Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7194
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7194, 676 aa
1>>>pF1KB7194 676 - 676 aa - 676 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7518+/-0.000991; mu= 7.2297+/- 0.060
mean_var=239.9754+/-48.560, 0's: 0 Z-trim(114.0): 50 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.082792
statistics sampled from 14555 (14605) to 14555 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.752), E-opt: 0.2 (0.449), width: 16
Scan time: 4.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7736.1 KCNQ1 gene_id:3784|Hs108|chr11 ( 676) 4541 555.5 8.8e-158
CCDS55037.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 923) 1440 185.2 3.5e-46
CCDS4976.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 932) 1411 181.8 3.9e-45
CCDS34943.1 KCNQ3 gene_id:3786|Hs108|chr8 ( 872) 1254 163.0 1.6e-39
CCDS55035.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 822) 1195 155.9 2.1e-37
CCDS56554.1 KCNQ3 gene_id:3786|Hs108|chr8 ( 752) 1188 155.1 3.5e-37
CCDS55034.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 ( 951) 1185 154.8 5.3e-37
CCDS13518.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 844) 1182 154.4 6.2e-37
CCDS13521.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 393) 1172 152.9 8.2e-37
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CCDS46629.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 841) 1171 153.1 1.5e-36
CCDS13519.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 854) 1171 153.1 1.6e-36
CCDS13520.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 ( 872) 1171 153.1 1.6e-36
>>CCDS7736.1 KCNQ1 gene_id:3784|Hs108|chr11 (676 aa)
initn: 4541 init1: 4541 opt: 4541 Z-score: 2946.1 bits: 555.5 E(32554): 8.8e-158
Smith-Waterman score: 4541; 100.0% identity (100.0% similar) in 676 aa overlap (1-676:1-676)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAAASSPPRAERKRWGWGRLPGARRGSAGLAKKCPFSLELAEGGPAGGALYAPIAPGAPG
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CCDS77 MAAASSPPRAERKRWGWGRLPGARRGSAGLAKKCPFSLELAEGGPAGGALYAPIAPGAPG
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 PAPPASPAAPAAPPVASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PAPPASPAAPAAPPVASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KCFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KCFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 RSKYVGLWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RSKYVGLWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VDRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VDRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 DALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QKHFNRQIPAAASLIQTAWRCYAAENPDSSTWKIYIRKAPRSHTLLSPSPKPKKSVVVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QKHFNRQIPAAASLIQTAWRCYAAENPDSSTWKIYIRKAPRSHTLLSPSPKPKKSVVVKK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 KKFKLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPEERRLDHFSVDGYDSSVRKSPTLLEVSMPHFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KKFKLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPEERRLDHFSVDGYDSSVRKSPTLLEVSMPHFM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 RTNSFAEDLDLEGETLLTPITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDVRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RTNSFAEDLDLEGETLLTPITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDVRD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 VIEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQSIGKPSLFISVSEKSKDRGSNTIGARLNRVEDKVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VIEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQSIGKPSLFISVSEKSKDRGSNTIGARLNRVEDKVT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 QLDQRLALITDMLHQLLSLHGGSTPGSGGPPREGGAHITQPCGSGGSVDPELFLPSNTLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QLDQRLALITDMLHQLLSLHGGSTPGSGGPPREGGAHITQPCGSGGSVDPELFLPSNTLP
610 620 630 640 650 660
670
pF1KB7 TYEQLTVPRRGPDEGS
::::::::::::::::
CCDS77 TYEQLTVPRRGPDEGS
670
>>CCDS55037.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 (923 aa)
initn: 707 init1: 679 opt: 1440 Z-score: 942.6 bits: 185.2 E(32554): 3.5e-46
Smith-Waterman score: 1440; 44.5% identity (72.5% similar) in 541 aa overlap (92-617:98-622)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 APPASPAAPAAPPVASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGWK
: : :: : : .::. .:: :::: ::
CCDS55 LGGGGGGLRESRRGKQGARMSLLGKPLSYTSSQSCRRNVKYR-RVQNYLYNVLERPRGWA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 CFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCR
:.:: :::.:. :::.::.::: ... ::.. :. .:.:..: :: :...:.:::::
CCDS55 -FIYHAFVFLLVFGCLILSVFSTIPEHTKLASSCLLILEFVMIVVFGLEFIIRIWSAGCC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SKYVGLWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHV
.: : :::::::::. .:: ::..::..:. . ..:..:::::.:..::::::::...
