Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7199
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7199, 467 aa
1>>>pF1KB7199 467 - 467 aa - 467 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1707+/-0.00108; mu= 0.3693+/- 0.063
mean_var=294.7408+/-66.010, 0's: 0 Z-trim(113.1): 784 B-trim: 869 in 2/48
Lambda= 0.074706
statistics sampled from 12883 (13789) to 12883 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.752), E-opt: 0.2 (0.424), width: 16
Scan time: 2.920
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14663.1 ZIC3 gene_id:7547|Hs108|chrX ( 467) 3303 369.7 3.7e-102
CCDS83494.1 ZIC3 gene_id:7547|Hs108|chrX ( 457) 2912 327.5 1.8e-89
CCDS3136.1 ZIC1 gene_id:7545|Hs108|chr3 ( 447) 1790 206.6 4.4e-53
CCDS9495.1 ZIC2 gene_id:7546|Hs108|chr13 ( 532) 1720 199.1 9.2e-51
CCDS43160.1 ZIC4 gene_id:84107|Hs108|chr3 ( 334) 1346 158.6 9.1e-39
CCDS54653.1 ZIC4 gene_id:84107|Hs108|chr3 ( 372) 1346 158.7 9.8e-39
CCDS54652.1 ZIC4 gene_id:84107|Hs108|chr3 ( 384) 1346 158.7 1e-38
CCDS9494.2 ZIC5 gene_id:85416|Hs108|chr13 ( 663) 1007 122.4 1.5e-27
CCDS33283.1 GLI2 gene_id:2736|Hs108|chr2 (1586) 603 79.2 3.4e-14
CCDS5465.1 GLI3 gene_id:2737|Hs108|chr7 (1580) 600 78.9 4.2e-14
CCDS6451.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 ( 775) 583 76.8 9.2e-14
CCDS43784.1 GLIS3 gene_id:169792|Hs108|chr9 ( 930) 583 76.8 1e-13
CCDS53806.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1065) 577 76.3 1.8e-13
CCDS53807.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 ( 978) 576 76.1 1.8e-13
CCDS8940.1 GLI1 gene_id:2735|Hs108|chr12 (1106) 577 76.3 1.8e-13
CCDS582.1 GLIS1 gene_id:148979|Hs108|chr1 ( 620) 554 73.5 6.9e-13
>>CCDS14663.1 ZIC3 gene_id:7547|Hs108|chrX (467 aa)
initn: 3303 init1: 3303 opt: 3303 Z-score: 1947.6 bits: 369.7 E(32554): 3.7e-102
Smith-Waterman score: 3303; 100.0% identity (100.0% similar) in 467 aa overlap (1-467:1-467)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MTMLLDGGPQFPGLGVGSFGAPRHHEMPNREPAGMGLNPFGDSTHAAAAAAAAAAFKLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MTMLLDGGPQFPGLGVGSFGAPRHHEMPNREPAGMGLNPFGDSTHAAAAAAAAAAFKLSP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AAAHDLSSGQSSAFTPQGSGYANALGHHHHHHHHHHHTSQVPSYGGAASAAFNSTREFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AAAHDLSSGQSSAFTPQGSGYANALGHHHHHHHHHHHTSQVPSYGGAASAAFNSTREFLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RQRSSGLSEAASGGGQHGLFAGSASSLHAPAGIPEPPSYLLFPGLHEQGAGHPSPTGHVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RQRSSGLSEAASGGGQHGLFAGSASSLHAPAGIPEPPSYLLFPGLHEQGAGHPSPTGHVD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 