Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA1944
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1944, 1099 aa
1>>>pF1KA1944 1099 - 1099 aa - 1099 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9861+/-0.000997; mu= 18.2735+/- 0.060
mean_var=68.1418+/-13.220, 0's: 0 Z-trim(103.5): 28 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.155370
statistics sampled from 7437 (7448) to 7437 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.59), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 4.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9266.1 TMEM132D gene_id:121256|Hs108|chr12 (1099) 7258 1636.6 0
CCDS45009.2 TMEM132C gene_id:92293|Hs108|chr12 (1108) 4383 992.1 0
CCDS41859.1 TMEM132B gene_id:114795|Hs108|chr12 (1078) 2955 672.0 1.9e-192
CCDS11283.2 TMEM132E gene_id:124842|Hs108|chr17 (1074) 1423 328.6 4.5e-89
CCDS66501.1 TMEM132B gene_id:114795|Hs108|chr12 ( 590) 1401 323.6 7.9e-88
CCDS44618.1 TMEM132A gene_id:54972|Hs108|chr11 (1023) 1200 278.6 4.8e-74
CCDS7997.1 TMEM132A gene_id:54972|Hs108|chr11 (1024) 1200 278.6 4.8e-74
>>CCDS9266.1 TMEM132D gene_id:121256|Hs108|chr12 (1099 aa)
initn: 7258 init1: 7258 opt: 7258 Z-score: 8781.0 bits: 1636.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7258; 100.0% identity (100.0% similar) in 1099 aa overlap (1-1099:1-1099)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MCPSEMGTLWHHWSPVLISLAALFSKVTEGRGILESIQRFSLLPTYLPVTYHINNADVSF
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CCDS92 MCPSEMGTLWHHWSPVLISLAALFSKVTEGRGILESIQRFSLLPTYLPVTYHINNADVSF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 FLKEANQDIMRNSSLQSRVESFLIYKSRRLPVLNASYGPFSIEQVVPQDLMLPSNPFGFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 FLKEANQDIMRNSSLQSRVESFLIYKSRRLPVLNASYGPFSIEQVVPQDLMLPSNPFGFT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 NKFSLNWKLKAHILRDKVYLSRPKVQVLFHIMGRDWDDRSAGEKLPCLRVFAFRETREVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 NKFSLNWKLKAHILRDKVYLSRPKVQVLFHIMGRDWDDRSAGEKLPCLRVFAFRETREVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 GSCRLQGDLGLCVAELELLSSWFSPPTVVAGRRKSVDQPEGTPVELYYTVHPGGERGDCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 GSCRLQGDLGLCVAELELLSSWFSPPTVVAGRRKSVDQPEGTPVELYYTVHPGGERGDCV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 REDARRSNGIRTGHSDIDESGPPLQRIGSIFLYQTHRKPSLRELRLDNSVAIHYIPKTVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 REDARRSNGIRTGHSDIDESGPPLQRIGSIFLYQTHRKPSLRELRLDNSVAIHYIPKTVR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 KGDVLTFPVSISRNSTEDRFTLRAKVKKGVNIIGVRASSPSIWDVKERTDYTGKYAPAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 KGDVLTFPVSISRNSTEDRFTLRAKVKKGVNIIGVRASSPSIWDVKERTDYTGKYAPAVI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 VCQKKAAGSENSADGASYEVMQIDVEVEEPGDLPATQLVTWQVEYPGEITSDLGVSKIYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 VCQKKAAGSENSADGASYEVMQIDVEVEEPGDLPATQLVTWQVEYPGEITSDLGVSKIYV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 