Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8345
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8345, 628 aa
1>>>pF1KB8345 628 - 628 aa - 628 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4814+/-0.00241; mu= 21.9210+/- 0.145
mean_var=312.6688+/-58.534, 0's: 0 Z-trim(103.0): 965 B-trim: 49 in 1/48
Lambda= 0.072532
statistics sampled from 6155 (7214) to 6155 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.528), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 3.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12096.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 ( 628) 4484 484.8 1.5e-136
CCDS59329.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 ( 627) 4467 483.0 5e-136
CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 ( 576) 2074 232.6 1.2e-60
CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 2056 230.8 4.5e-60
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 2027 227.7 3.7e-59
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 1970 221.8 2.3e-57
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1956 220.3 6.2e-57
CCDS77240.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 638) 1922 216.7 7.4e-56
CCDS45983.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 673) 1922 216.8 7.6e-56
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1902 214.6 3.1e-55
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1858 210.1 7.9e-54
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1848 209.0 1.6e-53
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1848 209.0 1.6e-53
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1848 209.1 1.6e-53
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1839 207.9 2.8e-53
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1839 208.1 3.1e-53
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1837 207.9 3.6e-53
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1836 207.7 3.7e-53
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1828 206.9 6.7e-53
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1828 206.9 6.9e-53
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1828 207.0 6.9e-53
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1824 206.5 9e-53
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1818 205.8 1.4e-52
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 1803 204.6 4.7e-52
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 1804 205.0 5e-52
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1800 204.4 6.3e-52
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1787 202.9 1.5e-51
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1787 202.9 1.5e-51
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1787 203.1 1.7e-51
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1787 203.2 1.7e-51
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1782 202.5 2.3e-51
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1782 202.6 2.4e-51
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1775 201.5 3.4e-51
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1775 201.6 3.5e-51
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 742) 1774 201.4 3.6e-51
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 745) 1774 201.4 3.6e-51
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1774 201.5 3.7e-51
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1774 201.5 3.7e-51
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1774 201.5 3.8e-51
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1771 201.1 4.5e-51
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1766 200.4 6.1e-51
