Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9767
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9767, 947 aa
1>>>pF1KB9767 947 - 947 aa - 947 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2177+/-0.00118; mu= -0.9728+/- 0.071
mean_var=243.8208+/-49.035, 0's: 0 Z-trim(110.0): 78 B-trim: 112 in 1/51
Lambda= 0.082137
statistics sampled from 11260 (11321) to 11260 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.348), width: 16
Scan time: 3.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS735.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1 ( 947) 6145 742.1 1.2e-213
CCDS72820.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1 ( 951) 6127 740.0 5.1e-213
CCDS55616.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1 ( 874) 5647 683.1 6.3e-196
CCDS55615.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1 ( 901) 5400 653.8 4.2e-187
CCDS82307.1 BRD4 gene_id:23476|Hs108|chr19 ( 794) 945 125.9 3.1e-28
CCDS12328.1 BRD4 gene_id:23476|Hs108|chr19 (1362) 950 126.6 3.2e-28
CCDS46004.1 BRD4 gene_id:23476|Hs108|chr19 ( 722) 942 125.5 3.7e-28
CCDS6980.1 BRD3 gene_id:8019|Hs108|chr9 ( 726) 722 99.4 2.6e-20
CCDS56421.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6 ( 754) 701 97.0 1.5e-19
CCDS4762.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6 ( 801) 701 97.0 1.6e-19
CCDS56420.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6 ( 836) 701 97.0 1.6e-19
>>CCDS735.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1 (947 aa)
initn: 6145 init1: 6145 opt: 6145 Z-score: 3949.4 bits: 742.1 E(32554): 1.2e-213
Smith-Waterman score: 6145; 99.8% identity (99.9% similar) in 947 aa overlap (1-947:1-947)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LKLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNKPGDDIVLMAQ
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LQLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNKPGDDIVLMAQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 ALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKGTQQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQEIPSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKGTQQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQEIPSV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 FPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATSAVKASSEFSPTFTEKSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATSAVKASSEFSPTFTEKSV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 ALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNPVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNPVD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 VNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEVVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEVVT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 MARMLQDVFETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTNEASSEGNSSDDSEDERV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MARMLQDVFETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTNEASSEGNSSDDSEDERV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 KRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNENPRKMCEQMRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNENPRKMCEQMRL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 KEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHIIQSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHIIQSR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 EPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPPAKKIMMSKEELHSQKKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPPAKKIMMSKEELHSQKKQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 ELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLSESSSSSSSSSESESSSSDLSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLSESSSSSSSSSESESSSSDLSSS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 DSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECILPEGRTGVTQIGYCVQDTTSANTTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECIPPEGRTGVTQIGYCVQDTTSANTTL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 VHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQILPPSGDSEQLSNGITVMHPSGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQILPPSGDSEQLSNGITVMHPSGD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 SDTTMLESECQAPVQKDIKIKNADSWKSLGKPVKPSGVMKSSDELFNQFRKAAIEKEVKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SDTTMLESECQAPVQKDIKIKNADSWKSLGKPVKPSGVMKSSDELFNQFRKAAIEKEVKA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 RTQELIRKHLEQNTKELKASQENQRDLGNGLTVESFSNKIQNKCSGEEQKEHQQSSEAQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RTQELIRKHLEQNTKELKASQENQRDLGNGLTVESFSNKIQNKCSGEEQKEHQQSSEAQD
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940
pF1KB9 KSKLWLLKDRDLARQKEQERRRREAMVGTIDMTLQSDIMTMFENNFD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 KSKLWLLKDRDLARQKEQERRRREAMVGTIDMTLQSDIMTMFENNFD
910 920 930 940
>>CCDS72820.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1 (951 aa)
initn: 5156 init1: 5156 opt: 6127 Z-score: 3937.8 bits: 740.0 E(32554): 5.1e-213
Smith-Waterman score: 6127; 99.4% identity (99.5% similar) in 951 aa overlap (1-947:1-951)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LKLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNKPGDDIVLMAQ
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LQLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNKPGDDIVLMAQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB9 ALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKG----TQQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQE
