Result of FASTA (omim) for
pFN21AB4216
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4216, 1141 aa
1>>>pF1KB4216 1141 - 1141 aa - 1141 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.5087+/-0.000501; mu= -12.7749+/- 0.031
mean_var=358.1166+/-73.842, 0's: 0 Z-trim(118.4): 69 B-trim: 367 in 1/54
Lambda= 0.067774
statistics sampled from 31298 (31367) to 31298 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.697), E-opt: 0.2 (0.368), width: 16
Scan time: 17.730
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004590 (OMIM: 600481) sterol regulatory element (1141) 7510 749.5 2.6e-215
XP_006724373 (OMIM: 600481) PREDICTED: sterol regu (1111) 7320 730.9 9.9e-210
XP_016884410 (OMIM: 600481) PREDICTED: sterol regu ( 965) 5993 601.2 1e-170
XP_016884411 (OMIM: 600481) PREDICTED: sterol regu ( 749) 4803 484.8 8.6e-136
XP_011528649 (OMIM: 600481) PREDICTED: sterol regu (1016) 3711 378.1 1.5e-103
XP_005256829 (OMIM: 184756) PREDICTED: sterol regu (1145) 2050 215.7 1.3e-54
NP_004167 (OMIM: 184756) sterol regulatory element (1147) 2037 214.4 3.2e-54
NP_001308025 (OMIM: 184756) sterol regulatory elem (1123) 2017 212.4 1.2e-53
NP_001005291 (OMIM: 184756) sterol regulatory elem (1177) 2017 212.5 1.3e-53
XP_016880459 (OMIM: 184756) PREDICTED: sterol regu ( 766) 1751 186.3 6e-46
XP_016880460 (OMIM: 184756) PREDICTED: sterol regu ( 666) 1733 184.6 1.8e-45
>>NP_004590 (OMIM: 600481) sterol regulatory element-bin (1141 aa)
initn: 7510 init1: 7510 opt: 7510 Z-score: 3986.5 bits: 749.5 E(85289): 2.6e-215
Smith-Waterman score: 7510; 100.0% identity (100.0% similar) in 1141 aa overlap (1-1141:1-1141)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDDSGELGGLETMETLTELGDELTLGDIDEMLQFVSNQVGEFPDLFSEQLCSSFPGSGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MDDSGELGGLETMETLTELGDELTLGDIDEMLQFVSNQVGEFPDLFSEQLCSSFPGSGGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GSSSGSSGSSSSSSNGRGSSSGAVDPSVQRSFTQVTLPSFSPSAASPQAPTLQVKVSPTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GSSSGSSGSSSSSSNGRGSSSGAVDPSVQRSFTQVTLPSFSPSAASPQAPTLQVKVSPTS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 VPTTPRATPILQPRPQPQPQPQTQLQQQTVMITPTFSTTPQTRIIQQPLIYQNAATSFQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VPTTPRATPILQPRPQPQPQPQTQLQQQTVMITPTFSTTPQTRIIQQPLIYQNAATSFQV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LQPQVQSLVTSSQVQPVTIQQQVQTVQAQRVLTQTANGTLQTLAPATVQTVAAPQVQQVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LQPQVQSLVTSSQVQPVTIQQQVQTVQAQRVLTQTANGTLQTLAPATVQTVAAPQVQQVP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 VLVQPQIIKTDSLVLTTLKTDGSPVMAAVQNPALTALTTPIQTAALQVPTLVGSSGTILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VLVQPQIIKTDSLVLTTLKTDGSPVMAAVQNPALTALTTPIQTAALQVPTLVGSSGTILT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TMPVMMGQEKVPIKQVPGGVKQLEPPKEGERRTTHNIIEKRYRSSINDKIIELKDLVMGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TMPVMMGQEKVPIKQVPGGVKQLEPPKEGERRTTHNIIEKRYRSSINDKIIELKDLVMGT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 DAKMHKSGVLRKAIDYIKYLQQVNHKLRQENMVLKLANQKNKLLKGIDLGSLVDNEVDLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DAKMHKSGVLRKAIDYIKYLQQVNHKLRQENMVLKLANQKNKLLKGIDLGSLVDNEVDLK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 IEDFNQNVLLMSPPASDSGSQAGFSPYSIDSEPGSPLLDDAKVKDEPDSPPVALGMVDRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IEDFNQNVLLMSPPASDSGSQAGFSPYSIDSEPGSPLLDDAKVKDEPDSPPVALGMVDRS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 