Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0288
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0288, 1084 aa
1>>>pF1KA0288 1084 - 1084 aa - 1084 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3631+/-0.00106; mu= -0.5804+/- 0.063
mean_var=295.9892+/-60.983, 0's: 0 Z-trim(112.4): 49 B-trim: 13 in 1/55
Lambda= 0.074548
statistics sampled from 13133 (13175) to 13133 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.729), E-opt: 0.2 (0.405), width: 16
Scan time: 5.810
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2529.1 HDAC4 gene_id:9759|Hs108|chr2 (1084) 7222 791.3 0
CCDS47553.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1069) 3906 434.7 5.4e-121
CCDS47554.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1066) 3878 431.6 4.3e-120
CCDS47555.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1011) 3744 417.2 9e-116
CCDS45696.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17 (1122) 2946 331.4 6.7e-90
CCDS32663.1 HDAC5 gene_id:10014|Hs108|chr17 (1123) 2946 331.4 6.7e-90
CCDS83163.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1025) 2884 324.7 6.4e-88
CCDS41776.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12 ( 954) 2287 260.5 1.3e-68
CCDS81685.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12 ( 974) 2278 259.5 2.6e-68
CCDS8756.2 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12 ( 991) 2278 259.5 2.6e-68
CCDS47557.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 ( 590) 1594 185.8 2.4e-46
CCDS56467.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 ( 562) 1386 163.4 1.3e-39
CCDS56465.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 ( 588) 923 113.6 1.3e-24
CCDS56466.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 ( 546) 873 108.2 5e-23
CCDS75565.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 ( 549) 856 106.4 1.8e-22
CCDS56468.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 ( 513) 778 98.0 5.7e-20
CCDS14306.1 HDAC6 gene_id:10013|Hs108|chrX (1215) 774 97.9 1.5e-19
CCDS14088.1 HDAC10 gene_id:83933|Hs108|chr22 ( 669) 744 94.4 8.8e-19
CCDS54545.1 HDAC10 gene_id:83933|Hs108|chr22 ( 649) 500 68.2 6.8e-11
>>CCDS2529.1 HDAC4 gene_id:9759|Hs108|chr2 (1084 aa)
initn: 7222 init1: 7222 opt: 7222 Z-score: 4213.1 bits: 791.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7222; 100.0% identity (100.0% similar) in 1084 aa overlap (1-1084:1-1084)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSSQSHPDGLSGRDQPVELLNPARVNHMPSTVDVATALPLQVAPSAVPMDLRLDHQFSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MSSQSHPDGLSGRDQPVELLNPARVNHMPSTVDVATALPLQVAPSAVPMDLRLDHQFSLP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 VAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 MKHQQELLEHQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MKHQQELLEHQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 NKKKALAHRNLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGMYDAKDDFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 NKKKALAHRNLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGMYDAKDDFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 LRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVTDSACSSAPGSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVTDSACSSAPGSGP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SSPNNSSGSVSAENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNITLGLPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SSPNNSSGSVSAENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNITLGLPA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 TGPSAGTAGQQDAERLTLPALQQRLSLFPGTHLTPYLSTSPLERDGGAAHSPLLQHMVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 TGPSAGTAGQQDAERLTLPALQQRLSLFPGTHLTPYLSTSPLERDGGAAHSPLLQHMVLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 EQPPAQAPLVTGLGALPLHAQSLVGADRVSPSIHKLRQHRPLGRTQSAPLPQNAQALQHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 EQPPAQAPLVTGLGALPLHAQSLVGADRVSPSIHKLRQHRPLGRTQSAPLPQNAQALQHL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 VIQQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEETEEELREHQALLDEPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 VIQQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEETEEELREHQALLDEPY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 LDRLPGQKEAHAQAGVQVKQEPIESDEEEAEPPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LDRLPGQKEAHAQAGVQVKQEPIESDEEEAEPPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 RIHQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRAQSSPASATFPVSVQEPPTKPRFTTGLVYDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 RIHQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRAQSSPASATFPVSVQEPPTKPRFTTGLVYDT