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1765 200.3 6.6e-51
CCDS33046.1 ZNF224 gene_id:7767|Hs108|chr19 ( 707) 1757 199.6 1.2e-50
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1753 199.3 1.7e-50
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1753 199.3 1.7e-50
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1751 198.9 1.8e-50
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 1748 198.4 2.1e-50
CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19 ( 803) 1743 198.2 3.5e-50
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 1738 197.2 4.1e-50
CCDS42505.1 ZNF564 gene_id:163050|Hs108|chr19 ( 553) 1738 197.4 4.4e-50
>>CCDS12096.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 (628 aa)
initn: 4484 init1: 4484 opt: 4484 Z-score: 2565.2 bits: 484.8 E(32554): 1.5e-136
Smith-Waterman score: 4484; 100.0% identity (100.0% similar) in 628 aa overlap (1-628:1-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDSVVFEDVAVDFTLEEWALLDSAQRDLYRDVMLETFQNLASVDDETQFKASGSVSQQDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MDSVVFEDVAVDFTLEEWALLDSAQRDLYRDVMLETFQNLASVDDETQFKASGSVSQQDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 YGEKIPKESKIATFTRNVSWASVLGKIWDSLSIEDQTTNQGRNLSRNHGLERLCESNDQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YGEKIPKESKIATFTRNVSWASVLGKIWDSLSIEDQTTNQGRNLSRNHGLERLCESNDQC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GEALSQIPHLNLYKKIPPGVKQYEYNTYGKVFMHRRTSLKSPITVHTGHKPYQCQECGQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GEALSQIPHLNLYKKIPPGVKQYEYNTYGKVFMHRRTSLKSPITVHTGHKPYQCQECGQA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 YSCRSHLRMHVRTHNGERPYVCKLCGKTFPRTSSLNRHVRIHTAEKTYECKQCGKAFIDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YSCRSHLRMHVRTHNGERPYVCKLCGKTFPRTSSLNRHVRIHTAEKTYECKQCGKAFIDF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SSLTSHLRSHTGEKPYKCKECGKAFSYSSTFRRHTITHTGEKPYKCKECAEAFSYSSTFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SSLTSHLRSHTGEKPYKCKECGKAFSYSSTFRRHTITHTGEKPYKCKECAEAFSYSSTFR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RHMISHTGEKPHKCKECGEAFSYSSAFRRHMITHTGEKPYECKQCGKTFIYLQSFRRHER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RHMISHTGEKPHKCKECGEAFSYSSAFRRHMITHTGEKPYECKQCGKTFIYLQSFRRHER
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 IHTGEKPYECKQCGKTFIYPQSFRRHERTHGGEKPYECNQCGKAFSHPSSFRGHMRVHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IHTGEKPYECKQCGKTFIYPQSFRRHERTHGGEKPYECNQCGKAFSHPSSFRGHMRVHTG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 EKPYECKQCGKTFNWPISLRKHMRTHTREKPYECKQCGKAFSLSACFREHVRMHPEDKSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EKPYECKQCGKTFNWPISLRKHMRTHTREKPYECKQCGKAFSLSACFREHVRMHPEDKSY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 ECKLCGKAFYCHISLQKHMRRHTAEKLYKCKQCGKAFSWPELLQQHVRTHTVEKPYECKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ECKLCGKAFYCHISLQKHMRRHTAEKLYKCKQCGKAFSWPELLQQHVRTHTVEKPYECKE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 CGKVFKWPSSLPIHMRLHTGEKPYQCKHCGKAFNCSSSLRRHVRIHTTEKQYKCNVGHPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CGKVFKWPSSLPIHMRLHTGEKPYQCKHCGKAFNCSSSLRRHVRIHTTEKQYKCNVGHPP
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB8 ANEFMCSASEKSHQERDLIKVVNMVLPL
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ANEFMCSASEKSHQERDLIKVVNMVLPL
610 620
>>CCDS59329.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 (627 aa)
initn: 3811 init1: 3811 opt: 4467 Z-score: 2555.6 bits: 483.0 E(32554): 5e-136
