Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8726
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8726, 358 aa
1>>>pF1KB8726 358 - 358 aa - 358 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0240+/-0.00135; mu= 2.4814+/- 0.077
mean_var=253.5815+/-59.051, 0's: 0 Z-trim(106.6): 674 B-trim: 94 in 1/52
Lambda= 0.080541
statistics sampled from 8272 (9068) to 8272 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 2.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13755.1 TSSK2 gene_id:23617|Hs108|chr22 ( 358) 2393 291.9 5.5e-79
CCDS4112.1 TSSK1B gene_id:83942|Hs108|chr5 ( 367) 1597 199.5 3.9e-51
CCDS362.1 TSSK3 gene_id:81629|Hs108|chr1 ( 268) 893 117.5 1.3e-26
CCDS12403.1 TSSK6 gene_id:83983|Hs108|chr19 ( 273) 818 108.8 5.7e-24
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 670 92.1 1.7e-18
CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 670 92.1 1.7e-18
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 632 87.7 3.6e-17
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 630 87.4 4e-17
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 630 87.4 4e-17
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 630 87.4 4.1e-17
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 630 87.5 4.1e-17
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 ( 926) 629 87.4 5.1e-17
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 629 87.6 6.3e-17
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 629 87.6 6.4e-17
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 624 86.7 6.4e-17
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 624 86.7 6.5e-17
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 624 86.7 6.5e-17
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 624 86.8 6.7e-17
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 624 86.8 6.9e-17
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 624 86.8 6.9e-17
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 624 86.8 6.9e-17
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 624 86.8 6.9e-17
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 619 86.1 9.5e-17
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 619 86.2 1e-16
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 599 83.8 4.6e-16
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 599 83.8 4.7e-16
CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 559) 570 80.3 4.3e-15
CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1 ( 552) 563 79.5 7.5e-15
CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 610) 556 78.8 1.4e-14
CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 651) 556 78.8 1.5e-14
CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs108|chr21 ( 714) 552 78.4 2.1e-14
CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 668) 549 78.0 2.6e-14
CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 674) 549 78.0 2.6e-14
CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 736) 549 78.0 2.8e-14
CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 ( 778) 544 77.5 4.3e-14
CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs108|chr5 ( 436) 535 76.1 6.1e-14
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 ( 370) 530 75.5 8.2e-14
CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 766) 535 76.4 8.8e-14
CCDS60696.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 614) 504 72.7 9.3e-13
CCDS59126.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 619) 504 72.7 9.3e-13
CCDS43064.1 DCLK3 gene_id:85443|Hs108|chr3 ( 648) 490 71.1 3e-12
CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs108|chr1 ( 476) 487 70.6 3.1e-12
CCDS76779.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15 ( 470) 485 70.4 3.6e-12
CCDS45305.1 ULK3 gene_id:25989|Hs108|chr15 ( 472) 485 70.4 3.6e-12
CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs108|chr16 ( 424) 478 69.5 5.9e-12
CCDS73254.1 STK33 gene_id:65975|Hs108|chr11 ( 473) 474 69.1 8.8e-12
CCDS7789.1 STK33 gene_id:65975|Hs108|chr11 ( 514) 474 69.1 9.2e-12
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 471 68.6 9.3e-12
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 385) 471 68.6 9.8e-12
CCDS13843.1 CHEK2 gene_id:11200|Hs108|chr22 ( 543) 471 68.8 1.2e-11
