Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8337
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8337, 539 aa
1>>>pF1KB8337 539 - 539 aa - 539 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3734+/-0.00165; mu= 10.0907+/- 0.098
mean_var=262.3286+/-49.689, 0's: 0 Z-trim(107.3): 978 B-trim: 44 in 1/49
Lambda= 0.079187
statistics sampled from 8418 (9493) to 8418 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16
Scan time: 2.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 3799 448.3 1e-125
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 3799 448.3 1.1e-125
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1685 207.0 6.4e-53
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CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1621 199.6 9e-51
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1621 199.6 9.4e-51
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1621 199.6 9.5e-51
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1621 199.6 9.6e-51
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 616) 1614 198.8 1.6e-50
CCDS32991.1 ZNF599 gene_id:148103|Hs108|chr19 ( 588) 1606 197.8 2.9e-50
CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 540) 1582 195.0 1.8e-49
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1581 195.1 2.3e-49
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1579 194.7 2.4e-49
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 1576 194.6 3.9e-49
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1572 194.3 6e-49
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1572 194.3 6.1e-49
CCDS12493.1 ZFP82 gene_id:284406|Hs108|chr19 ( 532) 1565 193.1 7e-49
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1562 192.9 1e-48
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1559 192.5 1.3e-48
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1558 192.5 1.5e-48
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1558 192.5 1.5e-48
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 1553 191.7 1.9e-48
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 1553 191.7 1.9e-48
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1549 191.2 2.4e-48
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1549 191.3 2.5e-48
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1551 191.7 2.6e-48
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1549 191.3 2.6e-48
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1549 191.4 2.8e-48
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1548 191.3 3.1e-48
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 1543 190.3 3.2e-48
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1547 191.1 3.2e-48
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1543 190.5 3.7e-48
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1543 190.5 3.7e-48
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1543 190.5 3.8e-48
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1544 190.8 4.2e-48
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1543 190.8 5e-48
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1543 190.8 5.1e-48
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1538 190.0 5.9e-48
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1538 190.2 6.9e-48
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1536 189.9 7.6e-48
CCDS33089.1 ZNF613 gene_id:79898|Hs108|chr19 ( 617) 1534 189.6 8.9e-48
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1534 189.7 9.1e-48
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1534 189.7 9.3e-48
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1535 189.9 9.8e-48
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1535 189.9 9.8e-48
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1530 189.1 1.1e-47
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1532 189.5 1.2e-47
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1529 189.0 1.3e-47
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 1529 189.0 1.3e-47
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1529 189.1 1.4e-47
>>CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 (539 aa)
initn: 3799 init1: 3799 opt: 3799 Z-score: 2370.3 bits: 448.3 E(32554): 1e-125