::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKGKAGGTQQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 IPSVFPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATSAVKASSEFSPTFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IPSVFPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATSAVKASSEFSPTFT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 EKSVALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EKSVALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFY
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 NPVDVNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 NPVDVNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDH
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 EVVTMARMLQDVFETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTNEASSEGNSSDDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EVVTMARMLQDVFETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTNEASSEGNSSDDSE
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 DERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNENPRKMCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNENPRKMCE
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 QMRLKEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QMRLKEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHI
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 IQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPPAKKIMMSKEELHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPPAKKIMMSKEELHS
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB9 QKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLSESSSSSSSSSESESSSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLSESSSSSSSSSESESSSSD
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB9 LSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECILPEGRTGVTQIGYCVQDTTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS72 LSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECIPPEGRTGVTQIGYCVQDTTSA
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB9 NTTLVHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQILPPSGDSEQLSNGITVMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 NTTLVHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQILPPSGDSEQLSNGITVMH
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB9 PSGDSDTTMLESECQAPVQKDIKIKNADSWKSLGKPVKPSGVMKSSDELFNQFRKAAIEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PSGDSDTTMLESECQAPVQKDIKIKNADSWKSLGKPVKPSGVMKSSDELFNQFRKAAIEK
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KB9 EVKARTQELIRKHLEQNTKELKASQENQRDLGNGLTVESFSNKIQNKCSGEEQKEHQQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EVKARTQELIRKHLEQNTKELKASQENQRDLGNGLTVESFSNKIQNKCSGEEQKEHQQSS
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940
pF1KB9 EAQDKSKLWLLKDRDLARQKEQERRRREAMVGTIDMTLQSDIMTMFENNFD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EAQDKSKLWLLKDRDLARQKEQERRRREAMVGTIDMTLQSDIMTMFENNFD
910 920 930 940 950
>>CCDS55616.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1 (874 aa)
initn: 5647 init1: 5647 opt: 5647 Z-score: 3631.0 bits: 683.1 E(32554): 6.3e-196
Smith-Waterman score: 5647; 99.9% identity (99.9% similar) in 874 aa overlap (74-947:1-874)
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 WKHSFSWPFQRPVDAVKLKLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFS
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 NCYLYNKPGDDIVLMAQALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKGTQQNIAVSSAKEKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NCYLYNKPGDDIVLMAQALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKGTQQNIAVSSAKEKS
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 SPSATEKVFKQQEIPSVFPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SPSATEKVFKQQEIPSVFPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATS
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 AVKASSEFSPTFTEKSVALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AVKASSEFSPTFTEKSVALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEM
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 LAKKHFSYAWPFYNPVDVNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LAKKHFSYAWPFYNPVDVNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRL
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 MFMNCYKYNPPDHEVVTMARMLQDVFETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MFMNCYKYNPPDHEVVTMARMLQDVFETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTN
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 EASSEGNSSDDSEDERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EASSEGNSSDDSEDERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEK
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 VNNSNENPRKMCEQMRLKEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VNNSNENPRKMCEQMRLKEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNIN
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 KLPGDKLGRVVHIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KLPGDKLGRVVHIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPP
460 470 480 490 500 510
590 600 610 620 630 640
pF1KB9 AKKIMMSKEELHSQKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLSESSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AKKIMMSKEELHSQKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLSESSSS
520 530 540 550 560 570
650 660 670 680 690 700
pF1KB9 SSSSSESESSSSDLSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECILPEGRTGV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS55 SSSSSESESSSSDLSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECIPPEGRTGV
580 590 600 610 620 630
710 720 730 740 750 760
pF1KB9 TQIGYCVQDTTSANTTLVHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQILPPSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TQIGYCVQDTTSANTTLVHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQILPPSG
640 650 660 670 680 690
