Result of FASTA (ccds) for
pFN21AF0006
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KF0006, 749 aa
1>>>pF1KF0006 749 - 749 aa - 749 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7053+/-0.00127; mu= 12.5239+/- 0.075
mean_var=123.8456+/-26.917, 0's: 0 Z-trim(104.3): 159 B-trim: 132 in 1/50
Lambda= 0.115248
statistics sampled from 7644 (7843) to 7644 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.241), width: 16
Scan time: 3.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22 ( 749) 5014 846.2 0
CCDS45314.1 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 ( 963) 696 128.3 5.5e-29
CCDS32301.2 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 ( 914) 682 126.0 2.7e-28
CCDS59137.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 468) 659 121.9 2.2e-27
CCDS75865.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 928) 659 122.2 3.8e-27
CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4 (1266) 589 110.6 1.5e-23
CCDS35080.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 917) 582 109.4 2.7e-23
CCDS14522.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX (1120) 572 107.8 9.9e-23
CCDS4450.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1233) 561 106.0 3.8e-22
CCDS43408.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1250) 561 106.0 3.8e-22
CCDS46375.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1140) 531 100.9 1.1e-20
CCDS82486.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1155) 531 101.0 1.1e-20
CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 336) 475 91.2 2.8e-18
CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 344) 460 88.8 1.6e-17
CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 508) 433 84.4 4.9e-16
CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 515) 433 84.4 4.9e-16
CCDS8162.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 ( 446) 431 84.0 5.6e-16
CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16 ( 808) 423 82.9 2.2e-15
CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1168) 403 79.7 3e-14
CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1235) 398 78.9 5.5e-14
CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1290) 398 78.9 5.7e-14
CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1298) 398 78.9 5.7e-14
CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 794) 383 76.2 2.2e-13
CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 805) 383 76.2 2.2e-13
CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 810) 383 76.2 2.2e-13
CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 821) 383 76.2 2.3e-13
CCDS14523.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX ( 632) 381 75.8 2.3e-13
CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 828) 378 75.4 4e-13
CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 845) 378 75.4 4.1e-13
CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 ( 815) 374 74.7 6.3e-13
CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9 (1069) 366 73.5 2e-12
>>CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22 (749 aa)
initn: 5014 init1: 5014 opt: 5014 Z-score: 4515.5 bits: 846.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5014; 100.0% identity (100.0% similar) in 749 aa overlap (1-749:1-749)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFYYDEFGFRVYKEEGDEPGSS
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CCDS14 MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFYYDEFGFRVYKEEGDEPGSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KF0 LLANSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWDKIAVSLPRSEKLRSLVLAGIPHGMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLANSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWDKIAVSLPRSEKLRSLVLAGIPHGMR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KF0 PQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KF0 VPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPASYFSTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPASYFSTT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KF0 LLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KF0 FFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KF0 LTDVAVETQRRKHLAYLIADQGQLLGAGTLTNLSQVVRRRTQRRKSTITALLFGEDDLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LTDVAVETQRRKHLAYLIADQGQLLGAGTLTNLSQVVRRRTQRRKSTITALLFGEDDLEA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KF0 LKAKNIKQTELVADLREAILRVARHFQCTDPKNCSVELTPDYSMESHQRDHENYVACSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LKAKNIKQTELVADLREAILRVARHFQCTDPKNCSVELTPDYSMESHQRDHENYVACSRS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KF0 HRRRAKALLDFERHDDDELGFRKNDIITIVSQKDEHCWVGELNGLRGWFPAKFVEVLDER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HRRRAKALLDFERHDDDELGFRKNDIITIVSQKDEHCWVGELNGLRGWFPAKFVEVLDER
