Result of FASTA (ccds) for
pFN21ASDA0396
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0396, 627 aa
1>>>pF1KSDA0396 627 - 627 aa - 627 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5463+/-0.00163; mu= 12.2138+/- 0.095
mean_var=118.4416+/-24.402, 0's: 0 Z-trim(99.1): 231 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.117848
statistics sampled from 5341 (5602) to 5341 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.508), E-opt: 0.2 (0.172), width: 16
Scan time: 3.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10228.1 FEM1B gene_id:10116|Hs108|chr15 ( 627) 4127 714.4 1.1e-205
CCDS4118.1 FEM1C gene_id:56929|Hs108|chr5 ( 617) 1387 248.5 1.9e-65
CCDS12135.1 FEM1A gene_id:55527|Hs108|chr19 ( 669) 672 127.0 8.1e-29
CCDS6121.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1880) 355 73.4 3e-12
CCDS6119.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1881) 355 73.4 3e-12
CCDS47849.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1897) 355 73.4 3e-12
CCDS13675.1 RIPK4 gene_id:54101|Hs108|chr21 ( 784) 346 71.6 4.4e-12
CCDS54796.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1863) 339 70.7 2e-11
CCDS43261.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1872) 339 70.7 2e-11
CCDS55712.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1861) 338 70.5 2.2e-11
CCDS3702.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (3957) 339 71.0 3.5e-11
CCDS7258.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (4377) 338 70.8 4.3e-11
CCDS55711.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1868) 332 69.5 4.5e-11
CCDS11879.1 ANKRD29 gene_id:147463|Hs108|chr18 ( 301) 316 66.2 7.3e-11
>>CCDS10228.1 FEM1B gene_id:10116|Hs108|chr15 (627 aa)
initn: 4127 init1: 4127 opt: 4127 Z-score: 3805.9 bits: 714.4 E(32554): 1.1e-205
Smith-Waterman score: 4127; 100.0% identity (100.0% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-627)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEGLAGYVYKAASEGKVLTLAALLLNRSESDIRYLLGYVSQQGGQRSTPLIIAARNGHAK
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CCDS10 MEGLAGYVYKAASEGKVLTLAALLLNRSESDIRYLLGYVSQQGGQRSTPLIIAARNGHAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VVRLLLEHYRVQTQQTGTVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VVRLLLEHYRVQTQQTGTVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD NSTPLRAACFDGRLDIVKYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRADP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NSTPLRAACFDGRLDIVKYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRADP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NAKAHCGATALHFAAEAGHIDIVKELIKWRAAIVVNGHGMTPLKVAAESCKADVVELLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NAKAHCGATALHFAAEAGHIDIVKELIKWRAAIVVNGHGMTPLKVAAESCKADVVELLLS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD HADCDRRSRIEALELLGASFANDRENYDIIKTYHYLYLAMLERFQDGDNILEKEVLPPIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HADCDRRSRIEALELLGASFANDRENYDIIKTYHYLYLAMLERFQDGDNILEKEVLPPIH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD