Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA1646
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1646, 537 aa
1>>>pF1KA1646 537 - 537 aa - 537 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1401+/-0.000749; mu= 19.6491+/- 0.045
mean_var=68.3733+/-13.558, 0's: 0 Z-trim(108.6): 18 B-trim: 47 in 1/50
Lambda= 0.155107
statistics sampled from 10306 (10324) to 10306 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.689), E-opt: 0.2 (0.317), width: 16
Scan time: 3.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14077.1 CERK gene_id:64781|Hs108|chr22 ( 537) 3722 841.9 0
CCDS46466.1 CERKL gene_id:375298|Hs108|chr2 ( 532) 532 128.0 2.7e-29
CCDS42789.1 CERKL gene_id:375298|Hs108|chr2 ( 558) 401 98.7 1.8e-20
CCDS59404.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs108|chr19 ( 595) 347 86.7 8.4e-17
CCDS59405.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs108|chr19 ( 618) 347 86.7 8.7e-17
CCDS12727.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs108|chr19 ( 654) 347 86.7 9.1e-17
CCDS45785.1 SPHK1 gene_id:8877|Hs108|chr17 ( 384) 320 80.5 3.9e-15
CCDS59297.1 SPHK1 gene_id:8877|Hs108|chr17 ( 398) 320 80.5 4e-15
CCDS11744.1 SPHK1 gene_id:8877|Hs108|chr17 ( 470) 320 80.6 4.6e-15
>>CCDS14077.1 CERK gene_id:64781|Hs108|chr22 (537 aa)
initn: 3722 init1: 3722 opt: 3722 Z-score: 4497.4 bits: 841.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3722; 100.0% identity (100.0% similar) in 537 aa overlap (1-537:1-537)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MGATGAAEPLQSVLWVKQQRCAVSLEPARALLRWWRSPGPGAGAPGADACSVPVSEIIAV
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CCDS14 MGATGAAEPLQSVLWVKQQRCAVSLEPARALLRWWRSPGPGAGAPGADACSVPVSEIIAV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EETDVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVHCVKRARRHRWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EETDVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVHCVKRARRHRWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 EMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVAPLFTLASITTDIIVTEHANQAKETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVAPLFTLASITTDIIVTEHANQAKETL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 YEINIDKYDGIVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVPSSLRIGIIPAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YEINIDKYDGIVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVPSSLRIGIIPAGS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TDCVCYSTVGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYGFYGDIIKDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TDCVCYSTVGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYGFYGDIIKDS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 EKKRWLGLARYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGCFVCRQSKQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EKKRWLGLARYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGCFVCRQSKQQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 LEEEQKKALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAAHLGDGSSDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LEEEQKKALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAAHLGDGSSDL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 ILIRKCSRFNFLRFLIRHTNQQDQFDFTFVEVYRVKKFQFTSKHMEDEDSDLKEGGKKRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ILIRKCSRFNFLRFLIRHTNQQDQFDFTFVEVYRVKKFQFTSKHMEDEDSDLKEGGKKRF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KA1 GHICSSHPSCCCTVSNSSWNCDGEVLHSPAIEVRVHCQLVRLFARGIEENPKPDSHS
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CCDS14 GHICSSHPSCCCTVSNSSWNCDGEVLHSPAIEVRVHCQLVRLFARGIEENPKPDSHS
490 500 510 520 530
>>CCDS46466.1 CERKL gene_id:375298|Hs108|chr2 (532 aa)
initn: 639 init1: 267 opt: 532 Z-score: 639.6 bits: 128.0 E(32554): 2.7e-29
Smith-Waterman score: 756; 28.8% identity (59.6% similar) in 532 aa overlap (10-532:48-532)
10 20 30
pF1KA1 MGATGAAEPLQSVLWVKQQRCAVSLEPARALLRWWR-SP
:.... . .. : : : ::: :: .:
CCDS46 EEEAPPEAAAVPPALLTSPQQTEAAAERILLRGIFEIGRDSCDVVLSE-RAL-RWRPIQP
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 GPGAGAPGADA-CSVPVSEIIAVEET-DVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVH-CVKRARRH
:: : :. :.: ... .:. :.. : : :. ..:. :.:. ...
