Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7130
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7130, 316 aa
1>>>pF1KB7130 316 - 316 aa - 316 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0483+/-0.000531; mu= 17.9454+/- 0.033
mean_var=99.9407+/-25.208, 0's: 0 Z-trim(108.0): 338 B-trim: 1000 in 1/49
Lambda= 0.128293
statistics sampled from 15574 (16056) to 15574 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.511), E-opt: 0.2 (0.188), width: 16
Scan time: 7.110
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 884 174.8 2.1e-43
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 869 172.0 1.4e-42
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 869 172.0 1.4e-42
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 857 169.8 6.6e-42
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 856 169.6 7.6e-42
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 855 169.4 8.5e-42
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 848 168.1 2.1e-41
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 845 167.6 3.1e-41
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 821 163.1 6.7e-40
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 817 162.4 1.1e-39
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 803 159.8 6.7e-39
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 800 159.2 1e-38
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 789 157.2 4.1e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 781 155.7 1.1e-37
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 781 155.7 1.1e-37
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 781 155.7 1.1e-37
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 760 151.8 1.7e-36
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 757 151.2 2.4e-36
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 753 150.5 4.1e-36
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 551 113.1 7.5e-25
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 531 109.4 9.8e-24
NP_000697 (OMIM: 600821) vasopressin V1a receptor ( 418) 206 49.4 1.5e-05
XP_011509323 (OMIM: 602886) PREDICTED: G-protein c ( 293) 199 47.9 2.9e-05
NP_001499 (OMIM: 602886) G-protein coupled recepto ( 453) 199 48.2 3.9e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 194 47.1 6.1e-05
NP_003941 (OMIM: 602779) proteinase-activated rece ( 385) 189 46.2 0.00013
NP_036257 (OMIM: 118496) muscarinic acetylcholine ( 532) 189 46.4 0.00015
NP_001307846 (OMIM: 118496) muscarinic acetylcholi ( 532) 189 46.4 0.00015
XP_016855642 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
XP_011542347 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
XP_011542349 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
XP_016855648 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
XP_016855644 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
XP_016855647 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
XP_011542346 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
XP_011542345 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
XP_016855652 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
XP_016855651 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
XP_011542343 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
XP_016855643 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
NP_000731 (OMIM: 100100,118494) muscarinic acetylc ( 590) 189 46.4 0.00017
XP_016855650 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
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XP_016855645 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
XP_016855641 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
XP_011542348 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
XP_005273089 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
XP_016855646 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 189 46.4 0.00017
NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 183 45.0 0.00024
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 884; 41.8% identity (78.8% similar) in 306 aa overlap (2-307:4-308)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQLHSPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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pF1KB7 FFLGNLSCLDISYSSVTLPKLLVNLVCSRRAISFLGCITQLHFFHFLGSTEAILLAIMAF
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pF1KB7 DRFVAICNPLRYTVIMNPQVCILLAAAAWLISFFYALMHSVMTAHLSFCGSQKLNHFFYD
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAG-VNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFS
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pF1KB7 TCASHFMVVCLFYGPVGFTYIRPASATSMIQDRIMAIMYSAVTPVLNPLIYTLRNKEVMM
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NP_003 TCASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKK
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300 310
pF1KB7 ALKKIFGRKLFKDWQQHH
:: ....::
NP_003 ALANVISRKRTSSFL
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB7 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQLHSPMY
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pF1KB7 FFLGNLSCLDISYSSVTLPKLLVNLVCSRRAISFLGCITQLHFFHFLGSTEAILLAIMAF
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pF1KB7 DRFVAICNPLRYTVIMNPQVCILLAAAAWLISFFYALMHSVMTAHLSFCGSQKLNHFFYD
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pF1KB7 VKPLLELACSDTLLNQWLLSIVTGSISMGAFFLTLLSCFYVIGFLLFKNRSCRILHKALS
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pF1KB7 TCASHFMVVCLFYGPVGFTYIRPASATSMIQDRIMAIMYSAVTPVLNPLIYTLRNKEVMM
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300 310
pF1KB7 ALKKIFGRKLFKDWQQHH
::::. :: .:
XP_011 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
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pF1KB7 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQLHSPMY
: ....:::::::. . : ..: .:: .:: ...:: :.. : .. ::.:::
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pF1KB7 DRFVAICNPLRYTVIMNPQVCILLAAAAWLISFFYALMHSVMTAHLSFCGSQKLNHFFYD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KB7 VKPLLELACSDTLLNQWLLSIVTGSISMGAFFLTLLSCFYVIGFLLFKNRSCRILHKALS
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::.::. :: :::. . .:. : :. : .: . ...:..:::.:::.::.:::. .
