Result of FASTA (ccds) for pFN21AB9624
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9624, 358 aa
  1>>>pF1KB9624 358 - 358 aa - 358 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6568+/-0.000757; mu= 13.6827+/- 0.046
 mean_var=162.7836+/-33.541, 0's: 0 Z-trim(115.2): 47  B-trim: 986 in 2/50
 Lambda= 0.100524
 statistics sampled from 15695 (15743) to 15695 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.797), E-opt: 0.2 (0.484), width:  16
 Scan time:  3.240

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS46132.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19        ( 358) 2357 353.0 2.3e-97
CCDS74406.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19        ( 375) 1384 211.9   7e-55
CCDS33064.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19        ( 421)  979 153.2 3.6e-37
CCDS45220.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15         ( 306)  969 151.6   8e-37
CCDS42014.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15         ( 381)  969 151.7 9.3e-37
CCDS45218.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15         ( 394)  969 151.8 9.5e-37
CCDS46309.1 MEIS1 gene_id:4211|Hs108|chr2          ( 390)  953 149.4 4.7e-36
CCDS10045.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15         ( 470)  910 143.3   4e-34
CCDS45219.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15         ( 388)  882 139.1 5.9e-33
CCDS45217.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15         ( 401)  882 139.2   6e-33
CCDS10044.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15         ( 477)  882 139.2 6.8e-33


>>CCDS46132.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19             (358 aa)
 initn: 2357 init1: 2357 opt: 2357  Z-score: 1861.6  bits: 353.0 E(32554): 2.3e-97
Smith-Waterman score: 2357; 94.1% identity (97.8% similar) in 358 aa overlap (1-358:1-358)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MARRYDELPHYPSIADGPAALAGFPEAVPAAPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKRDKDEI
       ::::::::::::.:.:::::::.:::.:::.::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS46 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPRGGDVCSSDSFNEDNTAFAKQVRSER
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::: .::::::::::
CCDS46 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 PFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKGKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCLSLP
       :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS46 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKGKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 DQNNIWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGVGLDTSVASPSSGGEDEDLD
       ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS46 DQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLD
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 QEPRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLWHPYPSEEQKKQLVQDTGLTILQVNNWFINAR
       :: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS46 QERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINAR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350        
pF1KB9 RRMVQPMIDQSNRIGQGAAFSPEGQPIGGYTETEPHVAFRPPASVGMSLNLEGEWHYL
       ::.:::::::::: :::::::::::::::::::.:::: :::.:::::::::::::::
CCDS46 RRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPGSVGMSLNLEGEWHYL
              310       320       330       340       350        

>>CCDS74406.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19             (375 aa)
 initn: 1384 init1: 1384 opt: 1384  Z-score: 1098.8  bits: 211.9 E(32554): 7e-55
Smith-Waterman score: 2313; 89.9% identity (93.3% similar) in 375 aa overlap (1-358:1-375)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MARRYDELPHYPSIADGPAALAGFPEAVPAAPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKRDKDEI
       ::::::::::::.:.:::::::.:::.:::.::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS74 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPRGGDVCSSDSFNEDNTAFAKQVRSER
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::: .::::::::::
CCDS74 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
               70        80        90       100       110       120

              130       140                        150       160   
pF1KB9 PFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK-----------------GKMPIDLVIEDRDG
       :.:::::::::::::::::::::::::::                 ::::::::::::::
CCDS74 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHDLCDNFCHRYITCLKGKMPIDLVIEDRDG
              130       140       150       160       170       180

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB9 GCREDFEDYPASCLSLPDQNNIWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGVGL
       ::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS74 GCREDFEDYPASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGL
              190       200       210       220       230       240

           230       240       250       260       270       280   
pF1KB9 DTSVASPSSGGEDEDLDQEPRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLWHPYPSEEQKKQLVQ
       ::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::.:
CCDS74 DTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQ
              250       260       270       280       290       300