CCDS55 CRYRGWQGRLRFARKPFCVIDTIVLIASIAVVSAKTQGNIFATSALRSLRFLQILRMVRM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 DRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYAD
::.::::.::::::. : .::::. ::::: :::::..:::.:::: :. ::..:::
CCDS55 DRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITAWYIGFLVLIFSSFLVYLVEKDA-NK----EFSTYAD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQRQ
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CCDS55 ALWWGTITLTTIGYGDKTPLTWLGRLLSAGFALLGISFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 KHFNRQIPAAASLIQTAWRCYAAENPDSS--TWKIYIRKAPRSHTLLSPSPKP---KKSV
:::... ::.::: .:: :::.. . : ::: ... :: ::. . :. :
CCDS55 KHFEKRRNPAANLIQCVWRSYAADEKSVSIATWKPHLKAL---HTC-SPTNQKLSFKERV
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 VVKKKKFKLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPEERRLDHFSVDGYDSSVRKSPTL-LEVS
. . . . :. .. :.. :: . . .: ... .: :.: :. :
CCDS55 RMASPRGQSIKSRQASVGDRRSPSTDITAEGSPTKVQKSWS---FNDRTRFRPSLRLKSS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 MPH-FMRTNSFAEDLDLEGETLLTPITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARK
.:. . ... :. : . . .: ...:..:: :.. :::.::... .
CCDS55 QPKPVIDADTALGTDDVYDEKGCQCDVSVEDLTPPLKTVIRAIRIMKFHVAKRKFKETLR
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580
pF1KB7 PYDVRDVIEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQSIGKPSLFISVSEKSKDRGSN--------
::::.::::::: :::... ::: :: :.:: .:: . :. ..::... .
CCDS55 PYDVKDVIEQYSAGHLDMLCRIKSLQTRVDQILGKGQ--ITSDKKSREKITAEHETTDDL
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 TIGARLNRVEDKVTQLDQRLALITDMLHQLLSLHGGSTPGSGGPPREGGAHITQPCGSGG
.. .:. .:: .: .....: . :. .:.:
CCDS55 SMLGRVVKVEKQVQSIESKLDCLLDIYQQVLRKGSASALALASFQIPPFECEQTSDYQSP
600 610 620 630 640 650
650 660 670
pF1KB7 SVDPELFLPSNTLPTYEQLTVPRRGPDEGS
CCDS55 VDSKDLSGSAQNSGCLSRSTSANISRGLQFILTPNEFSAQTFYALSPTMHSQATQVPISQ
660 670 680 690 700 710
>>CCDS4976.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 (932 aa)
initn: 1353 init1: 679 opt: 1411 Z-score: 923.8 bits: 181.8 E(32554): 3.9e-45
Smith-Waterman score: 1432; 44.3% identity (72.3% similar) in 549 aa overlap (92-617:98-631)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 APPASPAAPAAPPVASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGWK
: : :: : : .::. .:: :::: ::
CCDS49 LGGGGGGLRESRRGKQGARMSLLGKPLSYTSSQSCRRNVKYR-RVQNYLYNVLERPRGWA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 CFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCR
:.:: :::.:. :::.::.::: ... ::.. :. .:.:..: :: :...:.:::::
CCDS49 -FIYHAFVFLLVFGCLILSVFSTIPEHTKLASSCLLILEFVMIVVFGLEFIIRIWSAGCC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SKYVGLWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHV
.: : :::::::::. .:: ::..::..:. . ..:..:::::.:..::::::::...
CCDS49 CRYRGWQGRLRFARKPFCVIDTIVLIASIAVVSAKTQGNIFATSALRSLRFLQILRMVRM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 DRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYAD
::.::::.::::::. : .::::. ::::: :::::..:::.:::: :. ::..:::
CCDS49 DRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITAWYIGFLVLIFSSFLVYLVEKDA-NK----EFSTYAD
250 260 270 280 290 300
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pF1KB7 ALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQRQ
:::::..:.::::::::.: ::.:. ... :....::::::::::::::::::::...::
CCDS49 ALWWGTITLTTIGYGDKTPLTWLGRLLSAGFALLGISFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQ
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pF1KB7 KHFNRQIPAAASLIQTAWRCYAAENPDSS--TWKIYIRKAPRSHTLLSPSPKPKKSVVVK
:::... ::.::: .:: :::.. . : ::: ... :: ::. : . . .