610 620 630 640 650 660
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pF1KA0 LMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQETGLRGKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQETGLRGKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 LLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLASVFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSAGAARLAVGCVVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLASVFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSAGAARLAVGCVVE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 LVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTPMGFCYFNSVAVAAKLLQQRLSVSKILIVDWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTPMGFCYFNSVAVAAKLLQQRLSVSKILIVDWD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 VHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFTGGLDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 VHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFTGGLDP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 PMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNLSARCFGYLTKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 PMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNLSARCFGYLTKQL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 MGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNELDPLPEKVLQQRPNANAVRSMEKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNELDPLPEKVLQQRPNANAVRSMEKV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 MEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGVKPAEKRPDEEPMEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGVKPAEKRPDEEPMEE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 EPPL
::::
CCDS25 EPPL
>>CCDS47553.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1069 aa)
initn: 3320 init1: 1590 opt: 3906 Z-score: 2285.7 bits: 434.7 E(32554): 5.4e-121
Smith-Waterman score: 3931; 58.2% identity (79.4% similar) in 1095 aa overlap (25-1084:1-1069)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSSQSHPDGLSGRDQPVELLNPARVNHMPSTVDVATALPLQVAPSAVPMDLRLDHQFSLP
.. : :.::: . .:. . : . :.::: : .. .:
CCDS47 MHSMISSVDVKSEVPVGLEPIS-PLDLRTDLRMMMP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLA
:..:..::.::::::: ..:.::::.:.::::::.:::.:.:::.:::.:::: :::.::
CCDS47 VVDPVVREKQLQQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKLQQELLA
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 MKHQQELLEHQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVL
.:.::::::...:::..:::::.:...:::.: :..:..:.: ::::::::.:::::.:
CCDS47 IKQQQELLEKEQKLEQQRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KA0 NKK--KALAHRNLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGMYDAKDD
.:. : . :: .: :. :: ..:.:::::::: ::.: ::.. . : :::::
CCDS47 SKSATKDTPTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSGTSPSYKYTLPGAQDAKDD
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FPLRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVTDSACSSA-PG
:::::::::::::.:::::::::::::::::::::: :::..::: ..::.:. ::. ::
CCDS47 FPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGNVVTSFKKRMFEVTESSVSSSSPG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 SGPSSPNNS-SGSVSA-ENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNIT
::::::::. .:::. :... : .: .: .:.. .: : : :::::::::::
CCDS47 SGPSSPNNGPTGSVTENETSVLPPTPHAEQMVS-QQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNIT
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KA0 LGLPATGPSAGTAGQ--QDAERLTLPALQQRLSLFPGTH--LTPYLSTSP---LE-RDGG
:::::. :: .:.. .. .. .:.: . : :: . : :. : :: . .
CCDS47 LGLPAV-PSQLNASNSLKEKQKCETQTLRQGVPL-PGQYGGSIPASSSHPHVTLEGKPPN
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 AAHSPLLQHMVLLEQPPAQAPLVTGLGALPLHAQS-LVGADRVSPSI---HKLRQHRPLG
..:. ::::..: :: : ::. :..::: :: :. .:.::.: ::: .::::.
CCDS47 SSHQALLQHLLLKEQMRQQKLLVA--GGVPLHPQSPLATKERISPGIRGTHKLPRHRPLN
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 RTQSAPLPQNAQALQHLVIQQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPE
:::::::::.. : .:::::::::::::.:: :::..:::.. : : .:: :: :
CCDS47 RTQSAPLPQST--LAQLVIQQQHQQFLEKQKQ--YQQQIHMNKLLSKSIEQLKQPGSHLE
460 470 480 490 500
530 540 550 560 570
pF1KA0 ETEEELREHQALLDEPYLDRLPG-----QKEAHA-------QAG-VQVKQEPIESDEEEA
:.::::. ::. . :: :. .... : :.: :.::.::..:::.
CCDS47 EAEEELQGDQAMQE----DRAPSSGNSTRSDSSACVDDTLGQVGAVKVKEEPVDSDEDAQ
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 EPPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQRIHQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRA
.:.: :.. : :: .: : . . : :: . :.:. .. :: .::.