770 780 790 800 810 820
pF1KB9 DSEQLSNGITVMHPSGDSDTTMLESECQAPVQKDIKIKNADSWKSLGKPVKPSGVMKSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DSEQLSNGITVMHPSGDSDTTMLESECQAPVQKDIKIKNADSWKSLGKPVKPSGVMKSSD
700 710 720 730 740 750
830 840 850 860 870 880
pF1KB9 ELFNQFRKAAIEKEVKARTQELIRKHLEQNTKELKASQENQRDLGNGLTVESFSNKIQNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELFNQFRKAAIEKEVKARTQELIRKHLEQNTKELKASQENQRDLGNGLTVESFSNKIQNK
760 770 780 790 800 810
890 900 910 920 930 940
pF1KB9 CSGEEQKEHQQSSEAQDKSKLWLLKDRDLARQKEQERRRREAMVGTIDMTLQSDIMTMFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CSGEEQKEHQQSSEAQDKSKLWLLKDRDLARQKEQERRRREAMVGTIDMTLQSDIMTMFE
820 830 840 850 860 870
pF1KB9 NNFD
::::
CCDS55 NNFD
>>CCDS55615.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1 (901 aa)
initn: 5398 init1: 5398 opt: 5400 Z-score: 3472.6 bits: 653.8 E(32554): 4.2e-187
Smith-Waterman score: 5732; 94.9% identity (95.0% similar) in 947 aa overlap (1-947:1-901)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LKLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNKPGDDIVLMAQ
:.:: ::::::::::
CCDS55 LQLP----------------------------------------------PGDDIVLMAQ
70
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 ALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKGTQQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQEIPSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALEKLFMQKLSQMPQEEQVVGVKERIKKGTQQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQEIPSV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FPKTSISPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPATSAVKASSEFSPTFTEKSV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNPVD
200 210 220 230 240 250
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEVVT
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 MARMLQDVFETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTNEASSEGNSSDDSEDERV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MARMLQDVFETHFSKIPIEPVESMPLCYIKTDITETTGRENTNEASSEGNSSDDSEDERV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNENPRKMCEQMRL
380 390 400 410 420 430
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pF1KB9 KEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHIIQSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KEKSKRNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHIIQSR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPPAKKIMMSKEELHSQKKQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLSESSSSSSSSSESESSSSDLSSS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQILPPSGDSEQLSNGITVMHPSGD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SDTTMLESECQAPVQKDIKIKNADSWKSLGKPVKPSGVMKSSDELFNQFRKAAIEKEVKA
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CCDS55 RTQELIRKHLEQNTKELKASQENQRDLGNGLTVESFSNKIQNKCSGEEQKEHQQSSEAQD
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KSKLWLLKDRDLARQKEQERRRREAMVGTIDMTLQSDIMTMFENNFD
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60 70 80 90 100 110
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160 170 180
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: : .: . :..: .. : . .: : .
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.: : . . ... ... ::::::::::::.: . .. . : . ..
CCDS82 APAPQPVQSHPPIIAATPQPVKTKKGVKRKADTTTPTTIDPIHEPPSLPPEPKTTKLGQR
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240 250 260 270 280 290
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. :.: ::. .:::::. :. ::.:::. :: :::::.:::: .::::::.:
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:::.:::::.: :..:.:::..::: :.. .::.:: .:.::::::: ::::::::::::
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360 370 380 390 400 410
pF1KB9 VTMARMLQDVFETHFSKIPIEPVE-----SMPLCYIKTDITET-TGRENTNEASSEGNSS
:.::: :::::: .:.:.: :: : : : : .. .. ......::...::
CCDS82 VAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPEEPVVAVSSPAVPPPTKVVAPPSSSDSSSDSSSDSDSS
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pF1KB9 -DDSEDERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNE--
::::.::..:::.:::::::::.:: .::: : .. :::::.:::::::: . ..:
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. .: . .:.:.:. .. :.. .:: :.::. :::.:.:::::
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pF1KB9 SLNINKLPGDKLGRVVHIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKR
::.::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::.::..::::.
CCDS82 SLDINKLPGEKLGRVVHIIQSREPSLKNSNPDEIEIDFETLKPSTLRELERYVTSCLRKK
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pF1KB9 PLKPPAKKIMMSKEELHSQKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLS
:: :.:. :: . . :...
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640 650 660 670 680 690
pF1KB9 ESSSSSSSSSESESSSSDLSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECILPE
. ::::::::: . ::::: :::. . . :.:. :: . .:.
CCDS82 -----GFSSSESESSSES-SSSDSEDSETAFCTSGDFVSPGPSPYHSHVQCGRFREMLRW
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700 710 720 730 740 750
pF1KB9 GRTGVTQIGYCVQDTTSANTTLVHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQI
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60 70 80 90 100 110
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CCDS12 PFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNK
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120 130 140 150
pF1KB9 PGDDIVLMAQALEKLFMQKLSQMPQEE---QVVGVKER---------IKKGT--------
:::::::::.::::::.::....: :: ..: .: : : :.
CCDS12 PGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEETEIMIVQAKGRGRGRKETGTAKPGVSTVPNTTQ
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160 170 180
pF1KB9 ----------QQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQEIPSVFPKTSI--------------
: : .: . :..: .. : . .: : .