AYGNRTECRNPQELESIRQDRDALHMEGLIVRERILGADNIDVSHPIIYRGAVYADNMEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AYGNRTECRNPQELESIRQDRDALHMEGLIVRERILGADNIDVSHPIIYRGAVYADNMEF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EQCIKLWLHALHLRQKGNRNTHKDLLRFAQVFSQMIHLNETVKAPDIECVLRCSVLEIEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EQCIKLWLHALHLRQKGNRNTHKDLLRFAQVFSQMIHLNETVKAPDIECVLRCSVLEIEQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SMNRVKNISDADVHNAMDNYECNLYTFLYLVCISTKTQCSEEDQCKINKQIYNLIHLDPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SMNRVKNISDADVHNAMDNYECNLYTFLYLVCISTKTQCSEEDQCKINKQIYNLIHLDPR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TREGFTLLHLAVNSNTPVDDFHTNDVCSFPNALVTKLLLDCGAEVNAVDNEGNSALHIIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TREGFTLLHLAVNSNTPVDDFHTNDVCSFPNALVTKLLLDCGAEVNAVDNEGNSALHIIV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QYNRPISDFLTLHSIIISLVEAGAHTDMTNKQNKTPLDKSTTGVSEILLKTQMKMSLKCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QYNRPISDFLTLHSIIISLVEAGAHTDMTNKQNKTPLDKSTTGVSEILLKTQMKMSLKCL
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KSD AARAVRANDINYQDQIPRTLEEFVGFH
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AARAVRANDINYQDQIPRTLEEFVGFH
610 620
>>CCDS4118.1 FEM1C gene_id:56929|Hs108|chr5 (617 aa)
initn: 1212 init1: 725 opt: 1387 Z-score: 1288.3 bits: 248.5 E(32554): 1.9e-65
Smith-Waterman score: 1438; 40.7% identity (69.9% similar) in 634 aa overlap (8-627:7-616)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEGLAGYVYKAASEGKVLTLAALLLNRSESDIRYLLGYVSQQGGQRSTPLIIAARNGHAK
:..:: .::. :. :: ..:. .. :.. . .: .:::..::: ::
CCDS41 MDLKTAVFNAARDGKLRLLTKLLASKSKEEVSSLIS--EKTNG--ATPLLMAARYGHLD
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VVRLLLEHYRVQTQQTGTVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVT
.:..:::. .. . :.: ::: .:.:: :: :..:::..::. :..:::.::.::.:
CCDS41 MVEFLLEQCSASIEVGGSVNFDGETIEGAPPLWAASAAGHLKVVQSLLNHGASVNNTTLT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD NSTPLRAACFDGRLDIVKYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRADP
::::::::::::.:.:::::::..:.. ..:.. .:::::. :::: ....::::. ::
CCDS41 NSTPLRAACFDGHLEIVKYLVEHKADLEVSNRHGHTCLMISCYKGHKEIAQYLLEKGADV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NAKAHCGATALHFAAEAGHIDIVKELIKWRAAIVVNGHGMTPLKVAAESCKADVVELLLS
: :. : :::: ::.: .::.: :. . : . .:.::::: :. . ....:..:
CCDS41 NRKSVKGNTALHDCAESGSLDIMKMLLMYCAKMEKDGYGMTPLLSASVTGHTNIVDFLTH
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KSD HADCDRRSRIEALELLGASFANDRENYDIIKTYHYLYLAMLERFQDGDNILEKEVLPP--
::. .. ::.:::::::.:.. .. :.. . .: :: :..: ::. : : :
CCDS41 HAQTSKTERINALELLGATFVDKKR--DLLGALKYWKKAMNMRYSDRTNIISKPV-PQTL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD IHAYGNRTECRNPQELESIRQDRDALHMEGLIVRERILGADNIDVSHPIIYRGAVYADNM
: :: : . .:::.. : : ..:..:..:::::: .. :.:. : ::::::::.
CCDS41 IMAYDYAKEVNSAEELEGLIADPDEMRMQALLIRERILGPSHPDTSYYIRYRGAVYADSG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KSD EFEQCIKLWLHALHLRQKG----NRNTHKDLLRFAQVFSQMIH------LNETVKAPDIE
.:..::.:: .:: ..:.. . : ..:: ::..:: :.. :. :: :.
CCDS41 NFKRCINLWKYALDMQQSNLDPLSPMTASSLLSFAELFSFMLQDRAKGLLGTTVTFDDLM
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD CVLRCSVLEIEQSMNRVKNISDADVHNAMDNYECNLYTFLYLVCISTKTQCS-EEDQCKI
.: ::::::....... .: : : .:.:.:. :. :. :.:. :
CCDS41 GILCKSVLEIERAIKQTQCPADPLQLNK------ALSIILHLICLLEKVPCTLEQDHFK-
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KSD NKQIYNLIHLDPRTREGFTLLHLAVNSNTPVDDFHTNDVCSFPNALVTKLLLDCGAEVNA
.. :: ...: :: ...:. :::::..:: ::.::. :: .:..:::.::.