CCDS47 --IQEMESGEQAA------FMQQPFL-EPTHTRALSVRQAPLAAVGMD-GLEKHRLVSRT
570 580 590 600 610
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pF1KA0 QSSPASATFPVSVQEPPTKPRFTTGLVYDTLMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQ
.::::....: ... : .: .::..:: :::::::.::.:..::::::::::::::::
CCDS47 HSSPAASVLPHPAMDRPLQPGSATGIAYDPLMLKHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWSRLQ
620 630 640 650 660 670
700 710 720 730 740
pF1KA0 ETGLRGKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHTLLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLAS-VFVRL
:::: .::: :.::::.:::.: :::: :.::::::::. :::: . :::. .. : :
CCDS47 ETGLLNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSLLYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSL
680 690 700 710 720 730
750 760 770 780 790 800
pF1KA0 PCGGVGVDSDTIWNEVHSAGAARLAVGCVVELVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTP
::::.::::::::::.::.::::.:::::.::. :::.:::::::::::::::::::::
CCDS47 PCGGLGVDSDTIWNELHSSGAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEESTA
740 750 760 770 780 790
810 820 830 840 850 860
pF1KA0 MGFCYFNSVAVAAKLLQQRLSVSKILIVDWDVHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGN
::::.:::::..:: :...:..::::::: :::::::::::::.:::.::.::::::.::
CCDS47 MGFCFFNSVAITAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGN
800 810 820 830 840 850
870 880 890 900 910 920
pF1KA0 FFPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFTGGLDPPMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLV
::::::::.::::: : :.:.:.:.::::::::::.::: ::::.: :.:.:: ::.:::
CCDS47 FFPGSGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDMVLV
860 870 880 890 900 910
930 940 950 960 970 980
pF1KA0 SSGFDAVEGHPTPLGGYNLSARCFGYLTKQLMGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACV
:.::::.::: :::::...:.:::.:::::: :: ::.:::::::::::::::::::::
CCDS47 SAGFDALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVLALEGGHDLTAICDASEACV
920 930 940 950 960 970
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KA0 SALLGNELDPLPEKVLQQRPNANAVRSMEKVMEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCE
.:::::::.:: : .:.: :: ::: :..:..::.::::. .. .. : .: ::
CCDS47 NALLGNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKIIEIQSKYWKSVRMVAVPRGCALAGAQL--
980 990 1000 1010 1020 1030
1050 1060 1070 1080
pF1KA0 NEEAETVTAMASLSVGV-KP---AEKRPDEEPMEEEPPL
.::.:::.:.:::.: : .: ..: ::::::: :
CCDS47 QEETETVSALASLTVDVEQPFAQEDSRTAGEPMEEEPAL
1040 1050 1060
>>CCDS47554.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1066 aa)
initn: 2732 init1: 1590 opt: 3878 Z-score: 2269.5 bits: 431.6 E(32554): 4.3e-120
Smith-Waterman score: 3903; 58.0% identity (79.2% similar) in 1095 aa overlap (25-1084:1-1066)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSSQSHPDGLSGRDQPVELLNPARVNHMPSTVDVATALPLQVAPSAVPMDLRLDHQFSLP
.. : :.::: . .:. . : . :.::: : .. .:
CCDS47 MHSMISSVDVKSEVPVGLEPIS-PLDLRTDLRMMMP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLA
:..:..::.::::::: ..:.::::.:.::::::.:::.:.:::.:::.:::: :.::
CCDS47 VVDPVVREKQLQQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIK---ELLA
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 MKHQQELLEHQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVL
.:.::::::...:::..:::::.:...:::.: :..:..:.: ::::::::.:::::.:
CCDS47 IKQQQELLEKEQKLEQQRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KA0 NKK--KALAHRNLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGMYDAKDD
.:. : . :: .: :. :: ..:.:::::::: ::.: ::.. . : :::::
CCDS47 SKSATKDTPTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSGTSPSYKYTLPGAQDAKDD
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FPLRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVTDSACSSA-PG
:::::::::::::.:::::::::::::::::::::: :::..::: ..::.:. ::. ::
CCDS47 FPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGNVVTSFKKRMFEVTESSVSSSSPG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 SGPSSPNNS-SGSVSA-ENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNIT
::::::::. .:::. :... : .: .: .:.. .: : : :::::::::::
CCDS47 SGPSSPNNGPTGSVTENETSVLPPTPHAEQMVS-QQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNIT
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KA0 LGLPATGPSAGTAGQ--QDAERLTLPALQQRLSLFPGTH--LTPYLSTSP---LE-RDGG
:::::. :: .:.. .. .. .:.: . : :: . : :. : :: . .
CCDS47 LGLPAV-PSQLNASNSLKEKQKCETQTLRQGVPL-PGQYGGSIPASSSHPHVTLEGKPPN
340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 AAHSPLLQHMVLLEQPPAQAPLVTGLGALPLHAQS-LVGADRVSPSI---HKLRQHRPLG
..:. ::::..: :: : ::. :..::: :: :. .:.::.: ::: .::::.
CCDS47 SSHQALLQHLLLKEQMRQQKLLVA--GGVPLHPQSPLATKERISPGIRGTHKLPRHRPLN
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470 480 490 500 510 520
pF1KA0 RTQSAPLPQNAQALQHLVIQQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPE
:::::::::.. : .:::::::::::::.:: :::..:::.. : : .:: :: :
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530 540 550 560 570
pF1KA0 ETEEELREHQALLDEPYLDRLPG-----QKEAHA-------QAG-VQVKQEPIESDEEEA
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.:.: :.. : :: .: : . . : :: . :.:. .. :: .::.