NNQVHLGLRGELFGRADPYRPVASPRTDPYAAGAQFPNYSPMNMNMGVNVAAHHGPGAFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NNQVHLGLRGELFGRADPYRPVASPRTDPYAAGAQFPNYSPMNMNMGVNVAAHHGPGAFF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RYMRQPIKQELSCKWIDEAQLSRPKKSCDRTFSTMHELVTHVTMEHVGGPEQNNHVCYWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RYMRQPIKQELSCKWIDEAQLSRPKKSCDRTFSTMHELVTHVTMEHVGGPEQNNHVCYWE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ECPREGKSFKAKYKLVNHIRVHTGEKPFPCPFPGCGKIFARSENLKIHKRTHTGEKPFKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ECPREGKSFKAKYKLVNHIRVHTGEKPFPCPFPGCGKIFARSENLKIHKRTHTGEKPFKC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EFEGCDRRFANSSDRKKHMHVHTSDKPYICKVCDKSYTHPSSLRKHMKVHESQGSDSSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EFEGCDRRFANSSDRKKHMHVHTSDKPYICKVCDKSYTHPSSLRKHMKVHESQGSDSSPA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB7 ASSGYESSTPPAIASANSKDTTKTPSAVQTSTSHNPGLPPNFNEWYV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ASSGYESSTPPAIASANSKDTTKTPSAVQTSTSHNPGLPPNFNEWYV
430 440 450 460
>>CCDS83494.1 ZIC3 gene_id:7547|Hs108|chrX (457 aa)
initn: 2912 init1: 2912 opt: 2912 Z-score: 1719.9 bits: 327.5 E(32554): 1.8e-89
Smith-Waterman score: 2912; 100.0% identity (100.0% similar) in 408 aa overlap (1-408:1-408)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MTMLLDGGPQFPGLGVGSFGAPRHHEMPNREPAGMGLNPFGDSTHAAAAAAAAAAFKLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MTMLLDGGPQFPGLGVGSFGAPRHHEMPNREPAGMGLNPFGDSTHAAAAAAAAAAFKLSP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AAAHDLSSGQSSAFTPQGSGYANALGHHHHHHHHHHHTSQVPSYGGAASAAFNSTREFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 AAAHDLSSGQSSAFTPQGSGYANALGHHHHHHHHHHHTSQVPSYGGAASAAFNSTREFLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RQRSSGLSEAASGGGQHGLFAGSASSLHAPAGIPEPPSYLLFPGLHEQGAGHPSPTGHVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RQRSSGLSEAASGGGQHGLFAGSASSLHAPAGIPEPPSYLLFPGLHEQGAGHPSPTGHVD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 NNQVHLGLRGELFGRADPYRPVASPRTDPYAAGAQFPNYSPMNMNMGVNVAAHHGPGAFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 NNQVHLGLRGELFGRADPYRPVASPRTDPYAAGAQFPNYSPMNMNMGVNVAAHHGPGAFF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RYMRQPIKQELSCKWIDEAQLSRPKKSCDRTFSTMHELVTHVTMEHVGGPEQNNHVCYWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RYMRQPIKQELSCKWIDEAQLSRPKKSCDRTFSTMHELVTHVTMEHVGGPEQNNHVCYWE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ECPREGKSFKAKYKLVNHIRVHTGEKPFPCPFPGCGKIFARSENLKIHKRTHTGEKPFKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ECPREGKSFKAKYKLVNHIRVHTGEKPFPCPFPGCGKIFARSENLKIHKRTHTGEKPFKC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 EFEGCDRRFANSSDRKKHMHVHTSDKPYICKVCDKSYTHPSSLRKHMKVHESQGSDSSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EFEGCDRRFANSSDRKKHMHVHTSDKPYICKVCDKSYTHPSSLRKHMKCCPAWYPGQSLI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB7 ASSGYESSTPPAIASANSKDTTKTPSAVQTSTSHNPGLPPNFNEWYV
