Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8776
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8776, 541 aa
1>>>pF1KB8776 541 - 541 aa - 541 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1151+/-0.00148; mu= 10.9280+/- 0.087
mean_var=235.4209+/-47.931, 0's: 0 Z-trim(106.3): 948 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.083590
statistics sampled from 7873 (8894) to 7873 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.273), width: 16
Scan time: 3.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19 ( 541) 3864 480.1 2.8e-135
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1744 224.5 2.8e-58
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1744 224.6 2.9e-58
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1744 224.6 2.9e-58
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1744 224.6 2.9e-58
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1734 223.4 6.8e-58
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1704 220.0 1.1e-56
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1704 220.0 1.1e-56
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1695 218.7 1.8e-56
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1693 218.4 1.9e-56
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1697 219.2 1.9e-56
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1693 218.4 2e-56
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1689 218.1 3.3e-56
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1689 218.1 3.3e-56
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1679 216.8 6.7e-56
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1675 216.3 9.3e-56
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1675 216.3 9.3e-56
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1675 216.3 9.5e-56
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1670 215.4 1.1e-55
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1672 216.0 1.3e-55
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1663 214.8 2.6e-55
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1660 214.4 3e-55
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1660 214.4 3.2e-55
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1658 214.0 3.2e-55
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1654 213.6 4.7e-55
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1657 214.2 4.9e-55
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1654 213.7 5.5e-55
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1647 213.0 1e-54
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1641 212.3 1.8e-54
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1641 212.3 1.8e-54
CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19 ( 803) 1639 212.0 2.1e-54
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1634 211.3 2.7e-54
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 1635 211.6 3.2e-54
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1632 211.0 3.2e-54
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1632 211.1 3.3e-54
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1630 210.9 4.2e-54
CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19 ( 718) 1626 210.4 5.8e-54
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1625 210.4 7.5e-54
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1621 209.8 9.3e-54
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 1610 208.2 1.8e-53
CCDS33091.1 ZNF528 gene_id:84436|Hs108|chr19 ( 628) 1611 208.5 1.9e-53
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1609 208.4 2.5e-53
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1605 207.7 2.9e-53
CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 1606 207.9 3e-53
CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 664) 1606 207.9 3e-53
CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19 ( 609) 1602 207.4 3.9e-53
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 1602 207.4 4e-53
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 1603 207.7 4.3e-53
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 1603 207.8 4.6e-53
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 1603 207.8 4.8e-53
>>CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19 (541 aa)
initn: 3864 init1: 3864 opt: 3864 Z-score: 2542.2 bits: 480.1 E(32554): 2.8e-135
Smith-Waterman score: 3864; 100.0% identity (100.0% similar) in 541 aa overlap (1-541:1-541)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MRLKMTTRNFPEREVPCDVEVERFTREVPCLSSLGDGWDCENQEGHLRQSALTLEKPGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MRLKMTTRNFPEREVPCDVEVERFTREVPCLSSLGDGWDCENQEGHLRQSALTLEKPGTQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EAICEYPGFGEHLIASSDLPPSQRVLATNGFHAPDSNVSGLDCDPALPSYPKSYADKRTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EAICEYPGFGEHLIASSDLPPSQRVLATNGFHAPDSNVSGLDCDPALPSYPKSYADKRTG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DSDACGKGFNHSMEVIHGRNPVREKPYKYPESVKSFNHFTSLGHQKIMKRGKKSYEGKNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DSDACGKGFNHSMEVIHGRNPVREKPYKYPESVKSFNHFTSLGHQKIMKRGKKSYEGKNF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ENIFTLSSSLNENQRNLPGEKQYRCTECGKCFKRNSSLVLHHRTHTGEKPYTCNECGKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ENIFTLSSSLNENQRNLPGEKQYRCTECGKCFKRNSSLVLHHRTHTGEKPYTCNECGKSF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SKNYNLIVHQRIHTGEKPYECSKCGKAFSDGSALTQHQRIHTGEKPYECLECGKTFNRNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SKNYNLIVHQRIHTGEKPYECSKCGKAFSDGSALTQHQRIHTGEKPYECLECGKTFNRNS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 SLILHQRTHTGEKPYRCNECGKPFTDISHLTVHLRIHTGEKPYECSKCGKAFRDGSYLTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SLILHQRTHTGEKPYRCNECGKPFTDISHLTVHLRIHTGEKPYECSKCGKAFRDGSYLTQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 HERTHTGEKPFECAECGKSFNRNSHLIVHQKIHSGEKPYECKECGKTFIESAYLIRHQRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HERTHTGEKPFECAECGKSFNRNSHLIVHQKIHSGEKPYECKECGKTFIESAYLIRHQRI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 HTGEKPYGCNQCQKLFRNIAGLIRHQRTHTGEKPYECNQCGKAFRDSSCLTKHQRIHTKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HTGEKPYGCNQCQKLFRNIAGLIRHQRTHTGEKPYECNQCGKAFRDSSCLTKHQRIHTKE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 TPYQCPECGKSFKQNSHLAVHQRLHSREGPSRCPQCGKMFQKSSSLVRHQRAHLGEQPME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TPYQCPECGKSFKQNSHLAVHQRLHSREGPSRCPQCGKMFQKSSSLVRHQRAHLGEQPME
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 T
:
CCDS12 T
>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
initn: 8030 init1: 1699 opt: 1744 Z-score: 1159.9 bits: 224.5 E(32554): 2.8e-58
Smith-Waterman score: 1851; 50.0% identity (72.2% similar) in 546 aa overlap (1-538:51-591)
10 20
pF1KB8 MRLKMTTRNFPEREVPCDVEVERFTRE--V
..:.. ... :. . :::: .
