Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA1313
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1313, 1101 aa
1>>>pF1KA1313 1101 - 1101 aa - 1101 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3156+/-0.0011; mu= 16.3969+/- 0.066
mean_var=80.5468+/-15.870, 0's: 0 Z-trim(104.0): 192 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.142906
statistics sampled from 7511 (7706) to 7511 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.237), width: 16
Scan time: 4.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43976.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1101) 7206 1496.3 0
CCDS48141.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1100) 7189 1492.8 0
CCDS55462.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1148) 4617 962.5 0
CCDS75193.1 PCDH18 gene_id:54510|Hs108|chr4 (1134) 1997 422.3 3e-117
CCDS34064.1 PCDH18 gene_id:54510|Hs108|chr4 (1135) 1996 422.1 3.4e-117
CCDS4242.1 PCDHAC2 gene_id:56134|Hs108|chr5 (1007) 1838 389.5 2e-107
CCDS75332.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 811) 1685 358.0 5e-98
CCDS54924.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 931) 1685 358.0 5.7e-98
CCDS75349.1 PCDHGC4 gene_id:56098|Hs108|chr5 ( 871) 1684 357.8 6.2e-98
CCDS4262.1 PCDHGC4 gene_id:56098|Hs108|chr5 ( 938) 1684 357.8 6.6e-98
CCDS75331.1 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 851) 1682 357.4 8.1e-98
CCDS58979.2 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 962) 1682 357.4 9e-98
CCDS75345.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 837) 1647 350.1 1.2e-95
CCDS47294.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 935) 1647 350.2 1.3e-95
CCDS75344.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 808) 1646 349.9 1.3e-95
CCDS47293.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 929) 1646 350.0 1.5e-95
CCDS54917.1 PCDHA5 gene_id:56143|Hs108|chr5 ( 936) 1645 349.7 1.7e-95
CCDS54916.1 PCDHA4 gene_id:56144|Hs108|chr5 ( 947) 1636 347.9 6.4e-95
CCDS54919.1 PCDHA8 gene_id:56140|Hs108|chr5 ( 950) 1628 346.2 2e-94
CCDS75343.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 850) 1624 345.4 3.2e-94
CCDS47292.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 936) 1624 345.4 3.5e-94
CCDS47281.1 PCDHA6 gene_id:56142|Hs108|chr5 ( 950) 1623 345.2 4.1e-94
CCDS75346.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 820) 1622 345.0 4.1e-94
CCDS75341.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 828) 1622 345.0 4.2e-94
CCDS58981.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 932) 1622 345.0 4.6e-94
CCDS4260.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 932) 1622 345.0 4.6e-94
CCDS75326.1 PCDHA11 gene_id:56138|Hs108|chr5 ( 810) 1617 344.0 8.4e-94
CCDS47284.1 PCDHA11 gene_id:56138|Hs108|chr5 ( 949) 1617 344.0 9.7e-94
CCDS47290.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 932) 1616 343.8 1.1e-93
CCDS75335.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 818) 1615 343.5 1.1e-93
CCDS54926.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 932) 1615 343.6 1.3e-93
CCDS4240.1 PCDHA13 gene_id:56136|Hs108|chr5 ( 950) 1613 343.2 1.7e-93
CCDS75329.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 829) 1610 342.5 2.3e-93
CCDS47291.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 932) 1610 342.5 2.6e-93
CCDS75350.1 PCDHGC5 gene_id:56097|Hs108|chr5 ( 878) 1608 342.1 3.3e-93
CCDS4263.1 PCDHGC5 gene_id:56097|Hs108|chr5 ( 944) 1608 342.1 3.5e-93
CCDS54918.1 PCDHA7 gene_id:56141|Hs108|chr5 ( 937) 1606 341.7 4.6e-93
CCDS75330.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 810) 1605 341.5 4.6e-93
CCDS54923.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 927) 1605 341.5 5.3e-93
CCDS64269.1 PCDHA2 gene_id:56146|Hs108|chr5 ( 808) 1604 341.3 5.4e-93
CCDS54914.1 PCDHA2 gene_id:56146|Hs108|chr5 ( 948) 1604 341.3 6.2e-93
CCDS47289.1 PCDHGA2 gene_id:56113|Hs108|chr5 ( 932) 1601 340.7 9.3e-93
CCDS75338.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 820) 1600 340.5 9.6e-93
CCDS4257.1 PCDHB15 gene_id:56121|Hs108|chr5 ( 787) 1591 338.6 3.3e-92
CCDS54915.1 PCDHA3 gene_id:56145|Hs108|chr5 ( 950) 1590 338.4 4.6e-92
CCDS75327.1 PCDHA12 gene_id:56137|Hs108|chr5 ( 792) 1583 336.9 1.1e-91
CCDS54922.1 PCDHGA1 gene_id:56114|Hs108|chr5 ( 931) 1583 337.0 1.2e-91
CCDS47285.1 PCDHA12 gene_id:56137|Hs108|chr5 ( 941) 1583 337.0 1.2e-91
CCDS75333.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 813) 1576 335.5 2.9e-91
CCDS54925.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 931) 1576 335.5 3.3e-91
>>CCDS43976.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1101 aa)
