Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7874
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7874, 637 aa
1>>>pF1KB7874 637 - 637 aa - 637 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6164+/-0.00161; mu= 8.1958+/- 0.093
mean_var=263.5515+/-59.036, 0's: 0 Z-trim(105.0): 855 B-trim: 442 in 1/51
Lambda= 0.079003
statistics sampled from 7229 (8193) to 7229 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 3.160
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS60720.1 ZNF143 gene_id:7702|Hs108|chr11 ( 637) 4229 496.9 3.4e-140
CCDS7799.2 ZNF143 gene_id:7702|Hs108|chr11 ( 638) 4209 494.6 1.7e-139
CCDS60721.1 ZNF143 gene_id:7702|Hs108|chr11 ( 607) 3774 445.0 1.4e-124
CCDS4801.1 ZNF76 gene_id:7629|Hs108|chr6 ( 570) 1918 233.5 6.2e-61
CCDS75435.1 ZNF76 gene_id:7629|Hs108|chr6 ( 515) 1652 203.1 7.9e-52
CCDS32902.1 ZNF121 gene_id:7675|Hs108|chr19 ( 390) 677 91.8 1.9e-18
CCDS77228.1 ZNF121 gene_id:7675|Hs108|chr19 ( 390) 677 91.8 1.9e-18
CCDS12837.1 ZNF175 gene_id:7728|Hs108|chr19 ( 711) 675 91.9 3.2e-18
CCDS45550.1 ZNF778 gene_id:197320|Hs108|chr16 ( 729) 675 91.9 3.2e-18
CCDS73928.1 ZNF778 gene_id:197320|Hs108|chr16 ( 757) 675 91.9 3.3e-18
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 662 90.5 9.3e-18
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 660 90.3 1.2e-17
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 655 89.5 1.4e-17
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 655 89.6 1.4e-17
CCDS42496.1 ZNF846 gene_id:162993|Hs108|chr19 ( 533) 653 89.2 1.5e-17
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 652 89.1 1.6e-17
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 650 89.1 2.3e-17
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 742) 649 89.0 2.5e-17
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 745) 649 89.0 2.5e-17
CCDS46160.1 ZNF577 gene_id:84765|Hs108|chr19 ( 426) 641 87.7 3.4e-17
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 639 87.7 5.1e-17
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 636 87.2 5.2e-17
CCDS74279.1 ZNF426 gene_id:79088|Hs108|chr19 ( 516) 634 87.1 6.7e-17
CCDS12215.1 ZNF426 gene_id:79088|Hs108|chr19 ( 554) 634 87.1 6.9e-17
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 636 87.5 7.2e-17
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 633 87.1 8.8e-17
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 633 87.2 9.2e-17
CCDS2720.2 ZNF501 gene_id:115560|Hs108|chr3 ( 271) 625 85.7 9.2e-17
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 629 86.5 1e-16
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 629 86.5 1e-16
CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 540) 628 86.4 1.1e-16
CCDS54257.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 563) 628 86.4 1.1e-16
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 629 86.7 1.3e-16
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 629 86.8 1.3e-16
CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 ( 576) 626 86.2 1.3e-16
CCDS82297.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19 ( 611) 624 86.0 1.6e-16
CCDS12842.2 ZNF577 gene_id:84765|Hs108|chr19 ( 485) 622 85.7 1.7e-16
CCDS45989.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19 ( 643) 624 86.0 1.7e-16
CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6 ( 358) 619 85.1 1.7e-16
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 621 85.6 1.9e-16
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 623 86.0 1.9e-16
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 621 85.7 2e-16
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 622 86.0 2.3e-16
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 620 85.6 2.3e-16
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 622 86.0 2.3e-16
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 622 86.0 2.3e-16
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 620 85.6 2.4e-16
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 615 84.7 2.4e-16
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 615 84.8 2.8e-16
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 615 84.9 2.9e-16
>>CCDS60720.1 ZNF143 gene_id:7702|Hs108|chr11 (637 aa)
initn: 4229 init1: 4229 opt: 4229 Z-score: 2630.4 bits: 496.9 E(32554): 3.4e-140
