Result of FASTA (ccds) for pFN21AB5848
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB5848, 486 aa
  1>>>pF1KB5848 486 - 486 aa - 486 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2168+/-0.000838; mu= 14.2782+/- 0.051
 mean_var=84.0050+/-16.592, 0's: 0 Z-trim(108.2): 18  B-trim: 7 in 1/52
 Lambda= 0.139934
 statistics sampled from 10063 (10077) to 10063 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.672), E-opt: 0.2 (0.31), width:  16
 Scan time:  3.260

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1503.1 PPP2R5A gene_id:5525|Hs108|chr1         ( 486) 3158 647.3 1.1e-185
CCDS55686.1 PPP2R5A gene_id:5525|Hs108|chr1        ( 429) 2773 569.5 2.4e-162
CCDS9758.1 PPP2R5E gene_id:5529|Hs108|chr14        ( 467) 2477 509.8 2.6e-144
CCDS61468.1 PPP2R5E gene_id:5529|Hs108|chr14       ( 462) 2427 499.7 2.8e-141
CCDS8085.1 PPP2R5B gene_id:5526|Hs108|chr11        ( 497) 2338 481.7 7.6e-136
CCDS61467.1 PPP2R5E gene_id:5529|Hs108|chr14       ( 391) 2152 444.1 1.2e-124
CCDS53911.1 PPP2R5C gene_id:5527|Hs108|chr14       ( 540) 2074 428.4  9e-120
CCDS4878.1 PPP2R5D gene_id:5528|Hs108|chr6         ( 602) 2063 426.2 4.6e-119
CCDS9964.1 PPP2R5C gene_id:5527|Hs108|chr14        ( 524) 2024 418.3 9.6e-117
CCDS53912.1 PPP2R5C gene_id:5527|Hs108|chr14       ( 555) 2021 417.8 1.5e-116
CCDS45163.1 PPP2R5C gene_id:5527|Hs108|chr14       ( 449) 2015 416.5  3e-116
CCDS9965.1 PPP2R5C gene_id:5527|Hs108|chr14        ( 485) 2015 416.5 3.2e-116
CCDS55002.1 PPP2R5D gene_id:5528|Hs108|chr6        ( 570) 2001 413.7 2.6e-115
CCDS43464.1 PPP2R5D gene_id:5528|Hs108|chr6        ( 496) 1989 411.3 1.2e-114


>>CCDS1503.1 PPP2R5A gene_id:5525|Hs108|chr1              (486 aa)
 initn: 3158 init1: 3158 opt: 3158  Z-score: 3447.2  bits: 647.3 E(32554): 1.1e-185
Smith-Waterman score: 3158; 100.0% identity (100.0% similar) in 486 aa overlap (1-486:1-486)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSSSSPPAGAASAAISASEKVDGFTRKSVRKAQRQKRSQGSSQFRSQGSQAELHPLPQLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MSSSSPPAGAASAAISASEKVDGFTRKSVRKAQRQKRSQGSSQFRSQGSQAELHPLPQLK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DATSNEQQELFCQKLQQCCILFDFMDSVSDLKSKEIKRATLNELVEYVSTNRGVIVESAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 DATSNEQQELFCQKLQQCCILFDFMDSVSDLKSKEIKRATLNELVEYVSTNRGVIVESAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 SDIVKMISANIFRTLPPSDNPDFDPEEDEPTLEASWPHIQLVYEFFLRFLESPDFQPSIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 SDIVKMISANIFRTLPPSDNPDFDPEEDEPTLEASWPHIQLVYEFFLRFLESPDFQPSIA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 KRYIDQKFVQQLLELFDSEDPRERDFLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFIYET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 KRYIDQKFVQQLLELFDSEDPRERDFLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFIYET
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 EHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLMKVLIPMHTAKGLALFHAQLAYCVVQFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 EHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLMKVLIPMHTAKGLALFHAQLAYCVVQFL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 EKDTTLTEPVIRGLLKFWPKTCSQKEVMFLGEIEEILDVIEPTQFKKIEEPLFKQISKCV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 EKDTTLTEPVIRGLLKFWPKTCSQKEVMFLGEIEEILDVIEPTQFKKIEEPLFKQISKCV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 SSSHFQVAERALYFWNNEYILSLIEENIDKILPIMFASLYKISKEHWNPTIVALVYNVLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 SSSHFQVAERALYFWNNEYILSLIEENIDKILPIMFASLYKISKEHWNPTIVALVYNVLK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 TLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREKKKELEREELWKKLEELKLKKALEKQNSAYNMHSIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 TLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREKKKELEREELWKKLEELKLKKALEKQNSAYNMHSIL
              430       440       450       460       470       480

             
pF1KB5 SNTSAE
       ::::::
CCDS15 SNTSAE
             

>>CCDS55686.1 PPP2R5A gene_id:5525|Hs108|chr1             (429 aa)
 initn: 2773 init1: 2773 opt: 2773  Z-score: 3028.0  bits: 569.5 E(32554): 2.4e-162
Smith-Waterman score: 2773; 99.8% identity (100.0% similar) in 426 aa overlap (61-486:4-429)

