Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8772
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8772, 558 aa
1>>>pF1KB8772 558 - 558 aa - 558 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2083+/-0.000967; mu= 14.2844+/- 0.058
mean_var=78.5914+/-15.690, 0's: 0 Z-trim(105.5): 23 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.144673
statistics sampled from 8434 (8452) to 8434 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 3.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14500.1 ARMCX5 gene_id:64860|Hs108|chrX ( 558) 3616 764.6 0
CCDS59170.1 ARMCX4 gene_id:100131755|Hs108|chrX (2290) 706 157.4 1.7e-37
CCDS14502.1 BHLHB9 gene_id:80823|Hs108|chrX ( 547) 645 144.5 3.2e-34
CCDS35352.1 GPRASP1 gene_id:9737|Hs108|chrX (1395) 612 137.7 8.8e-32
CCDS14501.1 GPRASP2 gene_id:114928|Hs108|chrX ( 838) 590 133.1 1.3e-30
CCDS14489.1 ARMCX3 gene_id:51566|Hs108|chrX ( 379) 520 118.3 1.7e-26
CCDS14487.1 ARMCX1 gene_id:51309|Hs108|chrX ( 453) 509 116.1 9.5e-26
CCDS55146.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 308) 465 106.8 3.9e-23
CCDS5728.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 343) 465 106.8 4.3e-23
CCDS14490.1 ARMCX2 gene_id:9823|Hs108|chrX ( 632) 403 94.0 5.9e-19
CCDS55147.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 284) 284 69.0 8.6e-12
>>CCDS14500.1 ARMCX5 gene_id:64860|Hs108|chrX (558 aa)
initn: 3616 init1: 3616 opt: 3616 Z-score: 4079.0 bits: 764.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3616; 100.0% identity (100.0% similar) in 558 aa overlap (1-558:1-558)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MVDSGTEARARGKAEAGLQDGISGPATARVNGKTQAEAVAEAELKTESVTQAKAGDGAMT
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CCDS14 MVDSGTEARARGKAEAGLQDGISGPATARVNGKTQAEAVAEAELKTESVTQAKAGDGAMT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RTHTVTYREAMAVTREVIKVEDTTKTRVMVETKTKPLAERSIVPQTKSKAMPMSRVSTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RTHTVTYREAMAVTREVIKVEDTTKTRVMVETKTKPLAERSIVPQTKSKAMPMSRVSTVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KSEVKVVAVIEANIRSYAKSHDKANTGSRPDRREETSIGMKSSDEDEENICSWFWTGEEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KSEVKVVAVIEANIRSYAKSHDKANTGSRPDRREETSIGMKSSDEDEENICSWFWTGEEP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 SVGSWFWPEEETSLQVYKPLPKIQEKPKPTHKPTLTIKQKVIAWSRARYIVLVPVEGGEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SVGSWFWPEEETSLQVYKPLPKIQEKPKPTHKPTLTIKQKVIAWSRARYIVLVPVEGGEQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SLPPEGNWTLVETLIETPLGIRPLTKIPPYHGPYYQTLAEIKKQIRQREKYGPNPKACHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLPPEGNWTLVETLIETPLGIRPLTKIPPYHGPYYQTLAEIKKQIRQREKYGPNPKACHC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KSRGFSLEPKEFDKLVALLKLTKDPFIHEIATMIMGISPAYPFTQDIIHDVGITVMIENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KSRGFSLEPKEFDKLVALLKLTKDPFIHEIATMIMGISPAYPFTQDIIHDVGITVMIENL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 VNNPNVKEHPGALSMVDDSSESSEEPKSGESYIHQVCKGIISCPLNSPVQLAGLKLLGHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VNNPNVKEHPGALSMVDDSSESSEEPKSGESYIHQVCKGIISCPLNSPVQLAGLKLLGHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SIKFEDHYVITSYIPDFLTLLNKGSVKTKFYVLKVFSCLSKNHANTRELISAKVLSSLVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SIKFEDHYVITSYIPDFLTLLNKGSVKTKFYVLKVFSCLSKNHANTRELISAKVLSSLVA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 PFNKNESKANILNIIEIFENINFQFKTKAKLFTKEKFTKSELISIFQEAKQFGQKLQDLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PFNKNESKANILNIIEIFENINFQFKTKAKLFTKEKFTKSELISIFQEAKQFGQKLQDLA
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB8 EHSDPEVRDKVIRLILKL
::::::::::::::::::
CCDS14 EHSDPEVRDKVIRLILKL
550
>>CCDS59170.1 ARMCX4 gene_id:100131755|Hs108|chrX (2290 aa)
initn: 869 init1: 617 opt: 706 Z-score: 786.6 bits: 157.4 E(32554): 1.7e-37
Smith-Waterman score: 737; 30.2% identity (60.4% similar) in 556 aa overlap (4-558:1791-2290)
10 20 30
pF1KB8 MVDSGTEARARGKAEAGLQDGISGPATARVNGK
::. :.. : : : . : :....