CCDS12 ASTPPQTQTPQPNPPPVQATPHPFPAVTPDLIVQTPVMTVVPPQPLQTPPPVPPQPQPPP
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.: : . . ... ... ::::::::::::.: . .. . : . ..
CCDS12 APAPQPVQSHPPIIAATPQPVKTKKGVKRKADTTTPTTIDPIHEPPSLPPEPKTTKLGQR
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pF1KB9 SVALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNP
. :.: ::. .:::::. :. ::.:::. :: :::::.:::: .::::::.:
CCDS12 RESSRPVKP--PKKDVPDSQQHPAPEKSSKVSEQLKCCSGILKEMFAKKHAAYAWPFYKP
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:::.:::::.: :..:.:::..::: :.. .::.:: .:.::::::: ::::::::::::
CCDS12 VDVEALGLHDYCDIIKHPMDMSTIKSKLEAREYRDAQEFGADVRLMFSNCYKYNPPDHEV
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pF1KB9 VTMARMLQDVFETHFSKIPIEPVE-----SMPLCYIKTDITET-TGRENTNEASSEGNSS
:.::: :::::: .:.:.: :: : : : : .. .. ......::...::
CCDS12 VAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPEEPVVAVSSPAVPPPTKVVAPPSSSDSSSDSSSDSDSS
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pF1KB9 -DDSEDERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNE--
::::.::..:::.:::::::::.:: .::: : .. :::::.:::::::: . ..:
CCDS12 TDDSEEERAQRLAELQEQLKAVHEQLAALSQ-PQQNKPKKKEKDKKEKKKEKHKRKEEVE
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pF1KB9 NPRKMCEQMRLKEKSKRNQPKKR---KQQFIGLKS--------EDEDNAKPMNYDEKRQL
. .: . .:.:.:. .. :.. .:: :.::. :::.:.:::::
CCDS12 ENKKSKAKEPPPKKTKKNNSSNSNVSKKEPAPMKSKPPPTYESEEEDKCKPMSYEEKRQL
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pF1KB9 SLNINKLPGDKLGRVVHIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKR
::.::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::.::..::::.
CCDS12 SLDINKLPGEKLGRVVHIIQSREPSLKNSNPDEIEIDFETLKPSTLRELERYVTSCLRKK
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pF1KB9 PLKPPAKKIMMSKEELHSQKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLS
:: :.:. :: . . :...
CCDS12 R-KPQAEKV--------------------DV---------------------IAGSSKMK
680 690
640 650 660 670 680 690
pF1KB9 ESSSSSSSSSESESSSSDLSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECILPE
. ::::::::: . ::::: :::.:: :: : . :..:. :
CCDS12 -----GFSSSESESSSES-SSSDSEDSETEMAPK---SKKKGHPGREQKKHHHHHHQQMQ
700 710 720 730 740
700 710 720 730 740 750
pF1KB9 GRTGVTQIGYCVQDTTSANTTLVHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHLQTVKNISPLQI
CCDS12 QAPAPVPQQPPPPPQQPPPPPPPQQQQQPPPPPPPPSMPQQAAPAMKSSPPPFIATQVPV
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pF1KB9 MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSW
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CCDS46 ETSQMSTTQAQAQPQPANAASTNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAW
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pF1KB9 PFQRPVDAVKLKLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNK
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CCDS46 PFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNK
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pF1KB9 PGDDIVLMAQALEKLFMQKLSQMPQEE---QVVGVKER---------IKKGT--------
:::::::::.::::::.::....: :: ..: .: : : :.
CCDS46 PGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEETEIMIVQAKGRGRGRKETGTAKPGVSTVPNTTQ
150 160 170 180 190 200
160 170 180
pF1KB9 ----------QQNIAVSSAKEKSSPSATEKVFKQQEIPSVFPKTSI--------------
: : .: . :..: .. : . .: : .
CCDS46 ASTPPQTQTPQPNPPPVQATPHPFPAVTPDLIVQTPVMTVVPPQPLQTPPPVPPQPQPPP
210 220 230 240 250 260
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pF1KB9 --SPLNVVQGASVNSSSQTAAQVTKGVKRKADTTTPAT-SAVKASSEFSPT-----FTEK
.: : . . ... ... ::::::::::::.: . .. . : . ..