               40        50        60        70        80        90
pF1KB5 KAQRQKRSQGSSQFRSQGSQAELHPLPQLKDATSNEQQELFCQKLQQCCILFDFMDSVSD
                                     .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55                            MIMNATSNEQQELFCQKLQQCCILFDFMDSVSD
                                          10        20        30   

              100       110       120       130       140       150
pF1KB5 LKSKEIKRATLNELVEYVSTNRGVIVESAYSDIVKMISANIFRTLPPSDNPDFDPEEDEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LKSKEIKRATLNELVEYVSTNRGVIVESAYSDIVKMISANIFRTLPPSDNPDFDPEEDEP
            40        50        60        70        80        90   

              160       170       180       190       200       210
pF1KB5 TLEASWPHIQLVYEFFLRFLESPDFQPSIAKRYIDQKFVQQLLELFDSEDPRERDFLKTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TLEASWPHIQLVYEFFLRFLESPDFQPSIAKRYIDQKFVQQLLELFDSEDPRERDFLKTV
           100       110       120       130       140       150   

              220       230       240       250       260       270
pF1KB5 LHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFIYETEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFIYETEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQ
           160       170       180       190       200       210   

              280       290       300       310       320       330
pF1KB5 FLMKVLIPMHTAKGLALFHAQLAYCVVQFLEKDTTLTEPVIRGLLKFWPKTCSQKEVMFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FLMKVLIPMHTAKGLALFHAQLAYCVVQFLEKDTTLTEPVIRGLLKFWPKTCSQKEVMFL
           220       230       240       250       260       270   

              340       350       360       370       380       390
pF1KB5 GEIEEILDVIEPTQFKKIEEPLFKQISKCVSSSHFQVAERALYFWNNEYILSLIEENIDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GEIEEILDVIEPTQFKKIEEPLFKQISKCVSSSHFQVAERALYFWNNEYILSLIEENIDK
           280       290       300       310       320       330   

              400       410       420       430       440       450
pF1KB5 ILPIMFASLYKISKEHWNPTIVALVYNVLKTLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREKKKELE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ILPIMFASLYKISKEHWNPTIVALVYNVLKTLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREKKKELE
           340       350       360       370       380       390   

              460       470       480      
pF1KB5 REELWKKLEELKLKKALEKQNSAYNMHSILSNTSAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 REELWKKLEELKLKKALEKQNSAYNMHSILSNTSAE
           400       410       420         

>>CCDS9758.1 PPP2R5E gene_id:5529|Hs108|chr14             (467 aa)
 initn: 2484 init1: 2409 opt: 2477  Z-score: 2704.4  bits: 509.8 E(32554): 2.6e-144
Smith-Waterman score: 2477; 80.0% identity (94.7% similar) in 451 aa overlap (19-469:12-461)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSSSSPPAGAASAAISASEKVDGFTRKSVRKAQRQKRSQGSSQFRSQGSQAELHPLPQLK
                         .:::::.::::::: ::::::.::::::::.  :: ::: ::
CCDS97        MSSAPTTPPSVDKVDGFSRKSVRKA-RQKRSQSSSQFRSQGKPIELTPLPLLK
                      10        20         30        40        50  

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DATSNEQQELFCQKLQQCCILFDFMDSVSDLKSKEIKRATLNELVEYVSTNRGVIVESAY
       :. :.:: ::: .::::::..:::::..:::: :: ::.::::::.:.. .:: ..:..:
CCDS97 DVPSSEQPELFLKKLQQCCVIFDFMDTLSDLKMKEYKRSTLNELVDYITISRGCLTEQTY
             60        70        80        90       100       110  

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 SDIVKMISANIFRTLPPSDNPDFDPEEDEPTLEASWPHIQLVYEFFLRFLESPDFQPSIA
        ..:.:.: ::::::::::. .::::::::::::::::.:::::::.::::: .::::::
CCDS97 PEVVRMVSCNIFRTLPPSDSNEFDPEEDEPTLEASWPHLQLVYEFFIRFLESQEFQPSIA
            120       130       140       150       160       170  

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 KRYIDQKFVQQLLELFDSEDPRERDFLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFIYET
       :.::::::: :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS97 KKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDYLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFVYET
            180       190       200       210       220       230  