CCDS49 KHFEKRRNPAANLIQCVWRSYAADEKSVSIATWKPHLKAL---HTC-SPTKKEQGEASSS
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KB7 KK-KFKLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPEERRLDHFSVDGYDSSVRKS----------
.: .:: .. ..: . . . . . : ....: ..:.::
CCDS49 QKLSFK-ERVRMASPRGQSIKSRQASVGDRRSPSTD-ITAEGSPTKVQKSWSFNDRTRFR
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 PTL-LEVSMPH-FMRTNSFAEDLDLEGETLLTPITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAK
:.: :. :.:. . ... :. : . . .: ...:..:: :.. :::
CCDS49 PSLRLKSSQPKPVIDADTALGTDDVYDEKGCQCDVSVEDLTPPLKTVIRAIRIMKFHVAK
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 KKFQQARKPYDVRDVIEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQSIGKPSLFISVSEKSKDRGSN
.::... .::::.::::::: :::... ::: :: :.:: .:: . :. ..::... .
CCDS49 RKFKETLRPYDVKDVIEQYSAGHLDMLCRIKSLQTRVDQILGKGQ--ITSDKKSREKITA
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630
pF1KB7 --------TIGARLNRVEDKVTQLDQRLALITDMLHQLLSLHGGSTPGSGGPPREGGAHI
.. .:. .:: .: .....: . :. .:.:
CCDS49 EHETTDDLSMLGRVVKVEKQVQSIESKLDCLLDIYQQVLRKGSASALALASFQIPPFECE
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670
pF1KB7 TQPCGSGGSVDPELFLPSNTLPTYEQLTVPRRGPDEGS
CCDS49 QTSDYQSPVDSKDLSGSAQNSGCLSRSTSANISRGLQFILTPNEFSAQTFYALSPTMHSQ
660 670 680 690 700 710
>>CCDS34943.1 KCNQ3 gene_id:3786|Hs108|chr8 (872 aa)
initn: 985 init1: 441 opt: 1254 Z-score: 822.8 bits: 163.0 E(32554): 1.6e-39
Smith-Waterman score: 1254; 43.5% identity (71.7% similar) in 499 aa overlap (106-585:107-589)
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 ASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGWKCFVYHFAVFLIVLV
.: .:. :::: :: ..:: ::::::
CCDS34 GQRRTPQGIGLLAKTPLSRPVKRNNAKYRRIQTLIYDALERPRGWA-LLYHALVFLIVLG
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 CLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCRSKYVGLWGRLRFAR
:::..::.:...: ... :. .: . .::.:...:.:.::: .: : :::.:::
CCDS34 CLILAVLTTFKEYETVSGDWLLLLETFAIFIFGAEFALRIWAAGCCCRYKGWRGRLKFAR
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 KPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHVDRQGGTWRLLGSVV
::. ..:..:..::. :. ::..:.:.::: .:..:::::::::..::.::::.::::..
CCDS34 KPLCMLDIFVLIASVPVVAVGNQGNVLATS-LRSLRFLQILRMLRMDRRGGTWKLLGSAI
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 FIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDA--VNESG---RVEFGSYADALWWGVVTV
: .::::. ::::: ::.::..:::.:::. :. .: . :: .::::::::..:.
CCDS34 CAHSKELITAWYIGFLTLILSSFLVYLVEKDVPEVDAQGEEMKEEFETYADALWWGLITL
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 TTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQRQKHFNRQIPA
.:::::::.:.:: :. ::. ::....:::::::::::::.:::::...:::::...
CCDS34 ATIGYGDKTPKTWEGRLIAATFSLIGVSFFALPAGILGSGLALKVQEQHRQKHFEKRRKP
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420
pF1KB7 AASLIQTAWRCYAAENPDS----STWKIY--IRKAP--RSHTLLSPSPKPKKSVVVKKKK
:: :::.::: : : ::. .::..: . . : :.. : . : . : ... .
