Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9577
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9577, 1211 aa
1>>>pF1KB9577 1211 - 1211 aa - 1211 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7716+/-0.00101; mu= 19.4308+/- 0.061
mean_var=70.7764+/-14.272, 0's: 0 Z-trim(103.7): 31 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.152451
statistics sampled from 7514 (7538) to 7514 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16
Scan time: 5.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14084.1 MOV10L1 gene_id:54456|Hs108|chr22 (1211) 8085 1788.4 0
CCDS54542.1 MOV10L1 gene_id:54456|Hs108|chr22 (1165) 7468 1652.6 0
CCDS54541.1 MOV10L1 gene_id:54456|Hs108|chr22 (1165) 7375 1632.2 0
CCDS54543.1 MOV10L1 gene_id:54456|Hs108|chr22 ( 338) 2254 505.7 8e-143
CCDS65615.1 MOV10 gene_id:4343|Hs108|chr1 ( 947) 932 215.1 6.7e-55
CCDS853.1 MOV10 gene_id:4343|Hs108|chr1 (1003) 932 215.1 7e-55
CCDS14647.1 CT55 gene_id:54967|Hs108|chrX ( 242) 790 183.6 5.1e-46
CCDS35400.1 CT55 gene_id:54967|Hs108|chrX ( 264) 790 183.6 5.5e-46
CCDS12386.1 UPF1 gene_id:5976|Hs108|chr19 (1118) 410 100.3 2.8e-20
CCDS74315.1 UPF1 gene_id:5976|Hs108|chr19 (1129) 410 100.3 2.8e-20
CCDS44415.2 DNA2 gene_id:1763|Hs108|chr10 (1060) 380 93.7 2.6e-18
CCDS33508.1 HELZ2 gene_id:85441|Hs108|chr20 (2649) 332 83.3 8.8e-15
>>CCDS14084.1 MOV10L1 gene_id:54456|Hs108|chr22 (1211 aa)
initn: 8085 init1: 8085 opt: 8085 Z-score: 9599.9 bits: 1788.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8085; 100.0% identity (100.0% similar) in 1211 aa overlap (1-1211:1-1211)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MLSLAAKLVAFFWRTADTPREEAGQLEPELAEGDTKLKTVRGVVTRYCSDYGMIDDMIYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MLSLAAKLVAFFWRTADTPREEAGQLEPELAEGDTKLKTVRGVVTRYCSDYGMIDDMIYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SSDAVTSRVLLNVGQEVIAVVEENKVSNGLKAIRVEAVSDKWEDDSRNHGSPSDCGPRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SSDAVTSRVLLNVGQEVIAVVEENKVSNGLKAIRVEAVSDKWEDDSRNHGSPSDCGPRVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 IGCVTSLVEGAGCISQTTYFSLESVCEGFEPCKGDWVEAEYRIRPGTWSSEATSVKPLRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IGCVTSLVEGAGCISQTTYFSLESVCEGFEPCKGDWVEAEYRIRPGTWSSEATSVKPLRY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KRVDKVCISSLCGRNGVLEESIFFTLDSLKLPDGYTPRRGDVVNAVVVESSQSCYVWRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KRVDKVCISSLCGRNGVLEESIFFTLDSLKLPDGYTPRRGDVVNAVVVESSQSCYVWRAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 CMTLVKRRDAAPVHEATHFYGTILLKNKGDIEVTQVTHFGTLKEGRSKTMVIWIENKGDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CMTLVKRRDAAPVHEATHFYGTILLKNKGDIEVTQVTHFGTLKEGRSKTMVIWIENKGDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 PQNLVSCKLAGWDKSKQFRFQMLDKDQMCPVVSFVSVPEKENSSDENINSLNSHTKNKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PQNLVSCKLAGWDKSKQFRFQMLDKDQMCPVVSFVSVPEKENSSDENINSLNSHTKNKTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 QMSESSLVNNRGISPGDCTCKGENGEKDNILSRKQMTEPEPGGLVPPGGKTFIVVICDGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QMSESSLVNNRGISPGDCTCKGENGEKDNILSRKQMTEPEPGGLVPPGGKTFIVVICDGK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 NPGRCKELLLLCFSDFLIGRYLEVNVISGEESLIAAREPFSWKKLKSSQALTSAKTTVVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NPGRCKELLLLCFSDFLIGRYLEVNVISGEESLIAAREPFSWKKLKSSQALTSAKTTVVV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 TAQKRNSRRQLPSFLPQYPIPDRLRKCVEQKIDILTFQPLLAELLNMSNYKEKFSTLLWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TAQKRNSRRQLPSFLPQYPIPDRLRKCVEQKIDILTFQPLLAELLNMSNYKEKFSTLLWL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 EEIYAEMELKEYNMSGIILRRNGDLLVLEVPGLAEGRPSLYAGDKLILKTQEYNGHAIEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EEIYAEMELKEYNMSGIILRRNGDLLVLEVPGLAEGRPSLYAGDKLILKTQEYNGHAIEY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 ISYVTEIHEEDVTLKINPEFEQAYNFEPMDVEFTYNRTTSRRCHFALEHVIHLGVKVLFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ISYVTEIHEEDVTLKINPEFEQAYNFEPMDVEFTYNRTTSRRCHFALEHVIHLGVKVLFP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 EEIILQSPQVTGNWNHAQDTKSSGQSTSKKNRKTMTDQAEHGTEERRVGDKDLPVLAPFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EEIILQSPQVTGNWNHAQDTKSSGQSTSKKNRKTMTDQAEHGTEERRVGDKDLPVLAPFT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 AEMSDWVDEIQTPKARKMEFFNPVLNENQKLAVKRILSGDCRPLPYILFGPPGTGKTVTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AEMSDWVDEIQTPKARKMEFFNPVLNENQKLAVKRILSGDCRPLPYILFGPPGTGKTVTI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 IEAVLQVHFALPDSRILVCAPSNSAADLVCLRLHESKVLQPATMVRVNATCRFEEIVIDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IEAVLQVHFALPDSRILVCAPSNSAADLVCLRLHESKVLQPATMVRVNATCRFEEIVIDA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 VKPYCRDGEDIWKASRFRIIITTCSSSGLFYQIGVRVGHFTHVFVDEAGQASEPECLIPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VKPYCRDGEDIWKASRFRIIITTCSSSGLFYQIGVRVGHFTHVFVDEAGQASEPECLIPL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 GLMSDISGQIVLAGDPMQLGPVIKSRLAMAYGLNVSFLERLMSRPAYQRDENAFGACGAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GLMSDISGQIVLAGDPMQLGPVIKSRLAMAYGLNVSFLERLMSRPAYQRDENAFGACGAH