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 EHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLMKVLIPMHTAKGLALFHAQLAYCVVQFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::...:.:::::::::.::::
CCDS97 EHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLVKVLIPLHTVRSLSLFHAQLAYCIVQFL
            240       250       260       270       280       290  

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 EKDTTLTEPVIRGLLKFWPKTCSQKEVMFLGEIEEILDVIEPTQFKKIEEPLFKQISKCV
       ::: .:::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::.:: ::.:::::::.:::
CCDS97 EKDPSLTEPVIRGLMKFWPKTCSQKEVMFLGELEEILDVIEPSQFVKIQEPLFKQIAKCV
            300       310       320       330       340       350  

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 SSSHFQVAERALYFWNNEYILSLIEENIDKILPIMFASLYKISKEHWNPTIVALVYNVLK
       :: ::::::::::.::::::.:::::: . ::::::.:::.::::::::.::::::::::
CCDS97 SSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLIEENSNVILPIMFSSLYRISKEHWNPAIVALVYNVLK
            360       370       380       390       400       410  

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 TLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREKKKELEREELWKKLEELKLKKALEKQNSAYNMHSIL
       ..::::. .::.::..::..:::::::: ::::::::::.:.::..:..           
CCDS97 AFMEMNSTMFDELTATYKSDRQREKKKEKEREELWKKLEDLELKRGLRRDGIIPT     
            420       430       440       450       460            

             
pF1KB5 SNTSAE

>>CCDS61468.1 PPP2R5E gene_id:5529|Hs108|chr14            (462 aa)
 initn: 2463 init1: 2277 opt: 2427  Z-score: 2649.9  bits: 499.7 E(32554): 2.8e-141
Smith-Waterman score: 2427; 79.2% identity (93.6% similar) in 451 aa overlap (19-469:12-456)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB5 MSSSSPPAGAASAAISASEKVDGFTRKSVRKAQRQKRSQGSSQFRSQGSQAELHPLPQLK
                         .:::::.::::::: ::::::.::::::::.  :: ::: ::
CCDS61        MSSAPTTPPSVDKVDGFSRKSVRKA-RQKRSQSSSQFRSQGKPIELTPLPLLK
                      10        20         30        40        50  

               70        80        90       100       110       120
pF1KB5 DATSNEQQELFCQKLQQCCILFDFMDSVSDLKSKEIKRATLNELVEYVSTNRGVIVESAY
       :. :.:: ::: .::::::..:::::..:::: :: ::.::::::.:.. .:: ..:..:
CCDS61 DVPSSEQPELFLKKLQQCCVIFDFMDTLSDLKMKEYKRSTLNELVDYITISRGCLTEQTY
             60        70        80        90       100       110  

              130       140       150       160       170       180
pF1KB5 SDIVKMISANIFRTLPPSDNPDFDPEEDEPTLEASWPHIQLVYEFFLRFLESPDFQPSIA
        ..:.:.: ::::::::::. .::::::::::::::::.:::::::.::::: .::::::
CCDS61 PEVVRMVSCNIFRTLPPSDSNEFDPEEDEPTLEASWPHLQLVYEFFIRFLESQEFQPSIA
            120       130       140       150       160       170  

              190       200       210       220       230       240
pF1KB5 KRYIDQKFVQQLLELFDSEDPRERDFLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFIYET
       :.::::::: :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS61 KKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDYLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFVYET
            180       190       200       210       220       230  

              250       260       270       280       290       300
pF1KB5 EHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLMKVLIPMHTAKGLALFHAQLAYCVVQFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::...:.:::::::::.::::
CCDS61 EHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLVKVLIPLHTVRSLSLFHAQLAYCIVQFL
            240       250       260       270       280       290  

              310       320       330       340       350       360
pF1KB5 EKDTTLTEPVIRGLLKFWPKTCSQKEVMFLGEIEEILDVIEPTQFKKIEEPLFKQISKCV
       ::: .:::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::.:: ::.:::::::.:::
CCDS61 EKDPSLTEPVIRGLMKFWPKTCSQKEVMFLGELEEILDVIEPSQFVKIQEPLFKQIAKCV
            300       310       320       330       340       350  

              370       380       390       400       410       420
pF1KB5 SSSHFQVAERALYFWNNEYILSLIEENIDKILPIMFASLYKISKEHWNPTIVALVYNVLK
       :: ::::::::::.::::::.:::::: . ::::::.:::.::::::::.::::::::::
CCDS61 SSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLIEENSNVILPIMFSSLYRISKEHWNPAIVALVYNVLK
            360       370       380       390       400       410  

