Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7896
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7896, 658 aa
1>>>pF1KB7896 658 - 658 aa - 658 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4176+/-0.00233; mu= 16.5569+/- 0.141
mean_var=285.3164+/-52.310, 0's: 0 Z-trim(103.8): 994 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.075930
statistics sampled from 6517 (7595) to 6517 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.533), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 2.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 4692 529.3 6.7e-150
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 4418 499.2 7e-141
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 4126 467.3 3.1e-131
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 4126 467.3 3.2e-131
CCDS54330.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 390) 2583 297.8 1.8e-80
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2284 265.5 1.7e-70
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 2260 262.9 1.1e-69
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 2231 259.7 9.5e-69
CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 2230 259.5 1e-68
CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 659) 2230 259.6 1e-68
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 2227 259.3 1.3e-68
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 2204 257.1 9.4e-68
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 2185 254.7 3.2e-67
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 2179 254.0 5e-67
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 2180 254.3 5.2e-67
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 2180 254.3 5.2e-67
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 2158 251.8 2.7e-66
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 2158 251.8 2.7e-66
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 2151 251.0 4.4e-66
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 2149 251.0 6.1e-66
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 2149 251.1 6.2e-66
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 2135 249.0 1.3e-65
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 2135 249.2 1.4e-65
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 2117 247.1 5.3e-65
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 2108 246.4 1.2e-64
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 2108 246.4 1.2e-64
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 2105 246.1 1.6e-64
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 2101 245.6 2e-64
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 2099 245.2 2.1e-64
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 2099 245.2 2.1e-64
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 2099 245.3 2.2e-64
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 2099 245.4 2.4e-64
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 2099 245.4 2.4e-64
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 2099 245.4 2.4e-64
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 2099 245.4 2.4e-64
CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 2090 244.2 4.2e-64
CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 659) 2087 243.9 5.4e-64
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 2090 244.6 5.6e-64
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 2090 244.7 5.7e-64
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 2080 242.9 7.7e-64
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 2080 243.0 8.6e-64
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 2080 243.1 8.8e-64
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 2080 243.1 9e-64
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 2075 242.6 1.4e-63
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 2075 242.7 1.5e-63
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 2075 242.7 1.5e-63
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 2075 242.7 1.5e-63
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 2071 242.2 1.9e-63
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 2059 240.8 4.4e-63
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 2059 240.8 4.5e-63
>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
initn: 4692 init1: 4692 opt: 4692 Z-score: 2804.7 bits: 529.3 E(32554): 6.7e-150
Smith-Waterman score: 4692; 99.8% identity (99.8% similar) in 658 aa overlap (1-658:1-658)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVDFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKP
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 NVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYEC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 KAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 QSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 LTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 QRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KB7 TGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
610 620 630 640 650
>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
initn: 4418 init1: 4418 opt: 4418 Z-score: 2642.7 bits: 499.2 E(32554): 7e-141
Smith-Waterman score: 4418; 100.0% identity (100.0% similar) in 616 aa overlap (43-658:1-616)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 QVTFEDVVVDFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAEL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MLDTFRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAEL
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 WAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 WAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGH
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 WEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 WEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGT
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 RGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFR
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 NSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSS
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 FSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKH
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 QRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIH
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 TGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEK
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 PYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYEC
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 NQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCG
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650
pF1KB7 KSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
580 590 600 610
>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (670 aa)
initn: 4126 init1: 4126 opt: 4126 Z-score: 2469.5 bits: 467.3 E(32554): 3.1e-131
Smith-Waterman score: 4658; 98.1% identity (98.1% similar) in 670 aa overlap (1-658:1-670)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVDFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKP
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KB7 NVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYP------------DLETRPKVKLSVLKQGISEEISN
::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
CCDS12 NVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPEIKGHFQFLLLSDLETRPKVKLSVLKQGISEEISN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 SVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGEN
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 ISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSA
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 LIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQH
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 QRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIH
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 TGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEK
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 PYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYEC
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 SQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCG
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 RAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFS
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 HSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSS
610 620 630 640 650 660
650
pF1KB7 LTKHQRTHTG
::::::::::
CCDS12 LTKHQRTHTG
670
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10 20 30 40
pF1KB7 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVDFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFR
:. ... :::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MELGSRRRSVGCRCRGLCLAVRREQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS54 LLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPEIKGHFQFLLLSDLETRPKVKLS
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100 110 120 130 140 150
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPV
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160 170 180 190 200 210
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKC
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCG
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280 290 300 310 320 330
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFR
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340 350 360 370 380 390
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITP
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400 410 420 430 440 450
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQH
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460 470 480 490 500 510
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIH
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520 530 540 550 560 570
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEK
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580 590 600 610 620 630
pF1KB7 PYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYAC
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640 650
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::::::::::::::::::::::
CCDS54 RDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
670 680
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10 20 30 40
pF1KB7 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVDFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFR
:. ... :::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MELGSRRRSVGCRCRGLCLAVRREQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 LLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGEN
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170 180 190 200 210 220
pF1KB7 ISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSA
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 LIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQH
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 QRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIH
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350 360 370 380 390 400
pF1KB7 TGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEK
:::::::::::::::.:::::::::: :::
CCDS54 TGEKPYQCGECGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
370 380 390
>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 (688 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVDFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKP
: :.::..::::::: : ::: :::::::... :::. ::.
