Result of FASTA (omim) for
pFN21AB6006
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6006, 2468 aa
1>>>pF1KB6006 2468 - 2468 aa - 2468 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.6865+/-0.000556; mu= -30.9198+/- 0.035
mean_var=545.0923+/-108.902, 0's: 0 Z-trim(120.2): 122 B-trim: 0 in 0/61
Lambda= 0.054934
statistics sampled from 35091 (35215) to 35091 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.413), width: 16
Scan time: 24.570
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005900 (OMIM: 157129) microtubule-associated pr (2468) 15986 1283.7 0
NP_001311184 (OMIM: 157129) microtubule-associated (2342) 15185 1220.2 0
XP_016877678 (OMIM: 600178) PREDICTED: microtubule (3041) 2442 210.3 3.1e-52
NP_002364 (OMIM: 600178) microtubule-associated pr (2803) 1896 167.0 3.1e-39
NP_060644 (OMIM: 607573) microtubule-associated pr (1059) 1320 121.3 6.9e-26
XP_016882419 (OMIM: 607573) PREDICTED: microtubule (1068) 1320 121.3 7e-26
NP_001295292 (OMIM: 607573) microtubule-associated (1033) 1299 119.6 2.1e-25
XP_016882420 (OMIM: 607573) PREDICTED: microtubule (1042) 1299 119.6 2.2e-25
XP_011528502 (OMIM: 105400,162230,616924) PREDICTE ( 924) 374 46.3 0.0023
NP_066554 (OMIM: 105400,162230,616924) neurofilame (1020) 374 46.3 0.0025
>>NP_005900 (OMIM: 157129) microtubule-associated protei (2468 aa)
initn: 15986 init1: 15986 opt: 15986 Z-score: 6861.4 bits: 1283.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 15986; 100.0% identity (100.0% similar) in 2468 aa overlap (1-2468:1-2468)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MATVVVEATEPEPSGSIANPAASTSPSLSHRFLDSKFYLLVVVGEIVTEEHLRRAIGNIE
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NP_005 MATVVVEATEPEPSGSIANPAASTSPSLSHRFLDSKFYLLVVVGEIVTEEHLRRAIGNIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LGIRSWDTNLIECNLDQELKLFVSRHSARFSPEVPGQKILHHRSDVLETVVLINPSDEAV
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NP_005 LGIRSWDTNLIECNLDQELKLFVSRHSARFSPEVPGQKILHHRSDVLETVVLINPSDEAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 STEVRLMITDAARHKLLVLTGQCFENTGELILQSGSFSFQNFIEIFTDQEIGELLSTTHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 STEVRLMITDAARHKLLVLTGQCFENTGELILQSGSFSFQNFIEIFTDQEIGELLSTTHP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 ANKASLTLFCPEEGDWKNSNLDRHNLQDFINIKLNSASILPEMEGLSEFTEYLSESVEVP
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NP_005 ANKASLTLFCPEEGDWKNSNLDRHNLQDFINIKLNSASILPEMEGLSEFTEYLSESVEVP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SPFDILEPPTSGGFLKLSKPCCYIFPGGRGDSALFAVNGFNMLINGGSERKSCFWKLIRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SPFDILEPPTSGGFLKLSKPCCYIFPGGRGDSALFAVNGFNMLINGGSERKSCFWKLIRH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LDRVDSILLTHIGDDNLPGINSMLQRKIAELEEEQSQGSTTNSDWMKNLISPDLGVVFLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LDRVDSILLTHIGDDNLPGINSMLQRKIAELEEEQSQGSTTNSDWMKNLISPDLGVVFLN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 VPENLKNPEPNIKMKRSIEEACFTLQYLNKLSMKPEPLFRSVGNTIDPVILFQKMGVGKL
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NP_005 VPENLKNPEPNIKMKRSIEEACFTLQYLNKLSMKPEPLFRSVGNTIDPVILFQKMGVGKL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 EMYVLNPVKSSKEMQYFMQQWTGTNKDKAEFILPNGQEVDLPISYLTSVSSLIVWHPANP
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NP_005 EMYVLNPVKSSKEMQYFMQQWTGTNKDKAEFILPNGQEVDLPISYLTSVSSLIVWHPANP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 AEKIIRVLFPGNSTQYNILEGLEKLKHLDFLKQPLATQKDLTGQVPTPVVKQTKLKQRAD