NP_036 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG
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300 310
pF1KB7 ALKKIFGRKLFKDWQQHH
::::. :: .:
NP_036 ALKKVVGRVVFSV
300 310
>>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa)
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Smith-Waterman score: 869; 43.0% identity (75.2% similar) in 307 aa overlap (3-309:15-320)
10 20 30 40
pF1KB7 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVV
: ....:::::::. . : ..: .:: .:: ...:: :.. :
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.. ..::: :: :::.:.:::: ::. .. . :.. : . :: .:. .. : ..:
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XP_011 STKGRWKAFSTCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFI
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pF1KB7 YTLRNKEVMMALKKIFGRKLFKDWQQHH
:.:::. . ::::. :: .:
XP_011 YSLRNRYLKGALKKVVGRVVFSV
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>>NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 [Ho (312 aa)
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Smith-Waterman score: 857; 43.3% identity (75.4% similar) in 305 aa overlap (2-306:4-307)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQLHSPMY
::.: ...::::::. :::: .::.:: .::....:: :.. : . .::.:::
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pF1KB7 FFLGNLSCLDISYSSVTLPKLLVNLVCSRRAISFLGCITQLHFFHFLGSTEAILLAIMAF
:::.::: .:: . :.:.::.::.. . ::..::.::..:. .... ...:::.::.
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pF1KB7 DRFVAICNPLRYTVIMNPQVCILLAAAAWLISFFYALMHSVMTAHLSFCGSQKLNHFFYD
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.:..:::.::::. .: ..:. ... :.: ... :. : . .::.:
NP_001 PAQVLKVACSNTLLNNIVLYVATALLGVFPVAGILFSYSQIVSSLM-GMSSTKGKYKAFS
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::.::. :: :::: .:. : . : .. ..::. :::.:::.::.::::.:
NP_001 TCGSHLCVVSLFYGTGLGVYLSSAVTHSSQSSSTASVMYAMVTPMLNPFIYSLRNKDVKG
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pF1KB7 ALKKIFGRKLFKDWQQHH
::.....:
NP_001 ALERLLSRADSCP
300 310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
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Smith-Waterman score: 856; 41.8% identity (73.2% similar) in 306 aa overlap (3-308:7-311)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQLHSP
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NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 MYFFLGNLSCLDISYSSVTLPKLLVNLVCSRRAISFLGCITQLHFFHFLGSTEAILLAIM
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NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 AFDRFVAICNPLRYTVIMNPQVCILLAAAAWLISFFYALMHSVMTAHLSFCGSQKLNHFF
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YDVKPLLELACSDTLLNQWLLSIVTGSISMGAFFLTLLSCFYVIGFLLFKNRSCRILHKA
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFIL-LSVLKIRSFSGRKKT
190 200 210 220 230
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pF1KB7 LSTCASHFMVVCLFYGPVGFTYIRPASATSMIQDRIMAIMYSAVTPVLNPLIYTLRNKEV
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NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 MMALKKIFGRKLFKDWQQHH
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NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
initn: 843 init1: 589 opt: 855 Z-score: 871.4 bits: 169.4 E(85289): 8.5e-42
Smith-Waterman score: 855; 43.0% identity (75.9% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQLHSPMYFF
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NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMYLS
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 LGNLSCLDISYSSVTLPKLLVNLVCSRRAISFLGCITQLHFFHFLGSTEAILLAIMAFDR
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NP_001 LAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAYDH
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pF1KB7 FVAICNPLRYTVIMNPQVCILLAAAAWLISFFYALMHSVMTAHLSFCGSQKLNHFFYDVK
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NP_001 YVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCDLN
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 PLLELACSDTLLNQWLLSIVTGSISMGAFFLTLLSCFYVIGFLLFKNRSCRILHKALSTC
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NP_001 PLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVS--YVVILCSLRTHSLEARHKALSTC
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pF1KB7 ASHFMVVCLFYGPVGFTYIRPASATSMIQDRIMAIMYSAVTPVLNPLIYTLRNKEVMMAL
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NP_001 VSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPI--DKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAI