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB9 DTGLTILQVNNWFINARRRMVQPMIDQSNRIGQGAAFSPEGQPIGGYTETEPHVAFRPPA
       :::::::::::::::::::.:::::::::: :::::::::::::::::::.:::: :::.
CCDS74 DTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPG
              310       320       330       340       350       360

           350        
pF1KB9 SVGMSLNLEGEWHYL
       :::::::::::::::
CCDS74 SVGMSLNLEGEWHYL
              370     

>>CCDS33064.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19             (421 aa)
 initn: 1577 init1: 979 opt: 979  Z-score: 780.7  bits: 153.2 E(32554): 3.6e-37
Smith-Waterman score: 2017; 79.5% identity (82.3% similar) in 390 aa overlap (1-327:1-390)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MARRYDELPHYPSIADGPAALAGFPEAVPAAPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKRDKDEI
       ::::::::::::.:.:::::::.:::.:::.::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS33 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPRGGDVCSSDSFNEDNTAFAKQVRSER
       :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::: .::::::::::
CCDS33 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
               70        80        90       100       110       120

              130       140                        150       160   
pF1KB9 PFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK-----------------GKMPIDLVIEDRDG
       :.:::::::::::::::::::::::::::                 ::::::::::::::
CCDS33 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHDLCDNFCHRYITCLKGKMPIDLVIEDRDG
              130       140       150       160       170       180

           170       180       190       200       210       220   
pF1KB9 GCREDFEDYPASCLSLPDQNNIWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGVGL
       ::::::::::::: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS33 GCREDFEDYPASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGL
              190       200       210       220       230       240

           230       240       250       260                       
pF1KB9 DTSVASPSSGGEDEDLDQEPRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHL---------------
       ::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::               
CCDS33 DTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSRRSEAPVLPDVCLG
              250       260       270       280       290       300

                                     270       280       290       
pF1KB9 ---------W----------------------HPYPSEEQKKQLVQDTGLTILQVNNWFI
                :                      ::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS33 LGSPSPGPRWARPWGSDCGRPGRQSDSCWWLQHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFI
              310       320       330       340       350       360

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB9 NARRRMVQPMIDQSNRIGQGAAFSPEGQPIGGYTETEPHVAFRPPASVGMSLNLEGEWHY
       :::::.:::::::::: :::::::::::::                              
CCDS33 NARRRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPGSVGMSLNLEGEWHY
              370       380       390       400       410       420

>>CCDS45220.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15              (306 aa)
 initn: 793 init1: 638 opt: 969  Z-score: 774.6  bits: 151.6 E(32554): 8e-37
Smith-Waterman score: 1322; 65.9% identity (82.8% similar) in 314 aa overlap (69-358:1-306)

       40        50        60        70        80        90        
pF1KB9 RPPQPLPPGLDSDGLKRDKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPRGGD
                                     .::::::::::::.::. . :      :::
CCDS45                               MALVFEKCELATCTPREPGVA------GGD
                                             10        20          

      100       110       120       130       140                  
pF1KB9 VCSSDSFNEDNTAFAKQVRSERPFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK---------
       :::::::::: ..::::::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::         
CCDS45 VCSSDSFNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFC
           30        40        50        60        70        80    

             150       160       170       180        190          
pF1KB9 --------GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCLSLPDQN-NIWIRDHEDSGSVH-LG
               :::::::::..:::. . : :.  .:  .: :.: . : :::.:. :.:  :
CCDS45 HRYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAG
           90       100       110       120       130        140   

     200       210       220       230       240       250         
pF1KB9 TPGPSSGGLASQSGDNSSDQGVGLDTSVASPSSGGEDEDLDQEPRRNKKRGIFPKVATNI
       :::::::: :::::::::.:: :::.:::::..: .:.: :.. .:.:::::::::::::
CCDS45 TPGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNI
           150       160       170        180       190       200  

     260       270       280       290       300       310         
pF1KB9 MRAWLFQHLWHPYPSEEQKKQLVQDTGLTILQVNNWFINARRRMVQPMIDQSNR-IGQGA
       ::::::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::: ..:::
CCDS45 MRAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGA
            210       220       230       240       250       260  

