Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7019
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7019, 751 aa
1>>>pF1KB7019 751 - 751 aa - 751 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2981+/-0.000457; mu= 14.6420+/- 0.028
mean_var=89.6150+/-17.379, 0's: 0 Z-trim(110.4): 203 B-trim: 458 in 2/54
Lambda= 0.135483
statistics sampled from 18473 (18706) to 18473 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.572), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 10.960
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006370 (OMIM: 602645) semaphorin-3C precursor [ ( 751) 5112 1010.3 0
XP_005250170 (OMIM: 602645) PREDICTED: semaphorin- ( 693) 4726 934.8 0
XP_005265439 (OMIM: 601124) PREDICTED: semaphorin- ( 754) 2862 570.5 8.7e-162
NP_001305729 (OMIM: 601124) semaphorin-3F isoform ( 754) 2862 570.5 8.7e-162
NP_001305727 (OMIM: 601124) semaphorin-3F isoform ( 686) 2734 545.5 2.7e-154
XP_005250168 (OMIM: 603961,614897) PREDICTED: sema ( 771) 2396 479.4 2.3e-134
XP_016867162 (OMIM: 603961,614897) PREDICTED: sema ( 771) 2396 479.4 2.3e-134
XP_006715902 (OMIM: 603961,614897) PREDICTED: sema ( 771) 2396 479.4 2.3e-134
XP_005250167 (OMIM: 603961,614897) PREDICTED: sema ( 771) 2396 479.4 2.3e-134
XP_011514036 (OMIM: 603961,614897) PREDICTED: sema ( 771) 2396 479.4 2.3e-134
NP_006071 (OMIM: 603961,614897) semaphorin-3A prec ( 771) 2396 479.4 2.3e-134
NP_004177 (OMIM: 601124) semaphorin-3F isoform 1 p ( 785) 2358 472.0 4.1e-132
XP_011532300 (OMIM: 601124) PREDICTED: semaphorin- ( 785) 2358 472.0 4.1e-132
XP_005265438 (OMIM: 601124) PREDICTED: semaphorin- ( 785) 2358 472.0 4.1e-132
NP_689967 (OMIM: 609907) semaphorin-3D precursor [ ( 777) 2348 470.1 1.6e-131
XP_016867362 (OMIM: 609907) PREDICTED: semaphorin- ( 777) 2348 470.1 1.6e-131
XP_011514262 (OMIM: 609907) PREDICTED: semaphorin- ( 777) 2348 470.1 1.6e-131
XP_006713352 (OMIM: 601124) PREDICTED: semaphorin- ( 588) 2255 451.8 3.7e-126
NP_036563 (OMIM: 214800,608166) semaphorin-3E isof ( 775) 2217 444.5 8e-124
NP_001276989 (OMIM: 601281) semaphorin-3B isoform ( 749) 2208 442.7 2.6e-123
NP_004627 (OMIM: 601281) semaphorin-3B isoform 1 p ( 749) 2208 442.7 2.6e-123
NP_001276990 (OMIM: 601281) semaphorin-3B isoform ( 754) 2192 439.6 2.3e-122
NP_001171600 (OMIM: 214800,608166) semaphorin-3E i ( 715) 2191 439.4 2.5e-122
NP_001005914 (OMIM: 601281) semaphorin-3B isoform ( 748) 2191 439.4 2.6e-122
XP_011514263 (OMIM: 609907) PREDICTED: semaphorin- ( 583) 1889 380.3 1.2e-104
XP_011532302 (OMIM: 601124) PREDICTED: semaphorin- ( 512) 1348 274.5 7.6e-73
XP_006713353 (OMIM: 601124) PREDICTED: semaphorin- ( 484) 1312 267.5 9.5e-71
NP_001276991 (OMIM: 601281) semaphorin-3B isoform ( 406) 1169 239.5 2.1e-62
NP_001276992 (OMIM: 601281) semaphorin-3B isoform ( 406) 1169 239.5 2.1e-62
NP_064595 (OMIM: 617029) semaphorin-4B isoform 1 p ( 837) 1152 236.3 3.9e-61
NP_945119 (OMIM: 617029) semaphorin-4B isoform 1 p ( 837) 1152 236.3 3.9e-61
NP_001310960 (OMIM: 617029) semaphorin-4B isoform ( 890) 1152 236.3 4.1e-61
NP_001135759 (OMIM: 601866) semaphorin-4D isoform ( 738) 1132 232.4 5.3e-60
XP_011516435 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4 6e-60
XP_011516429 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4 6e-60
XP_011516436 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4 6e-60
XP_016869682 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4 6e-60
NP_006369 (OMIM: 601866) semaphorin-4D isoform 1 p ( 862) 1132 232.4 6e-60
XP_005251711 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4 6e-60
XP_011516426 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4 6e-60
XP_011516430 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4 6e-60
XP_016869686 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4 6e-60
XP_011516427 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4 6e-60
XP_016869687 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4 6e-60
XP_011516432 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4 6e-60
XP_011516425 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4 6e-60
XP_011516431 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4 6e-60
XP_016869683 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4 6e-60
XP_016869685 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4 6e-60
XP_011516433 (OMIM: 601866) PREDICTED: semaphorin- ( 862) 1132 232.4 6e-60
>>NP_006370 (OMIM: 602645) semaphorin-3C precursor [Homo (751 aa)
