Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0840
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0840, 491 aa
1>>>pF1KA0840 491 - 491 aa - 491 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0548+/-0.000945; mu= 10.1824+/- 0.057
mean_var=115.7244+/-23.655, 0's: 0 Z-trim(108.5): 64 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.119223
statistics sampled from 10212 (10270) to 10212 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.315), width: 16
Scan time: 3.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS54833.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 ( 491) 3321 582.3 3.9e-166
CCDS64129.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 ( 444) 3028 531.9 5.4e-151
CCDS2658.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 ( 423) 527 101.7 1.6e-21
CCDS32640.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 ( 436) 520 100.5 3.8e-21
CCDS54116.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 ( 404) 421 83.5 4.8e-16
CCDS47678.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 690) 348 71.0 4.5e-12
CCDS54560.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 ( 355) 330 67.8 2.2e-11
CCDS5726.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 735) 332 68.3 3.2e-11
CCDS75649.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 707) 328 67.6 5e-11
>>CCDS54833.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 (491 aa)
initn: 3321 init1: 3321 opt: 3321 Z-score: 3096.0 bits: 582.3 E(32554): 3.9e-166
Smith-Waterman score: 3321; 100.0% identity (100.0% similar) in 491 aa overlap (1-491:1-491)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MGANNGKQYGSEGKGSSSISSDVSSSTDHTPTKAQKNVATSEDSDLSMRTLSTPSPALIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MGANNGKQYGSEGKGSSSISSDVSSSTDHTPTKAQKNVATSEDSDLSMRTLSTPSPALIC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 PPNLPGFQNGRGSSTSSSSITGETVAMVHSPPPTRLTHPLIRLASRPQKEQASIDRLPDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PPNLPGFQNGRGSSTSSSSITGETVAMVHSPPPTRLTHPLIRLASRPQKEQASIDRLPDH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 SMVQIFSFLPTNQLCRCARVCRRWYNLAWDPRLWRTIRLTGETINVDRALKVLTRRLCQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SMVQIFSFLPTNQLCRCARVCRRWYNLAWDPRLWRTIRLTGETINVDRALKVLTRRLCQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TPNVCLMLETVTVSGCRRLTDRGLYTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFDVVSLCPNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TPNVCLMLETVTVSGCRRLTDRGLYTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFDVVSLCPNL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 EHLDVSGCSKVTCISLTREASIKLSPLHGKQISIRYLDMTDCFVLEDEGLHTIAAHCTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EHLDVSGCSKVTCISLTREASIKLSPLHGKQISIRYLDMTDCFVLEDEGLHTIAAHCTQL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 THLYLRRCVRLTDEGLRYLVIYCASIKELSVSDCRFVSDFGLREIAKLESRLRYLSIAHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 THLYLRRCVRLTDEGLRYLVIYCASIKELSVSDCRFVSDFGLREIAKLESRLRYLSIAHC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 GRVTDVGIRYVAKYCSKLRYLNARGCEGITDHGVEYLAKNCTKLKSLDIGKCPLVSDTGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GRVTDVGIRYVAKYCSKLRYLNARGCEGITDHGVEYLAKNCTKLKSLDIGKCPLVSDTGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 ECLALNCFNLKRLSLKSCESITGQGLQIVAANCFDLQTLNVQDCEVSVEALRFVKRHCKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ECLALNCFNLKRLSLKSCESITGQGLQIVAANCFDLQTLNVQDCEVSVEALRFVKRHCKR
430 440 450 460 470 480
490
pF1KA0 CVIEHTNPAFF
:::::::::::
CCDS54 CVIEHTNPAFF
490
>>CCDS64129.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 (444 aa)