initn: 7206 init1: 7206 opt: 7206 Z-score: 8022.8 bits: 1496.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7206; 100.0% identity (100.0% similar) in 1101 aa overlap (1-1101:1-1101)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MESLLLPVLLLLAILWTQAAALINLKYSVEEEQRAGTVIANVAKDAREAGFALDPRQASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MESLLLPVLLLLAILWTQAAALINLKYSVEEEQRAGTVIANVAKDAREAGFALDPRQASA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 FRVVSNSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLEVMSSSMEICVIKVEIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FRVVSNSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLEVMSSSMEICVIKVEIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 DLNDNAPSFPAAQIELEISEAASPGTRIPLDSAYDPDSGSFGVQTYELTPNELFGLEIKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DLNDNAPSFPAAQIELEISEAASPGTRIPLDSAYDPDSGSFGVQTYELTPNELFGLEIKT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RGDGSRFAELVVEKSLDRETQSHYSFRITALDGGDPPRLGTVGLSIKVTDSNDNNPVFSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RGDGSRFAELVVEKSLDRETQSHYSFRITALDGGDPPRLGTVGLSIKVTDSNDNNPVFSE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 STYAVSVPENSPPNTPVIRLNASDPDEGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQIDPHSGLVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 STYAVSVPENSPPNTPVIRLNASDPDEGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQIDPHSGLVTV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNSIPAHCKVTVSVLDTNDNPPVINLLSVNSELVEVSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNSIPAHCKVTVSVLDTNDNPPVINLLSVNSELVEVSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 SAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLGNVPFRLQEYESFSTILVDGRLDREQHDQYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLGNVPFRLQEYESFSTILVDGRLDREQHDQYN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LTIQARDGGVPMLQSAKSFTVLITDENDNHPHFSKPYYQVIVQENNTPGAYLLSVSARDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LTIQARDGGVPMLQSAKSFTVLITDENDNHPHFSKPYYQVIVQENNTPGAYLLSVSARDP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 DLGLNGSVSYQIVPSQVRDMPVFTYVSINPNSGDIYALRSFNHEQTKAFEFKVLAKDGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DLGLNGSVSYQIVPSQVRDMPVFTYVSINPNSGDIYALRSFNHEQTKAFEFKVLAKDGGL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 PSLQSNATVRVIILDVNDNTPVITAPPLINGTAEVYIPRNSGIGYLVTVVKAEDYDEGEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PSLQSNATVRVIILDVNDNTPVITAPPLINGTAEVYIPRNSGIGYLVTVVKAEDYDEGEN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 GRVTYDMTEGDRGFFEIDQVNGEVRTTRTFGESSKSSYELIVVAHDHGKTSLSASALVLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GRVTYDMTEGDRGFFEIDQVNGEVRTTRTFGESSKSSYELIVVAHDHGKTSLSASALVLI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 YLSPALDAQESMGSVNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIFVAIKCKRDNKEIRTYNCRIAEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YLSPALDAQESMGSVNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIFVAIKCKRDNKEIRTYNCRIAEY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SYGHQKKSSKKKKISKNDIRLVPRDVEETDKMNVVSCSSLTSSLNYFDYHQQTLPLGCRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SYGHQKKSSKKKKISKNDIRLVPRDVEETDKMNVVSCSSLTSSLNYFDYHQQTLPLGCRR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 SESTFLNVENQNTRNTSANHIYHHSFNSQGPQQPDLIINGVPLPETENYSFDSNYVNSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SESTFLNVENQNTRNTSANHIYHHSFNSQGPQQPDLIINGVPLPETENYSFDSNYVNSRA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 HLIKSSSTFKDLEGNSLKDSGHEESDQTDSEHDVQRSLYCDTAVNDVLNTSVTSMGSQMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HLIKSSSTFKDLEGNSLKDSGHEESDQTDSEHDVQRSLYCDTAVNDVLNTSVTSMGSQMP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 DHDQNEGFHCREECRILGHSDRCWMPRNPMPIRSKSPEHVRNIIALSIEATAADVEAYDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DHDQNEGFHCREECRILGHSDRCWMPRNPMPIRSKSPEHVRNIIALSIEATAADVEAYDD
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 CGPTKRTFATFGKDVSDHPAEERPTLKGKRTVDVTICSPKVNSVIREAGNGCEAISPVTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CGPTKRTFATFGKDVSDHPAEERPTLKGKRTVDVTICSPKVNSVIREAGNGCEAISPVTS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 PLHLKSSLPTKPSVSYTIALAPPARDLEQYVNNVNNGPTRPSEAEPRGADSEKVMHEVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PLHLKSSLPTKPSVSYTIALAPPARDLEQYVNNVNNGPTRPSEAEPRGADSEKVMHEVSP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100
pF1KA1 ILKEGRNKESPGVKRLKDIVL
:::::::::::::::::::::
CCDS43 ILKEGRNKESPGVKRLKDIVL
1090 1100
>>CCDS48141.1 PCDH19 gene_id:57526|Hs108|chrX (1100 aa)