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KF0 SKEYSIAGDDSVTEGVTDLVRGTLCPALKALFEHGLKKPSLLGGACHPWLFIEEAAGREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SKEYSIAGDDSVTEGVTDLVRGTLCPALKALFEHGLKKPSLLGGACHPWLFIEEAAGREV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KF0 ERDFASVYSRLVLCKTFRLDEDGKVLTPEELLYRAVQSVNVTHDAVHAQMDVKLRSLICV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ERDFASVYSRLVLCKTFRLDEDGKVLTPEELLYRAVQSVNVTHDAVHAQMDVKLRSLICV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KF0 GLNEQVLHLWLEVLCSSLPTVEKWYQPWSFLRSPGWVQIKCELRVLCCFAFSLSQDWELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GLNEQVLHLWLEVLCSSLPTVEKWYQPWSFLRSPGWVQIKCELRVLCCFAFSLSQDWELP
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KF0 AKREAQQPLKEGVRDMLVKHHLFSWDVDG
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AKREAQQPLKEGVRDMLVKHHLFSWDVDG
730 740
>>CCDS45314.1 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 (963 aa)
initn: 688 init1: 606 opt: 696 Z-score: 633.9 bits: 128.3 E(32554): 5.5e-29
Smith-Waterman score: 708; 34.4% identity (65.6% similar) in 387 aa overlap (6-374:551-925)
10 20 30
pF1KF0 MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESA
::.:. .. : . : : . . . ::
CCDS45 ERDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQ--LLEDALQVESQ
530 540 550 560 570
40 50 60 70 80
pF1KF0 EQPE--FY-------YDEFGFRVYKEEGDEPGSSLLANSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHN
:::: : :: .:::. :. .: .:.:. .. :. : .:.:
CCDS45 EQPEQAFVKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEE--KLVAKVRALD-----LK---TLYLTEN
580 590 600 610 620
90 100 110 120 130
pF1KF0 HDVGD-LTWDK-IAVSLPR----SEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKK--RNSE
..:. . :.. .: .. : : .:..:. ::::: : ..: .: :.:
CCDS45 QEVSTGVKWENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTE
630 640 650 660 670 680
140 150 160 170 180 190
pF1KF0 LS-YREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPE
. .. ..... . .. :.:::: :::::.:.: .. : :. .:: :: :..: :.
CCDS45 PGHFQTLLQKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPD
690 700 710 720 730 740
200 210 220 230 240 250
pF1KF0 IGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQ
:::::: . ..: ::.::.::::: . .:.: ..: .:.. :::: :.::::.: :. .
CCDS45 IGYCQGLNRLVAVALLYLEQEDAFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSE
750 760 770 780 790 800
260 270 280 290 300 310
pF1KF0 YLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGML
:::: .... .. .:::..:::..:.. : .:..::: :.::: .:.:...:...
CCDS45 KLPRLHGHFEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALF
810 820 830 840 850 860
320 330 340 350 360 370
pF1KF0 HLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYL
. ::::... ..: :::. : . . ::. :..... . . ....: ::
CCDS45 KYKEEEILKLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARKLISISFGDLNPFPLRQIRNRRAYHLEKV
870 880 890 900 910 920
380 390 400 410 420 430
pF1KF0 IADQGQLLGAGTLTNLSQVVRRRTQRRKSTITALLFGEDDLEALKAKNIKQTELVADLRE
CCDS45 RLELTELEAIREDFLRERDTSPDKGELVSDEEEDT
930 940 950 960
>>CCDS32301.2 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 (914 aa)
initn: 674 init1: 592 opt: 682 Z-score: 621.6 bits: 126.0 E(32554): 2.7e-28
Smith-Waterman score: 694; 35.8% identity (66.1% similar) in 360 aa overlap (6-347:551-898)
10 20 30
pF1KF0 MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESA
::.:. .. : . : : . . . ::
CCDS32 ERDLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQ--LLEDALQVESQ
530 540 550 560 570
40 50 60 70 80
pF1KF0 EQPE--FY-------YDEFGFRVYKEEGDEPGSSLLANSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHN
:::: : :: .:::. :. .: .:.:. .. :. : .:.:
CCDS32 EQPEQAFVKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEE--KLVAKVRALD-----LK---TLYLTEN
580 590 600 610 620
90 100 110 120 130
pF1KF0 HDVGD-LTWDK-IAVSLPR----SEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKK--RNSE
..:. . :.. .: .. : : .:..:. ::::: : ..: .: :.:
CCDS32 QEVSTGVKWENYFASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTE
630 640 650 660 670 680
140 150 160 170 180 190
pF1KF0 LS-YREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPE
. .. ..... . .. :.:::: :::::.:.: .. : :. .:: :: :..: :.
CCDS32 PGHFQTLLQKALEKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPD
690 700 710 720 730 740
200 210 220 230 240 250
pF1KF0 IGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQ
:::::: . ..: ::.::.::::: . .:.: ..: .:.. :::: :.::::.: :. .
