Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8768
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8768, 229 aa
1>>>pF1KB8768 229 - 229 aa - 229 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3991+/-0.00109; mu= 13.4111+/- 0.066
mean_var=80.2708+/-16.253, 0's: 0 Z-trim(105.0): 175 B-trim: 396 in 2/48
Lambda= 0.143151
statistics sampled from 7981 (8186) to 7981 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.635), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 1.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS641.1 DIRAS3 gene_id:9077|Hs108|chr1 ( 229) 1516 322.8 1.2e-88
CCDS6687.1 DIRAS2 gene_id:54769|Hs108|chr9 ( 199) 614 136.4 1.3e-32
CCDS12092.1 DIRAS1 gene_id:148252|Hs108|chr19 ( 198) 578 129.0 2.2e-30
CCDS9485.1 RAP2A gene_id:5911|Hs108|chr13 ( 183) 374 86.8 9.8e-18
CCDS3170.1 RAP2B gene_id:5912|Hs108|chr3 ( 183) 370 86.0 1.7e-17
CCDS840.1 RAP1A gene_id:5906|Hs108|chr1 ( 184) 367 85.4 2.7e-17
CCDS14632.1 RAP2C gene_id:57826|Hs108|chrX ( 183) 366 85.2 3.1e-17
CCDS8984.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12 ( 184) 363 84.6 4.8e-17
CCDS7814.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11 ( 204) 344 80.7 7.8e-16
CCDS11921.1 RIT2 gene_id:6014|Hs108|chr18 ( 217) 328 77.4 8.1e-15
CCDS1123.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 ( 219) 326 77.0 1.1e-14
CCDS58037.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 ( 236) 326 77.0 1.2e-14
CCDS8778.1 RHEBL1 gene_id:121268|Hs108|chr12 ( 183) 318 75.3 3e-14
CCDS3100.1 MRAS gene_id:22808|Hs108|chr3 ( 208) 310 73.7 1e-13
CCDS12774.1 RRAS gene_id:6237|Hs108|chr19 ( 218) 310 73.7 1.1e-13
CCDS2131.1 RALB gene_id:5899|Hs108|chr2 ( 206) 303 72.2 2.8e-13
CCDS5460.1 RALA gene_id:5898|Hs108|chr7 ( 206) 301 71.8 3.7e-13
CCDS8702.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12 ( 188) 299 71.4 4.6e-13
CCDS8703.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12 ( 189) 297 70.9 6.2e-13
CCDS6261.1 GEM gene_id:2669|Hs108|chr8 ( 296) 294 70.5 1.3e-12
CCDS8673.1 RERG gene_id:85004|Hs108|chr12 ( 199) 278 67.0 9.8e-12
CCDS53603.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11 ( 169) 275 66.4 1.3e-11
CCDS7698.1 HRAS gene_id:3265|Hs108|chr11 ( 189) 274 66.2 1.7e-11
CCDS10824.1 RRAD gene_id:6236|Hs108|chr16 ( 308) 274 66.4 2.4e-11
CCDS10200.1 RASL12 gene_id:51285|Hs108|chr15 ( 266) 273 66.1 2.5e-11
CCDS5927.1 RHEB gene_id:6009|Hs108|chr7 ( 184) 271 65.6 2.5e-11
CCDS877.1 NRAS gene_id:4893|Hs108|chr1 ( 189) 267 64.8 4.5e-11
>>CCDS641.1 DIRAS3 gene_id:9077|Hs108|chr1 (229 aa)
initn: 1516 init1: 1516 opt: 1516 Z-score: 1705.1 bits: 322.8 E(32554): 1.2e-88
Smith-Waterman score: 1516; 100.0% identity (100.0% similar) in 229 aa overlap (1-229:1-229)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGNASFGSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASG
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CCDS64 MGNASFGSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NFRHEYLPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTK
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CCDS64 NFRHEYLPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KETLEELKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSDDTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEI
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CCDS64 KETLEELKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSDDTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KB8 SAKTDVNVQELFHMLLNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
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CCDS64 SAKTDVNVQELFHMLLNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
190 200 210 220
>>CCDS6687.1 DIRAS2 gene_id:54769|Hs108|chr9 (199 aa)
initn: 560 init1: 560 opt: 614 Z-score: 699.2 bits: 136.4 E(32554): 1.3e-32
Smith-Waterman score: 614; 49.0% identity (80.4% similar) in 194 aa overlap (37-229:7-199)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 GSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRHEY
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CCDS66 MPEQSNDYRVAVFGAGGVGKSSLVLRFVKGTFRESY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETLEE
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CCDS66 IPTVEDTYRQVISCDKSICTLQITDTTGSHQFPAMQRLSISKGHAFILVYSITSRQSLEE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSDDT-HREVALNDGATCAMEWNCAFMEISAKTD
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CCDS66 LKPIYEQICEIKGD-VESIPIMLVGNKCDESPSREVQSSEAEALARTWKCAFMETSAKLN
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220
pF1KB8 VNVQELFHMLLNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
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CCDS66 HNVKELFQELLNLEKRRTVSLQIDGKKSKQQKRKEKLKGKCVIM
160 170 180 190
>>CCDS12092.1 DIRAS1 gene_id:148252|Hs108|chr19 (198 aa)
initn: 561 init1: 356 opt: 578 Z-score: 659.1 bits: 129.0 E(32554): 2.2e-30
