Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9177
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9177, 1138 aa
1>>>pF1KB9177 1138 - 1138 aa - 1138 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7953+/-0.00143; mu= -8.7515+/- 0.085
mean_var=525.6664+/-110.788, 0's: 0 Z-trim(111.4): 309 B-trim: 160 in 1/52
Lambda= 0.055940
statistics sampled from 12031 (12345) to 12031 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.379), width: 16
Scan time: 5.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS482.1 TIE1 gene_id:7075|Hs108|chr1 (1138) 7895 653.7 6.9e-187
CCDS78389.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 ( 976) 1949 173.8 1.8e-42
CCDS75825.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1081) 1949 173.8 1.9e-42
CCDS6519.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1124) 1949 173.8 2e-42
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 852 85.1 6.4e-16
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 852 85.1 7e-16
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 852 85.1 7e-16
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 850 84.9 7.4e-16
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 850 84.9 7.4e-16
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 850 85.0 7.9e-16
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 850 85.0 8e-16
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 850 85.0 8e-16
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 850 85.0 8e-16
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 850 85.0 8.2e-16
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 830 83.2 2e-15
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 831 83.4 2.1e-15
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 831 83.4 2.2e-15
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 830 83.3 2.2e-15
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 830 83.3 2.2e-15
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 830 83.3 2.2e-15
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 830 83.3 2.3e-15
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 831 83.4 2.3e-15
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 819) 830 83.4 2.4e-15
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 821) 830 83.4 2.4e-15
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 822) 830 83.4 2.4e-15
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 827 83.0 2.5e-15
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 707) 827 83.1 2.6e-15
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 769) 827 83.1 2.8e-15
CCDS12574.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 885) 781 79.5 4e-14
CCDS81866.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 845) 772 78.7 6.4e-14
CCDS10080.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 890) 772 78.7 6.6e-14
CCDS12575.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 894) 748 76.8 2.5e-13
CCDS62677.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 626) 737 75.7 3.7e-13
CCDS2094.1 MERTK gene_id:10461|Hs108|chr2 ( 999) 716 74.3 1.6e-12
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 653 69.1 4.9e-11
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 653 69.1 4.9e-11
CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347) 665 70.6 5e-11
CCDS53525.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1072) 649 68.9 7.3e-11
CCDS7200.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1114) 649 68.9 7.4e-11
>>CCDS482.1 TIE1 gene_id:7075|Hs108|chr1 (1138 aa)
initn: 7895 init1: 7895 opt: 7895 Z-score: 3468.7 bits: 653.7 E(32554): 6.9e-187
