Result of FASTA (omim) for
pFN21AB1569
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB1569, 983 aa
1>>>pF1KB1569 983 - 983 aa - 983 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9406+/-0.000802; mu= -3.6453+/- 0.048
mean_var=1034.6064+/-232.065, 0's: 0 Z-trim(113.2): 1106 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.039874
statistics sampled from 21271 (22425) to 21271 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 8.270
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005224 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 ( 983) 6648 400.9 1.7e-110
XP_005264772 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 982) 6629 399.9 3.5e-110
XP_005264773 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 918) 6200 375.1 9.2e-103
NP_001268695 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1016) 4715 289.8 5e-77
NP_872272 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 (1015) 4709 289.4 6.4e-77
NP_004429 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor 4 ( 986) 4325 267.3 2.8e-70
NP_001291465 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 986) 4325 267.3 2.8e-70
NP_001275558 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor ( 993) 4315 266.7 4.2e-70
XP_016865854 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 989) 4272 264.3 2.3e-69
XP_005248726 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 994) 4262 263.7 3.5e-69
XP_005246431 (OMIM: 602188) PREDICTED: ephrin type ( 949) 4235 262.1 1e-68
NP_001291466 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 935) 4204 260.3 3.4e-68
NP_004432 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor 1 ( 984) 3777 235.8 8.6e-61
NP_004434 (OMIM: 601839) ephrin type-B receptor 3 ( 998) 3719 232.5 8.8e-60
NP_872585 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 ( 539) 3667 229.0 5.3e-59
NP_059145 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B rece ( 986) 3370 212.4 9.7e-54
NP_001296122 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B r (1055) 3370 212.4 9.9e-54
XP_006710504 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephr ( 980) 3368 212.3 1e-53
NP_004433 (OMIM: 600997,603688) ephrin type-B rece ( 987) 3368 212.3 1e-53
NP_004431 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor 7 ( 998) 3356 211.6 1.7e-53
NP_004435 (OMIM: 600011) ephrin type-B receptor 4 ( 987) 3167 200.7 3.2e-50
NP_001073917 (OMIM: 600066) ephrin type-A receptor (1130) 3076 195.6 1.3e-48
XP_016863369 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 852) 2697 173.5 4.1e-42
XP_016863367 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 904) 2696 173.5 4.4e-42
NP_005223 (OMIM: 179610) ephrin type-A receptor 1 ( 976) 2680 172.7 8.5e-42
XP_016856023 (OMIM: 116600,176946) PREDICTED: ephr ( 973) 2655 171.2 2.3e-41
NP_004422 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A rece ( 976) 2651 171.0 2.7e-41
XP_016856024 (OMIM: 116600,176946) PREDICTED: ephr ( 965) 2645 170.7 3.4e-41
XP_016863370 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 817) 2575 166.5 5.2e-40
NP_001316019 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A r ( 922) 2575 166.6 5.5e-40
XP_016863368 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 869) 2570 166.3 6.5e-40
XP_005248728 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 610) 2295 150.1 3.2e-35
XP_006713655 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type (1146) 2271 149.3 1.1e-34
XP_016861357 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1016) 2204 145.3 1.5e-33
XP_016861356 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1032) 2204 145.3 1.5e-33
XP_016861355 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1038) 2204 145.3 1.5e-33
XP_005265710 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 874) 2173 143.4 4.9e-33
XP_011530037 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 926) 2173 143.5 5e-33
NP_001305690 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 969) 2173 143.5 5.1e-33
NP_004430 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 (1037) 2173 143.6 5.3e-33
NP_001268694 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1038) 2173 143.6 5.3e-33
XP_016861701 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type (1012) 2168 143.3 6.4e-33
XP_016861700 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type (1018) 2168 143.3 6.4e-33
XP_016861702 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type ( 990) 2148 142.1 1.4e-32
XP_016861699 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type (1104) 2149 142.2 1.4e-32
XP_016861708 (OMIM: 600066) PREDICTED: ephrin type ( 537) 2093 138.4 9.6e-32
NP_001268696 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1004) 2057 136.9 5.3e-31
XP_016867305 (OMIM: 600011) PREDICTED: ephrin type (1005) 2049 136.4 7.3e-31
XP_006710505 (OMIM: 600997,603688) PREDICTED: ephr ( 956) 1968 131.7 1.8e-29
XP_016865855 (OMIM: 602190) PREDICTED: ephrin type ( 442) 1898 127.0 2.1e-28
>>NP_005224 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 isof (983 aa)
initn: 6648 init1: 6648 opt: 6648 Z-score: 2104.9 bits: 400.9 E(85289): 1.7e-110
Smith-Waterman score: 6648; 100.0% identity (100.0% similar) in 983 aa overlap (1-983:1-983)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHGWEEISGVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHGWEEISGVDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB1 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB1 NLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKKGFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKKGFY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB1 LAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVPMDSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVPMDSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPPHSSTQEDG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTGGRKDVTFN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAVNGVSELSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB1 PPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQ
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pF1KB1 ETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDSFSISGESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB1 TYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB1 EKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB1 IQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYT
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pF1KB1 TRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEG
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pF1KB1 YRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSN
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pF1KB1 LLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDDMKKVGVTVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDDMKKVGVTVVG
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KB1 PQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
:::::::::::::::::::::::
NP_005 PQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
970 980
>>XP_005264772 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type-A r (982 aa)
initn: 3335 init1: 3335 opt: 6629 Z-score: 2099.0 bits: 399.9 E(85289): 3.5e-110
Smith-Waterman score: 6629; 99.9% identity (99.9% similar) in 983 aa overlap (1-983:1-982)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHGWEEISGVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHGWEEISGVDE
10 20 30 40 50 60
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pF1KB1 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCKETF
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pF1KB1 NLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKKGFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKKGFY
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pF1KB1 LAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVPMDSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVPMDSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFYKALDGNMKCAKCPPHSSTQEDG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINETSVILDWSWPLDTGGRKDVTFN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTDLLAHTNYTFEIDAVNGVSELSS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
XP_005 PPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQEPEHPNGIILDYEVKYYEK-EQ
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pF1KB1 ETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDSFSISGESS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDSFSISGESS
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pF1KB1 QVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGYKSKHGADEKRLHFGNGHLKLPGLRTYVDPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLIGRFCGYKSKHGADEKRLHFGNGHLKLPGLRTYVDPH
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pF1KB1 TYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYT
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pF1KB1 EKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTV
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pF1KB1 IQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYT
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790 800 810 820 830 840
pF1KB1 TRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEG
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pF1KB1 YRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSN
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KB1 LLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDDMKKVGVTVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDDMKKVGVTVVG
900 910 920 930 940 950
970 980
pF1KB1 PQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
:::::::::::::::::::::::
XP_005 PQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
960 970 980
>>XP_005264773 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type-A r (918 aa)
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_005 LLLDQSNVDITTFRTTVT
910
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10 20 30
pF1KB1 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQ
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:::::::::.: :::::::::.::.::::..: ...:.:. ::::::::::::..::::
NP_001 KFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAADESFTELDLGD
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160 170 180 190 200 210
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:..:::::.:.:::..::::::::::::::.::::::::.:::: .:..::.::::.
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pF1KB1 DSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPPRMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFY
::..:.:: :::::.: ..::.:.::.::::::::::: :.:::::.. ::.:::::.
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:: ..:.:::::: :.:..: .: ::..::: ..:::.::::::::.:::.:::.::
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340 350 360 370 380 390
pF1KB1 TSVILDWSWPLDTGGRKDVTFNIICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTD
:::.:.: : ::::::::.. : ::::. . :: :. .::.:::: :: ::.: ..:
NP_001 TSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSGLKNTSVMMVD
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pF1KB1 LLAHTNYTFEIDAVNGVSELSSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQ
:::::::::::.::::::.:: ::...:..:::::::::: ..:: . ..::::::::
NP_001 LLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKIAKNSISLSWQ
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460 470 480 490 500 510
pF1KB1 EPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYG
::..::::::.::.::.:: .:::::::.... :..: .::: ..::::::::::::::
NP_001 EPDRPNGIILEYEIKYFEK-DQETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQIRARTAAGYG
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520 530 540 550 560 570
pF1KB1 TNSRKFEFETSPDSFSISGESSQVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLI-GRFCGY-KSKHGA
. ::.:::::.: : . :...::. .::.:..:..:::.::: ::. :: ::: :.:.
NP_001 VFSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVLLSGRRCGYSKAKQDP
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580 590 600 610 620 630
pF1KB1 DEKRLHFGNGHLKLPGLRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVC
.:...:: :::.::::.:::.::::::::.:::::::::..:. :.:..:.:::::::::
NP_001 EEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVC
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KB1 SGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVM
:::::::.:.:. ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
NP_001 SGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSKPVM
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700 710 720 730 740 750
pF1KB1 IVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINS
::::::::::::.::.:.:.::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINS
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pF1KB1 NLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::.::
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820 830 840 850 860 870
pF1KB1 VMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVS
:.::::::::::.::::::::.:::::: ::::::::::::::::::.::.::::..::.
NP_001 VVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVN
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pF1KB1 ILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVE
.::::::::.::: ...:. : :::: ..: . ..:..:.::... .. :::
NP_001 MLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENG
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940 950 960 970 980
pF1KB1 YSSCDTIAKISTDDMKKVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
::: :..:... .:....:::.:: ::::..:.. ...: :: ::.
NP_001 YSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMKVQLVNGMVPL
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10 20 30
pF1KB1 MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQ
:: :..: . :. .::::::::::.:..