Smith-Waterman score: 578; 46.6% identity (78.2% similar) in 193 aa overlap (37-229:7-198)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 GSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRHEY
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CCDS12 MPEQSNDYRVVVFGAGGVGKSSLVLRFVKGTFRDTY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETLEE
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CCDS12 IPTIEDTYRQVISCDKSVCTLQITDTTGSHQFPAMQRLSISKGHAFILVFSVTSKQSLEE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSDDTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEISAKTDV
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CCDS12 LGPIYKLIVQIKGS-VEDIPVMLVGNKCDETQREVDTREAQAVAQEWKCAFMETSAKMNY
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220
pF1KB8 NVQELFHMLLNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
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CCDS12 NVKELFQELLTLETRRNMSLNIDGKRSGKQKRTDRVKGKCTLM
160 170 180 190
>>CCDS9485.1 RAP2A gene_id:5911|Hs108|chr13 (183 aa)
initn: 319 init1: 188 opt: 374 Z-score: 431.8 bits: 86.8 E(32554): 9.8e-18
Smith-Waterman score: 374; 36.0% identity (70.9% similar) in 172 aa overlap (35-202:1-170)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 SFGSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRH
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CCDS94 MREYKVVVLGSGGVGKSALTVQFVTGTFIE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EYLPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETL
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CCDS94 KYDPTIEDFYRKEIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFASMRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 EELKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSD-DTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEISAK
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CCDS94 QDIKPMRDQIIRVK--RYEKVPVILVGNKVDLESEREVSSSEGRALAEEWGCPFMETSAK
100 110 120 130 140
190 200 210 220
pF1KB8 TDVNVQELFHML---LNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
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CCDS94 SKTMVDELFAEIVRQMNYAAQPDKDDPCCSACNIQ
150 160 170 180
>>CCDS3170.1 RAP2B gene_id:5912|Hs108|chr3 (183 aa)
initn: 320 init1: 189 opt: 370 Z-score: 427.4 bits: 86.0 E(32554): 1.7e-17
Smith-Waterman score: 370; 35.5% identity (70.9% similar) in 172 aa overlap (35-202:1-170)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 SFGSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRH
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CCDS31 MREYKVVVLGSGGVGKSALTVQFVTGSFIE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EYLPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETL
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CCDS31 KYDPTIEDFYRKEIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFASMRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 EELKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSD-DTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEISAK
...: . . : ..: .. :..::::: : . .:::. ..: . : ::.: ::: :::
CCDS31 QDIKPMRDQIIRVK--RYERVPMILVGNKVDLEGEREVSYGEGKALAEEWSCPFMETSAK
100 110 120 130 140
190 200 210 220
pF1KB8 TDVNVQELFHML---LNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
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CCDS31 NKASVDELFAEIVRQMNYAAQPNGDEGCCSACVIL
150 160 170 180
>>CCDS840.1 RAP1A gene_id:5906|Hs108|chr1 (184 aa)
initn: 266 init1: 266 opt: 367 Z-score: 424.0 bits: 85.4 E(32554): 2.7e-17
Smith-Waterman score: 367; 35.7% identity (70.3% similar) in 182 aa overlap (35-213:1-180)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 SFGSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRH
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CCDS84 MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EYLPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETL
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CCDS84 KYDPTIEDSYRKQVEVDCQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 EELKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSD-DTHREVALNDGATCAMEW-NCAFMEISA
..:. . : : ..: . . :..::::: : . .: :. ..: . : .: ::::.: ::
CCDS84 NDLQDLREQILRVK--DTEDVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWCNCAFLESSA
100 110 120 130 140
190 200 210 220
pF1KB8 KTDVNVQELFHMLL-NYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
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CCDS84 KSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVEKKKPKKKSCLLL
150 160 170 180
>>CCDS14632.1 RAP2C gene_id:57826|Hs108|chrX (183 aa)
initn: 332 init1: 189 opt: 366 Z-score: 422.9 bits: 85.2 E(32554): 3.1e-17
Smith-Waterman score: 366; 35.4% identity (70.2% similar) in 181 aa overlap (35-214:1-175)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 SFGSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRH
.:.:.:::.:..:::::.: ....:.: .