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 NPLLVTKLVKNYRSHEALLMLPSRLFYHRELEVCADPTVVTSLLGWEKLPKKGFPLIFHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NPLLVTKLVKNYRSHEALLMLPSRLFYHRELEVCADPTVVTSLLGWEKLPKKGFPLIFHG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB9 VRGSEAREGKSPSWFNPAEAVQVLRYCCLLAHSISSQVSASDIGVITPYRKQVEKIRILL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VRGSEAREGKSPSWFNPAEAVQVLRYCCLLAHSISSQVSASDIGVITPYRKQVEKIRILL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB9 RNVDLMDIKVGSVEEFQGQEYLVIIISTVRSNEDRFEDDRYFLGFLSNSKRFNVAITRPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RNVDLMDIKVGSVEEFQGQEYLVIIISTVRSNEDRFEDDRYFLGFLSNSKRFNVAITRPK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB9 ALLIVLGNPHVLVRDPCFGALLEYSITNGVYMGCDLPPALQSLQNCGEGVADPSYPVVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ALLIVLGNPHVLVRDPCFGALLEYSITNGVYMGCDLPPALQSLQNCGEGVADPSYPVVPE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210
pF1KB9 STGPEKHQEPS
:::::::::::
CCDS14 STGPEKHQEPS
1210
>>CCDS54542.1 MOV10L1 gene_id:54456|Hs108|chr22 (1165 aa)
initn: 7468 init1: 7468 opt: 7468 Z-score: 8866.7 bits: 1652.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7468; 100.0% identity (100.0% similar) in 1122 aa overlap (33-1154:13-1134)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 SLAAKLVAFFWRTADTPREEAGQLEPELAEGDTKLKTVRGVVTRYCSDYGMIDDMIYFSS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSFLPVRSVIGGGDTKLKTVRGVVTRYCSDYGMIDDMIYFSS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 DAVTSRVLLNVGQEVIAVVEENKVSNGLKAIRVEAVSDKWEDDSRNHGSPSDCGPRVLIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DAVTSRVLLNVGQEVIAVVEENKVSNGLKAIRVEAVSDKWEDDSRNHGSPSDCGPRVLIG
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 CVTSLVEGAGCISQTTYFSLESVCEGFEPCKGDWVEAEYRIRPGTWSSEATSVKPLRYKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CVTSLVEGAGCISQTTYFSLESVCEGFEPCKGDWVEAEYRIRPGTWSSEATSVKPLRYKR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VDKVCISSLCGRNGVLEESIFFTLDSLKLPDGYTPRRGDVVNAVVVESSQSCYVWRALCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VDKVCISSLCGRNGVLEESIFFTLDSLKLPDGYTPRRGDVVNAVVVESSQSCYVWRALCM
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 TLVKRRDAAPVHEATHFYGTILLKNKGDIEVTQVTHFGTLKEGRSKTMVIWIENKGDIPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TLVKRRDAAPVHEATHFYGTILLKNKGDIEVTQVTHFGTLKEGRSKTMVIWIENKGDIPQ
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 NLVSCKLAGWDKSKQFRFQMLDKDQMCPVVSFVSVPEKENSSDENINSLNSHTKNKTSQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NLVSCKLAGWDKSKQFRFQMLDKDQMCPVVSFVSVPEKENSSDENINSLNSHTKNKTSQM
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 SESSLVNNRGISPGDCTCKGENGEKDNILSRKQMTEPEPGGLVPPGGKTFIVVICDGKNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SESSLVNNRGISPGDCTCKGENGEKDNILSRKQMTEPEPGGLVPPGGKTFIVVICDGKNP
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 GRCKELLLLCFSDFLIGRYLEVNVISGEESLIAAREPFSWKKLKSSQALTSAKTTVVVTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GRCKELLLLCFSDFLIGRYLEVNVISGEESLIAAREPFSWKKLKSSQALTSAKTTVVVTA
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 QKRNSRRQLPSFLPQYPIPDRLRKCVEQKIDILTFQPLLAELLNMSNYKEKFSTLLWLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QKRNSRRQLPSFLPQYPIPDRLRKCVEQKIDILTFQPLLAELLNMSNYKEKFSTLLWLEE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 IYAEMELKEYNMSGIILRRNGDLLVLEVPGLAEGRPSLYAGDKLILKTQEYNGHAIEYIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IYAEMELKEYNMSGIILRRNGDLLVLEVPGLAEGRPSLYAGDKLILKTQEYNGHAIEYIS
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 YVTEIHEEDVTLKINPEFEQAYNFEPMDVEFTYNRTTSRRCHFALEHVIHLGVKVLFPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YVTEIHEEDVTLKINPEFEQAYNFEPMDVEFTYNRTTSRRCHFALEHVIHLGVKVLFPEE
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 IILQSPQVTGNWNHAQDTKSSGQSTSKKNRKTMTDQAEHGTEERRVGDKDLPVLAPFTAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IILQSPQVTGNWNHAQDTKSSGQSTSKKNRKTMTDQAEHGTEERRVGDKDLPVLAPFTAE
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 MSDWVDEIQTPKARKMEFFNPVLNENQKLAVKRILSGDCRPLPYILFGPPGTGKTVTIIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSDWVDEIQTPKARKMEFFNPVLNENQKLAVKRILSGDCRPLPYILFGPPGTGKTVTIIE
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 AVLQVHFALPDSRILVCAPSNSAADLVCLRLHESKVLQPATMVRVNATCRFEEIVIDAVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AVLQVHFALPDSRILVCAPSNSAADLVCLRLHESKVLQPATMVRVNATCRFEEIVIDAVK
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 PYCRDGEDIWKASRFRIIITTCSSSGLFYQIGVRVGHFTHVFVDEAGQASEPECLIPLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PYCRDGEDIWKASRFRIIITTCSSSGLFYQIGVRVGHFTHVFVDEAGQASEPECLIPLGL
