Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9830
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9830, 342 aa
1>>>pF1KB9830 342 - 342 aa - 342 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3599+/-0.00114; mu= 15.3157+/- 0.067
mean_var=114.9604+/-36.564, 0's: 0 Z-trim(102.1): 244 B-trim: 868 in 2/44
Lambda= 0.119619
statistics sampled from 6487 (6809) to 6487 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.553), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 1.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3 ( 342) 2256 401.2 6.4e-112
CCDS3158.2 P2RY13 gene_id:53829|Hs108|chr3 ( 354) 1075 197.4 1.5e-50
CCDS3156.1 P2RY14 gene_id:9934|Hs108|chr3 ( 338) 1001 184.6 9.9e-47
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 ( 358) 918 170.3 2.1e-42
CCDS3155.1 GPR171 gene_id:29909|Hs108|chr3 ( 319) 656 125.1 8e-29
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 575 111.2 1.5e-24
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 522 102.0 7.9e-22
CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 ( 342) 517 101.1 1.4e-21
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 489 96.3 4e-20
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 486 95.8 5.7e-20
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 458 91.0 1.7e-18
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 444 88.6 9.3e-18
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 441 88.0 1.3e-17
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 437 87.3 2.1e-17
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 437 87.4 2.2e-17
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 437 87.4 2.2e-17
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 429 85.9 5.2e-17
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 423 84.9 1.1e-16
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CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 419 84.3 1.9e-16
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CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 419 84.3 2e-16
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 419 84.3 2e-16
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 419 84.4 2.2e-16
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 415 83.6 3.1e-16
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 405 81.8 9.8e-16
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 404 81.7 1.1e-15
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CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 398 80.6 2.2e-15
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 395 80.1 3.2e-15
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 394 79.9 3.4e-15
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 392 79.5 4.3e-15
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 390 79.2 5.7e-15
CCDS14442.1 P2RY10 gene_id:27334|Hs108|chrX ( 339) 384 78.1 1.1e-14
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 ( 363) 384 78.2 1.2e-14
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 380 77.5 1.9e-14
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 ( 387) 380 77.5 2e-14
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CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 375 76.6 3.4e-14
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 372 76.1 4.9e-14
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 371 76.0 5.8e-14
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 370 75.8 6.2e-14
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 366 75.0 9.3e-14
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 366 75.1 1e-13
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 366 75.1 1.1e-13
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 365 74.9 1.2e-13
>>CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3 (342 aa)
initn: 2256 init1: 2256 opt: 2256 Z-score: 2122.8 bits: 401.2 E(32554): 6.4e-112
Smith-Waterman score: 2256; 100.0% identity (100.0% similar) in 342 aa overlap (1-342:1-342)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIRSKSNFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIRSKSNFI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGLITI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGLITI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 DRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQPRDKNVKKCSFLKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQPRDKNVKKCSFLKS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 EFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGKVPRKKVNVKVFI
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CCDS31 EFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGKVPRKKVNVKVFI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 IIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNACLDPFIYFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNACLDPFIYFF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB9 LCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
310 320 330 340
>>CCDS3158.2 P2RY13 gene_id:53829|Hs108|chr3 (354 aa)
initn: 1094 init1: 1047 opt: 1075 Z-score: 1021.2 bits: 197.4 E(32554): 1.5e-50