initn: 5937 init1: 5485 opt: 7189 Z-score: 8003.9 bits: 1492.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7189; 99.9% identity (99.9% similar) in 1101 aa overlap (1-1101:1-1100)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MESLLLPVLLLLAILWTQAAALINLKYSVEEEQRAGTVIANVAKDAREAGFALDPRQASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MESLLLPVLLLLAILWTQAAALINLKYSVEEEQRAGTVIANVAKDAREAGFALDPRQASA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 FRVVSNSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLEVMSSSMEICVIKVEIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FRVVSNSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLEVMSSSMEICVIKVEIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 DLNDNAPSFPAAQIELEISEAASPGTRIPLDSAYDPDSGSFGVQTYELTPNELFGLEIKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DLNDNAPSFPAAQIELEISEAASPGTRIPLDSAYDPDSGSFGVQTYELTPNELFGLEIKT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RGDGSRFAELVVEKSLDRETQSHYSFRITALDGGDPPRLGTVGLSIKVTDSNDNNPVFSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RGDGSRFAELVVEKSLDRETQSHYSFRITALDGGDPPRLGTVGLSIKVTDSNDNNPVFSE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 STYAVSVPENSPPNTPVIRLNASDPDEGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQIDPHSGLVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 STYAVSVPENSPPNTPVIRLNASDPDEGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQIDPHSGLVTV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNSIPAHCKVTVSVLDTNDNPPVINLLSVNSELVEVSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNSIPAHCKVTVSVLDTNDNPPVINLLSVNSELVEVSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 SAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLGNVPFRLQEYESFSTILVDGRLDREQHDQYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLGNVPFRLQEYESFSTILVDGRLDREQHDQYN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LTIQARDGGVPMLQSAKSFTVLITDENDNHPHFSKPYYQVIVQENNTPGAYLLSVSARDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LTIQARDGGVPMLQSAKSFTVLITDENDNHPHFSKPYYQVIVQENNTPGAYLLSVSARDP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 DLGLNGSVSYQIVPSQVRDMPVFTYVSINPNSGDIYALRSFNHEQTKAFEFKVLAKDGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DLGLNGSVSYQIVPSQVRDMPVFTYVSINPNSGDIYALRSFNHEQTKAFEFKVLAKDGGL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA1 PSLQSNATVRVIILDVNDNTPVITAPPLINGTAEVYIPRNSGIGYLVTVVKAEDYDEGEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PSLQSNATVRVIILDVNDNTPVITAPPLINGTAEVYIPRNSGIGYLVTVVKAEDYDEGEN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA1 GRVTYDMTEGDRGFFEIDQVNGEVRTTRTFGESSKSSYELIVVAHDHGKTSLSASALVLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GRVTYDMTEGDRGFFEIDQVNGEVRTTRTFGESSKSSYELIVVAHDHGKTSLSASALVLI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA1 YLSPALDAQESMGSVNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIFVAIKCKRDNKEIRTYNCRIAEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 YLSPALDAQESMGSVNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIFVAIKCKRDNKEIRTYNCRIAEY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA1 SYGHQKKSSKKKKISKNDIRLVPRDVEETDKMNVVSCSSLTSSLNYFDYHQQTLPLGCRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SYGHQKKSSKKKKISKNDIRLVPRDVEETDKMNVVSCSSLTSSLNYFDYHQQTLPLGCRR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA1 SESTFLNVENQNTRNTSANHIYHHSFNSQGPQQPDLIINGVPLPETENYSFDSNYVNSRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SESTFLNVENQNTRNTSANHIYHHSFNSQGPQQPDLIINGVPLPETENYSFDSNYVNSRA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA1 HLIKSSSTFKDLEGNSLKDSGHEESDQTDSEHDVQRSLYCDTAVNDVLNTSVTSMGSQMP
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HLIKSS-TFKDLEGNSLKDSGHEESDQTDSEHDVQRSLYCDTAVNDVLNTSVTSMGSQMP
850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KA1 DHDQNEGFHCREECRILGHSDRCWMPRNPMPIRSKSPEHVRNIIALSIEATAADVEAYDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DHDQNEGFHCREECRILGHSDRCWMPRNPMPIRSKSPEHVRNIIALSIEATAADVEAYDD
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA1 CGPTKRTFATFGKDVSDHPAEERPTLKGKRTVDVTICSPKVNSVIREAGNGCEAISPVTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 CGPTKRTFATFGKDVSDHPAEERPTLKGKRTVDVTICSPKVNSVIREAGNGCEAISPVTS
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA1 PLHLKSSLPTKPSVSYTIALAPPARDLEQYVNNVNNGPTRPSEAEPRGADSEKVMHEVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PLHLKSSLPTKPSVSYTIALAPPARDLEQYVNNVNNGPTRPSEAEPRGADSEKVMHEVSP
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100
pF1KA1 ILKEGRNKESPGVKRLKDIVL
:::::::::::::::::::::
CCDS48 ILKEGRNKESPGVKRLKDIVL
1080 1090 1100
