Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7297
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7297, 1226 aa
1>>>pF1KB7297 1226 - 1226 aa - 1226 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6647+/-0.00111; mu= 4.7009+/- 0.067
mean_var=329.4787+/-66.426, 0's: 0 Z-trim(113.1): 85 B-trim: 128 in 1/54
Lambda= 0.070658
statistics sampled from 13683 (13766) to 13683 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.423), width: 16
Scan time: 4.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7307.1 ADAMTS14 gene_id:140766|Hs108|chr10 (1226) 8832 915.4 0
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CCDS3553.1 ADAMTS3 gene_id:9508|Hs108|chr4 (1205) 4445 468.2 5.4e-131
CCDS4444.1 ADAMTS2 gene_id:9509|Hs108|chr5 (1211) 4192 442.4 3.2e-123
CCDS34311.1 ADAMTS2 gene_id:9509|Hs108|chr5 ( 566) 2132 232.1 3.1e-60
CCDS31778.2 ADAMTS20 gene_id:80070|Hs108|chr12 (1910) 1517 170.0 5.3e-41
CCDS2903.1 ADAMTS9 gene_id:56999|Hs108|chr3 (1935) 1503 168.5 1.4e-40
CCDS82801.1 ADAMTS9 gene_id:56999|Hs108|chr3 (1907) 1419 160.0 5.4e-38
CCDS32303.1 ADAMTS7 gene_id:11173|Hs108|chr15 (1686) 1399 157.9 2e-37
CCDS33524.1 ADAMTS1 gene_id:9510|Hs108|chr21 ( 967) 1381 155.8 4.9e-37
CCDS10926.1 ADAMTS18 gene_id:170692|Hs108|chr16 (1221) 1312 148.8 7.6e-35
CCDS34140.1 ADAMTS12 gene_id:81792|Hs108|chr5 (1594) 1301 147.8 2e-34
CCDS43299.1 ADAMTS16 gene_id:170690|Hs108|chr5 (1224) 1279 145.5 7.8e-34
CCDS13579.1 ADAMTS5 gene_id:11096|Hs108|chr21 ( 930) 1237 141.1 1.3e-32
CCDS8488.1 ADAMTS15 gene_id:170689|Hs108|chr11 ( 950) 1211 138.4 8e-32
CCDS1223.1 ADAMTS4 gene_id:9507|Hs108|chr1 ( 837) 1187 135.9 4e-31
CCDS3983.2 ADAMTS6 gene_id:11174|Hs108|chr5 (1117) 1116 128.8 7.4e-29
CCDS12206.1 ADAMTS10 gene_id:81794|Hs108|chr19 (1103) 1047 121.8 9.6e-27
CCDS6972.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1371) 997 116.8 3.8e-25
CCDS6970.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1427) 997 116.8 3.9e-25
CCDS4146.1 ADAMTS19 gene_id:171019|Hs108|chr5 (1207) 937 110.6 2.4e-23
CCDS10383.1 ADAMTS17 gene_id:170691|Hs108|chr15 (1095) 905 107.3 2.2e-22
CCDS41732.1 ADAMTS8 gene_id:11095|Hs108|chr11 ( 889) 900 106.7 2.7e-22
CCDS6971.1 ADAMTS13 gene_id:11093|Hs108|chr9 (1340) 758 92.4 8.1e-18
CCDS6485.1 ADAMTSL1 gene_id:92949|Hs108|chr9 ( 525) 625 78.4 5.1e-14
CCDS73773.1 ADAMTSL3 gene_id:57188|Hs108|chr15 (1682) 629 79.4 8.6e-14
CCDS10326.1 ADAMTSL3 gene_id:57188|Hs108|chr15 (1691) 629 79.4 8.6e-14
CCDS6976.1 ADAMTSL2 gene_id:9719|Hs108|chr9 ( 951) 602 76.4 3.9e-13
>>CCDS7307.1 ADAMTS14 gene_id:140766|Hs108|chr10 (1226 aa)
initn: 8832 init1: 8832 opt: 8832 Z-score: 4882.0 bits: 915.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8832; 100.0% identity (100.0% similar) in 1226 aa overlap (1-1226:1-1226)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MAPLRALLSYLLPLHCALCAAAGSRTPELHLSGKLSDYGVTVPCSTDFRGRFLSHVVSGP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AAASAGSMVVDTPPTLPRHSSHLRVARSPLHPGGTLWPGRVGRHSLYFNVTVFGKELHLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LRPNRRLVVPGSSVEWQEDFRELFRQPLRQECVYTGGVTGMPGAAVAISNCDGLAGLIRT
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DSTDFFIEPLERGQQEKEASGRTHVVYRREAVQQEWAEPDGDLHNEAFGLGDLPNLLGLV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GDQLGDTERKRRHAKPGSYSIEVLLVVDDSVVRFHGKEHVQNYVLTLMNIVDEIYHDESL
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GVHINIALVRLIMVGYRQSLSLIERGNPSRSLEQVCRWAHSQQRQDPSHAEHHDHVVFLT
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CCDS73 RQDFGPSGMQGYAPVTGMCHPLRSCALNHEDGFSSAFVIAHETGHVLGMEHDGQGNGCAD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ETSLGSVMAPLVQAAFHRFHWSRCSKLELSRYLPSYDCLLDDPFDPAWPQPPELPGINYS
