Result of FASTA (omim) for pFN21AB8299
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8299, 537 aa
  1>>>pF1KB8299 537 - 537 aa - 537 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2923+/-0.000307; mu= 19.2916+/- 0.019
 mean_var=71.0255+/-14.477, 0's: 0 Z-trim(116.3): 14  B-trim: 1450 in 1/55
 Lambda= 0.152183
 statistics sampled from 27425 (27439) to 27425 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.687), E-opt: 0.2 (0.322), width:  16
 Scan time:  7.640

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_068751 (OMIM: 609146) synembryn-A isoform 1 [Ho ( 537) 3523 782.6       0
NP_001273063 (OMIM: 609146) synembryn-A isoform 2  ( 531) 3441 764.5       0
XP_005253109 (OMIM: 609146) PREDICTED: synembryn-A ( 535) 3423 760.6       0
XP_016873596 (OMIM: 609146) PREDICTED: synembryn-A ( 421) 2727 607.7 2.2e-173
NP_001317075 (OMIM: 609147) synembryn-B isoform 2  ( 544)  915 210.0 1.6e-53
NP_001317074 (OMIM: 609147) synembryn-B isoform 1  ( 560)  915 210.0 1.6e-53
XP_011536828 (OMIM: 609147) PREDICTED: synembryn-B ( 564)  915 210.0 1.6e-53
NP_001317076 (OMIM: 609147) synembryn-B isoform 3  ( 536)  831 191.5 5.5e-48
XP_011536830 (OMIM: 609147) PREDICTED: synembryn-B ( 540)  831 191.5 5.5e-48
XP_016875038 (OMIM: 609147) PREDICTED: synembryn-B ( 504)  650 151.8 4.8e-36
NP_060627 (OMIM: 609147) synembryn-B isoform 4 [Ho ( 520)  650 151.8 4.9e-36
XP_011536831 (OMIM: 609147) PREDICTED: synembryn-B ( 524)  650 151.8 4.9e-36


>>NP_068751 (OMIM: 609146) synembryn-A isoform 1 [Homo s  (537 aa)
 initn: 3523 init1: 3523 opt: 3523  Z-score: 4176.8  bits: 782.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3523; 100.0% identity (100.0% similar) in 537 aa overlap (1-537:1-537)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MEPRAVAEAVETGEEDVIMEALRSYNQEHSQSFTFDDAQQEDRKRLAELLVSVLEQGLPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 MEPRAVAEAVETGEEDVIMEALRSYNQEHSQSFTFDDAQQEDRKRLAELLVSVLEQGLPP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 SHRVIWLQSVRILSRDRNCLDPFTSRQSLQALACYADISVSEGSVPESADMDVVLESLKC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 SHRVIWLQSVRILSRDRNCLDPFTSRQSLQALACYADISVSEGSVPESADMDVVLESLKC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 LCNLVLSSPVAQMLAAEARLVVKLTERVGLYRERSFPHDVQFFDLRLLFLLTALRTDVRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 LCNLVLSSPVAQMLAAEARLVVKLTERVGLYRERSFPHDVQFFDLRLLFLLTALRTDVRQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 QLFQELKGVRLLTDTLELTLGVTPEGNPPPTLLPSQETERAMEILKVLFNITLDSIKGEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 QLFQELKGVRLLTDTLELTLGVTPEGNPPPTLLPSQETERAMEILKVLFNITLDSIKGEV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 DEEDAALYRHLGTLLRHCVMIATAGDRTEEFHGHAVNLLGNLPLKCLDVLLTLEPHGDST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 DEEDAALYRHLGTLLRHCVMIATAGDRTEEFHGHAVNLLGNLPLKCLDVLLTLEPHGDST
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 EFMGVNMDVIRALLIFLEKRLHKTHRLKESVAPVLSVLTECARMHRPARKFLKAQGWPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 EFMGVNMDVIRALLIFLEKRLHKTHRLKESVAPVLSVLTECARMHRPARKFLKAQGWPPP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 QVLPPLRDVRTRPEVGEMLRNKLVRLMTHLDTDVKRVAAEFLFVLCSESVPRFIKYTGYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 QVLPPLRDVRTRPEVGEMLRNKLVRLMTHLDTDVKRVAAEFLFVLCSESVPRFIKYTGYG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 NAAGLLAARGLMAGGRPEGQYSEDEDTDTDEYKEAKASINPVTGRVEEKPPNPMEGMTEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 NAAGLLAARGLMAGGRPEGQYSEDEDTDTDEYKEAKASINPVTGRVEEKPPNPMEGMTEE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       
pF1KB8 QKEHEAMKLVTMFDKLSRNRVIQPMGMSPRGHLTSLQDAMCETMEQQLSSDPDSDPD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 QKEHEAMKLVTMFDKLSRNRVIQPMGMSPRGHLTSLQDAMCETMEQQLSSDPDSDPD
              490       500       510       520       530       

