Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7444
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7444, 496 aa
1>>>pF1KB7444 496 - 496 aa - 496 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3022+/-0.00105; mu= 6.3219+/- 0.063
mean_var=260.7179+/-55.375, 0's: 0 Z-trim(112.2): 131 B-trim: 808 in 1/50
Lambda= 0.079431
statistics sampled from 12831 (12972) to 12831 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.72), E-opt: 0.2 (0.398), width: 16
Scan time: 3.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35483.1 RBMY1F gene_id:159163|Hs108|chrY ( 496) 3504 415.0 9.6e-116
CCDS35484.1 RBMY1J gene_id:378951|Hs108|chrY ( 496) 3504 415.0 9.6e-116
CCDS35479.1 RBMY1B gene_id:378948|Hs108|chrY ( 496) 3473 411.4 1.1e-114
CCDS14796.1 RBMY1A1 gene_id:5940|Hs108|chrY ( 496) 3471 411.2 1.3e-114
CCDS35480.1 RBMY1D gene_id:378949|Hs108|chrY ( 496) 3462 410.2 2.7e-114
CCDS35481.1 RBMY1E gene_id:378950|Hs108|chrY ( 496) 3458 409.7 3.7e-114
CCDS83521.1 RBMY1D gene_id:378949|Hs108|chrY ( 459) 2300 277.0 3.1e-74
CCDS14661.1 RBMX gene_id:27316|Hs108|chrX ( 391) 1197 150.5 3.1e-36
CCDS716.1 RBMXL1 gene_id:494115|Hs108|chr1 ( 390) 1169 147.3 2.9e-35
CCDS7777.1 RBMXL2 gene_id:27288|Hs108|chr11 ( 392) 887 115.0 1.6e-25
CCDS55478.1 RBMXL3 gene_id:139804|Hs108|chrX (1067) 621 85.0 4.5e-16
>>CCDS35483.1 RBMY1F gene_id:159163|Hs108|chrY (496 aa)
initn: 3504 init1: 3504 opt: 3504 Z-score: 2191.4 bits: 415.0 E(32554): 9.6e-116
Smith-Waterman score: 3504; 100.0% identity (100.0% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVEADHPGKLFIGGLNRETNEKMLKAVFGKHGPISEVLLIKDRTSKSRGFAFITFENPAD
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CCDS35 MVEADHPGKLFIGGLNRETNEKMLKAVFGKHGPISEVLLIKDRTSKSRGFAFITFENPAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AKNAAKDMNGTSLHGKAIKVEQAKKPSFQSGGRRRPPASSRNRSPSGSLRSARGSSGGTR
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CCDS35 AKNAAKDMNGTSLHGKAIKVEQAKKPSFQSGGRRRPPASSRNRSPSGSLRSARGSSGGTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GWLPSHEGHLDDGGYTPDLKMSYSRGLIPVKRGPSSRSGGPPPKKSAPSAVARSNSWMGS
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CCDS35 GWLPSHEGHLDDGGYTPDLKMSYSRGLIPVKRGPSSRSGGPPPKKSAPSAVARSNSWMGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QGPMSQRRENYGVPPRRATISSWRNDRMSTRHDGYATNDGNHPSCQETRDYAPPSRGYAY
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CCDS35 QGPMSQRRENYGVPPRRATISSWRNDRMSTRHDGYATNDGNHPSCQETRDYAPPSRGYAY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RDNGHSNRDEHSSRGYRNHRSSRETRDYAPPSRGHAYRDYGHSRRDESYSRGYRNHRSSR
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CCDS35 RDNGHSNRDEHSSRGYRNHRSSRETRDYAPPSRGHAYRDYGHSRRDESYSRGYRNHRSSR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ETREYAPPSRGHGYRDYGHSRRHESYSRGYRNHPSSRETRDYAPPHRDYAYRDYGHSSWD
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CCDS35 ETREYAPPSRGHGYRDYGHSRRHESYSRGYRNHPSSRETRDYAPPHRDYAYRDYGHSSWD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EHSSRGYSYHDGYGEALGRDHSEHLSGSSYRDALQRYGTSHGAPPARGPRMSYGGSTCHA
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CCDS35 EHSSRGYSYHDGYGEALGRDHSEHLSGSSYRDALQRYGTSHGAPPARGPRMSYGGSTCHA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 YSNTRDRYGRSWESYSSCGDFHYCDREHVCRKDQRNPPSLGRVLPDPREAYGSSSYVASI