CCDS34 AAELIQAAWR-YYATNPNRIDLVATWRFYESVVSFPFFRKEQLEAASSQ-KLGLL---DR
380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB7 FKLDKDNGVTPGEKMLT---VPHITCDPPEERR-LDHFSVDGYDSSVRKSPTLLEVSMPH
.:.. : . :..: : : .: .: . . . . . .. : . . :
CCDS34 VRLSNPRGSNTKGKLFTPLNVDAIEESPSKEPKPVGLNNKERFRTAFRMKAYAFWQSSED
430 440 450 460 470 480
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pF1KB7 FMRTNSFAEDLDLEGETLLTPITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDV
. .::: .: : : .. .:.:...: .:. . ::::... .::::
CCDS34 AGTGDPMAED---RGYGNDFP---IEDMIPTLKAAIRAVRILQFRLYKKKFKETLRPYDV
490 500 510 520 530 540
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pF1KB7 RDVIEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQ--SIGKPSLFISVSEKSKDRGSNTIGARLNRVE
.::::::: :::... ::: :: :.:. . : :: . ..:....::
CCDS34 KDVIEQYSAGHLDMLSRIKYLQTRIDMIFTPGPPS---TPKHKKSQKGSAFTFPSQQSPR
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 DKVTQLDQRLALITDMLHQLLSLHGGSTPGSGGPPREGGAHITQPCGSGGSVDPELFLPS
CCDS34 NEPYVARPSTSEIEDQSMMGKFVKVERQVQDMGKKLDFLVDMHMQHMERLQVQVTEYYPT
610 620 630 640 650 660
>>CCDS55035.1 KCNQ5 gene_id:56479|Hs108|chr6 (822 aa)
initn: 916 init1: 679 opt: 1195 Z-score: 785.1 bits: 155.9 E(32554): 2.1e-37
Smith-Waterman score: 1248; 42.9% identity (64.8% similar) in 534 aa overlap (92-617:98-521)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 APPASPAAPAAPPVASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGWK
: : :: : : .::. .:: :::: ::
CCDS55 LGGGGGGLRESRRGKQGARMSLLGKPLSYTSSQSCRRNVKYR-RVQNYLYNVLERPRGWA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 CFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCR
:.:: :::.:. :::.::.::: ... ::.. :. .:.:..: :: :...:.:::::
CCDS55 -FIYHAFVFLLVFGCLILSVFSTIPEHTKLASSCLLILEFVMIVVFGLEFIIRIWSAGCC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SKYVGLWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHV
.: : :::::::::. .:: ::..::..:. . ..:..:::::.:..::::::::...
CCDS55 CRYRGWQGRLRFARKPFCVIDTIVLIASIAVVSAKTQGNIFATSALRSLRFLQILRMVRM
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 DRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYAD
::.::::.::::::. : .::::. ::::: :::::..:::.:::: :. ::..:::
CCDS55 DRRGGTWKLLGSVVYAHSKELITAWYIGFLVLIFSSFLVYLVEKDA-NK----EFSTYAD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQRQ
:::::..:.::::::::.: ::.:. ... :....::::::::::::::::::::...::
CCDS55 ALWWGTITLTTIGYGDKTPLTWLGRLLSAGFALLGISFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 KHFNRQIPAAASLIQTAWRCYAAENPDSSTWKIYIRKAPRSHTLLSPSPKPKKSVVVKKK
:::... ::.::: .:: :::. .::: .
CCDS55 KHFEKRRNPAANLIQCVWRSYAAD---------------------------EKSVSIATW
370 380 390
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pF1KB7 KFKLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPEERRLDHFSVDGYDSSVRKSPTLLEVSMPHFMR
: : : : : ::.: .... : ::
CCDS55 K----------PHLKAL---H-TCSPTKKEQ-------GEASS-----------------
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pF1KB7 TNSFAEDLDLEGETLLTPITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDVRDV
: :.. :::.::... .::::.::
CCDS55 ------------------------------------RIMKFHVAKRKFKETLRPYDVKDV
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pF1KB7 IEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQSIGKPSLFISVSEKSKDRGSN--------TIGARLN
::::: :::... ::: :: :.:: .:: . :. ..::... . .. .:.