              430       440       450       460       470       480
pF1KB5 TLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREKKKELEREELWKKLEELKLKKALEKQNSAYNMHSIL
       ..::::. .::.::..:.     ::::: ::::::::::.:.::..:..           
CCDS61 AFMEMNSTMFDELTATYN-----EKKKEKEREELWKKLEDLELKRGLRRDGIIPT     
            420       430            440       450       460       

             
pF1KB5 SNTSAE

>>CCDS8085.1 PPP2R5B gene_id:5526|Hs108|chr11             (497 aa)
 initn: 2315 init1: 2256 opt: 2338  Z-score: 2552.3  bits: 481.7 E(32554): 7.6e-136
Smith-Waterman score: 2338; 72.0% identity (91.6% similar) in 464 aa overlap (2-465:9-471)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB5        MSSSSPPAGAASAAISASEKVDGFTRKSVRKAQRQKRSQGSSQFRSQGSQAEL
               :. . :.. . . .   .:::::.:.:.:.: : .::..::::: :..: ::
CCDS80 METKLPPASTPTSPSSPGLSPVPPPDKVDGFSRRSLRRA-RPRRSHSSSQFRYQSNQQEL
               10        20        30         40        50         

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB5 HPLPQLKDATSNEQQELFCQKLQQCCILFDFMDSVSDLKSKEIKRATLNELVEYVSTNRG
        ::: :::. ..: .::. .:: :: ..:::.: :.:::.::.:::.:::::: :...::
CCDS80 TPLPLLKDVPASELHELLSRKLAQCGVMFDFLDCVADLKGKEVKRAALNELVECVGSTRG
      60        70        80        90       100       110         

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB5 VIVESAYSDIVKMISANIFRTLPPSDNPDFDPEEDEPTLEASWPHIQLVYEFFLRFLESP
       :..: .: ::..:::.:::::::::.::.::::::::.:: ::::.::::::::::::::
CCDS80 VLIEPVYPDIIRMISVNIFRTLPPSENPEFDPEEDEPNLEPSWPHLQLVYEFFLRFLESP
     120       130       140       150       160       170         

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB5 DFQPSIAKRYIDQKFVQQLLELFDSEDPRERDFLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIF
       :::::.::::.::::: .:::::::::::::..:::.:::.:::::::::.:::: :.::
CCDS80 DFQPSVAKRYVDQKFVLMLLELFDSEDPREREYLKTILHRVYGKFLGLRAYIRKQCNHIF
     180       190       200       210       220       230         

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB5 LRFIYETEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLMKVLIPMHTAKGLALFHAQLA
       :::::: :::::::::::::::::::::::::.::::::..::::.:..:.:..::::::
CCDS80 LRFIYEFEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKTEHKQFLVRVLIPLHSVKSLSVFHAQLA
     240       250       260       270       280       290         

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB5 YCVVQFLEKDTTLTEPVIRGLLKFWPKTCSQKEVMFLGEIEEILDVIEPTQFKKIEEPLF
       ::::::::::.:::: :::::::.:::::.:::::::::.:::::::::.:: ::.::::
CCDS80 YCVVQFLEKDATLTEHVIRGLLKYWPKTCTQKEVMFLGEMEEILDVIEPSQFVKIQEPLF
     300       310       320       330       340       350         

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB5 KQISKCVSSSHFQVAERALYFWNNEYILSLIEENIDKILPIMFASLYKISKEHWNPTIVA
       ::...:::: ::::::::::::::::::::::.:   .:: .:..::..:::::: :::.
CCDS80 KQVARCVSSPHFQVAERALYFWNNEYILSLIEDNCHTVLPAVFGTLYQVSKEHWNQTIVS
     360       370       380       390       400       410         

           420       430       440       450       460       470   
pF1KB5 LVYNVLKTLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREKKKELEREELWKKLEELKLKKALEKQNSA
       :.::::::.:::::::::.::.::: :.:.:..:  ::.:::. ::::.:..        
CCDS80 LIYNVLKTFMEMNGKLFDELTASYKLEKQQEQQKAQERQELWQGLEELRLRRLQGTQGAK
     420       430       440       450       460       470         

           480           
pF1KB5 YNMHSILSNTSAE     
                         
CCDS80 EAPLQRLTPQVAASGGQS
     480       490       

>>CCDS61467.1 PPP2R5E gene_id:5529|Hs108|chr14            (391 aa)
 initn: 2177 init1: 2152 opt: 2152  Z-score: 2351.0  bits: 444.1 E(32554): 1.2e-124
Smith-Waterman score: 2152; 81.0% identity (95.8% similar) in 385 aa overlap (85-469:1-385)

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB5 PLPQLKDATSNEQQELFCQKLQQCCILFDFMDSVSDLKSKEIKRATLNELVEYVSTNRGV
                                     ::..:::: :: ::.::::::.:.. .:: 
CCDS61                               MDTLSDLKMKEYKRSTLNELVDYITISRGC
                                             10        20        30