CCDS32 IGYCQGLNRLVAVALLYLEQEDAFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSE
750 760 770 780 790 800
260 270 280 290 300 310
pF1KF0 YLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGML
:::: .... .. .:::..:::..:.. : .:..::: :.::: .:.:...:...
CCDS32 KLPRLHGHFEQYKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALF
810 820 830 840 850 860
320 330 340 350 360 370
pF1KF0 HLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYL
. ::::... ..: :::. : . . ::
CCDS32 KYKEEEILKLQDSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAPTTWRKSGWS
870 880 890 900 910
>>CCDS59137.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 (468 aa)
initn: 479 init1: 403 opt: 659 Z-score: 605.0 bits: 121.9 E(32554): 2.2e-27
Smith-Waterman score: 663; 33.3% identity (61.0% similar) in 415 aa overlap (22-419:77-465)
10 20 30 40
pF1KF0 MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFY----YDEFGF
:: : .. : :... :. :::.::
CCDS59 ESKYLAGLRRLQEALGDEASECSELLRQLVQEAL-QWEAGEASSDSIELSPISKYDEYGF
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90
pF1KF0 RVYKEEGDEPGSSLLANSPLME------------DAPQRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWD
. . : .:::. .: : : : :: : .:::
CCDS59 LTVPDYEVED-LKLLAKIQALESRSHHLLGLEAVDRPLRERWAA---------LGDL---
110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KF0 KIAVSLPRSEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIA
.: .: :..:. ::.:. ::..: : .. .. :.:... .. : :
CCDS59 -----VPSAE-LKQLLRAGVPREHRPRVWRWLVHLRVQHLHTPGCYQELLSRGQAREHPA
160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KF0 AKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFL
:.::: :: ::.:.: :. : .::::: :..: : :::::: . .:: :: :
CCDS59 ARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAAIALLVL
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KF0 EEED-AFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELS
:::. ::: . ::.: ..::.:. .:: . :.:::::. :. . :::: : .: ..::
CCDS59 EEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQHHVDLS
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KF0 LITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIF
:.:..:::..::. . ..:::.:: :.:::..:.:. .:.... .:.:... .:. :.
CCDS59 LVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKVVFRYALAIFKYNEKEILRLQNGLEIY
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KF0 NTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYLIADQGQLLGAGTLTNLS
. : . . . ... :...:. . . .. : : : :. .: .
CCDS59 QYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLK-----A
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KF0 QVVRRRTQRRKSTITALLFGEDDLEALKAKNIKQTELVADLREAILRVARHFQCTDPKNC
. ..::..::.. .. .::..:
CCDS59 EYLERRASRRRA-VSEGCASEDEVEGEA
450 460
>>CCDS75865.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 (928 aa)
initn: 479 init1: 403 opt: 659 Z-score: 600.8 bits: 122.2 E(32554): 3.8e-27
Smith-Waterman score: 663; 33.3% identity (61.0% similar) in 415 aa overlap (22-419:537-925)
10 20 30 40
pF1KF0 MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFY----YDEFGF
:: : .. : :... :. :::.::
CCDS75 ESKYLAGLRRLQEALGDEASECSELLRQLVQEAL-QWEAGEASSDSIELSPISKYDEYGF
510 520 530 540 550 560
50 60 70 80 90
pF1KF0 RVYKEEGDEPGSSLLANSPLME------------DAPQRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWD
. . : .:::. .: : : : :: : .:::
CCDS75 LTVPDYEVED-LKLLAKIQALESRSHHLLGLEAVDRPLRERWAA---------LGDL---
570 580 590 600 610
100 110 120 130 140 150
pF1KF0 KIAVSLPRSEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIA
.: .: :..:. ::.:. ::..: : .. .. :.:... .. : :
CCDS75 -----VPSAE-LKQLLRAGVPREHRPRVWRWLVHLRVQHLHTPGCYQELLSRGQAREHPA
620 630 640 650 660
160 170 180 190 200 210
pF1KF0 AKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFL
:.::: :: ::.:.: :. : .::::: :..: : :::::: . .:: :: :
CCDS75 ARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAAIALLVL
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220 230 240 250 260 270
pF1KF0 EEED-AFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELS
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CCDS75 EEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQHHVDLS
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pF1KF0 LITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIF
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CCDS75 LVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKVVFRYALAIFKYNEKEILRLQNGLEIY
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pF1KF0 NTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYLIADQGQLLGAGTLTNLS
. : . . . ... :...:. . . .. : : : :. .: .
