Result of FASTA (omim) for
pFN21AB8734
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8734, 551 aa
1>>>pF1KB8734 551 - 551 aa - 551 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2555+/-0.000394; mu= -14.5750+/- 0.025
mean_var=338.0557+/-69.717, 0's: 0 Z-trim(122.8): 63 B-trim: 183 in 1/59
Lambda= 0.069756
statistics sampled from 41384 (41469) to 41384 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.777), E-opt: 0.2 (0.486), width: 16
Scan time: 13.270
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001273620 (OMIM: 159558) protein AF-9 isoform b ( 565) 2580 273.4 1.3e-72
NP_004520 (OMIM: 159558) protein AF-9 isoform a [H ( 568) 2580 273.4 1.3e-72
XP_016870216 (OMIM: 159558) PREDICTED: protein AF- ( 517) 2005 215.5 3.2e-55
XP_016870215 (OMIM: 159558) PREDICTED: protein AF- ( 520) 2005 215.5 3.2e-55
NP_005925 (OMIM: 159556) protein ENL [Homo sapiens ( 559) 990 113.4 1.9e-24
XP_011526324 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL ( 561) 984 112.8 2.9e-24
XP_011526323 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL ( 600) 984 112.8 3.1e-24
XP_011526325 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL ( 558) 981 112.5 3.6e-24
XP_016882308 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL ( 527) 803 94.6 8.4e-19
>>NP_001273620 (OMIM: 159558) protein AF-9 isoform b [Ho (565 aa)
initn: 2580 init1: 2580 opt: 2580 Z-score: 1424.5 bits: 273.4 E(85289): 1.3e-72
Smith-Waterman score: 3552; 97.0% identity (97.0% similar) in 564 aa overlap (5-551:2-565)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS-------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB8 ----------TSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 PLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAPSKRPPISDSEELSAKKRKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAPSKRPPISDSEELSAKKRKK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 SSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 PNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESD
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 EVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQILE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 VKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITN
480 490 500 510 520 530
530 540 550
pF1KB8 TTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
540 550 560
>>NP_004520 (OMIM: 159558) protein AF-9 isoform a [Homo (568 aa)
initn: 2580 init1: 2580 opt: 2580 Z-score: 1424.5 bits: 273.4 E(85289): 1.3e-72
Smith-Waterman score: 3574; 97.0% identity (97.0% similar) in 568 aa overlap (1-551:1-568)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB8 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS-------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB8 ----------TSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 PLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAPSKRPPISDSEELSAKKRKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAPSKRPPISDSEELSAKKRKK
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 SSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVD
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 PNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESD
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 EVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQILE
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 VKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITN
490 500 510 520 530 540
530 540 550
pF1KB8 TTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
550 560
>>XP_016870216 (OMIM: 159558) PREDICTED: protein AF-9 is (517 aa)
initn: 3333 init1: 2002 opt: 2005 Z-score: 1112.4 bits: 215.5 E(85289): 3.2e-55
Smith-Waterman score: 3137; 88.5% identity (88.5% similar) in 564 aa overlap (5-551:2-517)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS-------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB8 ----------TSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 PLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAPSKRPPISDSEELSAKKRKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAPSKRPPISDSEELSAKKRKK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 SSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 PNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESD
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 EVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQI--
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 VKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITN
::::::::::::::
XP_016 ----------------------------------------------VNLIEETGHFHITN
480
530 540 550
pF1KB8 TTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
490 500 510
>>XP_016870215 (OMIM: 159558) PREDICTED: protein AF-9 is (520 aa)
initn: 3355 init1: 2002 opt: 2005 Z-score: 1112.4 bits: 215.5 E(85289): 3.2e-55
Smith-Waterman score: 3159; 88.6% identity (88.6% similar) in 568 aa overlap (1-551:1-520)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB8 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS-------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB8 ----------TSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 PLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAPSKRPPISDSEELSAKKRKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLKEEKIVPKMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAPSKRPPISDSEELSAKKRKK
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 SSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSSEALFKSFSSAPPLILTCSADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVD
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 PNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSSFTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESD
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 EVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTNNNQI--
430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 VKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITN
::::::::::::::
XP_016 ----------------------------------------------VNLIEETGHFHITN
480 490
530 540 550
pF1KB8 TTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
500 510 520
>>NP_005925 (OMIM: 159556) protein ENL [Homo sapiens] (559 aa)
initn: 1485 init1: 831 opt: 990 Z-score: 559.8 bits: 113.4 E(85289): 1.9e-24
Smith-Waterman score: 1792; 54.7% identity (74.0% similar) in 578 aa overlap (1-550:1-559)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFP
: ..:.:::.::::::::.:::::.:::::::::::::::. .:::::::::: ::.:::
NP_005 MDNQCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMVFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCE
.:.::::.::::::::::::::.::::.:::::::::: : :::::.:::.:::::::::
NP_005 KPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEEPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160
pF1KB8 KLTFNNPTEDFRRKLLKAGG--------------DPNRSI-HTSSSSSSSSSSSSSSSSS
:::::::: .:: :::.::: .:. . : :. :. .... : .
