Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8173
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8173, 358 aa
1>>>pF1KB8173 358 - 358 aa - 358 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8166+/-0.000698; mu= 12.5630+/- 0.043
mean_var=158.6667+/-32.493, 0's: 0 Z-trim(115.6): 49 B-trim: 875 in 1/54
Lambda= 0.101820
statistics sampled from 16075 (16125) to 16075 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.807), E-opt: 0.2 (0.495), width: 16
Scan time: 2.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46132.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 ( 358) 2502 378.6 4.4e-105
CCDS74406.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 ( 375) 1467 226.6 2.7e-59
CCDS33064.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 ( 421) 1043 164.4 1.6e-40
CCDS45220.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 306) 1007 158.9 5.1e-39
CCDS42014.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 381) 1007 159.0 5.9e-39
CCDS45218.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 394) 1007 159.0 6.1e-39
CCDS46309.1 MEIS1 gene_id:4211|Hs108|chr2 ( 390) 994 157.1 2.3e-38
CCDS10045.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 470) 953 151.2 1.7e-36
CCDS45219.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 388) 913 145.2 8.6e-35
CCDS45217.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 401) 913 145.2 8.8e-35
CCDS10044.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 477) 913 145.3 1e-34
CCDS41730.1 PKNOX2 gene_id:63876|Hs108|chr11 ( 472) 373 66.0 7.5e-11
CCDS68211.1 PKNOX1 gene_id:5316|Hs108|chr21 ( 319) 368 65.1 9.5e-11
>>CCDS46132.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 (358 aa)
initn: 2502 init1: 2502 opt: 2502 Z-score: 2000.0 bits: 378.6 E(32554): 4.4e-105
Smith-Waterman score: 2502; 100.0% identity (100.0% similar) in 358 aa overlap (1-358:1-358)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKGKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKGKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 DQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 QERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINAR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB8 RRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPGSVGMSLNLEGEWHYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPGSVGMSLNLEGEWHYL
310 320 330 340 350
>>CCDS74406.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 (375 aa)
initn: 1467 init1: 1467 opt: 1467 Z-score: 1178.1 bits: 226.6 E(32554): 2.7e-59
Smith-Waterman score: 2458; 95.5% identity (95.5% similar) in 375 aa overlap (1-358:1-375)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160
pF1KB8 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK-----------------GKMPIDLVIEDRDG
::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS74 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHDLCDNFCHRYITCLKGKMPIDLVIEDRDG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 GCREDFEDYPASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GCREDFEDYPASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 DTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 DTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQ
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 DTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 DTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPG
310 320 330 340 350 360
350
pF1KB8 SVGMSLNLEGEWHYL
:::::::::::::::
CCDS74 SVGMSLNLEGEWHYL
370
>>CCDS33064.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 (421 aa)
initn: 1672 init1: 1041 opt: 1043 Z-score: 840.8 bits: 164.4 E(32554): 1.6e-40
Smith-Waterman score: 2134; 83.8% identity (83.8% similar) in 390 aa overlap (1-327:1-390)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDGLKREKDEI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFAKQVRSER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160
pF1KB8 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK-----------------GKMPIDLVIEDRDG
::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS33 PLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHDLCDNFCHRYITCLKGKMPIDLVIEDRDG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 GCREDFEDYPASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GCREDFEDYPASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGL
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260
pF1KB8 DTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLS--------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSRRSEAPVLPDVCLG
250 260 270 280 290 300
270 280 290
pF1KB8 --------------------------------HPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFI
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LGSPSPGPRWARPWGSDCGRPGRQSDSCWWLQHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFI
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 NARRRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPGSVGMSLNLEGEWHY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NARRRIVQPMIDQSNRTGQGAAFSPEGQPIGGYTETQPHVAVRPPGSVGMSLNLEGEWHY
370 380 390 400 410 420
>>CCDS45220.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (306 aa)
initn: 1077 init1: 659 opt: 1007 Z-score: 814.0 bits: 158.9 E(32554): 5.1e-39
Smith-Waterman score: 1377; 67.8% identity (84.1% similar) in 314 aa overlap (69-358:1-306)