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CCDS35 YSNTRDRYGRSWESYSSCGDFHYCDREHVCRKDQRNPPSLGRVLPDPREAYGSSSYVASI
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB7 VDGGESRSEKGDSSRY
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CCDS35 VDGGESRSEKGDSSRY
490
>>CCDS35484.1 RBMY1J gene_id:378951|Hs108|chrY (496 aa)
initn: 3504 init1: 3504 opt: 3504 Z-score: 2191.4 bits: 415.0 E(32554): 9.6e-116
Smith-Waterman score: 3504; 100.0% identity (100.0% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVEADHPGKLFIGGLNRETNEKMLKAVFGKHGPISEVLLIKDRTSKSRGFAFITFENPAD
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CCDS35 MVEADHPGKLFIGGLNRETNEKMLKAVFGKHGPISEVLLIKDRTSKSRGFAFITFENPAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AKNAAKDMNGTSLHGKAIKVEQAKKPSFQSGGRRRPPASSRNRSPSGSLRSARGSSGGTR
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CCDS35 AKNAAKDMNGTSLHGKAIKVEQAKKPSFQSGGRRRPPASSRNRSPSGSLRSARGSSGGTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GWLPSHEGHLDDGGYTPDLKMSYSRGLIPVKRGPSSRSGGPPPKKSAPSAVARSNSWMGS
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CCDS35 GWLPSHEGHLDDGGYTPDLKMSYSRGLIPVKRGPSSRSGGPPPKKSAPSAVARSNSWMGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QGPMSQRRENYGVPPRRATISSWRNDRMSTRHDGYATNDGNHPSCQETRDYAPPSRGYAY
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CCDS35 QGPMSQRRENYGVPPRRATISSWRNDRMSTRHDGYATNDGNHPSCQETRDYAPPSRGYAY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RDNGHSNRDEHSSRGYRNHRSSRETRDYAPPSRGHAYRDYGHSRRDESYSRGYRNHRSSR
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CCDS35 RDNGHSNRDEHSSRGYRNHRSSRETRDYAPPSRGHAYRDYGHSRRDESYSRGYRNHRSSR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ETREYAPPSRGHGYRDYGHSRRHESYSRGYRNHPSSRETRDYAPPHRDYAYRDYGHSSWD
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CCDS35 ETREYAPPSRGHGYRDYGHSRRHESYSRGYRNHPSSRETRDYAPPHRDYAYRDYGHSSWD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EHSSRGYSYHDGYGEALGRDHSEHLSGSSYRDALQRYGTSHGAPPARGPRMSYGGSTCHA
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CCDS35 EHSSRGYSYHDGYGEALGRDHSEHLSGSSYRDALQRYGTSHGAPPARGPRMSYGGSTCHA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 YSNTRDRYGRSWESYSSCGDFHYCDREHVCRKDQRNPPSLGRVLPDPREAYGSSSYVASI
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CCDS35 YSNTRDRYGRSWESYSSCGDFHYCDREHVCRKDQRNPPSLGRVLPDPREAYGSSSYVASI
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB7 VDGGESRSEKGDSSRY
::::::::::::::::
CCDS35 VDGGESRSEKGDSSRY
490
>>CCDS35479.1 RBMY1B gene_id:378948|Hs108|chrY (496 aa)
initn: 3473 init1: 3473 opt: 3473 Z-score: 2172.2 bits: 411.4 E(32554): 1.1e-114
Smith-Waterman score: 3473; 99.2% identity (99.6% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVEADHPGKLFIGGLNRETNEKMLKAVFGKHGPISEVLLIKDRTSKSRGFAFITFENPAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MVEADHPGKLFIGGLNRETNEKMLKAVFGKHGPISEVLLIKDRTSKSRGFAFITFENPAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AKNAAKDMNGTSLHGKAIKVEQAKKPSFQSGGRRRPPASSRNRSPSGSLRSARGSSGGTR