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pF1KB7 MDEQCRFDFGSGYQTCLAFRTFEPCKQLWCSHPDNPYFCKTKKGPPLDGTECAPGKWCFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MDEQCRFDFGSGYQTCLAFRTFEPCKQLWCSHPDNPYFCKTKKGPPLDGTECAPGKWCFK
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pF1KB7 GHCIWKSPEQTYGQDGGWSSWTKFGSCSRSCGGGVRSRSRSCNNPSPAYGGRLCLGPMFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GHCIWKSPEQTYGQDGGWSSWTKFGSCSRSCGGGVRSRSRSCNNPSPAYGGRLCLGPMFE
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610 620 630 640 650 660
pF1KB7 YQVCNSEECPGTYEDFRAQQCAKRNSYYVHQNAKHSWVPYEPDDDAQKCELICQSADTGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YQVCNSEECPGTYEDFRAQQCAKRNSYYVHQNAKHSWVPYEPDDDAQKCELICQSADTGD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FTAMGLEWEDAVEDAKESLKTSGPLPEAIAILALPPTEGGPRSSLAYKYVIHEDLLPLIG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SNNVLLEEMDTYEWALKSWAPCSKACGGGIQFTKYGCRRRRDHHMVQRHLCDHKKRPKPI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB7 LPACGGNHQNSTVRADVWELGTPEGQWVPQSEPLHPINKISSTEPCTGDRSVFCQMEVLD
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pF1KB7 RYCSIPGYHRLCCVSCIKKASGPNPGPDPGPTSLPPFSTPGSPLPGPQDPADAAEPPGKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RYCSIPGYHRLCCVSCIKKASGPNPGPDPGPTSLPPFSTPGSPLPGPQDPADAAEPPGKP
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1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB7 TGSEDHQHGRATQLPGALDTSSPGTQHPFAPETPIPGASWSISPTTPGGLPWGWTQTPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TGSEDHQHGRATQLPGALDTSSPGTQHPFAPETPIPGASWSISPTTPGGLPWGWTQTPTP
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1210 1220
pF1KB7 VPEDKGQPGEDLRHPGTSLPAASPVT
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CCDS73 VPEDKGQPGEDLRHPGTSLPAASPVT
1210 1220
>>CCDS7306.1 ADAMTS14 gene_id:140766|Hs108|chr10 (1223 aa)
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Smith-Waterman score: 8794; 99.8% identity (99.8% similar) in 1226 aa overlap (1-1226:1-1223)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAPLRALLSYLLPLHCALCAAAGSRTPELHLSGKLSDYGVTVPCSTDFRGRFLSHVVSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB7 GVHINIALVRLIMVGYRQSLSLIERGNPSRSLEQVCRWAHSQQRQDPSHAEHHDHVVFLT
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pF1KB7 RQDFGPSGMQGYAPVTGMCHPLRSCALNHEDGFSSAFVIAHETGHVLGMEHDGQGNGCAD
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB7 ETSLGSVMAPLVQAAFHRFHWSRCSKLELSRYLPSYDCLLDDPFDPAWPQPPELPGINYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS73 VVFMNQVVHDGTRCSYRDPYSVCARGECVPVGCDKEVGSMKADDKCGVCGGDNSHCRTVK
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CCDS73 GTLGKASKQAGALKLVQIPAGARHIQIEALEKSPHRIVVKNQVTGSFILNPKGKEATSRT
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790 800 810 820 830 840
pF1KB7 FTAMGLEWEDAVEDAKESLKTSGPLPEAIAILALPPTEGGPRSSLAYKYVIHEDLLPLIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FTAMGLEWEDAVEDAKESLKTSGPLPEAIAILALPPTEGGPRSSLAYKYVIHEDLLPLIG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SNNVLLEEMDTYEWALKSWAPCSKACGGGIQFTKYGCRRRRDHHMVQRHLCDHKKRPKPI
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CCDS73 RRRCNQHPCSQPVWVTEEWGACSRSCGKLGVQTRGIQCLLPLSNGTHKVMPAKACAGDRP
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pF1KB7 EARRPCLRVPCPAQWRLGAWSQCSATCGEGIQQRQVVCRTNANSLGHCEGDRPDTVQVCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EARRPCLRVPCPAQWRLGAWSQCSATCGEGIQQRQVVCRTNANSLGHCEGDRPDTVQVCS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LPACGGNHQNSTVRADVWELGTPEGQWVPQSEPLHPINKISSTEPCTGDRSVFCQMEVLD
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pF1KB7 RYCSIPGYHRLCCVSCIKKASGPNPGPDPGPTSLPPFSTPGSPLPGPQDPADAAEPPGKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 RYCSIPGYHRLCCVSCIKKASGPNPGPDPGPTSLPPFSTPGSPLPGPQDPADAAEPPGKP