CCDS83 PDEELDTDVGMQQPALHNTTYPKCRVNAEPTVQEMIY
430 440 450
>>CCDS3136.1 ZIC1 gene_id:7545|Hs108|chr3 (447 aa)
initn: 1851 init1: 1275 opt: 1790 Z-score: 1066.5 bits: 206.6 E(32554): 4.4e-53
Smith-Waterman score: 2017; 64.5% identity (81.9% similar) in 476 aa overlap (3-467:1-447)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MTMLLDGGPQFPGLGVGSFGAPRHH---EMPNREPAGMGLNPFGDSTHAAAAAAAAAAFK
::::.:::.:..:: .::: ::: .. .:. .:.:.:::.:. .:::
CCDS31 MLLDAGPQYPAIGVTTFGASRHHSAGDVAERD-VGLGINPFADGM---------GAFK
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LSPAAAHDLSSGQSSAFTPQGSGYANA--LGHHHHHHHHHHHTSQVPSYGGAASAAFNST
:.:.. :.:.:. ..::: :. ::: : :::::: : : :: .:::::::
CCDS31 LNPSS-HELASAGQTAFTSQAPGYAAAAALGHHHHPGH-------VGSY---SSAAFNST
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 REFLFRQRSSGLSEAASGGGQHGLFAGSASSLHAPAGIPEPPSYLLFPGLHEQGAGHPSP
:.::::.:. : . ::....::.:::.::... .: : . ..:::::::::.::: ::
CCDS31 RDFLFRNRGFG-DAAAAASAQHSLFAASAGGFGGPHGHTDAAGHLLFPGLHEQAAGHASP
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 TGHVDNNQVHLGLRGELFGRADPYRPVASPRTDPYAAGAQFPNYSPMNMNMGVNVAAHHG
.: :.:..::. :... : . : :.:::.. ::: :. .:.:::.:: :::::
CCDS31 --NVVNGQMRLGFSGDMYPRPEQYGQVTSPRSEHYAA-PQLHGYGPMNVNM----AAHHG
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PGAFFRYMRQPIKQELSCKWIDEAQLSRPKKSCDRTFSTMHELVTHVTMEHVGGPEQNNH
::::::::::::::: ::::. ::. :::::..:::::::::::::.::::::::.::
CCDS31 AGAFFRYMRQPIKQELICKWIEPEQLANPKKSCNKTFSTMHELVTHVTVEHVGGPEQSNH
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 VCYWEECPREGKSFKAKYKLVNHIRVHTGEKPFPCPFPGCGKIFARSENLKIHKRTHTGE
.:.::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS31 ICFWEECPREGKPFKAKYKLVNHIRVHTGEKPFPCPFPGCGKVFARSENLKIHKRTHTGE
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 KPFKCEFEGCDRRFANSSDRKKHMHVHTSDKPYICKVCDKSYTHPSSLRKHMKVHES--Q
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::: :
CCDS31 KPFKCEFEGCDRRFANSSDRKKHMHVHTSDKPYLCKMCDKSYTHPSSLRKHMKVHESSSQ
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460
pF1KB7 GSDSSPAASSGYESSTPPAIASANSKD-TTKTPSAVQTSTSHNPG---LPPNFNEWYV
::. ::::::::::::::.:.: .. . ::.. : .... :. : : :::::::
CCDS31 GSQPSPAASSGYESSTPPTIVSPSTDNPTTSSLSPSSSAVHHTAGHSALSSNFNEWYV
390 400 410 420 430 440
>>CCDS9495.1 ZIC2 gene_id:7546|Hs108|chr13 (532 aa)
initn: 1929 init1: 1152 opt: 1720 Z-score: 1024.8 bits: 199.1 E(32554): 9.2e-51
Smith-Waterman score: 1926; 63.9% identity (79.1% similar) in 479 aa overlap (3-453:1-463)
10 20 30 40
pF1KB7 MTMLLDGGPQFPGLGVGSFGAPRHH----------EMPNREPA-GMGLNPFGDSTHAAAA
::::.:::::..:::::. .:: :: .:: . . . : : :: :