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NP_005 AEKIIRVLFPGNSTQYNILEGLEKLKHLDFLKQPLATQKDLTGQVPTPVVKQTKLKQRAD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 SRESLKPAAKPLPSKSVRKESKEETPEVTKVNHVEKPPKVESKEKVMVKKDKPIKTETKP
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NP_005 SRESLKPAAKPLPSKSVRKESKEETPEVTKVNHVEKPPKVESKEKVMVKKDKPIKTETKP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 SVTEKEVPSKEEPSPVKAEVAEKQATDVKPKAAKEKTVKKETKVKPEDKKEEKEKPKKEV
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NP_005 SVTEKEVPSKEEPSPVKAEVAEKQATDVKPKAAKEKTVKKETKVKPEDKKEEKEKPKKEV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 AKKEDKTPIKKEEKPKKEEVKKEVKKEIKKEEKKEPKKEVKKETPPKEVKKEVKKEEKKE
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NP_005 AKKEDKTPIKKEEKPKKEEVKKEVKKEIKKEEKKEPKKEVKKETPPKEVKKEVKKEEKKE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 VKKEEKEPKKEIKKLPKDAKKSSTPLSEAKKPAALKPKVPKKEESVKKDSVAAGKPKEKG
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NP_005 VKKEEKEPKKEIKKLPKDAKKSSTPLSEAKKPAALKPKVPKKEESVKKDSVAAGKPKEKG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB6 KIKVIKKEGKAAEAVAAAVGTGATTAAVMAAAGIAAIGPAKELEAERSLMSSPEDLTKDF
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NP_005 KIKVIKKEGKAAEAVAAAVGTGATTAAVMAAAGIAAIGPAKELEAERSLMSSPEDLTKDF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB6 EELKAEEVDVTKDIKPQLELIEDEEKLKETEPVEAYVIQKEREVTKGPAESPDEGITTTE
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NP_005 EELKAEEVDVTKDIKPQLELIEDEEKLKETEPVEAYVIQKEREVTKGPAESPDEGITTTE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB6 GEGECEQTPEELEPVEKQGVDDIEKFEDEGAGFEESSETGDYEEKAETEEAEEPEEDGEE
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NP_005 GEGECEQTPEELEPVEKQGVDDIEKFEDEGAGFEESSETGDYEEKAETEEAEEPEEDGEE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB6 HVCVSASKHSPTEDEESAKAEADAYIREKRESVASGDDRAEEDMDEAIEKGEAEQSEEEA
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NP_005 HVCVSASKHSPTEDEESAKAEADAYIREKRESVASGDDRAEEDMDEAIEKGEAEQSEEEA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB6 DEEDKAEDAREEEYEPEKMEAEDYVMAVVDKAAEAGGAEEQYGFLTTPTKQLGAQSPGRE
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NP_005 DEEDKAEDAREEEYEPEKMEAEDYVMAVVDKAAEAGGAEEQYGFLTTPTKQLGAQSPGRE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB6 PASSIHDETLPGGSESEATASDEENREDQPEEFTATSGYTQSTIEISSEPTPMDEMSTPR
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NP_005 PASSIHDETLPGGSESEATASDEENREDQPEEFTATSGYTQSTIEISSEPTPMDEMSTPR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB6 DVMSDETNNEETESPSQEFVNITKYESSLYSQEYSKPADVTPLNGFSEGSKTDATDGKDY
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NP_005 DVMSDETNNEETESPSQEFVNITKYESSLYSQEYSKPADVTPLNGFSEGSKTDATDGKDY
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB6 NASASTISPPSSMEEDKFSRSALRDAYCSEVKASTTLDIKDSISAVSSEKVSPSKSPSLS
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NP_005 NASASTISPPSSMEEDKFSRSALRDAYCSEVKASTTLDIKDSISAVSSEKVSPSKSPSLS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB6 PSPPSPLEKTPLGERSVNFSLTPNEIKVSAEAEVAPVSPEVTQEVVEEHCASPEDKTLEV
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NP_005 PSPPSPLEKTPLGERSVNFSLTPNEIKVSAEAEVAPVSPEVTQEVVEEHCASPEDKTLEV
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB6 VSPSQSVTGSAGHTPYYQSPTDEKSSHLPTEVIEKPPAVPVSFEFSDAKDENERASVSPM