Smith-Waterman score: 4229; 99.8% identity (100.0% similar) in 637 aa overlap (1-637:1-637)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLLAQINRDSQGMTEFPGGGMEAQHVTLCLTEAVTVADGDNLENMEGVSLQAVTLADGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MLLAQINRDSQGMTEFPGGGMEAQHVTLCLTEAVTVADGDNLENMEGVSLQAVTLADGST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AYIQHNSKDAKLIDGQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKSRDSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AYIQHNSKDAKLIDGQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKSRDSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIHH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 TSKDSYDQSALQAVQLEDGTTAYIHHAVQVPQSDTILAIQADGTVAGLHTGDATIDPDTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TSKDSYDQSALQAVQLEDGTTAYIHHAVQVPQSDTILAIQADGTVAGLHTGDATIDPDTI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SALEQYAAKVSIDGSESVAGTGMIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SALEQYAAKVSIDGSESVAGTGMIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCEY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 DGCGKLYTTAHHLKVHERSHTGDRPYQCEHAGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DGCGKLYTTAHHLKVHERSHTGDRPYQCEHAGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCSE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 DNCTKSFKTSGDLQKHIRTHTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYYCTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DNCTKSFKTSGDLQKHIRTHTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYYCTE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 PGCGRAFASATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PGCGRAFASATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 CGKTYKQISTLAMHKRTAHNDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGSQITYVTGVEGDDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 CGKTYKQISTLAMHKRTAHNDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGSQITYVTGVEGDDV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 VSTQVATVTQSGLSQQVTLISQDGTQHVNISQADMQAIGNTITMVTQDGTPITVPAHDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VSTQVATVTQSGLSQQVTLISQDGTQHVNISQADMQAIGNTITMVTQDGTPITVPAHDAV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 ISSAGTHSVAMVTAEGTEGQQVAIVAQDLAAFHTASSEMGHQQHSHHLVTTETRPLTLVA
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ISSAGTHSVAMVTAEGTEGEQVAIVAQDLAAFHTASSEMGHQQHSHHLVTTETRPLTLVA
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KB7 TSNGTQIAVQLGEQPSLEEAIRIASRIQQGETPGLDD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TSNGTQIAVQLGEQPSLEEAIRIASRIQQGETPGLDD
610 620 630
>>CCDS7799.2 ZNF143 gene_id:7702|Hs108|chr11 (638 aa)
initn: 4208 init1: 3604 opt: 4209 Z-score: 2618.1 bits: 494.6 E(32554): 1.7e-139
Smith-Waterman score: 4209; 99.5% identity (99.7% similar) in 638 aa overlap (1-637:1-638)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLLAQINRDSQGMTEFPGGGMEAQHVTLCLTEAVTVADGDNLENMEGVSLQAVTLADGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MLLAQINRDSQGMTEFPGGGMEAQHVTLCLTEAVTVADGDNLENMEGVSLQAVTLADGST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 AYIQHNSKDAKLIDGQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKSR-DSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS77 AYIQHNSKDAKLIDGQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKSTGDSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 HTSKDSYDQSALQAVQLEDGTTAYIHHAVQVPQSDTILAIQADGTVAGLHTGDATIDPDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HTSKDSYDQSALQAVQLEDGTTAYIHHAVQVPQSDTILAIQADGTVAGLHTGDATIDPDT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 ISALEQYAAKVSIDGSESVAGTGMIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ISALEQYAAKVSIDGSESVAGTGMIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 YDGCGKLYTTAHHLKVHERSHTGDRPYQCEHAGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 YDGCGKLYTTAHHLKVHERSHTGDRPYQCEHAGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 EDNCTKSFKTSGDLQKHIRTHTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYYCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EDNCTKSFKTSGDLQKHIRTHTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYYCT
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 EPGCGRAFASATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EPGCGRAFASATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCN
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 HCGKTYKQISTLAMHKRTAHNDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGSQITYVTGVEGDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HCGKTYKQISTLAMHKRTAHNDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGSQITYVTGVEGDD
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 VVSTQVATVTQSGLSQQVTLISQDGTQHVNISQADMQAIGNTITMVTQDGTPITVPAHDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VVSTQVATVTQSGLSQQVTLISQDGTQHVNISQADMQAIGNTITMVTQDGTPITVPAHDA
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 VISSAGTHSVAMVTAEGTEGQQVAIVAQDLAAFHTASSEMGHQQHSHHLVTTETRPLTLV
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VISSAGTHSVAMVTAEGTEGEQVAIVAQDLAAFHTASSEMGHQQHSHHLVTTETRPLTLV
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630
pF1KB7 ATSNGTQIAVQLGEQPSLEEAIRIASRIQQGETPGLDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ATSNGTQIAVQLGEQPSLEEAIRIASRIQQGETPGLDD
610 620 630
>>CCDS60721.1 ZNF143 gene_id:7702|Hs108|chr11 (607 aa)
initn: 3772 init1: 3604 opt: 3774 Z-score: 2350.4 bits: 445.0 E(32554): 1.4e-124
Smith-Waterman score: 3941; 94.7% identity (94.8% similar) in 638 aa overlap (1-637:1-607)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLLAQINRDSQGMTEFPGGGMEAQHVTLCLTEAVTVADGDNLENMEGVSLQAVTLADGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MLLAQINRDSQGMTEFPGGGMEAQHVTLCLTEAVTVAD----------------------
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KB7 AYIQHNSKDAKLIDGQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKSR-DSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIH
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS60 ---------AKLIDGQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKSTGDSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIH
40 50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 HTSKDSYDQSALQAVQLEDGTTAYIHHAVQVPQSDTILAIQADGTVAGLHTGDATIDPDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 HTSKDSYDQSALQAVQLEDGTTAYIHHAVQVPQSDTILAIQADGTVAGLHTGDATIDPDT
90 100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 ISALEQYAAKVSIDGSESVAGTGMIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ISALEQYAAKVSIDGSESVAGTGMIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCE
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 YDGCGKLYTTAHHLKVHERSHTGDRPYQCEHAGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 YDGCGKLYTTAHHLKVHERSHTGDRPYQCEHAGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCS
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 EDNCTKSFKTSGDLQKHIRTHTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYYCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EDNCTKSFKTSGDLQKHIRTHTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYYCT
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 EPGCGRAFASATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EPGCGRAFASATNYKNHVRIHTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCN
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 HCGKTYKQISTLAMHKRTAHNDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGSQITYVTGVEGDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 HCGKTYKQISTLAMHKRTAHNDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGSQITYVTGVEGDD
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 VVSTQVATVTQSGLSQQVTLISQDGTQHVNISQADMQAIGNTITMVTQDGTPITVPAHDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VVSTQVATVTQSGLSQQVTLISQDGTQHVNISQADMQAIGNTITMVTQDGTPITVPAHDA
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 VISSAGTHSVAMVTAEGTEGQQVAIVAQDLAAFHTASSEMGHQQHSHHLVTTETRPLTLV
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VISSAGTHSVAMVTAEGTEGEQVAIVAQDLAAFHTASSEMGHQQHSHHLVTTETRPLTLV
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630
pF1KB7 ATSNGTQIAVQLGEQPSLEEAIRIASRIQQGETPGLDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ATSNGTQIAVQLGEQPSLEEAIRIASRIQQGETPGLDD
570 580 590 600
>>CCDS4801.1 ZNF76 gene_id:7629|Hs108|chr6 (570 aa)
initn: 2268 init1: 1374 opt: 1918 Z-score: 1207.4 bits: 233.5 E(32554): 6.2e-61
Smith-Waterman score: 2178; 57.1% identity (77.9% similar) in 597 aa overlap (45-630:1-557)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 EFPGGGMEAQHVTLCLTEAVTVADGDNLENMEGVSLQAVTLADGSTAYIQHNSKDAKLID
::...:..:::.::.:::.:. : ::..