SPKDLIGVVPLAMEAEILNTAILTGKTVAVPVKVVSVEDDGTVTELLESVECRSSDEDVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SPKDLIGVVPLAMEAEILNTAILTGKTVAVPVKVVSVEDDGTVTELLESVECRSSDEDVI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 KVSDRCDYVFVNGKEMKGKVNVVVNFTYQHLSSPLEMTVWVPRLPLQIEVSDTELNQIKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 KVSDRCDYVFVNGKEMKGKVNVVVNFTYQHLSSPLEMTVWVPRLPLQIEVSDTELNQIKG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 WRVPIVSSRRPAGDSEEEEDDERRGRGCTLQYQHAMVRVLTQFVAEAAGPGGHLAHLLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 WRVPIVSSRRPAGDSEEEEDDERRGRGCTLQYQHAMVRVLTQFVAEAAGPGGHLAHLLGS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 DWQVDITELINDFMQVEEPRIAKLQGGQILMGQELGMTTIQILSPLSDTILAEKTITVLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 DWQVDITELINDFMQVEEPRIAKLQGGQILMGQELGMTTIQILSPLSDTILAEKTITVLD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 EKVTITDLGVQLVTGLSLSLQLSPGSNRAIFATAVAQELLQRPKQEAAISCWVQFSDGSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 EKVTITDLGVQLVTGLSLSLQLSPGSNRAIFATAVAQELLQRPKQEAAISCWVQFSDGSV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 TPLDIYDGKDFSLMATSLDEKVVSIHQDPKFKWPIIAAETEGQGTLVKVEMVISESCQKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 TPLDIYDGKDFSLMATSLDEKVVSIHQDPKFKWPIIAAETEGQGTLVKVEMVISESCQKS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 KRKSVLAVGTANIKVKFGQNDANPNTSDSRHTGAGVHMENNVSDRRPKKPSQEWGSQEGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 KRKSVLAVGTANIKVKFGQNDANPNTSDSRHTGAGVHMENNVSDRRPKKPSQEWGSQEGQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 YYGSSSMGLMEGRGTTTDRSILQKKKGQESLLDDNSHLQTIPSDLTSFPAQVDLPRSNGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 YYGSSSMGLMEGRGTTTDRSILQKKKGQESLLDDNSHLQTIPSDLTSFPAQVDLPRSNGE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 MDGNDLMQASKGLSDLEIGMYALLGVFCLAILVFLINCVTFALKYRHKQVPFEEQEGMSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MDGNDLMQASKGLSDLEIGMYALLGVFCLAILVFLINCVTFALKYRHKQVPFEEQEGMSH
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 SHDWVGLSNRTELLENHINFASSQDEQITAIDRGMDFEESKYLLSTNSQKSINGQLFKPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SHDWVGLSNRTELLENHINFASSQDEQITAIDRGMDFEESKYLLSTNSQKSINGQLFKPL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 GPIIIDGKDQKSEPPTSPTSKRKRVKFTTFTAVSSDDEYPTRNSIVMSSEDDIKWVCQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 GPIIIDGKDQKSEPPTSPTSKRKRVKFTTFTAVSSDDEYPTRNSIVMSSEDDIKWVCQDL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090
pF1KA1 DPGDCKELHNYMERLHENV
:::::::::::::::::::
CCDS92 DPGDCKELHNYMERLHENV
1090
>>CCDS45009.2 TMEM132C gene_id:92293|Hs108|chr12 (1108 aa)
initn: 4333 init1: 3471 opt: 4383 Z-score: 5298.2 bits: 992.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4383; 61.1% identity (84.6% similar) in 1088 aa overlap (20-1097:22-1106)
10 20 30 40 50
pF1KA1 MCPSEMGTLWHHWSPVLISLAALFSKVTEGRGILESIQRFSLLPTYLPVTYHINNADV
:.::..:: ::.:. ..::::: :: ::::.::: :..