NP_872 PPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRT---LLASPSNEVNLLDSRTVM
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB1 GELGWISYPSHGWEEISGVDEHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVEL
:.::::..:..:::::. :::.:.::.:::::.::...::::: :.:. ..:..:..::
NP_872 GDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISNEGASRIFIEL
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB1 KFTLRDCNSIPLVLGTCKETFNLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGD
:::::::::.: :::::::::.::.::::..: ...:.:. ::::::::::::..::::
NP_872 KFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAADESFTELDLGD
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB1 RILKLNTEIREVGPVNKKGFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVP-M
:..:::::.:.:::..::::::::::::::.::::::::.:::: .:..::.::::.
NP_872 RVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDTITGA
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220 230 240 250 260 270
pF1KB1 DSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPPRMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFY
::..:.:: :::::.: ..::.:.::.::::::::::: :.:::::.. ::.:::::.
NP_872 DSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNGTCQVCRPGFF
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB1 KALDGNMKCAKCPPHSSTQEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINE
:: ..:.:::::: :.:..: .: ::..::: ..:::.::::::::.:::.:::.::
NP_872 KASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSAPRNAISNVNE
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB1 TSVILDWSWPLDTGGRKDVTFNIICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTD
:::.:.: : ::::::::.. : ::::. . :: :. .::.:::: :: ::.: ..:
NP_872 TSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSGLKNTSVMMVD
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:::::::::::.::::::.:: ::...:..:::::::::: ..:: . ..::::::::
NP_872 LLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKIAKNSISLSWQ
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460 470 480 490 500 510
pF1KB1 EPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYG
::..::::::.::.::.:: .:::::::.... :..: .::: ..::::::::::::::
NP_872 EPDRPNGIILEYEIKYFEK-DQETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQIRARTAAGYG
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520 530 540 550 560 570
pF1KB1 TNSRKFEFETSPDSFSISGESSQVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLI-GRFCGY-KSKHGA
. ::.:::::.: :. :...::. .::.:..:..:::.::: ::. :: ::: :.:.
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pF1KB1 DEKRLHFGNGHLKLPGLRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVC
.:...:: :::.::::.:::.::::::::.:::::::::..:. :.:..:.:::::::::
NP_872 EEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVC
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pF1KB1 SGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVM
:::::::.:.:. ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
NP_872 SGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSKPVM
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pF1KB1 IVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINS
::::::::::::.::.:.:.::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::
NP_872 IVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINS
730 740 750 760 770 780
760 770 780 790 800 810
pF1KB1 NLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::.::
NP_872 NLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWE
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KB1 VMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVS
:.::::::::::.::::::::.:::::: ::::::::::::::::::.::.::::..::.
NP_872 VVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVN
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KB1 ILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVE
.::::::::.::: ...:. : :::: ..: . ..:..:.::... .. :::
NP_872 MLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENG
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980
pF1KB1 YSSCDTIAKISTDDMKKVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
::: :..:... .:....:::.:: ::::..:.. ...: :: ::.
NP_872 YSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMKVQLVNGMVPL
970 980 990 1000 1010
>>NP_004429 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor 4 isof (986 aa)
initn: 4238 init1: 1965 opt: 4325 Z-score: 1382.7 bits: 267.3 E(85289): 2.8e-70
Smith-Waterman score: 4325; 63.6% identity (86.9% similar) in 974 aa overlap (10-975:9-975)
10 20 30 40 50
pF1KB1 MDCQLSILLLLSC--SVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQGELGWISYPSHG-WEEISG
:.:: .. :. :.:::.::::...:::::::. : .: :::.:
NP_004 MAGIFYFALFSCLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASPLEGGWEEVSI
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pF1KB1 VDEHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCK
.::. ::::::::::::. ::::::::.:. :..::..:.:.:::::::::.: :.::::
NP_004 MDEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTCK
60 70 80 90 100 110
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pF1KB1 ETFNLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPVNKK
:::::::.:::.:. .::.::.:::::::::::::.:.::::.:::::::.:::..::
NP_004 ETFNLYYYESDNDKERFIRENQFVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVGPLSKK
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NP_001 IEDDPEAVYTTTGGKIPVRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSN
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pF1KB1 ITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDD
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NP_001 PLGTCSRPISPLLDQNTPDFTTFCSVGEWLQAIKMERYKDNFTAAGYNSLESVARMTIED
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pF1KB1 MKKVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
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NP_001 VMSLGITLVGHQKKIMSSIQTMRAQMLHLHGTGIQV
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pF1KB1 VDEHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVELKFTLRDCNSIPLVLGTCK
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XP_016 LDENYTPIRTYQVCQVMEPNQNNWLRTNWISKGNAQRIFVELKFTLRDCNSLPGVLGTCK
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