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 MSDISGQIVLAGDPMQLGPVIKSRLAMAYGLNVSFLERLMSRPAYQRDENAFGACGAHNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSDISGQIVLAGDPMQLGPVIKSRLAMAYGLNVSFLERLMSRPAYQRDENAFGACGAHNP
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 LLVTKLVKNYRSHEALLMLPSRLFYHRELEVCADPTVVTSLLGWEKLPKKGFPLIFHGVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LLVTKLVKNYRSHEALLMLPSRLFYHRELEVCADPTVVTSLLGWEKLPKKGFPLIFHGVR
950 960 970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB9 GSEAREGKSPSWFNPAEAVQVLRYCCLLAHSISSQVSASDIGVITPYRKQVEKIRILLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSEAREGKSPSWFNPAEAVQVLRYCCLLAHSISSQVSASDIGVITPYRKQVEKIRILLRN
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB9 VDLMDIKVGSVEEFQGQEYLVIIISTVRSNEDRFEDDRYFLGFLSNSKRFNVAITRPKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VDLMDIKVGSVEEFQGQEYLVIIISTVRSNEDRFEDDRYFLGFLSNSKRFNVAITRPKAL
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB9 LIVLGNPHVLVRDPCFGALLEYSITNGVYMGCDLPPALQSLQNCGEGVADPSYPVVPEST
::::::::::::
CCDS54 LIVLGNPHVLVRLWRGGGRPLLPSGARIHRTREASGAQLICSG
1130 1140 1150 1160
>>CCDS54541.1 MOV10L1 gene_id:54456|Hs108|chr22 (1165 aa)
initn: 7375 init1: 7375 opt: 7375 Z-score: 8756.2 bits: 1632.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7684; 96.2% identity (96.2% similar) in 1211 aa overlap (1-1211:1-1165)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MLSLAAKLVAFFWRTADTPREEAGQLEPELAEGDTKLKTVRGVVTRYCSDYGMIDDMIYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MLSLAAKLVAFFWRTADTPREEAGQLEPELAEGDTKLKTVRGVVTRYCSDYGMIDDMIYF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SSDAVTSRVLLNVGQEVIAVVEENKVSNGLKAIRVEAVSDKWEDDSRNHGSPSDCGPRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SSDAVTSRVLLNVGQEVIAVVEENKVSNGLKAIRVEAVSDKWEDDSRNHGSPSDCGPRVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 IGCVTSLVEGAGCISQTTYFSLESVCEGFEPCKGDWVEAEYRIRPGTWSSEATSVKPLRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IGCVTSLVEGAGCISQTTYFSLESVCEGFEPCKGDWVEAEYRIRPGTWSSEATSVKPLRY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KRVDKVCISSLCGRNGVLEESIFFTLDSLKLPDGYTPRRGDVVNAVVVESSQSCYVWRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KRVDKVCISSLCGRNGVLEESIFFTLDSLKLPDGYTPRRGDVVNAVVVESSQSCYVWRAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 CMTLVKRRDAAPVHEATHFYGTILLKNKGDIEVTQVTHFGTLKEGRSKTMVIWIENKGDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CMTLVKRRDAAPVHEATHFYGTILLKNKGDIEVTQVTHFGTLKEGRSKTMVIWIENKGDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 PQNLVSCKLAGWDKSKQFRFQMLDKDQMCPVVSFVSVPEKENSSDENINSLNSHTKNKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PQNLVSCKLAGWDKSKQFRFQMLDKDQMCPVVSFVSVPEKENSSDENINSLNSHTKNKTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 QMSESSLVNNRGISPGDCTCKGENGEKDNILSRKQMTEPEPGGLVPPGGKTFIVVICDGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QMSESSLVNNRGISPGDCTCKGENGEKDNILSRKQMTEPEPGGLVPPGGKTFIVVICDGK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 NPGRCKELLLLCFSDFLIGRYLEVNVISGEESLIAAREPFSWKKLKSSQALTSAKTTVVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NPGRCKELLLLCFSDFLIGRYLEVNVISGEESLIAAREPFSWKKLKSSQALTSAKTTVVV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 TAQKRNSRRQLPSFLPQYPIPDRLRKCVEQKIDILTFQPLLAELLNMSNYKEKFSTLLWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TAQKRNSRRQLPSFLPQYPIPDRLRKCVEQKIDILTFQPLLAELLNMSNYKEKFSTLLWL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 EEIYAEMELKEYNMSGIILRRNGDLLVLEVPGLAEGRPSLYAGDKLILKTQEYNGHAIEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EEIYAEMELKEYNMSGIILRRNGDLLVLEVPGLAEGRPSLYAGDKLILKTQEYNGHAIEY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 ISYVTEIHEEDVTLKINPEFEQAYNFEPMDVEFTYNRTTSRRCHFALEHVIHLGVKVLFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ISYVTEIHEEDVTLKINPEFEQAYNFEPMDVEFTYNRTTSRRCHFALEHVIHLGVKVLFP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 EEIILQSPQVTGNWNHAQDTKSSGQSTSKKNRKTMTDQAEHGTEERRVGDKDLPVLAPFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EEIILQSPQVTGNWNHAQDTKSSGQSTSKKNRKTMTDQAEHGTEERRVGDKDLPVLAPFT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 AEMSDWVDEIQTPKARKMEFFNPVLNENQKLAVKRILSGDCRPLPYILFGPPGTGKTVTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AEMSDWVDEIQTPKARKMEFFNPVLNENQKLAVKRILSGDCRPLPYILFGPPGTGKTVTI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 IEAVLQVHFALPDSRILVCAPSNSAADLVCLRLHESKVLQPATMVRVNATCRFEEIVIDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IEAVLQVHFALPDSRILVCAPSNSAADLVCLRLHESKVLQPATMVRVNATCRFEEIVIDA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 VKPYCRDGEDIWKASRFRIIITTCSSSGLFYQIGVRVGHFTHVFVDEAGQASEPECLIPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VKPYCRDGEDIWKASRFRIIITTCSSSGLFYQIGVRVGHFTHVFVDEAGQASEPECLIPL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 GLMSDISGQIVLAGDPMQLGPVIKSRLAMAYGLNVSFLERLMSRPAYQRDENAFGACGAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GLMSDISGQIVLAGDPMQLGPVIKSRLAMAYGLNVSFLERLMSRPAYQRDENAFGACGAH
