Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8363
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8363, 503 aa
1>>>pF1KB8363 503 - 503 aa - 503 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5243+/-0.00103; mu= 16.6555+/- 0.061
mean_var=67.1336+/-13.740, 0's: 0 Z-trim(103.4): 69 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.156532
statistics sampled from 7336 (7408) to 7336 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.228), width: 16
Scan time: 2.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10139.1 CYP19A1 gene_id:1588|Hs108|chr15 ( 503) 3319 758.9 0
CCDS33491.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20 ( 514) 348 88.0 2.7e-17
CCDS34119.1 CYP4V2 gene_id:285440|Hs108|chr4 ( 525) 335 85.1 2.1e-16
CCDS33285.1 CYP27C1 gene_id:339761|Hs108|chr2 ( 372) 320 81.6 1.7e-15
CCDS9954.1 CYP46A1 gene_id:10858|Hs108|chr14 ( 500) 307 78.7 1.6e-14
CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 393) 303 77.8 2.5e-14
CCDS5676.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 503) 303 77.8 3.1e-14
CCDS5675.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 ( 504) 293 75.6 1.5e-13
CCDS55123.1 CYP51A1 gene_id:1595|Hs108|chr7 ( 404) 289 74.6 2.3e-13
CCDS5673.1 CYP3A7 gene_id:1551|Hs108|chr7 ( 503) 286 74.0 4.4e-13
CCDS75639.1 CYP3A51P gene_id:100861540|Hs108|chr7 ( 535) 286 74.0 4.7e-13
CCDS7686.1 CYP2E1 gene_id:1571|Hs108|chr10 ( 493) 285 73.8 5.1e-13
CCDS55721.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 ( 388) 282 73.0 6.6e-13
CCDS12569.1 CYP2A7 gene_id:1549|Hs108|chr19 ( 494) 283 73.3 6.9e-13
CCDS73166.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 ( 420) 282 73.0 7.1e-13
CCDS7438.1 CYP2C8 gene_id:1558|Hs108|chr10 ( 490) 282 73.1 8.1e-13
CCDS34047.1 CYP2U1 gene_id:113612|Hs108|chr4 ( 544) 281 72.9 1e-12
CCDS5674.1 CYP3A4 gene_id:1576|Hs108|chr7 ( 503) 280 72.6 1.1e-12
CCDS7818.1 CYP2R1 gene_id:120227|Hs108|chr11 ( 501) 279 72.4 1.3e-12
CCDS5672.1 CYP3A5 gene_id:1577|Hs108|chr7 ( 502) 278 72.2 1.5e-12
CCDS7426.1 CYP26A1 gene_id:1592|Hs108|chr10 ( 497) 273 71.0 3.3e-12
CCDS12568.1 CYP2A6 gene_id:1548|Hs108|chr19 ( 494) 272 70.8 3.9e-12
CCDS7437.1 CYP2C9 gene_id:1559|Hs108|chr10 ( 490) 269 70.1 6.2e-12
CCDS7427.1 CYP26A1 gene_id:1592|Hs108|chr10 ( 428) 268 69.9 6.4e-12
CCDS7436.1 CYP2C19 gene_id:1557|Hs108|chr10 ( 490) 260 68.1 2.5e-11
CCDS7435.1 CYP2C18 gene_id:1562|Hs108|chr10 ( 490) 257 67.4 4e-11
CCDS12570.1 CYP2B6 gene_id:1555|Hs108|chr19 ( 491) 255 67.0 5.5e-11
CCDS33657.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 446) 254 66.7 6e-11
CCDS46721.1 CYP2D6 gene_id:1565|Hs108|chr22 ( 497) 254 66.8 6.5e-11
CCDS44460.1 CYP2C18 gene_id:1562|Hs108|chr10 ( 431) 253 66.5 6.8e-11