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NP_005 VSPSQSVTGSAGHTPYYQSPTDEKSSHLPTEVIEKPPAVPVSFEFSDAKDENERASVSPM
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB6 DEPVPDSESPIEKVLSPLRSPPLIGSESAYESFLSADDKASGRGAESPFEEKSGKQGSPD
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NP_005 DEPVPDSESPIEKVLSPLRSPPLIGSESAYESFLSADDKASGRGAESPFEEKSGKQGSPD
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB6 QVSPVSEMTSTSLYQDKQEGKSTDFAPIKEDFGQEKKTDDVEAMSSQPALALDERKLGDV
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NP_005 QVSPVSEMTSTSLYQDKQEGKSTDFAPIKEDFGQEKKTDDVEAMSSQPALALDERKLGDV
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB6 SPTQIDVSQFGSFKEDTKMSISEGTVSDKSATPVDEGVAEDTYSHMEGVASVSTASVATS
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NP_005 SPTQIDVSQFGSFKEDTKMSISEGTVSDKSATPVDEGVAEDTYSHMEGVASVSTASVATS
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB6 SFPEPTTDDVSPSLHAEVGSPHSTEVDDSLSVSVVQTPTTFQETEMSPSKEECPRPMSIS
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NP_005 SFPEPTTDDVSPSLHAEVGSPHSTEVDDSLSVSVVQTPTTFQETEMSPSKEECPRPMSIS
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB6 PPDFSPKTAKSRTPVQDHRSEQSSMSIEFGQESPEQSLAMDFSRQSPDHPTVGAGVLHIT
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NP_005 PPDFSPKTAKSRTPVQDHRSEQSSMSIEFGQESPEQSLAMDFSRQSPDHPTVGAGVLHIT
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB6 ENGPTEVDYSPSDMQDSSLSHKIPPMEEPSYTQDNDLSELISVSQVEASPSTSSAHTPSQ
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NP_005 ENGPTEVDYSPSDMQDSSLSHKIPPMEEPSYTQDNDLSELISVSQVEASPSTSSAHTPSQ
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB6 IASPLQEDTLSDVAPPRDMSLYASLTSEKVQSLEGEKLSPKSDISPLTPRESSPLYSPTF
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NP_005 IASPLQEDTLSDVAPPRDMSLYASLTSEKVQSLEGEKLSPKSDISPLTPRESSPLYSPTF
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KB6 SDSTSAVKEKTATCHSSSSPPIDAASAEPYGFRASVLFDTMQHHLALNRDLSTPGLEKDS
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NP_005 SDSTSAVKEKTATCHSSSSPPIDAASAEPYGFRASVLFDTMQHHLALNRDLSTPGLEKDS
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KB6 GGKTPGDFSYAYQKPEETTRSPDEEDYDYESYEKTTRTSDVGGYYYEKIERTTKSPSDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GGKTPGDFSYAYQKPEETTRSPDEEDYDYESYEKTTRTSDVGGYYYEKIERTTKSPSDSG
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB6 YSYETIGKTTKTPEDGDYSYEIIEKTTRTPEEGGYSYDISEKTTSPPEVSGYSYEKTERS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YSYETIGKTTKTPEDGDYSYEIIEKTTRTPEEGGYSYDISEKTTSPPEVSGYSYEKTERS
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KB6 RRLLDDISNGYDDSEDGGHTLGDPSYSYETTEKITSFPESEGYSYETSTKTTRTPDTSTY
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NP_005 RRLLDDISNGYDDSEDGGHTLGDPSYSYETTEKITSFPESEGYSYETSTKTTRTPDTSTY
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KB6 CYETAEKITRTPQASTYSYETSDLCYTAEKKSPSEARQDVDLCLVSSCEYKHPKTELSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CYETAEKITRTPQASTYSYETSDLCYTAEKKSPSEARQDVDLCLVSSCEYKHPKTELSPS
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KB6 FINPNPLEWFASEEPTEESEKPLTQSGGAPPPPGGKQQGRQCDETPPTSVSESAPSQTDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FINPNPLEWFASEEPTEESEKPLTQSGGAPPPPGGKQQGRQCDETPPTSVSESAPSQTDS
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KB6 DVPPETEECPSITADANIDSEDESETIPTDKTVTYKHMDPPPAPVQDRSPSPRHPDVSMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DVPPETEECPSITADANIDSEDESETIPTDKTVTYKHMDPPPAPVQDRSPSPRHPDVSMV