NP_005 KLTFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSRPSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPSHG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 SSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENKPL
:..... :.. :::::. :::.:.: ::: : ::. :: :.. ::::..:.: :..
NP_005 SKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDS-ESKSSSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGRLP
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB8 KEEKIVP-KMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAP------SKRPPISDSEELSA
:::: : : :::::: :: : .:. . .: : :::: .:: . ::
NP_005 KEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLEST--SPKGGPPPPPPPPPRASSKRPATADSPKPSA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 KKRKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCS-ADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPP
::.:::::.. .. ...: . : .::: :::: .. ::: ::: : ::.
NP_005 KKQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESEPREAKKA----
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 FDDIVDPNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSS----FTPSQTRQQGPLRSIMKDL
.. ..:. :.. : ::.: : ::..:::::.:: : :::...::::::...::
NP_005 ----LEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVEDL
360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 HSDDNEEESDEVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPL
.: ::::: .:... : .: : :. :.:.:: :.:..:. :: .:::::
NP_005 QS----EESDE-DDSSSGEEAAGKTNPG--RDSRLSFSD-SESDNSADSSLPSREPPPPQ
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 LKTN-NNQILEVKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNL
:... .:: . :: .: .:.: :::: :::::::::::.::::..:::::::
NP_005 KPPPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERNVLQQIVNL
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550
pF1KB8 IEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
:::::::..::::::::: :::.:::::::: ::. .:
NP_005 IEETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLEAVAT
530 540 550
>>XP_011526324 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL iso (561 aa)
initn: 1479 init1: 825 opt: 984 Z-score: 556.5 bits: 112.8 E(85289): 2.9e-24
Smith-Waterman score: 1786; 54.9% identity (74.0% similar) in 574 aa overlap (5-550:7-561)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHES
:.:::.::::::::.:::::.:::::::::::::::. .:::::::::: ::.:
XP_011 MPKKRQCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMVFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 FPRPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLR
::.:.::::.::::::::::::::.::::.:::::::::: : :::::.:::.:::::::
XP_011 FPKPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEEPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB8 CEKLTFNNPTEDFRRKLLKAGG--------------DPNRSI-HTSSSSSSSSSSSSSSS
:::::::::: .:: :::.::: .:. . : :. :. .... :
XP_011 CEKLTFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSRPSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 SSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENK
.:..... :.. :::::. :::.:.: ::: : ::. :: :.. ::::..:.: :..
XP_011 HGSKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDS-ESKSSSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGR
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB8 PLKEEKIVP-KMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAP------SKRPPISDSEEL
:::: : : :::::: :: : .:. . .: : :::: .:: .
XP_011 LPKEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLEST--SPKGGPPPPPPPPPRASSKRPATADSPKP
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 SAKKRKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCS-ADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTL
::::.:::::.. .. ...: . : .::: :::: .. ::: ::: : ::.
XP_011 SAKKQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESEPREAKKA--
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 PPFDDIVDPNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSS----FTPSQTRQQGPLRSIMK
.. ..:. :.. : ::.: : ::..:::::.:: : :::...::::::...