>>NP_001273063 (OMIM: 609146) synembryn-A isoform 2 [Hom  (531 aa)
 initn: 2305 init1: 2305 opt: 3441  Z-score: 4079.5  bits: 764.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3441; 98.9% identity (98.9% similar) in 537 aa overlap (1-537:1-531)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MEPRAVAEAVETGEEDVIMEALRSYNQEHSQSFTFDDAQQEDRKRLAELLVSVLEQGLPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEPRAVAEAVETGEEDVIMEALRSYNQEHSQSFTFDDAQQEDRKRLAELLVSVLEQGLPP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 SHRVIWLQSVRILSRDRNCLDPFTSRQSLQALACYADISVSEGSVPESADMDVVLESLKC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SHRVIWLQSVRILSRDRNCLDPFTSRQSLQALACYADISVSEGSVPESADMDVVLESLKC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 LCNLVLSSPVAQMLAAEARLVVKLTERVGLYRERSFPHDVQFFDLRLLFLLTALRTDVRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LCNLVLSSPVAQMLAAEARLVVKLTERVGLYRERSFPHDVQFFDLRLLFLLTALRTDVRQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 QLFQELKGVRLLTDTLELTLGVTPEGNPPPTLLPSQETERAMEILKVLFNITLDSIKGEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLFQELKGVRLLTDTLELTLGVTPEGNPPPTLLPSQETERAMEILKVLFNITLDSIKGEV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 DEEDAALYRHLGTLLRHCVMIATAGDRTEEFHGHAVNLLGNLPLKCLDVLLTLEPHGDST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEEDAALYRHLGTLLRHCVMIATAGDRTEEFHGHAVNLLGNLPLKCLDVLLTLEPHGDST
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 EFMGVNMDVIRALLIFLEKRLHKTHRLKESVAPVLSVLTECARMHRPARKFLKAQGWPPP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::     
NP_001 EFMGVNMDVIRALLIFLEKRLHKTHRLKESVAPVLSVLTECARMHRPARKFLKAQ-----
              310       320       330       340       350          

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 QVLPPLRDVRTRPEVGEMLRNKLVRLMTHLDTDVKRVAAEFLFVLCSESVPRFIKYTGYG
        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -VLPPLRDVRTRPEVGEMLRNKLVRLMTHLDTDVKRVAAEFLFVLCSESVPRFIKYTGYG
          360       370       380       390       400       410    

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 NAAGLLAARGLMAGGRPEGQYSEDEDTDTDEYKEAKASINPVTGRVEEKPPNPMEGMTEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NAAGLLAARGLMAGGRPEGQYSEDEDTDTDEYKEAKASINPVTGRVEEKPPNPMEGMTEE
          420       430       440       450       460       470    

              490       500       510       520       530       
pF1KB8 QKEHEAMKLVTMFDKLSRNRVIQPMGMSPRGHLTSLQDAMCETMEQQLSSDPDSDPD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QKEHEAMKLVTMFDKLSRNRVIQPMGMSPRGHLTSLQDAMCETMEQQLSSDPDSDPD
          480       490       500       510       520       530 

>>XP_005253109 (OMIM: 609146) PREDICTED: synembryn-A iso  (535 aa)
 initn: 2137 init1: 2137 opt: 3423  Z-score: 4058.1  bits: 760.6 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3423; 98.2% identity (98.2% similar) in 541 aa overlap (1-537:1-535)

               10        20            30        40        50      
pF1KB8 MEPRAVAEAVETGEEDVIMEALRSYNQE----HSQSFTFDDAQQEDRKRLAELLVSVLEQ
       ::::::::::::::::::::::::::::    ::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MEPRAVAEAVETGEEDVIMEALRSYNQEFSLQHSQSFTFDDAQQEDRKRLAELLVSVLEQ
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB8 GLPPSHRVIWLQSVRILSRDRNCLDPFTSRQSLQALACYADISVSEGSVPESADMDVVLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GLPPSHRVIWLQSVRILSRDRNCLDPFTSRQSLQALACYADISVSEGSVPESADMDVVLE
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB8 SLKCLCNLVLSSPVAQMLAAEARLVVKLTERVGLYRERSFPHDVQFFDLRLLFLLTALRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SLKCLCNLVLSSPVAQMLAAEARLVVKLTERVGLYRERSFPHDVQFFDLRLLFLLTALRT
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB8 DVRQQLFQELKGVRLLTDTLELTLGVTPEGNPPPTLLPSQETERAMEILKVLFNITLDSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DVRQQLFQELKGVRLLTDTLELTLGVTPEGNPPPTLLPSQETERAMEILKVLFNITLDSI
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB8 KGEVDEEDAALYRHLGTLLRHCVMIATAGDRTEEFHGHAVNLLGNLPLKCLDVLLTLEPH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KGEVDEEDAALYRHLGTLLRHCVMIATAGDRTEEFHGHAVNLLGNLPLKCLDVLLTLEPH
              250       260       270       280       290       300