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KB6 DPEALAIEQNLGKALKKDLKEKTKTKKPGTKTKSSSPVKKSDGKSKPLAASPKPAGLKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DPEALAIEQNLGKALKKDLKEKTKTKKPGTKTKSSSPVKKSDGKSKPLAASPKPAGLKES
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KB6 SDKVSRVASPKKKESVEKAAKPTTTPEVKAARGEEKDKETKNAANASASKSAKTATAGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SDKVSRVASPKKKESVEKAAKPTTTPEVKAARGEEKDKETKNAANASASKSAKTATAGPG
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KB6 TTKTTKSSAVPPGLPVYLDLCYIPNHSNSKNVDVEFFKRVRSSYYVVSGNDPAAEEPSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TTKTTKSSAVPPGLPVYLDLCYIPNHSNSKNVDVEFFKRVRSSYYVVSGNDPAAEEPSRA
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KB6 VLDALLEGKAQWGSNMQVTLIPTHDSEVMREWYQETHEKQQDLNIMVLASSSTVVMQDES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VLDALLEGKAQWGSNMQVTLIPTHDSEVMREWYQETHEKQQDLNIMVLASSSTVVMQDES
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KB6 FPACKIEL
::::::::
NP_005 FPACKIEL
>>NP_001311184 (OMIM: 157129) microtubule-associated pro (2342 aa)
initn: 15185 init1: 15185 opt: 15185 Z-score: 6518.7 bits: 1220.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 15185; 100.0% identity (100.0% similar) in 2342 aa overlap (127-2468:1-2342)
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 QKILHHRSDVLETVVLINPSDEAVSTEVRLMITDAARHKLLVLTGQCFENTGELILQSGS
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MITDAARHKLLVLTGQCFENTGELILQSGS
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 FSFQNFIEIFTDQEIGELLSTTHPANKASLTLFCPEEGDWKNSNLDRHNLQDFINIKLNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FSFQNFIEIFTDQEIGELLSTTHPANKASLTLFCPEEGDWKNSNLDRHNLQDFINIKLNS
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 ASILPEMEGLSEFTEYLSESVEVPSPFDILEPPTSGGFLKLSKPCCYIFPGGRGDSALFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASILPEMEGLSEFTEYLSESVEVPSPFDILEPPTSGGFLKLSKPCCYIFPGGRGDSALFA
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 VNGFNMLINGGSERKSCFWKLIRHLDRVDSILLTHIGDDNLPGINSMLQRKIAELEEEQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNGFNMLINGGSERKSCFWKLIRHLDRVDSILLTHIGDDNLPGINSMLQRKIAELEEEQS
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 QGSTTNSDWMKNLISPDLGVVFLNVPENLKNPEPNIKMKRSIEEACFTLQYLNKLSMKPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGSTTNSDWMKNLISPDLGVVFLNVPENLKNPEPNIKMKRSIEEACFTLQYLNKLSMKPE
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 PLFRSVGNTIDPVILFQKMGVGKLEMYVLNPVKSSKEMQYFMQQWTGTNKDKAEFILPNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLFRSVGNTIDPVILFQKMGVGKLEMYVLNPVKSSKEMQYFMQQWTGTNKDKAEFILPNG
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 QEVDLPISYLTSVSSLIVWHPANPAEKIIRVLFPGNSTQYNILEGLEKLKHLDFLKQPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QEVDLPISYLTSVSSLIVWHPANPAEKIIRVLFPGNSTQYNILEGLEKLKHLDFLKQPLA
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 TQKDLTGQVPTPVVKQTKLKQRADSRESLKPAAKPLPSKSVRKESKEETPEVTKVNHVEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TQKDLTGQVPTPVVKQTKLKQRADSRESLKPAAKPLPSKSVRKESKEETPEVTKVNHVEK
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 PPKVESKEKVMVKKDKPIKTETKPSVTEKEVPSKEEPSPVKAEVAEKQATDVKPKAAKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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.: ::.:.:....:: : :: :::..:::..::: : . : .. . .
