FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8299, 537 aa 1>>>pF1KB8299 537 - 537 aa - 537 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2923+/-0.000307; mu= 19.2916+/- 0.019 mean_var=71.0255+/-14.477, 0's: 0 Z-trim(116.3): 14 B-trim: 1450 in 1/55 Lambda= 0.152183 statistics sampled from 27425 (27439) to 27425 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.687), E-opt: 0.2 (0.322), width: 16 Scan time: 7.640 The best scores are: opt bits E(85289) NP_068751 (OMIM: 609146) synembryn-A isoform 1 [Ho ( 537) 3523 782.6 0 NP_001273063 (OMIM: 609146) synembryn-A isoform 2 ( 531) 3441 764.5 0 XP_005253109 (OMIM: 609146) PREDICTED: synembryn-A ( 535) 3423 760.6 0 XP_016873596 (OMIM: 609146) PREDICTED: synembryn-A ( 421) 2727 607.7 2.2e-173 NP_001317075 (OMIM: 609147) synembryn-B isoform 2 ( 544) 915 210.0 1.6e-53 NP_001317074 (OMIM: 609147) synembryn-B isoform 1 ( 560) 915 210.0 1.6e-53 XP_011536828 (OMIM: 609147) PREDICTED: synembryn-B ( 564) 915 210.0 1.6e-53 NP_001317076 (OMIM: 609147) synembryn-B isoform 3 ( 536) 831 191.5 5.5e-48 XP_011536830 (OMIM: 609147) PREDICTED: synembryn-B ( 540) 831 191.5 5.5e-48 XP_016875038 (OMIM: 609147) PREDICTED: synembryn-B ( 504) 650 151.8 4.8e-36 NP_060627 (OMIM: 609147) synembryn-B isoform 4 [Ho ( 520) 650 151.8 4.9e-36 XP_011536831 (OMIM: 609147) PREDICTED: synembryn-B ( 524) 650 151.8 4.9e-36 >>NP_068751 (OMIM: 609146) synembryn-A isoform 1 [Homo s (537 aa) initn: 3523 init1: 3523 opt: 3523 Z-score: 4176.8 bits: 782.6 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 3523; 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