Smith-Waterman score: 4467; 99.8% identity (99.8% similar) in 628 aa overlap (1-628:1-627)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDSVVFEDVAVDFTLEEWALLDSAQRDLYRDVMLETFQNLASVDDETQFKASGSVSQQDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MDSVVFEDVAVDFTLEEWALLDSAQRDLYRDVMLETFQNLASVDDETQFKASGSVSQQDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 YGEKIPKESKIATFTRNVSWASVLGKIWDSLSIEDQTTNQGRNLSRNHGLERLCESNDQC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS59 YGEKIPKESKIATFTRNVSWASVLGKIWDSLSIEDQTTNQGRNL-RNHGLERLCESNDQC
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GEALSQIPHLNLYKKIPPGVKQYEYNTYGKVFMHRRTSLKSPITVHTGHKPYQCQECGQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GEALSQIPHLNLYKKIPPGVKQYEYNTYGKVFMHRRTSLKSPITVHTGHKPYQCQECGQA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 YSCRSHLRMHVRTHNGERPYVCKLCGKTFPRTSSLNRHVRIHTAEKTYECKQCGKAFIDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 YSCRSHLRMHVRTHNGERPYVCKLCGKTFPRTSSLNRHVRIHTAEKTYECKQCGKAFIDF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SSLTSHLRSHTGEKPYKCKECGKAFSYSSTFRRHTITHTGEKPYKCKECAEAFSYSSTFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SSLTSHLRSHTGEKPYKCKECGKAFSYSSTFRRHTITHTGEKPYKCKECAEAFSYSSTFR
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 RHMISHTGEKPHKCKECGEAFSYSSAFRRHMITHTGEKPYECKQCGKTFIYLQSFRRHER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RHMISHTGEKPHKCKECGEAFSYSSAFRRHMITHTGEKPYECKQCGKTFIYLQSFRRHER
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 IHTGEKPYECKQCGKTFIYPQSFRRHERTHGGEKPYECNQCGKAFSHPSSFRGHMRVHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IHTGEKPYECKQCGKTFIYPQSFRRHERTHGGEKPYECNQCGKAFSHPSSFRGHMRVHTG
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 EKPYECKQCGKTFNWPISLRKHMRTHTREKPYECKQCGKAFSLSACFREHVRMHPEDKSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EKPYECKQCGKTFNWPISLRKHMRTHTREKPYECKQCGKAFSLSACFREHVRMHPEDKSY
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 ECKLCGKAFYCHISLQKHMRRHTAEKLYKCKQCGKAFSWPELLQQHVRTHTVEKPYECKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ECKLCGKAFYCHISLQKHMRRHTAEKLYKCKQCGKAFSWPELLQQHVRTHTVEKPYECKE
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 CGKVFKWPSSLPIHMRLHTGEKPYQCKHCGKAFNCSSSLRRHVRIHTTEKQYKCNVGHPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 CGKVFKWPSSLPIHMRLHTGEKPYQCKHCGKAFNCSSSLRRHVRIHTTEKQYKCNVGHPP
540 550 560 570 580 590
610 620
pF1KB8 ANEFMCSASEKSHQERDLIKVVNMVLPL
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ANEFMCSASEKSHQERDLIKVVNMVLPL
600 610 620
>>CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 (576 aa)
initn: 5115 init1: 1863 opt: 2074 Z-score: 1202.6 bits: 232.6 E(32554): 1.2e-60
Smith-Waterman score: 2180; 53.3% identity (70.9% similar) in 619 aa overlap (1-613:1-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDSVVFEDVAVDFTLEEWALLDSAQRDLYRDVMLETFQNLASVDDETQFKASGSVSQQDI
::::.::::.:.:. :::::: .:. :::::: :::.::::.
CCDS12 MDSVAFEDVSVSFSQEEWALLAPSQKKLYRDVMQETFKNLASI-----------------
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB8 YGEKIPKESKIATFTRNVSWASVLGKIWDSLSIEDQTTNQGRNLSRNHGLERLCESND--
::: :.. ..::: :::::: :.: :::::...
CCDS12 -GEK-----------------------WEDPNVEDQHKNQGRNL-RSHTGERLCEGKEGS
50 60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 QCGEALSQIPHLNLYKKIPPGVKQYEYNTYGKVFMHRRTSLKSPITVHTGH----KPYQC
::.: .: :.:.. :: ::: :: . ::.:: : .:: . :::. :::.:
CCDS12 QCAENFS--PNLSVTKKTA-GVKPYECTICGKAFM-RLSSLTRHMRSHTGYELFEKPYKC
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 QECGQAYSCRSHLRMHVRTHNGERPYVCKLCGKTFPRTSSLNRHVRIHTAEKTYECKQCG
.:: .:.: . .. : :.:.::.:: :: ::::: . ..:: : : .:: :::::::
CCDS12 KECEKAFSYLKSFQRHERSHTGEKPYKCKQCGKTFIYHQPFQRHERTHIGEKPYECKQCG
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KAFIDFSSLTSHLRSHTGEKPYKCKECGKAFSYSSTFRRHTITHTGEKPYKCKECAEAFS