CCDS46 APAPQPVQSHPPIIAATPQPVKTKKGVKRKADTTTPTTIDPIHEPPSLPPEPKTTKLGQR
270 280 290 300 310 320
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pF1KB9 SVALPPIKENMPKNVLPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNP
. :.: ::. .:::::. :. ::.:::. :: :::::.:::: .::::::.:
CCDS46 RESSRPVKP--PKKDVPDSQQHPAPEKSSKVSEQLKCCSGILKEMFAKKHAAYAWPFYKP
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pF1KB9 VDVNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEV
:::.:::::.: :..:.:::..::: :.. .::.:: .:.::::::: ::::::::::::
CCDS46 VDVEALGLHDYCDIIKHPMDMSTIKSKLEAREYRDAQEFGADVRLMFSNCYKYNPPDHEV
380 390 400 410 420 430
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 VTMARMLQDVFETHFSKIPIEPVE-----SMPLCYIKTDITET-TGRENTNEASSEGNSS
:.::: :::::: .:.:.: :: : : : : .. .. ......::...::
CCDS46 VAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPEEPVVAVSSPAVPPPTKVVAPPSSSDSSSDSSSDSDSS
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pF1KB9 -DDSEDERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKEKVNNSNE--
::::.::..:::.:::::::::.:: .::: : .. :::::.:::::::: . ..:
CCDS46 TDDSEEERAQRLAELQEQLKAVHEQLAALSQ-PQQNKPKKKEKDKKEKKKEKHKRKEEVE
500 510 520 530 540 550
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pF1KB9 NPRKMCEQMRLKEKSKRNQPKKR---KQQFIGLKS--------EDEDNAKPMNYDEKRQL
. .: . .:.:.:. .. :.. .:: :.::. :::.:.:::::
CCDS46 ENKKSKAKEPPPKKTKKNNSSNSNVSKKEPAPMKSKPPPTYESEEEDKCKPMSYEEKRQL
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pF1KB9 SLNINKLPGDKLGRVVHIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKR
::.::::::.::::::::::::::::.::::::::::::::: :::::::.::..::::.
CCDS46 SLDINKLPGEKLGRVVHIIQSREPSLKNSNPDEIEIDFETLKPSTLRELERYVTSCLRKK
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pF1KB9 PLKPPAKKIMMSKEELHSQKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVENVSRLS
:: :.:.
CCDS46 R-KPQAEKVDVIAGSSKMKGFSSSESESSSESSSSDSEDSETGPA
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pF1KB9 MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQ
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CCDS69 MSTATTVAPAGIPATPGPVNPPPPEVSNPSKPGRKTNQLQYMQNVVVKTLWKHQFAWPFY
10 20 30 40 50 60
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pF1KB9 RPVDAVKLKLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNKPGD
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CCDS69 QPVDAIKLNLPDYHKIIKNPMDMGTIKKRLENNYYWSASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTD
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120 130 140 150 160
pF1KB9 DIVLMAQALEKLFMQKLSQMPQEEQVV---GVKERIKK--------GTQQNIAVSSAKEK
:::::::::::.:.::..:::::: . . : . .: :::: ::::..
CCDS69 DIVLMAQALEKIFLQKVAQMPQEEVELLPPAPKGKGRKPAAGAQSAGTQQVAAVSSVSPA
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170 180 190 200
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. :.... :. .:.. : .. : .. . : . ...
CCDS69 TPFQSVPPTVSQTPVIAATPVPTITANVTSVPVPPAAAPPPPATPIVPVVPPTPPVVK-K
190 200 210 220 230
210 220 230 240 250
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CCDS69 KGVKRKADTTTPTTSAITASRSESPPPLSDPKQAKVVARRESGGRPIKP--PKKDLEDGE
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260 270 280 290 300 310
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CCDS69 VPQHAGKKGKLSEHLRYCDSILREMLSKKHAAYAWPFYKPVDAEALELHDYHDIIKHPMD
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320 330 340 350 360 370
pF1KB9 LGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEVVTMARMLQDVFETHFSKIPI
:.:.:.:::..:: :: ::::::::: :::::::::::::.::: :::::: .:.:.:
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::::. : . . : :.. .: :: ..:.:::.::. :::.:::::::::.:
CCDS69 EPVEA-PALPAPAAPMVSKGAESSRSSEESSSDSGSSDSEEERATRLAELQEQLKAVHEQ
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440 450 460 470 480
pF1KB9 LQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKKE---------KVNNSNEN------PRKMCEQMRLK
: .:::.: : .:::::..:::::. ::. .:. : :. .: .