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 NPLLVTKLVKNYRSHEALLMLPSRLFYHRELEVCADPTVVTSLLGWEKLPKKGFPLIFHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NPLLVTKLVKNYRSHEALLMLPSRLFYHRELEVCADPTVVTSLLGWEKLPKKGFPLIFHG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB9 VRGSEAREGKSPSWFNPAEAVQVLRYCCLLAHSISSQVSASDIGVITPYRKQVEKIRILL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VRGSEAREGKSPSWFNPAEAVQVLRYCCLLAHSISSQVSASDIGVITPYRKQVEKIRILL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB9 RNVDLMDIKVGSVEEFQGQEYLVIIISTVRSNEDRFEDDRYFLGFLSNSKRFNVAITRPK
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RNVDLMDIKVGSVEEFQGQEYLVIIIST--------------------------------
1090 1100
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB9 ALLIVLGNPHVLVRDPCFGALLEYSITNGVYMGCDLPPALQSLQNCGEGVADPSYPVVPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 --------------DPCFGALLEYSITNGVYMGCDLPPALQSLQNCGEGVADPSYPVVPE
1110 1120 1130 1140 1150
1210
pF1KB9 STGPEKHQEPS
:::::::::::
CCDS54 STGPEKHQEPS
1160
>>CCDS54543.1 MOV10L1 gene_id:54456|Hs108|chr22 (338 aa)
initn: 2254 init1: 2254 opt: 2254 Z-score: 2677.6 bits: 505.7 E(32554): 8e-143
Smith-Waterman score: 2254; 100.0% identity (100.0% similar) in 336 aa overlap (876-1211:3-338)
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 RDGEDIWKASRFRIIITTCSSSGLFYQIGVRVGHFTHVFVDEAGQASEPECLIPLGLMSD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MFRVGHFTHVFVDEAGQASEPECLIPLGLMSD
10 20 30
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 ISGQIVLAGDPMQLGPVIKSRLAMAYGLNVSFLERLMSRPAYQRDENAFGACGAHNPLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ISGQIVLAGDPMQLGPVIKSRLAMAYGLNVSFLERLMSRPAYQRDENAFGACGAHNPLLV
40 50 60 70 80 90
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 TKLVKNYRSHEALLMLPSRLFYHRELEVCADPTVVTSLLGWEKLPKKGFPLIFHGVRGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TKLVKNYRSHEALLMLPSRLFYHRELEVCADPTVVTSLLGWEKLPKKGFPLIFHGVRGSE
100 110 120 130 140 150
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB9 AREGKSPSWFNPAEAVQVLRYCCLLAHSISSQVSASDIGVITPYRKQVEKIRILLRNVDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AREGKSPSWFNPAEAVQVLRYCCLLAHSISSQVSASDIGVITPYRKQVEKIRILLRNVDL
160 170 180 190 200 210
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB9 MDIKVGSVEEFQGQEYLVIIISTVRSNEDRFEDDRYFLGFLSNSKRFNVAITRPKALLIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MDIKVGSVEEFQGQEYLVIIISTVRSNEDRFEDDRYFLGFLSNSKRFNVAITRPKALLIV
220 230 240 250 260 270
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB9 LGNPHVLVRDPCFGALLEYSITNGVYMGCDLPPALQSLQNCGEGVADPSYPVVPESTGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LGNPHVLVRDPCFGALLEYSITNGVYMGCDLPPALQSLQNCGEGVADPSYPVVPESTGPE
280 290 300 310 320 330
1210
pF1KB9 KHQEPS
::::::
CCDS54 KHQEPS
>>CCDS65615.1 MOV10 gene_id:4343|Hs108|chr1 (947 aa)
initn: 1374 init1: 322 opt: 932 Z-score: 1099.1 bits: 215.1 E(32554): 6.7e-55
Smith-Waterman score: 1451; 36.5% identity (60.5% similar) in 825 aa overlap (436-1207:176-922)
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 PPGGKTFIVVICDGKNPGRCKELLLLCFSDFLIGRYLEVNVISGEESLIAAREPFSWKKL
: :.:.: . . : . . ::. ..
CCDS65 CKTSFVGYFPATVLWELLGPGESGSEGAGTFYIARFLAAVAHSPLAAQLKPMTPFKRTRI
150 160 170 180 190 200
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 KSSQALTSAKTTVVVTAQKRNSRRQLPSFLPQYPIPDRLRKCVE---QKIDILTFQPLLA
.. ..:. . .. .: : : : :::. . : .:.: .:
CCDS65 TGNPVVTNRIEEGERPDRAKGYDLELSMALGTYYPPPRLRQLLPMLLQGTSIFTAPKEIA
210 220 230 240 250 260
530 540 550 560 570
pF1KB9 EL-------LNMSNYKEKFSTLLWLEEIYAEMELKEYNMSGIILR-----RNGDLLVLEV
:. :. ::. :. :: :::. : ....:.. .. . .: ::.:::
CCDS65 EIKAQLETALKWRNYEVKLRLLLHLEELQMEHDIRHYDLESVPMTWDPVDQNPRLLTLEV
270 280 290 300 310 320
580 590 600 610 620
pF1KB9 PGLAEGRPSLYAGDKL--ILKTQEYNGHAIEYISYVTEIHEEDVTLKIN----PEFEQAY
::..:.:::. ::.: .:... .. : : ..: ... . : :... .: ..
CCDS65 PGVTESRPSVLRGDHLFALLSSETHQEDPITYKGFVHKVELDRVKLSFSMSLLSRFVDGL
330 340 350 360 370 380
630 640 650 660 670 680
pF1KB9 NFEPMDVEFTYNRTTSRRCHFALEHVIHLGVKVLFPEEIILQSPQVTGNWNHAQDTKSSG
.:. :.::.:: : : ::: . : .:.: . :
CCDS65 TFK---VNFTFNRQPLRVQHRALELT---GRWLLWP----MLFP----------------
390 400 410
690 700 710 720 730 740
pF1KB9 QSTSKKNRKTMTDQAEHGTEERRVGDKDLPVLAPFTAEMSDWVDEIQTPKARKMEFFNPV
:. .:.:.: :. :.....
CCDS65 -----------------------VAPRDVPLL----------------PSDVKLKLYDRS
420 430 440
750 760 770 780 790 800
pF1KB9 LNEN--QKLAVKRILSGDCRPLPYILFGPPGTGKTVTIIEAVLQVHFALPDSRILVCAPS
:. : : :...:..: :: :::.:::::::::::..::. :: :: ..::.::::
CCDS65 LESNPEQLQAMRHIVTGTTRPAPYIIFGPPGTGKTVTLVEAIKQVVKHLPKAHILACAPS
450 460 470 480 490 500
810 820 830 840 850
pF1KB9 NSAADLVCLRLHESKVLQPATMVRVNATCRFEEIVIDAVKPYC----RDGEDIWKASR--
::.:::.: :: .: :... :. : : ..: . .:: : . :: .. :..
