Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8292
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8292, 449 aa
1>>>pF1KB8292 449 - 449 aa - 449 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5466+/-0.00135; mu= 2.4183+/- 0.078
mean_var=248.6309+/-55.016, 0's: 0 Z-trim(108.2): 939 B-trim: 409 in 1/51
Lambda= 0.081339
statistics sampled from 9022 (10077) to 9022 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.31), width: 16
Scan time: 2.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11837.1 ZBTB14 gene_id:7541|Hs108|chr18 ( 449) 3025 368.7 6.7e-102
CCDS34639.2 ZNF713 gene_id:349075|Hs108|chr7 ( 443) 532 76.2 7.7e-14
CCDS54213.1 ZNF317 gene_id:57693|Hs108|chr19 ( 563) 530 76.0 1.1e-13
CCDS12210.1 ZNF317 gene_id:57693|Hs108|chr19 ( 595) 530 76.1 1.1e-13
CCDS5951.2 ZNF596 gene_id:169270|Hs108|chr8 ( 504) 528 75.7 1.2e-13
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 531 76.3 1.2e-13
CCDS12634.1 ZNF155 gene_id:7711|Hs108|chr19 ( 538) 519 74.7 2.5e-13
CCDS12944.1 ZNF667 gene_id:63934|Hs108|chr19 ( 610) 520 74.9 2.5e-13
CCDS58668.1 ZNF155 gene_id:7711|Hs108|chr19 ( 549) 519 74.7 2.6e-13
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 ( 744) 521 75.1 2.7e-13
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 512 74.0 5.2e-13
CCDS54258.1 ZNF540 gene_id:163255|Hs108|chr19 ( 628) 511 73.8 5.4e-13
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 509 73.5 5.5e-13
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 509 73.5 5.6e-13
CCDS12506.1 ZNF540 gene_id:163255|Hs108|chr19 ( 660) 511 73.9 5.6e-13
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 509 73.6 5.9e-13
CCDS4441.1 ZNF454 gene_id:285676|Hs108|chr5 ( 522) 508 73.4 6.1e-13
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 512 74.1 6.2e-13
CCDS42557.1 ZNF829 gene_id:374899|Hs108|chr19 ( 432) 505 73.0 6.8e-13
CCDS59380.1 ZNF829 gene_id:374899|Hs108|chr19 ( 513) 505 73.1 7.6e-13
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 506 73.2 7.8e-13
CCDS12269.2 ZNF625 gene_id:90589|Hs108|chr19 ( 372) 502 72.6 7.8e-13
CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19 ( 491) 504 72.9 8e-13
CCDS46203.1 ZSCAN5B gene_id:342933|Hs108|chr19 ( 495) 504 72.9 8.1e-13
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 506 73.3 8.2e-13
CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 590) 505 73.1 8.4e-13
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CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 506 73.3 8.7e-13
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 504 73.0 9e-13
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 506 73.3 9.2e-13
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CCDS64996.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 697) 505 73.2 9.5e-13
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 504 73.0 9.7e-13
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17 ( 522) 502 72.7 9.9e-13
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8 ( 671) 504 73.1 1e-12
CCDS46160.1 ZNF577 gene_id:84765|Hs108|chr19 ( 426) 500 72.4 1e-12
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 504 73.1 1e-12
CCDS12842.2 ZNF577 gene_id:84765|Hs108|chr19 ( 485) 500 72.4 1.1e-12