      320       330        340          350        
pF1KB9 AFSPEGQPIGGYT-ETEPHVAFRP--PAS-VGMSLNLEGEWHYL
       :.::::::.:... . . :...::  : : .::.....:.:::.
CCDS45 AYSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
            270       280       290       300      

>>CCDS42014.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15              (381 aa)
 initn: 953 init1: 638 opt: 969  Z-score: 773.4  bits: 151.7 E(32554): 9.3e-37
Smith-Waterman score: 1481; 62.7% identity (78.3% similar) in 383 aa overlap (18-358:7-381)

               10        20         30                     40      
pF1KB9 MARRYDELPHYPSIADGPAALAGFPEAV-PAAP------GP-------YGPHRP-PQPLP
                        ::.. : :.:  :  :      ::       :: : : :. .:
CCDS42            MDGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPNVMP
                          10        20        30        40         

          50           60        70        80        90       100  
pF1KB9 PGLDS---DGLKRDKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPRGGDVCSS
        .. :   :.:::::: ::::::::::::::::::::::.::. . ::      ::::::
CCDS42 ASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVAG------GDVCSS
      50        60        70        80        90             100   

            110       120       130       140                      
pF1KB9 DSFNEDNTAFAKQVRSERPFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK-------------
       :::::: ..::::::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::             
CCDS42 DSFNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYI
           110       120       130       140       150       160   

         150       160       170       180        190        200   
pF1KB9 ----GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCLSLPDQN-NIWIRDHEDSGSVH-LGTPGP
           :::::::::..:::. . : :.  .:  .: :.: . : :::.:. :.:  :::::
CCDS42 SCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAGTPGP
           170       180       190       200        210       220  

           210       220       230       240       250       260   
pF1KB9 SSGGLASQSGDNSSDQGVGLDTSVASPSSGGEDEDLDQEPRRNKKRGIFPKVATNIMRAW
       :::: :::::::::.:: :::.:::::..: .:.: :.. .:.:::::::::::::::::
CCDS42 SSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAW
            230       240       250        260       270       280 

           270       280       290       300       310        320  
pF1KB9 LFQHLWHPYPSEEQKKQLVQDTGLTILQVNNWFINARRRMVQPMIDQSNR-IGQGAAFSP
       ::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::: ..::::.::
CCDS42 LFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGAAYSP
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            330        340          350        
pF1KB9 EGQPIGGYT-ETEPHVAFRP--PAS-VGMSLNLEGEWHYL
       ::::.:... . . :...::  : : .::.....:.:::.
CCDS42 EGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
             350       360       370       380 

>>CCDS45218.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15              (394 aa)
 initn: 1014 init1: 638 opt: 969  Z-score: 773.2  bits: 151.8 E(32554): 9.5e-37
Smith-Waterman score: 1544; 62.5% identity (78.2% similar) in 403 aa overlap (1-358:1-394)

               10           20         30                     40   
pF1KB9 MARRYDELPHYPSIADG---PAALAGFPEAV-PAAP------GP-------YGPHRP-PQ
       ::.:::::::: .. ::   ::.. : :.:  :  :      ::       :: : : :.
CCDS45 MAQRYDELPHYGGM-DGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPN
               10         20        30        40        50         

             50           60        70        80        90         
pF1KB9 PLPPGLDS---DGLKRDKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPRGGDV
        .: .. :   :.:::::: ::::::::::::::::::::::.::. . ::      :::
CCDS45 VMPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVAG------GDV
      60        70        80        90       100       110         

     100       110       120       130       140                   
pF1KB9 CSSDSFNEDNTAFAKQVRSERPFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK----------
       ::::::::: ..::::::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::          
CCDS45 CSSDSFNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCH
           120       130       140       150       160       170   

            150       160       170       180        190        200
pF1KB9 -------GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCLSLPDQN-NIWIRDHEDSGSVH-LGT
              :::::::::..:::. . : :.  .:  .: :.: . : :::.:. :.:  ::
CCDS45 RYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAGT
           180       190       200       210        220       230  

