Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9668
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9668, 498 aa
1>>>pF1KB9668 498 - 498 aa - 498 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0661+/-0.00117; mu= 13.0020+/- 0.070
mean_var=231.0899+/-46.169, 0's: 0 Z-trim(111.1): 945 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.084369
statistics sampled from 11108 (12126) to 11108 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.372), width: 16
Scan time: 3.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12977.1 ZNF497 gene_id:162968|Hs108|chr19 ( 498) 3629 455.0 8.9e-128
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CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1736 224.7 2.4e-58
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CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1675 217.3 4.2e-56
CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19 ( 537) 1669 216.4 6.1e-56
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1656 214.9 1.9e-55
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CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1658 215.5 2.3e-55
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 1651 214.3 2.9e-55
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CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1647 213.9 4.3e-55
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CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1642 213.3 6.6e-55
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 1643 213.5 7e-55
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 1643 213.6 7.2e-55
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 1643 213.6 7.2e-55
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1641 213.2 7.4e-55
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1641 213.2 7.6e-55
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1641 213.3 8.1e-55
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1641 213.3 8.3e-55
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1640 213.1 8.7e-55
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1633 212.2 1.5e-54
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1633 212.3 1.6e-54
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 1633 212.3 1.7e-54
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1632 212.2 1.7e-54
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1630 211.8 1.8e-54
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1629 211.6 1.9e-54
CCDS42539.1 ZNF676 gene_id:163223|Hs108|chr19 ( 588) 1629 211.6 1.9e-54
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1629 211.7 1.9e-54
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1629 211.7 2e-54
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1625 211.3 3.2e-54
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1625 211.3 3.2e-54
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1625 211.3 3.2e-54
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 1623 211.2 4.1e-54
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1621 210.8 4.1e-54
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1621 210.8 4.4e-54
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1621 210.8 4.5e-54
>>CCDS12977.1 ZNF497 gene_id:162968|Hs108|chr19 (498 aa)
initn: 3629 init1: 3629 opt: 3629 Z-score: 2407.5 bits: 455.0 E(32554): 8.9e-128
Smith-Waterman score: 3629; 100.0% identity (100.0% similar) in 498 aa overlap (1-498:1-498)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MESPRGWTLQVAPEEGQVLCNVKTATRGLSEGAVSGGWGAWENSTEVPREAGDGQRQQAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MESPRGWTLQVAPEEGQVLCNVKTATRGLSEGAVSGGWGAWENSTEVPREAGDGQRQQAT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSPLPEEPGCRCGECGKAFSQGSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSPLPEEPGCRCGECGKAFSQGSY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEKPYACRECGKAFRAHSQLIHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGEKPYACRECGKAFRAHSQLIHH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYECPECGKAFSWNSNFLEHRRVH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDCGKAFVRVAGLRQHRRTHSSEK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 PFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHAC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 AQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSSGLAHHRLSHTGERPFACAECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSSGLAHHRLSHTGERPFACAECG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 KAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLSHRRTHTGERPYACGECGKPFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLSHRRTHTGERPYACGECGKPFS
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490
pF1KB9 HRCNLNEHQKRHGGRAAP
::::::::::::::::::
CCDS12 HRCNLNEHQKRHGGRAAP
490
>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
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pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
: :. . : : : : .: .:. .
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pF1KB9 LPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGE
. :.: .: :::::::..: :..:.:.::::.:: : :: :.: :: :..:::::.::
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pF1KB9 KPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYE
::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
CCDS74 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
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220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
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::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
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.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
CCDS74 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
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pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
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:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
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CCDS74 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
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Smith-Waterman score: 1736; 52.0% identity (77.9% similar) in 425 aa overlap (70-494:182-602)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
: :. . : : : : .: .:. .
CCDS74 VKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR---GKREKPDLNVLQKTC
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pF1KB9 LPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGE
. :.: .: :::::::..: :..:.:.::::.:: : :: :.: :: :..:::::.::
CCDS74 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYE
::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
CCDS74 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
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220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
CCDS74 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAF
::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
CCDS74 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
390 400 410 420 430 440
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSS
.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
CCDS74 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
450 460 470 480 490 500
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
CCDS74 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
510 520 530 540 550 560
460 470 480 490
pF1KB9 HRRTHTGERPYACGECGKPFSHRCNLNEHQKRHGGRAAP
:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
CCDS74 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
570 580 590 600 610 620
CCDS74 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
630 640 650
>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (670 aa)
initn: 6618 init1: 1718 opt: 1736 Z-score: 1160.9 bits: 224.7 E(32554): 2.4e-58
Smith-Waterman score: 1736; 52.0% identity (77.9% similar) in 425 aa overlap (70-494:194-614)
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AWENSTEVPREAGDGQRQQATLGAADEQGGPGRELGPADGGRDGAGPRSEPADRALRPSP
: :. . : : : : .: .:. .