240 250 260 270 280 290
310
pF1KB7 KKIFGRKLFKDWQQHH
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NP_001 RKLCSRKDISGDK
300
>>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa)
initn: 783 init1: 569 opt: 848 Z-score: 864.3 bits: 168.1 E(85289): 2.1e-41
Smith-Waterman score: 848; 41.6% identity (76.6% similar) in 303 aa overlap (3-305:8-309)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQLHS
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NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 PMYFFLGNLSCLDISYSSVTLPKLLVNLVCSRRAISFLGCITQLHFFHFLGSTEAILLAI
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NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 MAFDRFVAICNPLRYTVIMNPQVCILLAAAAWLISFFYALMHSVMTAHLSFCGSQKLNHF
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NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF
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pF1KB7 FYDVKPLLELACSDTLLNQWLLSIVTGSISMGAFFLTLLSCFYVIGFLLFKNRSCRILHK
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NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTL-MITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQK
190 200 210 220 230
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pF1KB7 ALSTCASHFMVVCLFYGPVGFTYIRPASATSMIQDRIMAIMYSAVTPVLNPLIYTLRNKE
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NP_001 VFGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 VMMALKKIFGRKLFKDWQQHH
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NP_001 VRGAVKRLMGWE
300 310
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
initn: 826 init1: 562 opt: 845 Z-score: 861.2 bits: 167.6 E(85289): 3.1e-41
Smith-Waterman score: 845; 43.8% identity (74.4% similar) in 308 aa overlap (3-308:5-310)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENVTTMNEFLLLGLTGVQ-ELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQLHSPM
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NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHSPM
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pF1KB7 YFFLGNLSCLDISYSSVTLPKLLVNLVCSRRAISFLGCITQLHFFHFLGSTEAILLAIMA
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NP_835 YFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATMA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 FDRFVAICNPLRYTVIMNPQVCILLAAAAWLISFFYALMHSVMTAHLSFCGSQKLNHFFY
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NP_835 YDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFFC
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 DVKPLLELACSDTLLNQWLLSIVTGSISMGAFFLTLLSCFYV-IGFLLFKNRSCRILHKA
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NP_835 DSPPVLKLVCADTALFE--IYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKA
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LSTCASHFMVVCLFYGPVGFTYIRPASATSMIQDRIMAIMYSAVTPVLNPLIYTLRNKEV
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NP_835 FSTCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 MMALKKIFGRKLFKDWQQHH
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NP_835 KNALSRTFHKVLALRNCIP
300 310
>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo (312 aa)
initn: 785 init1: 593 opt: 821 Z-score: 837.3 bits: 163.1 E(85289): 6.7e-40
Smith-Waterman score: 821; 39.9% identity (73.5% similar) in 313 aa overlap (3-310:5-309)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MENVTTMNEFLLLGLTGVQELQPFFFGIFLIIYLINLIGNGSILVMVVLEPQLHSPMY
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NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 FFLGNLSCLDISYSSVTLPKLLVNLVCSRRAISFLGCITQLHFFHFLGSTEAILLAIMAF
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NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRFVAICNPLRYTVIMNPQVCILLAAAAWLISFFYALMHSVMTAHLSFCGSQKLNHFFYD
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NP_002 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VKPLLELACSDTLLNQWLLSIVTGSISMGAFFLTLLSCFYVIGFLLFKNRSCRI-----L
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NP_002 MYVLLRMACSNIQINHTVL------IATGCFIFLIPFGFVIISYVLIIRAILRIPSVSKK
190 200 210 220 230
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pF1KB7 HKALSTCASHFMVVCLFYGPVGFTYIRPASATSMIQDRIMAIMYSAVTPVLNPLIYTLRN
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NP_002 YKAFSTCASHLGAVSLFYGTLCMVYLKPLHTYS-VKDSVATVMYAVVTPMMNPFIYSLRN
240 250 260 270 280 290
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NP_002 KDMHGALGRLLDKH-FKRLT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]