Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB3881
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3881, 369 aa
1>>>pF1KB3881 369 - 369 aa - 369 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0971+/-0.000892; mu= 13.1231+/- 0.054
mean_var=80.8365+/-15.931, 0's: 0 Z-trim(107.5): 43 B-trim: 338 in 1/51
Lambda= 0.142650
statistics sampled from 9555 (9598) to 9555 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 2.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13764.1 SEPT5 gene_id:5413|Hs108|chr22 ( 369) 2482 520.3 1e-147
CCDS11609.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 459) 1869 394.2 1.2e-109
CCDS56041.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 470) 1869 394.2 1.2e-109
CCDS11610.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 478) 1869 394.2 1.2e-109
CCDS58582.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 493) 1869 394.2 1.3e-109
CCDS56224.1 SEPT5 gene_id:5413|Hs108|chr22 ( 346) 1699 359.2 3.1e-99
CCDS58581.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 331) 1679 355.0 5.2e-98
CCDS10678.3 SEPT1 gene_id:1731|Hs108|chr16 ( 414) 1569 332.5 4.1e-91
CCDS74682.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2 ( 396) 1361 289.6 3.1e-78
CCDS2548.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2 ( 361) 1359 289.2 3.8e-78
CCDS75582.1 SEPT7 gene_id:989|Hs108|chr7 ( 401) 1127 241.5 9.7e-64
CCDS63195.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2 ( 371) 1076 231.0 1.3e-60
CCDS14026.2 SEPT3 gene_id:55964|Hs108|chr22 ( 358) 1036 222.7 3.8e-58
CCDS14027.2 SEPT3 gene_id:55964|Hs108|chr22 ( 350) 1018 219.0 4.9e-57
CCDS45795.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 335) 1014 218.2 8.3e-57
CCDS74166.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 362) 1014 218.2 8.9e-57
CCDS45793.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 422) 1014 218.2 1e-56
CCDS45794.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 474) 1014 218.3 1.1e-56
CCDS77122.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 567) 1014 218.3 1.3e-56
CCDS45791.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 568) 1014 218.3 1.3e-56
CCDS45792.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 579) 1014 218.3 1.3e-56
CCDS45790.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 586) 1014 218.3 1.4e-56
CCDS45743.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 274) 940 202.9 2.7e-52
CCDS43360.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 429) 889 192.5 5.7e-49
CCDS43359.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 442) 889 192.5 5.9e-49
CCDS43358.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 483) 889 192.5 6.4e-49
CCDS10522.1 SEPT12 gene_id:124404|Hs108|chr16 ( 358) 881 190.8 1.5e-48
CCDS75298.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 440) 874 189.4 5e-48
CCDS14585.1 SEPT6 gene_id:23157|Hs108|chrX ( 427) 870 188.6 8.6e-48
CCDS14583.1 SEPT6 gene_id:23157|Hs108|chrX ( 429) 870 188.6 8.6e-48
CCDS14584.1 SEPT6 gene_id:23157|Hs108|chrX ( 434) 870 188.6 8.7e-48
CCDS34018.1 SEPT11 gene_id:55752|Hs108|chr4 ( 429) 858 186.1 4.8e-47
CCDS77931.1 SEPT11 gene_id:55752|Hs108|chr4 ( 439) 858 186.1 4.9e-47
CCDS42726.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 ( 431) 855 185.5 7.4e-47
CCDS82496.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 ( 450) 855 185.5 7.6e-47
CCDS46383.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 ( 454) 855 185.5 7.7e-47
CCDS82497.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 ( 544) 855 185.6 9e-47
CCDS5519.2 SEPT14 gene_id:346288|Hs108|chr7 ( 432) 852 184.9 1.1e-46
CCDS47262.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 369) 746 163.1 3.6e-40
CCDS53987.1 SEPT12 gene_id:124404|Hs108|chr16 ( 312) 420 95.9 4.9e-20
>>CCDS13764.1 SEPT5 gene_id:5413|Hs108|chr22 (369 aa)
initn: 2482 init1: 2482 opt: 2482 Z-score: 2765.4 bits: 520.3 E(32554): 1e-147
Smith-Waterman score: 2482; 100.0% identity (100.0% similar) in 369 aa overlap (1-369:1-369)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 VHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDTPGFGDAVNNTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDTPGFGDAVNNTE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 CWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPVDVGFMKALHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPVDVGFMKALHE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPECDSDEDEDFKQQDRELKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPECDSDEDEDFKQQDRELKE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 SAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKLRNMLIRTHMHDLKDVTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKLRNMLIRTHMHDLKDVTC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 DVHYENYRAHCIQQMTSKLTQDSRMESPIPILPLPTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DVHYENYRAHCIQQMTSKLTQDSRMESPIPILPLPTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQ
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 RMKQQMQDQ
:::::::::
CCDS13 RMKQQMQDQ
>>CCDS11609.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 (459 aa)
initn: 1900 init1: 1724 opt: 1869 Z-score: 2082.1 bits: 394.2 E(32554): 1.2e-109
Smith-Waterman score: 1909; 76.9% identity (91.2% similar) in 364 aa overlap (14-368:95-457)
10 20 30 40
pF1KB3 MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGF
: :... ::.::::::::::::::::::::
CCDS11 PQSSDNQQYFCAPAPLSPSARPRSPWGKLDPYDSSEDDKEYVGFATLPNQVHRKSVKKGF
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 DFTLMVAGESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLK
::::::::::::::::::.::::::::.:::::.::::: ::::: ::.::::::::.:.
CCDS11 DFTLMVAGESGLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLGAEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLR
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 LTIVDTPGFGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPF
:::::::::::::::::::::...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LTIVDTPGFGDAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPF
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 GHGLRPVDVGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPEC
::::::.:: ::::::..:::::..:::: :.: :. . :..:::::..:::..::::.:
CCDS11 GHGLRPLDVEFMKALHQRVNIVPILAKADTLTPPEVDHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDC
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 DSDEDEDFKQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKL
::::::::: ::. :::: :::::::::::::.:.:::::::::::::::: .:::::::
CCDS11 DSDEDEDFKLQDQALKESIPFAVIGSNTVVEARGRRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKL
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330
pF1KB3 RNMLIRTHMHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMT---------SKLTQDSRMESPIPILPL
:.::.::::.:::::: ..:::::::.:::.:: .:::..: . ::: .:
CCDS11 RTMLVRTHMQDLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTRLVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAVP-
370 380 390 400 410 420
340 350 360
pF1KB3 PTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQRMKQQMQDQ
: : ::::::: ::::::::::::.....::..
CCDS11 PGTDPETEKLIREKDEELRRMQEMLHKIQKQMKENY
430 440 450
>>CCDS56041.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 (470 aa)
initn: 1900 init1: 1724 opt: 1869 Z-score: 2082.0 bits: 394.2 E(32554): 1.2e-109
Smith-Waterman score: 1909; 76.9% identity (91.2% similar) in 364 aa overlap (14-368:106-468)
10 20 30 40
pF1KB3 MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGF
: :... ::.::::::::::::::::::::
CCDS56 PQSSDNQQYFCAPAPLSPSARPRSPWGKLDPYDSSEDDKEYVGFATLPNQVHRKSVKKGF
80 90 100 110 120 130
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 DFTLMVAGESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLK
::::::::::::::::::.::::::::.:::::.::::: ::::: ::.::::::::.:.
CCDS56 DFTLMVAGESGLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLGAEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLR
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 LTIVDTPGFGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPF
:::::::::::::::::::::...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LTIVDTPGFGDAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPF
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 GHGLRPVDVGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPEC
::::::.:: ::::::..:::::..:::: :.: :. . :..:::::..:::..::::.:
CCDS56 GHGLRPLDVEFMKALHQRVNIVPILAKADTLTPPEVDHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDC
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 DSDEDEDFKQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKL
::::::::: ::. :::: :::::::::::::.:.:::::::::::::::: .:::::::
CCDS56 DSDEDEDFKLQDQALKESIPFAVIGSNTVVEARGRRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKL
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330
pF1KB3 RNMLIRTHMHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMT---------SKLTQDSRMESPIPILPL
:.::.::::.:::::: ..:::::::.:::.:: .:::..: . ::: .:
CCDS56 RTMLVRTHMQDLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTRLVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAVP-
380 390 400 410 420 430
340 350 360
pF1KB3 PTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQRMKQQMQDQ
: : ::::::: ::::::::::::.....::..