CCDS94 MLLDAGPQFPAIGVGSFARHHHHSAAAAAAAAAEMQDRELSLAAAQNGFVDS-----A
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 AAAAAAFKLSPAAAHDLSSGQSSAFTPQGSG-YANALGHHHHHHHHHHHTSQVPSYGGAA
:: .::::.:.: :.:: ::::::: :: : : .. . :...: ::.:
CCDS94 AAHMGAFKLNPGA-HELSPGQSSAFTSQGPGAYPGSAAAAAAAAALGPHAAHVGSYSGP-
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 SAAFNSTREFLFRQRSSGLSEAASGGGQHGLFAGSASSLHAPAGIPEPPSYLLFPGLHEQ
:::::.::::.: :....: ::::::::. .:..:: . . ..:::::: ::
CCDS94 --PFNSTRDFLFRSR--GFGDSAPGGGQHGLFGPGAGGLHHAHS--DAQGHLLFPGLPEQ
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 GAGHPSPTGHVDNNQVHLGLRGELFGRADPYRPVASPRTDPYAAGAQFPN-YSPMNMNMG
. : : .: :.:..::: ::.:::.. :: :::::::::.: ::. : :.:::::::
CCDS94 HGPHGSQ--NVLNGQMRLGLPGEVFGRSEQYRQVASPRTDPYSA-AQLHNQYGPMNMNMG
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KB7 VNVAA---------HHGPGAFFRYMRQP-IKQELSCKWIDEAQLSRPKKSCDRTFSTMHE
.:.:: :: :::::::::: ::::: ::::: ::: :::::..:::::::
CCDS94 MNMAAAAAHHHHHHHHHPGAFFRYMRQQCIKQELICKWIDPEQLSNPKKSCNKTFSTMHE
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 LVTHVTMEHVGGPEQNNHVCYWEECPREGKSFKAKYKLVNHIRVHTGEKPFPCPFPGCGK
:::::..::::::::.::::.::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS94 LVTHVSVEHVGGPEQSNHVCFWEECPREGKPFKAKYKLVNHIRVHTGEKPFPCPFPGCGK
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 IFARSENLKIHKRTHTGEKPFKCEFEGCDRRFANSSDRKKHMHVHTSDKPYICKVCDKSY
.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::
CCDS94 VFARSENLKIHKRTHTGEKPFQCEFEGCDRRFANSSDRKKHMHVHTSDKPYLCKMCDKSY
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 THPSSLRKHMKVHES--QGSDSSPAASSGYESSTPPAIASANSKDTTKT---PSAVQTST
::::::::::::::: :::.:::::::::::::::...: ... ... :.:. ...
CCDS94 THPSSLRKHMKVHESSPQGSESSPAASSGYESSTPPGLVSPSAEPQSSSNLSPAAAAAAA
410 420 430 440 450 460
460
pF1KB7 SHNPGLPPNFNEWYV
.
CCDS94 AAAAAAAAVSAVHRGGGSGSGGAGGGSGGGSGSGGGGGGAGGGGGGSSGGGSGTAGGHSG
470 480 490 500 510 520
>>CCDS43160.1 ZIC4 gene_id:84107|Hs108|chr3 (334 aa)
initn: 1270 init1: 856 opt: 1346 Z-score: 809.5 bits: 158.6 E(32554): 9.1e-39
Smith-Waterman score: 1356; 60.9% identity (77.1% similar) in 340 aa overlap (120-453:13-330)
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 HHHHHHHHTSQVPSYGGAASAAFNSTREFLFRQRSSGLSEAASGGGQHGLFAGSASSLHA
.: . :.:..:..:.:: .:::
CCDS43 MRYKTSLVMRKRLRLYRNTLKESSSSSGHHGPQLTAASS---
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 PAGIPEPPSYLLFPGLHEQGAGHPSPTGHVDNNQVHLGLRGELFGRADPYRPVASPRTDP
:: .::::::. . ::. . :. ..::: :....: .:. : . :.:
CCDS43 -------PS--VFPGLHEEPP-QASPSRPL-NGLLRLGLPGDMYARPEPFPPGPAARSDA
40 50 60 70 80
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 YAAGAQFPNYSPMNMNMGVNVAAHHGPGAFFRYMRQPIKQELSCKWIDEAQLSRPKKSCD
::.: . .:. .::. ::.:: :::::::::::::::::: :::. . :. :.