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.::::....: ... : .: .::..:: :::::::.::.:..::::::::::::::::
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pF1KA0 ETGLRGKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHTLLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLAS-VFVRL
:::: .::: :.::::.:::.: :::: :.::::::::. :::: . :::. .. : :
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::::.::::::::::.::.::::.:::::.::. :::.:::::::::::::::::::::
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::::.:::::..:: :...:..::::::: :::::::::::::.:::.::.::::::.::
CCDS47 MGFCFFNSVAITAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGN
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:..:..::.::::::: ..:.::::.:.::::::.:::.:.:::.:::.:::: :.::
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.:.::::::...:::..:::::.:...:::.: :..:..:.: ::::::::.:::::.:
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CCDS47 FFPGSGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDMVLV
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CCDS47 NALLGNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKIIEIQSMSLKFS
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: ...: .:.:.:::::::::::.: ... ::::.. .::.::.: :: .
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..: . ::::::::::.::: :: : . ::.::: .: .:.: .:
CCDS45 DSSPNQFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNSHLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTLT
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CCDS45 QQLQLGKILTKTGELPRQPTTHPEETEEELTEQQEVLLGEGALT-MPREGSTESESTQED
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::::::::..::::::::::: ::::.:::::..::::::.:.:.:.::::::.::::::
CCDS45 GELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNGT
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CCDS45 QQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVEY
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:.:::::::::: ::.:::::::.:::::::: .:::::...:::::.::.::: :::::
CCDS45 LTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGGR
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CCDS45 VVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSKH
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pF1KA0 WRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGVKPAEK--------RPDEEPME
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CCDS45 WSCVQKFAAGLGRSLREAQAGETEEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPME
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1080
pF1KA0 EEPPL
.:: :
CCDS45 QEPAL
1120
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pF1KA0 MSSQSHPDGLSGRDQPVELLNPARVNHMPSTVDVATALPLQVAPSAV-------PMDLR
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CCDS32 MNSPNESADGMSGREPSLEILPRTSLHSIPVTVEVKPVLP-RAMPSSMGGGGGGSPSPVE
10 20 30 40 50
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pF1KA0 LDHQFSLPVAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHI
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CCDS32 LRGALVGSV-DPTLREQQLQQELLALKQQQQLQKQLLFAEFQKQHDHLTRQHEVQLQKHL
60 70 80 90 100 110
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CCDS32 KQQQEMLAAKQQQEMLAAKRQQELEQQRQREQQRQE-ELEKQRLEQQLLILRNKEKSKES
120 130 140 150 160 170
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pF1KA0 AVASTEVKMKLQEFVLNKKKALAHRNLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSG---V
:.::::::..::::.:.:.: . .::: . . :. : : ..:.::::::::::: .
CCDS32 AIASTEVKLRLQEFLLSKSKEPTPGGLNHSLPQHPKCW-G-AHHASLDQSSPPQSGPPGT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 STSYNHPVLGMYDAKDDFPLRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALK
::. :. : ::..:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: :....:
CCDS32 PPSYKLPLPGPYDSRDDFPLRKTASEPNLKVRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGTVISTFK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KA0 KRPLDVT------DSACSSAPGSGPSSPNNSSGSVSAENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVA
:: ...: .:.:.:::::::::::.: ... ::::.. .::.::.: :: .
CCDS32 KRAVEITGAGPGASSVCNSAPGSGPSSPNSSHSTI-AENGFTGSVPNIPTEMLPQHRALP
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KA0 REGSAAPLPLYTSPSLPNITLGLPAT--------GPSAGTAGQQDAERLTLPALQQRLSL
..: . ::::::::::.::: :: : . ::.::: .: .:.: .:
CCDS32 LDSSPNQFSLYTSPSLPNISLGLQATVTVTNSHLTASPKLSTQQEAERQALQSLRQGGTL
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KA0 ---FPGTHLTPY-LSTSPLERDGGA-AHSPLLQHMVLLEQPPAQAPLVTGLGALPLHAQS
: .: : : :: ::. .:. ::::..:::: :. :. :.:::.::
CCDS32 TGKFMSTSSIPGCLLGVALEGDGSPHGHASLLQHVLLLEQARQQSTLI----AVPLHGQS
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490
pF1KA0 -LVGADRVSPSIH---KLRQHRPLGRTQSAPLPQNAQALQHLVIQQQHQQFLEKHKQQFQ
:: ..::. :.. :: .::::.::::.::::. ::::.::.::::::::::.::
CCDS32 PLVTGERVATSMRTVGKLPRHRPLSRTQSSPLPQSPQALQQLVMQQQHQQFLEKQKQ---
480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KA0 QQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEETEEELREHQ-ALLDEPYLDRLPGQKEAHAQAGVQ
::::..::. : .: ::: .::::::::: :.: .:: : : .: . ..... .
