Result of FASTA (ccds) for pFN21AB7656
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7656, 394 aa
  1>>>pF1KB7656 394 - 394 aa - 394 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8434+/-0.00102; mu= 16.3243+/- 0.062
 mean_var=116.4773+/-24.692, 0's: 0 Z-trim(107.9): 23  B-trim: 372 in 1/50
 Lambda= 0.118838
 statistics sampled from 9839 (9852) to 9839 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.303), width:  16
 Scan time:  2.820

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10384.1 CERS3 gene_id:204219|Hs108|chr15       ( 383) 2673 469.3 2.7e-132
CCDS973.1 CERS2 gene_id:29956|Hs108|chr1           ( 380) 1438 257.5 1.4e-68
CCDS12197.1 CERS4 gene_id:79603|Hs108|chr19        ( 394) 1187 214.5 1.3e-55
CCDS8801.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12         ( 392) 1056 192.1 7.7e-49
CCDS2228.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2         ( 384) 1032 187.9 1.3e-47
CCDS58734.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2        ( 392) 1012 184.5 1.4e-46
CCDS61120.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12        ( 334)  895 164.4 1.4e-40


>>CCDS10384.1 CERS3 gene_id:204219|Hs108|chr15            (383 aa)
 initn: 2673 init1: 2673 opt: 2673  Z-score: 2488.7  bits: 469.3 E(32554): 2.7e-132
Smith-Waterman score: 2673; 99.7% identity (99.7% similar) in 383 aa overlap (12-394:1-383)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MLHTTARRAARMFWTFKEWFWLERFWLPPTIKWSDLEDHDGLVFVKPSHLYVTIPYAFLL
                  :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10            MFWTFKEWFWLERFWLPPTIKWSDLEDHDGLVFVKPSHLYVTIPYAFLL
                          10        20        30        40         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 LIIRRVFEKFVASPLAKSFGIKETVRKVTPNTVLENFFKHSTRQPLQTDIYGLAKKCNLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LIIRRVFEKFVASPLAKSFGIKETVRKVTPNTVLENFFKHSTRQPLQTDIYGLAKKCNLT
      50        60        70        80        90       100         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 ERQVERWFRSRRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMITVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWNGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ERQVERWFRSRRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMITVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWNGY
     110       120       130       140       150       160         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 PKQPLLPSQYWYYILEMSFYWSLLFRLGFDVKRKDFLAHIIHHLAAISLMSFSWCANYIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PKQPLLPSQYWYYILEMSFYWSLLFRLGFDVKRKDFLAHIIHHLAAISLMSFSWCANYIR
     170       180       190       200       210       220         

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 SGTLVMIVHDVADIWLESAKMFSYAGWTQTCNTLFFIFSTIFFISRLIVFPFWILYCTLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SGTLVMIVHDVADIWLESAKMFSYAGWTQTCNTLFFIFSTIFFISRLIVFPFWILYCTLI
     230       240       250       260       270       280         

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 LPMYHLEPFFSYIFLNLQLMILQVLHLYWGYYILKMLNRCIFMKSIQDVRSDDEDYEEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPMYHLEPFFSYIFLNLQLMILQVLHLYWGYYILKMLNRCIFMKSIQDVRSDDEDYEEEE
     290       300       310       320       330       340         

              370       380       390    
pF1KB7 EEEEEEATKGKEMDCLKNGLGAERHLIPNGQHGH
       :::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS10 EEEEEEATKGKEMDCLKNGLRAERHLIPNGQHGH
     350       360       370       380   

>>CCDS973.1 CERS2 gene_id:29956|Hs108|chr1                (380 aa)
 initn: 1198 init1: 1156 opt: 1438  Z-score: 1344.4  bits: 257.5 E(32554): 1.4e-68
Smith-Waterman score: 1438; 52.6% identity (77.5% similar) in 382 aa overlap (12-392:1-376)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MLHTTARRAARMFWTFKEWFWLERFWLPPTIKWSDLEDHDGLVFVKPSHLYVTIPYAFLL
                  :. :. ..:: ::.::: .. :.::::.:: :..: : ::.:.: :.:.
CCDS97            MLQTLYDYFWWERLWLPVNLTWADLEDRDGRVYAKASDLYITLPLALLF
                          10        20        30        40         