CCDS43 LAAAAALHGYG--GMNLTVNLAAPHGPGAFFRYMRQPIKQELICKWLAADGTATPSL-CS
90 100 110 120 130 140
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 RTFSTMHELVTHVTMEHVGGPEQNNHVCYWEECPREGKSFKAKYKLVNHIRVHTGEKPFP
.:::::::::::::.:::::::: ::.:.::::::.:: :::::::::::::::::::::
CCDS43 KTFSTMHELVTHVTVEHVGGPEQANHICFWEECPRQGKPFKAKYKLVNHIRVHTGEKPFP
150 160 170 180 190 200
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 CPFPGCGKIFARSENLKIHKRTHTGEKPFKCEFEGCDRRFANSSDRKKHMHVHTSDKPYI
::::::::.::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::: :::::::::
CCDS43 CPFPGCGKVFARSENLKIHKRTHTGEKPFRCEFEGCERRFANSSDRKKHSHVHTSDKPYT
210 220 230 240 250 260
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 CKV--CDKSYTHPSSLRKHMKVHESQGSDSSPAASSGYESSTPPAIASANS----KDTTK
::: ::: :::::::::::::: :: ::::.:.:: :..: .: :. .
CCDS43 CKVRGCDKCYTHPSSLRKHMKVH-----GRSPPPSSGYDSATPSALVSPSSDCGHKSQVA
270 280 290 300 310 320
450 460
pF1KB7 TPSAVQTSTSHNPGLPPNFNEWYV
. .:: . :.
CCDS43 SSAAVAARTADLSE
330
>>CCDS54653.1 ZIC4 gene_id:84107|Hs108|chr3 (372 aa)
initn: 1270 init1: 856 opt: 1346 Z-score: 808.9 bits: 158.7 E(32554): 9.8e-39
Smith-Waterman score: 1357; 58.0% identity (75.0% similar) in 364 aa overlap (100-453:27-368)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 QSSAFTPQGSGYANALGHHHHHHHHHHHTSQVPSYGGAASAAFNSTREFLFRQR----SS
..: . : : . ...:.: .
CCDS54 MNGPCQSLRKAEGLLEGCTSAVTVFRKLPLDSKAQSQKMRYKTSLVMRKRLRLYRN
10 20 30 40 50
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GLSEAASGGGQHGLFAGSASSLHAPAGIPEPPSYLLFPGLHEQGAGHPSPTGHVDNNQVH
:.:..:..:.:: .::: :: .::::::. . ::. . :. ..
CCDS54 TLKESSSSSGHHGPQLTAASS----------PS--VFPGLHEEPP-QASPSRPL-NGLLR
60 70 80 90 100
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LGLRGELFGRADPYRPVASPRTDPYAAGAQFPNYSPMNMNMGVNVAAHHGPGAFFRYMRQ
::: :....: .:. : . :.: ::.: . .:. ::.. ::.:: ::::::::::::
CCDS54 LGLPGDMYARPEPFPPGPAARSDALAAAAALHGYGGMNLT--VNLAAPHGPGAFFRYMRQ
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PIKQELSCKWIDEAQLSRPKKSCDRTFSTMHELVTHVTMEHVGGPEQNNHVCYWEECPRE
:::::: :::. . :. :..:::::::::::::.:::::::: ::.:.::::::.
CCDS54 PIKQELICKWLAADGTATPSL-CSKTFSTMHELVTHVTVEHVGGPEQANHICFWEECPRQ
170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GKSFKAKYKLVNHIRVHTGEKPFPCPFPGCGKIFARSENLKIHKRTHTGEKPFKCEFEGC
:: :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.::::::
CCDS54 GKPFKAKYKLVNHIRVHTGEKPFPCPFPGCGKVFARSENLKIHKRTHTGEKPFRCEFEGC
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 DRRFANSSDRKKHMHVHTSDKPYICKV--CDKSYTHPSSLRKHMKVHESQGSDSSPAASS
.:::::::::::: ::::::::: ::: ::: :::::::::::::: :: ::
CCDS54 ERRFANSSDRKKHSHVHTSDKPYTCKVRGCDKCYTHPSSLRKHMKVH-----GRSPPPSS
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460
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::.:.:: :..: .: :. . . .:: . :.