CCDS45 MRSEGAAPGPAAPLCGALSLLLGALLGKVIEGHGVTDNIQRFSSLPPYLPVSYHILRAET
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 SFFLKEANQDIMRNSSLQSRVESFLIYKSRRLPVLNASYGPFSIEQVVPQDLMLPSNPFG
::::::::::..::::::.:::::. ::.:. :::::::::::.:.::: :::: :: .:
CCDS45 SFFLKEANQDLLRNSSLQARVESFFTYKTRQPPVLNASYGPFSVEKVVPLDLMLTSNFLG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 FTNKFSLNWKLKAHILRDKVYLSRPKVQVLFHIMGRDWDDRSAGEKLPCLRVFAFRETRE
:::::..::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::
CCDS45 PTNKFSFDWKLKAHILRDKVYLSRPKVQVLFHIMGRDWDDHGAGEKLPCLRVFAFRETRE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 VRGSCRLQGDLGLCVAELELLSSWFSPPTVVAGRRKSVDQPEGTPVELYYTVHPGGERGD
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CCDS45 VRGSCRLKGDLGLCVAELELLSSWFSAPTVGAGRKKSMDQPEGTPVELYYTVHPGNERGD
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 CVREDARRSNGIRTGHSDIDESGPPLQRIGSIFLYQTHRKPSLRELRLDNSVAIHYIPKT
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CCDS45 CAGGDFRKGNAIRPGKDGLEETTSHLQRIGTVGLYRAQDSAQLSELRLDGNVVIWLPSRP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 VRKGDVLTFPVSISRNSTEDRFTLRAKVKKGVNIIGVRASSPSIWDVKERTDYTGKYAPA
:..:.:.: :.:: ::. : : :::::::::::..... : : ::... ::.. :
CCDS45 VKQGEVVTAYVTISSNSSVDLFILRAKVKKGVNILSAQTREPRQWGVKQEVGSGGKHVTA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 VIVCQKKAAGSENSADGASYEVMQIDVEVEEPGDLPATQLVTWQVEYPGEITSDLGVSKI
...::. . . .: ... ::.:.. :. ..: .:: .::::::: . :.:..::.:
CCDS45 TVACQRLGPSPRNRSSSLFNEVVQMNFEIASFSSLSGTQPITWQVEYPRKGTTDIAVSEI
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 YVSPKDLIGVVPLAMEAEILNTAILTGKTVAVPVKVVSVEDDGTVTELLESVECRSSDED
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CCDS45 FVSQKDLVGIVPLAMDTEILNTAVLTGKTVAMPIKVVSVEENSAVMDISESVECKSTDED
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 VIKVSDRCDYVFVNGKEMKGKVNVVVNFTYQHLSSPLEMTVWVPRLPLQIEVSDTELNQI
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CCDS45 VIKVSERCDYIFVNGKEIKGKMDAVVNFTYQYLSAPLCVTVWVPRLPLQIEVSDTELSQI
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 KGWRVPIVSSRRPAGDSEEEEDDERRGRGCTLQYQHAMVRVLTQFVAEAAGPGGHLAHLL
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CCDS45 KGWRVPIVTNKRPTRESEDEDEEERRGRGCALQYQHATVRVLTQFVSEGAGPWGQPNYLL
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 GSDWQVDITELINDFMQVEEPRIAKLQGGQILMGQELGMTTIQILSPLSDTILAEKTITV
. .:: :::.:. :::..:::..: :: ...:.:.:.::::::.::::::.:::::::::
CCDS45 SPNWQFDITHLVADFMKLEEPHVATLQDSRVLVGREVGMTTIQVLSPLSDSILAEKTITV
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 LDEKVTITDLGVQLVTGLSLSLQLSPGSNRAIFATAVAQELLQRPKQEAAISCWVQFSDG
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CCDS45 LDDKVSVTDLAIQLVAGLSVALYPNAENSKAVTAVVTAEEVLRTPKQEAVFSTWLQFSDG
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 SVTPLDIYDGKDFSLMATSLDEKVVSIHQDPKFKWPIIAAETEGQGTLVKVEMVISESCQ
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CCDS45 SVTPLDIYDTKDFSLAATSQDEAVVSVPQPRSPRWPVVVAEGEGQGPLIRVDMTIAEACQ
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 KSKRKSVLAVGTANIKVKFGQNDANPNTSDSRHTGAGVHMENNVSDRRPKKPSQEWGSQE
::::::.::::..:..::::::::. . . . . ...:..:::: : .: .:.