initn: 3028 init1: 3028 opt: 3028 Z-score: 2824.3 bits: 531.9 E(32554): 5.4e-151
Smith-Waterman score: 3028; 100.0% identity (100.0% similar) in 444 aa overlap (48-491:1-444)
20 30 40 50 60 70
pF1KA0 SISSDVSSSTDHTPTKAQKNVATSEDSDLSMRTLSTPSPALICPPNLPGFQNGRGSSTSS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MRTLSTPSPALICPPNLPGFQNGRGSSTSS
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 SSITGETVAMVHSPPPTRLTHPLIRLASRPQKEQASIDRLPDHSMVQIFSFLPTNQLCRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SSITGETVAMVHSPPPTRLTHPLIRLASRPQKEQASIDRLPDHSMVQIFSFLPTNQLCRC
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 ARVCRRWYNLAWDPRLWRTIRLTGETINVDRALKVLTRRLCQDTPNVCLMLETVTVSGCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ARVCRRWYNLAWDPRLWRTIRLTGETINVDRALKVLTRRLCQDTPNVCLMLETVTVSGCR
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 RLTDRGLYTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFDVVSLCPNLEHLDVSGCSKVTCISLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RLTDRGLYTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFDVVSLCPNLEHLDVSGCSKVTCISLT
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 REASIKLSPLHGKQISIRYLDMTDCFVLEDEGLHTIAAHCTQLTHLYLRRCVRLTDEGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 REASIKLSPLHGKQISIRYLDMTDCFVLEDEGLHTIAAHCTQLTHLYLRRCVRLTDEGLR
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 YLVIYCASIKELSVSDCRFVSDFGLREIAKLESRLRYLSIAHCGRVTDVGIRYVAKYCSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YLVIYCASIKELSVSDCRFVSDFGLREIAKLESRLRYLSIAHCGRVTDVGIRYVAKYCSK
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 LRYLNARGCEGITDHGVEYLAKNCTKLKSLDIGKCPLVSDTGLECLALNCFNLKRLSLKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LRYLNARGCEGITDHGVEYLAKNCTKLKSLDIGKCPLVSDTGLECLALNCFNLKRLSLKS
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 CESITGQGLQIVAANCFDLQTLNVQDCEVSVEALRFVKRHCKRCVIEHTNPAFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 CESITGQGLQIVAANCFDLQTLNVQDCEVSVEALRFVKRHCKRCVIEHTNPAFF
400 410 420 430 440
>>CCDS2658.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 (423 aa)
initn: 1129 init1: 335 opt: 527 Z-score: 499.8 bits: 101.7 E(32554): 1.6e-21
Smith-Waterman score: 644; 30.1% identity (65.9% similar) in 369 aa overlap (116-479:14-366)
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 AMVHSPPPTRLTHPLIRLASRPQKEQASIDRLPDHSMVQIFSFLPTNQLCRCARVCRRWY
.:: . ...::::: :::::.. . :
CCDS26 MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWN
10 20 30 40
150 160 170 180 190 200
pF1KA0 NLAWDPRLWRTIRLTGETINVD-RALKVLTRRLCQDTPNVCLMLETVTVSGCRRLTDRGL
:: : :. : : . .:. :... ...: : .:. ... :: . : .:
CCDS26 ILALDGSNWQRIDLFNFQTDVEGRVVENISKR-CGG------FLRKLSLRGCIGVGDSSL
50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 YTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFDVVSLCPNLEHLDVSGCSKVTCISLTREASIKL
:.:: : ....:...:: .:.. . ... .: .:.:::.. .:.:.: ..:.:
CCDS26 KTFAQNCRNIEHLNLNGCTKITDSTCYSLSRFCSKLKHLDLT-----SCVSIT-NSSLK-
100 110 120 130 140
270 280 290 300 310 320
pF1KA0 SPLHGKQISIRYLDMTDCFVLEDEGLHTIAAHCTQLTHLYLRRCVRLTDEGLRYLVIYCA
. .: . ...::... : . .:..... : : : :: :..: ::.:... ::
CCDS26 GISEGCR-NLEYLNLSWCDQITKDGIEALVRGCRGLKALLLRGCTQLEDEALKHIQNYCH
150 160 170 180 190 200
330 340 350 360 370 380
pF1KA0 SIKELSVSDCRFVSDFGLREIAKLESRLRYLSIAHCGRVTDVGIRYVAKYCSKLRYLNAR
. :....: ..: :. .: . ::. : .. :. .::... .. : .:. :.:
CCDS26 ELVSLNLQSCSRITDEGVVQICRGCHRLQALCLSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAA
210 220 230 240 250 260
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 GCEGITDHGVEYLAKNCTKLKSLDIGKCPLVSDTGLECLALNCFNLKRLSLKSCESITGQ
: .:: : ::.:: .:...:. .: :..:. : :...: .:. :::. :: :: .
