SEYNKNGNSFW-----------LNEDLIWHQKIKNWEQSFEYNECGKAFPENSLFLVHKR
: . . : :.. .: :..: :. :::. ..: ....: ...
CCDS12 SLREDCQSEDWYKNQLGSQEVHLSQLIITHKEILPEVQNKEYNKSWQTFHQDTIFDIQQS
120 130 140 150 160 170
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: .:. :. . :. : . :.... ... :.: :.. :
CCDS12 FPTKEKAHKHEPQKKSYRKKSVEMKHRKVYVEKKLLKCNDC-EKV--------------F
180 190 200 210 220
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pF1KB5 SQKLNLTPIQRTHSINNIIEYNECGTFFSEKLVLHLQQRTHTGEKPYECHECGKTFTQKS
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CCDS12 NQSSSLTLHQRIHTGEKPYACVECGKTFSQSANLAQHKRIHTGEKPYECKECRKAFSQNA
230 240 250 260 270 280
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pF1KB5 AHTRHQRTHTGGKPYECHECGKTFYKNSDLIKHQRIHTGERPYGCHECGKSFSEKSTLTQ
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CCDS12 HLAQHQRVHTGEKPYQCKECKKAFSQIAHLTQHQRVHTGERPFECIECGKAFSNGSFLAQ
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CCDS58 LMKGMLFTHTRAHRGERTFEYNKDGIAFIEKSSLSVHPSNLMEKKPSAYNKYGKFLCRKP
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CCDS58 VFIMPQRPQTEEKPFHCPYCGNNFRRKSYLIEHQRIHTGEKPYVCNQCGKAFRQKTALTL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]