CCDS46 ERPAGDSKYDLLCK---EEFIELKDIFSVKLKRRCSVKQQRSGTLLGITLFICLKK-EQN
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 RWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLREMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVA
. : . . . :. : .:.. ....: . .::: : ...:: . : .. ..: .::
CCDS46 KLKNSTLDLINLSEDHCDIWFRQFKKILAGFPNRPKSLKILLNPQSHKKEATQVYYEKVE
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KA1 PLFTLASITTDIIVTEHANQAKETLYEINIDKYDGIVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSA
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CCDS46 PLLKLAGIKTDVTIMEYEGHALSLLKECELQGFDGVVCVGGDGSASEVAHALLLRAQKNA
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 GVDQNHPRAVLVP--SSLRIGIIPAGSTDCVCYSTVGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSS
:.. .. .:.: ..: .:.::::::. . .: :. . :..:::..: .:: .
CCDS46 GMETDR---ILTPVRAQLPLGLIPAGSTNVLAHSLHGVPHVITATLHIIMGHVQLVDVCT
260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 VHHNSTLLRYSVSLLGYGFYGDIIKDSEKKRWLGLA-RYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFL
. :::.. : . .:: : . .:: ::.. : ::. .:.. . . . .:::
CCDS46 FSTAGKLLRFGFSAM-FGFGGRTLALAEKYRWMSPNQRRDFAVVKALAKLKAEDCEISFL
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KA1 PAQHTVGSPRDRKPCRAGCFVCRQSKQQLEEEQKKALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAIN
: . . .. :.. : .. ..::.. :.:: ..
CCDS46 PFNSS------------------------DDVQERRAQGSPKSDCNDQWQMIQGQFLNVS
370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 ATNMSCACRRSPRGLSPAAHLGDGSSDLILIRKCSRFNFLRFLIRHTNQQDQFDFTFVEV
. : : .::::.: ..:..:: ::. :. :: .:.. : :... ..::.: :::.
CCDS46 IMAIPCLCSVAPRGLAPNTRLNNGSMALIIARNTSRPEFIKHLKRYASVKNQFNFPFVET
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KA1 YRVKKFQFTSKHMEDEDSDLKEGGKKRFGHICSSHPSCCCTVSNSSWNCDGEVLH-SPAI
: :.. . .. . .: . .. .: :: ::.... . .
CCDS46 YTVEEVKVHPRNNTGGYNPEEEEDE-------TASENCF------PWNVDGDLMEVASEV
470 480 490 500 510
520 530
pF1KA1 EVRVHCQLVRLFARGIEEN-PKPDSHS
..:.: .:. :.. ..:: ::
CCDS46 HIRLHPRLISLYGGSMEEMIPK
520 530
>>CCDS42789.1 CERKL gene_id:375298|Hs108|chr2 (558 aa)
initn: 664 init1: 234 opt: 401 Z-score: 480.8 bits: 98.7 E(32554): 1.8e-20
Smith-Waterman score: 694; 27.4% identity (56.8% similar) in 558 aa overlap (10-532:48-558)
10 20 30
pF1KA1 MGATGAAEPLQSVLWVKQQRCAVSLEPARALLRWWR-SP
:.... . .. : : : ::: :: .:
CCDS42 EEEAPPEAAAVPPALLTSPQQTEAAAERILLRGIFEIGRDSCDVVLSE-RAL-RWRPIQP
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KA1 GPGAGAPGADA-CSVPVSEIIAVEET-DVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVH-CVKRARRH
:: : :. :.: ... .:. :.. : : :. ..:. :.:. ...