CCDS26 RCSHLTDAGFTLLARNCHELEKMDLEECILITDSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDD
270 280 290 300 310 320
450 460 470 480 490
pF1KA0 G-LQIVAANCFD--LQTLNVQDCEVSVE-ALRFVKRHCKRCVIEHTNPAFF
: :.. ..: :..:....: . .. ::. .. .:.
CCDS26 GILHLSNSTCGHERLRVLELDNCLLITDVALEHLE-NCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRM
330 340 350 360 370 380
CCDS26 RAQLPHVKVHAYFAPVTPPTAVAGSGQRLCRCCVIL
390 400 410 420
>>CCDS32640.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 (436 aa)
initn: 807 init1: 330 opt: 520 Z-score: 493.1 bits: 100.5 E(32554): 3.8e-21
Smith-Waterman score: 628; 29.6% identity (63.1% similar) in 385 aa overlap (102-481:12-378)
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 GSSTSSSSITGETVAMVHSPPPTRLTHPLIRLASRPQKEQASIDR-LPDHSMVQIFSFLP
:. ....: :.. :: . ...:::::
CCDS32 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLD
10 20 30 40
140 150 160 170 180
pF1KA0 TNQLCRCARVCRRWYNLAWDPRLWRTIRLTGETINVD-RALKVLTRRLCQDTPNVCLMLE
. :::::.: : : :: : :. : : ... :... ...: : .:.
CCDS32 VVTLCRCAQVSRAWNVLALDGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKR-CGG------FLR
50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TVTVSGCRRLTDRGLYTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFDVVSLCPNLEHLDVSGCS
... :: . : .: :.:: : ... :...:: . .. . .. ..: .:.:::...:.
CCDS32 KLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIEVLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCT
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KVTCISLTREASIKLSPLHGKQISIRYLDMTDCFVLEDEGLHTIAAHCTQLTHLYLRRCV
..: .:: .: . :: .:..: . :. : .: :..... : : :.:. :.
CCDS32 SITNMSL--KALSEGCPLL-EQLNISWCDQ----VTKD-GIQALVRGCGGLKALFLKGCT
160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 RLTDEGLRYLVIYCASIKELSVSDCRFVSDFGLREIAKLESRLRYLSIAHCGRVTDVGIR
.: ::.:.:. .: . :... : ..: :: : . .:. : . :. .::. .
CCDS32 QLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITDEGLITICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILN
210 220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 YVAKYCSKLRYLNARGCEGITDHGVEYLAKNCTKLKSLDIGKCPLVSDTGLECLALNCFN
... : .:: :.. : .:: : ::.:: .:...:. .: ..:. : :...:
CCDS32 ALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHELEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPR
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 LKRLSLKSCESITGQGLQIVAAN-CF--DLQTLNVQDCEVSVEALRFVKRHCKRCVIEHT
:. :::. :: :: .:.. .. . : .:.......: . ..: .: : :
CCDS32 LQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIELDNCPLITDA---SLEHLKSCHSLER
330 340 350 360 370 380
490
pF1KA0 NPAFF
CCDS32 IELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL
390 400 410 420 430
>>CCDS54116.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 (404 aa)
initn: 811 init1: 330 opt: 421 Z-score: 401.5 bits: 83.5 E(32554): 4.8e-16
Smith-Waterman score: 603; 29.6% identity (61.8% similar) in 382 aa overlap (102-477:12-371)
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 GSSTSSSSITGETVAMVHSPPPTRLTHPLIRLASRPQKEQASIDR-LPDHSMVQIFSFLP
:. ....: :.. :: . ...:::::
CCDS54 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLD
10 20 30 40
140 150 160 170 180
pF1KA0 TNQLCRCARVCRRWYNLAWDPRLWRTIRLTGETINVD-RALKVLTRRLCQDTPNVCLMLE
. :::::.: : : :: : :. : : ... :... ...: : .:.