Smith-Waterman score: 3799; 100.0% identity (100.0% similar) in 539 aa overlap (1-539:1-539)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAALFLSAPPQAEVTFEDVAVYLSREEWGRLGPAQRGLYRDVMLETYGNLVSLGVGPAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MAALFLSAPPQAEVTFEDVAVYLSREEWGRLGPAQRGLYRDVMLETYGNLVSLGVGPAGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KPGVISQLERGDEPWVLDVQGTSGKEHLRVNSPALGTRTEYKELTSQETFGEEDPQGSEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 KPGVISQLERGDEPWVLDVQGTSGKEHLRVNSPALGTRTEYKELTSQETFGEEDPQGSEP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VEACDHISKSEGSLEKLVEQRGPRAVTLTNGESSRESGGNLRLLSRPVPDQRPHKCDICE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 VEACDHISKSEGSLEKLVEQRGPRAVTLTNGESSRESGGNLRLLSRPVPDQRPHKCDICE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 QSFEQRSYLNNHKRVHRSKKTNTVRNSGEIFSANLVVKEDQKIPTGKKLHYCSYCGKTFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QSFEQRSYLNNHKRVHRSKKTNTVRNSGEIFSANLVVKEDQKIPTGKKLHYCSYCGKTFR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 YSANLVKHQRLHTEEKPYKCDECGKAFSQSCEFINHRRMHSGEIPYRCDECGKTFTRRPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 YSANLVKHQRLHTEEKPYKCDECGKAFSQSCEFINHRRMHSGEIPYRCDECGKTFTRRPN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LMKHQRIHTGEKPYKCGECGKHFSAYSSLIYHQRIHTGEKPYKCNDCGKAFSDGSILIRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LMKHQRIHTGEKPYKCGECGKHFSAYSSLIYHQRIHTGEKPYKCNDCGKAFSDGSILIRH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 RRTHTGEKPFECKECGKGFTQSSNLIQHQRIHTGEKPYKCNECEKAFIQKTKLVEHQRSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 RRTHTGEKPFECKECGKGFTQSSNLIQHQRIHTGEKPYKCNECEKAFIQKTKLVEHQRSH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 TGEKPYECNDCGKVFSQSTHLIQHQRIHTGEKPYKCSECGKAFHNSSRLIHHQRLHHGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 TGEKPYECNDCGKVFSQSTHLIQHQRIHTGEKPYKCSECGKAFHNSSRLIHHQRLHHGEK
430 440 450 460 470 480
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pF1KB8 PYRCSDCKKAFSQSTYLIQHRRIHTGEKPYKCSECGKAFRHSSNMCQHQRIHLREDFSM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 PYRCSDCKKAFSQSTYLIQHRRIHTGEKPYKCSECGKAFRHSSNMCQHQRIHLREDFSM
490 500 510 520 530
>>CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 (560 aa)
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Smith-Waterman score: 3799; 100.0% identity (100.0% similar) in 539 aa overlap (1-539:22-560)
10 20 30
pF1KB8 MAALFLSAPPQAEVTFEDVAVYLSREEWGRLGPAQRGLY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MLLLLSDQLLLTALRKPNPQAMAALFLSAPPQAEVTFEDVAVYLSREEWGRLGPAQRGLY
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 RDVMLETYGNLVSLGVGPAGPKPGVISQLERGDEPWVLDVQGTSGKEHLRVNSPALGTRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RDVMLETYGNLVSLGVGPAGPKPGVISQLERGDEPWVLDVQGTSGKEHLRVNSPALGTRT
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 EYKELTSQETFGEEDPQGSEPVEACDHISKSEGSLEKLVEQRGPRAVTLTNGESSRESGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EYKELTSQETFGEEDPQGSEPVEACDHISKSEGSLEKLVEQRGPRAVTLTNGESSRESGG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 NLRLLSRPVPDQRPHKCDICEQSFEQRSYLNNHKRVHRSKKTNTVRNSGEIFSANLVVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NLRLLSRPVPDQRPHKCDICEQSFEQRSYLNNHKRVHRSKKTNTVRNSGEIFSANLVVKE
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 DQKIPTGKKLHYCSYCGKTFRYSANLVKHQRLHTEEKPYKCDECGKAFSQSCEFINHRRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DQKIPTGKKLHYCSYCGKTFRYSANLVKHQRLHTEEKPYKCDECGKAFSQSCEFINHRRM
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 HSGEIPYRCDECGKTFTRRPNLMKHQRIHTGEKPYKCGECGKHFSAYSSLIYHQRIHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HSGEIPYRCDECGKTFTRRPNLMKHQRIHTGEKPYKCGECGKHFSAYSSLIYHQRIHTGE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 KPYKCNDCGKAFSDGSILIRHRRTHTGEKPFECKECGKGFTQSSNLIQHQRIHTGEKPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KPYKCNDCGKAFSDGSILIRHRRTHTGEKPFECKECGKGFTQSSNLIQHQRIHTGEKPYK
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 CNECEKAFIQKTKLVEHQRSHTGEKPYECNDCGKVFSQSTHLIQHQRIHTGEKPYKCSEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CNECEKAFIQKTKLVEHQRSHTGEKPYECNDCGKVFSQSTHLIQHQRIHTGEKPYKCSEC
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 GKAFHNSSRLIHHQRLHHGEKPYRCSDCKKAFSQSTYLIQHRRIHTGEKPYKCSECGKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GKAFHNSSRLIHHQRLHHGEKPYRCSDCKKAFSQSTYLIQHRRIHTGEKPYKCSECGKAF
490 500 510 520 530 540
520 530
pF1KB8 RHSSNMCQHQRIHLREDFSM
::::::::::::::::::::
CCDS47 RHSSNMCQHQRIHLREDFSM
550 560
>>CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 (754 aa)
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Smith-Waterman score: 1685; 46.2% identity (73.1% similar) in 539 aa overlap (10-538:227-747)
10 20 30
pF1KB8 MAALFLSAPPQAEVTFEDVAVYLSREEWGRLGPAQRGLY
:: :..::..: ....: : .::.:
CCDS27 FAQCTSPVPTLPQVGNSGDQAGATVLRMVRPQDTVAYEDLSVDYTQKKWKSLTLSQRALQ
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40 50 60 70 80 90
pF1KB8 RDVMLETYGNLVSLGVGPAGPKPGVISQLERGDEPWVLDVQGTSGKEHLRVNSPALGTRT
..: :.. ...:: :: . :.: .: . .:. ... :... .:.