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CCDS35 AKNAAKDMNGKSLHGKAIKVEQAKKPSFQSGGRRRPPASSRNRSPSGSLRSARGSRGGTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GWLPSHEGHLDDGGYTPDLKMSYSRGLIPVKRGPSSRSGGPPPKKSAPSAVARSNSWMGS
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CCDS35 GWLPSQEGHLDDGGYTPDLKMSYSRGLIPVKRGPSSRSGGPPPKKSAPSAVARSNSWMGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QGPMSQRRENYGVPPRRATISSWRNDRMSTRHDGYATNDGNHPSCQETRDYAPPSRGYAY
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CCDS35 QGPMSQRRENYGVPPRRATISSWRNDRMSTRHDGYATNDGNHPSCQETRDYAPPSRGYAY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RDNGHSNRDEHSSRGYRNHRSSRETRDYAPPSRGHAYRDYGHSRRDESYSRGYRNHRSSR
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CCDS35 RDNGHSNRDEHSSRGYRNHRSSRETRDYAPPSRGHAYRDYGHSRRDESYSRGYRNRRSSR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ETREYAPPSRGHGYRDYGHSRRHESYSRGYRNHPSSRETRDYAPPHRDYAYRDYGHSSWD
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CCDS35 ETREYAPPSRGHGYRDYGHSRRHESYSRGYRNHPSSRETRDYAPPHRDYAYRDYGHSSWD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EHSSRGYSYHDGYGEALGRDHSEHLSGSSYRDALQRYGTSHGAPPARGPRMSYGGSTCHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EHSSRGYSYHDGYGEALGRDHSEHLSGSSYRDALQRYGTSHGAPPARGPRMSYGGSTCHA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 YSNTRDRYGRSWESYSSCGDFHYCDREHVCRKDQRNPPSLGRVLPDPREAYGSSSYVASI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YSNTRDRYGRSWESYSSCGDFHYCDREHVCRKDQRNPPSLGRVLPDPREAYGSSSYVASI
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB7 VDGGESRSEKGDSSRY
::::::::::::::::
CCDS35 VDGGESRSEKGDSSRY
490
>>CCDS14796.1 RBMY1A1 gene_id:5940|Hs108|chrY (496 aa)
initn: 3471 init1: 3471 opt: 3471 Z-score: 2171.0 bits: 411.2 E(32554): 1.3e-114
Smith-Waterman score: 3471; 99.2% identity (99.4% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVEADHPGKLFIGGLNRETNEKMLKAVFGKHGPISEVLLIKDRTSKSRGFAFITFENPAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MVEADHPGKLFIGGLNRETNEKMLKAVFGKHGPISEVLLIKDRTSKSRGFAFITFENPAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AKNAAKDMNGTSLHGKAIKVEQAKKPSFQSGGRRRPPASSRNRSPSGSLRSARGSSGGTR
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CCDS14 AKNAAKDMNGKSLHGKAIKVEQAKKPSFQSGGRRRPPASSRNRSPSGSLRSARGSRGGTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GWLPSHEGHLDDGGYTPDLKMSYSRGLIPVKRGPSSRSGGPPPKKSAPSAVARSNSWMGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GWLPSHEGHLDDGGYTPDLKMSYSRGLIPVKRGPSSRSGGPPPKKSAPSAVARSNSWMGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QGPMSQRRENYGVPPRRATISSWRNDRMSTRHDGYATNDGNHPSCQETRDYAPPSRGYAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QGPMSQRRENYGVPPRRATISSWRNDRMSTRHDGYATNDGNHPSCQETRDYAPPSRGYAY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RDNGHSNRDEHSSRGYRNHRSSRETRDYAPPSRGHAYRDYGHSRRDESYSRGYRNHRSSR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS14 RDNGHSNRDEHSSRGYRNHRSSRETRDYAPPSRGHAYRDYGHSRRDESYSRGYRNRRSSR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ETREYAPPSRGHGYRDYGHSRRHESYSRGYRNHPSSRETRDYAPPHRDYAYRDYGHSSWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ETREYAPPSRGHGYRDYGHSRRHESYSRGYRNHPSSRETRDYAPPHRDYAYRDYGHSSWD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EHSSRGYSYHDGYGEALGRDHSEHLSGSSYRDALQRYGTSHGAPPARGPRMSYGGSTCHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EHSSRGYSYHDGYGEALGRDHSEHLSGSSYRDALQRYGTSHGAPPARGPRMSYGGSTCHA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 YSNTRDRYGRSWESYSSCGDFHYCDREHVCRKDQRNPPSLGRVLPDPREAYGSSSYVASI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS14 YSNTRDRYGRSWESYSSCGDFHYCDREHVCRKDQRNPPSLGRVLPDPREACGSSSYVASI