        300       310       320       330       340       350      
pF1KB8 GDSTEFMGVNMDVIRALLIFLEKRLHKTHRLKESVAPVLSVLTECARMHRPARKFLKAQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
XP_005 GDSTEFMGVNMDVIRALLIFLEKRLHKTHRLKESVAPVLSVLTECARMHRPARKFLKAQ-
              310       320       330       340       350          

        360       370       380       390       400       410      
pF1KB8 WPPPQVLPPLRDVRTRPEVGEMLRNKLVRLMTHLDTDVKRVAAEFLFVLCSESVPRFIKY
            :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 -----VLPPLRDVRTRPEVGEMLRNKLVRLMTHLDTDVKRVAAEFLFVLCSESVPRFIKY
          360       370       380       390       400       410    

        420       430       440       450       460       470      
pF1KB8 TGYGNAAGLLAARGLMAGGRPEGQYSEDEDTDTDEYKEAKASINPVTGRVEEKPPNPMEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TGYGNAAGLLAARGLMAGGRPEGQYSEDEDTDTDEYKEAKASINPVTGRVEEKPPNPMEG
          420       430       440       450       460       470    

        480       490       500       510       520       530      
pF1KB8 MTEEQKEHEAMKLVTMFDKLSRNRVIQPMGMSPRGHLTSLQDAMCETMEQQLSSDPDSDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MTEEQKEHEAMKLVTMFDKLSRNRVIQPMGMSPRGHLTSLQDAMCETMEQQLSSDPDSDP
          480       490       500       510       520       530    

        
pF1KB8 D
       :
XP_005 D
        

>>XP_016873596 (OMIM: 609146) PREDICTED: synembryn-A iso  (421 aa)
 initn: 1591 init1: 1591 opt: 2727  Z-score: 3233.8  bits: 607.7 E(85289): 2.2e-173
Smith-Waterman score: 2727; 98.6% identity (98.6% similar) in 427 aa overlap (111-537:1-421)

               90       100       110       120       130       140
pF1KB8 DPFTSRQSLQALACYADISVSEGSVPESADMDVVLESLKCLCNLVLSSPVAQMLAAEARL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016                               MDVVLESLKCLCNLVLSSPVAQMLAAEARL
                                             10        20        30

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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VVKLTERVGLYRERSFPHDVQFFDLRLLFLLTALRTDVRQQLFQELKGVRLLTDTLELTL
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pF1KB8 GVTPEGNPPPTLLPSQETERAMEILKVLFNITLDSIKGEVDEEDAALYRHLGTLLRHCVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GVTPEGNPPPTLLPSQETERAMEILKVLFNITLDSIKGEVDEEDAALYRHLGTLLRHCVM
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pF1KB8 IATAGDRTEEFHGHAVNLLGNLPLKCLDVLLTLEPHGDSTEFMGVNMDVIRALLIFLEKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IATAGDRTEEFHGHAVNLLGNLPLKCLDVLLTLEPHGDSTEFMGVNMDVIRALLIFLEKR
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       :::::::::::::::::::::::::::::::::::      :::::::::::::::::::
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pF1KB8 NKLVRLMTHLDTDVKRVAAEFLFVLCSESVPRFIKYTGYGNAAGLLAARGLMAGGRPEGQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NKLVRLMTHLDTDVKRVAAEFLFVLCSESVPRFIKYTGYGNAAGLLAARGLMAGGRPEGQ
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pF1KB8 YSEDEDTDTDEYKEAKASINPVTGRVEEKPPNPMEGMTEEQKEHEAMKLVTMFDKLSRNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YSEDEDTDTDEYKEAKASINPVTGRVEEKPPNPMEGMTEEQKEHEAMKLVTMFDKLSRNR
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pF1KB8 VIQPMGMSPRGHLTSLQDAMCETMEQQLSSDPDSDPD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VIQPMGMSPRGHLTSLQDAMCETMEQQLSSDPDSDPD
          390       400       410       420 

>>NP_001317075 (OMIM: 609147) synembryn-B isoform 2 [Hom  (544 aa)
 initn: 1516 init1: 734 opt: 915  Z-score: 1082.1  bits: 210.0 E(85289): 1.6e-53
Smith-Waterman score: 1480; 46.7% identity (71.8% similar) in 568 aa overlap (2-533:3-544)