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 504 73.1 1.1e-12
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 503 73.0 1.1e-12
CCDS31089.1 ZNF124 gene_id:7678|Hs108|chr1 ( 289) 495 71.6 1.2e-12
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 501 72.7 1.2e-12
CCDS33121.1 ZNF582 gene_id:147948|Hs108|chr19 ( 517) 499 72.4 1.3e-12
CCDS47592.1 ZNF679 gene_id:168417|Hs108|chr7 ( 411) 497 72.0 1.3e-12
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 501 72.7 1.3e-12
CCDS33094.1 ZNF468 gene_id:90333|Hs108|chr19 ( 522) 499 72.4 1.3e-12
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 742) 502 72.9 1.3e-12
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 745) 502 72.9 1.3e-12
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 501 72.7 1.3e-12
CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19 ( 537) 499 72.4 1.3e-12
>>CCDS11837.1 ZBTB14 gene_id:7541|Hs108|chr18 (449 aa)
initn: 3025 init1: 3025 opt: 3025 Z-score: 1942.9 bits: 368.7 E(32554): 6.7e-102
Smith-Waterman score: 3025; 100.0% identity (100.0% similar) in 449 aa overlap (1-449:1-449)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEFFISMSETIKYNDDDHKTLFLKTLNEQRLEGEFCDIAIVVEDVKFRAHRCVLAACSTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEFFISMSETIKYNDDDHKTLFLKTLNEQRLEGEFCDIAIVVEDVKFRAHRCVLAACSTY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 FKKLFKKLEVDSSSVIEIDFLRSDIFEEVLNYMYTAKISVKKEDVNLMMSSGQILGIRFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FKKLFKKLEVDSSSVIEIDFLRSDIFEEVLNYMYTAKISVKKEDVNLMMSSGQILGIRFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DKLCSQKRDVSSPDENNGQSKSKYCLKINRPIGDAADTQDDDVEEIGDQDDSPSDDTVEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DKLCSQKRDVSSPDENNGQSKSKYCLKINRPIGDAADTQDDDVEEIGDQDDSPSDDTVEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TPPSQEDGKSPTTTLRVQEAILKELGSEEVRKVNCYGQEVESMETPESKDLGSQTPQALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TPPSQEDGKSPTTTLRVQEAILKELGSEEVRKVNCYGQEVESMETPESKDLGSQTPQALT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 FNDGMSEVKDEQTPGWTTAASDMKFEYLLYGHHREQIACQACGKTFSDEGRLRKHEKLHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FNDGMSEVKDEQTPGWTTAASDMKFEYLLYGHHREQIACQACGKTFSDEGRLRKHEKLHT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ADRPFVCEMCTKGFTTQAHLKEHLKIHTGYKPYSCEVCGKSFIRAPDLKKHERVHSNERP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADRPFVCEMCTKGFTTQAHLKEHLKIHTGYKPYSCEVCGKSFIRAPDLKKHERVHSNERP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 FACHMCDKAFKHKSHLKDHERRHRGEKPFVCGSCTKAFAKASDLKRHENNMHSERKQVTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FACHMCDKAFKHKSHLKDHERRHRGEKPFVCGSCTKAFAKASDLKRHENNMHSERKQVTP
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KB8 SAIQSETEQLQAAAMAAEAEQQLETIACS
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SAIQSETEQLQAAAMAAEAEQQLETIACS
430 440
>>CCDS34639.2 ZNF713 gene_id:349075|Hs108|chr7 (443 aa)
initn: 1104 init1: 493 opt: 532 Z-score: 362.0 bits: 76.2 E(32554): 7.7e-14
Smith-Waterman score: 532; 37.8% identity (73.5% similar) in 196 aa overlap (224-416:232-424)
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 TLRVQEAILKELGSEEVRKVNCYGQEVESMETP-ESKDLGSQTPQALTFNDGM--SEVKD
::: : .. :. : . ..: . .: .