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10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MESLLLPVLLLLAILWTQAAALINLKYSVEEEQRAGTVIANVAKDAREAGFALDPRQASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MESLLLPVLLLLAILWTQAAALINLKYSVEEEQRAGTVIANVAKDAREAGFALDPRQASA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 FRVVSNSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLEVMSSSMEICVIKVEIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FRVVSNSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLEVMSSSMEICVIKVEIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 DLNDNAPSFPAAQIELEISEAASPGTRIPLDSAYDPDSGSFGVQTYELTPNELFGLEIKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DLNDNAPSFPAAQIELEISEAASPGTRIPLDSAYDPDSGSFGVQTYELTPNELFGLEIKT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 RGDGSRFAELVVEKSLDRETQSHYSFRITALDGGDPPRLGTVGLSIKVTDSNDNNPVFSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RGDGSRFAELVVEKSLDRETQSHYSFRITALDGGDPPRLGTVGLSIKVTDSNDNNPVFSE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 STYAVSVPENSPPNTPVIRLNASDPDEGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQIDPHSGLVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 STYAVSVPENSPPNTPVIRLNASDPDEGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQIDPHSGLVTV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNSIPAHCKVTVSVLDTNDNPPVINLLSVNSELVEVSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNSIPAHCKVTVSVLDTNDNPPVINLLSVNSELVEVSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 SAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLGNVPFRLQEYESFSTILVDGRLDREQHDQYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLGNVPFRLQEYESFSTILVDGRLDREQHDQYN
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430 440 450 460 470 480
pF1KA1 LTIQARDGGVPMLQSAKSFTVLITDENDNHPHFSKPYYQVIVQENNTPGAYLLSVSARDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LTIQARDGGVPMLQSAKSFTVLITDENDNHPHFSKPYYQVIVQENNTPGAYLLSVSARDP
430 440 450 460 470 480
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pF1KA1 DLGLNGSVSYQIVPSQVRDMPVFTYVSINPNSGDIYALRSFNHEQTKAFEFKVLAKDGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DLGLNGSVSYQIVPSQVRDMPVFTYVSINPNSGDIYALRSFNHEQTKAFEFKVLAKDGGL
490 500 510 520 530 540
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pF1KA1 PSLQSNATVRVIILDVNDNTPVITAPPLINGTAEVYIPRNSGIGYLVTVVKAEDYDEGEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PSLQSNATVRVIILDVNDNTPVITAPPLINGTAEVYIPRNSGIGYLVTVVKAEDYDEGEN
550 560 570 580 590 600
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pF1KA1 GRVTYDMTEGDRGFFEIDQVNGEVRTTRTFGESSKSSYELIVVAHDHGKTSLSASALVLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GRVTYDMTEGDRGFFEIDQVNGEVRTTRTFGESSKSSYELIVVAHDHGKTSLSASALVLI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KA1 YLSPALDAQESMGSVNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIFVAIKCKRDNKEIRTYNC-----
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YLSPALDAQESMGSVNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIFVAIKCKRDNKEIRTYNCSNCLT
670 680 690 700 710 720
720 730
pF1KA1 ------------------------------------------RIAEYSYGHQKKSSKKKK
::::::::::::::::::
CCDS55 ITCLLGCFIKGQNSKCLHCISVSPISEEQDKKTEEKVSLRGKRIAEYSYGHQKKSSKKKK
730 740 750 760 770 780
740 750 760 770 780 790
pF1KA1 ISKNDIRLVPRDVEETDKMNVVSCSSLTSSLNYFDYHQQTLPLGCRRSESTFLNVENQNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ISKNDIRLVPRDVEETDKMNVVSCSSLTSSLNYFDYHQQTLPLGCRRSESTFLNVENQNT
790 800 810 820 830 840
800 810 820 830 840 850
pF1KA1 RNTSANHIYHHSFNSQGPQQPDLIINGVPLPETENYSFDSNYVNSRAHLIKSSSTFKDLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RNTSANHIYHHSFNSQGPQQPDLIINGVPLPETENYSFDSNYVNSRAHLIKSSSTFKDLE
850 860 870 880 890 900
860 870 880 890 900 910
pF1KA1 GNSLKDSGHEESDQTDSEHDVQRSLYCDTAVNDVLNTSVTSMGSQMPDHDQNEGFHCREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GNSLKDSGHEESDQTDSEHDVQRSLYCDTAVNDVLNTSVTSMGSQMPDHDQNEGFHCREE
910 920 930 940 950 960
920 930 940 950 960 970
pF1KA1 CRILGHSDRCWMPRNPMPIRSKSPEHVRNIIALSIEATAADVEAYDDCGPTKRTFATFGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CRILGHSDRCWMPRNPMPIRSKSPEHVRNIIALSIEATAADVEAYDDCGPTKRTFATFGK
970 980 990 1000 1010 1020
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA1 DVSDHPAEERPTLKGKRTVDVTICSPKVNSVIREAGNGCEAISPVTSPLHLKSSLPTKPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DVSDHPAEERPTLKGKRTVDVTICSPKVNSVIREAGNGCEAISPVTSPLHLKSSLPTKPS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA1 VSYTIALAPPARDLEQYVNNVNNGPTRPSEAEPRGADSEKVMHEVSPILKEGRNKESPGV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VSYTIALAPPARDLEQYVNNVNNGPTRPSEAEPRGADSEKVMHEVSPILKEGRNKESPGV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1100
pF1KA1 KRLKDIVL
CCDS55 KRLKDIVL
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10 20 30 40 50
pF1KA1 MESLLLPVLLLLAILWTQAAALINLKYSVEEEQRAGTVIANVAKDAREAGFALDP
:. :: . ... . :::: . ::::.:.::: ...:. .. . :
CCDS75 MHQMNAKMHFRFVFALLIVSFNHDVLGKNLKYRIYEEQRVGSVIARLSEDVADVLLKLPN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 RQASAFRVVSNSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLEVMS---SSMEI
.. ::... . :. .: ..: . :::. ::... .: : ..:.. ...