CCDS12571.1 CYP2A13 gene_id:1553|Hs108|chr19 ( 494) 253 66.5 7.6e-11
CCDS81318.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 497) 253 66.5 7.6e-11
CCDS542.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 511) 253 66.5 7.8e-11
CCDS41328.1 CYP4B1 gene_id:1580|Hs108|chr1 ( 512) 253 66.5 7.8e-11
>>CCDS10139.1 CYP19A1 gene_id:1588|Hs108|chr15 (503 aa)
initn: 3319 init1: 3319 opt: 3319 Z-score: 4050.0 bits: 758.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3319; 99.4% identity (99.4% similar) in 503 aa overlap (1-503:1-503)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MVLEMLNPIHYNITSIVPEAMPAATMPVLLLTGLFLLVWNYEGTSSIPGPGYCMGIGPLI
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CCDS10 MVLEMLNPIHYNITSIVPEAMPAATMPVLLLTGLFLLVWNYEGTSSIPGPGYCMGIGPLI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SHGRFLWMGIGSACNYYNRVYGEFMRVWISGEGTLIISKSSSMFHIMKHNHYSSRFGSKL
:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SHGRFLWMGIGSACNYYNRVYGEFMRVWISGEETLIISKSSSMFHIMKHNHYSSRFGSKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GLQCIGMHEKGIIFNNNPELWKTTRPFFMKALSGPGLVRMVTVCAESLKTHLDRLEEVTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GLQCIGMHEKGIIFNNNPELWKTTRPFFMKALSGPGLVRMVTVCAESLKTHLDRLEEVTN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ESGYVDVLTLLRRVMLDTSNTLFLRISLDESAIVVKIQGYFDAWQALLIKPDIFFKISWL
:::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ESGYVDVLTLLRRVMLDTSNTLFLRIPLDESAIVVKIQGYFDAWQALLIKPDIFFKISWL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 YKKYEKSVKDLKDAIEVLIAEKRRRISTEEKLEECMDFATELILAEKRGDLTRENVNQCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YKKYEKSVKDLKDAIEVLIAEKRRRISTEEKLEECMDFATELILAEKRGDLTRENVNQCI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LEMLIAAPDTMSVSLFFMLFLIAKHPNVEEAIIKEIQTVIGERDIKIDDIQKLKVMENFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LEMLIAAPDTMSVSLFFMLFLIAKHPNVEEAIIKEIQTVIGERDIKIDDIQKLKVMENFI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 YESMRYQPVVDLVMRKALEDDVIDGYPVKKGTNIILNIGRMHRLEFFPKPNEFTLENFAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YESMRYQPVVDLVMRKALEDDVIDGYPVKKGTNIILNIGRMHRLEFFPKPNEFTLENFAK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 NVPYRYFQPFGFGPRGCAGKYIAMVMMKAILVTLLRRFHVKTLQGQCVESIQKIHDSSLH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS10 NVPYRYFQPFGFGPRGCAGKYIAMVMMKAILVTLLRRFHVKTLQGQCVESIQKIHDLSLH
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KB8 PDETKNMLEMIFTPRNSDRCLEH
:::::::::::::::::::::::
CCDS10 PDETKNMLEMIFTPRNSDRCLEH
490 500
>>CCDS33491.1 CYP24A1 gene_id:1591|Hs108|chr20 (514 aa)
initn: 258 init1: 98 opt: 348 Z-score: 423.9 bits: 88.0 E(32554): 2.7e-17