CCDS59 DKDEATTASRSGAGEEAMICSRIEAENKASSGSWIRSEEVAYMGSCVGAEAGAGAEAGAG
1770 1780 1790 1800 1810 1820
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 TQAEAVAEAELKTESVTQAKAGDGAMTRTHTVTYREAMAVTREVIKVEDTTKTRVMVETK
..: : : :: .:. . : :: :. . . .. .. :.: ::..
CCDS59 AEAGAGAGAEAGAEAGAGAGAGPGTESGAGIWSW-DGDATT---------------VESR
1830 1840 1850 1860
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 TKPLAERSIVPQTKSKAMPMSRVSTVTKSEVKVVAVIEANIRSYAKSHDKANTGSRPDRR
: .. : .. . ...: .. ... : ..:: .... .. :
CCDS59 LGAGEEAGVESWTLARNVGEDELSRESSPDIE-----EISLRSLFWAESENSNTFRSKSG
1870 1880 1890 1900 1910
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 EETSIGMKSSDEDEENICSWFWTGEEPSVGSWFWPEEETSLQVYKPLPKIQEKPKPTHKP
...:. .:. :. .: . : .. ..:::: .:.. . : :: . : .
CCDS59 KDASF--ESGAGDNTSIKDKFEAAGGVDIGSWFCAGNENTSE-DKSAPKAKAKKSSE---
1920 1930 1940 1950 1960 1970
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 TLTIKQKVIAWSRARYIVLVPVEGGEQSLPPEGNWTLVETLIETPLGIRPLTKIPPYHGP
::. : .:: : :.: . :: .. . ...:
CCDS59 -----------SRGIYPYMVPGAG-------MGSWDGAMIWSETKFAHQSEASFP-----
1980 1990 2000 2010
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 YYQTLAEIKKQIRQREKYGPNPKACHCKSRGFSLEPKEFDKLVALLKLTKDPFIHEIATM
. : .:: : :: : .:.:: .. ...:....::. ....:.:: .::::.
CCDS59 ---VEDESRKQTRTGEK--TRPWSCRCKHEA-NMDPRDLEKLICMIEMTEDPSVHEIANN
2020 2030 2040 2050 2060
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 IMGISPAYPFTQDIIHDVGITVMIENLVNNPNVKEHPGALSMVDDSSESSEEPKSGESYI
. : : ........:: .::.:.::: . . ::. ... : ..:. .. ..:.