CCDS54 VVTLCRCAQVSRAWNVLALDGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKR-CGG------FLR
50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 TVTVSGCRRLTDRGLYTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFDVVSLCPNLEHLDVSGCS
... :: . : .: :.:: : ... :...:: . .. . :: ::.:..: :.
CCDS54 KLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIEVLNLNGCTKTTD------AEGCPLLEQLNISWCD
100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 KVTCISLTREASIKLSPLHGKQISIRYLDMTDCFVLEDEGLHTIAAHCTQLTHLYLRRCV
.:: .. .: .. ... : . : ::::.:. :.::: .:. : :. :.
CCDS54 QVTKDGI--QALVRGCG------GLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCL
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 RLTDEGLRYLVIYCASIKELSVSDCRFVSDFGLREIAKLESRLRYLSIAHCGRVTDVGIR
..::::: . : ... : .: : ..: : ... ::: : .:.:...::::.
CCDS54 QITDEGLITICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFT
210 220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 YVAKYCSKLRYLNARGCEGITDHGVEYLAKNCTKLKSLDIGKCPLVSDTGLECLALN-CF
.:. : .:. .. . : ::: . :. .: .:. :....: :..: :.. :. . :
CCDS54 TLARNCHELEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACA
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 N--LKRLSLKSCESITGQGLQIVAANCFDLQTLNVQDCE-VSVEALRFVKRHCKRCVIEH
. :. . : .: :: .:. . . : .:. ... ::. .. ... .. :
CCDS54 HDQLEVIELDNCPLITDASLEHLKS-CHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHA
330 340 350 360 370
490
pF1KA0 TNPAFF
CCDS54 YFAPVTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL
380 390 400
>>CCDS47678.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 (690 aa)
initn: 374 init1: 128 opt: 348 Z-score: 330.2 bits: 71.0 E(32554): 4.5e-12
Smith-Waterman score: 436; 25.8% identity (55.1% similar) in 414 aa overlap (111-479:152-555)
90 100 110 120 130 140
pF1KA0 TGETVAMVHSPPPTRLTHPLIRLASRPQKEQASIDRLPDHSMVQIFSFLPTNQLCRCARV
. .:. ::.....::: .: ... :..:
CCDS47 NRLILKRAAAEESNFPERSSSEVFLVDETLKCDISLLPERAILQIFFYLSLKDVIICGQV
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180
pF1KA0 CRRWYNLAWDPRLWRTIRLTG-ETINVDRAL-KVLTR----------RLCQDTPNV----
. :. .. :: .: ... ... :. . ..: : : : :..
CCDS47 NHAWMLMTQLNSLWNAIDFSSVKNVIPDKYIVSTLQRWRLNVLRLNFRGCLLRPKTFRSV
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 --CLMLETVTVSGCRRLTDRGLYTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFD-VVSLCPNLE
: :. ..:: : .::... :.. :: . : :.:: .. . .. : :
CCDS47 SHCRNLQELNVSDCPTFTDESMRHISEGCPGVL------CLNLSNTTITNRTMRLLPRHF
250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 HLDVSGCSKVTCISLTREASIKLSPLHGKQISIRYLDMTDCFVLEDEGLHTIAAHCTQLT
: .... : . : .: .. :. .: . : :::.. : . .:.. :: :: .
CCDS47 H-NLQNLSLAYCRRFTDKGLQYLNLGNGCHKLI-YLDLSGCTQISVQGFRYIANSCTGIM
300 310 320 330 340 350
310 320 330
pF1KA0 HLYLRRCVRLTDEGLRYLVIYCASIKEL------SVSDCRF------------------V
:: . :::. .. :: :. : : .::: : :
CCDS47 HLTINDMPTLTDNCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSACKLRKIRFEGNKRV
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KA0 SDFGLREIAKLESRLRYLSIAHCGRVTDVGIRYVAKYCSKLRYLNARGCEGITDHGVEYL
.: ... : : : .. .: : .:: ..: .. ..: :: .: : : :.. .
CCDS47 TDASFKFIDKNYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLSPL-KQLTVLNLANCVRIGDMGLKQF
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 --AKNCTKLKSLDIGKCPLVSDTGLECLALNCFNLKRLSLKSCESITGQGLQIVAANCFD
. ... :....: .::... :. : ::. :::..:: .:.::. .. : :.