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB5 IVESAYSDIVKMISANIFRTLPPSDNPDFDPEEDEPTLEASWPHIQLVYEFFLRFLESPD
       ..:..: ..:.:.: ::::::::::. .::::::::::::::::.:::::::.::::: .
CCDS61 LTEQTYPEVVRMVSCNIFRTLPPSDSNEFDPEEDEPTLEASWPHLQLVYEFFIRFLESQE
               40        50        60        70        80        90

          180       190       200       210       220       230    
pF1KB5 FQPSIAKRYIDQKFVQQLLELFDSEDPRERDFLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFL
       :::::::.::::::: :::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 FQPSIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDYLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFL
              100       110       120       130       140       150

          240       250       260       270       280       290    
pF1KB5 RFIYETEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLMKVLIPMHTAKGLALFHAQLAY
       ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::...:.::::::::
CCDS61 RFVYETEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLVKVLIPLHTVRSLSLFHAQLAY
              160       170       180       190       200       210

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB5 CVVQFLEKDTTLTEPVIRGLLKFWPKTCSQKEVMFLGEIEEILDVIEPTQFKKIEEPLFK
       :.::::::: .:::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::.:: ::.:::::
CCDS61 CIVQFLEKDPSLTEPVIRGLMKFWPKTCSQKEVMFLGELEEILDVIEPSQFVKIQEPLFK
              220       230       240       250       260       270

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB5 QISKCVSSSHFQVAERALYFWNNEYILSLIEENIDKILPIMFASLYKISKEHWNPTIVAL
       ::.::::: ::::::::::.::::::.:::::: . ::::::.:::.::::::::.::::
CCDS61 QIAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLIEENSNVILPIMFSSLYRISKEHWNPAIVAL
              280       290       300       310       320       330

          420       430       440       450       460       470    
pF1KB5 VYNVLKTLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREKKKELEREELWKKLEELKLKKALEKQNSAY
       ::::::..::::. .::.::..::..:::::::: ::::::::::.:.::..:..     
CCDS61 VYNVLKAFMEMNSTMFDELTATYKSDRQREKKKEKEREELWKKLEDLELKRGLRRDGIIP
              340       350       360       370       380       390

          480      
pF1KB5 NMHSILSNTSAE
                   
CCDS61 T           
                   

>>CCDS53911.1 PPP2R5C gene_id:5527|Hs108|chr14            (540 aa)
 initn: 2041 init1: 1688 opt: 2074  Z-score: 2263.7  bits: 428.4 E(32554): 9e-120
Smith-Waterman score: 2074; 68.9% identity (86.8% similar) in 456 aa overlap (10-461:42-491)

                                    10        20        30         
pF1KB5                      MSSSSPPAGAASAAISASEKVDGFTRKSVRKAQRQKRSQ
                                     :. ...::. ::   ..  :.: .::.   
CCDS53 PKAGKSGKSSKEGQDTVESEQISVRKNSLVAVPSTVSAKIKVP-VSQPIVKKDKRQN---
              20        30        40        50         60          

      40        50        60        70        80         90        
pF1KB5 GSSQFRSQGSQAELHPLPQLKDATSNEQQELFCQKLQQCCILFDFM-DSVSDLKSKEIKR
        ::.: : ... ::. ::.:::.   .:..:: :::.:::.::::. : .:::: ::.::
CCDS53 -SSRF-SASNNRELQKLPSLKDVPPADQEKLFIQKLRQCCVLFDFVSDPLSDLKWKEVKR
         70         80        90       100       110       120     

      100       110       120       130       140          150     
pF1KB5 ATLNELVEYVSTNRGVIVESAYSDIVKMISANIFRTLPPSDNP---DFDPEEDEPTLEAS
       :.:.:.:::.. ::.::.:  : ..:.:...:.:::::::.::   .::::::::::::.
CCDS53 AALSEMVEYITHNRNVITEPIYPEVVHMFAVNMFRTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAA
         130       140       150       160       170       180     

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB5 WPHIQLVYEFFLRFLESPDFQPSIAKRYIDQKFVQQLLELFDSEDPRERDFLKTVLHRIY
       :::.::::::::::::::::::.:::.::::::: :::::::::::::::::::.:::::
CCDS53 WPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDFLKTTLHRIY
         190       200       210       220       230       240     

         220       230       240       250       260       270     
pF1KB5 GKFLGLRAFIRKQINNIFLRFIYETEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLMKV
       ::::::::.::::::::: :::::::: ::.::::::::::::::::::: ::: ::.::
CCDS53 GKFLGLRAYIRKQINNIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLKEEHKIFLLKV
         250       260       270       280       290       300     