CCDS42 ERPAGDSKYDLLCK---EEFIELKDIFSVKLKRRCSVKQQRSGTLLGITLFICLKK-EQN
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KA1 RWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLREMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVA
. : . . . :. : .:.. ....: . .::: : ...:: . : .. ..: .::
CCDS42 KLKNSTLDLINLSEDHCDIWFRQFKKILAGFPNRPKSLKILLNPQSHKKEATQVYYEKVE
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190
pF1KA1 PLFTLASITTDIIVTEHANQAKETLYEINIDKYDG-------------------------
::. ::.: ::. . :. ..: : : ... .::
CCDS42 PLLKLAGIKTDVTIMEYEGHALSLLKECELQGFDGGHRKPLFAIHWSVQRLFTGMQTLEP
200 210 220 230 240 250
200 210 220 230 240
pF1KA1 -IVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVP--SSLRIGIIPAGSTDCVCYS
.::::::: ::: :.:. :.:..::.. .. .:.: ..: .:.::::::. . .:
CCDS42 SVVCVGGDGSASEVAHALLLRAQKNAGMETDR---ILTPVRAQLPLGLIPAGSTNVLAHS
260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 TVGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYGFYGDIIKDSEKKRWLG
:. . :..:::..: .:: . . :::.. : . .:: : . .:: ::..
CCDS42 LHGVPHVITATLHIIMGHVQLVDVCTFSTAGKLLRFGFSAM-FGFGGRTLALAEKYRWMS
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 LA-RYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGCFVCRQSKQQLEEEQK
: ::. .:.. . . . .:::: . . .. :.
CCDS42 PNQRRDFAVVKALAKLKAEDCEISFLPFNSS------------------------DDVQE
370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 KALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAAHLGDGSSDLILIRKC
. : .. ..::.. :.:: .. . : : .::::.: ..:..:: ::. :.
CCDS42 RRAQGSPKSDCNDQWQMIQGQFLNVSIMAIPCLCSVAPRGLAPNTRLNNGSMALIIARNT
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 SRFNFLRFLIRHTNQQDQFDFTFVEVYRVKKFQFTSKHMEDEDSDLKEGGKKRFGHICSS
:: .:.. : :... ..::.: :::.: :.. . .. . .: . ..
CCDS42 SRPEFIKHLKRYASVKNQFNFPFVETYTVEEVKVHPRNNTGGYNPEEEEDE-------TA
470 480 490 500 510
490 500 510 520 530
pF1KA1 HPSCCCTVSNSSWNCDGEVLH-SPAIEVRVHCQLVRLFARGIEEN-PKPDSHS
.: :: ::.... . ...:.: .:. :.. ..:: ::
CCDS42 SENCF------PWNVDGDLMEVASEVHIRLHPRLISLYGGSMEEMIPK
520 530 540 550
>>CCDS59404.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs108|chr19 (595 aa)
initn: 344 init1: 241 opt: 347 Z-score: 415.1 bits: 86.7 E(32554): 8.4e-17
Smith-Waterman score: 353; 30.4% identity (57.7% similar) in 260 aa overlap (91-341:88-329)
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EETDVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVHCVKRARRHRWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLR
::. .:: : . : : : :
CCDS59 IYTYPRGRRGARRRATRTFRADGAATYEENRAEAQRWATALT---C---LLRGLPLPGDG
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130 140 150 160 170 180
pF1KA1 EMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVAPLFTLASITTDIIVTEHANQAKETL
:. : :: .::...:::::.: . . . .: :... :... ..: ::. :.:.: .