CCDS65 NSGADLLCQRL---RVHLPSSIYRLLAPSRDIRMVPEDIKPCCNWDAKKGEYVFPAKKKL
510 520 530 540 550
860 870 880 890 900
pF1KB9 --FRIIITTCSSSGLFYQIGVRVGHFTHVFVDEAGQASEPECLIPL-GLM-----SDISG
.:..::: ..: . . . ::::.:.::::. ::: :. . ::: .: .:
CCDS65 QEYRVLITTLITAGRLVSAQFPIDHFTHIFIDEAGHCMEPESLVAIAGLMEVKETGDPGG
560 570 580 590 600 610
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 QIVLAGDPMQLGPVIKSRLAMAYGLNVSFLERLMSRPA-YQRDENAFGACGAHNPLLVTK
:.:::::: :::::..: :.. .::. :.::::.. . :.. ... .: ..::
CCDS65 QLVLAGDPRQLGPVLRSPLTQKHGLGYSLLERLLTYNSLYKKGPDGY------DPQFITK
620 630 640 650 660 670
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 LVKNYRSHEALLMLPSRLFYHRELEVCADPTVVTSLLGWEKLPKKGFPLIFHGVRGSEAR
:..::::: ..: .:..:.:. ::..::: . . : ::..:::.::::: :.. :
CCDS65 LLRNYRSHPTILDIPNQLYYEGELQACADVVDRERFCRWAGLPRQGFPIIFHGVMGKDER
680 690 700 710 720 730
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB9 EGKSPSWFNPAEAVQVLRYCCLLAHSISSQ----VSASDIGVITPYRKQVEKIRIL----
::.:::.::: ::. : : :: :.. .: ..:::.::::::::::
CCDS65 EGNSPSFFNPEEAATVTSYLKLLLAPSSKKGKARLSPRSVGVISPYRKQVEKIRYCITKL
740 750 760 770 780 790
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB9 ---LRNVD-LMDIKVGSVEEFQGQEYLVIIISTVRSNEDRFEDDRYF-LGFLSNSKRFNV
::..: . :.:::::::::::: ::.::::::... . : : ::::.: :::::
CCDS65 DRELRGLDDIKDLKVGSVEEFQGQERSVILISTVRSSQSFVQLDLDFNLGFLKNPKRFNV
800 810 820 830 840 850
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB9 AITRPKALLIVLGNPHVLVRDPCFGALLEYSITNGVYMGCDLPPAL--QSLQNCGEGVAD
:.:: :::::..::: .: .:: . ..::. :: : :: .: : :. :: .:..
CCDS65 AVTRAKALLIIVGNPLLLGHDPDWKVFLEFCKENGGYTGCPFPAKLDLQQGQNLLQGLSK
860 870 880 890 900 910
1200 1210
pF1KB9 PSYPVVPESTGPEKHQEPS
: : ..::..:
CCDS65 LS----PSTSGPHSHDYLPQEREGEGGLSLQVEPEWRNEL
920 930 940
>>CCDS853.1 MOV10 gene_id:4343|Hs108|chr1 (1003 aa)
initn: 1374 init1: 322 opt: 932 Z-score: 1098.7 bits: 215.1 E(32554): 7e-55
Smith-Waterman score: 1451; 36.5% identity (60.5% similar) in 825 aa overlap (436-1207:232-978)
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 PPGGKTFIVVICDGKNPGRCKELLLLCFSDFLIGRYLEVNVISGEESLIAAREPFSWKKL
: :.:.: . . : . . ::. ..
CCDS85 CKTSFVGYFPATVLWELLGPGESGSEGAGTFYIARFLAAVAHSPLAAQLKPMTPFKRTRI
210 220 230 240 250 260
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 KSSQALTSAKTTVVVTAQKRNSRRQLPSFLPQYPIPDRLRKCVE---QKIDILTFQPLLA
.. ..:. . .. .: : : : :::. . : .:.: .:
CCDS85 TGNPVVTNRIEEGERPDRAKGYDLELSMALGTYYPPPRLRQLLPMLLQGTSIFTAPKEIA
270 280 290 300 310 320
530 540 550 560 570
pF1KB9 EL-------LNMSNYKEKFSTLLWLEEIYAEMELKEYNMSGIILR-----RNGDLLVLEV
:. :. ::. :. :: :::. : ....:.. .. . .: ::.:::
CCDS85 EIKAQLETALKWRNYEVKLRLLLHLEELQMEHDIRHYDLESVPMTWDPVDQNPRLLTLEV
330 340 350 360 370 380
580 590 600 610 620
pF1KB9 PGLAEGRPSLYAGDKL--ILKTQEYNGHAIEYISYVTEIHEEDVTLKIN----PEFEQAY
::..:.:::. ::.: .:... .. : : ..: ... . : :... .: ..
CCDS85 PGVTESRPSVLRGDHLFALLSSETHQEDPITYKGFVHKVELDRVKLSFSMSLLSRFVDGL
390 400 410 420 430 440
630 640 650 660 670 680
pF1KB9 NFEPMDVEFTYNRTTSRRCHFALEHVIHLGVKVLFPEEIILQSPQVTGNWNHAQDTKSSG
.:. :.::.:: : : ::: . : .:.: . :
CCDS85 TFK---VNFTFNRQPLRVQHRALELT---GRWLLWP----MLFP----------------
450 460 470
690 700 710 720 730 740
pF1KB9 QSTSKKNRKTMTDQAEHGTEERRVGDKDLPVLAPFTAEMSDWVDEIQTPKARKMEFFNPV
:. .:.:.: :. :.....
CCDS85 -----------------------VAPRDVPLL----------------PSDVKLKLYDRS
480 490
750 760 770 780 790 800
pF1KB9 LNEN--QKLAVKRILSGDCRPLPYILFGPPGTGKTVTIIEAVLQVHFALPDSRILVCAPS
:. : : :...:..: :: :::.:::::::::::..::. :: :: ..::.::::
CCDS85 LESNPEQLQAMRHIVTGTTRPAPYIIFGPPGTGKTVTLVEAIKQVVKHLPKAHILACAPS
500 510 520 530 540 550
810 820 830 840 850
pF1KB9 NSAADLVCLRLHESKVLQPATMVRVNATCRFEEIVIDAVKPYC----RDGEDIWKASR--
::.:::.: :: .: :... :. : : ..: . .:: : . :: .. :..