         280       290       300       310       320       330     
pF1KB5 LIPMHTAKGLALFHAQLAYCVVQFLEKDTTLTEPVIRGLLKFWPKTCSQKEVMFLGEIEE
       :.:.: .:.:...: :::::::::::::.::::::. .:::.:::: : ::::::.:.::
CCDS53 LLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEPVVMALLKYWPKTHSPKEVMFLNELEE
         310       320       330       340       350       360     

         340       350       360       370       380       390     
pF1KB5 ILDVIEPTQFKKIEEPLFKQISKCVSSSHFQVAERALYFWNNEYILSLIEENIDKILPIM
       :::::::..: :: ::::.:..::::: ::::::::::.::::::.::: .:  ::::::
CCDS53 ILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLISDNAAKILPIM
         370       380       390       400       410       420     

         400       410       420       430       440       450     
pF1KB5 FASLYKISKEHWNPTIVALVYNVLKTLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREKKKELEREELW
       : :::. :: ::: :: .:.::.:: .:::: ::::: :...:::. .:: :  :::: :
CCDS53 FPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQFKAEKLKEKLKMKEREEAW
         430       440       450       460       470       480     

         460       470       480                              
pF1KB5 KKLEELKLKKALEKQNSAYNMHSILSNTSAE                        
        :.:.:                                                 
CCDS53 VKIENLAKANPQAQKDPKKDRPLARRKSELPQDPHTKKALEAHCRADELASQDGR
         490       500       510       520       530       540

>>CCDS4878.1 PPP2R5D gene_id:5528|Hs108|chr6              (602 aa)
 initn: 2046 init1: 1682 opt: 2063  Z-score: 2251.0  bits: 426.2 E(32554): 4.6e-119
Smith-Waterman score: 2063; 65.0% identity (86.1% similar) in 466 aa overlap (2-461:48-512)

                                            10          20         
pF1KB5                              MSSSSPPAGAA--SAAISASEKVDGFTRKSV
                                     ..:.::..    : .     ... .  .. 
CCDS48 TAKPSSSGKDGGGENTEEAQPQPQPQPQPQAQSQPPSSNKRPSNSTPPPTQLSKIKYSGG
        20        30        40        50        60        70       

      30        40        50        60        70        80         
pF1KB5 RKAQRQKRSQGSSQFRSQGSQAELHPLPQLKDATSNEQQELFCQKLQQCCILFDFM-DSV
        .  ...: :.::.: . ... ::. :: :::. ..:..::: :::.:::.::::. : .
CCDS48 PQIVKKERRQSSSRF-NLSKNRELQKLPALKDSPTQEREELFIQKLRQCCVLFDFVSDPL
        80        90        100       110       120       130      

       90       100       110       120       130       140        
pF1KB5 SDLKSKEIKRATLNELVEYVSTNRGVIVESAYSDIVKMISANIFRTLPPSDNP---DFDP
       :::: ::.::: :::.:::.. .: :..:. : . : :.:.:.:::::::.::   .:::
CCDS48 SDLKFKEVKRAGLNEMVEYITHSRDVVTEAIYPEAVTMFSVNLFRTLPPSSNPTGAEFDP
        140       150       160       170       180       190      

         150       160       170       180       190       200     
pF1KB5 EEDEPTLEASWPHIQLVYEFFLRFLESPDFQPSIAKRYIDQKFVQQLLELFDSEDPRERD
       :::::::::.:::.::::::::::::::::::.:::.:::::::  ::.:::::::::::
CCDS48 EEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLALLDLFDSEDPRERD
        200       210       220       230       240       250      

         210       220       230       240       250       260     
pF1KB5 FLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFIYETEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLK
       ::::.:::::::::::::.::.:::.:: :::::::: ::.:::::::::::::::::::
CCDS48 FLKTILHRIYGKFLGLRAYIRRQINHIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLK
        260       270       280       290       300       310      

         270       280       290       300       310       320     
pF1KB5 AEHKQFLMKVLIPMHTAKGLALFHAQLAYCVVQFLEKDTTLTEPVIRGLLKFWPKTCSQK
        :::.::..::.:.: .:.:...: ::::::::::::...:::::: ::::::::: : :
CCDS48 EEHKMFLIRVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKESSLTEPVIVGLLKFWPKTHSPK
        320       330       340       350       360       370      

         330       340       350       360       370       380     
pF1KB5 EVMFLGEIEEILDVIEPTQFKKIEEPLFKQISKCVSSSHFQVAERALYFWNNEYILSLIE
       :::::.:.:::::::::..:.:. ::::.:..::::: ::::::::::.::::::.::: 
CCDS48 EVMFLNELEEILDVIEPSEFSKVMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLIS
        380       390       400       410       420       430      