CCDS32 -QQLQLGKILTKTGELPRQPTTHPEETEEELTEQQEVLLGEGALT-MPREGSTESESTQE
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600 610
pF1KA0 -VKQEPIESDEEEAEP-----PREVEPGQRQ-PSEQELLFRQQALLLEQQRIHQLRNYQA
...: :.: :: : .: : : .. :. .: . :. . : .. :. :::
CCDS32 DLEEEDEEDDGEEEEDCIQVKDEEGESGAEEGPDLEEPGAGYKKLFSDAQPLQPLQVYQA
590 600 610 620 630 640
620 630 640 650 660
pF1KA0 SMEAAGIPVSFGGHRPLSRAQSSPASATFPVSVQEPPTKPR---FTTGLVYDTLMLKHQC
. : .: :. :.:.:::::. : ... :: .: ::::.::::.::::::
CCDS32 PLSLATVP-----HQALGRTQSSPAA---PGGMKSPPDQPVKHLFTTGVVYDTFMLKHQC
650 660 670 680 690
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 TCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQETGLRGKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHTLLYGTNP
::.. :::::::::::::::::::: .::: ::::::::.:.:::::: :::::::.:
CCDS32 MCGNTHVHPEHAGRIQSIWSRLQETGLLSKCERIRGRKATLDEIQTVHSEYHTLLYGTSP
700 710 720 730 740 750
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 LNRQKLDSKKLLGSLAS-VFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSAGAARLAVGCVVELVFKVA
::::::::::::: ... ... :::::.::::::.:::.::..:.:.::::..::.::::
CCDS32 LNRQKLDSKKLLGPISQKMYAVLPCGGIGVDSDTVWNEMHSSSAVRMAVGCLLELAFKVA
760 770 780 790 800 810
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 TGELKNGFAVVRPPGHHAEESTPMGFCYFNSVAVAAKLLQQRLSVSKILIVDWDVHHGNG
.::::::::..::::::::::: ::::.:::::..::::::.:.:.:.::::::.:::::
CCDS32 AGELKNGFAIIRPPGHHAEESTAMGFCFFNSVAITAKLLQQKLNVGKVLIVDWDIHHGNG
820 830 840 850 860 870
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 TQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFTGGLDPPMGDAE
::::::.::::::.::::::.::::::::::.::: :::::.:::.:.:::.:::.::.:
CCDS32 TQQAFYNDPSVLYISLHRYDNGNFFPGSGAPEEVGGGPGVGYNVNVAWTGGVDPPIGDVE
880 890 900 910 920 930
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 YLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNLSARCFGYLTKQLMGLAGG
::.:::::::::: ::.:::::::.:::::::: .:::::...:::::.::.::: ::::
CCDS32 YLTAFRTVVMPIAHEFSPDVVLVSAGFDAVEGHLSPLGGYSVTARCFGHLTRQLMTLAGG
940 950 960 970 980 990
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 RIVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNELDPLPEKVLQQRPNANAVRSMEKVMEIHSK
:.:::::::::::::::::::::::::. ::.:: : ::::.:: ::: ..:::.::.::
CCDS32 RVVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLSVELQPLDEAVLQQKPNINAVATLEKVIEIQSK
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KA0 YWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGVKPAEK--------RPDEEPM
.: :.:. .. :::: :::. :.::::::.::: ::::.. :. :: ::::
CCDS32 HWSCVQKFAAGLGRSLREAQAGETEEAETVSAMALLSVGAEQAQAAAAREHSPRPAEEPM
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1080
pF1KA0 EEEPPL
:.:: :
CCDS32 EQEPAL
1120
>>CCDS83163.1 HDAC9 gene_id:9734|Hs108|chr7 (1025 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MSSQSHPDGLSGRDQPVELLNPARVNHMPSTVDVATALPLQVAPSAVPMDLRLDHQFSLP
.. : :.::: . .:. . : . :.::: : .. .:
CCDS83 MHSMISSVDVKSEVPVGLEPIS-PLDLRTDLRMMMP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VAEPALREQQLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLA
:..:..::.::::::: ..:.::::.:.::::::.:::.:.:::.:::.:::: :::.::
CCDS83 VVDPVVREKQLQQELLLIQQQQQIQKQLLIAEFQKQHENLTRQHQAQLQEHIKLQQELLA
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 MKHQQELLEHQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVL
.:.::::::...:::..:::::.:...:::.: :..:..:.: ::::::::.:::::.:
CCDS83 IKQQQELLEKEQKLEQQRQEQEVERHRREQQLPPLRGKDRGRERAVASTEVKQKLQEFLL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KA0 NKK--KALAHRNLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGMYDAKDD
.:. : . :: .: :. :: ..:.:::::::: ::.: ::.. . : :::::
CCDS83 SKSATKDTPTNGKNHSVSRHPKLWYTAAHHTSLDQSSPPLSGTSPSYKYTLPGAQDAKDD
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FPLRKTASEPNLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVTDSACSSAPGS
:::::: : :. ::.:::
CCDS83 FPLRKTES-------------------------------------------SVSSSSPGS
220 230
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 GPSSPNNS-SGSVSA-ENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNITL
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CCDS83 GPSSPNNGPTGSVTENETSVLPPTPHAEQMVS-QQRILIHEDSMNLLSLYTSPSLPNITL
240 250 260 270 280 290
360 370 380 390 400
pF1KA0 GLPATGPSAGTAGQ--QDAERLTLPALQQRLSLFPGTH--LTPYLSTSP---LE-RDGGA
::::. :: .:.. .. .. .:.: . : :: . : :. : :: . ..