                10        20        30        40        50         
pF1KB8  MEPRAVAEAVETGEEDVIMEALRSYNQEHSQSFTFDDAQQEDRKRLAELLVSVLEQGLP
         : ::.   :..::  .: ..::.:..                :.: : . .:: . .:
NP_001 MDEERALY-IVRAGEAGAIERVLRDYSD----------------KKLCEGIFKVLIKDIP
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pF1KB8 PSHRVIWLQSVRILSRDRNCLDPFTSRQSLQALACYADISVSEGSVPESADMDVVLESLK
        . .:  :. .::::::.. : : :.....: :   : ..  . :. . ... :..::::
NP_001 TTCQVSCLEVLRILSRDKKVLVPVTTKENMQILLRLAKLNELDDSLEKVSEFPVIVESLK
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pF1KB8 CLCNLVLSSPVAQMLAAEARLVVKLTERVGLYRERSFPHDVQFFDLRLLFLLTALRTDVR
       ::::.:..: .::.:. :  :..:: . .   ..:.: .:.. :::::::::. :.::.:
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pF1KB8 QQLFQELKGVRLLTDTLELTLGV--TPE------GNPPPTLLPSQETERAMEILKVLFNI
       .::  ::.:. :::. :: ....  : :       : ::  :  :::. :.: ::.:::.
NP_001 SQLRYELQGLPLLTQILESAFSIKWTDEYESAIDHNGPP--LSPQETDCAIEALKALFNV
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pF1KB8 TLDSIKGEVDEEDAALYRHLGTLLRHCVMIA-TAGDRTEEFHGHAVNLLGNLPLKCLDVL
       :.:: : .  : :.  .: ....::::..:.  . :.:::.:..:::::.:.:..:::::
NP_001 TVDSWKVH-KESDSHQFRVMAAVLRHCLLIVGPTEDKTEELHSNAVNLLSNVPVSCLDVL
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pF1KB8 L-------------TLE--PHGDSTE-----------FMGVNMDVIRALLIFLEKRLHKT
       .             ::.  : . ..:           . :.::..:..:: :.:::. : 
NP_001 ICPLTHEETAQEATTLDELPSNKTAEKETVLKNNTMVYNGMNMEAIHVLLNFMEKRIDKG
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pF1KB8 HRLKESVAPVLSVLTECARMHRPARKFLKAQGWPPPQVLPPLRDVRTRPEVGEMLRNKLV
          .:...::::.::::.: ::  :::::       ::::::::: .:::::  .:::::
NP_001 SSYREGLTPVLSLLTECSRAHRNIRKFLK------DQVLPPLRDVTNRPEVGSTVRNKLV
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pF1KB8 RLMTHLDTDVKRVAAEFLFVLCSESVPRFIKYTGYGNAAGLLAARGLMAGGRPEGQYSED
       :::::.:  ::..:::::::::.: :  ..:::::::::::::::::.:::: .. ::::
NP_001 RLMTHVDLGVKQIAAEFLFVLCKERVDSLLKYTGYGNAAGLLAARGLLAGGRGDNWYSED
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pF1KB8 EDTDTDEYKEAKASINPVTGRVEEKPPNPMEGMTEEQKEHEAMKLVTMFDKLSRNRVIQP
       :::::.:::.:: .:: .::..::  :::.. :::::::.::::::.:.:::::.....:
NP_001 EDTDTEEYKNAKPNINLITGHLEEPMPNPIDEMTEEQKEYEAMKLVNMLDKLSREELLKP
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pF1KB8 MGMSPRGHLTSLQDAMCE-TMEQQLSSDPDSDPD
       ::..: : .: :..:. . .. .. ::: :    
NP_001 MGLKPDGTITPLEEALNQYSVIEETSSDTD    
          520       530       540        

>>NP_001317074 (OMIM: 609147) synembryn-B isoform 1 [Hom  (560 aa)
 initn: 1595 init1: 734 opt: 915  Z-score: 1081.9  bits: 210.0 E(85289): 1.6e-53
Smith-Waterman score: 1560; 47.4% identity (73.9% similar) in 568 aa overlap (2-533:3-560)

                10        20        30        40        50         
pF1KB8  MEPRAVAEAVETGEEDVIMEALRSYNQEHSQSFTFDDAQQEDRKRLAELLVSVLEQGLP
         : ::.   :..::  .: ..::.:...:  .: :...... ::.: : . .:: . .:
NP_001 MDEERALY-IVRAGEAGAIERVLRDYSDKHRATFKFESTDEDKRKKLCEGIFKVLIKDIP
                10        20        30        40        50         

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 PSHRVIWLQSVRILSRDRNCLDPFTSRQSLQALACYADISVSEGSVPESADMDVVLESLK
        . .:  :. .::::::.. : : :.....: :   : ..  . :. . ... :..::::
NP_001 TTCQVSCLEVLRILSRDKKVLVPVTTKENMQILLRLAKLNELDDSLEKVSEFPVIVESLK
      60        70        80        90       100       110         