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB7 VDGGESRSEKGDSSRY
::::::::::::::::
CCDS14 VDGGESRSEKGDSSRY
490
>>CCDS35480.1 RBMY1D gene_id:378949|Hs108|chrY (496 aa)
initn: 3462 init1: 3462 opt: 3462 Z-score: 2165.4 bits: 410.2 E(32554): 2.7e-114
Smith-Waterman score: 3462; 99.0% identity (99.4% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVEADHPGKLFIGGLNRETNEKMLKAVFGKHGPISEVLLIKDRTSKSRGFAFITFENPAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MVEADHPGKLFIGGLNRETNEKMLKAVFGKHGPISEVLLIKDRTSKSRGFAFITFENPAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AKNAAKDMNGTSLHGKAIKVEQAKKPSFQSGGRRRPPASSRNRSPSGSLRSARGSSGGTR
:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS35 AKNAAKDMNGKSLHGKAIKVEQAKKPSFQSGGRRRPPASSRNRSPSGSLRSARGSRGGTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GWLPSHEGHLDDGGYTPDLKMSYSRGLIPVKRGPSSRSGGPPPKKSAPSAVARSNSWMGS
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GWLPSQEGHLDDGGYTPDLKMSYSRGLIPVKRGPSSRSGGPPPKKSAPSAVARSNSWMGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QGPMSQRRENYGVPPRRATISSWRNDRMSTRHDGYATNDGNHPSCQETRDYAPPSRGYAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QGPMSQRRENYGVPPRRATISSWRNDRMSTRHDGYATNDGNHPSCQETRDYAPPSRGYAY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RDNGHSNRDEHSSRGYRNHRSSRETRDYAPPSRGHAYRDYGHSRRDESYSRGYRNHRSSR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS35 RDNGHSNRDEHSSRGYRNHRSSRETRDYAPPSRGHAYRDYGHSRRDESYSRGYRNRRSSR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ETREYAPPSRGHGYRDYGHSRRHESYSRGYRNHPSSRETRDYAPPHRDYAYRDYGHSSWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ETREYAPPSRGHGYRDYGHSRRHESYSRGYRNHPSSRETRDYAPPHRDYAYRDYGHSSWD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EHSSRGYSYHDGYGEALGRDHSEHLSGSSYRDALQRYGTSHGAPPARGPRMSYGGSTCHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EHSSRGYSYHDGYGEALGRDHSEHLSGSSYRDALQRYGTSHGAPPARGPRMSYGGSTCHA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 YSNTRDRYGRSWESYSSCGDFHYCDREHVCRKDQRNPPSLGRVLPDPREAYGSSSYVASI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS35 YSNTRDRYGRSWESYSSCGDFHYCDREHVCRKDQRNPPSLGRVLPDPREACGSSSYVASI
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB7 VDGGESRSEKGDSSRY
::::::::::::::::
CCDS35 VDGGESRSEKGDSSRY
490
>>CCDS35481.1 RBMY1E gene_id:378950|Hs108|chrY (496 aa)
initn: 3458 init1: 3458 opt: 3458 Z-score: 2163.0 bits: 409.7 E(32554): 3.7e-114
Smith-Waterman score: 3458; 98.8% identity (99.4% similar) in 496 aa overlap (1-496:1-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVEADHPGKLFIGGLNRETNEKMLKAVFGKHGPISEVLLIKDRTSKSRGFAFITFENPAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MVEADHPGKLFIGGLNRETNEKMLKAVFGKHGPISEVLLIKDRTSKSRGFAFITFENPAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AKNAAKDMNGTSLHGKAIKVEQAKKPSFQSGGRRRPPASSRNRSPSGSLRSARGSSGGTR
:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS35 AKNAAKDMNGKSLHGKAIKVEQAKKPSFQSGGRRRPPASSRNRSPSGSLRSARGSRGGTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GWLPSHEGHLDDGGYTPDLKMSYSRGLIPVKRGPSSRSGGPPPKKSAPSAVARSNSWMGS
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GWLPSQEGHLDDGGYTPDLKMSYSRGLIPVKRGPSSRSGGPPPKKSAPSAVARSNSWMGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QGPMSQRRENYGVPPRRATISSWRNDRMSTRHDGYATNDGNHPSCQETRDYAPPSRGYAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QGPMSQRRENYGVPPRRATISSWRNDRMSTRHDGYATNDGNHPSCQETRDYAPPSRGYAY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RDNGHSNRDEHSSRGYRNHRSSRETRDYAPPSRGHAYRDYGHSRRDESYSRGYRNHRSSR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS35 RDNGHSNRDEHSSRGYRNHRSSRETRDYAPPSRGHAYRDYGHSRRDESYSRGYRNRRSSR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ETREYAPPSRGHGYRDYGHSRRHESYSRGYRNHPSSRETRDYAPPHRDYAYRDYGHSSWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ETREYAPPSRGHGYRDYGHSRRHESYSRGYRNHPSSRETRDYAPPHRDYAYRDYGHSSWD
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370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EHSSRGYSYHDGYGEALGRDHSEHLSGSSYRDALQRYGTSHGAPPARGPRMSYGGSTCHA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS35 EHSSRGYSYHDGYGEALGRDHSEHLSGSSYRDALQRYGTAHGAPPARGPRMSYGGSTCHA
370 380 390 400 410 420
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CCDS35 YSNTRDRYGRSWESYSSCGDFHYCDREHVCRKDQRNPPSLGRVLPDPREACGSSSYVASI
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490
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CCDS35 VDGGESRSEKGDSSRY
490
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10 20 30 40 50 60
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CCDS83 MVEADHPGKLFIGGLNRETNEKMLKAVFGKHGPISEVLLIKDRTSKSRGFAFITFENPAD
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:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS83 AKNAAKDMNGKSLHGKAIKVEQAKKPSFQSGGRRRPPASSRNRSPSGSLRSARGSRGGTR
70 80 90 100 110 120
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:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 GWLPSQEGHLDDGGYTPDLKMSYSRGLIPVKRGPSSRSGGPPPKKSAPSAVARSNSWMGS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 QGPMSQRRENYGVPPRRATISSWRNDRMSTRHDGYATNDGNHPSCQETRDYAPPSRGYAY
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS83 RDNGHSNRDEHSSRGYRNHRSSRETRDYAPPSRGHAYRDYGHSRRDESYSRGYRNRRSSR
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pF1KB7 ETREYAPPSRGHGYRDYGHSRRHESYSRGYRNHPSSRETRDYAPPHRDYAYRDYGHSSWD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ETREYAPPSRGHGYRDYGHSRRHESYSRGY------------------------------
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 -------SYHDGYGEALGRDHSEHLSGSSYRDALQRYGTSHGAPPARGPRMSYGGSTCHA
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pF1KB7 YSNTRDRYGRSWESYSSCGDFHYCDREHVCRKDQRNPPSLGRVLPDPREAYGSSSYVASI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS83 YSNTRDRYGRSWESYSSCGDFHYCDREHVCRKDQRNPPSLGRVLPDPREACGSSSYVASI
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490
pF1KB7 VDGGESRSEKGDSSRY
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CCDS83 VDGGESRSEKGDSSRY
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:::.::.:::: :: ::::::::: ::::.:: :: :: :.:.: .::..::.::::
