FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9553, 706 aa 1>>>pF1KE9553 706 - 706 aa - 706 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2283+/-0.000452; mu= 15.8499+/- 0.028 mean_var=99.2058+/-20.323, 0's: 0 Z-trim(112.5): 63 B-trim: 402 in 1/50 Lambda= 0.128767 statistics sampled from 21399 (21459) to 21399 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.609), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16 Scan time: 9.130 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003497 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isoform ( 706) 4834 909.2 0 NP_001158087 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isof ( 706) 4834 909.2 0 NP_001158088 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isof ( 674) 4605 866.7 0 NP_001304725 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isof ( 401) 2623 498.3 2.3e-140 NP_665873 (OMIM: 606143) frizzled-3 precursor [Hom ( 666) 2298 438.1 5.3e-122 NP_059108 (OMIM: 606143) frizzled-3 precursor [Hom ( 666) 2298 438.1 5.3e-122 XP_016869330 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 ( 599) 2078 397.2 9.7e-110 XP_016869332 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 ( 491) 2039 389.9 1.3e-107 XP_016869331 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 ( 502) 2039 389.9 1.3e-107 XP_016869333 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 ( 470) 2032 388.6 3e-107 NP_003496 (OMIM: 603408) frizzled-1 [Homo sapiens] ( 647) 1265 246.2 3e-64 NP_001457 (OMIM: 600667) frizzled-2 precursor [Hom ( 565) 1259 245.0 5.9e-64 NP_003498 (OMIM: 603410) frizzled-7 precursor [Hom ( 574) 1239 241.3 7.8e-63 NP_036325 (OMIM: 133780,604579) frizzled-4 precurs ( 537) 1039 204.2 1.1e-51 NP_009128 (OMIM: 606147) frizzled-10 precursor [Ho ( 581) 961 189.7 2.8e-47 NP_003459 (OMIM: 601723) frizzled-5 precursor [Hom ( 585) 947 187.1 1.7e-46 NP_003499 (OMIM: 601766) frizzled-9 precursor [Hom ( 591) 916 181.3 9.2e-45 NP_114072 (OMIM: 606146) frizzled-8 precursor [Hom ( 694) 707 142.6 5.1e-33 XP_011514824 (OMIM: 601500,601707,605462) PREDICTE ( 657) 512 106.3 3.9e-22 NP_005622 (OMIM: 601500,601707,605462) smoothened ( 787) 512 106.4 4.5e-22 NP_003005 (OMIM: 265900,606570) secreted frizzled- ( 346) 320 70.5 1.3e-11 NP_001454 (OMIM: 165720,605083) secreted frizzled- ( 325) 307 68.0 6.5e-11 NP_003004 (OMIM: 604157) secreted frizzled-related ( 295) 291 65.0 4.7e-10 NP_001265515 (OMIM: 605236,614595) atrial natriure ( 734) 289 64.9 1.3e-09 NP_001265514 (OMIM: 605236,614595) atrial natriure ( 938) 289 65.0 1.5e-09 NP_006578 (OMIM: 605236,614595) atrial natriuretic (1042) 289 65.0 1.7e-09 NP_003003 (OMIM: 604156) secreted frizzled-related ( 314) 280 63.0 2e-09 NP_003006 (OMIM: 604158) secreted frizzled-related ( 317) 268 60.8 9.7e-09 NP_113621 (OMIM: 606227,609549,611040) membrane fr ( 579) 254 58.3 9.5e-08 NP_003643 (OMIM: 603105) carboxypeptidase Z isofor ( 641) 232 54.3 1.8e-06 NP_001014447 (OMIM: 603105) carboxypeptidase Z iso ( 652) 232 54.3 1.8e-06 >>NP_003497 (OMIM: 603409,614157) frizzled-6 isoform a p (706 aa) initn: 4834 init1: 4834 opt: 4834 Z-score: 4857.1 bits: 909.2 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4834; 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NP_665 HVRDCSPPCPNMYFRREELSFARYFIGLISIICLSATLFTFLTFLIDVTRFRYPERPIIF 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 YSVCYSIVSLMYFIGFLLGDSTACNKADEKLELGDTVVLGSQNKACTVLFMLLYFFTMAG :.::: .:::..:::::: : .::: . ..::. ::.:::::.:::.:::::::: NP_665 YAVCYMMVSLIFFIGFLLEDRVACNASIPAQYKASTVTQGSHNKACTMLFMILYFFTMAG 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 TVWWVILTITWFLAAGRKWSCEAIEQKAVWFHAVAWGTPGFLTVMLLAMNKVEGDNISGV .:::::::::::::: ::. ::::.::. ::: ::: :: ::..::::::.:::::::: NP_665 SVWWVILTITWFLAAVPKWGSEAIEKKALLFHASAWGIPGTLTIILLAMNKIEGDNISGV 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE9 CFVGLYDLDASRYFVLLPLCLCVFVGLSLLLAGIISLNHVRQVIQHDGRNQEKLKKFMIR :::::::.:: ::::: :::: : ::.:::::::::::.:: : . .::.:: ::::: NP_665 CFVGLYDVDALRYFVLAPLCLYVVVGVSLLLAGIISLNRVRIEIPLEKENQDKLVKFMIR 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE9 IGVFSGLYLVPLVTLLGCYVYEQVNRITWEITWVSDHCRQYHIPCPYQAKAKARPELALF ::::: ::::::....::: :::. : :: ::....::.::::::::. .::.: :: NP_665 IGVFSILYLVPLLVVIGCYFYEQAYRGIWETTWIQERCREYHIPCPYQVTQMSRPDLILF 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KE9 MIKYLMTLIVGISAVFWVGSKKTCTEWAGFFKRNRKRDPISESRRVLQESCEFFLKHNSK ..::::.::::: .:::::::::: :::.::. ::.. ..:::.:::: .: .: NP_665 LMKYLMALIVGIPSVFWVGSKKTCFEWASFFHGRRKKEIVNESRQVLQEP-DF---AQSL 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE9 VKHKKKHYKPSSHKLKVISKSMGTSTGATANHGTSA-VAITSHDYLGQETLTEIQTSPET .. :.. .: :: :::: .:..:..:. .:... . .. .: . NP_665 LRD------PNT---PIIRKSRGTSTQGTSTHASSTQLAMVDDQRSKAGSIHSKVSSYHG 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE9 SMREVKADGASTP-RLREQDCGEPASPAASISRLSGEQVDGKGQAGSVSESARSEGRISP :... . :: :: : . : : .:.:::. NP_665 SLHRSR-DGRYTPCSYRGM---EERLPHGSMSRLTDHSRHSSSHRLNEQSRHSSIRDLSN 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 pF1KE9 KSDITDTGLAQSNNLQVPSSSEPSSLKGSTSLLVHPVSGVRKEQGGGCHSDT NP_665 NPMTHITHGTSMNRVIEEDGTSA 650 660 >>NP_059108 (OMIM: 606143) frizzled-3 precursor [Homo sa (666 aa) initn: 2337 init1: 2285 opt: 2298 Z-score: 2311.4 bits: 438.1 E(85289): 5.3e-122 Smith-Waterman score: 2331; 55.2% identity (76.2% similar) in 629 aa overlap (3-629:7-618) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MEMFTFLLTCIFLPLLRGHSLFTCEPITVPRCMKMAYNMTFFPNLMGHYDQSIAAV .:.. .:. . :::::.:::::. :. . :: ::.:::..::::. ::. NP_059 MAMTWIVFSLWPLTVFMGHIGGHSLFSCEPITLRMCQDLPYNTTFMPNLLNHYDQQTAAL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 EMEHFLPLANLECSPNIETFLCKAFVPTCIEQIHVVPPCRKLCEKVYSDCKKLIDTFGIR :: : :..::.:: ... ::: ..: :.: .:. :::.::...::.:.::.. ::. NP_059 AMEPFHPMVNLDCSRDFRPFLCALYAPICMEYGRVTLPCRRLCQRAYSECSKLMEMFGVP 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 WPEELECDRLQYCDETVPVTFDPHTEFLGPQKKTEQVQRDIGFWCPRHLKTSGGQGYKFL :::..::.:. ::: : : . . :::: ::::::.:: . ::.:: NP_059 