XP_011 ------LEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVE
360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 DLHSDDNEEESDEVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPP
::.: ::::: .:... : .: : :. :.:.:: :.:..:. :: .::::
XP_011 DLQS----EESDE-DDSSSGEEAAGKTNPG--RDSRLSFSD-SESDNSADSSLPSREPPP
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 PLLKTN-NNQILEVKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIV
: :... .:: . :: .: .:.: :::: :::::::::::.::::..:::::
XP_011 PQKPPPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERNVLQQIV
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550
pF1KB8 NLIEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
:::::::::..::::::::: :::.:::::::: ::. .:
XP_011 NLIEETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLEAVAT
530 540 550 560
>>XP_011526323 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL iso (600 aa)
initn: 1479 init1: 825 opt: 984 Z-score: 556.1 bits: 112.8 E(85289): 3.1e-24
Smith-Waterman score: 1786; 54.9% identity (74.0% similar) in 574 aa overlap (5-550:46-600)
10 20 30
pF1KB8 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMV
:.:::.::::::::.:::::.:::::::::
XP_011 PGQRHQLRSSFCVCVCTCAPVCRLDSDFKRCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMV
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 FVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFPRPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEE
::::::. .:::::::::: ::.:::.:.::::.::::::::::::::.::::.::::::
XP_011 FVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFPKPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEE
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140
pF1KB8 PRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCEKLTFNNPTEDFRRKLLKAGG--------------
:::: : :::::.:::.::::::::::::::::: .:: :::.:::
XP_011 PRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCEKLTFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSRP
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190
pF1KB8 DPNRSI-HTSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKS
.:. . : :. :. .... : .:..... :.. :::::. :::.:.: ::: : ::
XP_011 SPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPSHGSKDANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDS-ESKS
200 210 220 230 240 250
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 AFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENKPLKEEKIVP-KMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSG
. :: :.. ::::..:.: :.. :::: : : :::::: :: : .:. . .:
XP_011 SSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGRLPKEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLEST--SPKGG
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 QDKKAP------SKRPPISDSEELSAKKRKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCS-ADKKQIK
: :::: .:: . ::::.:::::.. .. ...: . : .::: :
XP_011 PPPPPPPPPRASSKRPATADSPKPSAKKQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAK
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 DKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFDDIVDPNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSS
::: .. ::: ::: : ::. .. ..:. :.. : ::.: : ::..:::::
XP_011 DKSSTRGEKVKAESEPREAKKA--------LEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSS
380 390 400 410 420
380 390 400 410 420
pF1KB8 SSS----FTPSQTRQQGPLRSIMKDLHSDDNEEESDEVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRR
.:: : :::...::::::...::.: ::::: .:... : .: : :. :
XP_011 DSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVEDLQS----EESDE-DDSSSGEEAAGKTNPG--RDSR
430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 VSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLKTN-NNQILEVKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAY
.:.:: :.:..:. :: .::::: :... .:: . :: .: .:.: ::::
XP_011 LSFSD-SESDNSADSSLPSREPPPPQKPPPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAY
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 LDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLE
:::::::::::.::::..::::::::::::::..::::::::: :::.:::::::: ::
XP_011 TDELVELHRRLMALRERNVLQQIVNLIEETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLE
540 550 560 570 580 590
550
pF1KB8 TSGTS
. .:
XP_011 AVAT
600
>>XP_011526325 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL iso (558 aa)
initn: 1435 init1: 872 opt: 981 Z-score: 554.9 bits: 112.5 E(85289): 3.6e-24
Smith-Waterman score: 1762; 56.0% identity (73.0% similar) in 559 aa overlap (5-550:46-558)
10 20 30
pF1KB8 MASSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMV
:.:::.::::::::.:::::.:::::::::
XP_011 PGQRHQLRSSFCVCVCTCAPVCRLDSDFKRCTVQVRLELGHRAQLRKKPTTEGFTHDWMV
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 FVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFPRPKRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEE
::::::. .:::::::::: ::.:::.:.::::.::::::::::::::.::::.::::::
XP_011 FVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFPKPRRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEE
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 PRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCEKLTFNNPTEDFRRKLLKAGGDPNRSIHTSSSSSS
:::: : :::::.:::.::::::::::::::::: .:: :::.:::: :.
XP_011 PRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCEKLTFNNPTTEFRYKLLRAGGDANKE---------
140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKE
::.: :::::. :::.:.: ::: : ::. :: :.. ::::.
XP_011 ----------------SSKT--SKPHKVTKEHRERPRKDS-ESKSSSKELEREQAKSSKD
190 200 210 220
220 230 240 250 260
pF1KB8 SSKKPKENKPLKEEKIVP-KMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAP------SKR
.:.: :.. :::: : : :::::: :: : .:. . .: : :::
XP_011 TSRKLGEGRLPKEEKAPPPKAAFKEPKMALKETKLEST--SPKGGPPPPPPPPPRASSKR
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 PPISDSEELSAKKRKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCS-ADKKQIKDKSHVKMGKVKIESE
: .:: . ::::.:::::.. .. ...: . : .::: :::: .. ::: :::
XP_011 PATADSPKPSAKKQKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESE
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 TSEKKKSTLPPFDDIVDPNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSS----FTPSQTRQ
: ::. .. ..:. :.. : ::.: : ::..:::::.:: : :::...