CCDS74 ISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLW
30 40 50 60 70 80
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 PCLSSLGDG---WDCENQEGHLRQSALTLEKPGTQEAICEYPGFGEHLIASSDLPPSQRV
: . .: :.::. :. :.: : . : . ::::.. . ::: .
CCDS74 YCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQW-QRNGFGENISLNPDLPHQP--
90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 LATNGFHAPDS-NVSGLDCDPALPSYPKSYADKRTGDSDACGKGFNHSMEVI-HGRNPVR
: ..: . .. : : : :. . .. . :::.:.:: .: : :. .
CCDS74 -MTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTG
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 EKPYKYPESVKSFNHFTSLG-HQKIMKRGKKSYEGKNFENIFTLSSSLNENQRNLPGEKQ
:.::. : .:.: . ..: ::.: . :.: :. . :. . : ..::. :::
CCDS74 ERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRI-HTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKP
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 YRCTECGKCFKRNSSLVLHHRTHTGEKPYTCNECGKSFSKNYNLIVHQRIHTGEKPYECS
:.:.:::: :. ::. :.::::::::: :.::::.: .. .: : :::::::::.:.
CCDS74 YECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCG
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 KCGKAFSDGSALTQHQRIHTGEKPYECLECGKTFNRNSSLILHQRTHTGEKPYRCNECGK
.:::::: .:.::.::::::::::::: ::::.:.. . :: :::::::::::.:.::::
CCDS74 ECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGK
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 PFTDISHLTVHLRIHTGEKPYECSKCGKAFRDGSYLTQHERTHTGEKPFECAECGKSFNR
:.. . :: : ::::::::: :..:::.: .: :.:::::::::::.::..:::.: .
CCDS74 AFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQ
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390 400 410 420 430 440
pF1KB8 NSHLIVHQKIHSGEKPYECKECGKTFIESAYLIRHQRIHTGEKPYGCNQCQKLFRNIAGL
..:: ::.::.:::::::..:::.: .:. : .::::::::::: :::: . : ..: :
CCDS74 STHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPL
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450 460 470 480 490 500
pF1KB8 IRHQRTHTGEKPYECNQCGKAFRDSSCLTKHQRIHTKETPYQCPECGKSFKQNSHLAVHQ
:.::: :::::::::::::.:: .:: : .:::::::: :: : ::::::...: :. :.
CCDS74 IQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHE
500 510 520 530 540 550
510 520 530 540
pF1KB8 RLHSREGPSRCPQCGKMFQKSSSLVRHQRAHLGEQPMET
: :. : : .: .::: :..:. :..:.: : ::.:
CCDS74 RTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHT
560 570 580 590 600 610
CCDS74 G
>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
initn: 8030 init1: 1699 opt: 1744 Z-score: 1159.5 bits: 224.6 E(32554): 2.9e-58
Smith-Waterman score: 1851; 50.0% identity (72.2% similar) in 546 aa overlap (1-538:93-633)
10 20
pF1KB8 MRLKMTTRNFPEREVPCDVEVERFTRE--V
..:.. ... :. . :::: .
CCDS74 ISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLW
70 80 90 100 110 120
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 PCLSSLGDG---WDCENQEGHLRQSALTLEKPGTQEAICEYPGFGEHLIASSDLPPSQRV
: . .: :.::. :. :.: : . : . ::::.. . ::: .