Smith-Waterman score: 364; 21.2% identity (56.9% similar) in 480 aa overlap (42-495:53-514)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 NITSIVPEAMPAATMPVLLLTGLFLLVWNYEGTSSIPGPGYCMGIGPLISHGRFLWMGIG
......::: .: :. ..:: : :
CCDS33 QPPRLVTSTAYTSPQPREVPVCPLTAGGETQNAAALPGPTSWPLLGSLL---QILWKG-G
30 40 50 60 70
80 90 100 110 120
pF1KB8 SACNY-----YNRVYGEFMRVWISGEGTLIISKSSSMFHIMK-HNHYSSRFGSKLGLQCI
.. :.. ::...:. ... .. ... . ... .. : .:. :
CCDS33 LKKQHDTLVEYHKKYGKIFRMKLGSFESVHLGSPCLLEALYRTESAYPQRLEIKPWKAYR
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GMHEKGI-IFNNNPELWKTTRPFFMKALSGPGLV-RMVTVCAESLKTHLDRLEEVTNESG
....: .. . : :. .: :.: : :: : .. . : : . :..:. .: :
CCDS33 DYRKEGYGLLILEGEDWQRVRSAFQKKLMKPGEVMKLDNKINEVLADFMGRIDELCDERG
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230
pF1KB8 YV-DVLTLLRR--------VMLDTSNTLFLRISLDESA-IVVKIQGYFDAWQALLIKPDI
.: :. . : . :. . :. . . ::.. ... :. ..... ... :
CCDS33 HVEDLYSELNKWSFESICLVLYEKRFGLLQKNAGDEAVNFIMAIKTMMSTFGRMMVTPVE
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 FFKI--SWLYKKYEKSVKDLKDAIEVLIAEKRRRISTEEKLEECMDFATELILAEKRGDL
. : . ... . . . .... : .. .. : . . :: . : ..: :
CCDS33 LHKSLNTKVWQDHTLAWDTIFKSVKACIDNRLEKYSQQPS----ADFLCD-IYHQNR--L
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TRENVNQCILEMLIAAPDTMSVSLFFMLFLIAKHPNVEEAIIKEIQTVIGERDI-KIDDI
..... . :. .:: .: . ::...:. ....:.:.. ..::::.:. : .. . .:.
CCDS33 SKKELYAAVTELQLAAVETTANSLMWILYNLSRNPQVQQKLLKEIQSVLPENQVPRAEDL
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400
pF1KB8 QKLKVMENFIYESMRYQPVVDLVMRKALEDDVIDGYPVKKGTNIILNIGRMHRLE-FFPK
... .. . :::: : : .. : . :. : . ::: ..:: . : :
CCDS33 RNMPYLKACLKESMRLTPSVPFTTRTLDKATVLGEYALPKGTVLMLNTQVLGSSEDNFED
380 390 400 410 420 430
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 PNEFT----LENFAKNVPYRYFQPFGFGPRGCAGKYIAMVMMKAILVTLLRRFHVKTLQG
..: :.. : :. .. ::: : : : :. .: .... : ..:.. ... ..
CCDS33 SSQFRPERWLQEKEKINPFAHL-PFGVGKRMCIGRRLAELQLHLALCWIVRKYDIQATDN
440 450 460 470 480 490
470 480 490 500
pF1KB8 QCVESIQKIHDSSLHPDETKNMLEMIFTPRNSDRCLEH
: .. .:...: :.. : . : :
CCDS33 ---EPVEMLHSGTLVPSRE---LPIAFCQR
500 510
>>CCDS34119.1 CYP4V2 gene_id:285440|Hs108|chr4 (525 aa)
initn: 227 init1: 105 opt: 335 Z-score: 407.8 bits: 85.1 E(32554): 2.1e-16
Smith-Waterman score: 343; 29.0% identity (62.4% similar) in 255 aa overlap (233-464:246-494)
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 FLRISLDESAIVVKIQGYFDAWQALLIKPDIFFKISWLYKKYEKSVKDLKDAIEVLIAEK
..:: .: .:: :.. :. . .:::.
CCDS34 DSEYVRAVYRMSEMIFRRIKMPWLWLDLWYLMFKEGWEHKK---SLQILHTFTNSVIAER
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300
pF1KB8 RRRISTEE--------------KLEECMDFATELILAEKRGD-LTRENVNQCILEMLIAA
.....: : . .:. : ... .:. :..:.. . . ... .