CCDS56 PGTDPETEKLIREKDEELRRMQEMLHKIQKQMKENY
440 450 460 470
>>CCDS11610.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 (478 aa)
initn: 1900 init1: 1724 opt: 1869 Z-score: 2081.9 bits: 394.2 E(32554): 1.2e-109
Smith-Waterman score: 1909; 76.9% identity (91.2% similar) in 364 aa overlap (14-368:114-476)
10 20 30 40
pF1KB3 MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGF
: :... ::.::::::::::::::::::::
CCDS11 PQSSDNQQYFCAPAPLSPSARPRSPWGKLDPYDSSEDDKEYVGFATLPNQVHRKSVKKGF
90 100 110 120 130 140
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 DFTLMVAGESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLK
::::::::::::::::::.::::::::.:::::.::::: ::::: ::.::::::::.:.
CCDS11 DFTLMVAGESGLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLGAEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLR
150 160 170 180 190 200
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 LTIVDTPGFGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPF
:::::::::::::::::::::...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LTIVDTPGFGDAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPF
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 GHGLRPVDVGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPEC
::::::.:: ::::::..:::::..:::: :.: :. . :..:::::..:::..::::.:
CCDS11 GHGLRPLDVEFMKALHQRVNIVPILAKADTLTPPEVDHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDC
270 280 290 300 310 320
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 DSDEDEDFKQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKL
::::::::: ::. :::: :::::::::::::.:.:::::::::::::::: .:::::::
CCDS11 DSDEDEDFKLQDQALKESIPFAVIGSNTVVEARGRRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKL
330 340 350 360 370 380
290 300 310 320 330
pF1KB3 RNMLIRTHMHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMT---------SKLTQDSRMESPIPILPL
:.::.::::.:::::: ..:::::::.:::.:: .:::..: . ::: .:
CCDS11 RTMLVRTHMQDLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTRLVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAVP-
390 400 410 420 430 440
340 350 360
pF1KB3 PTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQRMKQQMQDQ
: : ::::::: ::::::::::::.....::..
CCDS11 PGTDPETEKLIREKDEELRRMQEMLHKIQKQMKENY
450 460 470
>>CCDS58582.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 (493 aa)
initn: 1900 init1: 1724 opt: 1869 Z-score: 2081.6 bits: 394.2 E(32554): 1.3e-109
Smith-Waterman score: 1909; 76.9% identity (91.2% similar) in 364 aa overlap (14-368:129-491)
10 20 30 40
pF1KB3 MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGF
: :... ::.::::::::::::::::::::
CCDS58 PQSSDNQQYFCAPAPLSPSARPRSPWGKLDPYDSSEDDKEYVGFATLPNQVHRKSVKKGF
100 110 120 130 140 150
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 DFTLMVAGESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLK
::::::::::::::::::.::::::::.:::::.::::: ::::: ::.::::::::.:.
CCDS58 DFTLMVAGESGLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLGAEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLR
160 170 180 190 200 210
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 LTIVDTPGFGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPF
:::::::::::::::::::::...:.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LTIVDTPGFGDAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPF
220 230 240 250 260 270
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 GHGLRPVDVGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPEC
::::::.:: ::::::..:::::..:::: :.: :. . :..:::::..:::..::::.:
CCDS58 GHGLRPLDVEFMKALHQRVNIVPILAKADTLTPPEVDHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDC
280 290 300 310 320 330
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 DSDEDEDFKQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKL
::::::::: ::. :::: :::::::::::::.:.:::::::::::::::: .:::::::
CCDS58 DSDEDEDFKLQDQALKESIPFAVIGSNTVVEARGRRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKL
340 350 360 370 380 390
290 300 310 320 330
pF1KB3 RNMLIRTHMHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMT---------SKLTQDSRMESPIPILPL
:.::.::::.:::::: ..:::::::.:::.:: .:::..: . ::: .:
CCDS58 RTMLVRTHMQDLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTRLVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAVP-
400 410 420 430 440 450
340 350 360
pF1KB3 PTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQRMKQQMQDQ
: : ::::::: ::::::::::::.....::..