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 RPPQPLPPGLDSDGLKREKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGD
.::::::::::::.::. . : :::
CCDS45 MALVFEKCELATCTPREPGVA------GGD
10 20
100 110 120 130 140
pF1KB8 VCSSDSFNEDIAAFAKQVRSERPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK---------
::::::::::::.::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VCSSDSFNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFC
30 40 50 60 70 80
150 160 170 180 190
pF1KB8 --------GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLPDQN-NMWIRDHEDSGSVH-LG
:::::::::..:::. . : :. .: .: :.: . : :::.:. :.: :
CCDS45 HRYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAG
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 TPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNI
:::::::: :::::::::.::::::.:::::..: .:.: :....:.:::::::::::::
CCDS45 TPGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNI
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 MRAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRT-GQGA
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .:::
CCDS45 MRAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGA
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350
pF1KB8 AFSPEGQPIGGYT-ETQPHVAVRPPG---SVGMSLNLEGEWHYL
:.::::::.:... . : :...:: : ..::.....:.:::.
CCDS45 AYSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
270 280 290 300
>>CCDS42014.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (381 aa)
initn: 1231 init1: 659 opt: 1007 Z-score: 812.8 bits: 159.0 E(32554): 5.9e-39
Smith-Waterman score: 1522; 63.8% identity (79.1% similar) in 378 aa overlap (9-358:14-381)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRP-PQPLPPGLDS---D
:: : . : : . :: : : :. .: .. : :
CCDS42 MDGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPL--HATQHYGAHAPHPNVMPASMGSAVND
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 GLKREKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAA
.:::.:: ::::::::::::::::::::::.::. . : :::::::::::::::.
CCDS42 ALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVA------GGDVCSSDSFNEDIAV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150
pF1KB8 FAKQVRSERPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK-----------------GKMPI
::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS42 FAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLKGKMPI
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 DLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLPDQN-NMWIRDHEDSGSVH-LGTPGPSSGGLASQS
::::..:::. . : :. .: .: :.: . : :::.:. :.: ::::::::: ::::
CCDS42 DLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAGTPGPSSGGHASQS
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 GDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPY
:::::.::::::.:::::..: .:.: :....:.::::::::::::::::::::::.:::
CCDS42 GDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLTHPY
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 PSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRT-GQGAAFSPEGQPIGGYT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .::::.::::::.:...
CCDS42 PSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGAAYSPEGQPMGSFV
300 310 320 330 340 350
340 350
pF1KB8 -ETQPHVAVRPPG---SVGMSLNLEGEWHYL
. : :...:: : ..::.....:.:::.
CCDS42 LDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
360 370 380
>>CCDS45218.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (394 aa)
initn: 1300 init1: 659 opt: 1007 Z-score: 812.6 bits: 159.0 E(32554): 6.1e-39
Smith-Waterman score: 1590; 63.3% identity (79.2% similar) in 403 aa overlap (1-358:1-394)
10 20 30 40
pF1KB8 MARRYDELPHYPGIVDG---PAALASFPETVPAVP-------GP-------YGPHRP-PQ
::.:::::::: :. :: ::.. . :.. .: :: :: : : :.
CCDS45 MAQRYDELPHYGGM-DGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPN
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KB8 PLPPGLDS---DGLKREKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDV
.: .. : :.:::.:: ::::::::::::::::::::::.::. . :: :::
CCDS45 VMPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVAG------GDV
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KB8 CSSDSFNEDIAAFAKQVRSERPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK----------
:::::::::::.::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CSSDSFNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCH
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 -------GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLPDQN-NMWIRDHEDSGSVH-LGT
:::::::::..:::. . : :. .: .: :.: . : :::.:. :.: ::
CCDS45 RYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAGT
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 PGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIM
::::::: :::::::::.::::::.:::::..: .:.: :....:.::::::::::::::
CCDS45 PGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIM
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310
pF1KB8 RAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRT-GQGAA
::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .::::
CCDS45 RAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGAA
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350
pF1KB8 FSPEGQPIGGYT-ETQPHVAVRPPG---SVGMSLNLEGEWHYL
.::::::.:... . : :...:: : ..::.....:.:::.