CCDS59 EITPDLLPRPPRLLLLVNPFGGRGLAWQWCKNHVLPMISEAGLSFNLIQTERQNHARELV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 YEINIDKYDGIVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVPSSLRIGIIPAGS
......:::: :.:::.. :::.::. : . .:: .: .::.: ::
CCDS59 QGLSLSEWDGIVTVSGDGLLHEVLNGLLDRP--------DWEEAVKMP----VGILPCGS
180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KA1 TDCVCYST---------VGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYG
. . .. .: . . .: . : . .:. :: : .: ...:
CCDS59 GNALAGAVNQHGGFEPALGLDLLLNCSLLLCRGGGHPLDLLSVTLASGSRCFSFLSVAWG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 FYGDIIKDSEKKRWLGLARYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGC
: .:. .::. : :: ::. .. . . . : :.: .:.::: .::
CCDS59 FVSDVDIQSERFRALGSARFTLGTVLGLATLHTYRGRLSYLPATVEPASPTPAHSLPRAK
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 FVCRQSKQQLEEEQKKALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAA
CCDS59 SELTLTPDPAPPMAHSPLHRSVSDLPLPLPQPALASPGSPEPLPILSLNGGGPELAGDWG
340 350 360 370 380 390
>>CCDS59405.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs108|chr19 (618 aa)
initn: 344 init1: 241 opt: 347 Z-score: 414.9 bits: 86.7 E(32554): 8.7e-17
Smith-Waterman score: 353; 30.4% identity (57.7% similar) in 260 aa overlap (91-341:111-352)
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EETDVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVHCVKRARRHRWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLR
::. .:: : . : : : :
CCDS59 IYTYPRGRRGARRRATRTFRADGAATYEENRAEAQRWATALT---C---LLRGLPLPGDG
90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 EMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVAPLFTLASITTDIIVTEHANQAKETL
:. : :: .::...:::::.: . . . .: :... :... ..: ::. :.:.: .
CCDS59 EITPDLLPRPPRLLLLVNPFGGRGLAWQWCKNHVLPMISEAGLSFNLIQTERQNHARELV
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 YEINIDKYDGIVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVPSSLRIGIIPAGS
......:::: :.:::.. :::.::. : . .:: .: .::.: ::
CCDS59 QGLSLSEWDGIVTVSGDGLLHEVLNGLLDRP--------DWEEAVKMP----VGILPCGS
200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KA1 TDCVCYST---------VGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYG
. . .. .: . . .: . : . .:. :: : .: ...:
CCDS59 GNALAGAVNQHGGFEPALGLDLLLNCSLLLCRGGGHPLDLLSVTLASGSRCFSFLSVAWG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 FYGDIIKDSEKKRWLGLARYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGC
: .:. .::. : :: ::. .. . . . : :.: .:.::: .::
CCDS59 FVSDVDIQSERFRALGSARFTLGTVLGLATLHTYRGRLSYLPATVEPASPTPAHSLPRAK
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 FVCRQSKQQLEEEQKKALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAA
CCDS59 SELTLTPDPAPPMAHSPLHRSVSDLPLPLPQPALASPGSPEPLPILSLNGGGPELAGDWG
370 380 390 400 410 420
>>CCDS12727.1 SPHK2 gene_id:56848|Hs108|chr19 (654 aa)
initn: 344 init1: 241 opt: 347 Z-score: 414.5 bits: 86.7 E(32554): 9.1e-17
Smith-Waterman score: 353; 30.4% identity (57.7% similar) in 260 aa overlap (91-341:147-388)
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 EETDVHGKHQGSGKWQKMEKPYAFTVHCVKRARRHRWKWAQVTFWCPEEQLCHLWLQTLR
::. .:: : . : : : :
CCDS12 IYTYPRGRRGARRRATRTFRADGAATYEENRAEAQRWATALT---C---LLRGLPLPGDG
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 EMLEKLTSRPKHLLVFINPFGGKGQGKRIYERKVAPLFTLASITTDIIVTEHANQAKETL
:. : :: .::...:::::.: . . . .: :... :... ..: ::. :.:.: .