Smith-Waterman score: 7895; 100.0% identity (100.0% similar) in 1138 aa overlap (1-1138:1-1138)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MVWRVPPFLLPILFLASHVGAAVDLTLLANLRLTDPQRFFLTCVSGEAGAGRGSDAWGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MVWRVPPFLLPILFLASHVGAAVDLTLLANLRLTDPQRFFLTCVSGEAGAGRGSDAWGPP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 LLLEKDDRIVRTPPGPPLRLARNGSHQVTLRGFSKPSDLVGVFSCVGGAGARRTRVIYVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LLLEKDDRIVRTPPGPPLRLARNGSHQVTLRGFSKPSDLVGVFSCVGGAGARRTRVIYVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 NSPGAHLLPDKVTHTVNKGDTAVLSARVHKEKQTDVIWKSNGSYFYTLDWHEAQDGRFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NSPGAHLLPDKVTHTVNKGDTAVLSARVHKEKQTDVIWKSNGSYFYTLDWHEAQDGRFLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 QLPNVQPPSSGIYSATYLEASPLGSAFFRLIVRGCGAGRWGPGCTKECPGCLHGGVCHDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QLPNVQPPSSGIYSATYLEASPLGSAFFRLIVRGCGAGRWGPGCTKECPGCLHGGVCHDH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 DGECVCPPGFTGTRCEQACREGRFGQSCQEQCPGISGCRGLTFCLPDPYGCSCGSGWRGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DGECVCPPGFTGTRCEQACREGRFGQSCQEQCPGISGCRGLTFCLPDPYGCSCGSGWRGS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 QCQEACAPGHFGADCRLQCQCQNGGTCDRFSGCVCPSGWHGVHCEKSDRIPQILNMASEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QCQEACAPGHFGADCRLQCQCQNGGTCDRFSGCVCPSGWHGVHCEKSDRIPQILNMASEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 EFNLETMPRINCAAAGNPFPVRGSIELRKPDGTVLLSTKAIVEPEKTTAEFEVPRLVLAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EFNLETMPRINCAAAGNPFPVRGSIELRKPDGTVLLSTKAIVEPEKTTAEFEVPRLVLAD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 SGFWECRVSTSGGQDSRRFKVNVKVPPVPLAAPRLLTKQSRQLVVSPLVSFSGDGPISTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SGFWECRVSTSGGQDSRRFKVNVKVPPVPLAAPRLLTKQSRQLVVSPLVSFSGDGPISTV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 RLHYRPQDSTMDWSTIVVDPSENVTLMNLRPKTGYSVRVQLSRPGEGGEGAWGPPTLMTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RLHYRPQDSTMDWSTIVVDPSENVTLMNLRPKTGYSVRVQLSRPGEGGEGAWGPPTLMTT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 DCPEPLLQPWLEGWHVEGTDRLRVSWSLPLVPGPLVGDGFLLRLWDGTRGQERRENVSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DCPEPLLQPWLEGWHVEGTDRLRVSWSLPLVPGPLVGDGFLLRLWDGTRGQERRENVSSP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 QARTALLTGLTPGTHYQLDVQLYHCTLLGPASPPAHVLLPPSGPPAPRHLHAQALSDSEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QARTALLTGLTPGTHYQLDVQLYHCTLLGPASPPAHVLLPPSGPPAPRHLHAQALSDSEI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 QLTWKHPEALPGPISKYVVEVQVAGGAGDPLWIDVDRPEETSTIIRGLNASTRYLFRMRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QLTWKHPEALPGPISKYVVEVQVAGGAGDPLWIDVDRPEETSTIIRGLNASTRYLFRMRA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB9 SIQGLGDWSNTVEESTLGNGLQAEGPVQESRAAEEGLDQQLILAVVGSVSATCLTILAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SIQGLGDWSNTVEESTLGNGLQAEGPVQESRAAEEGLDQQLILAVVGSVSATCLTILAAL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB9 LTLVCIRRSCLHRRRTFTYQSGSGEETILQFSSGTLTLTRRPKLQPEPLSYPVLEWEDIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LTLVCIRRSCLHRRRTFTYQSGSGEETILQFSSGTLTLTRRPKLQPEPLSYPVLEWEDIT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB9 FEDLIGEGNFGQVIRAMIKKDGLKMNAAIKMLKEYASENDHRDFAGELEVLCKLGHHPNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FEDLIGEGNFGQVIRAMIKKDGLKMNAAIKMLKEYASENDHRDFAGELEVLCKLGHHPNI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB9 INLLGACKNRGYLYIAIEYAPYGNLLDFLRKSRVLETDPAFAREHGTASTLSSRQLLRFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 INLLGACKNRGYLYIAIEYAPYGNLLDFLRKSRVLETDPAFAREHGTASTLSSRQLLRFA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB9 SDAANGMQYLSEKQFIHRDLAARNVLVGENLASKIADFGLSRGEEVYVKKTMGRLPVRWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SDAANGMQYLSEKQFIHRDLAARNVLVGENLASKIADFGLSRGEEVYVKKTMGRLPVRWM
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB9 AIESLNYSVYTTKSDVWSFGVLLWEIVSLGGTPYCGMTCAELYEKLPQGYRMEQPRNCDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AIESLNYSVYTTKSDVWSFGVLLWEIVSLGGTPYCGMTCAELYEKLPQGYRMEQPRNCDD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB9 EVYELMRQCWRDRPYERPPFAQIALQLGRMLEARKAYVNMSLFENFTYAGIDATAEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EVYELMRQCWRDRPYERPPFAQIALQLGRMLEARKAYVNMSLFENFTYAGIDATAEEA
1090 1100 1110 1120 1130
>>CCDS78389.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (976 aa)
initn: 2804 init1: 1843 opt: 1949 Z-score: 876.0 bits: 173.8 E(32554): 1.8e-42
Smith-Waterman score: 2951; 47.7% identity (70.1% similar) in 1022 aa overlap (125-1138:18-975)
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 KPSDLVGVFSCVGGAGARRTRVIYVHNSPGAHLLPDKVTHTVNKGDTAVLSARVHKEKQT
: .:: .: ::.:::.. .: . :.