CCDS12 MARKLVMFRDVAIDFSQEEWECLDSAQRDLYRDVMLENYSNLVSLD--LPSR
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70 80 90 100
pF1KB7 NVISLL-------EQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRP----KVKLSVLKQGISEEISNS
. . : : : : . .:: . . ..: : :. ... .: . ..
CCDS12 CASKDLSPEKNTYETELSQWEMSDRLENCDLEESNSRDYLEAKGKMEKQQENQKEYFRQG
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 VILVERF-LWDGLWY----CRGEDTEGHWE-WSC-ESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQR
.:. ... ... : : ..:: .. : .... . . ..: . ..
CCDS12 MIIYDKMSIFNQHTYLSQHSRCHSTEKPYKCKECGKAFRRASHLTQHQSIHTGE-KPYEC
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210
pF1KB7 NGFGENISLNPDLP-HQPM-TPERQSPHTWGTRGK--REKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQE
. :. .: . .: :: . : :. :.. :: .. .: . .. . ::::::.:
CCDS12 KQCGKAFSRDSQLSLHQRLHTGEK--PYACKECGKAFTQSSQLILHHRIHTGEKPYKCEE
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 CGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRT
::::: .:: : .:...::::.::::.:: :.: ..: :: :::.::::: :.: .: ..
CCDS12 CGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHTGEKLYECKECRKV
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 FNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQS
:.:.. :: :.: :::::::::.::::.: :..:::.. :.:::::::.:::.:: ..
CCDS12 FTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKPYECKECGRAFIRG
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 IHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLI
: :: :::::::::.: :::::: ..:.::.::::::.::::::.:::: :.. . :
CCDS12 SLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSHGSQLT
350 360 370 380 390 400
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pF1KB7 QHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHER
:::: :::::::.: ::::::....:::.:.::::::::: :.:::::::..: :.::::
CCDS12 QHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGSELTQHER
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pF1KB7 THTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTG
:::::::::..:::.: ....::::::::::::::::..: ::..:: :..:::.:::
CCDS12 IHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRLHTG
470 480 490 500 510 520
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pF1KB7 EKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPY
:::: ::.::.::.. ::::::::::::::.:..::.:: ..: : .:::::: ::::
CCDS12 EKPYVCNECGKAFARGLLLIQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFIRGSQLTQHQRIHTGEKPY
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KB7 GCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRD
:.::::.:::.:.:. :.: :::::::::..: :.: ::.::..:.::::::::: :..
CCDS12 ECKECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYECRECRKAFTQSSHLSRHQRIHTGEKPYQCKE
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640 650
pF1KB7 CGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
::::::..:.::.::: :
CCDS12 CGKAFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKECGIDFSHGSQVYM
650 660 670 680
>>CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 (751 aa)
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10 20 30 40
pF1KB7 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVDFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDT
: :::.::.:::.:::: :: :.:: :.::: :..