CCDS48 MESLGLHTVTLSDGTTAYVQQAVKGEKLLE
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 GQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKSRDSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIHHTSKDSYDQSALQAV
:::::::::..::...: . : ..: .:::: ::::::. :.::.: ...:: :.:.::
CCDS48 GQVIQLEDGTTAYIHQVTVQK--EALSFEDGQPVQLEDGSMAYIHRTPREGYDPSTLEAV
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140 150 160 170 180 190
pF1KB7 QLEDGTTAYIHHAVQVPQSDTILAIQADGTVAGLHT-GDATIDPDTISALEQYAAKVSID
:::::.:::::: : ::. .::::.:.. . : . : .. :.. ::::::.:: :
CCDS48 QLEDGSTAYIHHPVAVPSESTILAVQTEVGLEDLAAEDDEGFSADAVVALEQYASKVLHD
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. :: .: :.:: :..:::: : :::.::::::::
CCDS48 S-------------------QIPRNG-------KGQQVGDRAFRCGYKGCGRLYTTAHHL
150 160 170 180
260 270 280 290 300 310
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:::::.:::::::.:. .::::::::::::::::::::::::.: :. :.:.:::::::
CCDS48 KVHERAHTGDRPYRCDFPSCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYKCPEELCSKAFKTSGDL
190 200 210 220 230 240
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 QKHIRTHTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYYCTEPGCGRAFASATNY
:::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::: : :: :::.:.:::::
CCDS48 QKHVRTHTGERPFQCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYTCPEPHCGRGFTSATNY
250 260 270 280 290 300
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pF1KB7 KNHVRIHTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNHCGKTYKQISTLAM
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::: :::.:. :::::.: :::::
CCDS48 KNHVRIHTGEKPYVCTVPGCGKRFTEYSSLYKHHVVHTHCKPYTCSTCGKTYRQTSTLAM
310 320 330 340 350 360
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pF1KB7 HKRTAHNDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGS------QITYVTGV-EGDDVVSTQVA
:::.::.. : :: ..:..: .. .. . : .:.:.. : : : . .:::
CCDS48 HKRSAHGELEATEESEQALYEQQQLEAASAAEESPPPKRPRIAYLSEVKEERDDIPAQVA
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pF1KB7 TVTQSGLSQQVTLISQDGTQHVNISQADMQAIGNTITMVTQDG-TPITVPAHDAVISSAG
::. . ::.::.:::.:.:..: :.::.:..:.:::: : : .:.:. :: ....:
CCDS48 MVTEEDGAPQVALITQDGAQQVSLSPEDLQALGSAISMVTQHGSTTLTIPSPDADLATSG
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pF1KB7 THSVAMVTAEGTEGQQVAIVAQD-LAAFHTASSEMGHQQHSHHLVTTETRPLTLVATSNG
::.:.::.:.::. : :.:... ..: .. . . ::: ..:.::.::
CCDS48 THTVTMVSADGTQTQPVTIITSGAVVAEDSSVASLRHQQ------------VALLATANG
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pF1KB7 TQIAVQLGEQPSLEEAIRIASR-IQQGETPGLDD
:.::::: :: .::::: .:. .:::
CCDS48 THIAVQLEEQQTLEEAINVATAAMQQGAVTLETTVSESGC
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20 30 40 50 60 70
pF1KB7 EFPGGGMEAQHVTLCLTEAVTVADGDNLENMEGVSLQAVTLADGSTAYIQHNSKDAKLID
::...:..:::.::.:::.:. : ::..
CCDS75 MESLGLHTVTLSDGTTAYVQQAVKGEKLLE
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 GQVIQLEDGSAAYVQHVPIPKSRDSLRLEDGQAVQLEDGTTAFIHHTSKDSYDQSALQAV
:::::::::..::...: . : ..: .:::: ::::::. :.::.: ...:: :.:.::
CCDS75 GQVIQLEDGTTAYIHQVTVQK--EALSFEDGQPVQLEDGSMAYIHRTPREGYDPSTLEAV
40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 QLEDGTTAYIHHAVQVPQSDTILAIQADGTVAGLHT-GDATIDPDTISALEQYAAKVSID
:::::.:::::: : ::. .::::.:.. . : . : .. :.. ::::::.:: :
CCDS75 QLEDGSTAYIHHPVAVPSESTILAVQTEVGLEDLAAEDDEGFSADAVVALEQYASKVLHD
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 GSESVAGTGMIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCEYDGCGKLYTTAHHL
. :: .: :.:: :..:::: : :::.::::::::
CCDS75 S-------------------QIPRNG-------KGQQVGDRAFRCGYKGCGRLYTTAHHL
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pF1KB7 KVHERSHTGDRPYQCEHAGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCSEDNCTKSFKTSGDL
:::::.:::::::.:. .::::::::::::::::::::::::.: :. :.:.:::::::
CCDS75 KVHERAHTGDRPYRCDFPSCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYKCPEELCSKAFKTSGDL
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pF1KB7 QKHIRTHTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYYCTEPGCGRAFASATNY
:::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::: : :: :::.:.:::::
CCDS75 QKHVRTHTGERPFQCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYTCPEPHCGRGFTSATNY
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pF1KB7 KNHVRIHTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNHCGKTYKQISTLAM
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::: :::.:. :::::.: :::::
CCDS75 KNHVRIHTGEKPYVCTVPGCGKRFTEYSSLYKHHVVHTHCKPYTCSTCGKTYRQTSTLAM
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pF1KB7 HKRTAHNDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGS------QITYVTGV-EGDDVVSTQVA
:::.::.. : :: ..:..: .. .. . : .:.:.. : : : . .:::
CCDS75 HKRSAHGELEATEESEQALYEQQQLEAASAAEESPPPKRPRIAYLSEVKEERDDIPAQVA
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pF1KB7 TVTQSGLSQQVTLISQDGTQHVNISQADMQAIGNTITMVTQDGTPITVPAHDAVISSAGT
::. . ::.::.:::.:.:.: :.:.
