Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7421
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7421, 369 aa
1>>>pF1KB7421 369 - 369 aa - 369 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1655+/-0.000543; mu= 17.1034+/- 0.034
mean_var=96.3888+/-26.062, 0's: 0 Z-trim(106.8): 353 B-trim: 1750 in 2/49
Lambda= 0.130635
statistics sampled from 14314 (14864) to 14314 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.497), E-opt: 0.2 (0.174), width: 16
Scan time: 4.900
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 946 189.6 8.1e-48
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 946 189.6 8.1e-48
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 946 189.6 8.1e-48
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 894 179.8 7.1e-45
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 886 178.3 2.1e-44
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 882 177.6 3.4e-44
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 882 177.6 3.4e-44
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 878 176.8 5.8e-44
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 868 174.9 2.1e-43
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 862 173.8 4.7e-43
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 862 173.8 4.7e-43
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 862 173.8 4.8e-43
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 850 171.5 2.2e-42
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 848 171.2 2.9e-42
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 842 170.0 6.2e-42
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 828 167.4 4e-41
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 804 162.9 9.1e-40
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 775 157.4 4e-38
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 760 154.6 3e-37
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 691 141.6 2.3e-33
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 523 109.9 8.1e-24
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 519 109.2 1.4e-23
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 223 53.4 8.9e-07
XP_016884927 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 216 52.1 2.3e-06
NP_005287 (OMIM: 300086) lysophosphatidic acid rec ( 370) 216 52.1 2.3e-06
XP_006724702 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 216 52.1 2.3e-06
XP_016884926 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 216 52.1 2.3e-06
NP_001264929 (OMIM: 300086) lysophosphatidic acid ( 370) 216 52.1 2.3e-06
XP_005262183 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 216 52.1 2.3e-06
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 208 50.6 6e-06
XP_016882198 (OMIM: 603823) PREDICTED: free fatty ( 330) 200 49.1 1.8e-05
XP_016882199 (OMIM: 603823) PREDICTED: free fatty ( 330) 200 49.1 1.8e-05
NP_005297 (OMIM: 603823) free fatty acid receptor ( 330) 200 49.1 1.8e-05
XP_016882200 (OMIM: 603823) PREDICTED: free fatty ( 330) 200 49.1 1.8e-05
XP_011532064 (OMIM: 167055) PREDICTED: oxytocin re ( 389) 200 49.1 2e-05
NP_000907 (OMIM: 167055) oxytocin receptor [Homo s ( 389) 200 49.1 2e-05
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 200 49.2 2e-05
NP_065133 (OMIM: 606926) lysophosphatidic acid rec ( 372) 198 48.8 2.5e-05
NP_001136433 (OMIM: 606926) lysophosphatidic acid ( 372) 198 48.8 2.5e-05
NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413) 196 48.4 3.4e-05
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 194 48.0 3.9e-05
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 194 48.0 4.2e-05
NP_003848 (OMIM: 603691) galanin receptor type 2 [ ( 387) 194 48.0 4.3e-05
NP_005305 (OMIM: 305670) gastrin-releasing peptide ( 384) 191 47.4 6.3e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 189 47.0 7.3e-05
XP_011527129 (OMIM: 162651) PREDICTED: neurotensin ( 336) 188 46.8 8.5e-05
NP_003458 (OMIM: 162643,193670) C-X-C chemokine re ( 352) 188 46.8 8.8e-05
NP_001008540 (OMIM: 162643,193670) C-X-C chemokine ( 356) 188 46.8 8.9e-05
NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 188 46.9 9.3e-05
NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 188 46.9 9.3e-05
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 946; 44.9% identity (78.7% similar) in 301 aa overlap (60-360:10-310)
30 40 50 60 70 80
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XP_011 ILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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Smith-Waterman score: 946; 44.9% identity (78.7% similar) in 301 aa overlap (60-360:10-310)
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pF1KB7 LPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYNTSSTDFTFMGLFNRKETSGLIFAIISIIFFTAL
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NP_036 QLFFSLALGGIEFVLLAVMAYDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQ
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pF1KB7 ILTPMLNPLIYSLRNKDVTGALKRALGRFKGPQRVSGGVF
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NP_036 ILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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Smith-Waterman score: 946; 44.9% identity (78.7% similar) in 301 aa overlap (60-360:10-310)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 LPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYNTSSTDFTFMGLFNRKETSGLIFAIISIIFFTAL
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XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTV
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pF1KB7 ILTPMLNPLIYSLRNKDVTGALKRALGRFKGPQRVSGGVF
::::::::.:::::::.: :: .. : .:.:
XP_011 ILTPMLNPMIYSLRNKEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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pF1KB7 INSHVVILLPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYN-TSSTDFTFMGLFNRKETSGLIFAI
:.. : :. :.: ..:: . .: :.: .