CCDS74 YCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQW-QRNGFGENISLNPDLPHQP--
130 140 150 160 170
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 LATNGFHAPDS-NVSGLDCDPALPSYPKSYADKRTGDSDACGKGFNHSMEVI-HGRNPVR
: ..: . .. : : : :. . .. . :::.:.:: .: : :. .
CCDS74 -MTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTG
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 EKPYKYPESVKSFNHFTSLG-HQKIMKRGKKSYEGKNFENIFTLSSSLNENQRNLPGEKQ
:.::. : .:.: . ..: ::.: . :.: :. . :. . : ..::. :::
CCDS74 ERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRI-HTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKP
240 250 260 270 280 290
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 YRCTECGKCFKRNSSLVLHHRTHTGEKPYTCNECGKSFSKNYNLIVHQRIHTGEKPYECS
:.:.:::: :. ::. :.::::::::: :.::::.: .. .: : :::::::::.:.
CCDS74 YECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCG
300 310 320 330 340 350
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 KCGKAFSDGSALTQHQRIHTGEKPYECLECGKTFNRNSSLILHQRTHTGEKPYRCNECGK
.:::::: .:.::.::::::::::::: ::::.:.. . :: :::::::::::.:.::::
CCDS74 ECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGK
360 370 380 390 400 410
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 PFTDISHLTVHLRIHTGEKPYECSKCGKAFRDGSYLTQHERTHTGEKPFECAECGKSFNR
:.. . :: : ::::::::: :..:::.: .: :.:::::::::::.::..:::.: .
CCDS74 AFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQ
420 430 440 450 460 470
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 NSHLIVHQKIHSGEKPYECKECGKTFIESAYLIRHQRIHTGEKPYGCNQCQKLFRNIAGL
..:: ::.::.:::::::..:::.: .:. : .::::::::::: :::: . : ..: :
CCDS74 STHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPL
480 490 500 510 520 530
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 IRHQRTHTGEKPYECNQCGKAFRDSSCLTKHQRIHTKETPYQCPECGKSFKQNSHLAVHQ
:.::: :::::::::::::.:: .:: : .:::::::: :: : ::::::...: :. :.
CCDS74 IQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHE
540 550 560 570 580 590
510 520 530 540
pF1KB8 RLHSREGPSRCPQCGKMFQKSSSLVRHQRAHLGEQPMET
: :. : : .: .::: :..:. :..:.: : ::.:
CCDS74 RTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHT
600 610 620 630 640 650
CCDS74 G
>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (670 aa)
initn: 8030 init1: 1699 opt: 1744 Z-score: 1159.5 bits: 224.6 E(32554): 2.9e-58
Smith-Waterman score: 1851; 50.0% identity (72.2% similar) in 546 aa overlap (1-538:105-645)
10 20
pF1KB8 MRLKMTTRNFPEREVPCDVEVERFTRE--V
..:.. ... :. . :::: .
CCDS12 VESRLPQGVYPEIKGHFQFLLLSDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLW
80 90 100 110 120 130
30 40 50 60 70 80
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: ..: . .. : : : :. . .. . :::.:.:: .: : :. .
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200 210 220 230 240 250
150 160 170 180 190 200
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:.:.:::: :. ::. :.::::::::: :.::::.: .. .: : :::::::::.:.
CCDS12 YECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCG
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330 340 350 360 370 380
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:.. . :: : ::::::::: :..:::.: .: :.:::::::::::.::..:::.: .