CCDS45 YSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
360 370 380 390
>>CCDS46309.1 MEIS1 gene_id:4211|Hs108|chr2 (390 aa)
initn: 1192 init1: 506 opt: 994 Z-score: 802.3 bits: 157.1 E(32554): 2.3e-38
Smith-Waterman score: 1535; 61.2% identity (79.2% similar) in 400 aa overlap (1-358:1-390)
10 20 30 40
pF1KB8 MARRYDELPHYPGIVDG---PAALASFPETV----PAVPGPYGP----HRPPQP-----L
::.:::.:::: :. :: :... . :... :. .:: :. :. .
CCDS46 MAQRYDDLPHYGGM-DGVGIPSTMYGDPHAARSMQPVHHLNHGPPLHSHQYPHTAHTNAM
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 PPGLDS---DGLKREKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCS
:.. : :.:::.:: ::::::::::::.:::::::::.::. . :: :::::
CCDS46 APSMGSSVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALIFEKCELATCTPREPGVAG------GDVCS
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140
pF1KB8 SDSFNEDIAAFAKQVRSERPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK------------
:.:::::::.::::.:.:.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SESFNEDIAVFAKQIRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRY
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 -----GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLG-TPGP
:::::::::.::.:: . : :: : .: :: . : :::.:..:.. : ::::
CCDS46 ISCLKGKMPIDLVIDDREGGSKSDSEDITRSA-NLTDQPS-WNRDHDDTASTRSGGTPGP
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 SSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAW
:::: .:.::::::.::::::.::::::.: .:.: :....:.:::::::::::::::::
CCDS46 SSGGHTSHSGDNSSEQGDGLDNSVASPSTG-DDDDPDKDKKRHKKRGIFPKVATNIMRAW
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 LFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRT-GQGAAFSP
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .::. ..:
CCDS46 LFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGTPYNP
300 310 320 330 340 350
330 340 350
pF1KB8 EGQPIGGYT-ETQPHVAVRPPG---SVGMSLNLEGEWHYL
.:::.::.. . : :...: :: ..::....::.:::.
CCDS46 DGQPMGGFVMDGQQHMGIRAPGPMSGMGMNMGMEGQWHYM
360 370 380 390
>>CCDS10045.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (470 aa)
initn: 1203 init1: 659 opt: 953 Z-score: 768.8 bits: 151.2 E(32554): 1.7e-36
Smith-Waterman score: 1536; 64.3% identity (78.7% similar) in 389 aa overlap (1-347:1-380)
10 20 30 40
pF1KB8 MARRYDELPHYPGIVDG---PAALASFPETVPAVP-------GP-------YGPHRP-PQ
::.:::::::: :. :: ::.. . :.. .: :: :: : : :.