CCDS59 ALYNSADYSYSHEVVRNVGGISVIESLLNNPYPSVRQKALNALNNISVAAENHRKVKTYL
2070 2080 2090 2100 2110 2120
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 HQVCKGIISCPLNSPVQLAGLKLLGHLSIKFEDHYVITSYIPDFLTLLNKGSVKTKFYVL
.:::. .. :::: ::::::.:. ::.: : ....:.:: .:: ::. :: .:: .::
CCDS59 NQVCEDTVTYPLNSNVQLAGLRLIRHLTITSEYQHMVTNYISEFLRLLTVGSGETKDHVL
2130 2140 2150 2160 2170 2180
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 KVFSCLSKNHANTRELISAKVLSSLVAPFNKNESKANILNIIEIFENINFQFKTKAKLFT
.. .::: . :..:. :.. .::. :.:.:.: :::: . .:::::..:: .:: ::
CCDS59 GMLLNFSKNPSMTKDLLIANAPTSLINIFSKKETKENILNALSLFENINYHFKRRAKAFT
2190 2200 2210 2220 2230 2240
520 530 540 550
pF1KB8 KEKFTKSELISIFQEAKQFGQKLQDLA-EHSDPEVRDKVIRLILKL
..::.:. : .::. : ..::. :: : .::::...: :: ::
CCDS59 QDKFSKNSLYFLFQRPKACAKKLRALAAECNDPEVKERVELLISKL
2250 2260 2270 2280 2290
>>CCDS14502.1 BHLHB9 gene_id:80823|Hs108|chrX (547 aa)
initn: 720 init1: 287 opt: 645 Z-score: 727.8 bits: 144.5 E(32554): 3.2e-34
Smith-Waterman score: 727; 30.7% identity (61.5% similar) in 553 aa overlap (26-531:10-542)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MVDSGTEARARGKAEAGLQDGISGPATARVNGKTQAEAVAEAELKTESVTQAKAGDGAMT
: :... :. .: : :: .. .:.. : : .
CCDS14 MAGTKNKTRAQAKTEKKAAIQAKAGAEREATGVVRPVAKTRAKA
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB8 RTHTVTYREAMAVTREVIKVEDTTKTRVMVETKTKPLAERSIVPQTKSKAM----PMS--
...: . .:.: . : .:..:..::: :.: :.: .::: : .
CCDS14 KAKTGSKTDAVAEMKAV------SKNKVVAETKEGALSE----PKTLGKAMGDFTPKAGN
50 60 70 80 90
120 130 140 150
pF1KB8 -RVSTVTKSEVKVVAVI----EANIRS-----------YAKSHDKANTGSRPDRRE-ETS
.:.. :.:. . : . ::.: : .. ..:: . :.. .: : .
CCDS14 ESTSSTCKNEAGTDAWFWAGEEATINSWFWNGEEAGNSFSTKNDKPEIGAQVCAEELEPA
100 110 120 130 140 150
160 170 180 190 200
pF1KB8 IGMK------SSDEDEENIC-SWFWTGEEPSVGSWFWPEEETSLQVYKPLP--KIQEKPK
: . .:.:::. .::: :.. : : :. . .. :: : .:.:: .
CCDS14 AGADCKPRSGAEEEEEENVIGNWFWEGDDTS----FDPNPKPVSRIVKPQPVYEINEKNR
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250
pF1KB8 PTHKPTLTIKQKVIAWSRA---------------RYIVLVPVEGGEQSLPPEGNWTLVET
: .:: .. : . : ::::. .: . ::: : .
CCDS14 PKDWSEVTIWPNAPAVTPAVLGFRSQAPSEASPPSYIVLASAEENACSLPVA---TACRP
220 230 240 250 260
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 LIETPLGIRPLTKIPPYHGPYYQTLAEIKKQIRQREKYGPNPKACHCKSRGFSLEPKEFD
.: .:. . : ::. ::..::: :: : .: :: :: . . .. .::.
CCDS14 SRNTRSCSQPIPECRFDSDPCIQTIDEIRRQIRIREVNGIKPFACPCKMECY-MDSEEFE
270 280 290 300 310 320
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 KLVALLKLTKDPFIHEIATMIMGISPAYPFTQDIIHDVGITVMIENLVNNPNVKEHPGAL
:::.::: : ::.::.:: . ::. ..::.:..:..::....::.:.. :. . . ..