CCDS47 LDGPASMRIRELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIV-NIFS
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490
pF1KA0 LQTLNVQDCEVSVEALRFVKRHCKRCVIEHTNPAFF
: ..... ..: :.: ..:: :
CCDS47 LVSIDLSGTDISNEGLNVLSRHKKLKELSVSECYRITDDGIQITDSAMEMLSAKCHYLHI
540 550 560 570 580 590
>>CCDS54560.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 (355 aa)
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90 100 110 120 130 140
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.:: . ...::::: :::::.. . :
CCDS54 MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWN
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150 160 170 180 190 200
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:: : :. : : . .:. :... ...:
CCDS54 ILALDGSNWQRIDLFNFQTDVEGRVVENISKR----------------------------
50 60 70
210 220 230 240 250 260
pF1KA0 YTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFDVVSLCPNLEHLDVSGCSKVT---CISLTREAS
: ::.: . :: .... .. .. : :.:::...::.:.: : ::.: :
CCDS54 -----CGGFLRKLSLRGCIGVGDSSLKTFAQNCRNIEHLNLNGCTKITDSTCYSLSRFCS
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::. ... . :.. .: . :::. : : .: : : : ::: .: : .
CCDS54 -KLKHIQNYCHELVSLNLQSCSRITDEGVVQICRGCHRLQALCLSGCSNLTDASLTALGL
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: .. : .. : ..: :. .:. .:. ... .: .:: . .. .: ::. :
CCDS54 NCPRLQILEAARCSHLTDAGFTLLARNCHELEKMDLEECILITDSTLIQLSIHCPKLQAL
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. :: ::: :. .:... : .:. :.. .: :..:..:: : :: .:.:: : .:
CCDS54 SLSHCELITDDGILHLSNSTCGHERLRVLELDNCLLITDVALEHLE-NCRGLERLELYDC
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...: :..
CCDS54 QQVTRAGIKRMRAQLPHVKVHAYFAPVTPPTAVAGSGQRLCRCCVIL
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>>CCDS5726.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 (735 aa)
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:. . : .:.:: .. : . :.: ..
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.. : .:.. .. .. : .: :....: .. ..: . . .: .. :: :
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....: : : .. .. .: .:..: :: : .:: .:. :.: :. .:: .:
CCDS57 NLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIVNIFSLVSIDLSGTD---
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.:. :: ... ...:. ::...: :.:: ::. : :..:.. : ..: ..
CCDS57 ISNEGLNVLSR-HKKLKELSVSECYRITDDGIQAFCKSSLILEHLDVSYCSQLSDMIIKA
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:: : .: ::.:. :: ..:...: :. .: :. :....: .: : :. . .: .:
CCDS57 LAIYCINLTSLSIAGCPKITDSAMEMLSAKCHYLHILDISGCVLLTDQILEDLQIGCKQL
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. :..: : ..: .: . .. . .. . ..:
CCDS57 RILKMQYCTNISKKAAQRMSSKVQQQEYNTNDPPRWFGYDREGNPVTELDNITSSKGALE
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CCDS57 LTVKKSTYSSEDQAA
730
>>CCDS75649.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 (707 aa)
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CCDS75 SDCPTFTDESMRHISEGCPGVLCLNLSNTTITNRTMRLLPRHFHNLQNLSLAYCRRFTDK
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210 220 230 240 250
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:: .... : .: :..::: .:: .. ... : .. :: .. .: :..
CCDS75 GLQYLNLGNGCHKLIYLDLSGCTQISVQGFRYIANSCTGIMHLTINDMPTLTDNCVKALV
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: ... : : .. ..: :. .. :: .. : . .:.:.:
CCDS75 EKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSACKLRKIRFEGNKRVTDASFKFIDKNYPNLSHIY
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. : .:: .:: : . .:.:.: ..: ..:.::... . :.: :....
CCDS75 MADCKGITDSSLRSL----SPLKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGPASMRIRELNLSN
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CCDS75 CVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIVNIFSLVSIDLSGTDISNEAFC
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]