CCDS45 KSKRKSILAVGVGNVRVKFGQNDADSSPGGDYEED---EIKNHASDRRQKGQHHERTGQD
790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KA1 GQYYGSSSMGLMEG---RGTTTDRSILQKKKGQESLLDDN-----SHLQTIPSDLTSFPA
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CCDS45 GHLYGSSPVEREEGALRRATTTARSLLDNKVVKNSRADGGRLAGEGQLQNIPIDFTNFPA
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KA1 QVDLPRSNGEMDGNDLMQASKGLSDLEIGMYALLGVFCLAILVFLINCVTFALKYRHKQV
.::::.... .. :::.:. .:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS45 HVDLPKAGSGLEENDLVQTPRGLSDLEIGMYALLGVFCLAILVFLINCATFALKYRHKQV
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000
pF1KA1 PFEEQEGMSHSHDWVGLSNRTELLENHINFASSQDEQITAIDRGMD-FEESKYLL-STNS
:.: : .:.:::::: :.:..::::. . :::. : :::: :::..:: . .:
CCDS45 PLEGQASMTHSHDWVWLGNEAELLESMGDAPPPQDEHTTIIDRGPGACEESNHLLLNGGS
960 970 980 990 1000 1010
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA1 QKSINGQLFKPLGPIIIDGKDQKSEPPTSPTSKRKRVKFTTFTAVSSDDEYPTRNSIVMS
.: ...:. . .:..::..: :::::::.:::::::.. :: :: :::: :
CCDS45 HKHVQSQIHRSADSGGRQGREQKQDPLHSPTSKRKKVKFTTFTTIPPDDSCPTVNSIVSS
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1070 1080 1090
pF1KA1 SEDDIKWVCQDLDPGDCKELHNYMERLHENV
...::::::::. : :::.::.:.:..
CCDS45 NDEDIKWVCQDVAVGAPKELRNYLEKLKDKA
1080 1090 1100
>>CCDS41859.1 TMEM132B gene_id:114795|Hs108|chr12 (1078 aa)
initn: 2516 init1: 1040 opt: 2955 Z-score: 3568.5 bits: 672.0 E(32554): 1.9e-192
Smith-Waterman score: 3606; 51.2% identity (79.5% similar) in 1077 aa overlap (27-1099:18-1078)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MCPSEMGTLWHHWSPVLISLAALFSKVTEGRGILESIQRFSLLPTYLPVTYHINNADVSF
:::.:::..:.:.:: ::.:::.. ::.::. ::
CCDS41 MFGAASRMDTTAVCTGGVTESRGIVDSLQKFSSLPAYLPTNLHISNAEESF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 FLKEANQDIMRNSSLQSRVESFLIYKSRRLPVLNASYGPFSIEQVVPQDLMLPSNPFGFT
::::::::. ::::::.::: :.::..: :..::::::::.:...::.:.: :. ::
CCDS41 FLKEANQDLTRNSSLQARVEPFFIYRARTPPIINASYGPFSVEKIIPQELLLTSTAFGNM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 NKFSLNWKLKAHILRDKVYLSRPKVQVLFHIMGRDWDDRSAGEKLPCLRVFAFRETREVR
.:: .:::::.::: ...: .:::::.::.. : ::: . : :::...::: :.:::
CCDS41 DKFPFNWKLKSHILDSSIYSNRPKVQTLFYVTGMGWDDSDLTEDLPCVKMFAFPEAREVA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KA1 GSCRLQGDLGLCVAELELLSSWFSPPTVVAGRRKSVDQPEGTPVELYYTVHPGGERGDC-
.:::::: :::::::::: ::: . ... :: .::..:..:. . :.:
CCDS41 ASCRLQGAPGLCVAELELLPEWFSSGLDLEPEEEIPALLGGTTMELFFTLYPADKAGQCP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 VREDARRSNGIRTGHSDIDESGPPLQRIGSIFLYQTHRKPSLRELRLDNSVAIHYIPKTV
..:... :.:..: . ... : .::::. .: :. . . ::..:.: . :
CCDS41 LEEEGKWENNIHSGLESPQQAFPARERIGSVVVYPTQDDLKWSLVSLDENVVISVPLNLV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 RKGDVLTFPVSISRNSTEDRFTLRAKVKKGVNIIGVRASSPSIWDVKERTDYTGKYAPAV
:.::. :: ::.. .:. :.:::: :. ::.: .::.:: . : :.:. : . . :.