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pF1KB8 CLCNLVLSSPVAQMLAAEARLVVKLTERVGLYRERSFPHDVQFFDLRLLFLLTALRTDVR
       ::::.:..: .::.:. :  :..:: . .   ..:.: .:.. :::::::::. :.::.:
NP_001 CLCNIVFNSQMAQQLSLELNLAAKLCNLLRKCKDRKFINDIKCFDLRLLFLLSLLHTDIR
     120       130       140       150       160       170         

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pF1KB8 QQLFQELKGVRLLTDTLELTLGV--TPE------GNPPPTLLPSQETERAMEILKVLFNI
       .::  ::.:. :::. :: ....  : :       : ::  :  :::. :.: ::.:::.
NP_001 SQLRYELQGLPLLTQILESAFSIKWTDEYESAIDHNGPP--LSPQETDCAIEALKALFNV
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pF1KB8 TLDSIKGEVDEEDAALYRHLGTLLRHCVMIA-TAGDRTEEFHGHAVNLLGNLPLKCLDVL
       :.:: : .  : :.  .: ....::::..:.  . :.:::.:..:::::.:.:..:::::
NP_001 TVDSWKVH-KESDSHQFRVMAAVLRHCLLIVGPTEDKTEELHSNAVNLLSNVPVSCLDVL
       240        250       260       270       280       290      

                             300                  310       320    
pF1KB8 L-------------TLE--PHGDSTE-----------FMGVNMDVIRALLIFLEKRLHKT
       .             ::.  : . ..:           . :.::..:..:: :.:::. : 
NP_001 ICPLTHEETAQEATTLDELPSNKTAEKETVLKNNTMVYNGMNMEAIHVLLNFMEKRIDKG
        300       310       320       330       340       350      

          330       340       350       360       370       380    
pF1KB8 HRLKESVAPVLSVLTECARMHRPARKFLKAQGWPPPQVLPPLRDVRTRPEVGEMLRNKLV
          .:...::::.::::.: ::  :::::       ::::::::: .:::::  .:::::
NP_001 SSYREGLTPVLSLLTECSRAHRNIRKFLK------DQVLPPLRDVTNRPEVGSTVRNKLV
        360       370       380             390       400       410

          390       400       410       420       430       440    
pF1KB8 RLMTHLDTDVKRVAAEFLFVLCSESVPRFIKYTGYGNAAGLLAARGLMAGGRPEGQYSED
       :::::.:  ::..:::::::::.: :  ..:::::::::::::::::.:::: .. ::::
NP_001 RLMTHVDLGVKQIAAEFLFVLCKERVDSLLKYTGYGNAAGLLAARGLLAGGRGDNWYSED
              420       430       440       450       460       470

          450       460       470       480       490       500    
pF1KB8 EDTDTDEYKEAKASINPVTGRVEEKPPNPMEGMTEEQKEHEAMKLVTMFDKLSRNRVIQP
       :::::.:::.:: .:: .::..::  :::.. :::::::.::::::.:.:::::.....:
NP_001 EDTDTEEYKNAKPNINLITGHLEEPMPNPIDEMTEEQKEYEAMKLVNMLDKLSREELLKP
              480       490       500       510       520       530

          510       520        530       
pF1KB8 MGMSPRGHLTSLQDAMCE-TMEQQLSSDPDSDPD
       ::..: : .: :..:. . .. .. ::: :    
NP_001 MGLKPDGTITPLEEALNQYSVIEETSSDTD    
              540       550       560    

>>XP_011536828 (OMIM: 609147) PREDICTED: synembryn-B iso  (564 aa)
 initn: 1512 init1: 734 opt: 915  Z-score: 1081.9  bits: 210.0 E(85289): 1.6e-53
Smith-Waterman score: 1475; 47.8% identity (73.8% similar) in 534 aa overlap (36-533:40-564)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB8 VAEAVETGEEDVIMEALRSYNQEHSQSFTFDDAQQEDRKRLAELLVSVLEQGLPPSHRVI
                                     : ....  ..: : . .:: . .: . .: 
XP_011 GTVKEKCLPGSNIFFLLPALGSKSPISEVKDTTNNQVIQKLCEGIFKVLIKDIPTTCQVS
      10        20        30        40        50        60         

          70        80        90       100       110       120     
pF1KB8 WLQSVRILSRDRNCLDPFTSRQSLQALACYADISVSEGSVPESADMDVVLESLKCLCNLV
        :. .::::::.. : : :.....: :   : ..  . :. . ... :..::::::::.:
XP_011 CLEVLRILSRDKKVLVPVTTKENMQILLRLAKLNELDDSLEKVSEFPVIVESLKCLCNIV
      70        80        90       100       110       120         