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pF1KB7 ISIIFFTALMANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLLDQR
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..:.::.::..:: :.:. : :::.::.::. :: ::::.:. ::: :.: .. :
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pF1KB7 DKVLSVFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTGALKRALGRFKGPQRVSGGVF
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NP_003 EKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRNKDVKAALRKVATRNFP
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>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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pF1KB7 VILLPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYNTSSTDFTFMGLFNRK-ETSGLIFAIISIIF
: ..: .:.. . : ..:.: . :.
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pF1KB7 FTALMANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLLDQRTISFV
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::..: .... . :: :::. ::::::::::.::.:::.:..:. . :.::: :
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pF1KB7 GFLLTPITMSFPFCNSREINHFFCEAPAVLKLACADTALYETVMYVCCVLMLLIPFSVVL
. . : .:::::.. ..:::::..: ::::.::::::.: : .:...:: ..:
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pF1KB7 ASYARILTTVQCMSSVEGRKKAFATCSSHMTVVSLFYGAAMYTYMLPHSYHKPAQDKVLS
::.:: ... . :..:..:::.:::::. :::::: .. ::. :.: ..: . :.::
NP_835 CSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLS
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. ::..::::::.::::::..: .::.:.. .
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>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo (312 aa)
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pF1KB7 VVILLPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYNTSSTD-FTFMGLFNRKETSGLIFAIISII
: ::: : ..:. .. .:...
NP_009 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTS
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 FFTALMANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLLDQRTISF
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NP_009 YLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMYFFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISF
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
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NP_009 LDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLV
100 110 120 130 140 150
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pF1KB7 DGFLLTPITMSFPFCNSREINHFFCEAPAVLKLACADTALYETVMYVCCVLMLLIPFSVV
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NP_009 ESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLI
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pF1KB7 LASYARILTTVQCMSSVEGRKKAFATCSSHMTVVSLFYGAAMYTYMLPHSYHKPAQDKVL
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NP_009 LVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFF
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pF1KB7 SVFYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTGALKRALGRFKGPQRVSGGVF
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NP_009 GLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVTRAFRRLLGKEMGLTQS
280 290 300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 925 init1: 882 opt: 882 Z-score: 914.3 bits: 177.6 E(85289): 3.4e-44
Smith-Waterman score: 882; 44.2% identity (75.7% similar) in 301 aa overlap (57-357:7-307)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 VILLPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYNTSSTDFTFMGLFNRKETSGLIFAIISIIFF
:: :.:...:: . : . ..: .. .:.