CCDS41 REGDTATFLVSLTSSSVADQFTLRIKAAAGVKITAVRVSSEDQWAVQEEIDNGSTQTSAT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 IVCQKKAAGSENSADGASYEVMQIDVEVEEPGDLPATQLVTWQVEYPGEIT-SDLGVSKI
..:. . ... ..:. ::..:.: ... .:: ..: .::::::: : . :.: ::.:
CCDS41 LTCMGHRPDTQSRVNGSFYEILQVDFGIDNSSDLAGAQQITWQVEYPIEDSMSELVVSEI
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 YVSPKDLIGVVPLAMEAEILNTAILTGKTVAVPVKVVSVEDDGTVTELLESVECRSSDED
.:: ..:.:::::..:.::::::::: :.::::::.:..::.:... :::::.:.:::
CCDS41 FVSQTTFVGIVPLAMDTEVLNTAILTGKPVSVPVKVVGVQEDGSVVDVSESVECKSADED
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KA1 VIKVSDRCDYVFVNGKEMKGKVNVVVNFTYQHLSSPLEMTVWVPRLPLQIEVSDTELNQI
:::::. :: .::::::::.::...::::.::..: .:.:::.::::::::.:::::.::
CCDS41 VIKVSNNCDSIFVNGKEMKSKVDTIVNFTHQHFTSQFEVTVWAPRLPLQIEISDTELSQI
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 KGWRVPIVSSRRPAGDSEEEEDDERRGRGCTLQYQHAMVRVLTQFVAEAAGPG-GHLAHL
::::.:....:::. .:..:.:.:..::::.:::::: ::::::::::. : :.:...
CCDS41 KGWRIPVAANRRPTRESDDEDDEEKKGRGCSLQYQHATVRVLTQFVAES--PDLGQLTYM
540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 LGSDWQVDITELINDFMQVEEPRIAKLQGGQILMGQELGMTTIQILSPLSDTILAEKTIT
:: ::: :::.:...::.::::.::.:: :. : :.: :.::.:.::::::.::::::.