CCDS78 MDSLASLVLCGVSLLLSASFLPATLTMTVDKGDNVNISFKKVLIKEE
10 20 30 40
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 DVIWKSNGSYFYTLDWHEAQDGRFLLQLPNVQPPSSGIYSATYLEASPLGSAFFRLIVRG
:.. .:::..... ::. : . ..::..:: ..:.::: :. .. . ::: :::::
CCDS78 DAVIYKNGSFIHSVPRHEVPDI-LEVHLPHAQPQDAGVYSARYIGGNLFTSAFTRLIVRR
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220 230 240 250 260 270
pF1KB9 CGAGRWGPGCTKECPGCLHGGVCHDHDGECVCPPGFTGTRCEQACREGRFGQSCQEQCPG
: : .::: :.. : .:...::::. :::.::::: : ::.::. ::..:.:.: :
CCDS78 CEAQKWGPECNHLCTACMNNGVCHEDTGECICPPGFMGRTCEKACELHTFGRTCKERCSG
110 120 130 140 150 160
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 ISGCRGLTFCLPDPYGCSCGSGWRGSQCQEACAPGHFGADCRLQCQCQNGGTCDRFSGCV
::.. .:::::::::::..::.: ::.:. .: :..
CCDS78 QEGCKSYVFCLPDPYGCSCATGWKGLQCNEG-----------IQ----------RMT---
170 180 190 200
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 CPSGWHGVHCEKSDRIPQILNMASELEFNLETMPRINCAAAGNPFPVRGSIELRKPDGTV
:.:... ...: : . : : :.: :.:. . : ::::::
CCDS78 ----------------PKIVDLPDHIEVNSGKFNPI-CKASGWPLPTNEEMTLVKPDGTV
210 220 230 240
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 LLSTKAIVEPEKTTAEFEVPRLVLADSGFWECRVSTSGGQDSRRFKVNVKVPPVPLAAPR
: . ..: : . :.. ::: : : :.: .:. . :...::: : :: ::
CCDS78 LHPKDFNHTDHFSVAIFTIHRILPPDSGVWVCSVNTVAGMVEKPFNISVKVLPKPLNAPN
250 260 270 280 290 300
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 LL-TKQSRQLVVSPLVSFSGDGPISTVRLHYRPQDSTMDWSTIVVDPSENVTLMNLRPKT
.. : .. .. . :::::.. .: :.: . :. : : .: ::: :.:.:
CCDS78 VIDTGHNFAVINISSEPYFGDGPIKSKKLLYKPVNHYEAWQHIQVT-NEIVTLNYLEPRT
310 320 330 340 350 360
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 GYSVRVQLSRPGEGGEGAWGPPTLMTTDCPEPLLQPWLEGWHV--EGTDRLRVSWSLPLV
: . ::: : :::::: :: .:: . : .: .. .. : ..:. :.
CCDS78 EYELCVQLVRRGEGGEGHPGPVRRFTT---ASIGLPPPRGLNLLPKSQTTLNLTWQ-PIF
370 380 390 400 410 420
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 PGPLVGDGFLLRLWDGTRGQERRENVSSPQARTA-LLTGLTPGTHYQLDVQLYHCTLLGP
:. : : ... . . ..:.. : :. ::..: : .: . ... . :
CCDS78 PSSE--DDFYVEVERRSVQKSDQQNIKVPGNLTSVLLNNLHPREQYVVRARV-NTKAQGE
430 440 450 460 470
640 650 660 670 680
pF1KB9 ASPPAHV-LLPPSGPPAPRHLHAQALSDSEIQLTWKHPEALPG-PISKYVVEVQVAGGAG
: . : :: :.... . .. : ..: : : ::. ... .: :
CCDS78 WSEDLTAWTLSDILPPQPENIKISNITHSSAVISWT---ILDGYSISSITIRYKVQGKNE
480 490 500 510 520 530
690 700 710 720 730 740
pF1KB9 DPLWIDVDRPEETSTI--IRGLNASTRYLFRMRASIQGLGDWSNTVEESTLGNGLQAEGP
: .:: . : : ..::. : : . : ...:. :: . : . ....:
CCDS78 DQH-VDVKIKNATITQYQLKGLEPETAYQVDIFAE-NNIGS-SNPAFSHELVTLPESQAP
540 550 560 570 580 590
750 760 770 780 790 800
pF1KB9 VQESRAAEEGLDQQLILAVVGSVSATCLTILAALLTLVCIRRSCLHRRRTFTYQSGSGEE
:. : ..:..:..::.. ::::.: :.: .. ..:. ..:: . ..:. ::
CCDS78 ------ADLGGGKMLLIAILGSAGMTCLTVLLAFLIILQLKRANVQRRMAQAFQNR--EE
600 610 620 630 640
810 820 830 840 850 860
pF1KB9 TILQFSSGTLTLTRRPKLQPEPLSYPVLEWEDITFEDLIGEGNFGQVIRAMIKKDGLKMN
.::.::::.:.:. : .:.: ::::.:.:: :.:.:::::::::..: ::::::.:.