              210       220       230       240       250       260
pF1KB9 PGPSSGGLASQSGDNSSDQGVGLDTSVASPSSGGEDEDLDQEPRRNKKRGIFPKVATNIM
       ::::::: :::::::::.:: :::.:::::..: .:.: :.. .:.::::::::::::::
CCDS45 PGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIM
            240       250       260        270       280       290 

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pF1KB9 RAWLFQHLWHPYPSEEQKKQLVQDTGLTILQVNNWFINARRRMVQPMIDQSNR-IGQGAA
       :::::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::: ..::::
CCDS45 RAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGAA
             300       310       320       330       340       350 

     320       330        340          350        
pF1KB9 FSPEGQPIGGYT-ETEPHVAFRP--PAS-VGMSLNLEGEWHYL
       .::::::.:... . . :...::  : : .::.....:.:::.
CCDS45 YSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
             360       370       380       390    

>>CCDS46309.1 MEIS1 gene_id:4211|Hs108|chr2               (390 aa)
 initn: 1238 init1: 489 opt: 953  Z-score: 760.8  bits: 149.4 E(32554): 4.7e-36
Smith-Waterman score: 1490; 59.8% identity (78.2% similar) in 400 aa overlap (1-358:1-390)

               10           20            30            40         
pF1KB9 MARRYDELPHYPSIADG---PAALAGFPEAV----PAAPGPYGP----HRPPQP-----L
       ::.:::.:::: .. ::   :... : :.:.    :.    .::    :. :.      .
CCDS46 MAQRYDDLPHYGGM-DGVGIPSTMYGDPHAARSMQPVHHLNHGPPLHSHQYPHTAHTNAM
               10         20        30        40        50         

           50           60        70        80        90       100 
pF1KB9 PPGLDS---DGLKRDKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPRGGDVCS
        :.. :   :.:::::: ::::::::::::.:::::::::.::. . ::      :::::
CCDS46 APSMGSSVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALIFEKCELATCTPREPGVAG------GDVCS
      60        70        80        90       100             110   

             110       120       130       140                     
pF1KB9 SDSFNEDNTAFAKQVRSERPFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK------------
       :.::::: ..::::.:.:.:.:::::::::::::::::::::::::::            
CCDS46 SESFNEDIAVFAKQIRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRY
           120       130       140       150       160       170   

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pF1KB9 -----GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCLSLPDQNNIWIRDHEDSGSVHLG-TPGP
            :::::::::.::.:: . : ::   :  .: :: . : :::.:..:.. : ::::
CCDS46 ISCLKGKMPIDLVIDDREGGSKSDSEDITRSA-NLTDQPS-WNRDHDDTASTRSGGTPGP
           180       190       200        210        220       230 

           210       220       230       240       250       260   
pF1KB9 SSGGLASQSGDNSSDQGVGLDTSVASPSSGGEDEDLDQEPRRNKKRGIFPKVATNIMRAW
       :::: .:.::::::.:: :::.::::::.: .:.: :.. .:.:::::::::::::::::
CCDS46 SSGGHTSHSGDNSSEQGDGLDNSVASPSTG-DDDDPDKDKKRHKKRGIFPKVATNIMRAW
             240       250       260        270       280       290

           270       280       290       300       310        320  
pF1KB9 LFQHLWHPYPSEEQKKQLVQDTGLTILQVNNWFINARRRMVQPMIDQSNR-IGQGAAFSP
       ::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::: ..::. ..:
CCDS46 LFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGTPYNP
              300       310       320       330       340       350

            330        340          350        
pF1KB9 EGQPIGGYT-ETEPHVAFRPP---ASVGMSLNLEGEWHYL
       .:::.::.. . . :...: :   ...::....::.:::.
CCDS46 DGQPMGGFVMDGQQHMGIRAPGPMSGMGMNMGMEGQWHYM
              360       370       380       390

