Result of FASTA (omim) for
pFN21AB8709
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8709, 405 aa
1>>>pF1KB8709 405 - 405 aa - 405 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9053+/-0.000556; mu= 13.1187+/- 0.034
mean_var=66.2855+/-13.352, 0's: 0 Z-trim(106.8): 134 B-trim: 188 in 1/49
Lambda= 0.157531
statistics sampled from 14756 (14895) to 14756 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.511), E-opt: 0.2 (0.175), width: 16
Scan time: 7.830
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001747 (OMIM: 122500,611489) corticosteroid-bin ( 405) 2630 607.4 2.1e-173
NP_001076 (OMIM: 107280) alpha-1-antichymotrypsin ( 423) 1108 261.5 2.9e-69
NP_006206 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 2 pre ( 427) 1077 254.4 3.8e-67
NP_001275962 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 2 ( 427) 1077 254.4 3.8e-67
NP_001275961 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 1 ( 464) 1077 254.4 4.1e-67
NP_001121174 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1047 247.6 4.2e-65
NP_001002235 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1047 247.6 4.2e-65
NP_001121172 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1047 247.6 4.2e-65
NP_001121178 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1047 247.6 4.2e-65
XP_016876859 (OMIM: 107400,606963,613490) PREDICTE ( 418) 1047 247.6 4.2e-65
NP_000286 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1-ant ( 418) 1047 247.6 4.2e-65
NP_001121176 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1047 247.6 4.2e-65
NP_001121173 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1047 247.6 4.2e-65
NP_001121179 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1047 247.6 4.2e-65
NP_001121177 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1047 247.6 4.2e-65
NP_001121175 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1047 247.6 4.2e-65
NP_001002236 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 1047 247.6 4.2e-65
NP_000615 (OMIM: 601841) plasma serine protease in ( 406) 1026 242.8 1.1e-63
XP_011535016 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 417) 1015 240.3 6.6e-63
XP_011535017 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 417) 1015 240.3 6.6e-63
NP_783866 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform A [Homo ( 435) 1015 240.3 6.8e-63
NP_000345 (OMIM: 300932,314200) thyroxine-binding ( 415) 1004 237.8 3.7e-62
NP_001271204 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform C [H ( 399) 974 231.0 4e-60
NP_006211 (OMIM: 107410) putative alpha-1-antitryp ( 421) 920 218.7 2.1e-56
XP_005262237 (OMIM: 300932,314200) PREDICTED: thyr ( 371) 893 212.6 1.3e-54
XP_006724746 (OMIM: 300932,314200) PREDICTED: thyr ( 425) 887 211.2 3.8e-54
XP_011535019 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 337) 878 209.2 1.3e-53
XP_011535018 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 337) 878 209.2 1.3e-53
NP_001271205 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform D [H ( 286) 717 172.6 1.1e-42
XP_005249241 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 376) 656 158.7 2.2e-38
NP_004146 (OMIM: 601799) serpin B9 [Homo sapiens] ( 376) 656 158.7 2.2e-38
NP_001284628 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 655 158.5 2.5e-38
NP_001258754 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 655 158.5 2.5e-38
NP_004559 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isoform ( 376) 655 158.5 2.5e-38
XP_011512976 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376) 655 158.5 2.5e-38
NP_001284629 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 655 158.5 2.5e-38
XP_011512975 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376) 655 158.5 2.5e-38
NP_001258753 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 655 158.5 2.5e-38
XP_016866429 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 380) 655 158.5 2.6e-38
NP_001182220 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 380) 655 158.5 2.6e-38
NP_001258751 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 390) 655 158.5 2.6e-38
NP_001258752 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 395) 655 158.5 2.7e-38
XP_011512974 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 454) 655 158.5 3e-38
XP_005267790 (OMIM: 605271) PREDICTED: protein Z-d ( 444) 653 158.1 4.1e-38
NP_057270 (OMIM: 605271) protein Z-dependent prote ( 444) 653 158.1 4.1e-38
NP_001094077 (OMIM: 605271) protein Z-dependent pr ( 444) 653 158.1 4.1e-38
XP_016876842 (OMIM: 605271) PREDICTED: protein Z-d ( 484) 653 158.1 4.4e-38
NP_000176 (OMIM: 142360,612356) heparin cofactor 2 ( 499) 636 154.2 6.6e-37