         390       400       410       420       430       440     
pF1KB5 ENIDKILPIMFASLYKISKEHWNPTIVALVYNVLKTLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREK
       .:  ..::::: .::. :: ::: :: .:.::.:: .:::: ::::: :..::::.:. .
CCDS48 DNAARVLPIMFPALYRNSKSHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQYKAEKQKGR
        440       450       460       470       480       490      

         450       460       470       480                         
pF1KB5 KKELEREELWKKLEELKLKKALEKQNSAYNMHSILSNTSAE                   
        .  ::::.:.:.:::                                            
CCDS48 FRMKEREEMWQKIEELARLNPQYPMFRAPPPLPPVYSMETETPTAEDIQLLKRTVETEAV
        500       510       520       530       540       550      

>>CCDS9964.1 PPP2R5C gene_id:5527|Hs108|chr14             (524 aa)
 initn: 1989 init1: 1690 opt: 2024  Z-score: 2209.4  bits: 418.3 E(32554): 9.6e-117
Smith-Waterman score: 2024; 69.2% identity (87.2% similar) in 439 aa overlap (49-481:18-453)

       20        30        40        50          60        70      
pF1KB5 EKVDGFTRKSVRKAQRQKRSQGSSQFRSQGSQAELHP--LPQLKDATSNEQQELFCQKLQ
                                     :.. ..:  : ...:.   .:..:: :::.
CCDS99              MLTCNKAGSRMVVDAANSNGPFQPVVLLHIRDVPPADQEKLFIQKLR
                            10        20        30        40       

         80         90       100       110       120       130     
pF1KB5 QCCILFDFM-DSVSDLKSKEIKRATLNELVEYVSTNRGVIVESAYSDIVKMISANIFRTL
       :::.::::. : .:::: ::.:::.:.:.:::.. ::.::.:  : ..:.:...:.::::
CCDS99 QCCVLFDFVSDPLSDLKWKEVKRAALSEMVEYITHNRNVITEPIYPEVVHMFAVNMFRTL
        50        60        70        80        90       100       

         140          150       160       170       180       190  
pF1KB5 PPSDNP---DFDPEEDEPTLEASWPHIQLVYEFFLRFLESPDFQPSIAKRYIDQKFVQQL
       :::.::   .::::::::::::.:::.::::::::::::::::::.:::.::::::: ::
CCDS99 PPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFFLRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLQL
       110       120       130       140       150       160       

            200       210       220       230       240       250  
pF1KB5 LELFDSEDPRERDFLKTVLHRIYGKFLGLRAFIRKQINNIFLRFIYETEHFNGVAELLEI
       :::::::::::::::::.:::::::::::::.::::::::: :::::::: ::.::::::
CCDS99 LELFDSEDPRERDFLKTTLHRIYGKFLGLRAYIRKQINNIFYRFIYETEHHNGIAELLEI
       170       180       190       200       210       220       

            260       270       280       290       300       310  
pF1KB5 LGSIINGFALPLKAEHKQFLMKVLIPMHTAKGLALFHAQLAYCVVQFLEKDTTLTEPVIR
       ::::::::::::: ::: ::.:::.:.: .:.:...: :::::::::::::.::::::. 
CCDS99 LGSIINGFALPLKEEHKIFLLKVLLPLHKVKSLSVYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEPVVM
       230       240       250       260       270       280       

            320       330       340       350       360       370  
pF1KB5 GLLKFWPKTCSQKEVMFLGEIEEILDVIEPTQFKKIEEPLFKQISKCVSSSHFQVAERAL
       .:::.:::: : ::::::.:.:::::::::..: :: ::::.:..::::: :::::::::
CCDS99 ALLKYWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFVKIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERAL
       290       300       310       320       330       340       

            380       390       400       410       420       430  
pF1KB5 YFWNNEYILSLIEENIDKILPIMFASLYKISKEHWNPTIVALVYNVLKTLMEMNGKLFDD
       :.::::::.::: .:  ::::::: :::. :: ::: :: .:.::.:: .:::: :::::
CCDS99 YYWNNEYIMSLISDNAAKILPIMFPSLYRNSKTHWNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDD
       350       360       370       380       390       400       

            440       450       460       470       480            
pF1KB5 LTSSYKAERQREKKKELEREELWKKLEELKLKKALEKQNSAYNMHSILSNTSAE      
        :...:::. .:: :  :::: : :.:.:   :: . : ..:.. : .:           
CCDS99 CTQQFKAEKLKEKLKMKEREEAWVKIENL--AKA-NPQYTVYSQASTMSIPVAMETDGPL
       410       420       430          440       450       460    

CCDS99 FEDVQMLRKTVKDEAHQAQKDPKKDRPLARRKSELPQDPHTKKALEAHCRADELASQDGR
          470       480       490       500       510       520    