CCDS34 SIKIPLNSDTQGNSIKHNSDLIYYQGNYVRETPYEYSECGKIFNQHILLTDHIHTAEKPS
210 220 230 240 250 260
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 EQTPGWTTAASDMKFEYLLYGHHREQIACQACGKTFSDEGRLRKHEKLHTADRPFVCEMC
: ... ..: . ..:: :. . :. ::: ::.. .: .:...::...::.:. :
CCDS34 ECGKAFSHTSSLSQPQMLLTGE--KPYKCDECGKRFSQRIHLIQHQRIHTGEKPFICNGC
270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 TKGFTTQAHLKEHLKIHTGYKPYSCEVCGKSFIRAPDLKKHERVHSNERPFACHMCDKAF
:.: .. . .::.:::: :::.:. :::.: : .: .:.:.:..:.:. : .: :::
CCDS34 GKAFRQHSSFTQHLRIHTGEKPYKCNQCGKAFSRITSLTEHHRLHTGEKPYECGFCGKAF
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KB8 KHKSHLKDHERRHRGEKPFVCGSCTKAFAKASDLKRHENNMHSERKQVTPSAIQSETEQL
....::..::: : ::::. :. : :::.... :..:.. .:...:
CCDS34 SQRTHLNQHERTHTGEKPYKCNECGKAFSQSAHLNQHRK-IHTREKLCEYKCEQTVRHSP
380 390 400 410 420 430
440
pF1KB8 QAAAMAAEAEQQLETIACS
CCDS34 SFSST
440
>>CCDS54213.1 ZNF317 gene_id:57693|Hs108|chr19 (563 aa)
initn: 1941 init1: 489 opt: 530 Z-score: 359.4 bits: 76.0 E(32554): 1.1e-13
Smith-Waterman score: 530; 40.9% identity (68.5% similar) in 181 aa overlap (237-415:179-356)
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 SEEVRKVNCYGQEVESMETPESKDLGSQTPQALTFNDG--MSEVKDEQTPGWTTAASDMK
: ... :: : : .. : ..::.:: .
CCDS54 LTQPMGRHAGKRPYHRRDYGVAFKGRPHLTQHMSMYDGRKMHECHQCQK-AFTTSASLTR
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270 280 290 300 310 320
pF1KB8 FEYLLYGHHREQIACQACGKTFSDEGRLRKHEKLHTADRPFVCEMCTKGFTTQAHLKEHL
. . :. . :. :::.:.: . ::.: . : ..:: : .: ..: : . :: :.
CCDS54 HRRIHTGE--KPYECSDCGKAFNDPSALRSHARTHLKEKPFDCSQCGNAFRTLSALKIHM
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 KIHTGYKPYSCEVCGKSFIRAPDLKKHERVHSNERPFACHMCDKAFKHKSHLKDHERRHR
..::: .::.:. :::.. :. : :.:.:..:::. :: : :::.: ::::.: : :
CCDS54 RVHTGERPYKCDQCGKAYGRSCHLIAHKRTHTGERPYECHDCGKAFQHPSHLKEHVRNHT
270 280 290 300 310 320
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pF1KB8 GEKPFVCGSCTKAFAKASDLKRHENNMHSERKQVTPSAIQSETEQLQAAAMAAEAEQQLE
::::..: .: ::: :... :..: :.
CCDS54 GEKPYACTQCGKAFRWKSNFNLHKKNHMVEKTYECKECGKSFGDLVSRRKHMRIHIVKKP
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 TIACS
CCDS54 VECRQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGEKPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERRYECA
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>>CCDS12210.1 ZNF317 gene_id:57693|Hs108|chr19 (595 aa)
initn: 1941 init1: 489 opt: 530 Z-score: 359.1 bits: 76.1 E(32554): 1.1e-13
Smith-Waterman score: 537; 31.4% identity (61.0% similar) in 315 aa overlap (125-415:77-388)
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 TAKISVKKEDVNLMMSSGQILGIRFLDKLCSQKRDVSSPDENNGQSKSKYCLKINRP--I
::.. .. .: .. .. ....: :
CCDS12 HTPSVGSQESVTFQDVAVDFTEKEWPLLDSSQRKLYKDVMLENYSNLTSLGYQVGKPSLI
50 60 70 80 90 100
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pF1KB8 GDAADTQDDDVEEIGDQDDSPSD-DTVEGTPPS--QED--GKSPTTTLRVQEAILKELGS
. . .. .:: : .. . .: .: : : .:: :: . . ...: : : ..
CCDS12 SHLEQEEEPRTEERGAHQGACADWETPSKTKWSLLMEDIFGKETPSGVTMERAGLGEKST
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250
pF1KB8 EEVRKVNCYGQE---VESM-----ETP-ESKDLG------SQTPQALTFNDG--MSEVKD
: .. . .:.. .. : . : . .: : . : ... :: : : ..