Smith-Waterman score: 1075; 48.7% identity (78.8% similar) in 316 aa overlap (17-332:36-349)
10 20 30 40
pF1KB9 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLA
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CCDS31 RRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 MRIFFQIRSKSNFIIFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYF
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CCDS31 LWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFYE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 TMYISISFLGLITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQ
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CCDS31 TMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNTILSNKE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 PRDKNVKKCSFLKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGV
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CCDS31 ATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYRKSKSK
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 GKVPRKKVNVKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWL
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CCDS31 DRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKETTLFL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 TSLNACLDPFIYFFLCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
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CCDS31 AATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTAS--SQENHSSQTDNITLG
310 320 330 340 350
>>CCDS3156.1 P2RY14 gene_id:9934|Hs108|chr3 (338 aa)
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Smith-Waterman score: 1001; 46.8% identity (77.5% similar) in 316 aa overlap (4-319:2-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIRSKSNFI
... .. : . : :... ::: ..:.:: ..:..:.. ::.. ::: . :...::
CCDS31 MINSTSTQPPDES-CSQNLLITQQIIPVLYCMVFIAGILLNGVSGWIFFYVPSSKSFI
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70 80 90 100 110 120
pF1KB9 IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGLITI
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CCDS31 IYLKNIVIADFVMSLTFPFKILGDSGLGPWQLNVFVCRVSAVLFYVNMYVSIVFFGLISF
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130 140 150 160 170 180
pF1KB9 DRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQPRDKNVKKCSFLKS
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190 200 210 220 230 240
pF1KB9 EFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGKVPRKKVNVKVFI
:.: ::. ::: .:::: ::..:: :: :::....:.... . .:: . ..:
CCDS31 ELGRKWHKASNYIFVAIFWIVFLLLIVFYTAITKKIFKSHLKSSRNSTSVKKKSSRNIFS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 IIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNACLDPFIYFF
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CCDS31 IVFVFFVCFVPYHIARIPYTKSQTEAHYSCQSKEILRYMKEFTLLLSAANVCLDPIIYFF
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pF1KB9 LCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
::. ::. : . :. : .:
CCDS31 LCQPFREILCKKLHIPLKAQNDLDISRIKRGNTTLESTDTL
300 310 320 330
>>CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 (358 aa)
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Smith-Waterman score: 918; 42.2% identity (73.3% similar) in 329 aa overlap (6-330:25-348)
10 20 30 40
pF1KB9 MQAVDNLTSAPG-NTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGL
: ...:: ::.: .. ...:.:: ..: ...
CCDS31 MGFNLTLAKLPNNELHGQESHNSGNRSDGPGKNTTL---HNEFDTIVLPVLYLIIFVASI
10 20 30 40 50
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pF1KB9 ITNGLAMRIFFQIRSKSNFIIFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVT
. ::::. :::.::.:..::..::: :..::.: :::::.:. :: .: .. ..:. :
CCDS31 LLNGLAVWIFFHIRNKTSFIFYLKNIVVADLIMTLTFPFRIVHDAGFGPWYFKFILCRYT
60 70 80 90 100 110
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pF1KB9 SVIFYFTMYISISFLGLITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNM
::.:: .:: :: :::::.:::: :...:: : .. .:.::: .:..: .:::::.
CCDS31 SVLFYANMYTSIVFLGLISIDRYLKVVKPFGDSRMYSITFTKVLSVCVWVIMAVLSLPNI
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 ILTNRQPRDKNVKKCSFLKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSY
:::: :: . :.. :: ::: .:. :: :.:. . .: ..:.: :: :.. ...:
CCDS31 ILTNGQPTEDNIHDCSKLKSPLGVKWHTAVTYVNSCLFVAVLVILIGCYIAISRYIHKS-
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB9 VRTRGVGKVPRK-KVNVKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYV
. ... :: : : .. ...:::: ::.:.:. :::.:.:. ..: .:.. :.:
CCDS31 -SRQFISQSSRKRKHNQSIRVVVAVFFTCFLPYHLCRIPFTFSHLDRLLDESAQKILYYC
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 KESTLWLTSLNACLDPFIYFFLCKSFRNSLI--SMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPN
:: ::.:.. :.::::.::::.:.:: :. : .. . . :. :..:
CCDS31 KEITLFLSACNVCLDPIIYFFMCRSFSRRLFKKSNIRTRSESIRSLQSVRRSEVRIYYDY
300 310 320 330 340 350
340
pF1KB9 EETPM
CCDS31 TDV
>>CCDS3155.1 GPR171 gene_id:29909|Hs108|chr3 (319 aa)
initn: 571 init1: 315 opt: 656 Z-score: 630.9 bits: 125.1 E(32554): 8e-29
Smith-Waterman score: 656; 34.4% identity (68.1% similar) in 320 aa overlap (13-327:3-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIRSKSNFI
:.:. :: . : .. ..:.::.: . .: :.: .. .