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pF1KB7 TGSEDHQHGRATQLPGALDTSSPGTQHPFAPETPIPGASWSISPTTPGGLPWGWTQTPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TGSEDHQHGRATQLPGALDTSSPGTQHPFAPETPIPGASWSISPTTPGGLPWGWTQTPTP
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1210 1220
pF1KB7 VPEDKGQPGEDLRHPGTSLPAASPVT
::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VPEDKGQPGEDLRHPGTSLPAASPVT
1200 1210 1220
>>CCDS3553.1 ADAMTS3 gene_id:9508|Hs108|chr4 (1205 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 LRALLSYLLPLHCALCAAAGSRTPELHLSGKLSDYGVTVPCSTDFRGRFLSHVVSGPAAA
. .: ...: ::...::.:::..: :
CCDS35 LIAAALVEVRTSADGQAGNEEMVQIDLPIKRYREYELVTPVSTNLEGRYLSHTLS----A
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 SAGSMVVDTPPTLPRHSSHLRVARSPLHPGGTLWPGRVGRHSLYFNVTVFGKELHLRLRP
: .. : :. .: ..:.::.:.:::..::::.:
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70 80 90
130 140 150 160
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: .::.::. :::.: .: .::. .:.:.: .. .::
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100 110 120 130 140 150
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..:::::::::::.:..:. ..::::::::.: .: .:: ::::.: ::.: . . :.
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: .. :: :: .. : . .::..: :.:::: ..:.::::: ::::::::::::::
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.:::.: .:.:::::..:::::::::.::::::::::::::.:::.::::::::::::.:
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:::::::::::::::: :.:::..::::::::::::::.:::::: ::.::. ::::::
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.:::: : ::. : : ::::.::.::: .:::::::: .:::.. .::.:: :.::
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: : ..:.: ::: .::::..:.:.:::::.:::.::::.:.::::: ::::::.::
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::.:: .::: ::.:: :::: .:.::. .:: :::.:.::: . . .: .: :.
CCDS35 NQATGHYILNGKGEEAKSRTFIDLGVEWDYNIEDDIESLHTDGPLHDPVIVLIIPQ-END
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::::.:::.:::: .: :.::::. ::.::.:::::::. ::: ::::.:.:::::::.
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:..::.: .:. .:.:::::: :: . :..:.::.::: :...::. : : : ..::
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CCDS35 G----DHCDGEKPESVRACQLPPC------------------------------------
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. ::: ::.:.::::::: ::::::::..::: :: :..: : : : :
CCDS35 -NDEPCLGDKSIFCQMEVLARYCSIPGYNKLCCESCSKRSS-----TLPPPYLLEAAETH
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pF1KB7 GSPLPGPQD-PADAAEPPGK-PTGSEDHQHGRATQLPGALDTSSPGTQHPFAPETPIPGA
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.
CCDS35 NLRQRSAQQAGSKTVRLVTVPSSPPTKRVHLSSASQMAAASFFAASDSIGASSQARTSKK
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CCDS44 CRTADDSFGICQEERPETARTCRLGPCPRNISDPSKKSYVV-------QWLSRPDPDSPI
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CCDS44 RKISSKGHCQGDKSIFCRMEVLSRYCSIPGYNKLCCKSCNLYNNLTNVEGRIEPPPGKHN
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.: . .: . :.:. : .. .. ...::: . :.. : . .
CCDS44 DIDVFMPTLPVPTVAMEVRPSPSTPLEVPLNASSTNATEDHPETNAVDEPYKIHGLEDEV
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CCDS44 QPPNLIPRRPSPYEKTRNQRIQELIDEMRKKEMLGKF
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CCDS34 EASSVALSNCDGLAGLIRMEEEEFFIEPLEKGLAAQEAEQGRVHVVYRRPPTSPPLGGPQ
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CCDS34 CKTKKGPPLDGTMCAPGK--FRPGAVAHACYPSTLGGQGRWIA
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pF1KB7 RSRSCNNPSPAYGGRLCLGPMFEYQVCNSEECPGTYEDFRAQQCAKRNSYYVHQNAKHSW
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pF1KB7 PRHSSHLRVARSPLHPGGTLWPGRVGRHSLYFNVTVFGKELHLRLRPNRRLVVPG-SSVE
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CCDS31 NEFGEVFPQSHHFSRQKRSSEALEPMPFRTHYRFTAYGQLFQLNLTADASFLAAGYTEVH
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