::. ::: : : :::::::.::.:::::: ::..: : :::::::: ::::..::
CCDS12 KALSCSSSLRVHERIHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSIRVHERTHTGEKPYACKECGKAFI
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 YSSTFRRHMISHTGEKPHKCKECGEAFSYSSAFRRHMITHTGEKPYECKQCGKTFIYLQS
.. :::.:.:..:.::::::.:: . : .: : :::::::.::::::.: :
CCDS12 SHTSVLTHMITHNGDRPYKCKECGKAFIFPSFLRVHERIHTGEKPYKCKQCGKAFRCSTS
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 FRRHERIHTGEKPYECKQCGKTFIYPQSFRRHERTHGGEKPYECNQCGKAFSHPSSFRGH
.. :::::::::::.::.:::.: .:: : :.: :::::.:..::::::. : :: :
CCDS12 IQIHERIHTGEKPYKCKECGKSFSARPAFRVHVRVHTGEKPYKCKECGKAFSRISYFRIH
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 MRVHTGEKPYECKQCGKTFNWPISLRKHMRTHTREKPYECKQCGKAFSLSACFREHVRMH
:.::::::::::.::::::.:..:. : :.:: :::::::.:.:.: ::.:. :
CCDS12 ERTHTGEKPYECKKCGKTFNYPLDLKIHKRNHTGEKPYECKECAKTFISLENFRRHMITH
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 PEDKSYECKLCGKAFYCHISLQKHMRRHTAEKLYKCKQCGKAFSWPELLQQHVRTHTVEK
: :.:. :::.: .:. : : ::.:: :.::::::::: .. : :::: ::
CCDS12 TGDGPYKCRDCGKVFIFPSALRTHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSYIRIHKRTHTGEK
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 PYECKECGKVFKWPSSLPIHMRLHTGEKPYQCKHCGKAFNCSSSLRRHVRIHTTEKQYKC
:::::::::.: .:.:. :::.:::::::.::.:::::. ::..::.:::. :: .:
CCDS12 PYECKECGKAFIYPTSFQGHMRMHTGEKPYKCKECGKAFSLHSSFQRHTRIHNYEKPLEC
500 510 520 530 540 550
600 610 620
pF1KB8 NVGHPPANEFMCSASEKSHQERDLIKVVNMVLPL
. .. : :.: :.:
CCDS12 K---QCGKAFSVSTSLKKHMRMHNR
560 570
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CCDS42 IHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSFRMHERIHTGEKPYECKQCGKAFSFSSSFRMHER
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50 60
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CCDS42 PLHTPHLISQWEQEEDLQTVKRELIQGIFMGEHREGFETQLKTNESVASQDICGEKISNE
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70 80 90 100 110 120
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.::. : :: :: : : . .: .:. :. .. :.: ::: .: . : ..: :...::
CCDS42 QKIVRFKRNDSWFSSLHENQESCGIDYQNKSHERHL-RNHMVENIYECYEENQDGQTFSQ
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130 140 150 160 170 180
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CCDS42 FKKHMKTPTEEKPYECKECTKAFSCSSFFRAHMKIHIGKTNYECKECGKGFSCSSSLTEH
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CCDS42 KRIHSGDKPYECKECGKAFSCSSSLSKHKRIHSGDKPYECKECGKAFSSSSHLIIHIRIH
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CCDS42 TGEKPYECKECGKAFSESSKLTVHGRTHTGEKPYKCKECGKAYNCPSSLSIHMRKHTGEK
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CCDS42 PYECLECGKAFYLPTSLNTHVKNQSREKPYECKECGKAFSCPSSFRAHVRDHTGKIQYEC
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CCDS42 KECGKTFSRSSSLTEHLRTHSGEKPYECKECGKAFISSSHLTVHIRTHTGEKPYECKKCG
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CCDS12 KCGETTSQMPNVNINKETFTGAKPHECSFCGRDFIHH-SSLNRHMRSHTGQKPNEYQEYE
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CCDS12 KQPCKCKAVGKTFSYHHCFRKHERTHTGVKPYECKQCGKAFIYYQPFQRHERTHAGQKPY
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CCDS12 ECKQCGKTFIYYQSFQKHA--HTGKKPYECKQCGKAFICYQSFQRHKRTHTGEKPYECKQ
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CCDS12 CGKAFSCPTYFRTHERTHTGEKPYKCKECGKAFSFLSSFRRHKRTHSGEKPYECKECGKA
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CCDS12 FFYSASFRAHVIIHTGARPYKCKECGKAFNSSNSCRVHERTHIGEKPYECKRCGKSFSWS
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CCDS12 ISLRLHERTHTGEKPYECKQCHKTFSFSSSLREHETTHTGEKPYECKQCGKTFSFSSSLQ
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CCDS12 RHERTHNAEKPYECKQCGKAFRCSSYFRIHERSHTGEKPYECKQCGKVFIRSSSFRLHER