>>CCDS10045.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15              (470 aa)
 initn: 940 init1: 638 opt: 910  Z-score: 726.1  bits: 143.3 E(32554): 4e-34
Smith-Waterman score: 1485; 63.7% identity (78.1% similar) in 383 aa overlap (1-341:1-374)

               10           20         30                     40   
pF1KB9 MARRYDELPHYPSIADG---PAALAGFPEAV-PAAP------GP-------YGPHRP-PQ
       ::.:::::::: .. ::   ::.. : :.:  :  :      ::       :: : : :.
CCDS10 MAQRYDELPHYGGM-DGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPN
               10         20        30        40        50         

             50           60        70        80        90         
pF1KB9 PLPPGLDS---DGLKRDKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPRGGDV
        .: .. :   :.:::::: ::::::::::::::::::::::.::. . :      ::::
CCDS10 VMPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVA------GGDV
      60        70        80        90       100             110   

     100       110       120       130       140                   
pF1KB9 CSSDSFNEDNTAFAKQVRSERPFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK----------
       ::::::::: ..::::::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::          
CCDS10 CSSDSFNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCH
           120       130       140       150       160       170   

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pF1KB9 -------GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCLSLPDQN-NIWIRDHEDSGSVH-LGT
              :::::::::..:::. . : :.  .:  .: :.: . : :::.:. :.:  ::
CCDS10 RYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAGT
           180       190       200       210        220       230  

              210       220       230       240       250       260
pF1KB9 PGPSSGGLASQSGDNSSDQGVGLDTSVASPSSGGEDEDLDQEPRRNKKRGIFPKVATNIM
       ::::::: :::::::::.:: :::.:::::..: .:.: :.. .:.::::::::::::::
CCDS10 PGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIM
            240       250       260        270       280       290 

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pF1KB9 RAWLFQHLWHPYPSEEQKKQLVQDTGLTILQVNNWFINARRRMVQPMIDQSNR-IGQGAA
       :::::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::: ..::::
CCDS10 RAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGAA
             300       310       320       330       340       350 

     320       330        340       350                            
pF1KB9 FSPEGQPIGGYT-ETEPHVAFRPPASVGMSLNLEGEWHYL                    
       .::::::.:... . . :...::                                     
CCDS10 YSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGLQSMPGDYVSQGGPMGMSMAQPSYTPPQMTPHPTQ
             360       370       380       390       400       410 

>>CCDS45219.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15              (388 aa)
 initn: 1328 init1: 645 opt: 882  Z-score: 705.1  bits: 139.1 E(32554): 5.9e-33
Smith-Waterman score: 1470; 61.8% identity (76.7% similar) in 390 aa overlap (18-358:7-388)

               10        20         30                     40      
pF1KB9 MARRYDELPHYPSIADGPAALAGFPEAV-PAAP------GP-------YGPHRP-PQPLP
                        ::.. : :.:  :  :      ::       :: : : :. .:
CCDS45            MDGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPNVMP
                          10        20        30        40         

          50           60        70        80        90       100  
pF1KB9 PGLDS---DGLKRDKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPRGGDVCSS
        .. :   :.:::::: ::::::::::::::::::::::.::. . ::      ::::::
CCDS45 ASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVAG------GDVCSS
      50        60        70        80        90             100   

            110       120       130       140                      
pF1KB9 DSFNEDNTAFAKQVRSERPFFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK-------------
       :::::: ..::::::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::             
CCDS45 DSFNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYI
           110       120       130       140       150       160   

         150       160       170       180        190        200   
pF1KB9 ----GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCLSLPDQN-NIWIRDHEDSGSVH-LGTPGP
           :::::::::..:::. . : :.  .:  .: :.: . : :::.:. :.:  :::::
CCDS45 SCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAGTPGP
           170       180       190       200        210       220  

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pF1KB9 SSGGLASQSGDNSSDQGVGLDTSVASPSSGGEDEDLDQEPRRNKKRGIFPKVATNIMRAW
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