CCDS10 MAQRYDELPHYGGM-DGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPN
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KB8 PLPPGLDS---DGLKREKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDV
.: .. : :.:::.:: ::::::::::::::::::::::.::. . :: :::
CCDS10 VMPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVAG------GDV
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KB8 CSSDSFNEDIAAFAKQVRSERPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK----------
:::::::::::.::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CSSDSFNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCH
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 -------GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLPDQN-NMWIRDHEDSGSVH-LGT
:::::::::..:::. . : :. .: .: :.: . : :::.:. :.: ::
CCDS10 RYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAGT
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 PGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIM
::::::: :::::::::.::::::.:::::..: .:.: :....:.::::::::::::::
CCDS10 PGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIM
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310
pF1KB8 RAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRT-GQGAA
::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .::::
CCDS10 RAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQGAA
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350
pF1KB8 FSPEGQPIGGYT-ETQPHVAVRPPGSVGMSLNLEGEWHYL
.::::::.:... . : :...:: : .:
CCDS10 YSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGLQSMPGDYVSQGGPMGMSMAQPSYTPPQMTPHPTQ
360 370 380 390 400 410
>>CCDS45219.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (388 aa)
initn: 1379 init1: 667 opt: 913 Z-score: 738.1 bits: 145.2 E(32554): 8.6e-35
Smith-Waterman score: 1516; 62.9% identity (77.7% similar) in 385 aa overlap (9-358:14-388)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MARRYDELPHYPGIVDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRP-PQPLPPGLDS---D
:: : . : : . :: : : :. .: .. : :
CCDS45 MDGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPL--HATQHYGAHAPHPNVMPASMGSAVND
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 GLKREKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAA
.:::.:: ::::::::::::::::::::::.::. . : :::::::::::::::.
CCDS45 ALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVA------GGDVCSSDSFNEDIAV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150
pF1KB8 FAKQVRSERPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK-----------------GKMPI
::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS45 FAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLKGKMPI
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 DLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLPDQN-NMWIRDHEDSGSVH-LGTPGPSSGGLASQS
::::..:::. . : :. .: .: :.: . : :::.:. :.: ::::::::: ::::
CCDS45 DLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAGTPGPSSGGHASQS
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 GDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPY
:::::.::::::.:::::..: .:.: :....:.::::::::::::::::::::::.:::
CCDS45 GDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLTHPY
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KB8 PSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRTG--------QGAAFSPEG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: ::::.::::
CCDS45 PSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAGFLLDPSVSQGAAYSPEG
300 310 320 330 340 350
330 340 350
pF1KB8 QPIGGYT-ETQPHVAVRPPG---SVGMSLNLEGEWHYL
::.:... . : :...:: : ..::.....:.:::.
CCDS45 QPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
360 370 380
>>CCDS45217.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (401 aa)
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Smith-Waterman score: 1584; 62.4% identity (77.8% similar) in 410 aa overlap (1-358:1-401)
10 20 30 40
pF1KB8 MARRYDELPHYPGIVDG---PAALASFPETVPAVP-------GP-------YGPHRP-PQ
::.:::::::: :. :: ::.. . :.. .: :: :: : : :.
CCDS45 MAQRYDELPHYGGM-DGVGVPASMYGDPHAPRPIPPVHHLNHGPPLHATQHYGAHAPHPN
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KB8 PLPPGLDS---DGLKREKDEIYGHPLFPLLALVFEKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDV
.: .. : :.:::.:: ::::::::::::::::::::::.::. . :: :::
CCDS45 VMPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPREPGVAG------GDV
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KB8 CSSDSFNEDIAAFAKQVRSERPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEK----------
:::::::::::.::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CSSDSFNEDIAVFAKQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCH
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 -------GKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDYPASCPSLPDQN-NMWIRDHEDSGSVH-LGT
:::::::::..:::. . : :. .: .: :.: . : :::.:. :.: ::
CCDS45 RYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSW-RDHDDATSTHSAGT
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 PGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSSGGEDEDLDQERRRNKKRGIFPKVATNIM
::::::: :::::::::.::::::.:::::..: .:.: :....:.::::::::::::::
CCDS45 PGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTG-DDDDPDKDKKRQKKRGIFPKVATNIM
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310
pF1KB8 RAWLFQHLSHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRTG-----
::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS45 RAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAGFLLDP
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350
pF1KB8 ---QGAAFSPEGQPIGGYT-ETQPHVAVRPPG---SVGMSLNLEGEWHYL
::::.::::::.:... . : :...:: : ..::.....:.:::.
CCDS45 SVSQGAAYSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQWHYM
360 370 380 390 400
358 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 10:14:34 2016 done: Fri Nov 4 10:14:34 2016
Total Scan time: 2.400 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]