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XP_016 DESFPACKIEF
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NP_002 DESFPACKIEF
2800
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NP_060 ALGITVLGSNSMVSMQDDAFPACKVEF
1040 1050
>>XP_016882419 (OMIM: 607573) PREDICTED: microtubule-ass (1068 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB6 TEPEPSGSIANPAASTSPSLSHRFLDSKFYLLVVVG-EIVTEEHLRRAIGNIELGIRSWD
::.::: :. . : .. ..: ::::::
XP_016 MAAVAGSGAAAAPSSLLLVVGSEFGSPGLLTYVLEELERGIRSWD
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
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.. ::::..::.::::::: :: : ::. ::::.: :::.::.::::... :.: .
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pF1KB6 ITDAARHKLLVLTGQCFENTGELILQSGSFSFQNFIEIFTDQEIGELLSTTHPANKAS-L
. : : ::::::.: :.:.::::.::.:.:: ..:.... :.:: ..:.:: : . :
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110 120 130 140 150 160
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:. :: ::: . .:: . ...:: . ::. ::: :: ::..::.: ::::.
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.::::::::::.:..::::::::: ::.:.::::::..:.::::. :: ::::.::::::
XP_016 LLEPPTSGGFLRLGRPCCYIFPGGLGDAAFFAVNGFTVLVNGGSNPKSSFWKLVRHLDRV
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:..:.:: : :.:::.::.:.::.:: . : . :. . .: .. ::::.:::::.:. :
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. .. :. .:: ..:. : .:.. : :: :. :..::.:::::.:.:::
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:.: ... : :.:: .:.:::::.:.::.
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.:::::: . .:.:: .:.:: ::..:..: .:: : : . .. .. .: .:..
XP_016 VRVLFPGCTPPACLLDGLVRLQHLRFLREPVVTPQDLEG--PGRAESKESVGSRDSSKRE
430 440 450 460 470 480
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:..: :.. .::: .. :.:. :. .... : .... : :.. .: ...
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490 500 510 520 530 540
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: . :.. .. :.: ::
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550 560 570 580 590 600
>--
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1980 1990 2000 2010 2020 2030
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: .:... : : . .. :. :: ..
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: . :. :... . :. : ::. . ..: : .:::::
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::: ::..: :. : . : : .:.. . .:.. ..:: :. .
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:::::::::: :. .::: : : . :. : . :. .: .: :: :
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:.. : : .. ::::: : . .. .. ..:.:: .. .: . .