CCDS54 GYDSATPSALVSPSSDCGHKSQVASSAAVAARTADLSE
340 350 360 370
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.: . :.:..:..:.:: .:::
CCDS54 LERIENNNTLWEKAQSQKMRYKTSLVMRKRLRLYRNTLKESSSSSGHHGPQLTAASS---
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:: .::::::. . ::. . :. ..::: :....: .:. : . :.:
CCDS54 -------PS--VFPGLHEEPP-QASPSRPL-NGLLRLGLPGDMYARPEPFPPGPAARSDA
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::.: . .:. .::. ::.:: :::::::::::::::::: :::. . :. :.
CCDS54 LAAAAALHGYG--GMNLTVNLAAPHGPGAFFRYMRQPIKQELICKWLAADGTATPSL-CS
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CCDS54 KTFSTMHELVTHVTVEHVGGPEQANHICFWEECPRQGKPFKAKYKLVNHIRVHTGEKPFP
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CCDS54 CPFPGCGKVFARSENLKIHKRTHTGEKPFRCEFEGCERRFANSSDRKKHSHVHTSDKPYT
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::: ::: :::::::::::::: :: ::::.:.:: :..: .: :. .
CCDS54 CKVRGCDKCYTHPSSLRKHMKVH-----GRSPPPSSGYDSATPSALVSPSSDCGHKSQVA
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. .:: . :.
CCDS54 SSAAVAARTADLSE
380
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CCDS94 APPLPPTPSPPPPPPPPPPPALSGYTTTNSGGGGSSGKGHSRDFVLRRDLSATAPAAAMH
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:: : :: :.: ..... .: : : :::.::. ::
CCDS94 GAPLGGEQRSGTGSPQHPAPPPHSAGMFISASGTYAGPDGSGGPA---LFPALHDTPGAP
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::: : :.:..::: . ::.:::.: : : ::. : . ::.:
CCDS94 GGHPHPL----NGQMRLGLAAAAAAAAAELYGRAEP--PFA-PRSGDAHYGAVAAAAAAA
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220 230
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. .:. .:.:... .:: ::.: ::
CCDS94 LHGYGAVNLNLNLAAAAAAAAAGPGPHLQHHAPPPAPPPPPAPAQHPHQHHPHLPGAAGA
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:.::::::::::: ::::: : : : : :..::.::::::.
CCDS94 FLRYMRQPIKQELICKWIDPDELAGLPPPPPPPPPPPPPPPAGGAKPCSKTFGTMHELVN
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290 300 310 320 330 340
pF1KB7 HVTMEHVGGPEQNNHVCYWEECPREGKSFKAKYKLVNHIRVHTGEKPFPCPFPGCGKIFA
:::.::::::::..:::.::.:::::: :::::::.:::::::::::::::::::::.::
CCDS94 HVTVEHVGGPEQSSHVCFWEDCPREGKPFKAKYKLINHIRVHTGEKPFPCPFPGCGKVFA
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pF1KB7 RSENLKIHKRTHTGEKPFKCEFEGCDRRFANSSDRKKHMHVHTSDKPYICKV--CDKSYT
::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::: ::::::::: ::. ::::::
CCDS94 RSENLKIHKRTHTGEKPFKCEFDGCDRKFANSSDRKKHSHVHTSDKPYYCKIRGCDKSYT
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pF1KB7 HPSSLRKHMKVHESQGSDSSPAASSGYESSTPPAIASANSKDTTKTPSAVQTSTSHNPGL
::::::::::.: .. ::. :: : :. : .: ... . ::. :
CCDS94 HPSSLRKHMKIH-CKSPPPSPGPL-GYSSVGTPVGAPL-------SP-VLDPARSHSSTL
570 580 590 600 610
460
pF1KB7 PP---NFNEWYV
: :.:::::
CCDS94 SPQVTNLNEWYVCQASGAPSHLHTPSSNGTTSETEDEEIYGNPEVVRTIH
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pF1KB7 AFTPQGSGYANALGHHHHHHHHHHHTSQVPSYGGAASAAFNSTREFLFRQRSSGLSEAAS
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CCDS33 SLDLQRMIRTSPNSLVAYINNSRSSSAASGSYGHLSAGALSPA--FTFPHPINPVAYQQI
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pF1KB7 GGGQHGLFAGSASSLHAPAGIPEPPSYLLF-PGLHEQGAGHPSPTGHV-----DNNQVHL
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CCDS33 LSQQRGL--GSAFG-HTPPLIQPSPTFLAQQPMALTSINATPTQLSSSSNCLSDTNQNKQ
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. .. . . ..: .. : . : ::. ...: .:..: . : . ..