CCDS75 MVTEEDGAPQVALITQDGAQQVTI------------------------------ITSG--
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pF1KB7 HSVAMVTAEGTEGQQVAIVAQDLAAFHTASSEMGHQQHSHHLVTTETRPLTLVATSNGTQ
:.::.: .. . . ::: ..:.::.:::.
CCDS75 ----------------AVVAED-----SSVASLRHQQ------------VALLATANGTH
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610 620 630
pF1KB7 IAVQLGEQPSLEEAIRIASR-IQQGETPGLDD
::::: :: .::::: .:. .:::
CCDS75 IAVQLEEQQTLEEAINVATAAMQQGAVTLETTVSESGC
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:: :.::.: ::.:: .:. : : : ::: .:: : : ::.::. ... .:::.:
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. .:
CCDS32 TGEKPYICNECGKAYNRFYLLTKHLKTH
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pF1KB7 HTGDRPYQCEHAGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCSEDNCTKSFKTSGDLQKHIRT
:::..::::.. ::.::: :: .::: :::::::.:.: : :... : .:..:
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pF1KB7 HTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYYCTEPGCGRAFASATNYKNHVRI
:: :.::.: ::.:: .:. : : : ::: .:: : : ::.::. ... .:::.:
CCDS77 HTEEKPFECKV--CGKSFRSSSCLKNHFRIHTGIKPYKCKE--CGKAFTVSSSLHNHVKI
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CCDS77 HTGEKPYEC--KDCGKAFATSSQLIEHIRTHTGEKPYICKECGKTFRASSHLQKHVRI-H
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pF1KB7 NDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGSQITYVTGVEGDDVVSTQVATVTQSGLSQQVTL
. .:
CCDS77 TGEKPYICNECGKAYNRFYLLTKHLKTH
370 380 390
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pF1KB7 GTGMIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCEYDGCGKLYTTAHHLKVHERS
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CCDS12 KIHTGERQYACSECGKAFTQKSTLSLHQRIHSGQKSYVCIE--CGQAFIQKAHLIVHQRS
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pF1KB7 HTGDRPYQCEHAGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCSEDNCTKSFKTSGDLQKHIRT
:::..::::.. :::.: . : : : :::::::.::. : :.: .. :. : .
CCDS12 HTGEKPYQCHN--CGKSFISKSQLDIHHRIHTGEKPYECSD--CGKTFTQKSHLNIHQKI
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pF1KB7 HTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYYCTEPGCGRAFASATNYKNHVRI
::::: : ::..:. ..: ..: : ::::.:: :.: ::.::.: ...:.: ::
CCDS12 HTGERHHVCS--ECGKAFNQKSILSMHQRIHTGEKPYKCSE--CGKAFTSKSQFKEHQRI
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pF1KB7 HTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNHCGKTYKQISTLAMHKRTAH
:::::::::: : : :. :...::...::. .:. : .:::.. : : : :.:: :
CCDS12 HTGEKPYVCT--ECGKAFNGRSNFHKHQITHTRERPFVCYKCGKAFVQKSELITHQRT-H
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pF1KB7 NDTEPIE--EEQEAFFEPPPGQGEDVLKGSQITYVTGVEGDDVVSTQVATVTQSGLSQQV
.: : . ..: . : . .. .. .. :: . :
CCDS12 MGEKPYECLDCGKSFSKKPQLKVHQRIHTGERPYVCSECGKAFNNRSNFNKHQTTHTRDK
640 650 660 670 680 690
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pF1KB7 TLISQDGTQHVNISQADMQAIGNTITMVTQDGTPITVPAHDAVISSAGTHSVAMVTAEGT
CCDS12 SYKCSYSVKGFTKQ
700 710
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pF1KB7 GTGMIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCEYDGCGKLYTTAHHLKVHERS
..: : . : : ::: .:. : : :.
