Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7419
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7419, 318 aa
1>>>pF1KB7419 318 - 318 aa - 318 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4070+/-0.000626; mu= 21.3545+/- 0.039
mean_var=114.3855+/-31.413, 0's: 0 Z-trim(106.0): 301 B-trim: 897 in 1/49
Lambda= 0.119919
statistics sampled from 13763 (14160) to 13763 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.484), E-opt: 0.2 (0.166), width: 16
Scan time: 6.860
The best scores are: opt bits E(85289)
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XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 967 179.3 9.4e-45
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XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 864 161.4 2.2e-39
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 857 160.2 5.1e-39
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 846 158.3 1.9e-38
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 840 157.3 3.8e-38
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 840 157.3 3.8e-38
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 814 152.8 8.6e-37
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 683 130.1 5.7e-30
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 556 108.2 2.4e-23
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 539 105.2 1.8e-22
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NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 215 49.3 1.5e-05
NP_001305426 (OMIM: 165196) kappa-type opioid rece ( 409) 215 49.3 1.6e-05
XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 215 49.4 1.6e-05
XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 215 49.4 1.6e-05
XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 215 49.4 1.6e-05
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XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 215 49.4 1.6e-05
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 202 47.0 6.8e-05
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 201 46.8 7.7e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 196 45.9 0.00014
XP_005263091 (OMIM: 162642) PREDICTED: neuropeptid ( 381) 190 45.0 0.0003
XP_005263090 (OMIM: 162642) PREDICTED: neuropeptid ( 381) 190 45.0 0.0003
NP_000901 (OMIM: 162642) neuropeptide Y receptor t ( 381) 190 45.0 0.0003
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 188 44.7 0.00041
NP_001517 (OMIM: 602393) orexin receptor type 2 [H ( 444) 188 44.7 0.00042
XP_016866287 (OMIM: 602393) PREDICTED: orexin rece ( 461) 188 44.7 0.00043
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 182 43.6 0.00078
NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 181 43.3 0.00085
XP_016856596 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 389) 179 43.1 0.0011
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XP_016856595 (OMIM: 602392) PREDICTED: orexin rece ( 425) 179 43.1 0.0012
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 177 42.6 0.0013
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>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY
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pF1KB7 KDVKAAIKYLLSRKAINQ
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NP_036 KEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
300 310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY
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pF1KB7 FFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKRNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGMMAF
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pF1KB7 KDVKAAIKYLLSRKAINQ
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XP_011 KEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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pF1KB7 ILAVLKLACSDISVNIVTLAVSNIAFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKAFST
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pF1KB7 KDVKAAIKYLLSRKAINQ
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NP_009 KEVTRAFRRLLGKEMGLTQS
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>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY
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NP_003 FFLCNLSLADLCFSTNIVPQALVHLLSRKKVIAFTLCAARLLFFLIFGCTQCALLAVMSY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 DRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWLSGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHFLCE
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
130 140 150 160 170 180
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NP_003 APALLILASTDTHASEMAIFLMGVVILLIPVFLILVSYGRIIVTVVKMKSTVGSLKAFST
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSS--------KQQEKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRN
250 260 270 280 290
310
pF1KB7 KDVKAAIKYLLSRKAINQ
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NP_003 KDVKAALRKVATRNFP
300
>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
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Smith-Waterman score: 937; 46.2% identity (76.1% similar) in 301 aa overlap (4-304:2-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY
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XP_011 MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
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pF1KB7 FFLGNLSFLDICYTTSSIPSTLVSLISKKRNISFSGCAVQMFFGFAMGSTECFLLGMMAF
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XP_011 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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XP_011 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
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pF1KB7 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGKDNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYSLRN
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XP_011 CSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNP------YAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRN
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pF1KB7 KDVKAAIKYLLSRKAINQ
:. :
XP_011 KEQKRRGS
300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 907 init1: 797 opt: 930 Z-score: 889.9 bits: 172.8 E(85289): 7.9e-43
Smith-Waterman score: 930; 44.1% identity (78.1% similar) in 311 aa overlap (5-314:7-310)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGN-GVLIIASILDSRLHM
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10 20 30 40 50
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pF1KB7 MAFDRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWLSGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHF
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NP_006 MAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHF
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pF1KB7 LCEILAVLKLACSDISVNIVTLAVSNIAFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKA
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NP_006 FCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT
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pF1KB7 FSTCSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPKSQDLLGKDNLQATEGLVSMFYGVVTPMLNPIIYS
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NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRP---SYLYSPN---TDKIISVFYTIFIPVLNPLIYS
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pF1KB7 LRNKDVKAAIKYLLSRKAINQ
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NP_006 LRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 924; 44.5% identity (77.3% similar) in 317 aa overlap (1-314:1-308)
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pF1KB7 MDKINQTFVREFILLGLSGYPKLEIIFFALILVMYVVILIGNGVLIIASILDSRLHMPMY
: . : : . ::.::::. .:.::.: ..::.:.. ..:: .:. .::.:: :::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KB7 DRYVAICNPLRYPIIMNKVVYVLLTSVSWLSGGINSTVQTSLAMRWPFCGNNIINHFLCE
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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NP_003 LRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
300 310
>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho (314 aa)
initn: 969 init1: 801 opt: 919 Z-score: 879.6 bits: 170.9 E(85289): 3e-42
Smith-Waterman score: 919; 43.8% identity (77.2% similar) in 320 aa overlap (1-318:1-313)
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NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
10 20 30 40 50 60
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NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
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pF1KB7 ILAVLKLAC-SDISVNIVTLAVSNIAFLVLPLLVIFFSYMFILYTILRTNSATGRHKAFS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]