CCDS41 KQTIYRFLKLHPRGKNNFSPLHLAVDKNTTC--VGRYPVCKFPSLQVTAILIECGADVNV
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KSD VDNEGNSALHIIVQYNRPISDFLTLHSIIISLVEAGAHTDMTNKQNKTPLDK-STTGVSE
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CCDS41 RDSDDNSPLHIAALNNHP--DIMNL------LIKSGAHFDATNLHKQTASDLLDEKEIAK
530 540 550 560 570
590 600 610 620
pF1KSD ILLKTQMKMSLKCLAARAVRANDINYQDQIPRTLEEFVGFH
:.. . .:.:::::.. . : :. .::. :: ::..:
CCDS41 NLIQPINHTTLQCLAARVIVNHRIYYKGHIPEKLETFVSLHR
580 590 600 610
>>CCDS12135.1 FEM1A gene_id:55527|Hs108|chr19 (669 aa)
initn: 1098 init1: 349 opt: 672 Z-score: 630.8 bits: 127.0 E(32554): 8.1e-29
Smith-Waterman score: 1191; 35.8% identity (62.9% similar) in 674 aa overlap (8-612:7-654)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEGLAGYVYKAASEGKVLTLAALLLNRSESDIRYLLGYVSQQGGQRSTPLIIAARNGHAK
::.:: .::. : :: .::. .. : : :. :: .:::.:::: ::
CCDS12 MDLRTAVYNAARDGKLQLLQKLLSGRSREELDELTGEVA--GG--GTPLLIAARYGHLD
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VVRLLLEHYRVQTQQTGTVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVT
::. :... .... :.:.::: .:.:: :: :..:::..::. :. .::.::.:: :
CCDS12 VVEYLVDRCGASVEAGGSVHFDGETIEGAPPLWAASAAGHLDVVRSLLRRGASVNRTTRT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KSD NSTPLRAACFDGRLDIVKYLV-ENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRAD
::::::::::::.:..:.::: :..:.. .::.. .:::::. :::: ...:::::: :.
CCDS12 NSTPLRAACFDGHLEVVRYLVGEHQADLEVANRHGHTCLMISCYKGHREIARYLLEQGAQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD PNAKAHCGATALHFAAEAGHIDIVKELIKWRAAIVVNGHGMTPLKVAAESCKADVVELLL
: .. : :::: ::.: ..:.. :. .: . .:.::::: .:. . ....:: :.
CCDS12 VNRRSAKGNTALHDCAESGSLEILQLLLGCKARMERDGYGMTPLLAASVTGHTNIVEYLI
180 190 200 210 220 230
240
pF1KSD -------------------------------------------------SHADC---DRR
:. .: .:.
CCDS12 QEQPGQEQVAGGEAQPGLPQEDPSTSQGCAQPQGAPCCSSSPEEPLNGESYESCCPTSRE
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SRIEALELLGASFANDRENYDIIKTYHYLYLAMLERFQDGDNILEKEVLPP--IHAYGNR
. .::::::::.... .. :.. . .. :: : : :. . . : :: . ::
CCDS12 AAVEALELLGATYVDKKR--DLLGALKHWRRAMELRHQGGEYLPKPE--PPQLVLAYDYS
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TECRNPQELESIRQDRDALHMEGLIVRERILGADNIDVSHPIIYRGAVYADNMEFEQCIK
: . .:::.. : : ..:..:..:::::: .. :.:. : ::::::::. .::.::.
CCDS12 REVNTTEELEALITDPDEMRMQALLIRERILGPSHPDTSYYIRYRGAVYADSGNFERCIR
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410
pF1KSD LWLHALHLRQKG----NRNTHKDLLRFAQVFSQMIH-------LNETVKAPDIECVLRCS
:: .:: ..:.. . : ...: ::..:: ... :. . :. :: .
CCDS12 LWKYALDMQQSNLEPLSPMTASSFLSFAELFSYVLQDRAAKGSLGTQIGFADLMGVLTKG
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KSD VLEIEQSMNRVKNISDADVHNAMDNYECNLYTFLYLVCISTKTQCSEEDQCKINKQIYNL
: :.:.... .. .:. .. : .:.:. . :..:. .. .. .: :
CCDS12 VREVERALQLPREPGDSA------QFTKALAIILHLLYLLEKVECTPSQEHLKHQTVYRL
480 490 500 510 520
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IHLDPRTREGFTLLHLAVNSNTPVDDFHTNDVCSFPNALVTKLLLDCGAEVNAVDNEGNS
.. :: ..::: ::.::...: . : ::. :.:.::::::. .. : ..:.
CCDS12 LKCAPRGKNGFTPLHMAVDKDT--TNVGRYPVGRFPSLHVVKVLLDCGADPDSRDFDNNT
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ALHIIVQYNRPISDFLTLHSIIISLVEAGAHTDMTNKQNKTP---LDKSTTGVSEILLKT
::: .: : : .:. .:.::::: : :: .:: ::.. ... ..