CCDS14 MREYKVVVLGSGGVGKSALTVQFVTGTFIE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EYLPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETL
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CCDS14 KYDPTIEDFYRKEIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFASMRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 EELKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSD-DTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEISAK
...: . . : ..: .: :..::::: : . .::: ..: . :.::.: ::: :::
CCDS14 QDIKPMRDQIVRVK--RYEKVPLILVGNKVDLEPEREVMSSEGRALAQEWGCPFMETSAK
100 110 120 130 140
190 200 210 220
pF1KB8 TDVNVQELFHMLLNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
. :.::: .. .. ..: :::..:
CCDS14 SKSMVDELFAEIV--RQMNYSSL--PEKQDQCCTTCVVQ
150 160 170 180
>>CCDS8984.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12 (184 aa)
initn: 271 init1: 271 opt: 363 Z-score: 419.5 bits: 84.6 E(32554): 4.8e-17
Smith-Waterman score: 363; 34.6% identity (68.6% similar) in 185 aa overlap (35-215:1-183)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 SFGSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRH
.:.:..::.:..:::::.: ....: : .
CCDS89 MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EYLPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETL
.: ::::..: . . . :.: :. . . :.. . :..:.::::.: . :.
CCDS89 KYDPTIEDSYRKQVEVDAQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 EELKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSD-DTHREVALNDGATCAMEWN-CAFMEISA
..:. . : : ..: .. :..::::: : . .: :. ..: . : .:: :::.: ::
CCDS89 NDLQDLREQILRVKDTD--DVPMILVGNKCDLEDERVVGKEQGQNLARQWNNCAFLESSA
100 110 120 130 140
190 200 210 220
pF1KB8 KTDVNVQELFHMLLNY--KKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDKCIIM
:. .::.:.:. :. .: :. : . ... :.
CCDS89 KSKINVNEIFYDLVRQINRKTPVPGKARKKSSCQLL
150 160 170 180
>>CCDS7814.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11 (204 aa)
initn: 311 init1: 195 opt: 344 Z-score: 397.7 bits: 80.7 E(32554): 7.8e-16
Smith-Waterman score: 344; 34.7% identity (63.8% similar) in 196 aa overlap (38-228:15-203)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 SKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRHEYL
::.:::: .:::::.: .. .. : .:
CCDS78 MAAAGWRDGSGQEKYRLVVVGGGGVGKSALTIQFIQSYFVTDYD
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETLEEL
::::..: . . . : : :. . . :.... . :..:.::.::: . ..::.
CCDS78 PTIEDSYTKQCVIDDRAARLDILDTAGQEEFGAMREQYMRTGEGFLLVFSVTDRGSFEEI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSD-DTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEISAKTDV
: . : ..: . .::..:.:::.: : .:.:. ..: : . . ..:: ::: .
CCDS78 YKFQRQILRVKDRD--EFPMILIGNKADLDHQRQVTQEEGQQLARQLKVTYMEASAKIRM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220
pF1KB8 NVQELFHMLLNYKKKPTTGLQEPEKKSQMPNTTEKLLDK----CIIM
::.. :: :. .: .:: : . :. :.: :: :.:
CCDS78 NVDQAFHELVRVIRK----FQEQECPPS-PEPTRKEKDKKGCHCVIF
170 180 190 200
>>CCDS11921.1 RIT2 gene_id:6014|Hs108|chr18 (217 aa)
initn: 327 init1: 190 opt: 328 Z-score: 379.5 bits: 77.4 E(32554): 8.1e-15
Smith-Waterman score: 333; 32.5% identity (63.9% similar) in 191 aa overlap (36-225:19-197)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 FGSKEQKLLKRLRLLPALLILRAFKPHRKIRDYRVVVVGTAGVGKSTLLHKWASGNFRHE
:.:.::..:..:::::.. .. : .:
CCDS11 MEVENEASCSPGSASGGSREYKVVMLGAGGVGKSAMTMQFISHQFPDY
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 YLPTIENTYCQLLGCSHGVLSLHITDSKSGDGNRALQRHVIARGHAFVLVYSVTKKETLE
. ::::..: . .. : : :. . :.... . :..:.. :::: .....
CCDS11 HDPTIEDAYKTQVRIDNEPAYLDILDTAGQAEFTAMREQYMRGGEGFIICYSVTDRQSFQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ELKAFYELICKIKGNNLHKFPIVLVGNKSD-DTHREVALNDGATCAMEWNCAFMEISAKT
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