CCDS55 IEQYSAGHLDMLCRIKSLQTRVDQILGKGQ--ITSDKKSREKITAEHETTDDLSMLGRVV
440 450 460 470 480 490
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 RVEDKVTQLDQRLALITDMLHQLLSLHGGSTPGSGGPPREGGAHITQPCGSGGSVDPELF
.:: .: .....: . :. .:.:
CCDS55 KVEKQVQSIESKLDCLLDIYQQVLRKGSASALALASFQIPPFECEQTSDYQSPVDSKDLS
500 510 520 530 540 550
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: ..::::: :::..::.:...: ...
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:. .: . .::.:...:.:.::: .: : :::.:::::. ..:..:..::. :. :
CCDS56 LLLLETFAIFIFGAEFALRIWAAGCCCRYKGWRGRLKFARKPLCMLDIFVLIASVPVVAV
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pF1KB7 GSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHVDRQGGTWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIF
:..:.:.::: .:..:::::::::..::.::::.::::.. : .::::. ::::: ::.
CCDS56 GNQGNVLATS-LRSLRFLQILRMLRMDRRGGTWKLLGSAICAHSKELITAWYIGFLTLIL
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pF1KB7 SSYFVYLAEKDA--VNESG---RVEFGSYADALWWGVVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIAS
::..:::.:::. :. .: . :: .::::::::..:..:::::::.:.:: :. ::.
CCDS56 SSFLVYLVEKDVPEVDAQGEEMKEEFETYADALWWGLITLATIGYGDKTPKTWEGRLIAA
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::....:::::::::::::.:::::...:::::... :: :::.::: : : ::.
CCDS56 TFSLIGVSFFALPAGILGSGLALKVQEQHRQKHFEKRRKPAAELIQAAWR-YYATNPNRI
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pF1KB7 ---STWKIY--IRKAP--RSHTLLSPSPKPKKSVVVKKKKFKLDKDNGVTPGEKMLT---
.::..: . . : :.. : . : . : ... . .:.. : . :..:
CCDS56 DLVATWRFYESVVSFPFFRKEQLEAASSQ-KLGLL---DRVRLSNPRGSNTKGKLFTPLN
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: : .: .: . . . . . .. : . . : . .::: .:
CCDS56 VDAIEESPSKEPKPVGLNNKERFRTAFRMKAYAFWQSSEDAGTGDPMAED---RGYGNDF
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pF1KB7 PITHISQLREHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDVRDVIEQYSQGHLNLMVRIKE
:: .. .:.:...: .:. . ::::... .::::.::::::: :::... :::
CCDS56 PIE---DMIPTLKAAIRAVRILQFRLYKKKFKETLRPYDVKDVIEQYSAGHLDMLSRIKY
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pF1KB7 LQRRLDQ--SIGKPSLFISVSEKSKDRGSNTIGARLNRVEDKVTQLDQRLALITDMLHQL
:: :.:. . : :: . ..:....::
CCDS56 LQTRIDMIFTPGPPS---TPKHKKSQKGSAFTFPSQQSPRNEPYVARPSTSEIEDQSMMG
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CCDS55 LGGGGGGLRESRRGKQGARMSLLGKPLSYTSSQSCRRNVKYR-RVQNYLYNVLERPRGWA
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pF1KB7 CFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCR
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CCDS55 -FIYHAFVFLLVFGCLILSVFSTIPEHTKLASSCLLILEFVMIVVFGLEFIIRIWSAGCC
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pF1KB7 SKYVGLWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHV
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CCDS55 CRYRGWQGRLRFARKPFCVIDTIVLIASIAVVSAKTQGNIFATSALRSLRFLQILRMVRM
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::.::::.::::::. : .::::. ::::: :::::..:::.:::: :. ::..:::
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CCDS55 ALWWGTITLTTIGYGDKTPLTWLGRLLSAGFALLGISFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQ
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:::... ::.::: .:: :::.. . : ::: ... :: ::. : .
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pF1KB7 KSVVVKKKKFKLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPE------------ERRLDHFSV--D
: :.: :.. . ..:. .. :. .:: .. .