CCDS45 KTHTREKPFACVVCGKYFRNSSCLNNHVRIHTGIKPYTCSY--CGKAFTVRCGLTRHVRT
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pF1KB7 HTGDRPYQCEHAGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCSEDNCTKSFKTSGDLQKHIRT
:::..:: :. ::::: :. :: :::::::::::.:. .: ::: .:..: .: :
CCDS45 HTGEKPYTCKD--CGKAFCTSSGLTEHVRTHTGEKPYECK--DCGKSFTVSSSLTEHARI
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320 330 340 350 360 370
pF1KB7 HTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYYCTEPGCGRAFASATNYKNHVRI
::::.:..: . ::..:: . :.::::::.:: : . ::.:. . ..::.
CCDS45 HTGEKPYEC--KQCGKAFTGRSGLTKHMRTHTGEKPYECKD--CGKAYNRVYLLNEHVKT
480 490 500 510 520
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pF1KB7 HTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNHCGKTYKQISTLAMHKRTAH
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CCDS45 HTEEKPFICTV--CRKSFRNSSCLNKHIQIHTGIKPYECKDCGKTFTVSSSLTEHIRT-H
530 540 550 560 570 580
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 NDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGSQITYVTGVEGDDVVSTQVATVTQSGLSQQVTL
. .: :
CCDS45 TGEKPYECKVCGKAFTTSSHLIVHIRTHTGEKPYICKECGKAFASSSHLIEHRRTHTGEK
590 600 610 620 630 640
>>CCDS73928.1 ZNF778 gene_id:197320|Hs108|chr16 (757 aa)
initn: 633 init1: 148 opt: 675 Z-score: 440.4 bits: 91.9 E(32554): 3.3e-18
Smith-Waterman score: 687; 47.5% identity (67.7% similar) in 217 aa overlap (230-446:415-618)
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 GTGMIGENEQEKKMQIVLQGHATRVTAKSQQSGEKAFRCEYDGCGKLYTTAHHLKVHERS
..: : . : : ::: .:. : : :.
CCDS73 KTHTREKPFACVVCGKYFRNSSCLNNHVRIHTGIKPYTCSY--CGKAFTVRCGLTRHVRT
390 400 410 420 430 440
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pF1KB7 HTGDRPYQCEHAGCGKAFATGYGLKSHVRTHTGEKPYRCSEDNCTKSFKTSGDLQKHIRT
:::..:: :. ::::: :. :: :::::::::::.:. .: ::: .:..: .: :
CCDS73 HTGEKPYTCKD--CGKAFCTSSGLTEHVRTHTGEKPYECK--DCGKSFTVSSSLTEHARI
450 460 470 480 490
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 HTGERPFKCPFEGCGRSFTTSNIRKVHVRTHTGERPYYCTEPGCGRAFASATNYKNHVRI
::::.:..: . ::..:: . :.::::::.:: : . ::.:. . ..::.
CCDS73 HTGEKPYEC--KQCGKAFTGRSGLTKHMRTHTGEKPYECKD--CGKAYNRVYLLNEHVKT
500 510 520 530 540 550
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 HTGEKPYVCTVPGCDKRFTEYSSLYKHHVVHTHSKPYNCNHCGKTYKQISTLAMHKRTAH
:: :::..::: : : : . : : :: .:: :::.:. ::::. :.:. : :: :
CCDS73 HTEEKPFICTV--CRKSFRNSSCLNKHIQIHTGIKPYECKDCGKTFTVSSSLTEHIRT-H
560 570 580 590 600 610
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 NDTEPIEEEQEAFFEPPPGQGEDVLKGSQITYVTGVEGDDVVSTQVATVTQSGLSQQVTL
. .: :
CCDS73 TGEKPYECKVCGKAFTTSSHLIVHIRTHTGEKPYICKECGKAFASSSHLIEHRRTHTGEK
620 630 640 650 660 670
637 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 09:58:57 2016 done: Sat Nov 5 09:58:58 2016
Total Scan time: 3.160 Total Display time: 0.160
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]