               70        80         90       100       110         
pF1KB7 LIIRRVFEKFVASPLAKSFGIKETVR-KVTPNTVLENFFKHSTRQPLQTDIYGLAKKCNL
       ::.:  :: .::.:::  ..::: .: .. ::..::.:.  : .:: :...  :... .:
CCDS97 LIVRYFFELYVATPLAALLNIKEKTRLRAPPNATLEHFYLTSGKQPKQVEVELLSRQSGL
      50        60        70        80        90       100         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 TERQVERWFRSRRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMITVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWNG
       . :::::::: ::::.::: ::::.:: :::.:::.  .::.: . ::::.::. .::.:
CCDS97 SGRQVERWFRRRRNQDRPSLLKKFREASWRFTFYLIAFIAGMAVIVDKPWFYDMKKVWEG
     110       120       130       140       150       160         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB7 YPKQPLLPSQYWYYILEMSFYWSLLFRLGFDVKRKDFLAHIIHHLAAISLMSFSWCANYI
       :: :  .:::::::..:.:::::::: .. :::::::  .::::.:.: :.:::: ::::
CCDS97 YPIQSTIPSQYWYYMIELSFYWSLLFSIASDVKRKDFKEQIIHHVATIILISFSWFANYI
     170       180       190       200       210       220         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB7 RSGTLVMIVHDVADIWLESAKMFSYAGWTQTCNTLFFIFSTIFFISRLIVFPFWILYCTL
       :.:::.: .:: .:  :::::::.:::: .:::..:..:. .:.:.::...:::::.:::
CCDS97 RAGTLIMALHDSSDYLLESAKMFNYAGWKNTCNNIFIVFAIVFIITRLVILPFWILHCTL
     230       240       250       260       270       280         

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB7 ILPMYHLEPFFSYIFLNLQLMILQVLHLYWGYYILKMLNRCIFMKSIQDVRSDDEDYEEE
       . :.     ::.: :.: .. .::.::..:.: ::.: .. :  : ..: ::: :.  : 
CCDS97 VYPLELYPAFFGYYFFNSMMGVLQLLHIFWAYLILRMAHKFITGKLVEDERSDREE-TES
     290       300       310       320       330       340         

     360       370       380       390      
pF1KB7 EEEEEEEATKGKEMDCLKNGLGAERHLIPNGQHGH  
        : ::  :  : .   : ::     : : :..:    
CCDS97 SEGEEAAAGGGAKSRPLANG-----HPILNNNHRKND
      350       360            370       380

>>CCDS12197.1 CERS4 gene_id:79603|Hs108|chr19             (394 aa)
 initn: 907 init1: 870 opt: 1187  Z-score: 1111.7  bits: 214.5 E(32554): 1.3e-55
Smith-Waterman score: 1187; 46.4% identity (71.9% similar) in 384 aa overlap (12-390:1-377)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MLHTTARRAARMFWTFKEWFWLERFWLPPTIKWSDLEDHDGLVFVKPSHLYVTIPYAFLL
                  :. .:.:::: .::::::.. :..:::.:: :. .:. : ...: :..:
CCDS12            MLSSFNEWFWQDRFWLPPNVTWTELEDRDGRVYPHPQDLLAALPLALVL
                          10        20        30        40         

               70        80         90       100       110         
pF1KB7 LIIRRVFEKFVASPLAKSFGIKE-TVRKVTPNTVLENFFKHSTRQPLQTDIYGLAKKCNL
       : .: .::.:.. ::.. .:... : :.: ::..::. :    ..: . ..  :: .:.:
CCDS12 LAMRLAFERFIGLPLSRWLGVRDQTRRQVKPNATLEKHFLTEGHRPKEPQLSLLAAQCGL
      50        60        70        80        90       100         

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 TERQVERWFRSRRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMITVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWNG
       : .:..:::: ::::.::.  ::: :: ::: :::   :.:.. :: . ::.     :. 
CCDS12 TLQQTQRWFRRRRNQDRPQLTKKFCEASWRFLFYLSSFVGGLSVLYHESWLWAPVMCWDR
     110       120       130       140       150       160         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB7 YPKQPLLPSQYWYYILEMSFYWSLLFRLGFDVKRKDFLAHIIHHLAAISLMSFSWCANYI
       ::.: : :: ::.:.::..:: :::.:: ::::::::  ..:::..:. ::.::. :: .
CCDS12 YPNQTLKPSLYWWYLLELGFYLSLLIRLPFDVKRKDFKEQVIHHFVAVILMTFSYSANLL
     170       180       190       200       210       220         

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB7 RSGTLVMIVHDVADIWLESAKMFSYAGWTQTCNTLFFIFSTIFFISRLIVFPFWILYCTL
       : :.::...:: .:  ::. :: .:  . :.:..::.::: .:: .::..::  ::: : 
CCDS12 RIGSLVLLLHDSSDYLLEACKMVNYMQYQQVCDALFLIFSFVFFYTRLVLFPTQILYTTY
     230       240       250       260       270       280         

     300       310       320       330       340          350      
pF1KB7 ILPMYHLEPFFSYIFLNLQLMILQVLHLYWGYYILKMLNRCIFMKSIQ---DVRSDDEDY
          . .  :::.: :.:  ::.::.::..:.  ::.::    :::. :   :.:::    
CCDS12 YESISNRGPFFGYYFFNGLLMLLQLLHVFWSCLILRMLYS--FMKKGQMEKDIRSD----
     290       300       310       320         330       340       