CCDS12 EITPDLLPRPPRLLLLVNPFGGRGLAWQWCKNHVLPMISEAGLSFNLIQTERQNHARELV
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 YEINIDKYDGIVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSAGVDQNHPRAVLVPSSLRIGIIPAGS
......:::: :.:::.. :::.::. : . .:: .: .::.: ::
CCDS12 QGLSLSEWDGIVTVSGDGLLHEVLNGLLDRP--------DWEEAVKMP----VGILPCGS
240 250 260 270
250 260 270 280 290
pF1KA1 TDCVCYST---------VGTSDAETSALHIVVGDSLAMDVSSVHHNSTLLRYSVSLLGYG
. . .. .: . . .: . : . .:. :: : .: ...:
CCDS12 GNALAGAVNQHGGFEPALGLDLLLNCSLLLCRGGGHPLDLLSVTLASGSRCFSFLSVAWG
280 290 300 310 320 330
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 FYGDIIKDSEKKRWLGLARYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFLPAQHTVGSPRDRKPCRAGC
: .:. .::. : :: ::. .. . . . : :.: .:.::: .::
CCDS12 FVSDVDIQSERFRALGSARFTLGTVLGLATLHTYRGRLSYLPATVEPASPTPAHSLPRAK
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 FVCRQSKQQLEEEQKKALYGLEAAEDVEEWQVVCGKFLAINATNMSCACRRSPRGLSPAA
CCDS12 SELTLTPDPAPPMAHSPLHRSVSDLPLPLPQPALASPGSPEPLPILSLNGGGPELAGDWG
400 410 420 430 440 450
>>CCDS45785.1 SPHK1 gene_id:8877|Hs108|chr17 (384 aa)
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::: .:
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>>CCDS59297.1 SPHK1 gene_id:8877|Hs108|chr17 (398 aa)
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Smith-Waterman score: 320; 30.5% identity (62.7% similar) in 220 aa overlap (129-346:27-240)
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CCDS59 AEAEISFTLMLTERRNHARELVRSEELGRWDALVVMSGDGLMHEVVNGLMERPDWETAIQ
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CCDS59 K--PLCSLPAGS---GNALAASLNHYAGYEQVTNEDLLTNCTLLLCRRLLSPMNLLSLHT
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::: .:
CCDS59 -VGSKTPASPVVVQQGPVDAHLVPLEEPVPSHWTVVPDEDFVLVLALLHSHLGSEMFAAP
240 250 260 270 280 290
>>CCDS11744.1 SPHK1 gene_id:8877|Hs108|chr17 (470 aa)
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CCDS11 SAPTAPGTPWQREPRVEVMDPAGGPRGVLPRPCRVLVLLNPRGGKGKALQLFRSHVQPLL
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160 170 180 190 200 210
pF1KA1 TLASITTDIIVTEHANQAKETLYEINIDKYDGIVCVGGDGMFSEVLHGLIGRTQRSAGVD
. : :. ...::. :.:.: . .. ..:..: ..:::.. ::..::. : . ....
CCDS11 AEAEISFTLMLTERRNHARELVRSEELGRWDALVVMSGDGLMHEVVNGLMERPDWETAIQ
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KA1 QNHPRAVLVPSSLRIGIIPAGSTDCVC-YSTVGTSDAETSALHIVVGDSLA-MDVSSVHH
. : : .: : :.: . : : . : :. .. :. :.. :.:
CCDS11 K--PLCSLPAGS---GNALAASLNHYAGYEQVTNEDLLTNCTLLLCRRLLSPMNLLSLHT
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KA1 NSTLLRYSVSLLGYGFYGDIIKDSEKKRWLGLARYDFSGLKTFLSHHCYEGTVSFLPAQH
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CCDS11 ASGLRLFSVLSLAWGFIADVDLESEKYRRLGEMRFTLGTFLRLAALRTYRGRLAYLPVGR
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
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CCDS11 -VGSKTPASPVVVQQGPVDAHLVPLEEPVPSHWTVVPDEDFVLVLALLHSHLGSEMFAAP
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]