initn: 5112 init1: 5112 opt: 5112 Z-score: 5402.4 bits: 1010.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5112; 100.0% identity (100.0% similar) in 751 aa overlap (1-751:1-751)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAFRTICVLVGVFICSICVKGSSQPQARVYLTFDELRETKTSEYFSLSHHPLDYRILLMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MAFRTICVLVGVFICSICVKGSSQPQARVYLTFDELRETKTSEYFSLSHHPLDYRILLMD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALSVFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVRVIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALSVFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVRVIQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 TFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMIDSKCESGKGRCSFNPNVNTVSVMIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMIDSKCESGKGRCSFNPNVNTVSVMIN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 EELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAVRTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPNDAKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAVRTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPNDAKV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 YFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPNDTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDEDGPET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 YFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPNDTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDEDGPET
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 HFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTSSSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHKEGPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 HFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTSSSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHKEGPN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 HQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMRTTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHKRPLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 HQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMRTTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHKRPLI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 VRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLFLGTDRGTVQKVVVLPTNNSVSGELILEELEVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLFLGTDRGTVQKVVVLPTNNSVSGELILEELEVF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 KNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEGVSQVSLHRCHIYGTACADCCLARDPYCAWDGHSCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEGVSQVSLHRCHIYGTACADCCLARDPYCAWDGHSCS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 RFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCRGFNLKAYRNAAEIVQYGVKNNTTFLECAPKSPQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCRGFNLKAYRNAAEIVQYGVKNNTTFLECAPKSPQAS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 IKWLLQKDKDRRKEVKLNERIIATSQGLLIRSVQGSDQGLYHCIATENSFKQTIAKINFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IKWLLQKDKDRRKEVKLNERIIATSQGLLIRSVQGSDQGLYHCIATENSFKQTIAKINFK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 VLDSEMVAVVTDKWSPWTWASSVRALPFHPKDIMGAFSHSEMQMINQYCKDTRQQHQQGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VLDSEMVAVVTDKWSPWTWASSVRALPFHPKDIMGAFSHSEMQMINQYCKDTRQQHQQGD
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KB7 ESQKMRGDYGKLKALINSRKSRNRRNQLPES
:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ESQKMRGDYGKLKALINSRKSRNRRNQLPES
730 740 750
>>XP_005250170 (OMIM: 602645) PREDICTED: semaphorin-3C i (693 aa)
initn: 4726 init1: 4726 opt: 4726 Z-score: 4995.2 bits: 934.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4726; 100.0% identity (100.0% similar) in 693 aa overlap (59-751:1-693)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 VYLTFDELRETKTSEYFSLSHHPLDYRILLMDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALS
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALS
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 VFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVRVIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVRVIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRS
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 EDQVFMIDSKCESGKGRCSFNPNVNTVSVMINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EDQVFMIDSKCESGKGRCSFNPNVNTVSVMINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAV
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 RTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPNDAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPNDAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPN
160 170 180 190 200 210
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pF1KB7 DTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDEDGPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDEDGPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTS
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 SSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHKEGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHKEGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMR
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 TTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHKRPLIVRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHKRPLIVRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLF
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 LGTDRGTVQKVVVLPTNNSVSGELILEELEVFKNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEGVSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LGTDRGTVQKVVVLPTNNSVSGELILEELEVFKNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEGVSQ
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 VSLHRCHIYGTACADCCLARDPYCAWDGHSCSRFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCRGFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSLHRCHIYGTACADCCLARDPYCAWDGHSCSRFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCRGFN
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KB7 LKAYRNAAEIVQYGVKNNTTFLECAPKSPQASIKWLLQKDKDRRKEVKLNERIIATSQGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LKAYRNAAEIVQYGVKNNTTFLECAPKSPQASIKWLLQKDKDRRKEVKLNERIIATSQGL
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KB7 LIRSVQGSDQGLYHCIATENSFKQTIAKINFKVLDSEMVAVVTDKWSPWTWASSVRALPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LIRSVQGSDQGLYHCIATENSFKQTIAKINFKVLDSEMVAVVTDKWSPWTWASSVRALPF
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KB7 HPKDIMGAFSHSEMQMINQYCKDTRQQHQQGDESQKMRGDYGKLKALINSRKSRNRRNQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HPKDIMGAFSHSEMQMINQYCKDTRQQHQQGDESQKMRGDYGKLKALINSRKSRNRRNQL
640 650 660 670 680 690
750
pF1KB7 PES
:::
XP_005 PES
>>XP_005265439 (OMIM: 601124) PREDICTED: semaphorin-3F i (754 aa)
initn: 2174 init1: 2174 opt: 2862 Z-score: 3025.6 bits: 570.5 E(85289): 8.7e-162
Smith-Waterman score: 2862; 54.7% identity (82.2% similar) in 730 aa overlap (28-751:31-754)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAFRTICVLVGVFICSICVKGSSQPQARVYLTFDELRETKTSEYFSLSHHPLDYRIL
:: :.: ::. : :...:.. . :::::
XP_005 MLVAGLLLWASLLTGAWPSFPTQDHLPATPRVRLSFKELKATGTAHFFNFLLNTTDYRIL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LMDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALSVFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVR
: :::.::.::::::..:::....:..: : . : :: ..::: ..::: . ::::::
XP_005 LKDEDHDRMYVGSKDYVLSLDLHDINREPLIIHWAASPQRIEECVLSGKDVNGECGNFVR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 VIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMIDS-KCESGKGRCSFNPNVNTVS
.:: .:::::::::.::..:.:::.:::::..: .:... . :::::.: ..:...:.:
XP_005 LIQPWNRTHLYVCGTGAYNPMCTYVNRGRRAQDYIFYLEPERLESGKGKCPYDPKLDTAS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VMINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAVRTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPN
..:::::..:.:::::::::::::.: :..:.::::.::.::..: :. :..:::... :
XP_005 ALINEELYAGVYIDFMGTDAAIFRTLGKQTAMRTDQYNSRWLNDPSFIHAELIPDSAERN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 DAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPNDTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDED
: :.::::.:. .. .: ... :.::: :: :: :::::.::::::::::: ::
XP_005 DDKLYFFFRERSAEAPQSPA-VYARIGRICLNDDGGHCCLVNKWSTFLKARLVCSVPGED
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTSSSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHK
: :::::::.:::. .:.. :. ..:..::.:.:::.::::::: ..::. :::::::::
XP_005 GIETHFDELQDVFVQQTQDVRNPVIYAVFTSSGSVFRGSAVCVYSMADIRMVFNGPFAHK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 EGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMRTTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHK
::::.: . ..:..:::::::::::.:::.:..::..::.:..:.:.:::::...::...
XP_005 EGPNYQWMPFSGKMPYPRPGTCPGGTFTPSMKSTKDYPDEVINFMRSHPLMYQAVYPLQR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 RPLIVRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLFLGTDRGTVQKVVVLPTNNSVSGELILEE
:::.:: :. :. : ::::.:.::::::.::::::::::::::.::: ... ::.:::
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480 490 500 510 520 530
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.::::. ::. :: ::::.:::::.: ::...:::::. ::.:::::::::::::::::
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..:::. ..::::::::::::::. :::::: .: .::.: ::::: ....:::: :.:
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:::..:::.:.: :::.:.. ..:.. : ::::.:..: ::.::: : ::::.::....
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.....:: . : .. . : . .. : : : ... ... :. .:.:::.
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.: : . . ...: ::::.. :..
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720 730 740 750
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: :::.::.::::::..:::....:..: : . : :: ..::: ..::: . ::::::
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pF1KB7 LEVFKNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEGVSQVSLHRCHIYGTACADCCLARDPYCAWDG
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pF1KB7 HSCSRFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCRGFNLKAYRNAAEIVQYGVKNNTTFLECAPKS
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pF1KB7 PQASIKWLLQKDK-DRRKEVKLNERIIATSQGLLIRSVQGSDQGLYHCIATENSFKQTIA
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pF1KB7 KINFKVLDSEMVAVVTDKWSPWTWASSVR--ALPFHP--KDIMGAFSHSEMQMINQYCKD
.....:: . : .. . : . .. : : : ... ... :. .:.:::.
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pF1KB7 TRQQHQQGDESQKMRGDYGKLKALINSRKSRNRRNQLPES
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NP_001 -YWRHV--PPSPREAPGAPRSPEPQDQKKPRNRRHHPPDT
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pF1KB7 SAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHKEGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMRTTKEFP
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pF1KB7 AAEIVQYGVKNNTTFLECAPKSPQASIKWLLQKDK-DRRKEVKLNERIIATSQGLLIRSV
:.: ::::: ....:::: :.::::..:::.:.: :::.:.. ..:.. : ::::.:..