>>CCDS13755.1 TSSK2 gene_id:23617|Hs108|chr22 (358 aa)
initn: 2393 init1: 2393 opt: 2393 Z-score: 1531.5 bits: 291.9 E(32554): 5.5e-79
Smith-Waterman score: 2393; 100.0% identity (100.0% similar) in 358 aa overlap (1-358:1-358)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDDATVLRKKGYIVGINLGKGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDRKKTPTDFVERFLPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MDDATVLRKKGYIVGINLGKGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDRKKTPTDFVERFLPRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 MDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFIKCQGALHEDVARKMFRQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFIKCQGALHEDVARKMFRQL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 SSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLLDKDFNIKLSDFGFSKRCLRDSNGRIILSKTFCGSAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLLDKDFNIKLSDFGFSKRCLRDSNGRIILSKTFCGSAA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 YAAPEVLQSIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSDIRKMLRIQKEHRVDFPRSKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YAAPEVLQSIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSDIRKMLRIQKEHRVDFPRSKN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LTCECKDLIYRMLQPDVSQRLHIDEILSHSWLQPPKPKATSSASFKREGEGKYRAECKLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LTCECKDLIYRMLQPDVSQRLHIDEILSHSWLQPPKPKATSSASFKREGEGKYRAECKLD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB8 TKTGLRPDHRPDHKLGAKTQHRLLVVPENENRMEDRLAETSRAKDHHISGAEVGKAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TKTGLRPDHRPDHKLGAKTQHRLLVVPENENRMEDRLAETSRAKDHHISGAEVGKAST
310 320 330 340 350
>>CCDS4112.1 TSSK1B gene_id:83942|Hs108|chr5 (367 aa)
initn: 1602 init1: 1566 opt: 1597 Z-score: 1031.5 bits: 199.5 E(32554): 3.9e-51
Smith-Waterman score: 1597; 71.8% identity (89.4% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-327)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDDATVLRKKGYIVGINLGKGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDRKKTPTDFVERFLPRE
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CCDS41 MDDAAVLKRRGYLLGINLGEGSYAKVKSAYSERLKFNVAIKIIDRKKAPADFLEKFLPRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 MDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFIKCQGALHEDVARKMFRQL
..::: .:: :::::::::::: :..::.:::.:::::::.:: .:::::: ::: :.::
CCDS41 IEILAMLNHCSIIKTYEIFETSHGKVYIVMELAVQGDLLELIKTRGALHEDEARKKFHQL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 SSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLLDKDFNIKLSDFGFSKRCLRDSNGRIILSKTFCGSAA
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CCDS41 SLAIKYCHDLDVVHRDLKCDNLLLDKDFNIKLSDFSFSKRCLRDDSGRMALSKTFCGSPA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 YAAPEVLQSIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSDIRKMLRIQKEHRVDFPRSKN
::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::::::.:::::.
CCDS41 YAAPEVLQGIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSNIKKMLRIQKEHRVNFPRSKH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LTCECKDLIYRMLQPDVSQRLHIDEILSHSWLQPPKPKATSSASFKREGEGKYRAECKLD
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CCDS41 LTGECKDLIYHMLQPDVNRRLHIDEILSHCWMQP-KARGSPSVAINKEGESSRGTEPLWT
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB8 TKTGLRPDHRPDHKLGAKTQHRLLVVPENENRMEDRLAETSRAKDHHISGAEVGKAST
. : :.. :: . . . . ::..
CCDS41 PEPG--SDKKSATKLEPEGEAQPQAQPETKPEGTAMQMSRQSEILGFPSKPSTMETEEGP
300 310 320 330 340 350
>>CCDS362.1 TSSK3 gene_id:81629|Hs108|chr1 (268 aa)
initn: 843 init1: 458 opt: 893 Z-score: 591.0 bits: 117.5 E(32554): 1.3e-26
Smith-Waterman score: 893; 47.4% identity (77.9% similar) in 272 aa overlap (1-272:1-265)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDDATVLRKKGYIVGINLGKGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDRKKTPTDFVERFLPRE
:.: : ..:: .: ..:.:.:.::: :.:.. . .::.:.::. : .:..::::::
CCDS36 MED--FLLSNGYQLGKTIGEGTYSKVKEAFSKKHQRKVAIKVIDKMGGPEEFIQRFLPRE
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pF1KB8 MDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFIKCQGALHEDVARKMFRQL
..:. :..: .::..::..:..::.: ..:::. ::... . : : :. :. .:::.