CCDS83 GLPAV-PSQLNASNSLKEKQKCETQTLRQGVPL-PGQYGGSIPASSSHPHVTLEGKPPNS
300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 AHSPLLQHMVLLEQPPAQAPLVTGLGALPLHAQS-LVGADRVSPSI---HKLRQHRPLGR
.:. ::::..: :: : ::. :..::: :: :. .:.::.: ::: .::::.:
CCDS83 SHQALLQHLLLKEQMRQQKLLVA--GGVPLHPQSPLATKERISPGIRGTHKLPRHRPLNR
350 360 370 380 390 400
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 TQSAPLPQNAQALQHLVIQQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEE
::::::::.. : .:::::::::::::.:: :::..:::.. : : .:: :: ::
CCDS83 TQSAPLPQST--LAQLVIQQQHQQFLEKQKQ--YQQQIHMNKLLSKSIEQLKQPGSHLEE
410 420 430 440 450 460
530 540 550 560 570
pF1KA0 TEEELREHQALLDEPYLDRLPG-----QKEAHA-------QAG-VQVKQEPIESDEEEAE
.::::. ::. . :: :. .... : :.: :.::.::..:::.
CCDS83 AEEELQGDQAMQE----DRAPSSGNSTRSDSSACVDDTLGQVGAVKVKEEPVDSDEDAQ-
470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 PPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQRIHQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRAQ
.:.: :.. : :: .: : . . : :: . :.:. .. :: .::..
CCDS83 -IQEMESGEQAA------FMQQPFL-EPTHTRALSVRQAPLAAVGMD-GLEKHRLVSRTH
520 530 540 550 560
640 650 660 670 680 690
pF1KA0 SSPASATFPVSVQEPPTKPRFTTGLVYDTLMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQE
::::....: ... : .: .::..:: :::::::.::.:..:::::::::::::::::
CCDS83 SSPAASVLPHPAMDRPLQPGSATGIAYDPLMLKHQCVCGNSTTHPEHAGRIQSIWSRLQE
570 580 590 600 610 620
700 710 720 730 740 750
pF1KA0 TGLRGKCECIRGRKATLEELQTVHSEAHTLLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLAS-VFVRLP
::: .::: :.::::.:::.: :::: :.::::::::. :::: . :::. .. : ::
CCDS83 TGLLNKCERIQGRKASLEEIQLVHSEHHSLLYGTNPLDGQKLDPRILLGDDSQKFFSSLP
630 640 650 660 670 680
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pF1KA0 CGGVGVDSDTIWNEVHSAGAARLAVGCVVELVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTPM
:::.::::::::::.::.::::.:::::.::. :::.::::::::::::::::::::: :
CCDS83 CGGLGVDSDTIWNELHSSGAARMAVGCVIELASKVASGELKNGFAVVRPPGHHAEESTAM
690 700 710 720 730 740
820 830 840 850 860 870
pF1KA0 GFCYFNSVAVAAKLLQQRLSVSKILIVDWDVHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNF
:::.:::::..:: :...:..::::::: :::::::::::::.:::.::.::::::.:::
CCDS83 GFCFFNSVAITAKYLRDQLNISKILIVDLDVHHGNGTQQAFYADPSILYISLHRYDEGNF
750 760 770 780 790 800
880 890 900 910 920 930
pF1KA0 FPGSGAPDEVGTGPGVGFNVNMAFTGGLDPPMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVS
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CCDS83 FPGSGAPNEVGTGLGEGYNINIAWTGGLDPPMGDVEYLEAFRTIVKPVAKEFDPDMVLVS
810 820 830 840 850 860
940 950 960 970 980 990
pF1KA0 SGFDAVEGHPTPLGGYNLSARCFGYLTKQLMGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACVS
.::::.::: :::::...:.:::.:::::: :: ::.:::::::::::::::::::::.