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..:: ::.::.:::::::..:::.: .:. : .::::::::::: :::: . : ..: :
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: :. : : .: .::: :..:. :..:.: : ::.:
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CCDS12 G
670
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: :. : : .: .::: :..:. :..:.: : ::.:
CCDS54 RTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHT
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CCDS54 G
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CCDS74 HQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSGLTKHHSIHTGEKPYECKTCGKSFRQRTHLTLHQRI
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pF1KB8 HTGEKPYGCNQCQKLFRNIAGLIRHQRTHTGEKPYECNQCGKAFRDSSCLTKHQRIHTKE
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CCDS74 HTGDRPYECKECGKSFTCGSELIRHQRTHTGEKPYDCKECGKAFRCPSQLSQHKRIHTGE
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pF1KB8 TPYQCPECGKSFKQNSHLAVHQRLHSREGPSRCPQCGKMFQKSSSLVRHQRAHLGEQPME
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CCDS74 KTYQCPECGKAFFYASGLSRHQSVHTGEKPYECKTCGKAFKQLTQLTRHQRIHDLT
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pF1KB8 T
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CCDS59 THTGEKLYKCKECGKAFHHFSYLVKHQRIHTGEKPCACKEYGKAFISGSHLIQHQKMYTD
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CCDS59 ERPHECQESVKAFRPSAHLIQHWRIHTGDKPYECKECGKSFTSGSTLNQHQQIHTGEKPY
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CCDS59 HCKQCGKSFTVGSTLIRHQQIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALIRHQRIHTGEKPYDCKE
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CCDS59 CGKSFTFHSALIRHQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFRSGLIGHQAIHTGEKPYDCKECGKS
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CCDS59 FTAGSTLIQHQRIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYCCKECGKSFTFR
430 440 450 460 470 480
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 SHLTVHLRIHTGEKPYECSKCGKAFRDGSYLTQHERTHTGEKPFECAECGKSFNRNSHLI
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CCDS59 STRNRHQRIHTGEKPYNCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYHCKECGKSFTFRSGLI
490 500 510 520 530 540
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 VHQKIHSGEKPYECKECGKTFIESAYLIRHQRIHTGEKPYGCNQCQKLFRNIAGLIRHQR
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CCDS59 GHQAVHTGEKPYDCKECGKSFTSRSALIQHQRIHTGEKPYHCKECGKSFTVGSTLLQHQQ
550 560 570 580 590 600
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 THTGEKPYECNQCGKAFRDSSCLTKHQRIHTKETPYQCPECGKSFKQNSHLAVHQRLHSR
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CCDS59 IHTGEKPYDCKECGKAFRLRLRLTQHQQIHTGEKPYQCQECGKAFVSVSGLTQHHRIHTG
610 620 630 640 650 660
510 520 530 540
pF1KB8 EGPSRCPQCGKMFQKSSSLVRHQRAHLGEQPMET
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CCDS59 EKPYECPDCGKAFRQRTYLNQHRRIHTGEKPYECKECGKSFTFCSGLIQHQQNHTDEKPY
670 680 690 700 710 720
CCDS59 DGKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKPYDCKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKLYDCKE
730 740 750 760 770 780
>--
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130 140 150 160 170 180
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CCDS59 CPDCGKAFRQRTYLNQHRRIHTGEKPYECKECGKSFTFCSGLIQHQQNHTDEKPYDGKEC
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pF1KB8 ENIFTLSSSLNENQRNLPGEKQYRCTECGKCFKRNSSLVLHHRTHTGEKPYTCNECGKSF
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CCDS59 GKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKPYDCKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKLYDCKECGKSF
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pF1KB8 SKNYNLIVHQRIHTGEKPYECSKCGKAFSDGSALTQHQRIHTGEKPYECLECGKTFNRNS
... .:: :: .:::::::.:..:::.:. ::: ::. .::::: : : ::::.:. :
CCDS59 TSHSTLIQHQPLHTGEKPYHCKECGKSFTLRSALIQHRPVHTGEKRYSCKECGKSFTSRS
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pF1KB8 SLILHQRTHTGEKPYRCNECGKPFTDISHLTVHLRIHTGEKPYECSKCGKAFRDGSYLTQ
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CCDS59 TLIEHQRIHTGEKPYHCKECGKSFAFRSAIIQHRRIHTGEKPYDCKECGKAFRRRSKLTQ
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pF1KB8 HERTHTGEKPFECAECGKSFNRNSHLIVHQKIHSGEKPYECKECGKTFIESAYLIRHQRI
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CCDS59 HQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSGLTKHHSIHTGEKPYECKTCGKSFRQRTHLTLHQRI
920 930 940 950 960 970
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pF1KB8 HTGEKPYGCNQCQKLFRNIAGLIRHQRTHTGEKPYECNQCGKAFRDSSCLTKHQRIHTKE
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CCDS59 HTGDRPYECKECGKSFTCGSELIRHQRTHTGEKPYDCKECGKAFRCPSQLSQHKRIHTGE
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pF1KB8 TPYQCPECGKSFKQNSHLAVHQRLHSREGPSRCPQCGKMFQKSSSLVRHQRAHLGEQPME
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CCDS59 KTYQCPECGKAFFYASGLSRHQSVHTGEKPYECKTCGKAFKQLTQLTRHQRIHDLT
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KB8 T
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pF1KB8 AICEYPGFGEHLIASSDLPPSQRVLATNGFHAPDSNVSGLDCDPA------LPSYPKSYA
:. .. ..: : : .. . ..