CCDS85 NSGADLLCQRL---RVHLPSSIYRLLAPSRDIRMVPEDIKPCCNWDAKKGEYVFPAKKKL
560 570 580 590 600 610
860 870 880 890 900
pF1KB9 --FRIIITTCSSSGLFYQIGVRVGHFTHVFVDEAGQASEPECLIPL-GLM-----SDISG
.:..::: ..: . . . ::::.:.::::. ::: :. . ::: .: .:
CCDS85 QEYRVLITTLITAGRLVSAQFPIDHFTHIFIDEAGHCMEPESLVAIAGLMEVKETGDPGG
620 630 640 650 660 670
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 QIVLAGDPMQLGPVIKSRLAMAYGLNVSFLERLMSRPA-YQRDENAFGACGAHNPLLVTK
:.:::::: :::::..: :.. .::. :.::::.. . :.. ... .: ..::
CCDS85 QLVLAGDPRQLGPVLRSPLTQKHGLGYSLLERLLTYNSLYKKGPDGY------DPQFITK
680 690 700 710 720
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 LVKNYRSHEALLMLPSRLFYHRELEVCADPTVVTSLLGWEKLPKKGFPLIFHGVRGSEAR
:..::::: ..: .:..:.:. ::..::: . . : ::..:::.::::: :.. :
CCDS85 LLRNYRSHPTILDIPNQLYYEGELQACADVVDRERFCRWAGLPRQGFPIIFHGVMGKDER
730 740 750 760 770 780
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB9 EGKSPSWFNPAEAVQVLRYCCLLAHSISSQ----VSASDIGVITPYRKQVEKIRIL----
::.:::.::: ::. : : :: :.. .: ..:::.::::::::::
CCDS85 EGNSPSFFNPEEAATVTSYLKLLLAPSSKKGKARLSPRSVGVISPYRKQVEKIRYCITKL
790 800 810 820 830 840
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB9 ---LRNVD-LMDIKVGSVEEFQGQEYLVIIISTVRSNEDRFEDDRYF-LGFLSNSKRFNV
::..: . :.:::::::::::: ::.::::::... . : : ::::.: :::::
CCDS85 DRELRGLDDIKDLKVGSVEEFQGQERSVILISTVRSSQSFVQLDLDFNLGFLKNPKRFNV
850 860 870 880 890 900
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB9 AITRPKALLIVLGNPHVLVRDPCFGALLEYSITNGVYMGCDLPPAL--QSLQNCGEGVAD
:.:: :::::..::: .: .:: . ..::. :: : :: .: : :. :: .:..
CCDS85 AVTRAKALLIIVGNPLLLGHDPDWKVFLEFCKENGGYTGCPFPAKLDLQQGQNLLQGLSK
910 920 930 940 950 960
1200 1210
pF1KB9 PSYPVVPESTGPEKHQEPS
: : ..::..:
CCDS85 LS----PSTSGPHSHDYLPQEREGEGGLSLQVEPEWRNEL
970 980 990 1000
>>CCDS14647.1 CT55 gene_id:54967|Hs108|chrX (242 aa)
initn: 814 init1: 498 opt: 790 Z-score: 939.7 bits: 183.6 E(32554): 5.1e-46
Smith-Waterman score: 790; 52.6% identity (74.5% similar) in 247 aa overlap (1-247:1-241)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MLSLAAKLVAFFWRTADTPREEAGQLEPELAEGDTKLKTVRGVVTRYCSDYGMIDDMIYF
:: : .::. :::: : :. : . : .:::.: ::.:::: .:.::::::. :::
CCDS14 MLRLLRLALAFYGRTAD-PAERQGPQQQGLPQGDTQLTTVQGVVTSFCGDYGMIDESIYF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SSDAVTSRVLLNVGQEVIAVVEENKVSNGLKAIRVEAVSDKWEDDSRNHGSPSDCGPRVL
:::.::. : :.:::.: .::::.: ::.::.:..: . ..::: : :::
CCDS14 SSDVVTGNVPLKVGQKVNVVVEEDKPHYGLRAIKVDVVPRHLYG-----AGPSDSGTRVL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 IGCVTSLVEGAGCISQTTYFSLESVCEGFEPCKGDWVEAEYRIRPGTWSSEATSVKPLRY
::::::. : ::.. :::. : : : : ::: .:.:: .:: . .::::::.:
CCDS14 IGCVTSINEDNIYISNSIYFSIAIVSEDFVPYKGDLLEVEYSTEPGISNIKATSVKPIRC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KRVDKVCISSLCGRNGVLEESIFFTLDSLKLPDGYTPRRGDVVNAVVVESSQSCYVWRAL
....:::.:. :::::.. .:::::::.::::::.:. :.::.:.::: : :..:::.
CCDS14 IHTEEVCITSVHGRNGVIDYTIFFTLDSVKLPDGYVPQVDDIVNVVMVESIQFCFIWRAI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 CMTLVKRRDAAPVHEATHFYGTILLKNKGDIEVTQVTHFGTLKEGRSKTMVIWIENKGDI
.: :..
CCDS14 SITPVHKS
240
>>CCDS35400.1 CT55 gene_id:54967|Hs108|chrX (264 aa)
initn: 814 init1: 498 opt: 790 Z-score: 939.1 bits: 183.6 E(32554): 5.5e-46
Smith-Waterman score: 790; 52.6% identity (74.5% similar) in 247 aa overlap (1-247:1-241)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MLSLAAKLVAFFWRTADTPREEAGQLEPELAEGDTKLKTVRGVVTRYCSDYGMIDDMIYF
:: : .::. :::: : :. : . : .:::.: ::.:::: .:.::::::. :::
CCDS35 MLRLLRLALAFYGRTAD-PAERQGPQQQGLPQGDTQLTTVQGVVTSFCGDYGMIDESIYF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SSDAVTSRVLLNVGQEVIAVVEENKVSNGLKAIRVEAVSDKWEDDSRNHGSPSDCGPRVL
:::.::. : :.:::.: .::::.: ::.::.:..: . ..::: : :::
CCDS35 SSDVVTGNVPLKVGQKVNVVVEEDKPHYGLRAIKVDVVPRHLYG-----AGPSDSGTRVL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 IGCVTSLVEGAGCISQTTYFSLESVCEGFEPCKGDWVEAEYRIRPGTWSSEATSVKPLRY
::::::. : ::.. :::. : : : : ::: .:.:: .:: . .::::::.:
CCDS35 IGCVTSINEDNIYISNSIYFSIAIVSEDFVPYKGDLLEVEYSTEPGISNIKATSVKPIRC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KRVDKVCISSLCGRNGVLEESIFFTLDSLKLPDGYTPRRGDVVNAVVVESSQSCYVWRAL
....:::.:. :::::.. .:::::::.::::::.:. :.::.:.::: : :..:::.
CCDS35 IHTEEVCITSVHGRNGVIDYTIFFTLDSVKLPDGYVPQVDDIVNVVMVESIQFCFIWRAI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 CMTLVKRRDAAPVHEATHFYGTILLKNKGDIEVTQVTHFGTLKEGRSKTMVIWIENKGDI
.: :..