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB8 LSSPVAQMLAAEARLVVKLTERVGLYRERSFPHDVQFFDLRLLFLLTALRTDVRQQLFQE
       ..: .::.:. :  :..:: . .   ..:.: .:.. :::::::::. :.::.:.::  :
XP_011 FNSQMAQQLSLELNLAAKLCNLLRKCKDRKFINDIKCFDLRLLFLLSLLHTDIRSQLRYE
     130       140       150       160       170       180         

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pF1KB8 LKGVRLLTDTLELTLGV--TPE------GNPPPTLLPSQETERAMEILKVLFNITLDSIK
       :.:. :::. :: ....  : :       : ::  :  :::. :.: ::.:::.:.:: :
XP_011 LQGLPLLTQILESAFSIKWTDEYESAIDHNGPP--LSPQETDCAIEALKALFNVTVDSWK
     190       200       210       220         230       240       

       240       250       260        270       280       290      
pF1KB8 GEVDEEDAALYRHLGTLLRHCVMIA-TAGDRTEEFHGHAVNLLGNLPLKCLDVLL-----
        .  : :.  .: ....::::..:.  . :.:::.:..:::::.:.:..:::::.     
XP_011 VH-KESDSHQFRVMAAVLRHCLLIVGPTEDKTEELHSNAVNLLSNVPVSCLDVLICPLTH
        250       260       270       280       290       300      

                       300                  310       320       330
pF1KB8 --------TLE--PHGDSTE-----------FMGVNMDVIRALLIFLEKRLHKTHRLKES
               ::.  : . ..:           . :.::..:..:: :.:::. :    .:.
XP_011 EETAQEATTLDELPSNKTAEKETVLKNNTMVYNGMNMEAIHVLLNFMEKRIDKGSSYREG
        310       320       330       340       350       360      

              340       350       360       370       380       390
pF1KB8 VAPVLSVLTECARMHRPARKFLKAQGWPPPQVLPPLRDVRTRPEVGEMLRNKLVRLMTHL
       ..::::.::::.: ::  :::::       ::::::::: .:::::  .::::::::::.
XP_011 LTPVLSLLTECSRAHRNIRKFLK------DQVLPPLRDVTNRPEVGSTVRNKLVRLMTHV
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pF1KB8 DTDVKRVAAEFLFVLCSESVPRFIKYTGYGNAAGLLAARGLMAGGRPEGQYSEDEDTDTD
       :  ::..:::::::::.: :  ..:::::::::::::::::.:::: .. :::::::::.
XP_011 DLGVKQIAAEFLFVLCKERVDSLLKYTGYGNAAGLLAARGLLAGGRGDNWYSEDEDTDTE
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pF1KB8 EYKEAKASINPVTGRVEEKPPNPMEGMTEEQKEHEAMKLVTMFDKLSRNRVIQPMGMSPR
       :::.:: .:: .::..::  :::.. :::::::.::::::.:.:::::.....:::..: 
XP_011 EYKNAKPNINLITGHLEEPMPNPIDEMTEEQKEYEAMKLVNMLDKLSREELLKPMGLKPD
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              520        530       
pF1KB8 GHLTSLQDAMCE-TMEQQLSSDPDSDPD
       : .: :..:. . .. .. ::: :    
XP_011 GTITPLEEALNQYSVIEETSSDTD    
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>>NP_001317076 (OMIM: 609147) synembryn-B isoform 3 [Hom  (536 aa)
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pF1KB8  MEPRAVAEAVETGEEDVIMEALRSYNQEHSQSFTFDDAQQEDRKRLAELLVSVLEQGLP
         : ::.   :..::  .: ..::.:...:  .: :...... ::.: : . .:: . .:
NP_001 MDEERALY-IVRAGEAGAIERVLRDYSDKHRATFKFESTDEDKRKKLCEGIFKVLIKDIP
                10        20        30        40        50         