CCDS12 PLHIAAQNNCP--------AIMNALIEAGAHMDATNAFKKTAYELLDEKL--LARGTMQP
590 600 610 620 630
600 610 620
pF1KSD QMKMSLKCLAARAVRANDINYQDQIPRTLEEFVGFH
..:.::::::. : : :
CCDS12 FNYVTLQCLAARALDKNKIPYKGFIPEDLEAFIELH
640 650 660
>>CCDS6121.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1880 aa)
initn: 1280 init1: 273 opt: 355 Z-score: 333.3 bits: 73.4 E(32554): 3e-12
Smith-Waterman score: 387; 36.4% identity (65.4% similar) in 228 aa overlap (48-271:373-586)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LTLAALLLNRSESDIRYLLGYVSQQGGQRSTPLIIAARNGHAKVVRLLLEHYRVQTQQTG
::: :: ...:..:..::: .::
CCDS61 HVAAHCGHHRVAKVLLDKGAKPNSRALNGFTPLHIACKKNHVRVMELLL--------KTG
350 360 370 380 390
80 90 100 110 120 130
pF1KSD TVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVTNSTPLRAACFDGRLDIV
. .:. . .: : : :. ::. .:: :...::. : ..: :::. : :. ...
CCDS61 A-SIDAVTESGLTPLHVASFMGHLPIVKNLLQRGASPNVSNVKVETPLHMAARAGHTEVA
400 410 420 430 440 450
140 150 160 170 180 190
pF1KSD KYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRADPNAKAHCGATALHFAAEA
:::..:.:... : :.: : :: :::..:. :::. :.:: . : : ::.::.
CCDS61 KYLLQNKAKVNAKAKDDQTPLHCAARIGHTNMVKLLLENNANPNLATTAGHTPLHIAARE
460 470 480 490 500 510
200 210 220 230 240 250
pF1KSD GHIDIVKELIKWRAA-IVVNGHGMTPLKVAAESCKADVVELLL---SHADCDRRSRIEAL
::.. : :.. .:. .. .:.:::.:::. :. :.:::: .: . .. . :
CCDS61 GHVETVLALLEKEASQACMTKKGFTPLHVAAKYGKVRVAELLLERDAHPNAAGKNGLTPL
520 530 540 550 560 570
260 270 280 290 300 310
pF1KSD ELLGASFANDRENYDIIKTYHYLYLAMLERFQDGDNILEKEVLPPIHAYGNRTECRNPQE
.. : ..: ::.:
CCDS61 HV-----AVHHNNLDIVKLLLPRGGSPHSPAWNGYTPLHIAAKQNQVEVARSLLQYGGSA
580 590 600 610 620
>>CCDS6119.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1881 aa)
initn: 1280 init1: 273 opt: 355 Z-score: 333.3 bits: 73.4 E(32554): 3e-12
Smith-Waterman score: 387; 36.4% identity (65.4% similar) in 228 aa overlap (48-271:373-586)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LTLAALLLNRSESDIRYLLGYVSQQGGQRSTPLIIAARNGHAKVVRLLLEHYRVQTQQTG
::: :: ...:..:..::: .::
CCDS61 HVAAHCGHHRVAKVLLDKGAKPNSRALNGFTPLHIACKKNHVRVMELLL--------KTG
350 360 370 380 390
80 90 100 110 120 130
pF1KSD TVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVTNSTPLRAACFDGRLDIV
. .:. . .: : : :. ::. .:: :...::. : ..: :::. : :. ...
CCDS61 A-SIDAVTESGLTPLHVASFMGHLPIVKNLLQRGASPNVSNVKVETPLHMAARAGHTEVA
400 410 420 430 440 450
140 150 160 170 180 190
pF1KSD KYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRADPNAKAHCGATALHFAAEA
:::..:.:... : :.: : :: :::..:. :::. :.:: . : : ::.::.