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYT
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pF1KB7 TALMANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLLDQRTISFVG
....: ::.::. : .:::::::.:..::..:. .::.::::.. : ...::::.:
NP_003 LTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMYFFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAG
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pF1KB7 FLLTPITMSFPFCNSREINHFFCEAPAVLKLACADTALYETVMYVCCVLMLLIPFSVVLA
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NP_003 MVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCDSPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILS
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NP_003 SYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFSTCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASV
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pF1KB7 FYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTGALKRALGRFKGPQRVSGGVF
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NP_003 FYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
280 290 300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 858 init1: 828 opt: 878 Z-score: 910.2 bits: 176.8 E(85289): 5.8e-44
Smith-Waterman score: 878; 43.2% identity (75.3% similar) in 296 aa overlap (60-355:12-307)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 LPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYNTSSTDFTFMGLFNRKETSGLIFAIISIIFFTAL
:.: ..:. .: : . ..: .. .. :
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIIL
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pF1KB7 MANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLLDQRTISFVGCTA
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NP_006 IGNIGLMLLIRIDPHLQTPMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCAL
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pF1KB7 QHFLYLTLVGAEFFLLGLMAYDRYVAICNPLRYPVLMSRRVCWMIIAGSWFGGSLDGFLL
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NP_006 QFYFFCTFADTESFILAAMAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVH
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pF1KB7 TPITMSFPFCNSREINHFFCEAPAVLKLACADTALYETVMYVCCVLMLLIPFSVVLASYA
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NP_006 TSFAFILKYCDKNVINHFFCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYF
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pF1KB7 RILTTVQCMSSVEGRKKAFATCSSHMTVVSLFYGAAMYTYMLPHSYHKPAQDKVLSVFYT
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NP_006 FILLSVLKIRSFSGRKKTFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYT
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pF1KB7 ILTPMLNPLIYSLRNKDVTGALKRALGRFKGPQRVSGGVF
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NP_006 IFIPVLNPLIYSLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
290 300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 813 init1: 793 opt: 868 Z-score: 900.1 bits: 174.9 E(85289): 2.1e-43
Smith-Waterman score: 868; 41.8% identity (74.9% similar) in 299 aa overlap (57-355:7-305)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 VILLPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYNTSSTDFTFMGLFNRKETSGLIFAIISIIFF
...: : ..:. .: . ..:..: : ..
NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYL
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 TALMANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLLDQRTISFVG
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NP_001 LTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMYFFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMG
40 50 60 70 80 90
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pF1KB7 CTAQHFLYLTLVGAEFFLLGLMAYDRYVAICNPLRYPVLMSRRVCWMIIAGSWFGGSLDG
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NP_001 CAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAYDRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANS
100 110 120 130 140 150
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pF1KB7 FLLTPITMSFPFCNSREINHFFCEAPAVLKLACADTALYETVMYVCCVLMLLIPFSVVLA
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NP_001 LAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLREMPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILL
160 170 180 190 200 210
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pF1KB7 SYARILTTVQCMSSVEGRKKAFATCSSHMTVVSLFYGAAMYTYMLPHSYHKPAQDKVLSV
::. :. .: . :. ::.:::.::.::.:::::::: .: :: : . . : : .
NP_001 SYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGTCGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLML
220 230 240 250 260 270
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pF1KB7 FYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTGALKRALGRFKGPQRVSGGVF
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NP_001 FYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGALGRLLLGKRELGKE
280 290 300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 801 init1: 801 opt: 862 Z-score: 894.0 bits: 173.8 E(85289): 4.7e-43
Smith-Waterman score: 862; 41.2% identity (75.7% similar) in 301 aa overlap (57-357:7-307)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 VILLPWECYHLIWKILPYIGTTVGSMEEYNTSSTDFTFMGLFNRKETSGLIFAIISIIFF
.: ..: ..:: . . . :.:... ...
NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYL
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 TALMANGVMIFLIQTDLRLHTPMYFLLSHLSLIDMMYISTIVPKMLVNYLLDQRTISFVG
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NP_036 ATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCG
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pF1KB7 CTAQHFLYLTLVGAEFFLLGLMAYDRYVAICNPLRYPVLMSRRVCWMIIAGSWFGGSLDG
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NP_036 CLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAYDHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNV
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pF1KB7 FLLTPITMSFPFCNSREINHFFCEAPAVLKLACADTALYETVMYVCCVLMLLIPFSVVLA
.: : . . :: . :.::::.. .:::.:.:: : :... .:... :: .::
NP_036 LLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCDVTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILA
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pF1KB7 SYARILTTVQCMSSVEGRKKAFATCSSHMTVVSLFYGAAMYTYMLPHSYHKPAQDKVLSV
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NP_036 SYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATV
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360
pF1KB7 FYTILTPMLNPLIYSLRNKDVTGALKRALGRFKGPQRVSGGVF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]