Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7133
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7133, 319 aa
1>>>pF1KB7133 319 - 319 aa - 319 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0301+/-0.000795; mu= 9.4793+/- 0.048
mean_var=135.4635+/-26.718, 0's: 0 Z-trim(112.9): 47 B-trim: 8 in 1/51
Lambda= 0.110195
statistics sampled from 13579 (13626) to 13579 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.771), E-opt: 0.2 (0.419), width: 16
Scan time: 2.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX ( 319) 2080 341.4 5.4e-94
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX ( 347) 1373 229.1 4e-60
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX ( 346) 1311 219.2 3.7e-57
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX ( 336) 1060 179.3 3.7e-45
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 1021 173.1 2.7e-43
CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX ( 346) 995 169.0 4.9e-42
CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX ( 347) 963 163.9 1.7e-40
CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX ( 324) 867 148.6 6.2e-36
CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX ( 429) 809 139.5 4.6e-33
CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX ( 318) 783 135.3 6.4e-32
CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX ( 369) 783 135.3 7.1e-32
CCDS14217.1 MAGEB6 gene_id:158809|Hs108|chrX ( 407) 780 134.9 1.1e-31
CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX ( 317) 777 134.3 1.2e-31
CCDS65233.1 MAGEB5 gene_id:347541|Hs108|chrX ( 275) 765 132.3 4.1e-31
CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX ( 373) 739 128.3 9.2e-30
CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX ( 315) 724 125.9 4.2e-29
CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX ( 315) 724 125.9 4.2e-29
CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX ( 309) 723 125.7 4.6e-29
CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX ( 314) 684 119.5 3.4e-27
CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX ( 314) 673 117.8 1.2e-26
CCDS76046.1 MAGEA2B gene_id:266740|Hs108|chrX ( 314) 671 117.4 1.4e-26
CCDS76049.1 MAGEA2 gene_id:4101|Hs108|chrX ( 314) 671 117.4 1.4e-26
CCDS76048.1 MAGEA12 gene_id:4111|Hs108|chrX ( 314) 660 115.7 4.9e-26
CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX (1142) 669 117.5 4.9e-26
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 637 112.0 6e-25
CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 346) 619 109.2 4.8e-24
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 600 106.1 3.5e-23
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 603 106.8 4.3e-23
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 574 102.4 1.5e-21
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 557 99.6 7.7e-21
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 560 100.2 8.6e-21
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 557 99.8 1.3e-20
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 548 98.2 2.2e-20
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 548 98.2 2.2e-20
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 548 98.2 2.2e-20
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 536 96.0 4.1e-20
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 536 96.4 1e-19
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 499 90.4 5e-18
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 499 90.4 5.2e-18
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 492 89.0 5.4e-18
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 488 88.7 2e-17
CCDS14431.1 MAGEE2 gene_id:139599|Hs108|chrX ( 523) 474 86.3 5.7e-17
CCDS14676.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 643) 388 72.7 8.8e-13
CCDS14369.1 MAGEH1 gene_id:28986|Hs108|chrX ( 219) 365 68.7 4.8e-12
>>CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX (319 aa)
initn: 2080 init1: 2080 opt: 2080 Z-score: 1800.9 bits: 341.4 E(32554): 5.4e-94
Smith-Waterman score: 2080; 99.7% identity (100.0% similar) in 319 aa overlap (1-319:1-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 CAFPTHYEEALKDEEKAGV
:::::::::::::::::::
CCDS14 CAFPTHYEEALKDEEKAGV
310
>>CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX (347 aa)
initn: 1264 init1: 1043 opt: 1373 Z-score: 1193.0 bits: 229.1 E(32554): 4e-60
Smith-Waterman score: 1373; 65.5% identity (88.0% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
:::::::::::::::::::.::.::.: ..: ::.:: : :: : : . .:::::::::
CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPS-SSPVLGDTPTSSPAAGIPQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
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CCDS14 KPQGAPPTTTAAAA-VSCTESDEGAKC-QGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
:.: :::... . :..:::.: .....:: :::. ::. : .::::.:.. ::.:::::.
CCDS14 FILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
..:..::.. .: ..::::: :::::::::::.::::::::::.:.:.::.:::::: .
CCDS14 VSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
.::: :.::.::::::::.:.:::.:::::.::::::::::::.::::::::::.::.::
CCDS14 YGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATP
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 CAFPTHYEEALKDEEKAGV
::.::::::.:::.
CCDS14 RDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
300 310 320 330 340
>>CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX (346 aa)
initn: 1030 init1: 651 opt: 1311 Z-score: 1139.7 bits: 219.2 E(32554): 3.7e-57
Smith-Waterman score: 1311; 65.5% identity (83.4% similar) in 319 aa overlap (1-318:1-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
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CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRQRTRGQTQDLKVGQPTAAEKEESPSSSSSVLRDTASSSLAFGIPQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
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CCDS14 EPQREPPTTSAAAA-MSCTGSDKGDES-QDEENASSSQASTSTERSLKDSLTRKTKMLVQ
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
:::::::.:. .::.:::::..:...::::::..:.:. .:::: :..:::. :.: .
CCDS14 FLLYKYKMKEPTTKAEMLKIISKKYKEHFPEIFRKVSQRTELVFGLALKEVNPTTHSYIL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
.. . .: .. :.: .:: ::::::.::::::: : ::::::::::::.:::..: .