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pF1KB8 PSHRVIWLQSVRILSRDRNCLDPFTSRQSLQALACYADISVSEGSVPESADMDVVLESLK
        . .:  :. .::::::.. : : :.....: :   : ..  . :. . ... :..::::
NP_001 TTCQVSCLEVLRILSRDKKVLVPVTTKENMQILLRLAKLNELDDSLEKVSEFPVIVESLK
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pF1KB8 CLCNLVLSSPVAQMLAAEARLVVKLTERVGLYRERSFPHDVQFFDLRLLFLLTALRTDVR
       ::::.:..: .::.:. :  :..:: . .   ..:.: .:.. :::::::::. :.::.:
NP_001 CLCNIVFNSQMAQQLSLELNLAAKLCNLLRKCKDRKFINDIKCFDLRLLFLLSLLHTDIR
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pF1KB8 QQLFQELKGVRLLTDTLELTLGV--TPE------GNPPPTLLPSQETERAMEILKVLFNI
       .::  ::.:. :::. :: ....  : :       : ::  :  :::. :.: ::.:::.
NP_001 SQLRYELQGLPLLTQILESAFSIKWTDEYESAIDHNGPP--LSPQETDCAIEALKALFNV
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pF1KB8 TLDSIKGEVDEEDAALYRHLGTLLRHCVMIA-TAGDRTEEFHGHAVNLLGNLPLKCLDVL
       :.:: : .  : :.  .: ....::::..:.  . :.:::.:..:::::.:.:..:::::
NP_001 TVDSWKVH-KESDSHQFRVMAAVLRHCLLIVGPTEDKTEELHSNAVNLLSNVPVSCLDVL
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pF1KB8 L-------------TLE--PHGDSTE-----------FMGVNMDVIRALLIFLEKRLHKT
       .             ::.  : . ..:           . :.::..:..:: :.:::. : 
NP_001 ICPLTHEETAQEATTLDELPSNKTAEKETVLKNNTMVYNGMNMEAIHVLLNFMEKRIDKG
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pF1KB8 HRLKESVAPVLSVLTECARMHRPARKFLKAQGWPPPQVLPPLRDVRTRPEVGEMLRNKLV
          .:...::::.::::.: ::  :::::       ::::::::: .:::::  .:::::
NP_001 SSYREGLTPVLSLLTECSRAHRNIRKFLK------DQVLPPLRDVTNRPEVGSTVRNKLV
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pF1KB8 RLMTHLDTDVKRVAAEFLFVLCSESVPRFIKYTGYGNAAGLLAARGLMAGGRPEGQYSED
       :::::.:  ::..:::::::::.: :  ..:::::::::::::::::.:::: .. ::::
NP_001 RLMTHVDLGVKQIAAEFLFVLCKERVDSLLKYTGYGNAAGLLAARGLLAGGRGDNWYSED
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pF1KB8 EDTDTDEYKEAKASINPVTGRVEEKPPNPMEGMTEEQKEHEAMKLVTMFDKLSRNRVIQP
       :::::.:::.:: .:: .::..::  :::.. :::::::.::::::.:.:::::   .. 
NP_001 EDTDTEEYKNAKPNINLITGHLEEPMPNPIDEMTEEQKEYEAMKLVNMLDKLSRRADVKD
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          510       520       530       
pF1KB8 MGMSPRGHLTSLQDAMCETMEQQLSSDPDSDPD
       .                                
NP_001 LHQDGG                           
                                        

>>XP_011536830 (OMIM: 609147) PREDICTED: synembryn-B iso  (540 aa)
 initn: 1248 init1: 664 opt: 831  Z-score: 982.5  bits: 191.5 E(85289): 5.5e-48
Smith-Waterman score: 1391; 48.1% identity (73.1% similar) in 505 aa overlap (36-505:40-535)

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XP_011 GTVKEKCLPGSNIFFLLPALGSKSPISEVKDTTNNQVIQKLCEGIFKVLIKDIPTTCQVS
      10        20        30        40        50        60         