CCDS69 LAALSQAPVNKPKKKKEKKEKEKKKKDKEKEKEKHKVKAEEEKKAKVAPPAKQAQQKKAP
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490 500 510 520 530
pF1KB9 EKSK-------RNQPKKRKQQFIGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVV
:. :. : :: . ::.:... ::.:::::::::.::.:::.::::::
CCDS69 AKKANSTTTAGRQLKKGGKQASASYDSEEEEEGLPMSYDEKRQLSLDINRLPGEKLGRVV
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540 550 560 570 580 590
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:::::::::: .:::::::::::::: .::::::.::..::.:. :: . :. :
CCDS69 HIIQSREPSLRDSNPDEIEIDFETLKPTTLRELERYVKSCLQKKQRKPFSASGKKQAAKS
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600 610 620 630 640
pF1KB9 KEELHSQKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTKSDKTQPSKAVEN-VSRLSESSSSSSSSSE
:::: ..::.:::::: ::..::.: :. ....: :..: . :::: ::::::
CCDS69 KEELAQEKKKELEKRLQDVSGQLSSSKKPARKEK--PGSAPSGGPSRLS-----SSSSSE
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650 660 670 680 690 700
pF1KB9 SESSSSDLSSSDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECILPEGRTGVTQIGYC
: ::::. :::::::::
CCDS69 SGSSSSSGSSSDSSDSE
710 720
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CCDS56 KLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMA
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pF1KB9 QALEKLFMQKLSQMPQEEQ--VVGV-KERIKKGTQQNI---AVSSAKEK---SSPSATEK
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CCDS56 QTLEKIFLQKVASMPQEEQELVVTIPKNSHKKGAKLAALQGSVTSAHQVPAVSSVSHTAL
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CCDS56 YTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVTAAPPAQPLAKKKGVKRKADTT
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CCDS56 TPTPTAILAPGSPASPPGSLEPKAARLPPMRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKL
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CCDS56 SEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENR
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.:.:: .::::::::: ::::::::::.::.::: :::::: ...:.: ::.:
CCDS56 DYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVS
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.:: :.. .:....:...:.::: . :.:::.::..:::.:::
CCDS56 TAMPPGLAKSS-SESSSEESSSESSSEEEEEEDEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQE
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::.:::.:: .::: :. : ..:.::..:.::. :: .......:: .
CCDS56 QLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKKRKAEKHRGRAGADEDDKGPRAPRPPQPK
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pF1KB9 KEK----------------------SKRNQPKKRKQQF-----IGLKSEDEDNAKPMNYD
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CCDS56 KSKKASGSGGGSAALGPSGFGPSGGSGTKLPKKATKTAPPALPTGYDSEEEEESRPMSYD
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pF1KB9 EKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSA
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CCDS56 EKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLS
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pF1KB9 CLRKRPLKPPA--KKIMMSKEELHSQKKQELEKRLLDVNNQLNSRKRQTK--SDKTQPSK
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CCDS56 CLRKKPRKPYTIKKPVGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSGQLNSTKKPPKKANEKTESSS
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CCDS56 AQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG
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pF1KB9 KKMKNECILPEGRTGVTQIGYCVQDTTSANTTLVHQTTPSHVMPPNHHQLAFNYQELEHL
>>CCDS4762.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6 (801 aa)
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10 20 30
pF1KB9 MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQ
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CCDS47 LQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAA
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CCDS47 SECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQELVVTIPKNSHKK
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CCDS47 GAKLAALQGSVTSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAG
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CCDS47 PPLLAVTAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPASPPGSLEPKAARLPPMRR
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CCDS47 ESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVDA
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CCDS47 SALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAM
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. :.:::.::..:::.:::::.:::.:: .::: :. : ..:.::..:.::
CCDS47 DEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKK
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CCDS47 RKAEKHRGRAGADEDDKGPRAPRPPQPKKSKKASGSGGGSAALGPSGFGPSGGSGTKLPK
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CCDS47 KATKTAPPALPTGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLR
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pF1KB9 KRLLDVNNQLNSRKRQTK--SDKTQPSKAVE-NVSRLSESSSSS-SSSSESESSSSDLSS
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CCDS47 KRLQDVSGQLNSTKKPPKKANEKTESSSAQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSD
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CCDS47 SDSG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]