XP_011 PREAKKA--------LEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHS
350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 QGPLRSIMKDLHSDDNEEESDEVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSAS
::::::...::.: ::::: .:... : .: : :. :.:.:: :.:..:. :
XP_011 QGPLRSMVEDLQS----EESDE-DDSSSGEEAAGKTNPG--RDSRLSFSD-SESDNSADS
400 410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 SPLHHEPPPPLLKTN-NNQILEVKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLR
: .::::: :... .:: . :: .: .:.: :::: :::::::::::.::
XP_011 SLPSREPPPPQKPPPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALR
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550
pF1KB8 ERHILQQIVNLIEETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
::..::::::::::::::..::::::::: :::.:::::::: ::. .:
XP_011 ERNVLQQIVNLIEETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLEAVAT
510 520 530 540 550
>>XP_016882308 (OMIM: 159556) PREDICTED: protein ENL iso (527 aa)
initn: 1298 init1: 644 opt: 803 Z-score: 458.5 bits: 94.6 E(85289): 8.4e-19
Smith-Waterman score: 1605; 53.3% identity (72.7% similar) in 546 aa overlap (33-550:1-527)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 SSCAVQVKLELGHRAQVRKKPTVEGFTHDWMVFVRGPEHSNIQHFVEKVVFHLHESFPRP
::::::::. .:::::::::: ::.:::.:
XP_016 MVFVRGPEQCDIQHFVEKVVFWLHDSFPKP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KRVCKDPPYKVEESGYAGFILPIEVYFKNKEEPRKVRFDYDLFLHLEGHPPVNHLRCEKL
.::::.::::::::::::::.::::.:::::::::: : :::::.:::.:::::::::::
XP_016 RRVCKEPPYKVEESGYAGFIMPIEVHFKNKEEPRKVCFTYDLFLNLEGNPPVNHLRCEKL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160
pF1KB8 TFNNPTEDFRRKLLKAGG--------------DPNRSI-HTSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
:::::: .:: :::.::: .:. . : :. :. .... : .:.
XP_016 TFNNPTTEFRYKLLRAGGVMVMPEGADTVSRPSPDYPMLPTIPLSAFSDPKKTKPSHGSK
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 SSSSSSTSFSKPHKLMKEHKEKPSKDSREHKSAFKEPSRDHNKSSKESSKKPKENKPLKE
.... :.. :::::. :::.:.: ::: : ::. :: :.. ::::..:.: :.. ::
XP_016 DANKESSKTSKPHKVTKEHRERPRKDS-ESKSSSKELEREQAKSSKDTSRKLGEGRLPKE
160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 EKIVP-KMAFKEPKPMSKEPKPDSNLLTITSGQDKKAP------SKRPPISDSEELSAKK
:: : : :::::: :: : .:. . .: : :::: .:: . ::::
XP_016 EKAPPPKAAFKEPKMALKETKLEST--SPKGGPPPPPPPPPRASSKRPATADSPKPSAKK
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330
pF1KB8 RKKSSSEALFKSFSSAPPLILTCS-ADKKQIKDKSHVKMGKVKIESETSEKKKSTLPPFD
.:::::.. .. ...: . : .::: :::: .. ::: ::: : ::.
XP_016 QKKSSSKGSRSAPGTSPRTSSSSSFSDKKPAKDKSSTRGEKVKAESEPREAKKA------
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 DIVDPNDSDVEENISSKSDSEQPSPASSSSSSSSS----FTPSQTRQQGPLRSIMKDLHS
.. ..:. :.. : ::.: : ::..:::::.:: : :::...::::::...::.:
XP_016 --LEVEESNSEDEASFKSESAQSSPSNSSSSSDSSSDSDFEPSQNHSQGPLRSMVEDLQS
330 340 350 360 370
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 DDNEEESDEVEDNDNDSEMERPVNRGGSRSRRVSLSDGSDSESSSASSPLHHEPPPPLLK
::::: .:... : .: : :. :.:.:: :.:..:. :: .:::::
XP_016 ----EESDE-DDSSSGEEAAGKTNPG--RDSRLSFSD-SESDNSADSSLPSREPPPPQKP
380 390 400 410 420 430
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 TN-NNQILEVKSPIKQSKSDKQIKNGECDKAYLDELVELHRRLMTLRERHILQQIVNLIE
:... .:: . :: .: .:.: :::: :::::::::::.::::..:::::::::
XP_016 PPPNSKVSGRRSPESCSKPEKILKKGTYDKAYTDELVELHRRLMALRERNVLQQIVNLIE
440 450 460 470 480 490
520 530 540 550
pF1KB8 ETGHFHITNTTFDFDLCSLDKTTVRKLQSYLETSGTS
:::::..::::::::: :::.:::::::: ::. .:
XP_016 ETGHFNVTNTTFDFDLFSLDETTVRKLQSCLEAVAT
500 510 520
551 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 15:04:12 2016 done: Fri Nov 4 15:04:14 2016
Total Scan time: 13.270 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]