CCDS55 KFCSNKQKLFRMYTSR--KQSQKLSFKERVRMASPRGQSIKSRQASVGDRRSPSTDITAE
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: ..:.:: :.: :. :.:. . ... :. : . . .:
CCDS55 GSPTKVQKSWSFNDRTRFRPSLRLKSSQPKPVIDADTALGTDDVYDEKGCQCDVSVEDLT
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pF1KB7 EHHRATIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDVRDVIEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQSI
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CCDS55 PPLKTVIRAIRIMKFHVAKRKFKETLRPYDVKDVIEQYSAGHLDMLCRIKSLQTRVDQIL
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pF1KB7 GKPSLFISVSEKSKDRGSN--------TIGARLNRVEDKVTQLDQRLALITDMLHQLLSL
:: . :. ..::... . .. .:. .:: .: .....: . :. .:.:
CCDS55 GKGQ--ITSDKKSREKITAEHETTDDLSMLGRVVKVEKQVQSIESKLDCLLDIYQQVLRK
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620 630 640 650 660 670
pF1KB7 HGGSTPGSGGPPREGGAHITQPCGSGGSVDPELFLPSNTLPTYEQLTVPRRGPDEGS
CCDS55 GSASALALASFQIPPFECEQTSDYQSPVDSKDLSGSAQNSGCLSRSTSANISRGLQFILT
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CCDS13 LLIAGSEAPKRGSILSKPRAGGAGAGKPPKRNAFYR-KLQNFLYNVLERPRGWA-FIYHA
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pF1KB7 AVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCRSKYVGL
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CCDS13 YVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEKSSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRGW
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pF1KB7 WGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHVDRQGGT
:::.:::::. .::..:..::..:: .::.:.::::::.:..::::::::...::.:::
CCDS13 RGRLKFARKPFCVIDIMVLIASIAVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGGT
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pF1KB7 WRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYADALWWGV
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CCDS13 WKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGFLCLILASFLVYLAEKGENDH-----FDTYADALWWGL
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pF1KB7 VTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQRQKHFNRQ
.:.:::::::: :::: :. .:. :.....:::::::::::::::::::...:::::...
CCDS13 ITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLIGVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEKR
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pF1KB7 IPAAASLIQTAWRCYAAENPDS---STWKIYIRKAPRS-HTLLSPSPKPKKSVVVKKKK-
::.:::.::: ::.. . :::. : : . . :. : . . .:.:.
CCDS13 RNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTWQYYERTVTVPMYRLIPPLNQLELLRNLKSKSG
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pF1KB7 --FKLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPEERRLDHFSVDGYDSSVRKSPTL---LEVSMP
:. : .:..:. .. .: . : .. ..::.::. :: :
CCDS13 LAFRKDPPPEPSPSQKVSLKDRVFSSPRGVAAKGKGSPQA--QTVRRSPSADQSLEDSPS
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pF1KB7 HFMRTNSF--------------------AEDLDLEGETLLT----PITHISQ-LREHHRA
. .. :: .:. .: :: .. : ... : ..
CCDS13 KVPKSWSFGDRSRARQAFRIKGAASRQNSEEASLPGEDIVDDKSCPCEFVTEDLTPGLKV
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pF1KB7 TIKVIRRMQYFVAKKKFQQARKPYDVRDVIEQYSQGHLNLMVRIKELQRRLDQSIGKPSL
.:... :...:.:.::... .:::: ::::::: :::... ::: :: :.:: .:.
CCDS13 SIRAVCVMRFLVSKRKFKESLRPYDVMDVIEQYSAGHLDMLSRIKSLQSRVDQIVGRGP-
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pF1KB7 FISVSEKSKDRGSN--------TIGARLNRVEDKVTQLDQRLALITDMLHQLLSLHGGST
....:.. .: .. .::..:: .: .....: ..... : .
CCDS13 --AITDKDRTKGPAEAELPEDPSMMGRLGKVEKQVLSMEKKLDFLVNIYMQRM-------
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pF1KB7 PGSGGPPREGGAHITQPCGSGGSVDPELFLPSNTLPTYEQLTVPRRGPDEGS
: :: : :.. :. .:: : .. : . : :.:
CCDS13 ---GIPPTETEAYF-------GAKEPEPAPPYHS-PEDSREHVDRHGCIVKIVRSSSSTG
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CCDS13 QKNFSAPPAAPPVQCPPSTSWQPQSHPRQGHGTSPVGDHGSLVRIPPPPAHERSLSAYGG
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>>CCDS13521.1 KCNQ2 gene_id:3785|Hs108|chr20 (393 aa)
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pF1KB7 RWGWGRLPGARRGSAGLAKKCPFSLELAEGGPAG----GALYAPIAPGAPGPAPPAS--P
::.: . .. . :::: . ..