CCDS41 LGPDWQFDITDLVTEFMKVEEPKIAQLQDGRTLAGREPGITTVQVLSPLSDSILAEKTVI
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 VLDEKVTITDLGVQLVTGLSLSLQLSPGSNRAIFATAVAQELLQRPKQEAAISCWVQFSD
:::..:::..::::::.:.::::: ...::: .::.: ..:: :.::: .: :. :::
CCDS41 VLDDRVTIAELGVQLVAGMSLSLQPHRADKRAIVSTAAALDVLQSPQQEAIVSSWILFSD
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 GSVTPLDIYDGKDFSLMATSLDEKVVSIHQDPKFKWPIIAAETEGQGTLVKVEMVISESC
:::::::::: ::.:. ..:::: :::.. . . ::::..:: :::: :.:.::.::: :
CCDS41 GSVTPLDIYDPKDYSVTVSSLDEMVVSVQANLESKWPIVVAEGEGQGPLIKLEMMISEPC
710 720 730 740 750 760
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pF1KA1 QKSKRKSVLAVGTANIKVKFGQNDANPNTSDSRHTGAGVHMENNVSDRRPKKPSQEWGSQ
::.::::::::: .:.:::: .. . . ... : . ......:. .. .:: . :
CCDS41 QKTKRKSVLAVGKGNVKVKFEPSSDEHQGGSNDIEGINREYKDHLSNSIEREGNQERAVQ
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pF1KA1 EGQYYGSSSMGLMEGRG-TTTDRSILQKKKGQESLLDDNSHLQTIPSDLTSFPAQVDLPR
: .. .. .: :. . .:: .: .. :...:: ... :. .::::.: :
CCDS41 E-WFHRGTPVGQEESTNKSTTPQSPME---GKNKLLKSGG-----PDAFTSFPTQGKSPD
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pF1KA1 SNGEMDGNDLMQASKGLSDLEIGMYALLGVFCLAILVFLINCVTFALKYRHKQVPFEEQE
: . .:: .:.::.:::::::::: ::::::::::::::.:: :::::. ::
CCDS41 PN---NPSDLTVTSRGLTDLEIGMYALLCVFCLAILVFLINCVAFAWKYRHKRFAVSEQG
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pF1KA1 GMSHSHDWVGLSNRTELLENHINFASSQDEQITAIDRGMDFEESKYLLSTNSQKSINGQL
.. :::::: :.:..::::: .... ..: : ::::..::: ..::. .:::....::
CCDS41 NIPHSHDWVWLGNEVELLENPVDITLPSEECTTMIDRGLQFEERNFLLNGSSQKTFHSQL
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1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA1 FKPLGPIIIDGKDQKSEPPTSPTSKRKRVKFTTFTAVSSDDEYPTRNSIVMSSEDDIKWV
..: . . . :. :.:: .: ::::::::..:.. .: : :::...:.:.::::
CCDS41 LRP-SDYVYE-KEIKNEPMNSSGPKRKRVKFTSYTTILPEDGGPYTNSILFDSDDNIKWV
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CCDS41 CQDMGLGDSQDFRDYMESLQDQM
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CCDS11 LQ-RSEPFVVFQTKELPVLNVSLGPFSTSQVVARELLQPSSTLDIPERLTVNWKVRAFIV
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.. . .. ::. ..::::.:.::::...:... : . : : . .:.. :.
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... : .:. ...::::..::.:::::::.:::.::::...: .: : .. :::.:.
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CCDS11 NEDIIKVSSSCDYVFVSGKESRGSMNARVTFRYDVLNAPLEMTVWVPKLPLHIELSDARL
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CCDS11 SQVKGWRVPILPDRRSVRESEDEDEEEEERRQSASRGCTLQYQHATLQVFTQFHTTSSEG
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... .:: :: :..:.:..:::.: .::.:.. .. : : : : : ....:::....
CCDS11 TDQVVTMLGPDWLVEVTDLVSDFMRVGDPRVAHMVDSSTLAGLEPGTTPFKVVSPLTEAV
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CCDS11 LGETLLTVTEEKVSITQLQAQVVASLALSLRPSPGSSHTILATTAAQQTLSFLKQEALLS
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CCDS11 LWLSYSDGTTAPLSLYSPRDYGLLVSSLDEHVATVTQDRAF--PLVVAEAEGSGELLRAE
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CCDS11 GPGGGEDEARGAGPPGSALPAPEAPGPGTASPV-------------------VP------
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CCDS11 PTEDFLPLPTG------FLQVPRGLTDLEIGMYALLGVFCLAILVFLINCIVFVLRYRHK
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CCDS11 SSQTSVQSQVHGRGDGSSGGSARDQAEDPASSPTSKRKRVKFTTFTTLPSEEL--AYDSV
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CCDS66 SIEREGNQERAVQEWFHRGTP-VGQEESTNKSTTPQSPME---GKNKLLKSGG-----PD
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.::::.: : : . .:: .:.::.:::::::::: ::::::::::::::.::
CCDS66 AFTSFPTQGKSPDPN---NPSDLTVTSRGLTDLEIGMYALLCVFCLAILVFLINCVAFAW
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CCDS66 KYRHKRFAVSEQGNIPHSHDWVWLGNEVELLENPVDITLPSEECTTMIDRGLQFEERNFL
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pF1KA1 LSTNSQKSINGQLFKPLGPIIIDGKDQKSEPPTSPTSKRKRVKFTTFTAVSSDDEYPTRN
:. .:::....::..: . :. :.:: .: ::::::::..:.. .: : :
CCDS66 LNGSSQKTFHSQLLRPSD--YVYEKEIKNEPMNSSGPKRKRVKFTSYTTILPEDGGPYTN
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pF1KA1 SIVMSSEDDIKWVCQDLDPGDCKELHNYMERLHENV
::...:.:.:::::::. :: .....::: :....