CCDS14 DAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPSFESG-RRGPPPPPRSRGPPRGLRGGRGGSGGT
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pF1KB7 RGWLPSHEGHLDDGGYTPDLKMSYSRGLIPVKRGPSSRSGGPPPKKSAPSAVARSNSWMG
:: ::. ::.:::::. ...:: ::: .:::::: ::::::::.::::. .::.: ::
CCDS14 RGP-PSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPPPKRSAPSGPVRSSSGMG
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pF1KB7 SQGPMSQRRENYGVPPRRATISSWRNDRMSTRHDGYATNDGNHPSCQETRDYAPPSRGYA
...:.:. :..:: :::: . : :. .: : :::.:.:
CCDS14 GRAPVSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKD--------------------
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CCDS14 ------------------------------------------------SYSS--------
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pF1KB7 RETREYAPPSRGHGYRDYGHSRRHESYSRGYRNHPSSRETRDYAPPHRDYAYRDYGHSS-
::: ::::.::::::: :::.::::::::
CCDS14 ---------------RDY----------------PSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSS
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pF1KB7 WDEHSSRGYSYHDGYGEALGRDHSEHLSGSSYRDALQRYGTSHGAPPARGPRMSYGGSTC
:.. ::::: .::::. ::.:.: ::.::::. . ::.:..:::.::: :::::.
CCDS14 RDDYPSRGYSDRDGYGR--DRDYSDHPSGGSYRDSYESYGNSRSAPPTRGPPPSYGGSSR
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pF1KB7 HA-YSNTRDRYGRSWESYSSC-GDFHYCDREHVCRKDQRNPPSLGRVLPDPREAYGSSSY
. ::..:: :: : .:::: .:.. :..: :... :::. : : ::..:.:::
CCDS14 YDDYSSSRDGYGGSRDSYSSSRSDLYSSGRDRVGRQERGLPPSMERGYPPPRDSYSSSSR
310 320 330 340 350 360
480 490
pF1KB7 VASIVDG-GESRSEKGDS-SRY
: : : :::..: . :::
CCDS14 GAPRGGGRGGSRSDRGGGRSRY
370 380 390
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pF1KB7 MVEADHPGKLFIGGLNRETNEKMLKAVFGKHGPISEVLLIKDR-TSKSRGFAFITFENPA
:::::.:::::::::: ::::: :..::::.: : :::::::: :.:::::::.:::.::
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pF1KB7 DAKNAAKDMNGTSLHGKAIKVEQAKKPSFQSGGRRRPPASSRNRSPSGSLRSARGSSGGT
:::.::.:::: :: ::::::::: ::::. : :. :: :.:.: .. ..::.::::
CCDS71 DAKDAARDMNGKSLDGKAIKVEQATKPSFERG-RHGPPPPPRSRGPPRGFGAGRGGSGGT
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pF1KB7 RGWLPSHEGHLDDGGYTPDLKMSYSRGLIPVKRGPSSRSGGPPPKKSAPSAVARSNSWMG
:: ::. ::.:::::. ...:: ::: .:::::: ::::: ::.::::...::.: ::
CCDS71 RGP-PSRGGHMDDGGYSMNFNMSSSRGPLPVKRGPPPRSGGPSPKRSAPSGLVRSSSGMG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 SQGPMSQRRENYGVPPRRATISSWRNDRMSTRHDGYATNDGNHPSCQETRDYAPPSRGYA
...:.:. :..:: :::: . : :. .: : :::.:.:
CCDS71 GRAPLSRGRDSYGGPPRREPLPSRRDVYLSPRDDGYSTKD--------------------
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pF1KB7 YRDNGHSNRDEHSSRGYRNHRSSRETRDYAPPSRGHAYRDYGHSRRDESYSRGYRNHRSS
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CCDS71 ------------------------------------------------SYSS--------
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pF1KB7 RETREYAPPSRGHGYRDYGHSRRHESYSRGYRNHPSSRETRDYAPPHRDYAYRDYGHSS-
::: ::::.::::::: :::.::::::::
CCDS71 ---------------RDY----------------PSSRDTRDYAPPPRDYTYRDYGHSSS
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pF1KB7 WDEHSSRGYSYHDGYGEALGRDHSEHLSGSSYRDALQRYGTSHGAPPARGPRMSYGGSTC
:.. ::::. .::::. ::.:.: ::.::::. . ::.:..:: .::: :::::.