CCDS34 ANEMNANEDCRGDGRGSAPSKNKRRAFLDLL--LSVTDDEGNRLSHEDIREEVDTFMFEG
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 PDTMSVSLFFMLFLIAKHPNVEEAIIKEIQTVIGERD--IKIDDIQKLKVMENFIYESMR
:: .... . :.:....:.:.. . .:.. :.:. : ..:..::. .: : :..:
CCDS34 HDTTAAAINWSLYLLGSNPEVQKKVDHELDDVFGKSDRPATVEDLKKLRYLECVIKETLR
340 350 360 370 380 390
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 YQPVVDLVMRKALEDDVIDGYPVKKGTNIILNIGRMHRL-EFFPKPNEFTLENF-AKNV-
: : : :.. :: . :: : :::. .. .:: ..::.:.:: : : .:.
CCDS34 LFPSVPLFARSVSEDCEVAGYRVLKGTEAVIIPYALHRDPRYFPNPEEFQPERFFPENAQ
400 410 420 430 440 450
430 440 450 460 470
pF1KB8 ---PYRYFQPFGFGPRGCAGKYIAMVMMKAILVTLLRRFHVKTLQGQCVESIQKIHDSSL
:: : ::. :::.: :. .:.. :.:: .::.: ... :
CCDS34 GRHPYAYV-PFSAGPRNCIGQKFAVMEEKTILSCILRHFWIESNQKREELGLEGQLILRP
460 470 480 490 500
480 490 500
pF1KB8 HPDETKNMLEMIFTPRNSDRCLEH
CCDS34 SNGIWIKLKRRNADER
510 520
>>CCDS33285.1 CYP27C1 gene_id:339761|Hs108|chr2 (372 aa)
initn: 284 init1: 138 opt: 320 Z-score: 391.9 bits: 81.6 E(32554): 1.7e-15
Smith-Waterman score: 330; 29.8% identity (58.4% similar) in 255 aa overlap (219-462:102-343)
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TLLRRVMLDTSNTLFLRISLDESAIVVKIQGYFDAW-QALLIKPDIFFKISW--LYKKYE
: . : . .. :: : :: :.: .
CCDS33 CLENSIPQLTVEYIEALELMFSMFKTSMYAGAIPRWLRPFIPKPWREFCRSWDGLFKFSQ
80 90 100 110 120 130
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KSVKD-LKDAIEVLIAEKRRRISTEEKLEECMDFATELILAEKRGDLTRENVNQCILEML
: . :.: :. . .. ::.: . : :.:.. :: ... . :::
CCDS33 IHVDNKLRD-IQYQM-DRGRRVSG--------GLLTYLFLSQA---LTLQEIYANVTEML
140 150 160 170
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 IAAPDTMSVSLFFMLFLIAKHPNVEEAIIKEIQTVIGERDIKID-DIQKLKVMENFIYES
.:. :: : .: . ..:.:.::.:.... .:: .::: . :. :. ... .. :.
CCDS33 LAGVDTTSFTLSWTVYLLARHPEVQQTVYREIVKNLGERHVPTAADVPKVPLVRALLKET
180 190 200 210 220 230
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 MRYQPVVDLVMRKALEDDVIDGYPVKKGTNIIL-NIGRMHRLEFFPKPNEFTLENFAKNV
.: ::. : . :: :: :: . :::.. : . . .. : ::. .:: : . ..