CCDS13 MVQKSRNGGVYPGPSGEKKLKVGFVGLDPGAPDSTRDGALLI
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pF1KB7 AAPAAPPVASDLG-PRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFLERPTGWKCFVYH
:. :: .: :. :: . . .: .. : ..:. .:: :::: :: :.::
CCDS13 AGSEAPKRGSILSKPRAGGAGAGK----PPKRNAFYR-KLQNFLYNVLERPRGWA-FIYH
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pF1KB7 FAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVRLWSAGCRSKYVG
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CCDS13 AYVFLLVFSCLVLSVFSTIKEYEKSSEGALYILEIVTIVVFGVEYFVRIWAAGCCCRYRG
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pF1KB7 LWGRLRFARKPISIIDLIVVVASMVVLCVGSKGQVFATSAIRGIRFLQILRMLHVDRQGG
:::.:::::. .::..:..::..:: .::.:.::::::.:..::::::::...::.::
CCDS13 WRGRLKFARKPFCVIDIMVLIASIAVLAAGSQGNVFATSALRSLRFLQILRMIRMDRRGG
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pF1KB7 TWRLLGSVVFIHRQELITTLYIGFLGLIFSSYFVYLAEKDAVNESGRVEFGSYADALWWG
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CCDS13 TWKLLGSVVYAHSKELVTAWYIGFLCLILASFLVYLAEKGENDH-----FDTYADALWWG
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pF1KB7 VVTVTTIGYGDKVPQTWVGKTIASCFSVFAISFFALPAGILGSGFALKVQQKQRQKHFNR
..:.:::::::: :::: :. .:. :.....:::::::::::::::::::...:::::..
CCDS13 LITLTTIGYGDKYPQTWNGRLLAATFTLIGVSFFALPAGILGSGFALKVQEQHRQKHFEK
280 290 300 310 320 330
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pF1KB7 QIPAAASLIQTAWRCYAAENPDS---STWKIYIRKAPRSHTLLSPSPKPKKSVVVKKKKF
. ::.:::.::: ::.. . :::. : : :. : . .. . . :. :
CCDS13 RRNPAAGLIQSAWRFYATNLSRTDLHSTWQYYER------TVTVPMYRYRRRAPATKQLF
340 350 360 370 380
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pF1KB7 KLDKDNGVTPGEKMLTVPHITCDPPEERRLDHFSVDGYDSSVRKSPTLLEVSMPHFMRTN
..
CCDS13 HFLFSICS
390
>>CCDS456.1 KCNQ4 gene_id:9132|Hs108|chr1 (695 aa)
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pF1KB7 MAAASSPPRAERKRWGWGRLPG-ARRGSAGLAKKCPFSLELAEGGPAG-----GALYAPI
: .::: : : : :: : : : :. . : .:.: .: : : .:.
CCDS45 MAEAPPR----RLGLGPPPGDAPR--AELVALTAVQSEQGEAGGGGSPRRLGLLGSPL
10 20 30 40 50
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pF1KB7 APGAPGPAPPASPAAPAAPPVASDLGPRPPVSLDPRVSIYSTRRPVLARTHVQGRVYNFL
:::: :.: .. . : : : .. : :: .:. ::: :
CCDS45 PPGAPLPGPGSGSG--------SACGQRSSAA-HKRY-----RR-------LQNWVYNVL
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pF1KB7 ERPTGWKCFVYHFAVFLIVLVCLIFSVLSTIEQYAALATGTLFWMEIVLVVFFGTEYVVR
::: :: :::: .::.:. ::..::::::... ::. :. .:.:..: :: ::.::
CCDS45 ERPRGWA-FVYHVFIFLLVFSCLVLSVLSTIQEHQELANECLLILEFVMIVVFGLEYIVR
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.::::: .: : ::.::::::. .::.:: :::..:. .:..:..:::::.:..::::
CCDS45 VWSAGCCCRYRGWQGRFRFARKPFCVIDFIVFVASVAVIAAGTQGNIFATSALRSMRFLQ
160 170 180 190 200 210
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