CCDS12 VKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTR---GKREKPDLNVLQKTC
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pF1KB9 LPEEPGCRCGECGKAFSQGSYLLQHRRVHTGEKPYTCPECGKAFAWSSNLSQHQRIHSGE
. :.: .: :::::::..: :..:.:.::::.:: : :: :.: :: :..:::::.::
CCDS12 VKEKPY-KCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGE
230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KPYACRECGKAFRAHSQLIHHQETHSGLKPFRCPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYE
::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
CCDS12 KPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYE
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQSSNLAEHLKIHAGARPHACPDC
: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
CCDS12 CSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHEC
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 GKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAF
::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
CCDS12 GKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTF
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 VMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHRRTHSGAKPFACADCGKAFRGSS
.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
CCDS12 SHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSS
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GLAHHRLSHTGERPFACAECGKAFRGSSELRQHQRLHSGERPFVCAHCSKAFVRKSELLS
.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
CCDS12 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490
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:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
CCDS12 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
580 590 600 610 620 630
CCDS12 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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: :. . : : : : .: .:. .
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::: : .::..: . ::.::.::.: ::..: .:::::. ... ::.::::::::::
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: :::::: . .. .: :.::: .:. : .::::::.::.:..: .::.: .:. : .:
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::::.... : ::.:::..:::. :.:::::: .:. : .:.: ::::.:. : :::..:
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.: :..:.:.::::::. :.:::::: : ..: .:.: :.: ::. : :::::: ::
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.:..:. ::::.:. : .::.:: . : ::::.:.::.:. : .:..:: ..: :.
CCDS54 SLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIE
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:.: :: :.::.:.:::: ::: .:..:.. : :
CCDS54 HQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRI
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CCDS54 HTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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pF1KB9 SFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYECPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDCGKAFSQ
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CCDS64 AFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECNDCGKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQ
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pF1KB9 SSNLAEHLKIHAGARPHACPDCGKAFVRVAGLRQHRRTHSSEKPFPCAECGKAFRESSQL
::.: .: .::.: .::.: ::::: . ::.:. :..:::. :. ::::: .:: :
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pF1KB9 LQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRSNLLSHR
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CCDS64 IQHQGVHTGDKPYACHECGKTFGRSSNLILHQRVHTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQHQ
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: :.: :: : .::::: ::.: ::. ::::.:..:.::::.: ::.: ::: .:.
CCDS64 RIHNGLKPHECNQCGKAFNRSSNLIHHQKVHTGEKPYTCVECGKGFSQSSHLIQHQIIHT
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CCDS64 GERPYKCSECGKAFSQRSVLIQHQRIHTGVKPYDCAACGKAFSQRSKLIKHQLIHTRE
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pF1KB9 P
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: .:::.: ::. :..:...::::::::: ::::::. ::.. :.:.::: . . :..:
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pF1KB9 RESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFSQRS
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CCDS12 IRGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSHGS
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: :
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>--
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CCDS12 PYQCKECGKAFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYEC
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pF1KB9 KAFRESSQLLQHQRTHTGERPFECAECGQAFVMGSYLAEHRRVHTGEKPHACAQCGKAFS
: ..::.
CCDS12 IDFSHGSQVYM
680
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CCDS12 KPFECKECGKAFGSGSNLTHHQRIHTGEKPYECKECGKAFSFGSGLIRHQIIHSGEKPYE
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pF1KB9 CPDCGKSFGRSTTLVQHRRTHTGEKPYECPECGKAFSWNSNFLEHRRVHTGARPHACRDC
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CCDS12 CKECGKSFSFESALIRHHRIHTGEKPYECIDCGKAFGSGSNLTQHRRIHTGEKPYECKAC
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CCDS12 GMAFSSGSALTRHQRIHTGEKPYICNECGKAFSFGSALTRHQRIHTGEKPYVCKECGKAF
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CCDS12 NSGSDLTQHQRIHTGEKPYECKECEKAFRSGSKLIQHQRMHTGEKPYECKECGKTFSSGS
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CCDS12 DLTQHHRIHTGEKPYECKECGKAFGSGSKLIQHQLIHTGERPYECKECGKSFSSGSALNR
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CCDS12 HNGKKLCELETIN
480
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CCDS31 TGEKPYNCSQCGKAFSQKSQLTSHQRTHTGEKPY-ECGECGKAFSRKSHLISHWRTHTGE
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CCDS31 KPYGCNECGRAFSEKSNLINHQRIHTGEKPFECRECGKAFSRKSQLVTHHRTHTGTKPFG
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CCDS31 CSDCRKAFFEKSELIRHQTIHTGEKPYECSECRKAFRERSSLINHQRTHTGEKPHGCIQC
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CCDS31 GKAFSQKSHLISHQMTHTGEKPFICSKCGKAFSRKSQLVRHQRTHTGEKPYECSECGKAF
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CCDS31 SLATHQRTHTGEKPYECRDCEKAFSQKSQLNTHQRIHTGEKPYECSLCRKAFFEKSELIR
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CCDS31 HLRTHTGEKPYECNECRKAFREKSSLINHQRIHTGEKPFECSECGKAFSRKSHLIPHQRT
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pF1KB9 HGGRAAP
: :
CCDS31 HTGEKPYGCSECRKAFSQKSQLVNHQRIHTGEKPYRCIECGKAFSQKSQLINHQRTHTVK
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CCDS46 TGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIHTGEKPY-KCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGE
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