WPEDMECSRFPDCDEPYPRLVDLNLAGEPTEGAPVAVQRDYGFWCPRELKIDPDLGYSFL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 GIDQCAPPCPNMYFKSDELEFAKSFIGTVSIFCLCATLFTFLTFLIDVRRFRYPERPIIY . .:.::::::::. .:: ::. ::: .::.:: ::::::::::::: ::::::::::. NP_059 HVRDCSPPCPNMYFRREELSFARYFIGLISIICLSATLFTFLTFLIDVTRFRYPERPIIF 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 YSVCYSIVSLMYFIGFLLGDSTACNKADEKLELGDTVVLGSQNKACTVLFMLLYFFTMAG :.::: .:::..:::::: : .::: . ..::. ::.:::::.:::.:::::::: NP_059 YAVCYMMVSLIFFIGFLLEDRVACNASIPAQYKASTVTQGSHNKACTMLFMILYFFTMAG 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 TVWWVILTITWFLAAGRKWSCEAIEQKAVWFHAVAWGTPGFLTVMLLAMNKVEGDNISGV .:::::::::::::: ::. ::::.::. ::: ::: :: ::..::::::.:::::::: NP_059 SVWWVILTITWFLAAVPKWGSEAIEKKALLFHASAWGIPGTLTIILLAMNKIEGDNISGV 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE9 CFVGLYDLDASRYFVLLPLCLCVFVGLSLLLAGIISLNHVRQVIQHDGRNQEKLKKFMIR :::::::.:: ::::: :::: : ::.:::::::::::.:: : . .::.:: ::::: NP_059 CFVGLYDVDALRYFVLAPLCLYVVVGVSLLLAGIISLNRVRIEIPLEKENQDKLVKFMIR 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE9 IGVFSGLYLVPLVTLLGCYVYEQVNRITWEITWVSDHCRQYHIPCPYQAKAKARPELALF ::::: ::::::....::: :::. : :: ::....::.::::::::. .::.: :: NP_059 IGVFSILYLVPLLVVIGCYFYEQAYRGIWETTWIQERCREYHIPCPYQVTQMSRPDLILF 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KE9 MIKYLMTLIVGISAVFWVGSKKTCTEWAGFFKRNRKRDPISESRRVLQESCEFFLKHNSK ..::::.::::: .:::::::::: :::.::. ::.. ..:::.:::: .: .: NP_059 LMKYLMALIVGIPSVFWVGSKKTCFEWASFFHGRRKKEIVNESRQVLQEP-DF---AQSL 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE9 VKHKKKHYKPSSHKLKVISKSMGTSTGATANHGTSA-VAITSHDYLGQETLTEIQTSPET .. :.. .: :: :::: .:..:..:. .:... . .. .: . NP_059 LRD------PNT---PIIRKSRGTSTQGTSTHASSTQLAMVDDQRSKAGSIHSKVSSYHG 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE9 SMREVKADGASTP-RLREQDCGEPASPAASISRLSGEQVDGKGQAGSVSESARSEGRISP :... . :: :: : . : : .:.:::. NP_059 SLHRSR-DGRYTPCSYRGM---EERLPHGSMSRLTDHSRHSSSHRLNEQSRHSSIRDLSN 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 pF1KE9 KSDITDTGLAQSNNLQVPSSSEPSSLKGSTSLLVHPVSGVRKEQGGGCHSDT NP_059 NPMTHITHGTSMNRVIEEDGTSA 650 660 >>XP_016869330 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 isof (599 aa) initn: 2130 init1: 2078 opt: 2078 Z-score: 2091.2 bits: 397.2 E(85289): 9.7e-110 Smith-Waterman score: 2111; 55.8% identity (76.4% similar) in 568 aa overlap (64-629:1-551) 40 50 60 70 80 90 pF1KE9 KMAYNMTFFPNLMGHYDQSIAAVEMEHFLPLANLECSPNIETFLCKAFVPTCIEQIHVVP ..::.:: ... ::: ..: :.: .:. XP_016 MVNLDCSRDFRPFLCALYAPICMEYGRVTL 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KE9 PCRKLCEKVYSDCKKLIDTFGIRWPEELECDRLQYCDETVPVTFDPHTEFLGPQKKTEQV :::.::...::.:.::.. ::. :::..::.:. ::: : : . . : XP_016 PCRRLCQRAYSECSKLMEMFGVPWPEDMECSRFPDCDEPYPRLVDLNLAGEPTEGAPVAV 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 QRDIGFWCPRHLKTSGGQGYKFLGIDQCAPPCPNMYFKSDELEFAKSFIGTVSIFCLCAT ::: ::::::.:: . ::.:: . .:.::::::::. .:: ::. ::: .::.:: :: XP_016 QRDYGFWCPRELKIDPDLGYSFLHVRDCSPPCPNMYFRREELSFARYFIGLISIICLSAT 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 