CCDS14 KLVSLLKSTTDPLIHKIARIAMGVHNVHPFAQEFINEVGVVTLIESLLSFPSPEMRKKTV
330 340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KB8 SMVDDSSESSEEPKSGESYIHQVCKGIISCPLNSPVQLAGLKLLGHLSIKFEDHYVITSY
.. : ..:. .. : .....:: .: ::::: : .:::.::.:. : ::....:
CCDS14 ITLNPPS-GDERQRKIELHVKHMCKETMSFPLNSPGQQSGLKILGQLTTDFVHHYIVANY
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470 480 490
pF1KB8 IPDFLTLLNKGSVKTKFYVLKVFSCLSKNHANTRELISAKVLSSLVAPFNKNESKANILN
. ... ::..:. ::. :::.. .:.: . .:..:. :.:..: ::..:.:::...
CCDS14 FSELFHLLSSGNCKTRNLVLKLLLNMSENPTAARDMINMKALAALKLIFNQKEAKANLVS
450 460 470 480 490 500
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 IIEIFENINFQFKTKAKLFTKEKFTKSELISIFQEAKQFGQKLQDLAEHSDPEVRDKVIR
. :: ::. ... :... . .... . :..::.:.:.
CCDS14 GVAIFINIKEHIR-KGSIVVVDHLSYNTLMAIFREVKEIIETM
510 520 530 540
pF1KB8 LILKL
>>CCDS35352.1 GPRASP1 gene_id:9737|Hs108|chrX (1395 aa)
initn: 838 init1: 446 opt: 612 Z-score: 684.0 bits: 137.7 E(32554): 8.8e-32
Smith-Waterman score: 700; 28.3% identity (62.9% similar) in 477 aa overlap (94-546:927-1390)
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 TVTYREAMAVTREVIKVEDTTKTRVMVETKTKPLAERSIVPQTK--SKAMPMSRVSTVTK
.:: .. .. .. :. .....::.
CCDS35 MESETEEETIFGSWFWDGKEVSEEAGPCCVSKPEDDEEMIVESWFWSRDKAIKETGTVAT
900 910 920 930 940 950
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 SEVKVVAVIEANIRSYAKSHDKANTGSRPDRREETSIGMKS-SDEDEENICSWFWTGEEP
: : : . :. ...:... .: : . .. : .. .:::: . ::::.:.:
CCDS35 CESKPENEEGAIVGSWFEAEDEVD--NRTD--NGSNCGSRTLADEDEAIVGSWFWAGDEA
960 970 980 990 1000 1010
190 200 210 220 230
pF1KB8 SVGSWFWPEEETSLQVYKPLPKIQEKPKPTHKPT----LTIKQKVIAWSRARYIVLVPVE
: : .. . . .....: :...: .:.. : :.:. . . : .
CCDS35 HFESNPSPVFRA---ICRSTCSVEQEPDPSRRPQSWEEVTVQFKPGPWGRVGFPSISPFR
1020 1030 1040 1050 1060
240 250 260 270 280
pF1KB8 -------------GGEQS---LPPEGNWTLVETLIETPLGIRPLTKIPPYHGPYYQTLAE
::. : :::. :.:.. .: ..: . : :... :
CCDS35 FPKEAASLFCEMFGGKPRNMVLSPEGEDQ--ESLLQPD---QPSPEFPFQYDPSYRSVQE
1070 1080 1090 1100 1110 1120
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 IKKQIRQREKYGPNPKACHCKSRGFSLEPKEFDKLVALLKLTKDPFIHEIATMIMGISPA
:....: .:. :. ..:.: . ... .::..:. :.. .:::::::. . ::. :
CCDS35 IREHLRAKESTEPESSSCNCIQCELKIGSEEFEELLLLMEKIRDPFIHEISKIAMGMRSA
1130 1140 1150 1160 1170 1180
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 YPFTQDIIHDVGITVMIENLVNNPNVKEHPGALSMVDDSSESSEEPKSGESYIHQVCKGI
::.:.:.: :.. .::.:.: :. . . . : . . . . ..:: .::.