CCDS33 LRLFPVLPGNGRVTQEDLVIGGYLIPKGTQLALCHYATSYQDENFPRAKEFRPERWLRKG
240 250 260 270 280 290
430 440 450 460 470
pF1KB8 PYRYFQ-----PFGFGPRGCAGKYIAMVMMKAILVTLLRRFHVKTLQGQCVESIQKIHDS
. ::: : :.: :. :: . .. ... ::..:..::
CCDS33 DLDRVDNFGSIPFGHGVRSCIGRRIAELEIHLVVIQLLQHFEIKTSSQTNAVHAKTHGLL
300 310 320 330 340 350
480 490 500
pF1KB8 SLHPDETKNMLEMIFTPRNSDRCLEH
CCDS33 TPGGPIHVRFVNRK
360 370
>>CCDS9954.1 CYP46A1 gene_id:10858|Hs108|chr14 (500 aa)
initn: 168 init1: 109 opt: 307 Z-score: 374.0 bits: 78.7 E(32554): 1.6e-14
Smith-Waterman score: 341; 21.5% identity (57.5% similar) in 447 aa overlap (41-466:30-466)
20 30 40 50 60
pF1KB8 YNITSIVPEAMPAATMPVLLLTGLFLLVWNYEGTSSIPGPGYCMGIGPLISH-----GRF
:: . : :.. .: : . . ::
CCDS99 MSPGLLLLGSAVLLAFGLCCTFVHRARSRYEHIPGPPRPSFLLGHLPCFWKKDEVGGRV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LWMGIGSACNYYNRVYGEFMRVWISGEGTLIISKSSSMFHIMKHNHYSSRFGSKLGLQCI
: .. . . :: .:: . . ..:... :. ... ..:.. .:: .
CCDS99 LQ----DVFLDWAKKYGPVVRVNVFHKTSVIVTSPESVKKFLMSTKYNKDSKMYRALQTV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 -G--MHEKGIIFNNNPELWKTTRPFFMKALSGPGLVRMVTVCAESLKTHLDRLEEVTNES
: . .:.. . : : :. : . :.: .:: .. . :. . .. :: .. .
CCDS99 FGERLFGQGLVSECNYERWHKQRRVIDLAFSRSSLVSLMETFNEKAEQLVEILEAKADGQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB8 GYVDVLTLLRRVMLDTSNTLFLRISLD-ESAIVVKIQGYFDAWQALLIKPDIFFK--ISW
:.. .: . .: .. . .. :..... : .. :... . ..
CCDS99 TPVSMQDMLTYTAMD----ILAKAAFGMETSMLLGAQKPLSQAVKLMLEGITASRNTLAK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 LYKKYEKSVKDLKDAIEVL--IAE---KRRRISTEEKLEECMDFATELILAEKRGDLTRE
. .:........:. : ... .::: . .. : :. :... ::. : :
CCDS99 FLPGKRKQLREVRESIRFLRQVGRDWVQRRREALKRGEEVPADILTQILKAEE-GAQDDE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 NVNQCILEMLIAAPDTMSVSLFFMLFLIAKHPNVEEAIIKEIQTVIG-ERDIKIDDIQKL
.. . .. ..::. .: . : : .. ....:.. . :.. ::: .: . ..:. .:
CCDS99 GLLDNFVTFFIAGHETSANHLAFTVMELSRQPEIVARLQAEVDEVIGSKRYLDFEDLGRL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 KVMENFIYESMRYQPVVDLVMRKALEDDVIDGYPVKKGTNIILNIGRMHRLE-FFPKPNE
. . . . ::.: : . ..: :. .::: : .: .... : :.. .: :
CCDS99 QYLSQVLKESLRLYPPAWGTFRLLEEETLIDGVRVPGNTPLLFSTYVMGRMDTYFEDPLT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KB8 FTLENFAKNVP---YRYFQPFGFGPRGCAGKYIAMVMMKAILVTLLRRFHVKTLQGQCVE
:. . :. ..: . :: ::..: :.: :. .:.. .:.... ::.:.. . . ::
CCDS99 FNPDRFGPGAPKPRFTYF-PFSLGHRSCIGQQFAQMEVKVVMAKLLQRLEFRLVPGQRFG
420 430 440 450 460
470 480 490 500
pF1KB8 SIQKIHDSSLHPDETKNMLEMIFTPRNSDRCLEH
CCDS99 LQEQATLKPLDPVLCTLRPRGWQPAPPPPPC
470 480 490 500
>>CCDS64723.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 (393 aa)
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.: .. :. : :
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.: .. :. : :
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>>CCDS5675.1 CYP3A43 gene_id:64816|Hs108|chr7 (504 aa)