CCDS58 PGTDPETEKLIREKDEELRRMQEMLHKIQKQMKENY
460 470 480 490
>>CCDS56224.1 SEPT5 gene_id:5413|Hs108|chr22 (346 aa)
initn: 1699 init1: 1699 opt: 1699 Z-score: 1895.0 bits: 359.2 E(32554): 3.1e-99
Smith-Waterman score: 1699; 99.6% identity (100.0% similar) in 254 aa overlap (18-271:27-280)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAG
.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MDSLAAPQDRLVEQLLSPRTQAQRRLKDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 ESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDTPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDTPG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 FGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 FGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPVD
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 VGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPECDSDEDEDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 VGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPECDSDEDEDF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 KQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKLRNMLIRTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEGALRLREAAQHAHPHAYARP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 MHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMTSKLTQDSRMESPIPILPLPTPDAETEKLIRMKDEE
CCDS56 QGRDVRRALRELPRALHPADDQQTDPGQPHGEPHPDPAAAHPGRRD
310 320 330 340
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20 30 40 50 60 70
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::::::::::::::.::::::::.:::::.
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80 90 100 110 120 130
pF1KB3 AEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDTPGFGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYF
::::: ::::: ::.::::::::.:.:::::::::::::::::::::...:.::::::::
CCDS58 AEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLRLTIVDTPGFGDAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYF
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 RDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPVDVGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPS
::::::::::::::::::::::::::::::::.:: ::::::..:::::..:::: :.:
CCDS58 RDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPLDVEFMKALHQRVNIVPILAKADTLTPP
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200 210 220 230 240 250
pF1KB3 EIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPECDSDEDEDFKQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKG
:. . :..:::::..:::..::::.:::::::::: ::. :::: :::::::::::::.:
CCDS58 EVDHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDCDSDEDEDFKLQDQALKESIPFAVIGSNTVVEARG
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pF1KB3 QRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKLRNMLIRTHMHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMT-
.:::::::::::::::: .::::::::.::.::::.:::::: ..:::::::.:::.::
CCDS58 RRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKLRTMLVRTHMQDLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTR
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360
pF1KB3 --------SKLTQDSRMESPIPILPLPTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQRMKQQMQD
.:::..: . ::: .: : : ::::::: ::::::::::::.....::..
CCDS58 LVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAVP-PGTDPETEKLIREKDEELRRMQEMLHKIQKQMKE
280 290 300 310 320
pF1KB3 Q
CCDS58 NY
330
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10 20 30 40
pF1KB3 MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMV
.::.:::::.::::.:::::::::::::::
CCDS10 EGWRVEAALSFLPHQRKWGETAGAVMAGGVMDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMV
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50 60 70 80 90 100
pF1KB3 AGESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDT
:::::::::::..:::::.::.::.. : :..::. : .. :.::: :::.:::.:::
CCDS10 AGESGLGKSTLINSLFLTNLYEDRQVPEASARLTQTLAIERRGVEIEEGGVKVKLTLVDT
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pF1KB3 PGFGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRP
:::::.:. ..:: :.. ....:::::.:::::::::::::.:::::::::::::.::::
CCDS10 PGFGDSVDCSDCWLPVVKFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFGRGLRP
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 VDVGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPECDSDEDE
.::.:..:.::::::.:.:.::: :.:.: . ::..::... . ::.::::::::::::
CCDS10 LDVAFLRAVHEKVNIIPVIGKADALMPQETQALKQKIRDQLKEEEIHIYQFPECDSDEDE
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 DFKQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQR-VRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKLRNMLI
:::.:: :.::: ::::.:: ::. :.: :::: : :: ::::: ::::..:: ::.
