Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7132
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7132, 318 aa
1>>>pF1KB7132 318 - 318 aa - 318 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5208+/-0.000767; mu= 5.7244+/- 0.047
mean_var=107.6249+/-21.183, 0's: 0 Z-trim(111.9): 48 B-trim: 2 in 1/52
Lambda= 0.123628
statistics sampled from 12743 (12791) to 12743 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.747), E-opt: 0.2 (0.393), width: 16
Scan time: 3.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX ( 318) 2073 379.8 1.5e-105
CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX ( 317) 1400 259.8 2.1e-69
CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX ( 315) 1302 242.3 3.8e-64
CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX ( 315) 1302 242.3 3.8e-64
CCDS76048.1 MAGEA12 gene_id:4111|Hs108|chrX ( 314) 1265 235.7 3.7e-62
CCDS76049.1 MAGEA2 gene_id:4101|Hs108|chrX ( 314) 1260 234.8 6.8e-62
CCDS76046.1 MAGEA2B gene_id:266740|Hs108|chrX ( 314) 1260 234.8 6.8e-62
CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX ( 314) 1255 233.9 1.3e-61
CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX ( 309) 1244 231.9 4.9e-61
CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX ( 314) 1244 231.9 4.9e-61
CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX ( 429) 1214 226.6 2.7e-59
CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX ( 369) 1097 205.7 4.5e-53
CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX ( 324) 919 174.0 1.4e-43
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX ( 346) 830 158.1 9.1e-39
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX ( 347) 830 158.1 9.2e-39
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX ( 336) 829 157.9 1e-38
CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX ( 347) 821 156.5 2.8e-38
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 815 155.4 5.8e-38
CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 346) 808 154.2 1.4e-37
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX ( 319) 783 149.7 2.8e-36
CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX ( 346) 761 145.8 4.6e-35
CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX ( 373) 732 140.6 1.8e-33
CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX (1142) 739 142.0 2.1e-33
CCDS14217.1 MAGEB6 gene_id:158809|Hs108|chrX ( 407) 664 128.5 8.7e-30
CCDS65233.1 MAGEB5 gene_id:347541|Hs108|chrX ( 275) 602 117.4 1.3e-26
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 588 114.9 8e-26
CCDS14676.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 643) 590 115.4 1.2e-25
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 550 108.2 8.9e-24
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 555 109.1 1e-23
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 554 109.0 1.3e-23
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 554 109.0 1.4e-23
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 555 109.2 2e-23
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 550 108.3 2.7e-23
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 546 107.6 4.2e-23
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 540 106.5 6.9e-23
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 540 106.5 6.9e-23
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 540 106.5 6.9e-23
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 533 105.2 1.4e-22
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 513 101.7 3.2e-21
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 491 97.6 1.3e-20
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 469 93.8 5.7e-19
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 426 86.0 4.2e-17
CCDS65261.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 757) 405 82.4 1.2e-15
CCDS56602.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 757) 405 82.4 1.2e-15
CCDS14431.1 MAGEE2 gene_id:139599|Hs108|chrX ( 523) 385 78.8 1e-14
CCDS14369.1 MAGEH1 gene_id:28986|Hs108|chrX ( 219) 312 65.7 3.9e-11
>>CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX (318 aa)
initn: 2073 init1: 2073 opt: 2073 Z-score: 2008.2 bits: 379.8 E(32554): 1.5e-105