CCDS33 SSESAVSSTVNPVAIHKRSKVKTEPEGLR-PA-SPLALTQG-QVSGHGSCGCALPLSQEQ
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CCDS33 LADLKEDLDRDDCKQEAEVVIYETNCHWEDCTKEYDTQEQLVHHINNEHIHG-EKKEFVC
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CCDS33 RWQACTREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCSKAYSRLENLKTHLRSHTGEKP
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. :: :::.. :.:.::: ::.. .:...::::::. : : :: :::::::.:. ..
CCDS33 YVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYICKIPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPD
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CCDS33 AHVTKKQRNDVHLRTPLLKENGDSEAGTEPGGPESTEASSTSQAVEDCLHVRAIKTESSG
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CCDS33 LCQSSPGAQSSCSSEPSPLGSAPNNDSGVEMPGTGPGSLGDLTALDDTPPGADTSALAAP
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10 20 30 40
pF1KB7 MTMLLDGGPQFPGLGVGSFGAPRHHEMPNREPAGMGLNPFGDSTHAAA
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CCDS54 SPYADIIPSAATAGTGAIHMEYLHAMDSTRFSSPRLSARPSRKRT-LSISPLSDHSFDLQ
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50 60 70 80 90 100
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. .. :: . . ... :. . .:: . : : . :. ..
CCDS54 TM-----IRTSPNSLVTILNNSRSSSSASGS----------YGHLSASAISPALSFTYSS
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pF1KB7 ASAAFNSTREFLFRQRSSGLSEAASGGGQHGLFAGSASSLHAPAGIPEPPSYLLFPGLHE
: .... ...: ::.: : . :. : .: :: : :. .::.
CCDS54 APVSLHMHQQILSRQQSLG-----------SAFGHSPPLIH-PA--PTFPTQRPIPGIPT
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pF1KB7 QGAGHPSPTGHVDNNQVHLGLRGELFGRADPY---RPVASPRTDPYAAGAQFPNYSPMNM
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CCDS54 VLNPVQVSSGPSESSQNKPTSESAVSSTGDPMHNKRSKIKPDEDLPSPGARGQQEQPE--
400 410 420 430 440 450
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pF1KB7 NMGVNVAAHHGPGAFFRYMRQP-IKQELSCKWIDEAQLSRPKKSCDRTFSTMHELVTHVT
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CCDS54 --GTTLVKEEGDKDESK--QEPEVIYETNCHW----------EGCAREFDTQEQLVHHIN
460 470 480 490 500
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CCDS54 NDHIHG-EKKEFVCRWLDCSREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTFEGCTKAYSRLE
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CCDS54 NLKTHLRSHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRTHSNEKPYVCKIPGCTKRYTDP
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CCDS54 SSLRKHVKTVHGPEAHVTKK--QRGDIHPRPPPPRDSGSHSQSRSPGRPTQGALGEQQDL
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pF1KB7 PNFNEWYV
CCDS54 SNTTSKREECLQVKTVKAEKPMTSQPSPGGQSSCSSQQSPISNYSNSGLELPLTDGGSIG
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467 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]