CCDS66 SILFDSDDNIKWVCQDMGLGDSQDFRDYMESLQDQM
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CCDS44 MCARMAGRTTAAPRGPYGPWLCLLVALALDVVRVDCGQAPLD--------PVYLPAALEL
10 20 30 40 50
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CCDS44 LDAPEHFRVQQVGHYPPANSSLSSRSETFLLLQPWPRAQPLLRASYPPFATQQVVPPRVT
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: . . .. .::.: .:: ::.:::: : ::: : : .:: ::..
CCDS44 ATHPAGTAHQACRFQPSLGACVVELELPSHWFS-------------QASTTRAELAYTLE
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CCDS44 PAAEGPGGC-------------GSGEENDPGEQALPVGGVELRPAD-PPQYQEVPLDEAV
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CCDS44 TLRVPDMPVRPGQLFSATLLLRHNFTASLLTLRIKVKKGLHVTAARPAQPTLWTAKLDRF
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... ..:.:.. . .:. : . .: ::. : . .:. ::::.::::
CCDS44 KGSRHHTTLITCHRAGLTEPDSSPLELSEFLWVDFVVENSTGGGVAVTRPVTWQLEYPGQ
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CCDS44 APEAEKDKMVWEILVSERDIRALIPLAKAEELVNTAPLTGVPQHVPVRLVTVDGGGALVE
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. : : :.:.. .:..::. :: ::: ::: .: .: :.: ...: . :..:::.: ::
CCDS44 VTEHVGCESANTQVLQVSEACDAVFVAGKESRGARGVRVDFWWRRLRASLRLTVWAPLLP
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pF1KA1 LQIEVSDTELNQIKGWRVPIVSSRRPAGDSEEEEDD-ERRGRGCTLQYQHAMVRVLTQFV
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CCDS44 LRIELTDTTLEQVRGWRVPG-PAEGPAEPAAEASDEAERRARGCHLQYQRAGVRFLAPFA
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CCDS44 AHPLDGGRRLTHLLGPDWLLDVSHLVAPHARVLDSRVASLEGGRVVVGREPGVTSIEVRS
560 570 580 590 600 610
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CCDS44 PLSDSILGEQALAVTDDKVSVLELRVQPVMGISLTLSRGTAHPGEVTATCWAQSALPAPK
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CCDS44 LPLHVALHPPEPCRRGRHRVPLASGTAWL---------------------GLPPASTPAP
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:..:. . :. . :. ... : :.: :. ... . .:. ...
CCDS44 ALPSSPAWSPPATEATMGGKRQVAGSVG-GNTGVRGKFERAE-EEARKEETE--------
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pF1KA1 LTSFPAQVDLPRSNGEMDGNDLMQASKGLSDLEIGMYALLGVFCLAILVFLINCVTFALK
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CCDS44 ----------AREEEEEEEEEMVPAPQHVTELELGMYALLGVFCVAIFIFLVNGVVFVLR
830 840 850 860 870
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