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:. :.::. : :: ..:..:: : . ::.: ..: . :
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. ::.::.: :: :::::::: .: .: ..:: ::::: :: .:. :
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pF1KB6 YQETHEKQQDLNIMVLASSSTVVMQDESFPACKIEL
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XP_016 YAETHARHQALGITVLGSNSMVSMQDDAFPACKVEF
1040 1050 1060
>>NP_001295292 (OMIM: 607573) microtubule-associated pro (1033 aa)
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110 120 130 140 150 160
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pF1KB6 --NIKLNSASILPEMEGLSEFTEYLSESVEVPSPFDILEPPTSGGFLKLSKPCCYIFPGG
...:: . ::. ::: :: ::..::.: ::::..::::::::::.:..:::::::::
NP_001 RLQLRLNPPAQLPNSEGLCEFLEYVAESLEPPSPFELLEPPTSGGFLRLGRPCCYIFPGG
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pF1KB6 RGDSALFAVNGFNMLINGGSERKSCFWKLIRHLDRVDSILLTHIGDDNLPGINSMLQRKI
::.:.::::::..:.::::. :: ::::.:::::::..:.:: : :.:::.::.:.::.
NP_001 LGDAAFFAVNGFTVLVNGGSNPKSSFWKLVRHLDRVDAVLVTHPGADSLPGLNSLLRRKL
230 240 250 260 270 280
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pF1KB6 AELEEEQSQGSTTNSDWMKNLISPDLGVVFLNVPENLKNPEPNIKMKRSIEEACFTLQYL
:: . : . :. . .: .. ::::.:::::.:. : . .. :. .:: ..:. :
NP_001 AE-RSEVAAGGGSWDDRLRRLISPNLGVVFFNACEAAS------RLARGEDEAELALSLL
290 300 310 320 330
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pF1KB6 NKLSMKPEPLFRSVGNTIDPVILFQKMGVGKLEMYVLNPVKSSKEMQYFMQQWTGTNKDK
.:.. : :: :. :..::.:::::.:.::::.: ... :
NP_001 AQLGITPLPLSRG-PVPAKPTVLFEKMGVGRLDMYVLHPPSAGAERT-------------
340 350 360 370 380
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pF1KB6 AEFILPNGQEVDLPISYLTSVSSLIVWHPANPAEKIIRVLFPGNSTQYNILEGLEKLKHL
:.:: .:.:::::.:.::..:::::: . .:.:: .:.::
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390 400 410 420
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pF1KB6 DFLKQPLATQKDLTGQVPTPVVKQTKLKQRADSRESLKPAAKPLPSKS----VRKE-SKE
::..:..: .:: : : . .. .. .: .:.. :..: :.. .::: ..
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430 440 450 460 470 480
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:.:. :. .... : .... : :.. .: ... : . :.. .. :.: ::
NP_001 EAPRKTE-KEAKTPRELKKDPKPSVSRTQPREVRRAASSVPNLKKTNAQAAPKPRKAPST
490 500 510 520 530 540
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pF1KB6 EKQATDVKPKAAKEKTVKKETKVKPEDKKEEKEKPKKEVAKKEDKTPIKKEEKPKKEEVK
NP_001 SHSGFPPVANGPRSPPSLRCGEASPPSAACGSPASQLVATPSLELGPIPAGEEKALELPL
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>--
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1980 1990 2000 2010 2020 2030
pF1KB6 RSRRLLDDISNGYDDSEDGGHTLGDPSYSYETTEKITSFPESEGYSYETSTKTTRTPDTS
: .:... : : . .. :. :: ..
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pF1KB6 T----------YCYETAEKITRT-PQASTYSYETSDLCYTAEKKSPSEAR----QDVDLC
: . :. :... . :. : ::. . ..: : .:::::
NP_001 TPSLPAEVGSPHSTEVDESLSVSFEQVLPPSAPTSEAGLSLPLRGPRARRSASPHDVDLC
660 670 680 690 700 710
2090 2100 2110 2120 2130 2140
pF1KB6 LVSSCEYKHPKTELSPSFINPNPLEWFASEEPTEESEKPLTQSGGAPPPPGGKQQGRQCD
::: ::..: :. : . : : .:.. . .:.. ..:: :. .