CCDS75 PSTVRFRAMQRGNSPLLVVNEDNGEISIGATIDREQLCQKNLNCSIEFDVITLPTEHLQL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 CVIKVEIKDLNDNAPSFPAAQIELEISEAASPGTRIPLDSAYDPDSGSFGVQTYELTPNE
:.::. :.:::.:.: . : .::::.:. :::::::::.::: : ...:: :. :.
CCDS75 FHIEVEVLDINDNSPQFSRSLIPIEISESAAVGTRIPLDSAFDPDVGENSLHTYSLSAND
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 LFGLEIKTRGDGSRFAELVVEKSLDRETQSHYSFRITALDGGDPPRLGTVGLSIKVTDSN
.:..:..:: ::...:::.: . :::: .: : ...:: : : : : :. :.:...:::
CCDS75 FFNIEVRTRTDGAKYAELIVVRELDRELKSSYELQLTASDMGVPQRSGSSILKISISDSN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 DNNPVFSESTYAVSVPENSPPNTPVIRLNASDPDEGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQID
::.:.: ...: ... :::: .: .. :::.:::::.::..:::: ..:. . : :.::
CCDS75 DNSPAFEQQSYIIQLLENSPVGTLLLDLNATDPDEGANGKIVYSFSSHVSPKIMETFKID
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 PHSGLVTVTGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNSIPAHCKVTVSVLDTNDNPPVIN--LLS
. : .:. .::: . ::.::::.::::::::::::. ..:.:.::: : :: :.:
CCDS75 SERGHLTLFKQVDYEITKSYEIDVQAQDLGPNSIPAHCKIIIKVVDVNDNKPEININLMS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KA1 VNSELVE-VSESAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLGNVPFRLQE-YESFSTILVD
..: . . :. : .:::::.:.::::::.. :.: :. :.::. ::. ::..
CCDS75 PGKEEISYIFEGDPIDTFVALVRVQDKDSGLNGEIVCKLHGHGHFKLQKTYENNYLILTN
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 GRLDREQHDQYNLTIQARDGGVPMLQSAKSFTVLITDENDNHPHFSKPYYQVIVQENNTP
. ::::....:.::. :.: :.: :...: ::: :.: ::: :::.. :. ...:::.:
CCDS75 ATLDREKRSEYSLTVIAEDRGTPSLSTVKHFTVQINDINDNPPHFQRSRYEFVISENNSP
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 GAYLLSVSARDPDLGLNGSVSYQIVPSQVRDMPVFTYVSINPNSGDIYALRSFNHEQTKA
:::. .:.: ::::: ::.:.: :. : . . :::.:.:..: ::::: :.::...
CCDS75 GAYITTVTATDPDLGENGQVTYTILESFILGSSITTYVTIDPSNGAIYALRIFDHEEVSQ
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 FEFKVLAKDGGLPS-LQSNATVRVIILDVNDNTPVITAPPLINGTAEVYIPRNSGIGYLV
. : : :.::: :. : ::.:: . :.: :::.::. .: : :.:::. ::... :. :
CCDS75 ITFVVEARDGGSPKQLVSNTTVVLTIIDENDNVPVVIGPALRNNTAEITIPKGAESGFHV
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 TVVKAEDYDEGENGRVTYDMTEGDR-GFFEIDQVNGEVRTTRTFGESSKSSYELIVVAHD
: ..: : : : :.... .. :.. ..: :: . ...:. .. . .:: :. .:
CCDS75 TRIRAIDRDSGVNAELSCAIVAGNEENIFIIDPRSCDIHTNVSMDSVPYTEWELSVIIQD
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690
pF1KA1 HGKTSLSASALV--LIY------LSPALDAQESMGSVNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIF
.:. .: ...:. .:. : :. .. :..:...:.:.::.::.: ..:.: :..
CCDS75 KGNPQLHTKVLLKCMIFEYAESVTSTAM-TSVSQASLDVSMIIIISLGAICAVLLVIMVL
670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 VAIKCKRDNKEIRTYNCRIAEYSYGHQKKSSKKKKISKNDIRLVPRDVEETDKMNVVSCS
: .:.:..:. :.::::.:: .: :. : ... : :.:: ::: .. : . :
CCDS75 FATRCNREKKDTRSYNCRVAESTYQHHPKRPSRQ-IHKGDITLVPT-INGTLPIRSHHRS
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 SLTSSLNYFDYHQQTLPLGCRRSESTFLNVENQNTRNTSANHI--------YHHSFNSQG
: .:: .. : .: :.:... .... : :.::. : . .