CCDS61 KYLLQNKAKVNAKAKDDQTPLHCAARIGHTNMVKLLLENNANPNLATTAGHTPLHIAARE
460 470 480 490 500 510
200 210 220 230 240 250
pF1KSD GHIDIVKELIKWRAA-IVVNGHGMTPLKVAAESCKADVVELLL---SHADCDRRSRIEAL
::.. : :.. .:. .. .:.:::.:::. :. :.:::: .: . .. . :
CCDS61 GHVETVLALLEKEASQACMTKKGFTPLHVAAKYGKVRVAELLLERDAHPNAAGKNGLTPL
520 530 540 550 560 570
260 270 280 290 300 310
pF1KSD ELLGASFANDRENYDIIKTYHYLYLAMLERFQDGDNILEKEVLPPIHAYGNRTECRNPQE
.. : ..: ::.:
CCDS61 HV-----AVHHNNLDIVKLLLPRGGSPHSPAWNGYTPLHIAAKQNQVEVARSLLQYGGSA
580 590 600 610 620
>>CCDS47849.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1897 aa)
initn: 1280 init1: 273 opt: 355 Z-score: 333.3 bits: 73.4 E(32554): 3e-12
Smith-Waterman score: 387; 36.4% identity (65.4% similar) in 228 aa overlap (48-271:406-619)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LTLAALLLNRSESDIRYLLGYVSQQGGQRSTPLIIAARNGHAKVVRLLLEHYRVQTQQTG
::: :: ...:..:..::: .::
CCDS47 HVAAHCGHHRVAKVLLDKGAKPNSRALNGFTPLHIACKKNHVRVMELLL--------KTG
380 390 400 410 420
80 90 100 110 120 130
pF1KSD TVRFDGYVIDGATALWCAAGAGHFEVVKLLVSHGANVNHTTVTNSTPLRAACFDGRLDIV
. .:. . .: : : :. ::. .:: :...::. : ..: :::. : :. ...
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pF1KSD KYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRADPNAKAHCGATALHFAAEA
:::..:.:... : :.: : :: :::..:. :::. :.:: . : : ::.::.
CCDS47 KYLLQNKAKVNAKAKDDQTPLHCAARIGHTNMVKLLLENNANPNLATTAGHTPLHIAARE
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pF1KSD GHIDIVKELIKWRAA-IVVNGHGMTPLKVAAESCKADVVELLL---SHADCDRRSRIEAL
::.. : :.. .:. .. .:.:::.:::. :. :.:::: .: . .. . :
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.. : ..: ::.:
CCDS47 HV-----AVHHNNLDIVKLLLPRGGSPHSPAWNGYTPLHIAAKQNQVEVARSLLQYGGSA
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: :: :
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:....:. :.. : . . .. .:::..:.. :...:.:::.: : :
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:...... .: :: :.:. . . : : .: .:.: .:.
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:. : :.:. .. . . : . : .: . ...... .. ::
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:. .: . ::: :.: : :.. . . ::.. ... .
CCDS54 --ETNIVTKQGVT----PLHLASQEG----HTDMVTLLLDKGANIHMSTKSGLTSLHLAA
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. . ... . . .:. .: :.:. . :: : ..: ... .: .
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::.:: :
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. . ::: :::.:: .::.:::: :. .: ... :.
CCDS43 KTRDGLTPLHCAARSGHDQVVELLLERGAPLLARTKNGLSPLHMAAQGDHVECVKHLLQH
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CCDS43 KAPVDDVTLDYLTALHVAAHCGHYRVTKLLLDKRANPNARALNGFTPLHIACKKNRIKVM
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pF1KSD KYLVENNANISIANKYDNTCLMIAAYKGHTDVVRYLLEQRADPNAKAHCGATALHFAAEA
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CCDS43 ELLVKYGASIQAITESGLTPIHVAAFMGHLNIVLLLLQNGASPDVTNIRGETALHMAARA
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CCDS43 QEDKVNVADIL--TKHGADQDAHTKLG------YTPLIVACHYGNVKM-------VNFLL
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CCDS55 NVPVDDVTNDYLTALHVAAHCGHYKVAKVLLDKKANPNAKALNGFTPLHIACKKNRIKVM
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CCDS55 ELLLKHGASIQAVTESGLTPIHVAAFMGHVNIVSQLMHHGASPNTTNVRGETALHMAARS
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CCDS55 GQAEVVRYLVQDGAQVEAKAKDDQTPLHISARLGKADIVQQLLQQGASPNAATTSGYTPL
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CCDS55 HLS---AREGHEDVAAFLLDHGASL-------SITTKKGFTPLHVAAKYGKLEVANLLLQ
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CCDS55 KSASPDAAGKSGLTPLHVAAHYDNQKVALLLLDQGASP------HAAAKNGYTPLHIAAK
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CCDS55 KN---------------QM----------DIATTL----LEYGADANAVTRQGIASVHLA
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CCDS55 -------HIINVLLQNNASPNELTVNGN------TALGIARRLGYISVVDTLKIVTEETM
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]