NP_001 LVSPCEFEHRKA--VP--MAPAPASPGSSNDSSARSQE---RAGGL----GA-------E
720 730 740 750
2150 2160 2170 2180 2190 2200
pF1KB6 ETPPTSVSESAPSQTDSDVPPETEECPSITADANIDSEDESETIPTDKTVTYKHMDPPPA
:::::::::: :. .::: : : . :. : . :. .: .: :: :
NP_001 ETPPTSVSESLPTLSDSD-P-----VPLAPGAADSDEDTEGFGVP-------RH-DPLPD
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pF1KB6 PVQDRSPSPRHPDVSMVDPEALAIEQNLGKALKKDLKEKTKTKKPGTKTKSSSPVKKSDG
:.. : : .. ::::: : . .. .. ..:.:: .. .: . .
NP_001 PLKVPPPLPDPSSICMVDPEMLPPKTA------RQTENVSRTRKPLARPNS----RAAAP
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pF1KB6 KSKPLAASPKPAGLKESSDKVSRVASPKKKESVEKAAKPTTTPEVKAARGEEKDKETKNA
:. :.::. : :: ..:..:: : . ::.: ..: . :
NP_001 KATPVAAA-KTKGLA-GGDRASR---------------PLS------ARSEPSEKGGR-A
860 870 880
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pF1KB6 ANASASKSAKTATAGPGTTKTTKS--SAVPPGLPVYLDLCYIPNHSNSKNVDVEFFKRVR
. :.. :::: ::. . ... ::.:: :::::: :.:. :... :: :::.:::
NP_001 PLSRKSSTPKTATRGPSGSASSRPGVSATPPKSPVYLDLAYLPSGSSAHLVDEEFFQRVR
890 900 910 920 930 940
2390 2400 2410 2420 2430 2440
pF1KB6 SSYYVVSGNDPAAEEPSRAVLDALLEGKAQWGSNMQVTLIPTHDSEVMREWYQETHEKQQ
. ::.::.: :: :::::::: .: .: ..::::::: :: .:. :: ::: ..:
NP_001 ALCYVISGQDQRKEEGMRAVLDALLASKQHWDRDLQVTLIPTFDSVAMHTWYAETHARHQ
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pF1KB6 DLNIMVLASSSTVVMQDESFPACKIEL
:.: ::.:.: : :::..:::::.:.
NP_001 ALGITVLGSNSMVSMQDDAFPACKVEF
1010 1020 1030
>>XP_016882420 (OMIM: 607573) PREDICTED: microtubule-ass (1042 aa)
initn: 2131 init1: 602 opt: 1299 Z-score: 576.9 bits: 119.6 E(85289): 2.2e-25
Smith-Waterman score: 1493; 43.9% identity (70.5% similar) in 567 aa overlap (62-618:14-539)
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pF1KB6 FLDSKFYLLVVVGEIVTEEHLRRAIGNIELGIRSWDTNLIECNLDQELKLFVSRHSARFS
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XP_016 MAGMIDRFSPANTGIRSWDVDPGVCNLDEQLKVFVSRHSATFS
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XP_016 AE-RSEVAAGGGSWDDRLRRLISPNLGVVFFNACEAAS------RLARGEDEAELALSLL
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XP_016 AQLGITPLPLSRG-PVPAKPTVLFEKMGVGRLDMYVLHPPSAGAERT-------------
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pF1KB6 AEFILPNGQEVDLPISYLTSVSSLIVWHPANPAEKIIRVLFPGNSTQYNILEGLEKLKHL
:.:: .:.:::::.:.::..:::::: . .:.:: .:.::
XP_016 -----------------LASVCALLVWHPAGPGEKVVRVLFPGCTPPACLLDGLVRLQHL
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initn: 755 init1: 266 opt: 537 Z-score: 250.5 bits: 59.2 E(85289): 3.3e-07
Smith-Waterman score: 696; 34.2% identity (56.2% similar) in 486 aa overlap (2009-2468:623-1042)
1980 1990 2000 2010 2020 2030
pF1KB6 RSRRLLDDISNGYDDSEDGGHTLGDPSYSYETTEKITSFPESEGYSYETSTKTTRTPDTS
: .:... : : . .. :. :: ..
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