Smith-Waterman score: 2073; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLLGQKSQRYKAEEGLQAQGEAPGLMDVQIPTAEEQKAASSSSTLIMGTLEEVTDSGSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MLLGQKSQRYKAEEGLQAQGEAPGLMDVQIPTAEEQKAASSSSTLIMGTLEEVTDSGSPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PPQSPEGASSSLTVTDSTLWSQSDEGSSSNEEEGPSTSPDPAHLESLFREALDEKVAELV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PPQSPEGASSSLTVTDSTLWSQSDEGSSSNEEEGPSTSPDPAHLESLFREALDEKVAELV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RFLLRKYQIKEPVTKAEMLESVIKNYKNHFPDIFSKASECMQVIFGIDVKEVDPAGHSYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RFLLRKYQIKEPVTKAEMLESVIKNYKNHFPDIFSKASECMQVIFGIDVKEVDPAGHSYI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LVTCLGLSYDGLLGDDQSTPKTGLLIIVLGMILMEGSRAPEEAIWEALSVMGLYDGREHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LVTCLGLSYDGLLGDDQSTPKTGLLIIVLGMILMEGSRAPEEAIWEALSVMGLYDGREHS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VYWKLRKLLTQEWVQENYLEYRQAPGSDPVRYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VYWKLRKLLTQEWVQENYLEYRQAPGSDPVRYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARV
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB7 RISYPSLHEEALGEEKGV
::::::::::::::::::
CCDS14 RISYPSLHEEALGEEKGV
310
>>CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX (317 aa)
initn: 1303 init1: 1058 opt: 1400 Z-score: 1359.5 bits: 259.8 E(32554): 2.1e-69
Smith-Waterman score: 1400; 72.2% identity (85.4% similar) in 316 aa overlap (5-318:5-317)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MLLGQKSQRYKAEEGLQAQGEAPGLMDVQIPTAEEQKAA-SSSSTLIMGTLEEVTDSGSP
::::. : :::..:: :: ::. .: ::.:::.:: :::: :. :::::: . :
CCDS14 MSSEQKSQHCKPEEGVEAQEEALGLVGAQAPTTEEQEAAVSSSSPLVPGTLEEVPAAESA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 SPPQSPEGASSSLTVTDSTLWSQSDEGSSSNEEEGPSTSPDPAHLESLFREALDEKVAEL
.:::::.:::. :. . : : : .:::::.:::::::::: ::::::::..:: ::
CCDS14 GPPQSPQGASALPTTISFTCWRQPNEGSSSQEEEGPSTSPDA---ESLFREALSNKVDEL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 VRFLLRKYQIKEPVTKAEMLESVIKNYKNHFPDIFSKASECMQVIFGIDVKEVDPAGHSY
..::::::. :: :::::::: :::::: :: ::.:::: ...::::::::::::...:
CCDS14 AHFLLRKYRAKELVTKAEMLERVIKNYKRCFPVIFGKASESLKMIFGIDVKEVDPASNTY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 ILVTCLGLSYDGLLGDDQSTPKTGLLIIVLGMILMEGSRAPEEAIWEALSVMGLYDGREH
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CCDS14 TLVTCLGLSYDGLLGNNQIFPKTGLLIIVLGTIAMEGDSASEEEIWEELGVMGVYDGREH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SVYWKLRKLLTQEWVQENYLEYRQAPGSDPVRYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNAR
.:: . ::::::.:::::::::::.:::.:.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TVYGEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSNPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNAR
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 VRISYPSLHEEAL-GEEKGV
:::.::::.: :: ::.::
CCDS14 VRIAYPSLREAALLEEEEGV
300 310
>>CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX (315 aa)
initn: 1401 init1: 1197 opt: 1302 Z-score: 1265.1 bits: 242.3 E(32554): 3.8e-64
Smith-Waterman score: 1302; 67.2% identity (83.8% similar) in 320 aa overlap (1-318:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLLGQKSQRYKAEEGLQAQGEAPGLMDVQIPTAEEQKAASSSSTLIMGTLEEVTDSGSPS
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CCDS35 MSLEQRSPHCKPDEDLEAQGEDLGLMGAQEPTGEEEETTSSSDS----KEEEVSAAGSSS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 PPQSPEG-ASSSLTVTDSTLWSQSDEGSSSNEEEGPSTSPDPAHLESLFREALDEKVAEL
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CCDS35 PPQSPQGGASSSISVY-YTLWSQFDEGSSSQEEEEPSSSVDPAQLEFMFQEALKLKVAEL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 VRFLLRKYQIKEPVTKAEMLESVIKNYKNHFPDIFSKASECMQVIFGIDVKEVDPAGHSY
:.:::.::..:::::::::::::::::: .:: ::.:::: :::::: ::::::::::::
CCDS35 VHFLLHKYRVKEPVTKAEMLESVIKNYKRYFPVIFGKASEFMQVIFGTDVKEVDPAGHSY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 ILVTCLGLSYDGLLGDDQSTPKTGLLIIVLGMILMEGSRAPEEAIWEALSVMGLYDGREH
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CCDS35 ILVTALGLSCDSMLGDGHSMPKAALLIIVLGVILTKDNCAPEEVIWEALSVMGVYVGKEH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SVYWKLRKLLTQEWVQENYLEYRQAPGSDPVRYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNAR
: . ::::::.:::::::::::.:::::..:::::: .: ::::: ::....: .:::
CCDS35 MFYGEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSDPAHYEFLWGSKAHAETSYEKVINYLVMLNAR
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 VRISYPSLHEEALGEEK-GV
: ::::.::.::::. ::
CCDS35 EPICYPSLYEEVLGEEQEGV
300 310
>>CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX (315 aa)