CCDS35 SITPVHKSSSGFQDDGGLGRPKRERRSQSI
240 250 260
>>CCDS12386.1 UPF1 gene_id:5976|Hs108|chr19 (1118 aa)
initn: 543 init1: 130 opt: 410 Z-score: 477.5 bits: 100.3 E(32554): 2.8e-20
Smith-Waterman score: 565; 26.5% identity (53.4% similar) in 804 aa overlap (403-1164:195-891)
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 ISPGDCTCKGENGEKDNILSRKQMTEPEPGGLVPPGGKTFIVVICDGKNPGRCKELLLLC
:..: . . .:..: ..: :
CCDS12 CKEVTLHKDGPLGETVLECYNCGCRNVFLLGFIPAKADSVVVLLC--RQP---------C
170 180 190 200 210
440 450 460 470 480 490
pF1KB9 FSDFLIGRYLEVNVISGE-ESLIAAREPFSWK-KLKSSQALTSAKTTVVVTAQKRNSRRQ
:. . ..: :.. . :: : .:: :. : : :. .:::. :. ..
CCDS12 ASQ---SSLKDINWDSSQWQPLIQDRCFLSWLVKIPSEQEQLRARQ---ITAQQINKLEE
220 230 240 250 260
500 510 520 530 540 550
pF1KB9 LPSFLPQYPIPDRLRKCVEQKIDILTFQPLLAELLNMSNYKEKFSTLLWLEEIYAEMELK
: . :. . : . :... : .: . . .:.. :. :. :: : . .::
CCDS12 LWKENPSATLEDLEKPGVDEEP-----QHVLLRYEDAYQYQNIFGPLVKLEADY-DKKLK
270 280 290 300 310 320
560 570 580 590 600 610
pF1KB9 EYNMSGIILRRNGDLLVLEVPGLAEGRPSLYAGDKLILKTQEYNGHAIEYISYVTEIHEE
: . . : : :: :: . : . .. . ::. : . .. .
CCDS12 ESQTQDNITVR-WDL------GLNKKRIAYFT----LPKTD----------SDMRLMQGD
330 340 350 360
620 630 640 650 660 670
pF1KB9 DVTLKINPEFEQAYNFEPMDVEFTYNRTTSRRCHFALEHVIHLGVKVLFPEEIILQSPQV
.. :. . .. .. .. : .. : .:.: .: : :. .. ::
CCDS12 EICLRYKGDLAPLWKGIGHVIKVPDN--------YGDEIAIELRSSVGAPVEVT-HNFQV
370 380 390 400 410
680 690 700 710 720
pF1KB9 TGNWNHAQ-DTKSSGQSTSKKNRKTMTDQAEHGTEERRVGDKDLPVLAPFTAEMSDWVDE
:. .. : .:. .: .. ... : . .: :. : . .
CCDS12 DFVWKSTSFDRMQSALKTFAVDETSVSGYIYH----KLLGH-----------EVEDVIIK
420 430 440 450
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 IQTPKARKMEFFNPVLNENQKLAVKRILSGDCRPLPYILFGPPGTGKTVTIIEAVLQVHF
: :: . . : ::..: ::: .:. ::: : :::::::::: :.. :.
CCDS12 CQLPKRFTAQGL-PDLNHSQVYAVKTVLQ---RPLSLIQ-GPPGTGKTVT--SATIVYHL
460 470 480 490 500
790 800 810 820 830
pF1KB9 ALP-DSRILVCAPSNSAADLVCLRLHES--KVLQ-----------PATMVRVNATCRFEE
: .. .::::::: :.: . ..:.. ::.. :.... .. : .
CCDS12 ARQGNGPVLVCAPSNIAVDQLTEKIHQTGLKVVRLCAKSREAIDSPVSFLALHNQIRNMD
510 520 530 540 550 560
840 850 860 870
pF1KB9 IVIDAVK-PYCRD--GE-DIWKASRFRIIITTCSSSGLFYQ-------IGV---RVG--H
. . : .: :: . .:.: . : :. .:. :.. .
CCDS12 SMPELQKLQQLKDETGELSSADEKRYRALKRTAERELLMNADVICCTCVGAGDPRLAKMQ
570 580 590 600 610 620
880 890 900 910 920 930
pF1KB9 FTHVFVDEAGQASEPECLIPLGLMSDISGQIVLAGDPMQLGPVIKSRLAMAYGLNVSFLE
: ...::. ::.::::..:. : . :..:.:: :::::. . : ::. :..:
CCDS12 FRSILIDESTQATEPECMVPVVLGAK---QLILVGDHCQLGPVVMCKKAAKAGLSQSLFE
630 640 650 660 670 680
940 950 960 970 980 990
pF1KB9 RLMSRPAYQRDENAFGACGAHNPLLVTKLVKNYRSHEALLMLPSRLFYHRELE--VCADP
::. ..: :. .: .:: : :: .:: .::. :. : :
CCDS12 RLV----------VLGI----RPI---RLQVQYRMHPALSAFPSNIFYEGSLQNGVTAAD
690 700 710 720
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB9 TVVTSL-LGWEKLPKKGFPLIFHGVRGSEAREGKSPSWFNPAEAVQVLRYCCLLAHSISS
: .. . : . : : :..:. ..:.: ... :..: .::..: . : ...
CCDS12 RVKKGFDFQWPQ-PDK--PMFFYVTQGQEEIASSGTSYLNRTEAANVEKITTKL---LKA
730 740 750 760 770 780
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB9 QVSASDIGVITPYRKQ----VEKIRIL--LRNVDLMDIKVGSVEEFQGQEYLVIIISTVR
.. ..::.::::. : :. ... :.. ......::. :::.: ::.: ::
CCDS12 GAKPDQIGIITPYEGQRSYLVQYMQFSGSLHTKLYQEVEIASVDAFQGREKDFIILSCVR
790 800 810 820 830 840
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB9 SNEDRFEDDRYFLGFLSNSKRFNVAITRPKALLIVLGNPHVLVRDPCFGALLEYSITNGV
.:: . .:::.. .:.:::.:: . .:..:::..: ..: .. ::.:
CCDS12 ANEHQG------IGFLNDPRRLNVALTRARYGVIIVGNPKALSKQPLWNHLLNYYKEQKV
850 860 870 880 890
1180 1190 1200 1210
pF1KB9 YMGCDLPPALQSLQNCGEGVADPSYPVVPESTGPEKHQEPS
CCDS12 LVEGPLNNLRESLMQFSKPRKLVNTINPGARFMTTAMYDAREAIIPGSVYDRSSQGRPSS
900 910 920 930 940 950
>>CCDS74315.1 UPF1 gene_id:5976|Hs108|chr19 (1129 aa)
initn: 543 init1: 130 opt: 410 Z-score: 477.4 bits: 100.3 E(32554): 2.8e-20
Smith-Waterman score: 581; 26.6% identity (53.8% similar) in 805 aa overlap (403-1164:195-902)
380 390 400 410 420 430
pF1KB9 ISPGDCTCKGENGEKDNILSRKQMTEPEPGGLVPPGGKTFIVVICDGKNPGRCKELLLLC
:..: . . .:..: ..: :
CCDS74 CKEVTLHKDGPLGETVLECYNCGCRNVFLLGFIPAKADSVVVLLC--RQP---------C
170 180 190 200 210
440 450 460 470 480 490
pF1KB9 FSDFLIGRYLEVNVISGE-ESLIAAREPFSWK-KLKSSQALTSAKTTVVVTAQKRNSRRQ
:. . ..: :.. . :: : .:: :. : : :. .:::. :. ..