CCDS75 QYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLK-----A
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. ..::..::.. .. .::..:
CCDS75 EYLERRASRRRA-VSEGCASEDEVEGEA
910 920
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:. .. .. :. : : : : ..
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.:. : .. . . .:... . :: ... .: :: .. . :.
CCDS47 NGNSVPTATQTLMTMYRRRSPEEFNPKLAKEFLKEQ-----AW-KIHFAEYGQGICMYRT
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pF1KF0 EKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLL
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CCDS47 EKTRELVLKGIPESMRGELWLLLSGAINEKATHPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLH
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CCDS47 VALCERMLP-DYYNTRVVGALVDQGVFEELARDYVPQLYDCMQDLGV-ISTISLSWFLTL
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pF1KF0 FASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQM
: ::. .. . . : ::::: .:.:::.:..: . ..:.. .... ...:. ...
CCDS47 FLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKVIFQLALAVLDANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDSV
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. . : .: . :.: :: . . :: . . .: : . ..
CCDS47 TNKDSTLPPIPHLHSLLSD-DVEPYPEVDIFRLIRTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKV
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pF1KF0 -QVVRRRTQRR--KSTITALLFGEDDLEALKAKNIKQTELVADLREAILRVARHFQCTDP
:... :.: .. .: : :.:: : :
CCDS47 IQTLEDTTKRNVVRTIVTETSFTIDELEELYALFKAEHLTSCYWGGSSNALDRHDPSLPY
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CCDS47 LEQYRIDFEQFKGMFALLFPWACGTHSDVLASRLFQLLDENGDSLINFREFVSGLSAACH
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CCDS35 -----VPSAE-LKQLLRAGVPREHRPRVWRWLVHLRVQHLHTPGCYQELLSRGQAREHPA
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CCDS35 ARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAAIALLVL
670 680 690 700 710 720
220 230 240 250 260 270
pF1KF0 EEED-AFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELS
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CCDS35 EEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQHHVDLS
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pF1KF0 LITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIF
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CCDS35 LVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKY-----------NEKEILRLQNGLEIY
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. : . . . ... :...:. . . .. : : : :. .: .
CCDS35 QYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLK-----A
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. ..::..::.. .. .::..:
CCDS35 EYLERRASRRRA-VSEGCASEDEVEGEA
900 910
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CCDS14 QNLETLNSKMLKEKMKEQSWKILFAECGRGVSMFRTKKTRDLVVRGIPETLRGELWMLFS
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CCDS14 GAVNDMATNPDYYTEVVEQSLGTCNLATEEIERDLRRSLPEHPAFQS--DTGISALRRVL
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CCDS14 TAYAYRNPKIGYCQAMNILTSVLLLYAKEEEAFWLLVAVCERMLP-DYFNRRIIGALVDQ
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:...:: ..::.: . . . . .: ..: :::: : ::. :. . . : :::.: ..
CCDS14 AVFEELIRDHLPQLTEHMTDMTF-FSSVSLSWFLTLFISVLPIESAVNVVDCFFYDGIKA
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..:: :..: . ..:. ...: ..:. . ... . . : .. .....: . .
CCDS14 ILQLGLAILDYNLDKLLTCKDDAEAVTALNRFFDNVTNKDSPLPSNVQQGSNVSDEKT-S
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. : .. :: .... : .. .. : . : .: .: .... . ....:
CCDS14 HTRVDITDLIRESNEKYGNIRYEDIHSM---RCRNRLYVIQTLEETTKQNVLRVVSQDVK
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CCDS14 LSLQELDELYVIFKKELFLSCYWCLGCPVLKHHDPSLPYLEQYQIDCQQFRALYHLLSPW
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pF1KF0 AKALLDFERHDDDELGFRKNDIITIVSQKDEHCWVGELNGLRGWFPAKFVEVLDERSKEY
CCDS14 AHSANKDSLALWTFRLLDENSDCLINFKEFSSAIDIMYNGSFTEKLKLLFKLHIPPAYTE
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CCDS44 QNELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLP-D
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:..: ..:. .:: ....: ..::.:.. .:. . .: :.: :::: : ::. .. .