CCDS36 LQIVRTLDHKNIIQVYEMLESADGKICLVMELAEGGDVFDCVLNGGPLPESRAKALFRQM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 SSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLLDKDFNIKLSDFGFSKRCLRDSNGRIILSKTFCGSAA
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CCDS36 VEAIRYCHGCGVAHRDLKCENALL-QGFNLKLTDFGFAK-VLPKSHRE--LSQTFCGSTA
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190 200 210 220 230 240
pF1KB8 YAAPEVLQSIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSDIRKMLRIQKEHRVDFPRSKN
::::::::.::.. : :.::.::.::.:.:.:.:.::.:: ::: :... :.:: .
CCDS36 YAAPEVLQGIPHDSKKGDVWSMGVVLYVMLCASLPFDDTDIPKMLW-QQQKGVSFPTHLS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LTCECKDLIYRMLQPDVSQRLHIDEILSHSWLQPPKPKATSSASFKREGEGKYRAECKLD
.. .:.::. :.:.::. : :.:. : ::
CCDS36 ISADCQDLLKRLLEPDMILRPSIEEVSWHPWLAST
240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KB8 TKTGLRPDHRPDHKLGAKTQHRLLVVPENENRMEDRLAETSRAKDHHISGAEVGKAST
>>CCDS12403.1 TSSK6 gene_id:83983|Hs108|chr19 (273 aa)
initn: 765 init1: 292 opt: 818 Z-score: 543.8 bits: 108.8 E(32554): 5.7e-24
Smith-Waterman score: 818; 46.4% identity (74.5% similar) in 274 aa overlap (1-273:1-268)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDDATVLRKKGYIVGINLGKGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDRKKTPTDFVERFLPRE
:. .: . :: .: ..:.:::.::: : :.. : .::.:..::...: :::..:::::
CCDS12 MSGDKLLSELGYKLGRTIGEGSYSKVKVATSKKYKGTVAIKVVDRRRAPPDFVNKFLPRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 MDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFIKCQGALHEDVARKMFRQL
..:: : : :....:..:. .:..::.:: .. :::. .. .: . :: .: :.
CCDS12 LSILRGVRHPHIVHVFEFIEVCNGKLYIVME-AAATDLLQAVQRNGRIPGVQARDLFAQI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 SSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLLDKDFN-IKLSDFGFSKRCLRDSNGRIILSKTFCGSA
..::.: :: .:::::::::.::. : .::.::::. :...: :: :.::::
CCDS12 AGAVRYLHDHHLVHRDLKCENVLLSPDERRVKLTDFGFG----RQAHGYPDLSTTYCGSA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 AYAAPEVLQSIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSDIRKMLRIQKEHRVDFPRSK
:::.:::: .:::.:: ::.::.::.::.:: : ::.::::: . : ::. : .:..
CCDS12 AYASPEVLLGIPYDPKKYDVWSMGVVLYVMVTGCMPFDDSDIAGLPRRQKRG-VLYPEGL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 NLTCECKDLIYRMLQPDVSQRLHIDEILSHSWLQPPKPKATSSASFKREGEGKYRAECKL
.:. .:: :: ..:: . : : .. . ::.
CCDS12 ELSERCKALIAELLQFSPSARPSAGQVARNCWLRAGDSG
240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 DTKTGLRPDHRPDHKLGAKTQHRLLVVPENENRMEDRLAETSRAKDHHISGAEVGKAST
>>CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 (783 aa)
initn: 621 init1: 267 opt: 670 Z-score: 445.6 bits: 92.1 E(32554): 1.7e-18
Smith-Waterman score: 670; 41.1% identity (68.4% similar) in 285 aa overlap (7-285:22-297)
10 20 30 40
pF1KB8 MDDATVLRKKGYIVGINLGKGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDR
:: : . .::::..: :: : . : .::.::::.