initn: 1401 init1: 1197 opt: 1302 Z-score: 1265.1 bits: 242.3 E(32554): 3.8e-64
Smith-Waterman score: 1302; 67.2% identity (83.8% similar) in 320 aa overlap (1-318:1-315)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLLGQKSQRYKAEEGLQAQGEAPGLMDVQIPTAEEQKAASSSSTLIMGTLEEVTDSGSPS
: : :.: . : .: :.:::: ::: .: ::.::....:::.. :::. .:: :
CCDS14 MSLEQRSPHCKPDEDLEAQGEDLGLMGAQEPTGEEEETTSSSDS----KEEEVSAAGSSS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 PPQSPEG-ASSSLTVTDSTLWSQSDEGSSSNEEEGPSTSPDPAHLESLFREALDEKVAEL
:::::.: ::::..: ::::: ::::::.::: ::.: :::.:: .:.::: :::::
CCDS14 PPQSPQGGASSSISVY-YTLWSQFDEGSSSQEEEEPSSSVDPAQLEFMFQEALKLKVAEL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 VRFLLRKYQIKEPVTKAEMLESVIKNYKNHFPDIFSKASECMQVIFGIDVKEVDPAGHSY
:.:::.::..:::::::::::::::::: .:: ::.:::: :::::: ::::::::::::
CCDS14 VHFLLHKYRVKEPVTKAEMLESVIKNYKRYFPVIFGKASEFMQVIFGTDVKEVDPAGHSY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 ILVTCLGLSYDGLLGDDQSTPKTGLLIIVLGMILMEGSRAPEEAIWEALSVMGLYDGREH
:::: :::: :..::: .: ::..:::::::.:: . . ::::.:::::::::.: :.::
CCDS14 ILVTALGLSCDSMLGDGHSMPKAALLIIVLGVILTKDNCAPEEVIWEALSVMGVYVGKEH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SVYWKLRKLLTQEWVQENYLEYRQAPGSDPVRYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNAR
: . ::::::.:::::::::::.:::::..:::::: .: ::::: ::....: .:::
CCDS14 MFYGEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSDPAHYEFLWGSKAHAETSYEKVINYLVMLNAR
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 VRISYPSLHEEALGEEK-GV
: ::::.::.::::. ::
CCDS14 EPICYPSLYEEVLGEEQEGV
300 310
>>CCDS76048.1 MAGEA12 gene_id:4111|Hs108|chrX (314 aa)
initn: 1264 init1: 890 opt: 1265 Z-score: 1229.5 bits: 235.7 E(32554): 3.7e-62
Smith-Waterman score: 1265; 65.0% identity (83.0% similar) in 317 aa overlap (1-315:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLLGQKSQRYKAEEGLQAQGEAPGLMDVQIPTAEEQKAASSSSTLIMGTLEEVTDSGSPS
: : :.::. : ::::.::::: ::. .: :..:::..:::::::. ::.:: . :::
CCDS76 MPLEQRSQHCKPEEGLEAQGEALGLVGAQAPATEEQETASSSSTLVEVTLREVPAAESPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PPQSPEGASSSLTVTDSTLWSQSDEGSSSNEEEGPSTSPDPAHLESLFREALDEKVAELV
::.::.:::. :. . :::::::::::..:.::::: :: ::. :. ::..:.::::
CCDS76 PPHSPQGASTLPTTINYTLWSQSDEGSSNEEQEGPSTFPD---LETSFQVALSRKMAELV
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RFLLRKYQIKEPVTKAEMLESVIKNYKNHFPDIFSKASECMQVIFGIDVKEVDPAGHSYI
.::: ::. .:: :::::: :::.:... :: ::::::: .:..:::.: :: :: ::
CCDS76 HFLLLKYRAREPFTKAEMLGSVIRNFQDFFPVIFSKASEYLQLVFGIEVVEVVRIGHLYI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LVTCLGLSYDGLLGDDQSTPKTGLLIIVLGMILMEGSRAPEEAIWEALSVMGLYDGREHS
:::::::::::::::.: .::::::::::..: ::. :::: ::: :::. :::: :
CCDS76 LVTCLGLSYDGLLGDNQIVPKTGLLIIVLAIIAKEGDCAPEEKIWEELSVLEASDGREDS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VYWKLRKLLTQEWVQENYLEYRQAPGSDPVRYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARV
:. . ::::::. ::::::::::.:::::. ::::::::::.::::::::.:......
CCDS76 VFAHPRKLLTQDLVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHLLKISGGP
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 RISYPSLHEEAL--GEEKGV
.:::: ::: :. :::
CCDS76 HISYPPLHEWAFREGEE
300 310
>>CCDS76049.1 MAGEA2 gene_id:4101|Hs108|chrX (314 aa)
initn: 1278 init1: 901 opt: 1260 Z-score: 1224.6 bits: 234.8 E(32554): 6.8e-62
Smith-Waterman score: 1260; 63.7% identity (83.0% similar) in 317 aa overlap (1-315:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLLGQKSQRYKAEEGLQAQGEAPGLMDVQIPTAEEQKAASSSSTLIMGTLEEVTDSGSPS
: : :.::. : ::::.:.::: ::. .: :..:::..:::::::. :: :: . :::
CCDS76 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQQTASSSSTLVEVTLGEVPAADSPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PPQSPEGASSSLTVTDSTLWSQSDEGSSSNEEEGPSTSPDPAHLESLFREALDEKVAELV
::.::.:::: :. . ::: :::::::..::::: :: ::: :. :...:..:::
CCDS76 PPHSPQGASSFSTTINYTLWRQSDEGSSNQEEEGPRMFPD---LESEFQAAISRKMVELV
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RFLLRKYQIKEPVTKAEMLESVIKNYKNHFPDIFSKASECMQVIFGIDVKEVDPAGHSYI
.::: ::. .::::::::::::..: .. :: ::::::: .:..:::.: :: : .: ::
CCDS76 HFLLLKYRAREPVTKAEMLESVLRNCQDFFPVIFSKASEYLQLVFGIEVVEVVPISHLYI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LVTCLGLSYDGLLGDDQSTPKTGLLIIVLGMILMEGSRAPEEAIWEALSVMGLYDGREHS
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CCDS76 HISYPPLHEWVLREGEE
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318 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]