CCDS27 WNMMPENHHSMASL----AGENMMKGSELTPKQEFF----KGSESSN--RTSGGLFGVVP
260 270 280 290 300
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 EYKEL--TSQETFGEEDPQGSEPVEACDHISKSEGSLEKLVEQRGPRAVTLTNGESSRES
: . ..:: : . : :. .. :. :... ..... .. : .. .:
CCDS27 GAAETGDVCEDTFKELEGQTSD-----EEGSRLENDFLEITDEDKKKS-TKDRYDKYKEV
310 320 330 340 350 360
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 GGNLRLLSRPVPD------QRPHKCDICEQSFEQRSYLNNHKRVHRSKKTNTVRNSGEIF
: . : : :: :. ..:: : ..:.. :.: .:.:.: ..: . :. :
CCDS27 GEHPPLSSSPVEHEGVLKGQKSYRCDECGKAFNRSSHLIGHQRIHTGEKPYECNECGKTF
370 380 390 400 410 420
220 230 240 250 260
pF1KB8 --SANLVVKEDQKIPTGKKLHYCSYCGKTFRYSANLVKHQRLHTEEKPYKCDECGKAFSQ
...:.:. . ::.: . :: :::..:.:..:..:::::. ::::::.::.:::.:
CCDS27 RQTSQLIVH--LRTHTGEKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRLHNGEKPYKCNECAKAFTQ
430 440 450 460 470
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 SCEFINHRRMHSGEIPYRCDECGKTFTRRPNLMKHQRIHTGEKPYKCGECGKHFSAYSSL
: .. .:.: :.:: ::.:.:::..: : .: .:: .:::.:::::.:::. : . .:
CCDS27 SSRLTDHQRTHTGEKPYECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGKKPYKCNECGRAFCSNRNL
480 490 500 510 520 530
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 IYHQRIHTGEKPYKCNDCGKAFSDGSILIRHRRTHTGEKPFECKECGKGFTQSSNLIQHQ
: :::::::::::.:..:::::: .. ::::. ::::::..:.::::.:.:.:.::.:.
CCDS27 IDHQRIHTGEKPYECSECGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYKCSECGKAFNQNSQLIEHE
540 550 560 570 580 590
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 RIHTGEKPYKCNECEKAFIQKTKLVEHQRSHTGEKPYECNDCGKVFSQSTHLIQHQRIHT
::::::::..:.:: ::: . :..::: :::::::.::.::: :.:..::: ::::::
CCDS27 RIHTGEKPFECSECGKAFGLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCNECGKSFNQNSHLIIHQRIHT
600 610 620 630 640 650
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 GEKPYKCSECGKAFHNSSRLIHHQRLHHGEKPYRCSDCKKAFSQSTYLIQHRRIHTGEKP
:::::.:.::::.: :: :. ::: : :::::.:.:: ::::.:. :: :.:.::::::
CCDS27 GEKPYECNECGKVFSYSSSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGKAFSDSSQLIVHQRVHTGEKP
660 670 680 690 700 710
510 520 530
pF1KB8 YKCSECGKAFRHSSNMCQHQRIHLREDFSM
:.:::::::: . :.. .::: : : :
CCDS27 YECSECGKAFSQRSTFNHHQRTHTGEKSSGLAWSVS
720 730 740 750
>>CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 (682 aa)
initn: 4376 init1: 1543 opt: 1643 Z-score: 1038.1 bits: 202.1 E(32554): 1.7e-51
Smith-Waterman score: 1643; 59.9% identity (82.1% similar) in 364 aa overlap (171-532:290-651)
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 RGPRAVTLTNGESSRESGGNLRLLSRPVPDQRPHKCDICEQSFEQRSYLNNHKRVHRSKK
.::. :. : ..: : : :..:.. : :.:
CCDS64 MSEKAYQCSECGKAFRGHSDFSRHQSHHSSERPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEK
260 270 280 290 300 310
210 220 230 240 250
pF1KB8 TNTVRNSGEIF--SANLVVKEDQKIPTGKKLHYCSYCGKTFRYSANLVKHQRLHTEEKPY
. :. : :.::. . :.: .:.: . :: :::.:: :.::.::.: :: :::.
CCDS64 PYECNECGKAFRRSSNLI--QHQRIHSGEKPYVCSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPF
320 330 340 350 360 370
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 KCDECGKAFSQSCEFINHRRMHSGEIPYRCDECGKTFTRRPNLMKHQRIHTGEKPYKCGE
.: ::::::::: .. .:.:.:.:: ::.:..::: :.: ::.::.:.:::::::::..
CCDS64 ECGECGKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECNDCGKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSD
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CCDS75 FRQSRSLNEHKNIHTGEKPYTCEKCGKAFNQSSSLIIHRSIHSEQKLYKCEECGKAFTWS
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CCDS75 SSLNKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFYRSSHLAKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSTLI
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CCDS75 LHKRIHSGQKPYKCEECGKAFTRSTTLNEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFIWSASLNEHKN
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CCDS75 IHTGEKPYKCKECGKAFNQSSGLIIHRSIHSEQKLYKCEECGKAFTRSTALNEHKKIHSG
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CCDS32 KPELIYLLEHGQELWTVKRGLSQSTCAGEKAKPKITEPTASQLAFSEESSFQELLAQRSS
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CCDS32 RDSRLGQARDEEKLIKIQEGNLRPGTNPHKEICPEKLSYKHDDLEPDDSLGLRVLQERVT
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pF1KB8 PDQRPHKCDICEQSFEQRSYLNNHKRVHRSKKTNTVRNSGEIFSANLVVKEDQKIPTGKK
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CCDS32 PQDALHECDSQGPGKDPMTDARNNPY--------TCTECGKGFSKKWALVRHQQIHAGVK
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