Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7219
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7219, 320 aa
1>>>pF1KB7219 320 - 320 aa - 320 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1184+/-0.000664; mu= 17.1022+/- 0.041
mean_var=125.0094+/-38.608, 0's: 0 Z-trim(104.9): 319 B-trim: 901 in 1/48
Lambda= 0.114710
statistics sampled from 12710 (13184) to 12710 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.466), E-opt: 0.2 (0.155), width: 16
Scan time: 6.800
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 975 173.8 4.1e-43
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 975 173.8 4.1e-43
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 975 173.8 4.1e-43
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 946 169.0 1.1e-41
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 942 168.3 1.8e-41
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 941 168.2 2e-41
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 929 166.2 8.1e-41
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 928 166.0 8.8e-41
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 907 162.5 1e-39
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 904 162.0 1.4e-39
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 904 162.0 1.4e-39
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 904 162.1 1.4e-39
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 883 158.6 1.6e-38
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 882 158.4 1.8e-38
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 881 158.3 2e-38
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 844 152.1 1.4e-36
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 822 148.5 1.7e-35
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 809 146.3 7.6e-35
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 807 146.0 9.5e-35
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 667 122.8 9e-28
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 613 113.9 4.5e-25
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 602 112.1 1.6e-24
NP_057624 (OMIM: 605569) probable G-protein couple ( 423) 217 48.5 2.8e-05
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325) 206 46.6 8.6e-05
XP_005263090 (OMIM: 162642) PREDICTED: neuropeptid ( 381) 205 46.5 0.00011
XP_005263091 (OMIM: 162642) PREDICTED: neuropeptid ( 381) 205 46.5 0.00011
NP_000901 (OMIM: 162642) neuropeptide Y receptor t ( 381) 205 46.5 0.00011
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 199 45.4 0.00019
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 198 45.3 0.00022
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359) 198 45.3 0.00023
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NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor ( 397) 198 45.3 0.00024
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 197 45.1 0.00025
XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 198 45.4 0.00025
XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 198 45.4 0.00025
XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 198 45.4 0.00025
XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 198 45.4 0.00025
XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422) 198 45.4 0.00025
NP_005305 (OMIM: 305670) gastrin-releasing peptide ( 384) 197 45.2 0.00027
NP_005287 (OMIM: 300086) lysophosphatidic acid rec ( 370) 195 44.8 0.00033
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XP_005262183 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 195 44.8 0.00033
NP_001264929 (OMIM: 300086) lysophosphatidic acid ( 370) 195 44.8 0.00033
XP_016884926 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 195 44.8 0.00033
XP_006724702 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 195 44.8 0.00033
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 194 44.7 0.0004
NP_002377 (OMIM: 155555,203200,266300,613098,61309 ( 317) 188 43.6 0.00067
NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 189 43.9 0.00068
NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 185 43.1 0.001
NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 185 43.1 0.001
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
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pF1KB7 ILAILKLACADISINVISMTGSNLIVLVIPLLVISISYIFIVATILRIPSTEGKHKAFST
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pF1KB7 KDVKAAVKNILCRKNFSDGK
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NP_036 KEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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pF1KB7 MERTNDSTSTEFFLVGLSAHPKLQTVFFVLILWMYLMILLGNGVLISVIIFDSHLHTPMY
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pF1KB7 KDVKAAVKNILCRKNFSDGK
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XP_011 KEVKGAWQKLLWKFSGLTSKLAT
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>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
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pF1KB7 MERTNDSTSTEFFLVGLSAHPKLQTVFFVLILWMYLMILLGNGVLISVIIFDSHLHT
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pF1KB7 PMYFFLCNLSFLDVCYTSSSVPLILASFLAVKKKVSFSGCMVQMFISFAMGATECMILGT
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>>NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [Homo (308 aa)
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pF1KB7 MERTNDSTSTEFFLVGLSAHPKLQTVFFVLILWMYLMILLGNGVLISVIIFDSHLHTPMY
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pF1KB7 FFLCNLSFLDVCYTSSSVPLILASFLAVKKKVSFSGCMVQMFISFAMGATECMILGTMAL
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NP_003 DRYVAICNPLRYPNIMTWKVCVQLATGSWTSGILVSVVDTTFILRLPYRGSNSIAHFFCE
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pF1KB7 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPESKASVDSGNEDIIEALISLFYGVMTPMLNPLIYSLRN
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NP_003 CGSHLMVVILFYGSAIITYMTPKSSKQQ--------EKSVSVFYAIVTPMLNPLIYSLRN
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pF1KB7 KDVKAAVKNILCRKNFSDGK
::::::.... : ::
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pF1KB7 MERTNDSTSTEFFLVGLSAHPKLQTVFFVLILWMYLMILLGNGVLISVIIFDSHLHTPMY
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300 310
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NP_003 SLRSKEVKKALANVISRKRTSSFL
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>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep (300 aa)
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Smith-Waterman score: 928; 45.7% identity (76.7% similar) in 300 aa overlap (5-304:3-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MERTNDSTSTEFFLVGLSAHPKLQTVFFVLILWMYLMILLGNGVLISVIIFDSHLHTPMY
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pF1KB7 FFLCNLSFLDVCYTSSSVPLILASFLAVKKKVSFSGCMVQMFISFAMGATECMILGTMAL
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XP_011 FFLSNLSFLDLCFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVMAF
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XP_011 DRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFVCE
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pF1KB7 ILAILKLACADISINVISMTGSNLIVLVIPLLVISISYIFIVATILRIPSTEGKHKAFST
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XP_011 VPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAFGT
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pF1KB7 CSAHLTVVIIFYGTIFFMYAKPESKASVDSGNEDIIEALISLFYGVMTPMLNPLIYSLRN
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pF1KB7 KDVKAAVKNILCRKNFSDGK
:. :
XP_011 KEQKRRGS
300
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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pF1KB7 MERT--NDSTSTEFFLVGLSAHPKLQTVFFVLILWMYLMILLGNGVLISVIIFDSHLHTP
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
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pF1KB7 CEILAILKLACADISIN--VISMTGSNLIVLVIPLLVISISYIFIVATILRIPSTEGKHK
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSS--VEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKK
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pF1KB7 SLRNKDVKAAVKNILCRKNFSDGK
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NP_006 SLRNKDVKDAAEKVLRSKVDSS
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>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 930 init1: 786 opt: 904 Z-score: 831.5 bits: 162.0 E(85289): 1.4e-39
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10 20 30 40 50 60
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XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
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pF1KB7 FFLCNLSFLDVCYTSSSVPLILASFLAVKKKVSFSGCMVQMFISFAMGATECMILGTMAL
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KB7 ILAILKLACADISINVISMTGSNLIVLVIPLLVISISYIFIVATILRIPSTEGKHKAFST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]