CCDS12 EYAHLFEVFGMDPHLTQPMGRHAGKRPYHRRDYGVAFKGRPHLTQHMSMYDGRKMHECHQ
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 EQTPGWTTAASDMKFEYLLYGHHREQIACQACGKTFSDEGRLRKHEKLHTADRPFVCEMC
: ..::.:: . . . : .. :. :::.:.: . ::.: . : ..:: : .:
CCDS12 CQK-AFTTSASLTRHRRIHTG--EKPYECSDCGKAFNDPSALRSHARTHLKEKPFDCSQC
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 TKGFTTQAHLKEHLKIHTGYKPYSCEVCGKSFIRAPDLKKHERVHSNERPFACHMCDKAF
..: : . :: :...::: .::.:. :::.. :. : :.:.:..:::. :: : :::
CCDS12 GNAFRTLSALKIHMRVHTGERPYKCDQCGKAYGRSCHLIAHKRTHTGERPYECHDCGKAF
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KB8 KHKSHLKDHERRHRGEKPFVCGSCTKAFAKASDLKRHENNMHSERKQVTPSAIQSETEQL
.: ::::.: : : ::::..: .: ::: :... :..: :.
CCDS12 QHPSHLKEHVRNHTGEKPYACTQCGKAFRWKSNFNLHKKNHMVEKTYECKECGKSFGDLV
350 360 370 380 390 400
440
pF1KB8 QAAAMAAEAEQQLETIACS
CCDS12 SRRKHMRIHIVKKPVECRQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGEKPYGCDLCGKAFSASSNLTA
410 420 430 440 450 460
>>CCDS5951.2 ZNF596 gene_id:169270|Hs108|chr8 (504 aa)
initn: 1910 init1: 522 opt: 528 Z-score: 358.7 bits: 75.7 E(32554): 1.2e-13
Smith-Waterman score: 542; 43.0% identity (74.7% similar) in 158 aa overlap (258-415:261-417)
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 SKDLGSQTPQALTFNDGMSEVKDEQTPGWTTAASDMKFEYLLYGHHREQIACQACGKTFS
. .:... . ... ... :: :. :::.:.
CCDS59 AFTHCSDLRKHERTHTGEKPYGCHLCGKAFSKSSNLRRHEMIHTREKAQI-CHLCGKAFT
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 DEGRLRKHEKLHTADRPFVCEMCTKGFTTQAHLKEHLKIHTGYKPYSCEVCGKSFIRAPD
. :::::. : .:.:. : .: :.:. ..:..: . :.: ::: :..:::.: .
CCDS59 HCSDLRKHERTHLGDKPYGCLLCGKAFSKCSYLRQHERTHNGEKPYECHLCGKAFSHCSH
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 LKKHERVHSNERPFACHMCDKAFKHKSHLKDHERRHRGEKPFVCGSCTKAFAKASDLKRH
:..::: :..:.: .::.: ::: ..: :: ::: : ::::. : : :::...:::.::
CCDS59 LRQHERSHNGEKPHGCHLCGKAFTESSVLKRHERIHTGEKPYECHVCGKAFTESSDLRRH
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440
pF1KB8 ENNMHSERKQVTPSAIQSETEQLQAAAMAAEAEQQLETIACS
: . .:.
CCDS59 ERTHTGEKPYECHLCGKAFNHSSVLRRHERTHTGEKPYECNICGKAFNRSYNFRLHRRVH
410 420 430 440 450 460
>>CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 (738 aa)
initn: 3624 init1: 505 opt: 531 Z-score: 358.6 bits: 76.3 E(32554): 1.2e-13
Smith-Waterman score: 548; 34.6% identity (60.5% similar) in 286 aa overlap (139-416:202-457)
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 MSSGQILGIRFLDKLCSQKRDVSSPDENNGQSKSKYCLKINRPIGDA----ADTQDDDVE
: :.: : : : : . .::..
CCDS33 QEFPTGKVPNSWSKIYLNETQNYQRSCKQTQMKNKLC--IFAPYVDIFSCISHHHDDNIV
180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 EIGDQDDSPSD---DTVEGTPPSQEDGKSPTTTLRVQEAILKELGSEEVRKVNCYGQEVE
. :. : :: ::.. .: .:.. .. : . :.: . : .
CCDS33 HKRDKVHSNSDCGKDTLKVSPLTQRSIHTGQKTYQ---------GNECEEAFN----DSS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]