CCDS75 SPSSS-PTLERGQ----MGSRQSHNSHQSLNSLVT--ISSNHVPENFSLELTHATPAVEV
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 PQQPDLIINGVPLPETENYSFDSNYVNSRAHLIKSSSTFKDLEGNSLKDSGHEESDQTDS
: ... .: :. :: .: ::.. ...:.. ::::::. .:. ::
CCDS75 SQLLSMLHQGQYQPRP---SFRGNKY-SRSY----RYALQDMDKFSLKDSGRGDSEAGDS
840 850 860 870 880
880 890 900 910 920
pF1KA1 EHDVQRSLYCDTAVNDVLNTSVTSMGSQMPDHDQNEGFH-CREECRILGHSDRCWMPRNP
..:. : :. .. .:. . ... . : ... : ::::.:::::.:::: :
CCDS75 DYDLGR----DSPIDRLLGEGFSDL--FLTDGRIPAAMRLCTEECRVLGHSDQCWMP--P
890 900 910 920 930
930 940 950 960 970
pF1KA1 MPIRSKSPEHVRNIIALSIE-----------ATAADVEAYDDCGPTKRTFATFGKDV-SD
.: : : .. :.. . : . : : : :..:.::::: .:
CCDS75 LP--SPSSDYRSNMFIPGEEFPTQPQQQHPHQSLEDDAQPADSGEKKKSFSTFGKDSPND
940 950 960 970 980 990
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA1 HPAEERPT---LKGKRTVDVTICSPKVNSVIREAGNGCEAISPVTSPLHLKSSLPTKPSV
. . . : :. .: . :.... . : .. .: . :. ::.: .:
CCDS75 EDTGDTSTSSLLSEMSSVFQRLLPPSLDTY-----SECSEVDRSNSLERRKGPLPAK-TV
1000 1010 1020 1030 1040
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KA1 SYTIALAPPARDLEQYVNNVNNGPTRPSEAEPRGADSEKVMHEVSPILKEGRNKESPGVK
.: ..: : . . ..: ::
CCDS75 GYPQGVAAWAASTHFQNPTTNCGPPLGTHSSVQPSSKWLPAMEEIPENYEEDDFDNVLNH
1050 1060 1070 1080 1090 1100
>>CCDS34064.1 PCDH18 gene_id:54510|Hs108|chr4 (1135 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KA1 MESLLLPVLLLLAILWTQAAALINLKYSVEEEQRAGTVIANVAKDAREAGFALDP
:. :: . ... . :::: . ::::.:.::: ...:. .. . :
CCDS34 MHQMNAKMHFRFVFALLIVSFNHDVLGKNLKYRIYEEQRVGSVIARLSEDVADVLLKLPN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA1 RQASAFRVVSNSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLEVMS---SSMEI
.. ::... . :. .: ..: . :::. ::... .: : ..:.. ...
CCDS34 PSTVRFRAMQRGNSPLLVVNEDNGEISIGATIDREQLCQKNLNCSIEFDVITLPTEHLQL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 CVIKVEIKDLNDNAPSFPAAQIELEISEAASPGTRIPLDSAYDPDSGSFGVQTYELTPNE
:.::. :.:::.:.: . : .::::.:. :::::::::.::: : ...:: :. :.
CCDS34 FHIEVEVLDINDNSPQFSRSLIPIEISESAAVGTRIPLDSAFDPDVGENSLHTYSLSAND
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 LFGLEIKTRGDGSRFAELVVEKSLDRETQSHYSFRITALDGGDPPRLGTVGLSIKVTDSN
.:..:..:: ::...:::.: . :::: .: : ...:: : : : : :. :.:...:::
CCDS34 FFNIEVRTRTDGAKYAELIVVRELDRELKSSYELQLTASDMGVPQRSGSSILKISISDSN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 DNNPVFSESTYAVSVPENSPPNTPVIRLNASDPDEGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQID
::.:.: ...: ... :::: .: .. :::.:::::.::..:::: ..:. . : :.::
CCDS34 DNSPAFEQQSYIIQLLENSPVGTLLLDLNATDPDEGANGKIVYSFSSHVSPKIMETFKID
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 PHSGLVTVTGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNSIPAHCKVTVSVLDTNDNPPVIN--LLS
. : .:. .::: . ::.::::.::::::::::::. ..:.:.::: : :: :.:
CCDS34 SERGHLTLFKQVDYEITKSYEIDVQAQDLGPNSIPAHCKIIIKVVDVNDNKPEININLMS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KA1 VNSELVE-VSESAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLGNVPFRLQE-YESFSTILVD
..: . . :. : .:::::.:.::::::.. :.: :. :.::. ::. ::..
CCDS34 PGKEEISYIFEGDPIDTFVALVRVQDKDSGLNGEIVCKLHGHGHFKLQKTYENNYLILTN
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 GRLDREQHDQYNLTIQARDGGVPMLQSAKSFTVLITDENDNHPHFSKPYYQVIVQENNTP
. ::::....:.::. :.: :.: :...: ::: :.: ::: :::.. :. ...:::.:
CCDS34 ATLDREKRSEYSLTVIAEDRGTPSLSTVKHFTVQINDINDNPPHFQRSRYEFVISENNSP
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KA1 GAYLLSVSARDPDLGLNGSVSYQIVPSQVRDMPVFTYVSINPNSGDIYALRSFNHEQTKA
:::. .:.: ::::: ::.:.: :. : . . :::.:.:..: ::::: :.::...
CCDS34 GAYITTVTATDPDLGENGQVTYTILESFILGSSITTYVTIDPSNGAIYALRIFDHEEVSQ
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KA1 FEFKVLAKDGGLPS-LQSNATVRVIILDVNDNTPVITAPPLINGTAEVYIPRNSGIGYLV
. : : :.::: :. : ::.:: . :.: :::.::. .: : :.:::. ::... :. :
CCDS34 ITFVVEARDGGSPKQLVSNTTVVLTIIDENDNVPVVIGPALRNNTAEITIPKGAESGFHV
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KA1 TVVKAEDYDEGENGRVTYDMTEGDR-GFFEIDQVNGEVRTTRTFGESSKSSYELIVVAHD
: ..: : : : :.... .. :.. ..: :: . ...:. .. . .:: :. .:
CCDS34 TRIRAIDRDSGVNAELSCAIVAGNEENIFIIDPRSCDIHTNVSMDSVPYTEWELSVIIQD
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690
pF1KA1 HGKTSLSASALV--LIY------LSPALDAQESMGSVNLSLIFIIALGSIAGILFVTMIF
.:. .: ...:. .:. : :. .. :..:...:.:.::.::.: ..:.: :..