CCDS46 MEDLSSPDSTLLQGGHNLLSSASFQEAVTFKDVIVDFTQEEWKQLDPGQRDLFRDVTLEN
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 FRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEI
. :::.: . ::.::: ::: .: : .: .: :. : ::: . ..:. . ::::
CCDS46 YTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEPWIMEPSIPVGTCADWETRLENSVSAPEPDISEEE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 SNSVILVERFLWDGLWYC---RGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRN
. ..::. : : .. . :: : . . ..: . : : :. :
CCDS46 LSPEVIVEKHKRDDSWSSNLLESWEYEGSLERQQANQQTLPKEIKVTEKTIPSWEKGPVN
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200
pF1KB7 G-FGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRG----KREKP--------------DLNVL
. ::...... .: : .::. : . .. :.:: :
CCDS46 NEFGKSVNVSSNLVTQEPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRH
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 QKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIH
:.: . ::::::.:: ::::.: ::.:.: :::..::.: .: ::: .. .::.:::::
CCDS46 QRTHTGEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIH
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 TGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEK
:::::::: .::..:.: . :.:::: ::::::: :.::::.:: :. : .:.. :::::
CCDS46 TGEKPYKCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEK
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 PYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYEC
:..:.:: :.: .: ::::: .:::::: :.:.::::::. :.. .:. ::::::::::
CCDS46 PFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYEC
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 HECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECG
.::::::.: . : :::.::::::::.:.::::.:: . :..: .:::::::: :::::
CCDS46 NECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECG
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 KTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFS
:.::. :::.::.: :: :::.:::.::::: ..:.:::. :: :: :::..:::::
CCDS46 KAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFI
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 HSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSL
.::::.::.:::::::::.:..::..:: . ::::..:::::.::.::.:::::.:.
CCDS46 RSSSLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSYGSSLIQHRKIHTGERPYKCNECGRAFNQNIH
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KB7 LIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQH
: .:.:::: ::: : ::::.: : :::.::..::: ::::.:. : :.: ::.:::::
CCDS46 LTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQH
610 620 630 640 650 660
630 640 650
pF1KB7 RRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
.::::::::: : .: :::..:. ::.:: ::::
CCDS46 QRIHTGEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIH
670 680 690 700 710 720
CCDS46 SGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
730 740 750
>>CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 (648 aa)
initn: 2080 init1: 2080 opt: 2231 Z-score: 1347.7 bits: 259.7 E(32554): 9.5e-69
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVDFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKP
: :::.::...:: ::: : :::..:::::::...: :::.: . .:
CCDS75 MELVTFRDVAIEFSPEEWKCLDPAQQNLYRDVMLENYRNLVSLGFVISNP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 NVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVIL--VERFLW
.... ::: : .. . . : . . . :: . ::: :. ...:: :.
CCDS75 DLVTCLEQIKEPCNLKIHETAAKPPAICSPFSQDLSPV-QGI-EDSFHKLILKRYEKCGH
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQ
..: .: .. :. ... : . ..: . .: : . .: . ..
CCDS75 ENLQLRKGCKRVNE----CKVQKGVNNGV-YQCLSTTQSKIFQCNTCVKVFSKFSNSNKH
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 PMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVK--EKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTH
. ..: :. . .. :.: .. ::::::..:::::..:..: .:.: :
CCDS75 KIRHTGEKPFKCTECGRSFYMS-HLTQHTGIHAGEKPYKCEKCGKAFNRSTSLSKHKRIH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 TGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEK
:::.:: :.:: :.:: :..:..:..:::::::::: .::..:.. . : .:.. :::::
CCDS75 TGEKPYTCEECGKAFRRSTVLNEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFTRSTTLNEHKKIHTGEK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 PYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQC
::.:.::::.: . .:...:. :::::::.:.::::::::: :..: :::::::: :
CCDS75 PYKCKECGKAFRWSTSLNEHKNIHTGEKPYKCKECGKAFRQSRSLNEHKNIHTGEKPYTC
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 GECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECG
.:::::..:::: :. ::. .: :.:.::::::: . : .:.: ::::::: : :::
CCDS75 EKCGKAFNQSSSLIIHRSIHSEQKLYKCEECGKAFTWSSSLNKHKRIHTGEKPYTCEECG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 KAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFR
::: .:. :..:.::::::::: :.::::.:..::.: :.: :.:.:::.: .:::::
CCDS75 KAFYRSSHLAKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSTLILHKRIHSGQKPYKCEECGKAFT
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 QSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAP
.:: :..:..::::::::.:..::::: :.::..:. ::::::::.:..::.::.: .
CCDS75 RSTTLNEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFIWSASLNEHKNIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSG
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 LIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQH
:: :. ::. .: :.:..::.::..:. : ::..::. :::: :.::::... ::.:..:
CCDS75 LIIHRSIHSEQKLYKCEECGKAFTRSTALNEHKKIHSGEKPYKCKECGKAYNLSSTLTKH
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CCDS12 EEP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]