CCDS35 SQFTRDFIRDSGVVSLIETLLNYPSSRVRTSFLENMIRMAPPYPNLNIIQTYICKVCEET
1190 1200 1210 1220 1230 1240
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 ISCPLNSPVQLAGLKLLGHLSIKFEDHYVITSYIPDFLTLLNKGSVKTKFYVLKVFSCLS
.. ..:: ::.:.... ::. . : ....:. ::.:: :..::.:.:::.. ::
CCDS35 LAYSVDSPEQLSGIRMIRHLTTTTDYHTLVANYMSGFLSLLATGNAKTRFHVLKMLLNLS
1250 1260 1270 1280 1290 1300
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 KNHANTRELISAKVLSSLVAPFNKNESKANILNIIEIFENINFQFKTKAKLFTKEKFTKS
.: :.::.::...: ... ::..:.. :: .. :::::. ..: : .:. . :.
CCDS35 ENLFMTKELLSAEAVSEFIGLFNREETNDNIQIVLAIFENIGNNIK-KETVFSDDDFNIE
1310 1320 1330 1340 1350 1360
530 540 550
pF1KB8 ELISIFQEAKQFGQKLQDLAEH-SDPEVRDKVIRLILKL
::: :.....:...:: ... .:::
CCDS35 PLISAFHKVEKFAKELQGKTDNQNDPEGDQEN
1370 1380 1390
>>CCDS14501.1 GPRASP2 gene_id:114928|Hs108|chrX (838 aa)
initn: 783 init1: 534 opt: 590 Z-score: 662.8 bits: 133.1 E(32554): 1.3e-30
Smith-Waterman score: 605; 25.9% identity (59.8% similar) in 584 aa overlap (4-547:264-834)
10 20
pF1KB8 MVDSGTEARARGKAEA------GLQDGISGPAT
.. ..: :.: :: : .: :.: .
CCDS14 SSFWTGEETSVRSWPREESNTRSRHRAKHQTNPRSRPRSKQEAYVDSWSGSEDEASNPFS
240 250 260 270 280 290
30 40 50 60 70
pF1KB8 ARVNGKT--------QAEAVAEAELKT--ESVTQAKAGDGAMTRTHTVTYREAMAVTREV
:. .: . :: ...:.: :. .... : . .. .. .:: . :.
CCDS14 FWVGENTNNLFRPRVREEANIRSKLRTNREDCFESESEDEFYKQSWVLPGEEANSRFRHR
300 310 320 330 340 350
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 IKVEDTT--KTRVMVETKTKPLAERSIVPQTKSKAMPMSRVSTVTKSEVKVVAVIEANIR
: . .: : :.. .. . . .. :. . ... : ...:... . : .
CCDS14 DKEDPNTALKLRAQKDVDSDRVKQE---PRFEEEVIIGSWF--WAEKEASLEGGASAICE
360 370 380 390 400
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 SYAKSHDKANTGSRPDRREETSIGMKSSDEDEENICSWFWTGEEPSVGSWFWPEEETSLQ
: ... : :: .:..:.: . .: . . . :: ::::: ..:. ..
CCDS14 SEPGTEEGAIGGSAYWAEEKSSLGAVAREEAKPE------SEEEAIFGSWFWDRDEACFD
410 420 430 440 450 460
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 VYK-PLPKIQEKPKPTHKPTLTIKQKVIAWSRARYIVLVP--VEG-GEQSLPPEGNWTLV
. :. :.... . . . :. ... .:... . . : .: : .: : : .
CCDS14 LNPCPVYKVSDRFRDAAEE-LNASSRPQTWDEVT-VEFKPGLFHGVGFRSTSPFGIPEEA
470 480 490 500 510 520
260 270 280 290
pF1KB8 ETLIE--------TPLG------IRPLTKIPPY---HGPYYQTLAEIKKQIRQREKYGPN
..: .: : ..: : . . : :... ::....: ::. .