CCDS44 YYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEKMQDLGV-ISSISLSWFLTLFLSVMPFESAV
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: : ::::: .:..:..:..: . :.:. . : ::
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. : : .:. : . :: :.... . . . .: .: . .. :.. :
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CCDS44 ----EDIEQMRFK--QRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDI-GFSIEELEDLYMVFKAKHL
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CCDS44 ASQYWGCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRE----LFASLTPWAC--GSHTPL---L
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... ..::: .:. : . :: :.. . .: : ::.:.. : :.:
CCDS44 AGRMFRLLDE-NKDSLINFKEFVT-GMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLP-PALSPEEAESA
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CCDS44 LEAAHYFTEDSSSEEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRHYLRMWAKEKEAQKETIK
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Smith-Waterman score: 589; 28.3% identity (57.5% similar) in 562 aa overlap (32-581:424-932)
10 20 30 40 50 60
pF1KF0 SGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFYYDEFGFRVYKEEGDEPGSS-
.:..::: . .. : . : .:
CCDS43 LQKTPSKQPGSIGSRKASVVDPSTESSPAPQEGSEQPASPASPLSSRQSFCAQEAPTASQ
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pF1KF0 -LLA----NSPLMEDAPQRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWDKIAVSLPRSEKLRSLVLAGI
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CCDS43 GLLKLFQKNSPMEDLGAKGAKEKMKEESWHIH---FFEYGR-GVCMYRTAKTRALVLKGI
460 470 480 490 500
120 130 140 150 160 170
pF1KF0 PHGMRPQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFAS
:...: .::. .::: .. . : :.:..:.. ..:...::.:: :.:: . :
CCDS43 PESLRGELWLLFSGAWNEMVTHPGYYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAF--
510 520 530 540 550 560
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pF1KF0 MGSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPAS
.. .:. ::::: : :. : :::::. ..:.. :::. ::.:::.. :. : .:: .
CCDS43 QNELGIAALRRVLTAYAFRNPTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLP-D
570 580 590 600 610 620
240 250 260 270 280 290
pF1KF0 YFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLL
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CCDS43 YYNTRVVGALVDQGIFEELTRDFLPQLSEKMQDLGV-ISSISLSWFLTLFLSVMPFESAV
630 640 650 660 670 680
300 310 320 330 340 350
pF1KF0 RIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAM
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CCDS43 VIVDCFFYEGIKVILQVALAVLDANMEQLLGCSDE---------------------GEAM
690 700 710 720
360 370 380 390 400 410
pF1KF0 RLAGSLTDVAVETQRRK----HLAYLIADQGQLLGAGTLTNLSQVVRRRTQRRKSTITAL
. : : .:. : . :: :.... . . . .: .: . .. :.. :
CCDS43 TMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPPAEVDIFELLKV----SYEKFSSLRA-
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pF1KF0 LFGEDDLEALKAKNIKQTELVADLREAILRVARHFQCTDPKNCSVELTPD-YSMESHQRD
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CCDS43 ----EDIEQMRFK--QRLKVIQSLEDTAKRSVVRAIPVDI-GFSIEELEDLYMVFKAKHL
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pF1KF0 HENYVACSRSHR-RRAKALLDFERHDDDELGFRKNDIITIVSQKDEHCWVGELNGLRGWF
.: .:::. :: .: .:.. : ::. ..: : : . : .
CCDS43 ASQYWGCSRTMAGRRDPSLPYLEQYRIDASQFRE----LFASLTPWAC--GSHTPL---L
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pF1KF0 PAKFVEVLDERSKEYSIAGDDSVTEGVTDLVRGTLCPALKALFEHGLKKPSLLGGACHPW
... ..::: .:. : . :: :.. . .: : ::.:.. : :.:
CCDS43 AGRMFRLLDE-NKDSLINFKEFVT-GMSGMYHGDLTEKLKVLYKLHLP-PALSPEEAESA
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pF1KF0 LFIEEAAGREVERDFASVYSRLVLCKTFRLDEDGKVLTPEELLYRAVQSVNVTHDAVHAQ
CCDS43 LEAAHYFTEDSSSEASPLASDLDLFLPWEAQEALPQEEQEGSGSEERGEEKGTSSPDYRH
950 960 970 980 990 1000
749 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]