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: ::.::: : ::::.::.........:: . :: . . : . .. : : :
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pF1KB7 -KDIMGAFSHSEMQMINQYCKDTRQQHQQGDESQKMRGDYGKLKALINSRKSRNRRNQLP
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750
pF1KB7 ES
..
NP_001 DT
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pF1KB7 LMDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALSVFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVR
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pF1KB7 VIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMID-SKCESGKGRCSFNPNVNTVS
:....:.::::.::.::: :.:::.. :.. ::..: .. :. :.:.:. ..:.. :.:
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pF1KB7 VMINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAVRTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPN
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pF1KB7 DAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPNDTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDED
: ::::::.:. :...: : :. :..:: :: :: :::::::::::::::.::: .
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pF1KB7 GPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTSSSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHK
: .::::::.::::.. .:.. .:::.:::::..:::::::.: .::.. :: ::.::.
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pF1KB7 EGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMRTTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHK
.:::.: . ::::.:::::::::. .: .. .::..::::.:: :.:: ::: ..:...
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pF1KB7 RPLIVRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLFLGTDRGTVQKVVVLPTNNSVS-GELILE
::.... ..:..:.:.::::.: ::.: :.:.::: ::: ::: .: .. . :..::
XP_005 RPIVIKTDVNYQFTQIVVDRVDAEDGQYDVMFIGTDVGTVLKVVSIPKETWYDLEEVLLE
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pF1KB7 ELEVFKNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEGVSQVSLHRCHIYGTACADCCLARDPYCAWD
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XP_005 EMTVFREPTAISAMELSTKQQQLYIGSTAGVAQLPLHRCDIYGKACAECCLARDPYCAWD
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pF1KB7 GHSCSRFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCRGFNLKAYRNAA--EIVQYGVKNNTTFLECA
: .:::..::.:::.::::.:.:.:::.: .. ... . : . :::.:..:::::.
XP_005 GSACSRYFPTAKRRTRRQDIRNGDPLTHCSDLHHDNHHGHSPEERIIYGVENSSTFLECS
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pF1KB7 PKSPQASIKWLLQK-DKDRRKEVKLNERIIATSQGLLIRSVQGSDQGLYHCIATENSFKQ
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XP_005 PKSQRALVYWQFQRRNEERKEEIRVDDHIIRTDQGLLLRSLQQKDSGNYLCHAVEHGFIQ
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pF1KB7 TIAKINFKVLDSEMVAVVT----DKWSPWTWASSVRALPFHP---KDIMGAFSHSEMQMI
:. :....:.:.: . . : . : : : . .:.: ..: ... .
XP_005 TLLKVTLEVIDTEHLEELLHKDDDGDGSKTKEMSNSMTPSQKVWYRDFMQLINHPNLNTM
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pF1KB7 NQYCKDT--RQQHQQGDESQKMRGDYGKLKALINSRKSRNRRNQLPES
...:... :...:. .. . :. .: : : ...:.::::..
XP_005 DEFCEQVWKRDRKQRRQRPGHTPGNSNKWKHLQENKKGRNRRTHEFERAPRSV
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pF1KB7 MAFRTICVLVGVFICS-ICVKGSSQPQARVYLTFDELRETKTSEYFSLSHHPLDYRIL
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pF1KB7 LMDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALSVFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVR
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XP_016 LLDEERSRLYVGAKDHIFSFDLVNI-KDFQKIVWPVSYTRRDECKWAGKDILKECANFIK
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pF1KB7 VIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMID-SKCESGKGRCSFNPNVNTVS
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XP_016 VLKAYNQTHLYACGTGAFHPICTYIEIGHHPEDNIFKLENSHFENGRGKSPYDPKLLTAS
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pF1KB7 VMINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAVRTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPN
..:. ::.:: :::: : ::::.: ... .::.::.:.::..: :..::.: .. .:.
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pF1KB7 DAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPNDTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDED
: ::::::.:. :...: : :. :..:: :: :: :::::::::::::::.::: .
XP_016 DDKVYFFFRENAIDGEHSGKATHARIGQICKNDFGGHRSLVNKWTTFLKARLICSVPGPN
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pF1KB7 GPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTSSSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHK
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XP_016 GIDTHFDELQDVFLMNFKDPKNPVVYGVFTTSSNIFKGSAVCMYSMSDVRRVFLGPYAHR
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pF1KB7 EGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMRTTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHK
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XP_016 DGPNYQWVPYQGRVPYPRPGTCPSKTFG-GFDSTKDLPDDVITFARSHPAMYNPVFPMNN
360 370 380 390 400 410
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]