CCDS83 AGFDALEGHTPPLGGYKVTAKCFGHLTKQLMTLADGRVVLALEGGHDLTAICDASEACVN
870 880 890 900 910 920
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KA0 ALLGNELDPLPEKVLQQRPNANAVRSMEKVMEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCEN
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CCDS83 ALLGNELEPLAEDILHQSPNMNAVISLQKIIEIQSKYWKSVRMVAVPRGCALAGAQL--Q
930 940 950 960 970 980
1060 1070 1080
pF1KA0 EEAETVTAMASLSVGV-KP---AEKRPDEEPMEEEPPL
::.:::.:.:::.: : .: ..: ::::::: :
CCDS83 EETETVSALASLTVDVEQPFAQEDSRTAGEPMEEEPAL
990 1000 1010 1020
>>CCDS41776.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12 (954 aa)
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pF1KA0 QLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLAMKHQQELLE
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CCDS41 CADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHL-----FLAGLQQQRSVE
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pF1KA0 HQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVLNKKKALAHR
.: : ::. .::.:.:: .:.:.:.:::::. ::.:: : .:.:..: .:
CCDS41 PMR-LSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQAALER
90 100 110 120 130 140
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pF1KA0 NLNHCISSDPRYWYGKTQHSSLDQSSPPQSGVSTSYNHPVLGM-YDAKDDFPLRKTASEP
... ..: : . :. . .: .: :. :: .. : . ::::::.:::
CCDS41 TVH---PNSPGIPYRTLE--PLETEGATRSMLS-SFLPPVPSLPSDPPEHFPLRKTVSEP
150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 NLKLRSRLKQKVAERRSSPLLRRKDGPVVTALKKRPLDVT-DSA--CSSAPGSGPSSPNN
::::: . :... :::..::::....: .:..:: .. ::. ::.:.:: ::::.
CCDS41 NLKLRYKPKKSL-ERRKNPLLRKESAP--PSLRRRPAETLGDSSPSSSSTPASGCSSPND
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 SSGSVSAENGIAPAVPSIPAETSLAHRLVAREGSAAPLPLYTSPSLPNITLGLPATGPSA
: :.: :: :: :
CCDS41 S------EHG------------------------------------PNPILGSEA-----
260
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 GTAGQQDAERLTLPALQQRLSLFPGTHLTPYLSTSPLERDGGAAHSPLLQHMVLLEQPPA
:..: : :.: : .. . : :: . :: ..:.. :: ..::. .
CCDS41 ------DSDRRTHPTLGPRGPILGSPH-TPLFLPHGLEPEAGGTLPSRLQPILLLDPSGS
270 280 290 300 310
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 QAPLVT--GLGALPLH-AQSLVGADRVSPSIHKLRQHRPLGRTQSAPLPQNAQALQHLVI
.:::.: ::: ::.: ::::. ..:.: : : ::.::.: ::: .: :
CCDS41 HAPLLTVPGLGPLPFHFAQSLMTTERLSGS----GLHWPLSRTRSEPLPPSATAPPP---
320 330 340 350 360 370
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 QQQHQQFLEKHKQQFQQQQLQMNKIIPKPSEPARQPESHPEETEEELREHQALLDEPYLD
: ::. : . : .: . ..:...:. . . :.:. . . :
CCDS41 PGPMQPRLEQLKTHVQ--------VIKRSAKPSEKPRLRQIPSAEDLETDGGGPGQVVDD
380 390 400 410 420
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 RLPGQKEAHAQAGVQVKQEPIESDEEEAEPPREVEPGQRQPSEQELLFRQQALLLEQQRI
: .. .:.: : ::. : : :..: :.:: ::::.
CCDS41 GLEHRELGHGQ--------P------EARGP---APLQQHP---------QVLLWEQQRL
430 440 450
610 620 630 640 650
pF1KA0 HQLRNYQASMEAAGIPVSFGGHRPLSRAQSSPASATFPVSVQEPPTKPR-----------
.. ... .:.. :::::::::::::: : .:. :: .. :
CCDS41 AGRLPRGSTGDTVLLPLAQGGHRPLSRAQSSPA-APASLSAPEPASQARVLSSSETPART
460 470 480 490 500 510
660 670 680 690 700
pF1KA0 --FTTGLVYDTLMLKHQCTCGSSSSHPEHAGRIQSIWSRLQETGLRGKCECIRGRKATLE
:::::.::..::::::.::..: ::::::::::::::::: :::..:::.:::::.::
CCDS41 LPFTTGLIYDSVMLKHQCSCGDNSRHPEHAGRIQSIWSRLQERGLRSQCECLRGRKASLE
520 530 540 550 560 570
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 ELQTVHSEAHTLLYGTNPLNRQKLDSKKLLGSLAS-VFVRLPCGGVGVDSDTIWNEVHSA
:::.:::: :.::::::::.: :::. :: : ::. .:: :::::::::.::::::.::.
CCDS41 ELQSVHSERHVLLYGTNPLSRLKLDNGKLAGLLAQRMFVMLPCGGVGVDTDTIWNELHSS
580 590 600 610 620 630
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 GAARLAVGCVVELVFKVATGELKNGFAVVRPPGHHAEESTPMGFCYFNSVAVAAKLLQQR
.::: :.: :..:.::::. ::::::::::::::::..:: ::::.:::::.: . :::.