CCDS78 PAVQFNSGTLALNRKVKNNPDPTIYPVLDWNDIKFQDVIGEGNFGQVLKARIKKDGLRMD
650 660 670 680 690 700
870 880 890 900 910 920
pF1KB9 AAIKMLKEYASENDHRDFAGELEVLCKLGHHPNIINLLGACKNRGYLYIAIEYAPYGNLL
:::: .:::::..::::::::::::::::::::::::::::..:::::.::::::.::::
CCDS78 AAIKRMKEYASKDDHRDFAGELEVLCKLGHHPNIINLLGACEHRGYLYLAIEYAPHGNLL
710 720 730 740 750 760
930 940 950 960 970 980
pF1KB9 DFLRKSRVLETDPAFAREHGTASTLSSRQLLRFASDAANGMQYLSEKQFIHRDLAARNVL
:::::::::::::::: ..:::::::.:::.::.:.: ::.:::.::::::::::::.:
CCDS78 DFLRKSRVLETDPAFAIANSTASTLSSQQLLHFAADVARGMDYLSQKQFIHRDLAARNIL
770 780 790 800 810 820
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB9 VGENLASKIADFGLSRGEEVYVKKTMGRLPVRWMAIESLNYSVYTTKSDVWSFGVLLWEI
:::: ..::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::
CCDS78 VGENYVAKIADFGLSRGQEVYVKKTMGRLPVRWMAIESLNYSVYTTNSDVWSYGVLLWEI
830 840 850 860 870 880
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KB9 VSLGGTPYCGMTCAELYEKLPQGYRMEQPRNCDDEVYELMRQCWRDRPYERPPFAQIALQ
:::::::::::::::::::::::::.:.: :::::::.:::::::..::::: :::: ..
CCDS78 VSLGGTPYCGMTCAELYEKLPQGYRLEKPLNCDDEVYDLMRQCWREKPYERPSFAQILVS
890 900 910 920 930 940
1110 1120 1130
pF1KB9 LGRMLEARKAYVNMSLFENFTYAGIDATAEEA
:.:::: ::.::: .:.:.::::::: .::::
CCDS78 LNRMLEERKTYVNTTLYEKFTYAGIDCSAEEAA
950 960 970
>>CCDS75825.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1081 aa)
initn: 2804 init1: 1843 opt: 1949 Z-score: 875.5 bits: 173.8 E(32554): 1.9e-42
Smith-Waterman score: 3025; 45.0% identity (68.4% similar) in 1140 aa overlap (13-1138:14-1080)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MVWRVPPFLLPILFLASHVGAAVDLTLLANLRLTDPQRFFLTCVSGEAGAGRGSDAWGP
:.:.. : .:.:: :. .: :.. . :::... .: :
CCDS75 MDSLASLVLCGVSLLLSGTVEGAMDLILINSLPLVSDAETSLTCIAS---------GWRP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
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:. . .: . . . ::... :. ...:. . : : . :.. : : . ..
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:. .. : .:: .: ::.:::.. .: . :. :.. .:::..... ::.
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..::.: ::.:. .: :.. :.:
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... ...: : . : : :.: :.:. . : ::::::: . ..: : .
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1130
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CCDS75 FTYAGIDCSAEEAA
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pF1KB9 SL-FENFTYAGIDATAEEA
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CCDS33 SAPFEQYSPGGQDTPSSSSSGDDSVFAHDLLPPAPPSSGGSRT
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CCDS33 PPEEQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVH
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pF1KB9 GEEVYVKKTMGRLPVRWMAIESLNYSVYTTKSDVWSFGVLLWEIVSLGGTPYCGMTCAEL
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CCDS33 NLDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGIPVEEL
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pF1KB9 SL-FENFTYAGIDATAEEA
: ::... .: :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]