RILLCVLTFLCLSFNPLTSLLQWGGAHDSDQHPHSGSGRSVLSFESGSGGWFDWMMPTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RILLCVLTFLCLSFNPLTSLLQWGGAHDSDQHPHSGSGRSVLSFESGSGGWFDWMMPTLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LWLVNGVIVLSVFVKLLVHGEPVIRPHSRSSVTFWRHRKQADLDLARGDFAAAAGNLQTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LWLVNGVIVLSVFVKLLVHGEPVIRPHSRSSVTFWRHRKQADLDLARGDFAAAAGNLQTC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 LAVLGRALPTSRLDLACSLSWNVIRYSLQKLRLVRWLLKKVFQCRRATPATEAGFEDEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LAVLGRALPTSRLDLACSLSWNVIRYSLQKLRLVRWLLKKVFQCRRATPATEAGFEDEAK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 TSARDAALAYHRLHQLHITGKLPAGSACSDVHMALCAVNLAECAEEKIPPSTLVEIHLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TSARDAALAYHRLHQLHITGKLPAGSACSDVHMALCAVNLAECAEEKIPPSTLVEIHLTA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 AMGLKTRCGGKLGFLASYFLSRAQSLCGPEHSAVPDSLRWLCHPLGQKFFMERSWSVKSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AMGLKTRCGGKLGFLASYFLSRAQSLCGPEHSAVPDSLRWLCHPLGQKFFMERSWSVKSA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 AKESLYCAQRNPADPIAQVHQAFCKNLLERAIESLVKPQAKKKAGDQEEESCEFSSALEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AKESLYCAQRNPADPIAQVHQAFCKNLLERAIESLVKPQAKKKAGDQEEESCEFSSALEY
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 LKLLHSFVDSVGVMSPPLSRSSVLKSALGPDIICRWWTSAITVAISWLQGDDAAVRSHFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LKLLHSFVDSVGVMSPPLSRSSVLKSALGPDIICRWWTSAITVAISWLQGDDAAVRSHFT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 KVERIPKALEVTESPLVKAIFHACRAMHASLPGKADGQQSSFCHCERASGHLWSSLNVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KVERIPKALEVTESPLVKAIFHACRAMHASLPGKADGQQSSFCHCERASGHLWSSLNVSG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 ATSDPALNHVVQLLTCDLLLSLRTALWQKQASASQAVGETYHASGAELAGFQRDLGSLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ATSDPALNHVVQLLTCDLLLSLRTALWQKQASASQAVGETYHASGAELAGFQRDLGSLRR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 LAHSFRPAYRKVFLHEATVRLMAGASPTRTHQLLEHSLRRRTTQSTKHGEVDAWPGQRER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LAHSFRPAYRKVFLHEATVRLMAGASPTRTHQLLEHSLRRRTTQSTKHGEVDAWPGQRER
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 ATAILLACRHLPLSFLSSPGQRAVLLAEAARTLEKVGDRRSCNDCQQMIVKLGGGTAIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ATAILLACRHLPLSFLSSPGQRAVLLAEAARTLEKVGDRRSCNDCQQMIVKLGGGTAIAA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 S
:
NP_004 S
>>XP_006724373 (OMIM: 600481) PREDICTED: sterol regulato (1111 aa)
initn: 7320 init1: 7320 opt: 7320 Z-score: 3886.3 bits: 730.9 E(85289): 9.9e-210
Smith-Waterman score: 7320; 100.0% identity (100.0% similar) in 1111 aa overlap (31-1141:1-1111)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDDSGELGGLETMETLTELGDELTLGDIDEMLQFVSNQVGEFPDLFSEQLCSSFPGSGGS
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MLQFVSNQVGEFPDLFSEQLCSSFPGSGGS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GSSSGSSGSSSSSSNGRGSSSGAVDPSVQRSFTQVTLPSFSPSAASPQAPTLQVKVSPTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GSSSGSSGSSSSSSNGRGSSSGAVDPSVQRSFTQVTLPSFSPSAASPQAPTLQVKVSPTS
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 VPTTPRATPILQPRPQPQPQPQTQLQQQTVMITPTFSTTPQTRIIQQPLIYQNAATSFQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VPTTPRATPILQPRPQPQPQPQTQLQQQTVMITPTFSTTPQTRIIQQPLIYQNAATSFQV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LQPQVQSLVTSSQVQPVTIQQQVQTVQAQRVLTQTANGTLQTLAPATVQTVAAPQVQQVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LQPQVQSLVTSSQVQPVTIQQQVQTVQAQRVLTQTANGTLQTLAPATVQTVAAPQVQQVP