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CCDS12 THTGEKPYECKLCGKTFSFSSSLREHEKIHTGNKPFECKQCGKAFLRSSQIRLHERTHTG
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CCDS12 EKPYQCKQCGKAFISSSKFRMHERTHTGEKPYRCK---QCGKAFRFSSSVRIHERSHTGE
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CCDS12 KPYECKQCGKAFISSSHFRLHERTHMGEKV
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CCDS32 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVMLENYSNLVFL--------GIVVSKPDL
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CCDS32 IAH-LEQGKKPLTMKRHEMVANPSVICSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVILRRYEKRGHGNL
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CCDS32 QLIKRCESVDECKVHTGGYNGLNQCSTTTQS-KVFQCDKYGKVF-HKFSNSNRHNIRHTE
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CCDS32 KKPFKCIECGKAFNQFSTLITHKKIHTGEKPYICEECGKAFKYSSALNTHKRIHTGEKPY
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CCDS32 KCDKCDKAFIASSTLSKHEIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSSTLTKHKKIHTGEKPYKCEE
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CCDS32 CGKAFNQSSTLTKHKKIHTGEKPYVCEECGKAFKYSRILTTHKRIHTGEKPYKCNKCGKA
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CCDS32 FIASSTLSRHEFIHMGKKHYKCEECGKAFIWSSVLTRHKRVHTGEKPYKCEECGKAFKYS
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CCDS32 STLSSHKRSHTGEKPYKCEECGKAFVASSTLSKHEIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSSSLT
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pF1KB8 EHVRMHPEDKSYECKLCGKAFYCHISLQKHMRRHTAEKLYKCKQCGKAFSWPELLQQHVR
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CCDS32 KHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSSLTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLIKHKK
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pF1KB8 THTVEKPYECKECGKVFKWPSSLPIHMRLHTGEKPYQCKHCGKAFNCSSSLRRHVRIHTT
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CCDS32 IHTREKPYKCEECGKAFHLSTHLTTHKILHTGEKPYRCRECGKAFNHSATLSSHKKIHSG
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CCDS32 EKPYECDKCGKAFISPSSLSRHEIIHTGEKP
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CCDS77 YEYQEYGQKPYKCKYCKKPFNCLSSVQTHERAHSGRKLYVCE---ECGKTF--ISHSNLQ
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pF1KB8 KK--IPPGVKQYEYNTYGKVFMHRRTSLKSPITVHTGHKPYQCQECGQAYSCRSHLRMHV
.. . : :. . ::..: : : :::.:::::..::.:.: : ::.:
CCDS77 RHRIMHRGDGPYKCKFCGKALMFLSLYLIHKRT-HTGEKPYQCKQCGKAFSHSSSLRIHE
160 170 180 190 200 210
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pF1KB8 RTHNGERPYVCKLCGKTFPRTSSLNRHVRIHTAEKTYECKQCGKAFIDFSSLTSHLRSHT
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CCDS77 RTHTGEKPYKCNECGKAFHSSTCLHAHKRTHTGEKPYECKQCGKAFSSSHSFQIHERTHT
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pF1KB8 GEKPYKCKECGKAFSYSSTFRRHTITHTGEKPYKCKECAEAFSYSSTFRRHMISHTGEKP
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CCDS77 GEKPYECKECGKAFKCPSSVRRHERTHSRKKPYECKHCGKVLSYLTSFQNHLGMHTGEIS
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CCDS77 HKCKICGKAFYSPSSLQTHEKTHTGEKPYKCNQCGKAFNSSSSFRYHERTHTGEKPYECK
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CCDS77 QCGKAFRSASLLQTHGRTHTGEKPYACKECGKPFSNFSFFQIHERMHREEKPYECKGYGK
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CCDS77 TFSLPSLFHRHERTHTGGKTYECKQCGRSFNCSSSFRYHGRTHTGEKPYECKQCGKAFRS
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620
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630
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CCDS75 FTRSTTLNEHKKIHTGEKPYKCKECGKAFRWSTSLNEHKNIHTGEKPYKCKECGKAFRQS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]