NP_001035983 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform B [H ( 335) 629 152.6 1.4e-36
NP_006208 (OMIM: 605587) serpin I2 isoform 2 precu ( 405) 615 149.4 1.5e-35
>>NP_001747 (OMIM: 122500,611489) corticosteroid-binding (405 aa)
initn: 2630 init1: 2630 opt: 2630 Z-score: 3234.3 bits: 607.4 E(85289): 2.1e-173
Smith-Waterman score: 2630; 100.0% identity (100.0% similar) in 405 aa overlap (1-405:1-405)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPLLLYTCLLWLPTSGLWTVQAMDPNAAYVNMSNHHRGLASANVDFAFSLYKHLVALSPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPLLLYTCLLWLPTSGLWTVQAMDPNAAYVNMSNHHRGLASANVDFAFSLYKHLVALSPK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KNIFISPVSISMALAMLSLGTCGHTRAQLLQGLGFNLTERSETEIHQGFQHLHQLFAKSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNIFISPVSISMALAMLSLGTCGHTRAQLLQGLGFNLTERSETEIHQGFQHLHQLFAKSD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 TSLEMTMGNALFLDGSLELLESFSADIKHYYESEVLAMNFQDWATASRQINSYVKNKTQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSLEMTMGNALFLDGSLELLESFSADIKHYYESEVLAMNFQDWATASRQINSYVKNKTQG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 KIVDLFSGLDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLASTREENFYVDETTVVKVPMMLQSSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KIVDLFSGLDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLASTREENFYVDETTVVKVPMMLQSSTI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SYLHDAELPCQLVQMNYVGNGTVFFILPDKGKMNTVIAALSRDTINRWSAGLTSSQVDLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SYLHDAELPCQLVQMNYVGNGTVFFILPDKGKMNTVIAALSRDTINRWSAGLTSSQVDLY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 IPKVTISGVYDLGDVLEEMGIADLFTNQANFSRITQDAQLKSSKVVHKAVLQLNEEGVDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IPKVTISGVYDLGDVLEEMGIADLFTNQANFSRITQDAQLKSSKVVHKAVLQLNEEGVDT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB8 AGSTGVTLNLTSKPIILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNPV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGSTGVTLNLTSKPIILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNPV
370 380 390 400
>>NP_001076 (OMIM: 107280) alpha-1-antichymotrypsin prec (423 aa)
initn: 1104 init1: 686 opt: 1108 Z-score: 1364.5 bits: 261.5 E(85289): 2.9e-69
Smith-Waterman score: 1108; 48.5% identity (77.2% similar) in 373 aa overlap (38-404:48-420)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 CLLWLPTSGLWTVQAMDPNAAYVNMSNHHRGLASANVDFAFSLYKHLVALSPKKNIFISP
:::::::::::::::.:: .: ::...::
NP_001 CPAVLCHPNSPLDEENLTQENQDRGTHVDLGLASANVDFAFSLYKQLVLKAPDKNVIFSP
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70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VSISMALAMLSLGTCGHTRAQLLQGLGFNLTERSETEIHQGFQHLHQLFAKSDTSLEMTM
.::: :::.::::. . : ...:.:: ::::: ::.::::.:::: . . .:. :...:
NP_001 LSISTALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFNLTETSEAEIHQSFQHLLRTLNQSSDELQLSM
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GNALFLDGSLELLESFSADIKHYYESEVLAMNFQDWATASRQINSYVKNKTQGKIVDLFS
:::.:. .: ::. :. : :. : ::..: .::: :.:.. ::.:::: :.:::.::..
NP_001 GNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAKKLINDYVKNGTRGKITDLIK
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190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GLDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLASTREENFYVDETTVVKVPMM-LQSSTISYLHDA
::: ...:::::::::. : .::: .:.. ::... : :::: :. :: :..:
NP_001 DLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSRFYLSKKKWVMVPMMSLHHLTIPYFRDE
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ELPCQLVQMNYVGNGTVFFILPDKGKMNTVIAALSRDTINRWSAGLTSSQV-DLYIPKVT
:: : .:...:.::....:::::. ::. : : : .:..:: .: .. .::.:: .
NP_001 ELSCTVVELKYTGNASALFILPDQDKMEEVEAMLLPETLKRWRDSLEFREIGELYLPKFS
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ISGVYDLGDVLEEMGIADLFTNQANFSRITQDAQLKSSKVVHKAVLQLNEEGVDTAGSTG
:: :.:.:.: ..:: . ::..:..: :: .: :.:::::::.. :::......:.
NP_001 ISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLAVSQVVHKAVLDVFEEGTEASAATA
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370 380 390 400
pF1KB8 VTLNLTSKPI----ILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNPV
: ..: : . :.:::.::...: : . .:...: ::
NP_001 VKITLLSALVETRTIVRFNRPFLMIIVPTDTQNIFFMSKVTNPKQA
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>>NP_006206 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 2 precurs (427 aa)
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Smith-Waterman score: 1077; 45.2% identity (76.5% similar) in 374 aa overlap (39-404:51-424)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 LLWLPTSGLWTVQAMDPNAAYVNMSNHHRGLASANVDFAFSLYKHLVALSPKKNIFISPV
.: ::.:::: .: ... .: ::::.::.