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 VLVQPQIIKTDSLVLTTLKTDGSPVMAAVQNPALTALTTPIQTAALQVPTLVGSSGTILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VLVQPQIIKTDSLVLTTLKTDGSPVMAAVQNPALTALTTPIQTAALQVPTLVGSSGTILT
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TMPVMMGQEKVPIKQVPGGVKQLEPPKEGERRTTHNIIEKRYRSSINDKIIELKDLVMGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TMPVMMGQEKVPIKQVPGGVKQLEPPKEGERRTTHNIIEKRYRSSINDKIIELKDLVMGT
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 DAKMHKSGVLRKAIDYIKYLQQVNHKLRQENMVLKLANQKNKLLKGIDLGSLVDNEVDLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DAKMHKSGVLRKAIDYIKYLQQVNHKLRQENMVLKLANQKNKLLKGIDLGSLVDNEVDLK
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 IEDFNQNVLLMSPPASDSGSQAGFSPYSIDSEPGSPLLDDAKVKDEPDSPPVALGMVDRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IEDFNQNVLLMSPPASDSGSQAGFSPYSIDSEPGSPLLDDAKVKDEPDSPPVALGMVDRS
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 RILLCVLTFLCLSFNPLTSLLQWGGAHDSDQHPHSGSGRSVLSFESGSGGWFDWMMPTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RILLCVLTFLCLSFNPLTSLLQWGGAHDSDQHPHSGSGRSVLSFESGSGGWFDWMMPTLL
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LWLVNGVIVLSVFVKLLVHGEPVIRPHSRSSVTFWRHRKQADLDLARGDFAAAAGNLQTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LWLVNGVIVLSVFVKLLVHGEPVIRPHSRSSVTFWRHRKQADLDLARGDFAAAAGNLQTC
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 LAVLGRALPTSRLDLACSLSWNVIRYSLQKLRLVRWLLKKVFQCRRATPATEAGFEDEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LAVLGRALPTSRLDLACSLSWNVIRYSLQKLRLVRWLLKKVFQCRRATPATEAGFEDEAK
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 TSARDAALAYHRLHQLHITGKLPAGSACSDVHMALCAVNLAECAEEKIPPSTLVEIHLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TSARDAALAYHRLHQLHITGKLPAGSACSDVHMALCAVNLAECAEEKIPPSTLVEIHLTA
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 AMGLKTRCGGKLGFLASYFLSRAQSLCGPEHSAVPDSLRWLCHPLGQKFFMERSWSVKSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AMGLKTRCGGKLGFLASYFLSRAQSLCGPEHSAVPDSLRWLCHPLGQKFFMERSWSVKSA
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 AKESLYCAQRNPADPIAQVHQAFCKNLLERAIESLVKPQAKKKAGDQEEESCEFSSALEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AKESLYCAQRNPADPIAQVHQAFCKNLLERAIESLVKPQAKKKAGDQEEESCEFSSALEY
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 LKLLHSFVDSVGVMSPPLSRSSVLKSALGPDIICRWWTSAITVAISWLQGDDAAVRSHFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LKLLHSFVDSVGVMSPPLSRSSVLKSALGPDIICRWWTSAITVAISWLQGDDAAVRSHFT
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 KVERIPKALEVTESPLVKAIFHACRAMHASLPGKADGQQSSFCHCERASGHLWSSLNVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KVERIPKALEVTESPLVKAIFHACRAMHASLPGKADGQQSSFCHCERASGHLWSSLNVSG
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 ATSDPALNHVVQLLTCDLLLSLRTALWQKQASASQAVGETYHASGAELAGFQRDLGSLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ATSDPALNHVVQLLTCDLLLSLRTALWQKQASASQAVGETYHASGAELAGFQRDLGSLRR
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 LAHSFRPAYRKVFLHEATVRLMAGASPTRTHQLLEHSLRRRTTQSTKHGEVDAWPGQRER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LAHSFRPAYRKVFLHEATVRLMAGASPTRTHQLLEHSLRRRTTQSTKHGEVDAWPGQRER
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 ATAILLACRHLPLSFLSSPGQRAVLLAEAARTLEKVGDRRSCNDCQQMIVKLGGGTAIAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ATAILLACRHLPLSFLSSPGQRAVLLAEAARTLEKVGDRRSCNDCQQMIVKLGGGTAIAA
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB4 S