>>CCDS53912.1 PPP2R5C gene_id:5527|Hs108|chr14            (555 aa)
 initn: 1989 init1: 1690 opt: 2021  Z-score: 2205.7  bits: 417.8 E(32554): 1.5e-116
Smith-Waterman score: 2034; 65.8% identity (83.9% similar) in 473 aa overlap (23-481:15-484)

               10        20        30        40        50          
pF1KB5 MSSSSPPAGAASAAISASEKVDGFTRKSVRKAQRQKRSQGSSQFRSQGSQAELHPLPQL-
                             : . :: ...:   .:.:.:  . .. ..    ::.: 
CCDS53         MPNKNKKEKESPKAGKSGKSSKEGQDTVESEGTSPEEPSSPKVPPPLLPELL
                       10        20        30        40        50  

               60        70        80         90       100         
pF1KB5 ---------KDATSNEQQELFCQKLQQCCILFDFM-DSVSDLKSKEIKRATLNELVEYVS
                .:.   .:..:: :::.:::.::::. : .:::: ::.:::.:.:.:::..
CCDS53 VLIFGGLQGRDVPPADQEKLFIQKLRQCCVLFDFVSDPLSDLKWKEVKRAALSEMVEYIT
             60        70        80        90       100       110  

     110       120       130       140          150       160      
pF1KB5 TNRGVIVESAYSDIVKMISANIFRTLPPSDNP---DFDPEEDEPTLEASWPHIQLVYEFF
        ::.::.:  : ..:.:...:.:::::::.::   .::::::::::::.:::.:::::::
CCDS53 HNRNVITEPIYPEVVHMFAVNMFRTLPPSSNPTGAEFDPEEDEPTLEAAWPHLQLVYEFF
            120       130       140       150       160       170  

        170       180       190       200       210       220      
pF1KB5 LRFLESPDFQPSIAKRYIDQKFVQQLLELFDSEDPRERDFLKTVLHRIYGKFLGLRAFIR
       :::::::::::.:::.::::::: :::::::::::::::::::.:::::::::::::.::
CCDS53 LRFLESPDFQPNIAKKYIDQKFVLQLLELFDSEDPRERDFLKTTLHRIYGKFLGLRAYIR
            180       190       200       210       220       230  

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB5 KQINNIFLRFIYETEHFNGVAELLEILGSIINGFALPLKAEHKQFLMKVLIPMHTAKGLA
       ::::::: :::::::: ::.::::::::::::::::::: ::: ::.:::.:.: .:.:.
CCDS53 KQINNIFYRFIYETEHHNGIAELLEILGSIINGFALPLKEEHKIFLLKVLLPLHKVKSLS
            240       250       260       270       280       290  

        290       300       310       320       330       340      
pF1KB5 LFHAQLAYCVVQFLEKDTTLTEPVIRGLLKFWPKTCSQKEVMFLGEIEEILDVIEPTQFK
       ..: :::::::::::::.::::::. .:::.:::: : ::::::.:.:::::::::..: 
CCDS53 VYHPQLAYCVVQFLEKDSTLTEPVVMALLKYWPKTHSPKEVMFLNELEEILDVIEPSEFV
            300       310       320       330       340       350  

        350       360       370       380       390       400      
pF1KB5 KIEEPLFKQISKCVSSSHFQVAERALYFWNNEYILSLIEENIDKILPIMFASLYKISKEH
       :: ::::.:..::::: ::::::::::.::::::.::: .:  ::::::: :::. :: :
CCDS53 KIMEPLFRQLAKCVSSPHFQVAERALYYWNNEYIMSLISDNAAKILPIMFPSLYRNSKTH
            360       370       380       390       400       410  

        410       420       430       440       450       460      
pF1KB5 WNPTIVALVYNVLKTLMEMNGKLFDDLTSSYKAERQREKKKELEREELWKKLEELKLKKA
       :: :: .:.::.:: .:::: ::::: :...:::. .:: :  :::: : :.:.:   ::
CCDS53 WNKTIHGLIYNALKLFMEMNQKLFDDCTQQFKAEKLKEKLKMKEREEAWVKIENLA--KA
            420       430       440       450       460         470

        470       480                                              
pF1KB5 LEKQNSAYNMHSILSNTSAE                                        
        . : ..:.. : .:                                             
CCDS53 -NPQYTVYSQASTMSIPVAMETDGPLFEDVQMLRKTVKDEAHQAQKDPKKDRPLARRKSE
               480       490       500       510       520         




486 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 10:29:24 2016 done: Sat Nov  5 10:29:24 2016
 Total Scan time:  3.260 Total Display time:  0.100

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com