CCDS74 ASQ---SSLKDINWDSSQWQPLIQDRCFLSWLVKIPSEQEQLRARQ---ITAQQINKLEE
220 230 240 250 260
500 510 520 530 540 550
pF1KB9 LPSFLPQYPIPDRLRKCVEQKIDILTFQPLLAELLNMSNYKEKFSTLLWLEEIYAEMELK
: . :. . : . :... : .: . . .:.. :. :. :: : . .::
CCDS74 LWKENPSATLEDLEKPGVDEEP-----QHVLLRYEDAYQYQNIFGPLVKLEADY-DKKLK
270 280 290 300 310 320
560 570 580 590 600
pF1KB9 EYNMSGIILRRNGDLLVLEVPGLAEGRPSLYAGDKLILKTQEYNGH-AIEYISYVTEIHE
: . . : : :: :: . : . .. . ::. : .: .. . ..
CCDS74 ESQTQDNITVR-WDL------GLNKKRIAYFT----LPKTDSGNEDLVIIWLRDMRLMQG
330 340 350 360 370
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 EDVTLKINPEFEQAYNFEPMDVEFTYNRTTSRRCHFALEHVIHLGVKVLFPEEIILQSPQ
... :. . .. .. .. : .. : .:.: .: : :. .. :
CCDS74 DEICLRYKGDLAPLWKGIGHVIKVPDN--------YGDEIAIELRSSVGAPVEVT-HNFQ
380 390 400 410 420
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 VTGNWNHAQ-DTKSSGQSTSKKNRKTMTDQAEHGTEERRVGDKDLPVLAPFTAEMSDWVD
: :. .. : .:. .: .. ... : . .: :. : .
CCDS74 VDFVWKSTSFDRMQSALKTFAVDETSVSGYIYH----KLLGH-----------EVEDVII
430 440 450 460
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 EIQTPKARKMEFFNPVLNENQKLAVKRILSGDCRPLPYILFGPPGTGKTVTIIEAVLQVH
. : :: . . : ::..: ::: .:. ::: : :::::::::: :.. :
CCDS74 KCQLPKRFTAQGL-PDLNHSQVYAVKTVLQ---RPLSLIQ-GPPGTGKTVT--SATIVYH
470 480 490 500 510
790 800 810 820 830
pF1KB9 FALP-DSRILVCAPSNSAADLVCLRLHES--KVLQ-----------PATMVRVNATCRFE
.: .. .::::::: :.: . ..:.. ::.. :.... .. :
CCDS74 LARQGNGPVLVCAPSNIAVDQLTEKIHQTGLKVVRLCAKSREAIDSPVSFLALHNQIRNM
520 530 540 550 560 570
840 850 860 870
pF1KB9 EIVIDAVK-PYCRD--GE-DIWKASRFRIIITTCSSSGLFYQ-------IGV---RVG--
. . . : .: :: . .:.: . : :. .:. :..
CCDS74 DSMPELQKLQQLKDETGELSSADEKRYRALKRTAERELLMNADVICCTCVGAGDPRLAKM
580 590 600 610 620 630
880 890 900 910 920 930
pF1KB9 HFTHVFVDEAGQASEPECLIPLGLMSDISGQIVLAGDPMQLGPVIKSRLAMAYGLNVSFL
.: ...::. ::.::::..:. : . :..:.:: :::::. . : ::. :..
CCDS74 QFRSILIDESTQATEPECMVPVVLGAK---QLILVGDHCQLGPVVMCKKAAKAGLSQSLF
640 650 660 670 680 690
940 950 960 970 980 990
pF1KB9 ERLMSRPAYQRDENAFGACGAHNPLLVTKLVKNYRSHEALLMLPSRLFYHRELE--VCAD
:::. ..: :. .: .:: : :: .:: .::. :. : :
CCDS74 ERLV----------VLGI----RPI---RLQVQYRMHPALSAFPSNIFYEGSLQNGVTAA
700 710 720 730
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB9 PTVVTSL-LGWEKLPKKGFPLIFHGVRGSEAREGKSPSWFNPAEAVQVLRYCCLLAHSIS
: .. . : . : : :..:. ..:.: ... :..: .::..: . : ..
CCDS74 DRVKKGFDFQWPQ-PDK--PMFFYVTQGQEEIASSGTSYLNRTEAANVEKITTKL---LK
740 750 760 770 780 790
1060 1070 1080 1090 1100
pF1KB9 SQVSASDIGVITPYRKQ----VEKIRIL--LRNVDLMDIKVGSVEEFQGQEYLVIIISTV
. .. ..::.::::. : :. ... :.. ......::. :::.: ::.: :
CCDS74 AGAKPDQIGIITPYEGQRSYLVQYMQFSGSLHTKLYQEVEIASVDAFQGREKDFIILSCV
800 810 820 830 840 850
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB9 RSNEDRFEDDRYFLGFLSNSKRFNVAITRPKALLIVLGNPHVLVRDPCFGALLEYSITNG
:.:: . .:::.. .:.:::.:: . .:..:::..: ..: .. ::.:
CCDS74 RANEHQG------IGFLNDPRRLNVALTRARYGVIIVGNPKALSKQPLWNHLLNYYKEQK
860 870 880 890 900
1170 1180 1190 1200 1210
pF1KB9 VYMGCDLPPALQSLQNCGEGVADPSYPVVPESTGPEKHQEPS
CCDS74 VLVEGPLNNLRESLMQFSKPRKLVNTINPGARFMTTAMYDAREAIIPGSVYDRSSQGRPS
910 920 930 940 950 960
1211 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 17:26:57 2016 done: Fri Nov 4 17:26:58 2016
Total Scan time: 5.090 Total Display time: 0.400
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]