:
XP_006 S
>>XP_016884410 (OMIM: 600481) PREDICTED: sterol regulato (965 aa)
initn: 6289 init1: 5993 opt: 5993 Z-score: 3186.0 bits: 601.2 E(85289): 1e-170
Smith-Waterman score: 5993; 99.9% identity (100.0% similar) in 913 aa overlap (1-913:1-913)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDDSGELGGLETMETLTELGDELTLGDIDEMLQFVSNQVGEFPDLFSEQLCSSFPGSGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MDDSGELGGLETMETLTELGDELTLGDIDEMLQFVSNQVGEFPDLFSEQLCSSFPGSGGS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GSSSGSSGSSSSSSNGRGSSSGAVDPSVQRSFTQVTLPSFSPSAASPQAPTLQVKVSPTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSSSGSSGSSSSSSNGRGSSSGAVDPSVQRSFTQVTLPSFSPSAASPQAPTLQVKVSPTS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 VPTTPRATPILQPRPQPQPQPQTQLQQQTVMITPTFSTTPQTRIIQQPLIYQNAATSFQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VPTTPRATPILQPRPQPQPQPQTQLQQQTVMITPTFSTTPQTRIIQQPLIYQNAATSFQV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LQPQVQSLVTSSQVQPVTIQQQVQTVQAQRVLTQTANGTLQTLAPATVQTVAAPQVQQVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LQPQVQSLVTSSQVQPVTIQQQVQTVQAQRVLTQTANGTLQTLAPATVQTVAAPQVQQVP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 VLVQPQIIKTDSLVLTTLKTDGSPVMAAVQNPALTALTTPIQTAALQVPTLVGSSGTILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLVQPQIIKTDSLVLTTLKTDGSPVMAAVQNPALTALTTPIQTAALQVPTLVGSSGTILT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TMPVMMGQEKVPIKQVPGGVKQLEPPKEGERRTTHNIIEKRYRSSINDKIIELKDLVMGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TMPVMMGQEKVPIKQVPGGVKQLEPPKEGERRTTHNIIEKRYRSSINDKIIELKDLVMGT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 DAKMHKSGVLRKAIDYIKYLQQVNHKLRQENMVLKLANQKNKLLKGIDLGSLVDNEVDLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DAKMHKSGVLRKAIDYIKYLQQVNHKLRQENMVLKLANQKNKLLKGIDLGSLVDNEVDLK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 IEDFNQNVLLMSPPASDSGSQAGFSPYSIDSEPGSPLLDDAKVKDEPDSPPVALGMVDRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IEDFNQNVLLMSPPASDSGSQAGFSPYSIDSEPGSPLLDDAKVKDEPDSPPVALGMVDRS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 RILLCVLTFLCLSFNPLTSLLQWGGAHDSDQHPHSGSGRSVLSFESGSGGWFDWMMPTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RILLCVLTFLCLSFNPLTSLLQWGGAHDSDQHPHSGSGRSVLSFESGSGGWFDWMMPTLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LWLVNGVIVLSVFVKLLVHGEPVIRPHSRSSVTFWRHRKQADLDLARGDFAAAAGNLQTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LWLVNGVIVLSVFVKLLVHGEPVIRPHSRSSVTFWRHRKQADLDLARGDFAAAAGNLQTC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 LAVLGRALPTSRLDLACSLSWNVIRYSLQKLRLVRWLLKKVFQCRRATPATEAGFEDEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LAVLGRALPTSRLDLACSLSWNVIRYSLQKLRLVRWLLKKVFQCRRATPATEAGFEDEAK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 TSARDAALAYHRLHQLHITGKLPAGSACSDVHMALCAVNLAECAEEKIPPSTLVEIHLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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. .: ...: ::: : ::: : . : :. . : ::.:: . :
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..... .. :: :.. : ::... :::.: :..:: :: : ::.:
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:... :.:: ::.::..::.:::.::..::::. : :: .: ... : .::. :
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:::: :.::::.:.:... ::.::... .: : . .::.::.:: ::::::::::
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pF1KB4 DKIIELKDLVMGTDAKMHKSGVLRKAIDYIKYLQQVNHKLRQENMVLKLANQKNKLLKGI
::::::::::.::.::..::.:::::::::..::. :.::.:::. :. : .:.: :: .
XP_005 DKIIELKDLVVGTEAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLSLRTAVHKSKSLKDL
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pF1KB4 DLGSLVDNEVDLKIEDFNQNVL-LMSPPASDSGSQAGFSPYSI------------DSEPG
. ...:. .: . .: ..:: ::.:: :: :. ::::
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::...:.:.: : . ::.::::. ::.:.::::: :::.::: : :. .
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:: ::.::. :: .: :: .:..: .. ::.::..:: .: :.:.:::: ::::
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.: :::::::::::::::::: :: .: : .::: ::::.::::::: ::.::. ::.
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: . ::: : . . ... .:..:::::::.::.::::: :: .:. .
XP_005 LWVGRWLAG-----RAGGLQQDCALRVDASASARDAALVYHKLHQLHTMGK-HTGGHLTA
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pF1KB4 VHMALCAVNLAECAEEKIPPSTLVEIHLTAAMGLKTRCGGKLGFLASYFLSRAQSLCGPE
...:: :.:::::: . . .::.::...::. .:: : ::. .::: :.. : .
XP_005 TNLALSALNLAECAGDAVSVATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQ
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..:: ...:::::.:..::.. .::: :. :::: ::.::.::: : : ..::::
XP_005 SGSVPPAMQWLCHPVGHRFFVDGDWSVLSTPWESLYSLAGNPVDPLAQVTQLFREHLLER
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pF1KB4 AIESLVKPQAKKKAGDQEEESCEFSSALEYLKLLHSFVDSVGVMSPPLSRSSVLKSALGP
:.. ...:. . ..: ..: ::.:: ::.::.: :..:. . .: :: . .. :
XP_005 ALNCVTQPNPSPGSADGDKE---FSDALGYLQLLNSCSDAAGAPAYSFSISSSMATTTGV
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pF1KB4 DIICRWWTSAITVAISWLQGDDAAVRSHFTKVERIPKALEVTESPLVKAIFHACRAMHAS
: . .::.: .:.: ::. :. :.. ::..:..:. .: :: .: .:. .: .:
XP_005 DPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLCPLVEHLPRVLQESERPLPRAALHSFKAARAL
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pF1KB4 LP-GKADGQQSSFCHCERASGHLWSSLNVSGATSDPALNHVVQLLTCDLLLSLRTALWQK
: .::.. .:. ::.:::.: .:: .. :.: .....:::. ::::: .::.::..
XP_005 LGCAKAESGPASLTICEKASGYLQDSLATTPASS--SIDKAVQLFLCDLLLVVRTSLWRQ
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pF1KB4 Q-----ASASQAVGETYHASGAELAGFQRDLGSLRRLAHSFRPAYRKVFLHEATVRLMAG
: : :.:... .::. :: ::::::.::::::.:::::.:.:::::::.:::::
XP_005 QQPPAPAPAAQGTSSRPQASALELRGFQRDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAG
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::::::::::..:::::. . : : :.. : .::.: :.::: .:: .:::.:::
XP_005 ASPTRTHQLLDRSLRRRAGPGGKGGAVAELEPRPTRREHAEALLLASCYLPPGFLSAPGQ
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:. .::::::::::.:::: .:::::...:::::....:
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NP_001 PAVYFWRHRKQADLDLARGDFAQAAQQLWLALRALGRPLPTSHLDLACSLLWNLIRHLLQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]