Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7756
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7756, 498 aa
1>>>pF1KB7756 498 - 498 aa - 498 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6075+/-0.00131; mu= 14.3479+/- 0.079
mean_var=236.5288+/-44.347, 0's: 0 Z-trim(109.1): 962 B-trim: 5 in 1/51
Lambda= 0.083394
statistics sampled from 9630 (10659) to 9630 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.327), width: 16
Scan time: 2.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 3505 435.4 6.9e-122
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 3341 415.6 5.9e-116
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 2606 327.0 2.1e-89
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1635 210.6 4.4e-54
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1625 209.3 9.6e-54
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1625 209.4 9.9e-54
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1623 209.2 1.2e-53
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1623 209.2 1.2e-53
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1609 207.2 3.1e-53
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1599 206.3 9.3e-53
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1589 205.1 2e-52
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1589 205.1 2e-52
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1589 205.1 2.1e-52
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 1582 204.1 3.2e-52
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 1582 204.1 3.4e-52
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1580 203.8 3.5e-52
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1580 203.9 3.9e-52
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1577 203.5 4.9e-52
CCDS42559.1 ZNF527 gene_id:84503|Hs108|chr19 ( 609) 1571 202.8 8.6e-52
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1568 202.3 9.8e-52
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1563 202.0 1.9e-51
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1563 202.1 2e-51
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1559 201.3 2.2e-51
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 1559 201.4 2.2e-51
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1559 201.4 2.3e-51
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1559 201.5 2.5e-51
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1554 200.8 3.5e-51
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1554 200.8 3.7e-51
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1554 200.9 3.8e-51
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1553 200.9 4.5e-51
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1553 200.9 4.5e-51
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1553 200.9 4.5e-51
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1548 200.1 6.2e-51
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1547 200.1 7.1e-51
CCDS83401.1 ZNF883 gene_id:169834|Hs108|chr9 ( 379) 1542 199.0 7.4e-51
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 1543 199.4 8.3e-51
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 1543 199.4 8.5e-51
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1540 199.1 1.1e-50
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 1538 198.8 1.3e-50
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 1538 198.8 1.3e-50
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1537 198.9 1.6e-50
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1538 199.1 1.6e-50
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 1532 198.1 2.1e-50
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1532 198.1 2.2e-50
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1532 198.2 2.3e-50
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1531 198.0 2.4e-50
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 1529 197.6 2.5e-50
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1531 198.1 2.5e-50
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1534 198.7 2.5e-50
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1534 198.8 2.6e-50
>>CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 (498 aa)
initn: 3505 init1: 3505 opt: 3505 Z-score: 2301.7 bits: 435.4 E(32554): 6.9e-122
Smith-Waterman score: 3505; 99.6% identity (99.6% similar) in 498 aa overlap (1-498:1-498)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLEEGVLPSPGPALPQEENTGEEGMAAGLLIAGPRGSTFFSSVTVAFAQEGWRCLVSTPR
:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS68 MLEEGVLPSPGPALPQEENTGEEGMAAGLLTAGPRGSTFFSSVTVAFAQERWRCLVSTPR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DRFKEGIPGKSRSLVLLGLPVSQPGMNSQLEQREGAWMLEGEDLRSPSPGWKIISGSPPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 DRFKEGIPGKSRSLVLLGLPVSQPGMNSQLEQREGAWMLEGEDLRSPSPGWKIISGSPPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QALSEASFQDPCVEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEARPRKCETHTESFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 QALSEASFQDPCVEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEARPRKCETHTESFK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 NSEILKPHRAKPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 NSEILKPHRAKPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 RIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 GEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 YRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 YRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 ECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGK
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB7 AFRCSSAFVRHQRLHAGE
::::::::::::::::::
CCDS68 AFRCSSAFVRHQRLHAGE
490
>>CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 (474 aa)
initn: 3341 init1: 3341 opt: 3341 Z-score: 2195.3 bits: 415.6 E(32554): 5.9e-116
Smith-Waterman score: 3341; 99.6% identity (99.6% similar) in 474 aa overlap (25-498:1-474)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLEEGVLPSPGPALPQEENTGEEGMAAGLLIAGPRGSTFFSSVTVAFAQEGWRCLVSTPR
:::::: ::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS69 MAAGLLTAGPRGSTFFSSVTVAFAQERWRCLVSTPR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DRFKEGIPGKSRSLVLLGLPVSQPGMNSQLEQREGAWMLEGEDLRSPSPGWKIISGSPPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DRFKEGIPGKSRSLVLLGLPVSQPGMNSQLEQREGAWMLEGEDLRSPSPGWKIISGSPPE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QALSEASFQDPCVEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEARPRKCETHTESFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QALSEASFQDPCVEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEARPRKCETHTESFK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 NSEILKPHRAKPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NSEILKPHRAKPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQ
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 RIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 GEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKP
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 YRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 YRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCN
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 ECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGK
400 410 420 430 440 450
490
pF1KB7 AFRCSSAFVRHQRLHAGE
::::::::::::::::::
CCDS69 AFRCSSAFVRHQRLHAGE
460 470
>>CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 (364 aa)
initn: 2606 init1: 2606 opt: 2606 Z-score: 1718.5 bits: 327.0 E(32554): 2.1e-89
Smith-Waterman score: 2606; 100.0% identity (100.0% similar) in 364 aa overlap (135-498:1-364)
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 RSPSPGWKIISGSPPEQALSEASFQDPCVEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVP
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 VEARPRKCETHTESFKNSEILKPHRAKPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VEARPRKCETHTESFKNSEILKPHRAKPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYECS
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 ECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSECEK
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 AFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSY
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 CAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQSTNL
220 230 240 250 260 270
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 IIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQHQ
280 290 300 310 320 330
470 480 490
pF1KB7 RIHTGVKPYECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RIHTGVKPYECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE
340 350 360
>>CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 (682 aa)
initn: 5881 init1: 1595 opt: 1635 Z-score: 1084.4 bits: 210.6 E(32554): 4.4e-54
Smith-Waterman score: 1635; 60.1% identity (82.0% similar) in 366 aa overlap (138-498:233-598)
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 SPGWKIISGSPPEQALSEASFQDPCVEMPPGDSDHGTSDLEKSFNLRPVLSPQQRVPVEA
:... .: :.:. ::. ..: .
CCDS64 PTAESPLICNECGKTFQGNPDLIQRQIVHTGEASFMCDDCGKTFSQNSVLKNRHRSHMSE
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 RPRKCETHTESFKNSEILKPHRA-----KPYACNECGKAFSYCSSLSQHQKSHTGEKPYE
. .: ..:.. .. :.. .:: ::::::::: :::..::::: .:::::
CCDS64 KAYQCSECGKAFRGHSDFSRHQSHHSSERPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEKPYE
270 280 290 300 310 320
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 CSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTKHQRTHTGEKPYRCSEC
:.:::::: .::.::::::::.::::: :::::.:: ...:: ::.::::::::..:.::
CCDS64 CNECGKAFRRSSNLIQHQRIHSGEKPYVCSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGEC
330 340 350 360 370 380
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 EKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAF
::::. . : .:::.:::::::::.:::: : . .:: .:.:.::::::::::.:::::
CCDS64 GKAFSQSAHLRKHQRVHTGEKPYECNDCGKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAF
390 400 410 420 430 440
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 SYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGEKPYKCSECGKAFSQST
: ...:::.::::::::. : .:::::: :. : .:: :::::::.:: ::::::.:.
CCDS64 SQSSSLIQHRRIHTGEKPHVCNVCGKAFSYSSVLRKHQIIHTGEKPYRCSVCGKAFSHSS
450 460 470 480 490 500
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 NLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYECNECGKAFNQSSSLSQ
:: :: .:::.::: :.:::: :..:: :: :. .:::::::::.::::.:.:::.: :
CCDS64 ALIQHQGVHTGDKPYACHECGKTFGRSSNLILHQRVHTGEKPYECTECGKTFSQSSTLIQ
510 520 530 540 550 560
470 480 490
pF1KB7 HQRIHTGVKPYECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE
:::::.:.::.::..::::: :: ...::..:.::
CCDS64 HQRIHNGLKPHECNQCGKAFNRSSNLIHHQKVHTGEKPYTCVECGKGFSQSSHLIQHQII
570 580 590 600 610 620
CCDS64 HTGERPYKCSECGKAFSQRSVLIQHQRIHTGVKPYDCAACGKAFSQRSKLIKHQLIHTRE
630 640 650 660 670 680
>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
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CCDS54 YECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]