CCDS14 SEMLEAKPKNLELSPEGEEQESLLQPDQPSPEFTFQYDPSYRSVREIREHLRARESAESE
530 540 550 560 570 580
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 PKACHCKSRGFSLEPKEFDKLVALLKLTKDPFIHEIATMIMGISPAYPFTQDIIHDVGIT
.: : . ... .::.... :. .:::::::. . ::. : ::.:.:.: :..
CCDS14 SWSCSCIQCELKIGSEEFEEFLLLMDKIRDPFIHEISKIAMGMRSASQFTRDFIRDSGVV
590 600 610 620 630 640
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 VMIENLVNNPNVKEHPGALSMVDDSSESSEEPKSGESYIHQVCKGIISCPLNSPVQLAGL
.::.:.: :. . . . : . . . . :..: :::. .. ..: ::.:.
CCDS14 SLIETLLNYPSSRVRTSFLENMIHMAPPYPNLNMIETFICQVCEETLAHSVDSLEQLTGI
650 660 670 680 690 700
420 430 440 450 460 470
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:: .:. :: .:.. :: .:..:.::. .:. . . :. ::: :.: .....
CCDS14 LSIFVGLFNIEETNDNIQIVIKMFQNISNIIKSGKMSLIDDDFSLEPLISAFREFEELAK
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540 550
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CCDS14 QLQAQIDNQNDPEVGQQS
830
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CCDS14 IVAKILNTRDPIVKEK--ALIVLNNLSVNAENQRRLKVYMNQVCDDTITSRLNSSVQLAG
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CCDS14 VPSSLGSLFNKKENKEVILKLLVIFENINDNFKWEENEPTQNQFGEGSLFFFLKEFQVCA
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CCDS14 DKVLGIESHHDFLVKVKVGKFMAKLAEHMFPKSQE
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CCDS14 GGRASGKSKGKARSKSTRAPATTWPVRRGKFNFPYKIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPF
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CCDS14 IQEVALVTLGNNAAYSFNQNAIRELGGVPIIAKLIKTKDPIIREK--TYNALNNLSVNAE
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CCDS14 NQGKIKTYISQVCDDTMVCRLDSAVQMAGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLG
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CCDS14 NHFTKIQIMKLIINFTENPAMTRELVSCKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDN
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CCDS14 IKNEGLASSRKEFSRSSLFFLFKESGVCVKKIKALANHNDLVVKVKVLKVLTKL
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CCDS55 NNAAFSVNQAIIRELGGIPIVANKINHSNQSIKEKALNALNNLSVNVENQIKIKIYISQV
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CCDS55 CEDVFSGPLNSAVQLAGLTLLTNMTVTNDHQHMLHSYITDLFQVLLTGNGNTKVQVLKLL
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CCDS55 LNLSENPAMTEGLLRAQVDSSFLSLYDSHVAKEILLRVLTLFQNIKNCLKIEGHLAVQPT
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CCDS55 FTEGSLFFLLH-GEECAQKIRALVDHHDAEVKEKVVTIIPKI
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CCDS57 NNAAFSVNQAIIRELGGIPIVANKINHSNQSIKEKALNALNNLSVNVENQIKIKIYISQV
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CCDS57 CEDVFSGPLNSAVQLAGLTLLTNMTVTNDHQHMLHSYITDLFQVLLTGNGNTKVQVLKLL
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CCDS14 RKVLALLQKSDDPFIQQVALLTLSNNANYSCNQETIRKLGGLPIIANMINKTDPHIKEK-
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CCDS14 LINALTLFEIIYDNL--RAEVFNYREFNKGSLFYLCTTSGVCVKKIRALANHHDLLVKVK
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CCDS14 VIKLVNKF
630
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]