        360       370       380        390                 
pF1KB7 EEEEEEEEEEATKGKEMDCLKNGL-GAERHLIPNGQHGH             
         :: .  :::. ..:   ::::  :. :    .:                 
CCDS12 -VEESDSSEEAAAAQEPLQLKNGAAGGPRPAPTDGPRSRVAGRLTNRHTTAT
            350       360       370       380       390    

>>CCDS8801.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12              (392 aa)
 initn: 981 init1: 841 opt: 1056  Z-score: 990.3  bits: 192.1 E(32554): 7.7e-49
Smith-Waterman score: 1056; 42.4% identity (70.5% similar) in 363 aa overlap (2-361:1-360)

               10        20        30         40        50         
pF1KB7 MLHTTARRAARMFWTFKEWFWLERFWLPPTIKWSDLEDH-DGLVFVKPSHLYVTIPYAFL
        . :.:.    ..:    :.: :::::: ...:.:::   ::  . .  :.  ..: :  
CCDS88  MATAAQGPLSLLWG---WLWSERFWLPENVSWADLEGPADGYGYPRGRHILSVFPLAAG
                10           20        30        40        50      

      60        70        80         90       100       110        
pF1KB7 LLIIRRVFEKFVASPLAKSFGIKET-VRKVTPNTVLENFFKHSTRQPLQTDIYGLAKKCN
       ....: .::.:.:.: :  .::...   .. ::..::. :   :. : .  . ::.:. .
CCDS88 IFFVRLLFERFIAKPCALCIGIEDSGPYQAQPNAILEKVFISITKYPDKKRLEGLSKQLD
         60        70        80        90       100       110      

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB7 LTERQVERWFRSRRNQERPSRLKKFQEACWRFAFYLMITVAGIAFLYDKPWLYDLWEVWN
        . :... ::: ::::..:  : :: :. :::.::: :   :: ::...::..:. . :.
CCDS88 WNVRKIQCWFRHRRNQDKPPTLTKFCESMWRFTFYLCIFCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWH
        120       130       140       150       160       170      

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB7 GYPKQPLLPSQYWYYILEMSFYWSLLFRLGFDVKRKDFLAHIIHHLAAISLMSFSWCANY
       .:: :::  . : :::.:..:::::.:    :.::::::  ..:::..:.:.:::.  :.
CCDS88 NYPFQPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDFLIMFVHHLVTIGLISFSYINNM
        180       190       200       210       220       230      

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB7 IRSGTLVMIVHDVADIWLESAKMFSYAGWTQTCNTLFFIFSTIFFISRLIVFPFWILYCT
       .: :::.: .:::.:. ::.::. .:: . . :.::: :::..:...:: ..:::::  :
CCDS88 VRVGTLIMCLHDVSDFLLEAAKLANYAKYQRLCDTLFVIFSAVFMVTRLGIYPFWILNTT
        240       250       260       270       280       290      

      300       310       320       330        340       350       
pF1KB7 LILPMYHLEPFFSYIFLNLQLMILQVLHLYWGYYILKM-LNRCIFMKSIQDVRSDDEDYE
       :.     . :. :. .::  :. ::.::. :.: : .. :.  :  :  .: ::: :.  
CCDS88 LFESWEIIGPYASWWLLNGLLLTLQLLHVIWSYLIARIALKALIRGKVSKDDRSDVESSS
        300       310       320       330       340       350      

       360       370       380       390    
pF1KB7 EEEEEEEEEATKGKEMDCLKNGLGAERHLIPNGQHGH
       :::.                                 
CCDS88 EEEDVTTCTKSPCDSSSSNGANRVNGHMGGSYWAEE 
        360       370       380       390   

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CCDS22             MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEATFPQAEDLYLAFPLAFCI
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>>CCDS58734.1 CERS6 gene_id:253782|Hs108|chr2             (392 aa)
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CCDS58             MAGILAWFWNERFWLPHNVTWADLKNTEEATFPQAEDLYLAFPLAFCI
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CCDS58 FMVRLIFERFVAKPCAIALNIQANGPQIAPPNAILEKVFTAITKHPDEKRLEGLSKQLDW
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>>CCDS61120.1 CERS5 gene_id:91012|Hs108|chr12             (334 aa)
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Smith-Waterman score: 895; 44.3% identity (72.3% similar) in 296 aa overlap (68-361:7-302)

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CCDS61                         MMKPRPKRFIAKPCALCIGIEDSGPYQAQPNAILEK
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CCDS61 FCYGIRFLWSSPWFWDIRQCWHNYPFQPLSSGLYHYYIMELAFYWSLMFSQFTDIKRKDF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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