CCDS31 MTNSSFFCPVYKDLEP-FTYFFYLVFLVGIIGSCFATWAFIQKNTNHRCV
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB9 -IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGP--LRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGL
:.: : . .:.:. :..: ::. : ::..: :. : ::::. ..:..::.:: ::..
CCDS31 SIYLINLLTADFLLTLALPVKIVVD--LGVAPWKLKIFHCQVTACLIYINMYLSIIFLAF
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 ITIDRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQPRDKNVKKCSF
..::: . :. : .. ::..:.:.: ...:. .:::.. .. ..:. :
CCDS31 VSIDRCLQLTHSCKIYRIQEPGFAKMISTVVWLMVLLIMVPNMMIPIKDIKEKSNVGCME
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 LKSEFGLVWHEIVNYICQVIFWINF-LIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGKVPR-KKVN
.:.::: :: ..:.:: .:: .:: :... :. ..:::. . . : ::.
CCDS31 FKKEFGRNWHLLTNFICVAIF-LNFSAIILISNCLVIRQLYRN----KDNENYPNVKKAL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 VKVFIIIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNACLDP
...... . ..:::::.:..:::::::::. . ::... .:: .::.:: :. : :.::
CCDS31 INILLVTTGYIICFVPYHIVRIPYTLSQTEVITDCSTRISLFKAKEATLLLAVSNLCFDP
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340
pF1KB9 FIYFFLCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
..:. : :.::... . :. . . .. :
CCDS31 ILYYHLSKAFRSKVTETFASPKETKAQKEKLRCENNA
290 300 310
>>CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX (381 aa)
initn: 325 init1: 269 opt: 575 Z-score: 554.5 bits: 111.2 E(32554): 1.5e-24
Smith-Waterman score: 575; 32.6% identity (64.6% similar) in 316 aa overlap (2-313:32-342)
10 20 30
pF1KB9 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLL
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CCDS14 KIGKNLLRISKRRSKFPNSGKYATTARN--SFIVLIIFTICFVPYHAFRFIYISSQL-NV
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330 340
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CCDS14 SEFKPGYSLHDTSVAVKIQSSSKST
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CCDS94 FMTCLSIDRFIAVVHPLRYNKIKRIEHAKGVCIFVWILVFAQTLPLLINPMSKQEAERIT
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CCDS94 SKSSNGK
360
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CCDS31 EIKIFMVNLTMADMLFLITLPLWIVYYQNQGNWILPKFLCNVAGCLFFINTYCSVAFLGV
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CCDS31 ALWM-VCTVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAEL-GFQDSKFHQAINDAHQVTLCLLSTNCV
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CCDS94 TTYMINLAMSDLLFVFTLPFRIFY-FTTRNWPFGDLLCKISVMLFYTNMYGSILFLTCIS
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CCDS94 VDRFLAIVYPFKSKTLRTKRNAKIVCTGVWLTVIGGSAPAVFVQSTHSQGNNASEACFEN
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CCDS94 FPEATWKTYLSRIVIFIEIVGFFIPLILNVTCSSMVLKTLTKPVTLSR--SKINKTKVLK
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CCDS94 MIFVHLIIFCFCFVPYNINLILYSLVRTQTFVNCSVVAAVRTMYPITLCIAVSNCCFDPI
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CCDS94 VYYFTSDTIQNSIKMKNWSVRRSDFRFSEVHGAENFIQHNLQTLKSKIFDNESAA
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CCDS94 MERKFMSLQPSISVSEMEPNGTFSNNNSRNCTIENFK--REFFPIVYLIIFFWGVLGNGL
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CCDS94 GSEQNGSVTSCLEL-NLYKIAKLQTMNYIALVVGCLLPFFTLSICYLLIIRVLLKVEVPE
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CCDS94 SGL-RVSHRKALTTIIITLIIFFLCFLPYHTLRTVHL--TTWKVGLC--KDRLHKALVIT
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342 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Fri Nov 4 19:32:40 2016 done: Fri Nov 4 19:32:41 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]