CCDS71 RDDYPSRGYGDRDGYGR--DRDYSDHPSGGSYRDSYESYGNSRSAPLTRGPPPSYGGSSR
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pF1KB7 HA-YSNTRDRYGRSWESYSSC-GDFHY-CDREHVCRKDQRNPPSLGRVLPDPREAYGSSS
. ::..:: :: : .:::: .:.. ::: : :... :::. : :. :..:.:::
CCDS71 YDDYSSSRDGYGGSRDSYSSSRSDLYSSCDR--VGRQERGLPPSVERGYPSSRDSYSSSS
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pF1KB7 YVASIVDG-GESRSEKGDS-SRY
: : : :::..: . :::
CCDS71 RGAPRGAGPGGSRSDRGGGRSRY
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CCDS77 MVEADRPGKLFIGGLNLETDEKALEAEFGKYGRIVEVLLMKDRETNKSRGFAFVTFESPA
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pF1KB7 DAKNAAKDMNGTSLHGKAIKVEQAKKPSFQSGGRRRPPASSRNRSPSGSLRSARGSSGGT
::: ::.:::: :: :::::: :: ::.:.:. : :: ::.: : ::..::..::
CCDS77 DAKAAARDMNGKSLDGKAIKVAQATKPAFESSRRGPPPPRSRGR-PR-FLRGTRGGGGGP
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pF1KB7 RGWLPSHEGHLDDGGYTPDLKMSYSRGLIPVKRGPSSRSGGPPPKKSAPSAVARSNSWMG
: ::. : :::::: :. . ::. .:.:::: : :::::..:::. ::: : :
CCDS77 RR-SPSRGGPDDDGGYTADFDLRPSRAPMPMKRGPPPRRVGPPPKRAAPSGPARS-SGGG
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pF1KB7 SQG-PMSQR-RENYGVPPRRATISSWRNDRMSTRHDGYATNDG-NHPSCQETRDYAPPSR
.: .. : :..:. :::: . :. .. : .::.. :: . . .: : .::
CCDS77 MRGRALAVRGRDGYSGPPRREPLPPRRDPYLGPRDEGYSSRDGYSSRDYREPRGFAPSPG
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 GYAYRDNGHSN-RDEHSSRGY--RNHRSSRETRDYAPP-SRG-H--AYRDYGHSRRDESY
:..:: :::. ::. ::: :. ..:. :::. ::: : ...::. : .
CCDS77 EYTHRDYGHSSVRDDCPLRGYSDRDGYGGRD-RDYGDHLSRGSHREPFESYGELR-GAAP
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 SRG----YRNHRSSRETREYAPPSRGHGYRDYGHSR-RHESYSRGYRNHPSSRETRDYA-
.:: : . .: : :.: . . : .:. : : . :::: : .: : .
CCDS77 GRGTPPSYGGGGRYEEYRGYSPDAYSGGRDSYSSSYGRSDRYSRGR--HRVGRPDRGLSL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KB7 ------PPHRDYAYRDYGHSSWDEHSSRGYSYHDGYGEALGRDHSEHLSGSSYRDALQRY
::.:: :
CCDS77 SMERGCPPQRDSYSRSGCRVPRGGGRLGGRLERGGGRSRY
360 370 380 390
496 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 07:52:50 2016 done: Fri Nov 4 07:52:50 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]