CCDS33 MVIMSEFSADPAGQGQGQQKPLRVGFYDIERTLGKGNFAVVKLARHRVTKTQVAIKIIDK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 KKTPTDFVERFLPREMDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFIKCQ
. .. .:.. ::.... .:: ::: :...::.: .::. :.. .:...... .
CCDS33 TRLDSSNLEKIY-REVQLMKLLNHPHIIKLYQVMETKD-MLYIVTEFAKNGEMFDYLTSN
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 GALHEDVARKMFRQLSSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLLDKDFNIKLSDFGFSKRCLRDS
: : :. ::: : :. :::.:::: ::::::: :::::: ...:::.::::.. .
CCDS33 GHLSENEARKKFWQILSAVEYCHDHHIVHRDLKTENLLLDGNMDIKLADFGFGN---FYK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 NGRIILSKTFCGSAAYAAPEVLQSIPYQPKVYDIWSLGVILYIMVCGSMPYDDSDIRKML
.:. . .:.::: ::::::... :. :::::::.::..::::.:.: .. .
CCDS33 SGEPL--STWCGSPPYAAPEVFEGKEYEGPQLDIWSLGVVLYVLVCGSLPFDGPNLPTLR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB8 RIQKEHRVDFPRSKNLTCECKDLIYRMLQPDVSQRLHIDEILSHSWL--QP--PKPK--A
. : : .: .. .:..:: ::: : ..:. : .: .: :. .: : : :
CCDS33 QRVLEGRFRIPFF--MSQDCESLIRRMLVVDPARRITIAQIRQHRWMRAEPCLPGPACPA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 TSSASFKREGEGKYRAECKLDTKTGLRPDHRPDHKLGAKTQHRLLVVPENENRMEDRLAE
:. :.
CCDS33 FSAHSYTSNLGDYDEQALGIMQTLGVDRQRTVESLQNSSYNHFAAIYYLLLERLKEYRNA
300 310 320 330 340 350
>>CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|chr21 (783 aa)
initn: 621 init1: 267 opt: 670 Z-score: 445.6 bits: 92.1 E(32554): 1.7e-18
Smith-Waterman score: 670; 41.1% identity (68.4% similar) in 285 aa overlap (7-285:22-297)
10 20 30 40
pF1KB8 MDDATVLRKKGYIVGINLGKGSYAKVKSAYSERLKFNVAVKIIDR
:: : . .::::..: :: : . : .::.::::.
CCDS82 MVIMSEFSADPAGQGQGQQKPLRVGFYDIERTLGKGNFAVVKLARHRVTKTQVAIKIIDK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 KKTPTDFVERFLPREMDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFIKCQ
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:. :.
CCDS82 FSAHSYTSNLGDYDEQALGIMQTLGVDRQRTVESLQNSSYNHFAAIYYLLLERLKEYRNA
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pF1KB8 -TPTDFVERFLPREMDILATVNHGSIIKTYEIFETSDGRIYIIMELGVQGDLLEFIKCQG
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CCDS41 LNPTSLQKLF--REVRIMKILNHPNIVKLFEVIET-EKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHG
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pF1KB8 ALHEDVARKMFRQLSSAVKYCHDLDIVHRDLKCENLLLDKDFNIKLSDFGFSKRCLRDSN
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CCDS41 RVLRGKYRIPF----YMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPF
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CCDS45 LNPTSLQKLF--REVRIMKILNHPNIVKLFEVIET-EKTLYLIMEYASGGEVFDYLVAHG
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110 120 130 140 150 160
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CCDS45 RMKEKEARSKFRQIVSAVQYCHQKRIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFT--VG
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CCDS45 GKL---DTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRE
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230 240 250 260 270 280
pF1KB8 RIQK-EHRVDFPRSKNLTCECKDLIYRMLQPDVSQRLHIDEILSHSWLQPPKPKATSSAS
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CCDS45 RVLRGKYRIPF----YMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLEQIMKDRWINAGHEEDELKPF
270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]