LFTFLTFLIDVRRFRYPERPIIYYSVCYSIVSLMYFIGFLLGDSTACNKADEKLELGDTV ::::::::::: ::::::::::.:.::: .:::..:::::: : .::: . ..:: XP_016 LFTFLTFLIDVTRFRYPERPIIFYAVCYMMVSLIFFIGFLLEDRVACNASIPAQYKASTV 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 VLGSQNKACTVLFMLLYFFTMAGTVWWVILTITWFLAAGRKWSCEAIEQKAVWFHAVAWG . ::.:::::.:::.::::::::.:::::::::::::: ::. ::::.::. ::: ::: XP_016 TQGSHNKACTMLFMILYFFTMAGSVWWVILTITWFLAAVPKWGSEAIEKKALLFHASAWG 220 230 240 250 260 270 340 350 360 370 380 390 pF1KE9 TPGFLTVMLLAMNKVEGDNISGVCFVGLYDLDASRYFVLLPLCLCVFVGLSLLLAGIISL :: ::..::::::.:::::::::::::::.:: ::::: :::: : ::.:::::::::: XP_016 IPGTLTIILLAMNKIEGDNISGVCFVGLYDVDALRYFVLAPLCLYVVVGVSLLLAGIISL 280 290 300 310 320 330 400 410 420 430 440 450 pF1KE9 NHVRQVIQHDGRNQEKLKKFMIRIGVFSGLYLVPLVTLLGCYVYEQVNRITWEITWVSDH :.:: : . .::.:: :::::::::: ::::::....::: :::. : :: ::.... XP_016 NRVRIEIPLEKENQDKLVKFMIRIGVFSILYLVPLLVVIGCYFYEQAYRGIWETTWIQER 340 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 pF1KE9 CRQYHIPCPYQAKAKARPELALFMIKYLMTLIVGISAVFWVGSKKTCTEWAGFFKRNRKR ::.::::::::. .::.: ::..::::.::::: .:::::::::: :::.::. ::. XP_016 CREYHIPCPYQVTQMSRPDLILFLMKYLMALIVGIPSVFWVGSKKTCFEWASFFHGRRKK 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 570 pF1KE9 DPISESRRVLQESCEFFLKHNSKVKHKKKHYKPSSHKLKVISKSMGTSTGATANHGTSA- . ..:::.:::: .: .: .. :.. .: :: :::: .:..:..:. XP_016 EIVNESRQVLQEP-DF---AQSLLRD------PNT---PIIRKSRGTSTQGTSTHASSTQ 460 470 480 490 580 590 600 610 620 630 pF1KE9 VAITSHDYLGQETLTEIQTSPETSMREVKADGASTP-RLREQDCGEPASPAASISRLSGE .:... . .. .: . :... . :: :: : . : : .:.:::. XP_016 LAMVDDQRSKAGSIHSKVSSYHGSLHRSR-DGRYTPCSYRGM---EERLPHGSMSRLTDH 500 510 520 530 540 550 640 650 660 670 680 690 pF1KE9 QVDGKGQAGSVSESARSEGRISPKSDITDTGLAQSNNLQVPSSSEPSSLKGSTSLLVHPV XP_016 SRHSSSHRLNEQSRHSSIRDLSNNPMTHITHGTSMNRVIEEDGTSA 560 570 580 590 >>XP_016869332 (OMIM: 606143) PREDICTED: frizzled-3 isof (491 aa) initn: 2026 init1: 2026 opt: 2039 Z-score: 2053.2 bits: 389.9 E(85289): 1.3e-107 Smith-Waterman score: 2039; 60.9% identity (79.8% similar) in 466 aa overlap (3-468:7-472) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MEMFTFLLTCIFLPLLRGHSLFTCEPITVPRCMKMAYNMTFFPNLMGHYDQSIAAV .:.. .:. . :::::.:::::. :. . :: ::.:::..::::. ::. XP_016 MAMTWIVFSLWPLTVFMGHIGGHSLFSCEPITLRMCQDLPYNTTFMPNLLNHYDQQTAAL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 EMEHFLPLANLECSPNIETFLCKAFVPTCIEQIHVVPPCRKLCEKVYSDCKKLIDTFGIR :: : :..::.:: ... ::: ..: :.: .:. :::.::...::.:.::.. ::. XP_016 AMEPFHPMVNLDCSRDFRPFLCALYAPICMEYGRVTLPCRRLCQRAYSECSKLMEMFGVP 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 WPEELECDRLQYCDETVPVTFDPHTEFLGPQKKTEQVQRDIGFWCPRHLKTSGGQGYKFL :::..::.:. ::: : : . . :::: ::::::.:: . ::.:: XP_016 WPEDMECSRFPDCDEPYPRLVDLNLAGEPTEGAPVAVQRDYGFWCPRELKIDPDLGYSFL 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 GIDQCAPPCPNMYFKSDELEFAKSFIGTVSIFCLCATLFTFLTFLIDVRRFRYPERPIIY . .:.::::::::. .:: ::. ::: .::.:: ::::::::::::: ::::::::::. 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