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pF1KB8 WLQSVRILSRDRNCLDPFTSRQSLQALACYADISVSEGSVPESADMDVVLESLKCLCNLV
        :. .::::::.. : : :.....: :   : ..  . :. . ... :..::::::::.:
XP_011 CLEVLRILSRDKKVLVPVTTKENMQILLRLAKLNELDDSLEKVSEFPVIVESLKCLCNIV
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pF1KB8 LSSPVAQMLAAEARLVVKLTERVGLYRERSFPHDVQFFDLRLLFLLTALRTDVRQQLFQE
       ..: .::.:. :  :..:: . .   ..:.: .:.. :::::::::. :.::.:.::  :
XP_011 FNSQMAQQLSLELNLAAKLCNLLRKCKDRKFINDIKCFDLRLLFLLSLLHTDIRSQLRYE
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pF1KB8 LKGVRLLTDTLELTLGV--TPE------GNPPPTLLPSQETERAMEILKVLFNITLDSIK
       :.:. :::. :: ....  : :       : ::  :  :::. :.: ::.:::.:.:: :
XP_011 LQGLPLLTQILESAFSIKWTDEYESAIDHNGPP--LSPQETDCAIEALKALFNVTVDSWK
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pF1KB8 GEVDEEDAALYRHLGTLLRHCVMIA-TAGDRTEEFHGHAVNLLGNLPLKCLDVLL-----
        .  : :.  .: ....::::..:.  . :.:::.:..:::::.:.:..:::::.     
XP_011 VH-KESDSHQFRVMAAVLRHCLLIVGPTEDKTEELHSNAVNLLSNVPVSCLDVLICPLTH
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pF1KB8 --------TLE--PHGDSTE-----------FMGVNMDVIRALLIFLEKRLHKTHRLKES
               ::.  : . ..:           . :.::..:..:: :.:::. :    .:.
XP_011 EETAQEATTLDELPSNKTAEKETVLKNNTMVYNGMNMEAIHVLLNFMEKRIDKGSSYREG
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pF1KB8 VAPVLSVLTECARMHRPARKFLKAQGWPPPQVLPPLRDVRTRPEVGEMLRNKLVRLMTHL
       ..::::.::::.: ::  :::::       ::::::::: .:::::  .::::::::::.
XP_011 LTPVLSLLTECSRAHRNIRKFLK------DQVLPPLRDVTNRPEVGSTVRNKLVRLMTHV
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pF1KB8 DTDVKRVAAEFLFVLCSESVPRFIKYTGYGNAAGLLAARGLMAGGRPEGQYSEDEDTDTD
       :  ::..:::::::::.: :  ..:::::::::::::::::.:::: .. :::::::::.
XP_011 DLGVKQIAAEFLFVLCKERVDSLLKYTGYGNAAGLLAARGLLAGGRGDNWYSEDEDTDTE
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pF1KB8 EYKEAKASINPVTGRVEEKPPNPMEGMTEEQKEHEAMKLVTMFDKLSRNRVIQPMGMSPR
       :::.:: .:: .::..::  :::.. :::::::.::::::.:.:::::   .. .     
XP_011 EYKNAKPNINLITGHLEEPMPNPIDEMTEEQKEYEAMKLVNMLDKLSRRADVKDLHQDGG
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pF1KB8 GHLTSLQDAMCETMEQQLSSDPDSDPD

>>XP_016875038 (OMIM: 609147) PREDICTED: synembryn-B iso  (504 aa)
 initn: 1049 init1: 484 opt: 650  Z-score: 768.1  bits: 151.8 E(85289): 4.8e-36
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                10        20        30        40        50         
pF1KB8  MEPRAVAEAVETGEEDVIMEALRSYNQEHSQSFTFDDAQQEDRKRLAELLVSVLEQGLP
         : ::.   :..::  .: ..::.:..                :.: : . .:: . .:
XP_016 MDEERALY-IVRAGEAGAIERVLRDYSD----------------KKLCEGIFKVLIKDIP
                10        20                        30        40   

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pF1KB8 PSHRVIWLQSVRILSRDRNCLDPFTSRQSLQALACYADISVSEGSVPESADMDVVLESLK
        . .:  :. .::::::.. : : :.....: :   : ..  . :. . ... :..::::
XP_016 TTCQVSCLEVLRILSRDKKVLVPVTTKENMQILLRLAKLNELDDSLEKVSEFPVIVESLK
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pF1KB8 CLCNLVLSSPVAQMLAAEARLVVKLTERVGLYRERSFPHDVQFFDLRLLFLLTALRTDVR
       ::::.:..: .::.:. :  :..:: . .   ..:.: .:.. :::::::::. :.::.:
XP_016 CLCNIVFNSQMAQQLSLELNLAAKLCNLLRKCKDRKFINDIKCFDLRLLFLLSLLHTDIR
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pF1KB8 QQLFQELKGVRLLTDTLELTLGV--TPE------GNPPPTLLPSQETERAMEILKVLFNI
       .::  ::.:. :::. :: ....  : :       : ::  :  :::. :.: ::.:::.
XP_016 SQLRYELQGLPLLTQILESAFSIKWTDEYESAIDHNGPP--LSPQETDCAIEALKALFNV
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pF1KB8 TLDSIKGEVDEEDAALYRHLGTLLRHCVMIA-TAGDRTEEFHGHAVNLLGNLPLKCLDVL
       :.:: : .  : :.  .: ....::::..:.  . :.:::.:..:::::.:.:..:::::
XP_016 TVDSWKVH-KESDSHQFRVMAAVLRHCLLIVGPTEDKTEELHSNAVNLLSNVPVSCLDVL
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pF1KB8 L-------------TLE--PHGDSTE-----------FMGVNMDVIRALLIFLEKRLHKT
       .             ::.  : . ..:           . :.::..:..:: :.:::. : 
XP_016 ICPLTHEETAQEATTLDELPSNKTAEKETVLKNNTMVYNGMNMEAIHVLLNFMEKRIDKG
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pF1KB8 HRLKESVAPVLSVLTECARMHRPARKFLKAQGWPPPQVLPPLRDVRTRPEVGEMLRNKLV
          .:...::::.::::.: ::  :::::       ::::::::: .:::::  .:::::
XP_016 SSYREGLTPVLSLLTECSRAHRNIRKFLK------DQVLPPLRDVTNRPEVGSTVRNKLV
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