CCDS33 QDRGEKKLLKCNDCEKIFSKISTLTLHQRIHTGEKPYECIECGKAFSQSAHLAQHQRIHT
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pF1KB8 DKRTGDSDACGKGFNHSMEVI-HGRNPVREKPYKYPESVKSFNHFTSLGHQKIMKRGKKS
.. . :::.:... ... : : . ::::. . :.:.... :.... .. :.:
CCDS33 GEKPFECTECGKAFSQNAHLVQHQRVHTGEKPYQCKQCNKAFSQLAHLAQHQRVHTGEKP
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pF1KB8 YEGKNFENIFTLSSSLNENQRNLPGEKQYRCTECGKCFKRNSSLVLHHRT-HTGEKPYTC
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CCDS33 YECIECGKAFSDCSSLAHHRRIHTGKRPYECIDCGKAFRQNASLIRHRRYYHTGEKPFDC
340 350 360 370 380 390
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pF1KB8 NECGKSFSKNYNLIVHQRIHTGEKPYECSKCGKAFSDGSALTQHQRIHTGEKPYECLECG
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CCDS33 IDCGKAFTDHIGLIQHKRTHTGERPYKCNVCGKAFSHGSSLTVHQRIHTGEKPYECNICE
400 410 420 430 440 450
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pF1KB8 KTFNRNSSLILHQRTHTGEKPYRCNECGKPFTDISHLTVHLRIHTGEKPYECSKCGKAFR
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CCDS33 KAFSHRGSLTLHQRVHTGEKPYECKECGKAFRQSTHLAHHQRIHTGEKPYECKECSKTFS
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pF1KB8 DGSYLTQHERTHTGEKPFECAECGKSFNRNSHLIVHQKIHSGEKPYECKECGKTFIESAY
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CCDS33 QNAHLAQHQKIHTGEKPYECKECGKAFSQIAHLVQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSDGSY
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pF1KB8 LIRHQRIHTGEKPYGCNQCQKLFRNIAGLIRHQRTHTGEKPYECNQCGKAFRDSSCLTKH
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CCDS33 LVQHQRLHSGKRPYECLECGKAFRQRASLICHQRCHTGEKPYECNVCGKAFSHRKSLTLH
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pF1KB8 QRIHTKETPYQCPECGKSFKQNSHLAVHQRLHSREGPSRCPQCGKMFQKSSSLVRHQRAH
::::: : ::.: ::.:.:.: .::..:.:.:. : : .: .::: :..: :..::: :
CCDS33 QRIHTGEKPYECKECSKAFSQVAHLTLHKRIHTGERPYECKECGKAFRQSVHLAHHQRIH
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540
pF1KB8 LGEQPMET
::
CCDS33 TGESSVILSSALPYHQVL
700 710
>>CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 (585 aa)
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30 40 50 60 70 80
pF1KB8 VPCLSSLGDGWDCENQEGHLRQSALTLEKPGTQEAICEYPGFGEHLIASSDLPPSQRVLA
: : . : :.:. . .. : . . .
CCDS76 IDGTVKDETSPVEECFFSQSSNSYQCHTITGEQPSGC--TGLGKSISFDTKLVKHEIINS
50 60 70 80 90 100
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 TNGFHAPDSNVSGLDCDPALPSYPKSYADKRTGDSDACGKGFNHSMEVI-HGRNPVREKP
. . : . :: : .. .. .... . . :::.:. . ..: : : :::
CCDS76 EERPFKCEELVEPFRCDSQLIQHQENNTEEKPYQCSECGKAFSINEKLIWHQRLHSGEKP
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 YKYPESVKSFNHFTSLGHQKIMKRGKKSYEGKNFENIFTLSSSLNENQRNLPGEKQYRCT
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CCDS76 FKCVECGKSFSYSSHYITHQTIHSGEKPYQCKMCGKAFSVNGSLSRHQRIHTGEKPYQCK
170 180 190 200 210 220
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pF1KB8 ECGKCFKRNSSLVLHHRTHTGEKPYTCNECGKSFSKNYNLIVHQRIHTGEKPYECSKCGK
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CCDS76 ECGNGFSCSSAYITHQRVHTGEKPYECNDCGKAFNVNAKLIQHQRIHTGEKPYECNECGK
230 240 250 260 270 280
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pF1KB8 AFSDGSALTQHQRIHTGEKPYECLECGKTFNRNSSLILHQRTHTGEKPYRCNECGKPFTD
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CCDS76 GFRCSSQLRQHQSIHTGEKPYQCKECGKGFNNNTKLIQHQRIHTGEKPYECTECGKAFSV
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pF1KB8 ISHLTVHLRIHTGEKPYECSKCGKAFRDGSYLTQHERTHTGEKPFECAECGKSFNRNSHL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]