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10 20 30 40 50
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.: .: . .:.. :.. :: : ::::
CCDS56 MDLIPNFAMETWVLVATSLVLLYIYGTHSHKLFKKLGIPGPTP
10 20 30 40
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.: .. . : :: .. :: . :::. .. . . :.: . . .. .. :
CCDS56 LPFLGTILFYLRGLW-NFDRECN---EKYGEMWGLYEGQQPMLVIMDPDMIKTVLVKECY
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CCDS56 RSLRQEAENSKSINLKDFFGAYTMDVITGTLFGVNLDSLNNPQDPFLKNMKKLLKLDFLD
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.:. ..: .. ... . :.: ::..:: . :. :.. ..: . .::
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CCDS56 QEEIDAVLPNKAPVTYDALVQMEYLDMVVNETLRLFPVVSRVTRVCKKDIEINGVFIPKG
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... : .:. ... .:..: :. :.:. :::. ::: :::.: : .:.
CCDS56 LAVMVPIYALHHDPKYWTEPEKFCPESRFSKKNKDSIDLYRYI-PFGAGPRNCIGMRFAL
400 410 420 430 440 450
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. .: .. :. : :
CCDS56 TNIKLAVIRALQNFSFKPCKETQIPLKLDNLPILQPEKPIVLKVHLRDGITSGP
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CCDS55 HVSIIEKETKEYF----ESWGESGEKNVFEALSELIILTASHCLHGKEIRSQLNEKVAQL
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. ..: :. :: :: : .:: ... ... ...:: . : .:::.
CCDS55 YADLDGGFSHAAW--LL--P------GWLPLPSFRRRDRAHREIKDIFYKAI-QKRRQ--
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CCDS55 SQEKIDDILQTLLDATYKDGR-PLTDDEVAGMLIGLLLAGQHTSSTTSAWMGFFLARDKT
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CCDS55 LQKKCYLEQKTVCGENLPPLTYDQLKDLNLLDRCIKETLRLRPPIMIMMRMARTPQTVAG
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CCDS55 YTIPPGHQVCVSPTVNQRLKDSWVERLDF--NPDRYLQDNPASGEKFAYV-PFGAGRHRC
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:. .:.:..:.: :.:: .. ..:
CCDS55 IGENFAYVQIKTIWSTMLRLYEFDLIDGYFPTVNYTTMIHTPENPVIRYKRRSK
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10 20 30 40 50
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.: .. . :: .. :.. :: . ::::
CCDS56 MDLIPNLAVETWLLLAVSLILLYLYGTRTHGLFKKLGIPGPTP
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.: .: . : . : . : .:.: .. . : :. . . .. ..
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:: : .. . .:. ...: . .. : :: : .. .... : .:: . :.
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.:. . . . :: . . .::.: : .:. :. .::.. :
CCDS56 VRNLRREAETGKPVTLKHVFGAYSMDVITSTSFGVSIDSLNNPQDPFVENTKKLLRFNPL
160 170 180 190 200 210
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CCDS56 PDVQQKVQKEIDTVLPNKAPPTYDTVLQLEYLDMVVNETLRLFPVAMRLERVCKKDVEIN
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CCDS56 GMFIPKGVVVMIPSYVLHHDPKYWTEPEKFLPERFSKKNKDNIDPYIY-TPFGSGPRNCI
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CCDS56 GMRFALVNMKLALVRVLQNFSFKPCKETQIPLKLRFGGLLLTEKPIVLKAESRDETVSGA
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503 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]