CCDS34 KGNPQLHTKVLLKCMIFEYAESVTSTAM-TSVSQASLDVSMIIIISLGAICAVLLVIMVL
670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KA1 VAIKCKRDNKEIRTYNCRIAEYSYGHQKKSSKKKKISKNDIRLVPRDVEETDKMNVVSCS
: .:.:..:. :.::::.:: .: :. : ... : :.:: ::: .. : . :
CCDS34 FATRCNREKKDTRSYNCRVAESTYQHHPKRPSRQ-IHKGDITLVPT-INGTLPIRSHHRS
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KA1 SLTSSLNYFDYHQQTLPLGCRRSESTFLNVENQNTRNTSANHI---YHHSFNSQGP--QQ
: .:: .. : .: :.:... .... : :.::. . .. : .:
CCDS34 SPSSS-PTLERGQ----MGSRQSHNSHQSLNSLVT--ISSNHVPENFSLELTHATPAVEQ
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KA1 PDLIINGVPLPETENY-SFDSNYVNSRAHLIKSSSTFKDLEGNSLKDSGHEESDQTDSEH
. ... . . . :: .: ::.. ...:.. ::::::. .:. ::..
CCDS34 VSQLLSMLHQGQYQPRPSFRGNKY-SRSY----RYALQDMDKFSLKDSGRGDSEAGDSDY
840 850 860 870 880
880 890 900 910 920 930
pF1KA1 DVQRSLYCDTAVNDVLNTSVTSMGSQMPDHDQNEGFH-CREECRILGHSDRCWMPRNPMP
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CCDS34 DLGR----DSPIDRLLGEGFSDL--FLTDGRIPAAMRLCTEECRVLGHSDQCWMP--PLP
890 900 910 920 930
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pF1KA1 IRSKSPEHVRNIIALSIE-----------ATAADVEAYDDCGPTKRTFATFGKDV-SDHP
: : .. :.. . : . : : : :..:.::::: .:.
CCDS34 --SPSSDYRSNMFIPGEEFPTQPQQQHPHQSLEDDAQPADSGEKKKSFSTFGKDSPNDED
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980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KA1 AEERPT---LKGKRTVDVTICSPKVNSVIREAGNGCEAISPVTSPLHLKSSLPTKPSVSY
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CCDS34 TGDTSTSSLLSEMSSVFQRLLPPSLDTY-----SECSEVDRSNSLERRKGPLPAK-TVGY
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1040 1050 1060 1070 1080 1090
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..: : . . ..: ::
CCDS34 PQGVAAWAASTHFQNPTTNCGPPLGTHSSVQPSSKWLPAMEEIPENYEEDDFDNVLNHLN
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10 20 30 40
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50 60 70 80 90
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220 230 240 250 260 270
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280 290 300 310 320 330
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CCDS42 GFGNSYTLVVSGPLDRERVAVYNITVTATDGGIPQLTSLRTLKVEISDINDNPPSFLEDS
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pF1KA1 LRSFNHEQTKAFEFKVLAKDGGLPSLQSNATVRVIILDVNDNTPVITAPPLINGTAEV-Y
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CCDS42 VNSFDYEKFREFFVTVEAQDKGSPPLSSTVTANVYVVDMNDHAPHILYPTSTNSSAAFEM
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580 590 600 610 620 630
pF1KA1 IPRNSGIGYLVTVVKAEDYDEGENGRVTYDMTE-GDRGFFEIDQVNGEVRTTRTFGESSK
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CCDS42 VPRTAPAGYLVTKVIAMDSDSGQNAWLFYHLAQTSDLDLFKVELHTGEIRTTRKMGDESG
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640 650 660 670 680
pF1KA1 SSYELIVVAHDHGKTSLSASALVLI----YLSPAL-DAQESMGS----VNLSLIFIIALG
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CCDS42 STFNLTVVVRDNGEPSLSASVAITVAVVDRVSKILPDTQRHVKSPRTYSEITLYLIIALS
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690 700 710 720 730 740
pF1KA1 SIAGILFVTMIFVAI-KCKRDNKEIRTYN---CRIAEYSYGHQKKSSKKKKISK--NDIR
... :...:.:...: :: : . . : . : : .. :..... .. . ..
CCDS42 TVSFIFLLTIIILSIIKCYRYTAYGTACCGGFCGVRERSPAELYKQANNNIDARIPHGLK
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750 760 770 780
pF1KA1 LVPR--DVEETDKMNVVSC-------SSLTSSLNYFDYHQQTLP--LGCRRSESTFLNVE
. :. .:. . ... . : .: .... ... :: : : . . . :.