CCDS10 DFKRQDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGGNRPVRGRRYSWGTVEVENPHHCDFLNLRRMLV
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330
pF1KB3 RTHMHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMT----------SKLTQDSRMESPIPILPLPTPD
.::..:::.:: :. ::.:::.:.:... :::...: : :.:.:::
CCDS10 QTHLQDLKEVTHDLLYEGYRARCLQSLARPGARDRASRSKLSRQSATEIPLPMLPL----
320 330 340 350 360 370
340 350 360
pF1KB3 AETEKLIRMKDEELRRMQEMLQRMKQQMQDQ
:.:::::: ::::::::::::..:. :::
CCDS10 ADTEKLIREKDEELRRMQEMLEKMQAQMQQSQAQGEQSDAL
380 390 400 410
>>CCDS74682.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2 (396 aa)
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10 20 30
pF1KB3 MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQ---YVGFATLPNQVHR
:.. . : :. . :::::.:::::::
CCDS74 SEGRATRPCLRVPSARRGDEGLHQRDEASQKMSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 KSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTLVHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIE
:::::::.:::::.::::::::::..:::::::: .: . .: :.: .::.: ::.::
CCDS74 KSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 EKGVKLKLTIVDTPGFGDAVNNTECWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCC
:.::::.::.:::::.:::.: .:.: : .:.:.:::.:..:::::::..: :::::::
CCDS74 ERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCC
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 LYFISPFGHGLRPVDVGFMKALHEKVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIH
.::::::::::.:.::.::::.:.::::::.::::: :. .: ..::.:: .::.. .:.
CCDS74 FYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIK
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 VYQFPECDSDEDEDFKQQDRELKESAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQA
.:..:. .::::::::.: : :: : ::.:.::: ..::::..:::::::::.:::::
CCDS74 IYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 HCDFVKLRNMLIRTHMHDLKDVTCDVHYENYRAHCIQQMTSKLTQDSRMESPIPILPLPT
: ::.:::.::: :::.::..:: :.::::.:.. ... :. ..
CCDS74 HNDFLKLRTMLI-THMQDLQEVTQDLHYENFRSERLKRGGRKVENE--------------
310 320 330 340
340 350 360
pF1KB3 PDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQRMKQQMQDQ
: . .... :. ::::::::. ::. ::: :
CCDS74 -DMNKDQILLEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQMQGGDGDGGALGHHV
350 360 370 380 390
>>CCDS2548.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2 (361 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTL
:::::.::::::::::::::.:::::.::::::::::
CCDS25 MSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTL
10 20 30 40 50
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pF1KB3 VHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDTPGFGDAVNNTE
..:::::::: .: . .: :.: .::.: ::.:::.::::.::.:::::.:::.: .
CCDS25 INSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRD
60 70 80 90 100 110
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pF1KB3 CWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPVDVGFMKALHE
:.: : .:.:.:::.:..:::::::..: :::::::.::::::::::.:.::.::::.:.
CCDS25 CFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHN
120 130 140 150 160 170
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pF1KB3 KVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPECDSDEDEDFKQQDRELKE
::::::.::::: :. .: ..::.:: .::.. .:..:..:. .::::::::.: : ::
CCDS25 KVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKA
180 190 200 210 220 230
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pF1KB3 SAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKLRNMLIRTHMHDLKDVTC
: ::.:.::: ..::::..:::::::::.::::: : ::.:::.::: :::.::..::
CCDS25 SIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLI-THMQDLQEVTQ
240 250 260 270 280 290
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pF1KB3 DVHYENYRAHCIQQMTSKLTQDSRMESPIPILPLPTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQ
:.::::.:.. ... :. .. : . .... :. ::::::::.
CCDS25 DLHYENFRSERLKRGGRKVENE---------------DMNKDQILLEKEAELRRMQEMIA
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pF1KB3 RMKQQMQDQ
::. ::: :
CCDS25 RMQAQMQMQMQGGDGDGGALGHHV
340 350 360
369 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 02:42:44 2016 done: Fri Nov 4 02:42:45 2016
Total Scan time: 2.750 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]