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pF1KB8 SISMALAMLSLGTCGHTRAQLLQGLGFNLTERSETEIHQGFQHLHQLFAKSDTSLEMTMG
::: : ::::::.:.:.:.:.:.:::::::: ::...:.::::: . . .:: .:
NP_006 SISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHRGFQHLLHTLNLPGHGLETRVG
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pF1KB8 NALFLDGSLELLESFSADIKHYYESEVLAMNFQDWATASRQINSYVKNKTQGKIVDLFSG
.::::. .:..: .: : ::.... :: : . . . ::..::..:.:::::: :
NP_006 SALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTIQLINDHVKKETRGKIVDLVSE
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pF1KB8 LDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLASTREENFYVDETTVVKVPMMLQSSTIS-YLHDAE
: . ...::::::.::. : .:: . : ..:::::.:.:.::::::.. ::::
NP_006 LKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPKDFYVDENTTVRVPMMLQDQEHHWYLHDRY
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250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LPCQLVQMNYVGNGTVFFILPDKGKMNTVIAALSRDTINRWSAGLTS----SQVDLYIPK
:::....:.: :..:::::::..::: . .:. . . ::. : . ....:..::
NP_006 LPCSVLRMDYKGDATVFFILPNQGKMREIEEVLTPEMLMRWNNLLRKRNFYKKLELHLPK
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310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VTISGVYDLGDVLEEMGIADLFTNQANFSRITQDAQLKSSKVVHKAVLQLNEEGVDTAGS
.::: : : ..: ..:..:::.. :..: ::.. .:..:: :::.:...: :...:..
NP_006 FSISGSYVLDQILPRLGFTDLFSKWADLSGITKQQKLEASKSFHKATLDVDEAGTEAAAA
330 340 350 360 370 380
370 380 390 400
pF1KB8 TGVTLNLTSKPI---ILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNPV
:. .... : :::::.::...::. : : :::..:..:
NP_006 TSFAIKFFSAQTNRHILRFNRPFLVVIFSTSTQSVLFLGKVVDPTKP
390 400 410 420
>>NP_001275962 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 2 prec (427 aa)
initn: 913 init1: 649 opt: 1077 Z-score: 1326.4 bits: 254.4 E(85289): 3.8e-67
Smith-Waterman score: 1077; 45.2% identity (76.5% similar) in 374 aa overlap (39-404:51-424)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 LLWLPTSGLWTVQAMDPNAAYVNMSNHHRGLASANVDFAFSLYKHLVALSPKKNIFISPV
.: ::.:::: .: ... .: ::::.::.
NP_001 QLHVEHDGESCSNSSHQQILETGEGSPSLKIAPANADFAFRFYYLIASETPGKNIFFSPL
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70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SISMALAMLSLGTCGHTRAQLLQGLGFNLTERSETEIHQGFQHLHQLFAKSDTSLEMTMG
::: : ::::::.:.:.:.:.:.:::::::: ::...:.::::: . . .:: .:
NP_001 SISAAYAMLSLGACSHSRSQILEGLGFNLTELSESDVHRGFQHLLHTLNLPGHGLETRVG
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 NALFLDGSLELLESFSADIKHYYESEVLAMNFQDWATASRQINSYVKNKTQGKIVDLFSG
.::::. .:..: .: : ::.... :: : . . . ::..::..:.:::::: :
NP_001 SALFLSHNLKFLAKFLNDTMAVYEAKLFHTNFYDTVGTIQLINDHVKKETRGKIVDLVSE
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190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLASTREENFYVDETTVVKVPMMLQSSTIS-YLHDAE
: . ...::::::.::. : .:: . : ..:::::.:.:.::::::.. ::::
NP_001 LKKDVLMVLVNYIYFKALWEKPFISSRTTPKDFYVDENTTVRVPMMLQDQEHHWYLHDRY
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LPCQLVQMNYVGNGTVFFILPDKGKMNTVIAALSRDTINRWSAGLTS----SQVDLYIPK
:::....:.: :..:::::::..::: . .:. . . ::. : . ....:..::
NP_001 LPCSVLRMDYKGDATVFFILPNQGKMREIEEVLTPEMLMRWNNLLRKRNFYKKLELHLPK
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VTISGVYDLGDVLEEMGIADLFTNQANFSRITQDAQLKSSKVVHKAVLQLNEEGVDTAGS
.::: : : ..: ..:..:::.. :..: ::.. .:..:: :::.:...: :...:..
NP_001 FSISGSYVLDQILPRLGFTDLFSKWADLSGITKQQKLEASKSFHKATLDVDEAGTEAAAA
330 340 350 360 370 380
370 380 390 400
pF1KB8 TGVTLNLTSKPI---ILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNPV
:. .... : :::::.::...::. : : :::..:..:
NP_001 TSFAIKFFSAQTNRHILRFNRPFLVVIFSTSTQSVLFLGKVVDPTKP
390 400 410 420
>>NP_001275961 (OMIM: 147935) kallistatin isoform 1 [Hom (464 aa)
initn: 913 init1: 649 opt: 1077 Z-score: 1325.8 bits: 254.4 E(85289): 4.1e-67
Smith-Waterman score: 1077; 45.2% identity (76.5% similar) in 374 aa overlap (39-404:88-461)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 LLWLPTSGLWTVQAMDPNAAYVNMSNHHRGLASANVDFAFSLYKHLVALSPKKNIFISPV
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]