CCDS41 NAARWAAGSVTDLAFKVASRELKNGFAVVRPPGHHADHSTAMGFCFFNSVAIACRQLQQQ
640 650 660 670 680 690
830 840 850 860 870 880
pF1KA0 LSVSKILIVDWDVHHGNGTQQAFYSDPSVLYMSLHRYDDGNFFPGSGAPDEVGTGPGVGF
..::::::::::::::::::.::.::::::.::::.::::::::::: ::::.: : ::
CCDS41 SKASKILIVDWDVHHGNGTQQTFYQDPSVLYISLHRHDDGNFFPGSGAVDEVGAGSGEGF
700 710 720 730 740 750
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pF1KA0 NVNMAFTGGLDPPMGDAEYLAAFRTVVMPIASEFAPDVVLVSSGFDAVEGHPTPLGGYNL
:::.:..::::::::: ::::::: :::::: ::.::.::::.::::.::::.:::::..
CCDS41 NVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEGHPAPLGGYHV
760 770 780 790 800 810
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pF1KA0 SARCFGYLTKQLMGLAGGRIVLALEGGHDLTAICDASEACVSALLGNELDPLPEKVLQQR
::.::::.:.:::.:::: .:::::::::::::::::::::.:::::..::: :. .:.
CCDS41 SAKCFGYMTQQLMNLAGGAVVLALEGGHDLTAICDASEACVAALLGNRVDPLSEEGWKQK
820 830 840 850 860 870
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KA0 PNANAVRSMEKVMEIHSKYWRCLQRTTSTAGRSLIEAQTCENEEAETVTAMASLSVGVKP
:: ::.::.: :...::::: :.:: .: . .. ..::.:.:::.::::::.
CCDS41 PNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVEAVTALASLSVGIL-
880 890 900 910 920 930
1070 1080
pF1KA0 AEKRPDEEPMEEEPPL
:: ::.:. .::: :.
CCDS41 AEDRPSEQLVEEEEPMNL
940 950
>>CCDS81685.1 HDAC7 gene_id:51564|Hs108|chr12 (974 aa)
initn: 2652 init1: 1650 opt: 2278 Z-score: 1340.0 bits: 259.5 E(32554): 2.6e-68
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70 80 90 100 110 120
pF1KA0 QLQQELLALKQKQQIQRQILIAEFQRQHEQLSRQHEAQLHEHIKQQQEMLAMKHQQELLE
:. :. .::.:. .:: .::. .:
CCDS81 CADTPGPQPQPMDLRVGQRPPVEPPPEPTLLALQRPQRLHHHL-----FLAGLQQQRSVE
20 30 40 50 60
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 HQRKLERHRQEQELEKQHREQKLQQLKNKEKGKESAVASTEVKMKLQEFVLNKKKALAHR
.: : ::. .::.:.:: .:.:.:.:::::. ::.:: : .:.:..: .:
CCDS81 PMR-LSMDTPMPELQVGPQEQELRQLLHKDKSKRSAVASSVVKQKLAEVILKKQQAALER
70 80 90 100 110 120
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... ..: : . :. . .: .: :. :: .. : . ::::::.:::
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::::: . :... :::..::::....: .:..:: .. ::. ::.:.:: ::::.
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: :.: : . : :. :..:: .: :.::. : : :: ::::::: :.
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. :..: : :.: : .. . : :: . :: ..:.. :: ..::. .
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.:::.: ::: ::.: ::::. ..:.: : : ::.::.: ::: .: :
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: ::. : . : .: . ..:...:. . . :.:. . . :
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: .. .:.: : ::. : : :..: :.:: ::::.
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.. ... .:.. :::::::::::::: : .:. :: .. :
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:::::.::..::::::.::..: ::::::::::::::::: :::..:::.:::::.::
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:::.:::: :.::::::::.: :::. :: : ::. .:: :::::::::.::::::.::.
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.::: :.: :..:.::::. ::::::::::::::::..:: ::::.:::::.: . :::.
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..::::::::::::::::::.::.::::::.::::.::::::::::: ::::.: : ::
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:::.:..::::::::: ::::::: :::::: ::.::.::::.::::.::::.:::::..
CCDS81 NVNVAWAGGLDPPMGDPEYLAAFRIVVMPIAREFSPDLVLVSAGFDAAEGHPAPLGGYHV
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::.::::.:.:::.:::: .:::::::::::::::::::::.:::::..::: :. .:.
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:: ::.::.: :...::::: :.:: .: . .. ..::.:.:::.::::::.
CCDS81 PNLNAIRSLEAVIRVHSKYWGCMQRLASCPDSWVPRVPGADKEEVEAVTALASLSVGIL-
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