CCDS14 VSMLGPNDGNQS-SAWTLPRNGLLMPLLSVIFLNGNCAREEEIWEFLNMLGIYDGKRHLI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
:::: ::::.::::::::::.:::.:::::.::::::::.:::::::::::::::: :::
CCDS14 FGEPRKLITQDLVQEKYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTTP
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 CAFPTHYEEALKDEE-KAGV
:: :::::.::: .::
CCDS14 NNFPLLYEEALRDEEERAGARPRVAARRGTTAMTSAYSRATSSSSSQPM
300 310 320 330 340
>>CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX (336 aa)
initn: 1018 init1: 771 opt: 1060 Z-score: 924.2 bits: 179.3 E(32554): 3.7e-45
Smith-Waterman score: 1060; 51.6% identity (79.4% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
::::: :: :::::::.:: : . :. :.: ::.:. : :: . . .: : :::::
CCDS59 MPRGQASKRRAREKRRQARGEDQCLGGAQATAAEKEKLPSSSSPACQSPPQSFPNAGIPQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
. ::: .. :.: :: :.: .:::...:: . .: .. .:..: ..: :. :.: :::
CCDS59 ESQRASYPSSPASA-VSLTSSDEGAKGQKGE-SPNSFHGPSSSESTGRDLLNTKTGELVQ
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
::: :: :. .:. :::........::::::....:.. ::::: :....:. ..:..
CCDS59 FLLNKYIRKEPITREAMLKVINRKYKQHFPEILRRSTENVEVVFGLYLKEMDPSRQSYVL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
. :.:. .. :: .. :: ::: ::..::..:: :::::.:: :: ::.: :..: .
CCDS59 VGKLDFPNQGSLSDGGGFPLSGLLMVLLSTIFMHGNRATEEEMWECLNALGMYKGRKHFI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
.::: .:.:::::.: ::::.:::::::::..::::::: :::::::::::.::.: :.
CCDS59 YGEPQELVTKDLVREGYLEYQQVPSSDPPRYEFLWGPRARAETSKMKVLEFVAKLNDTVA
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 CAFPTHYEEALKDEEKAGV
.. ..:::::..::.
CCDS59 STYKSRYEEALREEEEQARARAVARDSARARASRSFQP
300 310 320 330
>>CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX (343 aa)
initn: 985 init1: 825 opt: 1021 Z-score: 890.6 bits: 173.1 E(32554): 2.7e-43
Smith-Waterman score: 1021; 52.7% identity (77.1% similar) in 319 aa overlap (1-316:1-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
:::::::::::::::..:: :.. :.. :.: :: : .: . . : .. ::: :.
CCDS14 MPRGQKSKLRAREKRHQARCENQDLGATQATVAEGE-SPSPAYLLFGDRPQNLPAAETPS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 KP---QRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGS
: : ::.:. : : : .:..::.: : ::. .::. . . : ::::..: :
CCDS14 IPEALQGAPSTTNAIAP--VSCSSNEGASS-QDEKSLGSSREAEGWK---EDPLNKKVVS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LVQFLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHT
::.::: ::. :. .:::.:.:.: .. . :: ::::.::: . ...:..:..:.: :
CCDS14 LVHFLLQKYETKEPITKGDMIKFVIRKDKCHFNEILKRASEHMELALGVDLKEVDPIRHY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YTFIDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEE
:.:..:.::: .:. . .:. ::: ::::::::: : :: .::..::.::: ..
CCDS14 YAFFSKLDLTYDETTSDEEKIPKTGLLMIALGVIFLNGNRAPEEAVWEIMNMMGVYADRK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 HSVFGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNG
: ..:.: :..:::::: :::::.:::.:::::..:::::::.:::::::::::.::..
CCDS14 HFLYGDPRKVMTKDLVQLKYLEYQQVPNSDPPRYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFVAKIHD
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 TTPCAFPTHYEEALKDEEKAGV
:.: :::. :::::.:::.
CCDS14 TVPSAFPSCYEEALRDEEQRTQARAAARAHTAAMANARSRTTSSSFSHAK
300 310 320 330 340
>>CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX (346 aa)
initn: 1001 init1: 944 opt: 995 Z-score: 868.2 bits: 169.0 E(32554): 4.9e-42
Smith-Waterman score: 995; 51.9% identity (76.6% similar) in 320 aa overlap (1-316:1-316)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIP-
::::::: :.:::::...: .:. . :.: ...... :: . ::. .. .::
CCDS14 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSF-SSPLILGATIQKKSAGRSR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 ---QKPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSG
.::::: .:.... :: :: :::.: . ::. : ::. .:: . ::: :..
CCDS14 SALKKPQRALSTTTSV--DVSYKKSYKGANS-KIEKKQSFSQGLSSTVQSRTDPLIMKTN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SLVQFLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGH
:::::. ::.:: . :..::::: : .. ::::::::: .. ::::..:.::. .
CCDS14 MLVQFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 TYTFIDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGE
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CCDS35 APSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
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CCDS43 LVNFMLHKCQMKKPITKADMLKIIIKDDESHFSEILLRASEHLEMIFGLDVVEVDPTTHC
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CCDS43 YGLFIKLGLTYDGMLSGEKGVPKTGLLIIVLGVIFMKGNRATEEEVWEVLNLTGVYSGKK
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CCDS43 SYPHSFPSQYAEALKEEEERARARI
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CCDS48 GVIFMEGNCIPEEVMWEVLSIMGVYAGREHFLFGEPKRLLTQNWVQEKYLVYRQVPGTDP
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CCDS48 ACYEFLWGPRAHAETSKMKVLEYIANANGRDPTSYPSLYEDALR-EEGEGV
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CCDS14 PPQ-SPEGASSSLTVTDSTLWSQSDEGSSSNE-EEGPSTSPDPAHLESLFREALDEKVAE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]