CCDS42 VQPHFIEVRGNGSLTKTYCYKACLTAGSGSDTFMFYNTGAQTGPGPSGAQAAVTDSRNLT
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790 800 810 820 830 840
pF1KA1 NQNTRNTSANHIYHHSFNSQG-PQQPDLIINGVPLPETENYSFDSNYVNSRAHLIKSSST
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CCDS42 GQSGQNAGNLIILKNEAVSQNEPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPD
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10 20 30 40
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CCDS75 PPGASIAQISASDPDLGPSGQVSYSIVASDLKPREILSYVSVSAQSGVVFAQRAFDHEQL
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CCDS75 RAFELTLQARDQGSPALSANVSLRVLVGDLNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPRAAEPG
530 540 550 560 570 580
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:::: : : : : :.:. ..: . .... :.: . .:::::.:..:. . . .:.:.
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CCDS75 VRDGGQPPLSATATLHLIFADSLQEVLPDLSDRREPSDPQAKLQFYLVVALALIS-VLFF
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CCDS75 LAVILAISLRLRLSSRSDAWDCFQPGLSSKPGPGVLPNYSEGTLPYSYNLCVASQSAKTE
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10 20 30 40
pF1KA1 MESLLLPVLLLLAILWTQAAALINLKYSVEEEQRAGTVIANVAKDARE
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CCDS54 MKASSGRCGLVRWLQVLLPFLLSL----FPGALPVQIRYSIPEELAKNSVVGNLAKDL--
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CCDS54 -GLSVRDLPARKLRV--SAEKEYFTVNPESGDLLVSDRIDREQICGKQPLCVLDFDTVAE
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pF1KA1 SSMEICVIKVEIKDLNDNAPSFPAAQIELEISEAASPGTRIPLDSAYDPDSGSFGVQTYE
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CCDS54 NPLNIFYIAVIVQDINDNTPLFKQTKINLKIGESTKPGTTFPLDPALDSDVGPNSLQRYH
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CCDS54 LNDNEYFDLAEKQTPDGRKYPELILKHSLDREEHSLHQLVLTAVDGGDPPQSGTTQIRIK
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CCDS54 VTDANDNPPVFSQDVYRVTLREDVPPGFFVLQVTATDRDEGINAEITYSFHN-VDEQVKH
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CCDS54 FFNLNEKTGEITTKDDLDFEIASSYTLSIEAKD--PGDLAAHCSIQVEILDDNDCAPEVI
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pF1KA1 LLSVNSELVEVSESAPPGYVIALVRVSDRDSGLNGRVQCRLLGNVPFRLQEY-ESFSTIL
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CCDS54 VTSVSTPL---PEDSPPGTVIALIKTRDRDSGENGEVYCQVLGNAKFILKSSSKNYYKLV
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CCDS54 PPGASIAQISASDPDLGPSGQVSYSIVASDLKPREILSYVSVSAQSGVVFAQRAFDHEQL
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CCDS54 RAFELTLQARDQGSPALSANVSLRVLVGDLNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPRAAEPG
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pF1KA1 YLVTVVKAEDYDEGENGRVTYDMTEGDR-GFFEIDQVNGEVRTTRTFGESSKSSYELIVV
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CCDS54 YLVTKVVAVDADSGHNAWLSYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAARQRLLVA
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pF1KA1 AHDHGKTSLSASA-LVLIYLS------PAL-DAQE-SMGSVNLSLIFIIALGSIAGILFV
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CCDS54 VRDGGQPPLSATATLHLIFADSLQEVLPDLSDRREPSDPQAKLQFYLVVALALIS-VLFF
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pF1KA1 TMIFVAIKCK-RDNKEIRTYNCRIAEYSYGHQKKSSKKKKISKNDIRLVPRDVEETDKMN
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CCDS54 LAVILAISLRLRLSSRSDAWDCFQPGLSSKPGPGVLPNYSEGTLPYSYNLCVASQSAKTE
710 720 730 740 750 760
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CCDS75 MLRKVRSWTEIWRWATLLFLFYHLGYVCGQIRYPVPEESQEGTFVGNVAQD-----FLLD
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pF1KA1 PRQASAFR--VVSNSAPHLVDINPSSGLLVTKQKIDRDLLCRQSPKCIISLE-VMSSSME
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CCDS75 TDSLSARRLQVAGEVNQRHFRVDLDSGALLIKNPIDREALCGLSASCIVPLEFVTEGPLE
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pF1KA1 ICVIKVEIKDLNDNAPSFPAAQIELEISEAASPGTRIPLDSAYDPDSGSFGVQTYELTPN
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CCDS75 MYRAEVEIVDVNDHAPRFPRQQLDLEIGEAAPPGQRFPLEKAQDADVGSNSISSYRLSSN
120 130 140 150 160 170
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pF1KA1 ELFGLEIKTRGDGSRFAELVVEKSLDRETQSHYSFRITALDGGDPPRLGTVGLSIKVTDS
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CCDS75 EHFALDVKKRSDGSLVPELLLEKPLDREKQSDYRLVLTAVDGGNPPRSGTAELRVSVLDV
180 190 200 210 220 230
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pF1KA1 NDNNPVFSESTYAVSVPENSPPNTPVIRLNASDPDEGTNGQVVYSFYGYVNDRTRELFQI
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CCDS75 NDNAPAFQQSSYRISVLESAPAGMVLIQLNASDPDLGPSGNVTFYFSGHTPDRVRNLFSL
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 DPHSGLVTVTGALDYEEGHVYELDVQAKDLGPNSIPAHCKVTVSVLDTNDNPPVINLLSV
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